4ZXLA

Cpoga d298n in complex with drosophila hcf -derived thr-o-glcnac peptide
Total Genus 233
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
233
sequence length
579
structure length
579
Chain Sequence
NQVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDNIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVAQLNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A mutant O-GlcNAcase as a probe to reveal global dynamics of protein O-GlcNAcylation during Drosophila embryonic development.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NAG-PRO-SER-THR-ALA-Thr-O-GlcNAc containing peptide from dro
molecule tags Hydrolase/peptide
source organism Clostridium perfringens (strain atcc 13124 / nctc 8237 / type a)
total genus 233
structure length 579
sequence length 579
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2015-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4zxlA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4zxlA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4zxlA01
3AHZA 3AMLA 1JFHA 1E4NA 4HA1A 1BHGA 3HJEA 4F9JA 1ZS2A 2XVNA 1JZ7A 1CDGA 1FH7A 1A3HA 3SCUA 2GFTA 2XVGA 1HT6A 3SUVA 3VGHA 5HXMA 4C91A 1MQQA 4GIAA 3CBWA 1E73M 1XRVA 1E4MM 3OBAA 5LA1A 2UY5A 3F5KA 2HISA 4HPHA 4JFVA 4P8UA 3GXMA 1ITXA 1E6XM 3ARRA 3WD2A 4F8XA 1E0WA 1WZAA 1EHAA 3WNNA 5CZKA 2WCGA 3VINA 2BHUA 1RP9A 3T0AA 1B3XA 4IM4A 3WNPA 4AD4A 1JZ6A 2D0HA 2QMKA 3K46A 4ZE4A 4DUVA 1WCGA 3BAYA 2JALA 1H11A 4GQRA 1JZ8A 3GDBA 2YBTA 4X9YA 3WH8A 5FL0A 4UCFA 3T2OA 4S3JA 4H8HA 2DIEA 2QHAA 2ZUUA 2A3AA 2WBGA 2GK1A 2X8RA 4PMDA 4PSRA 3AZRA 4MADA 3MMUA 2DSKA 1E1EA 1VAHA 4XUYA 3POHA 1L0PA 3VMOA 3CHDA 1ZBKA 4LYQA 1UZ1A 3B9EA 1U30A 5D9NA 3LPOA 1QI3A 3IK2A 5CG0A 1UWRA 2WVSA 4H8UA 3W37A 1MW3A 1W1VA 3SUSA 1N82A 3THDA 1NWUA 2W4XA 5AYIA 3L4TA 4JIEA 3WD1A 4FLQA 3UR7A 2J47A 1I1XA 4GZEA 5DT7A 4EANA 5JIWA 1KCLA 1OM0A 2BVDA 3ARUA 3SCWA 5KZ6A 4QCEA 1ISZA 1ODUA 4J7RA 1EOKA 1QHOA 3WD4A 2YA0A 3WD3A 1WNOA 4PBGA 3CHEA 1GW1A 1OGGA 3WMCA 2VCCA 1H09A 5D9MA 4RE2A 2W67A 1NARA 3K4DA 3OLDA 4WK9A 2OWCA 3PN8A 1JZ3A 4GO8A 1K9TA 1CGYA 5DT5A 2VVSA 1KXTA 1QHPA 3CTTA 3BMVA 5LYRA 4LGXA 2J62A 1E71M 1FP9A 2CNCA 3WDIA 4BCEA 4JAWA 4QFUA 2XJ7A 2DEPA 4H04A 1V6WA 1R7AA 5M3WA 2FGLA 3MUIA 3THCA 3VUPA 1J0KA 1TZ7A 1QNOA 1J0JA 1C7TA 4UOQA 3BAIA 4JKLA 1QW8A 2FHBA 4QP0A 1JNEA 4Q22A 2D3LA 2YA1A 1CTNA 4B9ZA 1JIBA 4TVDA 3MS8A 4D6GA 4L4PA 1CXEA 4HA4A 1FHDA 4CCEA 1PBGA 2CKRA 2X09A 5DO8A 5A95A 2WZEA 2WLZA 1MFUA 4R27A 5AYBA 3WL0A 3L4WA 2V3EA 1GUVA 3VNZA 2NW0A 1JDDA 3AI0A 3U5YA 1U2YA 3S2CA 4C7GA 1ISYA 2FH8A 1BYDA 4FK9A 3W27A 3ARTA 1EGZA 4B15A 2DSVA 3SCSA 4AZCB 1JZ5A 2WMGA 4E8CA 2IXUA 4KGJA 3VM7A 4X0NA 4MAVA 3VILA 2DIJA 1VFMA 1UWQA 3W0KA 2XVKA 2AOSA 1HJVA 5JIPA 3BXWA 4UQ9A 4AZCA 3LMYA 3W24A 3AMKA 3VGBA 4UZUA 2D24A 2JF7A 2E9BA 4GZJA 1UH4A 3ZQ9A 4EKJA 2D23A 4V28A 3F4VA 4Z2LA 2DT3A 2X1IA 4K68A 4P7OA 2UWFA 3UR8A 1GCYA 3CO4A 2PWDA 1CLVA 3ALFA 1W3LA 4FLRA 4F9DA 1UD2A 1OGBA 2XG9A 5BRQA 1F4HA 1FA2A 4MB1A 5BROA 3E1F1 1HN1A 1ZBCA 5HBFA 4AIUA 1NWSA 4W8AA 3PZMA 4NF7A 1P6WA 3CLWA 4B3KA 2BNJA 3DC0A 5FKYA 2ZUNA 3OGVA 2BS9A 1LL6A 5GQBA 4B16A 4ZXOA 1CENA 4P8XA 3L4XA 3AHTA 2J8FA 1SMAA 1JD9A 4BQ3A 2QMJA 4PTXA 1WZLA 1V0MA 4C7FA 5F7UA 1EDGA 4U2YA 2Y5EA 2YIHA 3O2LA 1NOUA 1UD6A 5DF0A 5A6MA 1JYXA 1UKOA 2X05A 4OJYA 3QOKA 2VURA 1MXDA 1FH9A 4MPKA 4ATLA 4QLLA 4W89A 1DHKA 3SCOA 1VFFA 1H41A 1X6NA 5BCAA 1NQ6A 1XSIA 3O9NA 1UQZA 3BGAA 1BGGA 1H0GA 4UFMA 3NSNA 4KRTA 3VIPA 4PUEA 1AQ0A 1J12A 1E6QM 3IANA 2WHMA 1HL8A 1PIFA 3WQ8A 3MKKA 2G41A 1CGWA 2A3HA 3ZM8A 1J01A 1MYRA 1M53A 4D6IA 5ABFB 4QCFA 2E8ZA 1W2VA 3AIEA 4OKDA 2CPUA 3ARVA 4UFLA 4CD7A 4NRSA 3LPFA 1VEPA 2G3JA 2WW5A 4JFWA 1TG7A 1CGTA 1C90A 1SMDA 1UR1A 2VZUA 2WZIA 2GJPA 1J11A 4J27A 2WMIB 4CVUA 4LYRA 3WNOA 1AQHA 1HKKA 1YQ2A 1E3ZA 1JAKA 2EPLX 2WMIA 2DSZA 1S46A 1NWRA 5CPQA 2YKKA 1C8XA 1JDCA 3WUEA 2EPMX 1L8NA 4RL3A 4AZGA 1UKTA 3BAXA 2BVYA 1HF6A 1CLXA 4A3YA 2WKGA 4U3CA 2YA2A 1TFVA 2RGMA 4M81A 3KL3A 2BFGA 3PZNA 1VB9A 1GOKA 7A3HA 2DGAA 2DT1A 2FGZA 1JNDA 1V3HA 1KQYA 2YBUA 4CGTA 1CGXA 2XFYA 1UOKA 1X6LA 4CKQA 4JZ5A 2DH3A 2XFRA 5AC4A 2XM2A 2OSYA 1CXIA 4D6FA 1V3KA 3CGTA 1UG6A 3PZVA 1H2JA 4AY1A 3CHCA 1TA3B 1E4IA 1KR1A 4NZCA 5I24A 1WDQA 3I3EA 3L2MA 4M56A 4UQCA 2GSJA 1E6SM 1JGIA 1GORA 2WWDA 4P7NA 3W29A 2OYKA 1TA3A 1EDTA 2F61A 2JIEA 1IZJA 3CMGA 4ZEPA 1K9FA 1WZMA 3WUFA 2FHFA 3OLIA 4Y7EA 3WFZA 2CHOA 3II1A 4W93A 1BTCA 2V5CA 2J8GA 2EO7A 3CZKA 2EXOA 3OG2A 5A8OA 3L4UA 4JL2A 4WKFA 1JG9A 1PAMA 2J7FA 3ZSSA 7CGTA 2OSXA 3A4XA 3VDAA 2VVNA 4F66A 4AIEA 4U5KA 4AISA 1LF1A 3EDJA 2W63A 3ARPA 3RO8A 5AC5A 2PF0A 3MANA 2ZX5A 4J3TA 1J0ZA 4ZE5A 3PTQA 4XX6A 4P7LA 1BQCA 3AMGA 1D7FA 3WQ5A 5IFPA 2BY0A 3VIJA 3OZPA 1UYQA 2J75A 1W1PA 1JYWA 1JI1A 1B2YA 3ARSA 3UG5A 3T09A 1UR8A 3FN9A 3SCTA 1HP5A 2D3NA 2G4FA 3ARXA 1KXVA 1HJWA 2E4TA 4P7RA 3BAJA 5CLTA 2GDUA 1OGSA 2A3BA 3WF1A 5JBEA 1Q6GA 2VI0A 3AMDA 1GNXA 1FOBA 1UKQA 4HTYA 1E5NA 4LXFA 1QNRA 2J7CA 2VNCA 3WELA 3TTOA 3VD9A 1A47A 2ZX6A 3ZR6A 2BHZA 3PZIA 1C7SA 3TTQA 5CGTA 1LWHA 1PZ2A 2VX5A 2ZX9A 2W61A 1WDPA 4HMEA 4HZ8A 1QHZA 2VX6A 4WSKA 4MB3A 4Z2HA 3W6MA 1E6ZA 4M1RA 3RM8A 3IAPA 2XWEA 1IV8A 3BAWA 1UD5A 3QHMA 3GM8A 4IPNB 3A4AA 3DHUA 4C90A 1DWAM 4UR9A 4N42A 3ZT7A 5ABGA 1UD8A 2YL8A 1TVPA 4PUDA 1WDSA 4AEFA 4KGLA 1J0IA 3MUZ1 4UFJA 3GXDA 2G3MA 3OLEA 1J10A 5I6SA 2X2YA 5JUVA 4AD1A 1K9EA 1QI5A 4BZYA 1W9PA 3WNKA 4PTMA 1V03A 1UD3A 2FHCA 4UQDA 3AS1A 2WXDM 2CYGA 2C0HA 1EOMA 1RD6A 3M07A 3BLPX 1MQRA 2WWCA 2RGLA 3WL1A 1HX0A 1KB3A 3M7SA 3MSDA 4R5EA 3VNYA 3AYSA 1MFVA 1W9VA 4HPGA 3WEOA 4CD4A 4Z2GA 3ZIZA 1VENA 3AFBA 3WY1A 2CBIA 1B31A 1LG2A 3EDKA 4GKLA 3ZMRA 4X0VA 1NWTA 5EB8A 1V0KA 3WH7A 2GJXB 2PWHA 4URIA 1OT1A 4HMDA 3VIOA 4P7QA 3ZJ7A 4DUXA 1PEZA 1C8YA 5EBAA 3HU7A 1G94A 5CSYA 3FAWA 1ISXA 4OOZA 2V38A 5CSUA 1PX3A 4GXPA 2WMFA 3BC9A 4GQQA 1US2A 1M7XA 4JFSA 2QLYA 4ATDA 1ZJBA 5D9PA 2X0YA 1E6PA 3TONA 4PRWA 3ARYA 1QW9A 3GXIA 3VU2A 5I3DA 3MU7A 4M82A 3FXYA 3ZO9A 4ACYA 5C8BB 1NOFA 3VGGA 4N0RA 2ZIDA 1XC6A 3MUY1 3VDBA 1OIFA 1UH2A 1CPUA 3EYPA 2EPNA 3NSXA 2QPUA 3BAKA 3GH5A 5C70A 4NI3A 4V2XA 2DDXA 4UQAA 3RIKA 3WEMA 2GDVA 4DWSB 1E43A 2DT2A 3ZR5A 1WP6A 2VOTA 1KXQA 1V6VA 1VJZA 3A3HA 3BCFA 4DM2A 3ARWA 2UY3A 1GVIA 4LYPA 1F4AA 4DWSA 3VPLA 3PTMA 2VMFA 2VC9A 3AIRA 3LPPA 1OCQA 1SYTA 1WB0A 1VJSA 4AZ6A 3OZOA 3FW6A 3WIJA 1KQZA 1FHLA 1GOQA 4MB4A 3T2QA 2ZXQA 4PSPA 1FP8A 1VIWA 4MNLA 4NRRA 4PMUA 2AAAA 4Z2KA 4HA3A 2VT0A 2CKSA 2VX4A 5A6SA 1PX4A 1C93A 3UERA 1XSKA 3AZSA 3SCVA 1ECEA 2ZXDA 1G1YA 1OT2A 1B1YA 3AIUA 1CZ1A 2J74A 3MMDA 5IHRA 2YL9A 4TOQA 1JF5A 4PMNA 3IJ9A 3M46A 4CN6A 4W87A 2W92A 3UESA 4W88A 1E5JA 5BXTA 1YHTA 1HJSA 4WKHA 3WMBA 3ZJKA 4PMZA 2VCAA 1Q6DA 1GJWA 1OD8A 1UKPA 4CU6A 1HXJA 3L4ZA 4TX8A 4FLOA 4WSJA 2Z1KA 2WHLA 1QI0A 3TTSA 4MDOA 1B3YA 1PJ9A 8A3HA 4HP5A 2CBJA 1E0VA 3RDKA 5LA2A 1W9BM 3DYMA 3SUWA 1X1NA 3EDFA 3N15A 1W9DM 3SCQA 3PZGA 3AXXA 4CU8A 1CECA 2DSWA 3GNRA 3KEHA 4D1IA 3TTYA 1V02E 2ESCA 5CPSA 4WJXA 3W82A 4GI6A 2DSUA 1QBBA 1GHRA 4BA0A 2XHYA 3BCDA 3EMQA 4CD5A 4GO9A 4M29A 5D4YA 3WN6A 4AZIA 1MW1A 3GH7A 1Q6CA 3RM9A 1UR2A 3NDZA 4PYSA 1ODZA 4DWSD 1GQLA 3ZT5A 1WKYA 4U3AA 3WF0A 2WSPA 3W81A 1V08A 5BXPA 9CGTA 4UNIA 2E9MA 2XYLA 4UFKA 1LL7A 4EE9A 1B3WA 5A8QA 4D6EA 2CIPA 3KE0A 1R8LA 5EFFA 1EIBA 1EQPA 3K4AA 3SIMA 5GNYA 2YL5A 1QPKA 2W91A 5D8WA 3ECQA 3NJ3A 1SR0A 4MDPA 1EXPA 1BGAA 2CBUA 3WEZA 4F79A 1XD1A 2WMHA 4CD6A 2PI6A 5CQ1A 3W53A 3ZT6A 4J28A 4PEEA 2WCSA 4HU8A 2E40A 2XPKA 3OGSA 1Q4NX 2J4GA 1MWOA 4CVWA 1OINA 4ZXLA 2JF6A 4ACZB 3MMWA 1C92A 3AOFA 4TTGA 2ZX7A 1UA3A 1W1YA 3VO0A 1CEOA 3F5LA 1CXLA 3AS3A 3JUGA 4HZ7A 4JHOA 2VL4A 4P8WA 1VEMA 1H0IA 2Y24A 5ABFA 2EEXA 2FH6A 3WQ4A 4B9YA 3VDCA 4W5UA 2ZUSA 1VRXA 1OB0A 1GHSA 4CD8A 3AXHA 4PN2A 3SURA 2V3FA 2A3EA 1V0NA 2EJ1A 3T08A 4W85A 1DWFM 1JYNA 1XCWA 2XIIA 3AZTA 4MAZA 3VKKA 4AEEA 3GZAA 3T0BA 1VFUA 4LPCA 4YPJA 4DM1A 1JD7A 3SCNA 1M01A 2PWFA 4HOZA 1D2KA 1VBRA 5CGMA 3T2PA 2G3NA 1GJUA 3T0DA 4IISA 2TAAA 3N11A 1TMQA 3DYOA 5BYWA 1CXHA 3CIVA 5FIPA 2CBVA 2BY1A 2WYSA 3GH4A 3N17A 4AC1X 3VD7A 2WVTA 1QOXA 1GOWA 3VOCA 2D22A 5FL1A 5E0FA 2C7FA 5A8NA 3W6LA 2WK2A 4PTVA 1PIGA 1NOWA 1SFSA 1J9YA 2WNWA 1BF2A 3SCPA 2Q8XA 4TUFA 2WC3A 4KMQA 3QOMA 3K8MA 4UFHA 2E9LA 3PZTA 4D1JA 3RJXA 3VGEA 5D8ZA 1UKSA 1W9UA 4YN5A 1XD0A 1KR0A 1IZKA 4BQ4A 3RMEA 3GYCA 3WDRA 3WF2A 2J7HA 4AD0A 4U33A 4GPNA 3MV11 1G5AA 1NM9A 3KZSA 2XFFA 2QV4A 1B9ZA 2BY2A 5AY7A 1AQMA 1B0IA 1TR1A 1QNPA 3AXIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3AHZ A;  3AML A;  1JFH A;  1E4N A;  4HA1 A;  1BHG A;  3HJE A;  4F9J A;  1ZS2 A;  2XVN A;  1JZ7 A;  1CDG A;  1FH7 A;  1A3H A;  3SCU A;  2GFT A;  2XVG A;  1HT6 A;  3SUV A;  3VGH A;  5HXM A;  4C91 A;  1MQQ A;  4GIA A;  3CBW A;  1E73 M;  1XRV A;  1E4M M;  3OBA A;  5LA1 A;  2UY5 A;  3F5K A;  2HIS A;  4HPH A;  4JFV A;  4P8U A;  3GXM A;  1ITX A;  1E6X M;  3ARR A;  3WD2 A;  4F8X A;  1E0W A;  1WZA A;  1EHA A;  3WNN A;  5CZK A;  2WCG A;  3VIN A;  2BHU A;  1RP9 A;  3T0A A;  1B3X A;  4IM4 A;  3WNP A;  4AD4 A;  1JZ6 A;  2D0H A;  2QMK A;  3K46 A;  4ZE4 A;  4DUV A;  1WCG A;  3BAY A;  2JAL A;  1H11 A;  4GQR A;  1JZ8 A;  3GDB A;  2YBT A;  4X9Y A;  3WH8 A;  5FL0 A;  4UCF A;  3T2O A;  4S3J A;  4H8H A;  2DIE A;  2QHA A;  2ZUU A;  2A3A A;  2WBG A;  2GK1 A;  2X8R A;  4PMD A;  4PSR A;  3AZR A;  4MAD A;  3MMU A;  2DSK A;  1E1E A;  1VAH A;  4XUY A;  3POH A;  1L0P A;  3VMO A;  3CHD A;  1ZBK A;  4LYQ A;  1UZ1 A;  3B9E A;  1U30 A;  5D9N A;  3LPO A;  1QI3 A;  3IK2 A;  5CG0 A;  1UWR A;  2WVS A;  4H8U A;  3W37 A;  1MW3 A; 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