4ZXLA

Cpoga d298n in complex with drosophila hcf -derived thr-o-glcnac peptide
Total Genus 233
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
233
sequence length
579
structure length
579
Chain Sequence
NQVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDNIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVAQLNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A mutant O-GlcNAcase as a probe to reveal global dynamics of protein O-GlcNAcylation during Drosophila embryonic development.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NAG-PRO-SER-THR-ALA-Thr-O-GlcNAc containing peptide from dro
molecule tags Hydrolase/peptide
source organism Clostridium perfringens (strain atcc 13124 / nctc 8237 / type a)
total genus 233
structure length 579
sequence length 579
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2015-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4zxlA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4zxlA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4zxlA01
2BY2A 2D3NA 1H0GA 1GORA 3VDCA 2WSPA 4JKKA 3VKKA 4MB3A 4AXNA 3ALGA 5I6SA 1TVNA 3RMEA 2WWCA 4HZ8A 5A6MA 1Z32X 3VD5A 3G6LA 2Q8XA 1FH9A 1JIBA 3GNOA 4JFSA 5CPTA 4A4AA 1SMDA 2VL4A 3GH7A 2ZXDA 4MPKA 1XD0A 1GHRA 3S2CA 2YDQA 4PTWA 1V3KA 4JKMA 1J0HA 4HZ6A 1UG6A 3NUKA 5DFAA 4U33A 4ZE5A 2VR4A 3BAXA 4RL3A 3QHOA 5AY7A 3NYDA 2WVSA 3WH8A 1UD2A 3WQ8A 4J3WA 4FLSA 2Y5EA 5C71A 3T0AA 4EKJA 4NI3A 4S3KA 3LPGA 2YA0A 3BLKA 5DT7A 2ZUSA 1UWUA 4P7RA 1UWSA 4W87A 1E0XA 1CPUA 3WUEA 4AZCA 4DWSC 1VIWA 1EQCA 4WKAA 3SUVA 3M7SA 3WNOA 4RE2A 4W5ZA 2CBUA 1WB0A 3ARVA 2ZWZA 1UKQA 1SR0A 4TTUA 4MB5A 2QMKA 4UQAA 4KGLA 5BRPA 4WK9A 4PCSA 3VGBA 2G3JA 3CO4A 4JL2A 3SCQA 4HOZA 3GXMA 1GVIA 4UQCA 1PPIA 2WVUA 3VD9A 4Z2IA 3VUPA 3F5LA 1C8XA 1H3GA 3MUAA 1GOWA 4W7UA 1XH1A 2XFFA 4OOUA 4DWSB 3AXHA 2A3CA 3K4DA 4LPCA 1DWFM 2V38A 1TZ7A 2VQUA 4A3HA 4TUFA 4W93A 3M6DA 1UR1A 1QHPA 4PTMA 3UERA 4AZ7A 2BXZA 1GHSA 3VGDA 3AQUA 3WF0A 4CU7A 5CZKA 1QNQA 4CD6A 3OZPA 2XG9A 1OIMA 1XSJA 1UWQA 5CPSA 5M5DA 3W24A 3W0KA 3VIJA 1FFQA 2A3AA 3L4WA 3MKKA 5CJ5A 5CLWA 5ABFA 1KCKA 1AQHA 2GDVA 1V3JA 3OG2A 3VVGA 4L4PA 8CGTA 2XFYA 1KR1A 2G3IA 3PTKA 2J62A 2EPOA 1XSKA 3MV11 1W2PA 5A8PA 1GQJA 2FGLA 1EXPA 1OD0A 4KH2A 1FFRA 3SUUA 1QOXA 4H2CA 1E15A 2GFTA 4CU8A 2Y8KA 1OIFA 4U5KA 2PWEA 4PMNA 2WC3A 1C93A 3FY1A 1JZ3A 3OGRA 1KGUA 4IISA 3MS8A 5A8OA 1W1VA 2BHUA 3VIGA 1WZKA 3VD4A 1JZ8A 2X2YA 3EDKA 2WANA 3ZT6A 1NOFA 5I0DA 3O6AA 4P8VA 3W29A 3KL5A 2ZXQA 4BS0A 2XJ7A 2C8NA 4MJ2A 1PIFA 1BYAA 1C90A 1W9PA 5GQBA 1KFWA 4W8LA 1CZ1A 1MXDA 3HN3A 2BVYA 1UUQA 3AJ7A 5IFTA 3ARPA 3N9KA 1U33A 1CENA 4U31A 1E6ZA 1QVBA 5A6LA 4Z2JA 4EANA 1V0NA 3AXXA 1XSIA 3RCNA 1CGTA 1I75A 3SCNA 1JDDA 1V0LA 4Z2HA 5IHRA 2A3EA 4AZIA 3AZRA 1MW3A 2WXDM 1ISVA 1NARA 1ZJAA 1BGGA 3NDZA 3WMCA 1K9DA 1Y7VA 4BF7A 4Z2GA 1VEOA 4TX8A 3SCWA 2PBGA 2VZSA 2J75A 1AQ0A 3CZLA 1HN1A 2A3HA 2ZX9A 3U5YA 4UQ9A 2WVVA 1SYTA 2GJXA 3PBGA 1TFVA 3ZSTA 1H09A 3MMDA 1JXJA 1QI2A 1IZJA 1UA3A 2EPLX 2J78A 2D22A 3ZJ6A 3TOPA 3UCQA 5I23A 4J28A 4W89A 2DSZA 4UFMA 2O9TA 1B3XA 1V6VA 4H8UA 1ODUA 2VC9A 4TTGA 4P8XA 3UG5A 4W88A 1V08A 2J7DA 5LYRA 1BQCA 3MUY1 1Q6CA 3B8SA 4OOZA 3WBAA 2GK1B 3FAXA 4LX4A 4D6HA 2EXOA 1W2VA 2D1ZA 4MB1A 5DMYA 4W7WA 2WPGA 3GYCA 3VTRA 3T2PA 1MVYA 3NSMA 1C7TA 2UY4A 2JIEA 4QFUA 3WMBA 4Y7EA 4BZYA 3AXIA 3PZUA 1OBAA 2J77A 3VMPA 3SUTA 1EH9A 2Z1SA 1ISWA 4C7GA 1B31A 3E1F1 1OB0A 1QI5A 1JG9A 2D2OA 2DSKA 4XV0A 1HT6A 4U3CA 1N82A 4J3SA 3VIKA 3N15A 1FOBA 3W28A 2CXGA 4H04A 1UKTA 1EIBA 4PMRA 3GBEA 3AIEA 1KWGA 3AHYA 1ISXA 2XVGA 4D1JA 1W9BM 1QHZA 3N18A 5EFFA 3CUIA 3WH7A 1TA3B 2XVNA 3NJ3A 3BMWA 3WEOA 1RP9A 2VVSA 1ODZA 2PWGA 4HMDA 3SCSA 2IXUA 1GJUA 1JL8A 4CVWA 2W66A 5D9OA 3W81A 3WUGA 4GXPA 1OD8A 2QLYA 2WHLA 4ML4A 1OT2A 4AIEA 4PSRA 2OYLA 2EPKX 4CD7A 2CBJA 4GO8A 4AZGA 3A4AA 3AMGA 2ZE0A 3DYPA 4IUGA 1YHTA 1E5JA 1QNRA 1Q6EA 1UKSA 3I3DA 4JKLA 3IJ7A 2WMKA 1VRXA 1HJWA 4CD8A 5A6BA 3GXIA 3GTNA 1HVXA 3D3AA 2VX7A 4KGJA 4GZEA 4GPNA 2ZICA 2JEPA 3VIMA 2F2HA 2OSYA 1JNEA 2BVTA 3PZTA 2QV4A 4B3KA 2XYLA 4UFKA 2B31A 3CBWA 3WSUA 1GQLA 1VJZA 4J3TA 4M29A 1CXFA 1M03A 2WMFA 1MW0A 4B9YA 1G1YA 3VMOA 3EDFA 1V02E 5I79A 2VQTA 2OWXA 4MNJA 3ZJ8A 1US2A 4GI9A 2DPEA 2VVNA 4CN4A 1E9LA 1B3YA 5A2AA 4HPHA 4AY1A 3VU2A 2J7GA 3IJ8A 4IM4A 1LF1A 1HJXA 2DT0A 4P7LA 4AIOA 4X0NA 1MW2A 2OWCA 3CMJA 1PJ9A 1PIGA 1P6WA 3WDQA 4W5UA 3T2OA 1OCQA 5DEZA 3TTSA 1ISZA 4W8BA 1ITCA 4PN2A 3WQWA 5I24A 2GJPA 3M46A 3BXWA 4PUDA 2PBOA 1B3ZA 2FH6A 4AD2A 1JNDA 2WSKA 1VAHA 2EO7A 2BY1A 1KBKA 1XV8A 1QBAA 3VDAA 2UY2A 5E9AA 2PC8A 4D1IA 1TR1A 5AYBA 1HJSA 1GVYA 3OB8A 1PX4A 4PMYA 1R8LA 1E6NA 4JFUA 1LL7A 5FD0A 1UR0A 1VF8A 4TVDA 1EDQA 2VT0A 1LG1A 1KGWA 4GKLA 2D3LA 3T09A 4WF7A 3OLEA 1QNOA 3A3HA 1H49A 3QOMA 4B9ZA 1BYDA 3UETA 4MDPA 3D5HA 2VZOA 2WMGA 4XB3A 3DECA 3POCA 4QLKA 5DO8A 4H7VA 3BC9A 2BY3A 4F79A 5BXPA 3SURA 3OZOA 3EDJA 2VRQA 4YN5A 2CHNA 2G3NA 1US3A 4URIA 4UFHA 3UESA 1EHAA 1UD3A 1JD7A 4UOQA 1UR8A 3PHAA 4V28A 1V02A 1IZKA 3ARSA 1UZ1A 4XUYA 3RJXA 4GQRA 1E1FA 1V0MA 3WQVA 1XC6A 1ZBKA 3WDJA 4D6FA 4PBGA 2YLLA 4C7DA 1C92A 4KRUA 2DT2A 1LLOA 4F9JA 2BVDA 1V3LA 3WF3A 1VFFA 2D23A 4UOJA 4AIUA 1W3KA 5FOOA 5I5RA 5KEZA 1MYRA 2WCAA 4NZCA 3WD0A 4U3AA 3PZNA 4GI8A 2VZVA 4F9DA 1JZ2A 1JFXA 5A8QA 1AMYA 1JAEA 5EBAA 3AI0A 1MQQA 3SCVA 4AD1A 3W26A 1EOKA 1W3JA 4BA0A 1CECA 2CIPA 1B0IA 1C8QA 1CXIA 3AROA 1X6LA 3ZM8A 1J0YA 1NOUA 2VCCA 4U2ZA 3BSGA 1UQYA 3AIWA 2EPNA 4HA1A 1QHOA 2OYKA 1C91A 2WHKA 3ZIZA 4J27A 3VM5A 5FCZA 3W38A 1VB9A 1RH9A 5HDRA 1Q6DA 3MU7A 4W86A 4MB4A 1E4IA 4DWSA 1E56A 4PMQA 5EMYA 1J18A 3ARYA 1V6WA 2XVPA 2J7HA 4Z2LA 1UD6A 3PN8A 2J74A 4D6CA 4CD4A 2QMJA 1WDPA 4E8DA 5A94A 3ECQA 2HISA 5CSUA 1WNOA 4CCDA 1ZBCA 1ESWA 2PWHA 2YA2A 3CHCA 4AZCB 4J3XA 3VGFA 3L2LA 1ISYA 3M07A 3ZJKA 1CEOA 2CKSA 4LQ1A 1R86A 1M7XA 1IT0A 4TOQA 5EB8A 5AYIA 3WD3A 2QPSA 1JFHA 1QI0A 1M04A 1KXVA 3EBVA 1W9UA 5EFDA 3SEPA 1ITXA 4PTXA 1UKPA 3ARTA 3AS0A 3A47A 2DSWA 4HOXA 3N1AA 3N04A 2WKGA 3ARZA 5E09A 3QHNA 3GM8A 4PSPA 4P7QA 4CCEA 3II1A 2X0HA 5HPOA 2ZX7A 1VEPA 2HVMA 2C0HA 1G5AA 4MNMA 4X9YA 5IFPA 1HKIA 4DUVA 3VOCA 4HPGA 6TAAA 3GH4A 3W27A 1WKYA 1L8NA 2CETA 1O7AA 1G9HA 3VIOA 1NWRA 4X0VA 5D8ZA 4NSBA 5IHSA 4GINA 1AQMA 3MO4A 1ZBWA 7A3HA 1FH7A 2DSVA 1R87A 1EOMA 5A2BA 4D6EA 2YDRA 1M01A 5ABFB 1J0KA 4JCLA 2WW5A 2Z1KA 1LL4A 3WD2A 3L2MA 1CGXA 2JALA 2JEQA 1WDRA 3T2QA 2UY5A 5JBEA 2ZX5A 2VOTA 1LQ0A 4OZOA 1QNSA 2WB5A 4ATLA 3UG3A 3WQ5A 4H41A 4ZENA 4JHZA 3T0BA 4JFWA 3RM9A 5A95A 2E40A 1E6SM 4M24A 4D6IA 5FKYA 3VPLA 1R7OA 3W6MA 1KR0A 3CUGA 1XYZA 4WSKA 1R7AA 4DWSD 3B9DA 3WDRA 1CIUA 5CXPA 4QLJA 1RD6A 3VX0A 4HU8A 1UYQA 4WLCA 3EMCA 4FLOA 2VMFA 4JHOA 5FIPA 3VDHA 2XGIA 3VD7A 2BXYA 1EHNA 4JZ5A 2WK2A 4AISA 2ZOXA 2CBIA 3BAKA 2D0HA 1VFOA 3VNZA 2WYSA 2YJQA 2XM1A 5M03A 4AMCA 3EMZA 3CGTA 2VURA 4C7FA 4RE3A 5CSYA 5JUVA 1WO2A 1WZAA 1X1NA 1QI4A 4WJXA 4GIAA 3PTMA 2VI0A 2CESA 4QCFA 1UD8A 2J4GA 3EMQA 4V27A 2VO5A 4S3JA 4UTFA 3SCPA 4RE4A 2E8YA 1FHLA 1ZBVA 2WBGA 2DIJA 3CPUA 3T0DA 1ZS2A 2E0PA 2GK1A 2WAGA 1E43A 1HF6A 3FHQA 3ZQ9A 3AHVA 5E0FA 2W63A 1MFVA 5HOSA 2EEXA 4UZUA 3VILA 1RPKA 5E0CA 2ZIDA 3MANA 1A3HA 4AZHA 2WVVB 2GJXB 4D6DA 1BPLB 3ARUA 1J0IA 2EJ1A 1TCMA 3K8MA 1NWUA 4MADA 2Y2WA 3WEMA 1M53A 1W1YA 2W67A 1OINA 1XHGA 4TXEA 5JIWA 4C90A 1JZ4A 3VM7A 1J0JA 5A2CA 4ACZA 2G3MA 2VRJA 3WQ4A 2XSBA 5BCAA 3WNLA 4MNKA 1TMQA 2O9RA 3ZJ7A 3AYSA 2XGBA 5M3WA 3CZJA 3AZSA 3WKZA 3BSHA 2WCSA 3EYPA 4CN1A 4K68A 1HNYA 3BCDA 1GOMA 3CZKA 4PRWA 3BGAA 3TTQA 4BCEA 2ZXAA 3W6LA 2CERA 2J7BA 3QGVA 1F4HA 1F4AA 3AHTA 1EDTA 1UH4A 2DH3A 1CDGA 3WD4A 3I3BA 1Q4NX 3K46A 3APGA 1JYNA 3QR3A 3IK2A 1VBRA 3VGEA 2XM2A 1OGBA 3MSGA 3SCOA 4DUWA 3VIFA 4JFVA 1C3FA 1UR4A 1K6AA 3OGVA 3UR8A 4AW7A 2XWEA 1NWTA 4OBRA 4PCTA 1R85A 1MFUA 3DHPA 4QDMA 3KZSA 3THDA 1CYGA 1HP5A 3OLGA 1SMAA 2PWFA 1QI3A 3WNNA 1NOWA 4DM1A 1GOOA 5I2UA 1OM0A 2X05A 4Q7NA 2FHFA 1VJSA 1HJVA 2V3FA 3RILA 1JXKA 2XIBA 1BF2A 2O92A 3W25A 1CNVA 1LL6A 3AOFA 2ZUVA 2E4TA 1IV8A 5HNNA 2CNCA 2YL9A 2D20A 2ZUWA 5JBDA 4QP0A 1BFNA 3GDBA 1UHVA 4KRTA 2EQDA 3LPOA 3BAIA 1CGUA 1E6RA 1HJQA 3GH5A 3AIRA 3CTTA 3LMYA 3SUWA 5JBFA 2D0FA 4HMEA 1LG2A 1JDAA 3AIUA 4UQBA 1TG7A 4LYRA 7CGTA 1QPKA 1S46A 2PF0A 3B9EA 2VX4A 2OLHA 4Q22A 2FDMA 1BAGA 4CUCA 1VBUA 3RM4A 1EA9C 2NT1A 3W37A 1W9XA 1WCGA 4HA3A 5CLTA 2V3EA 3L4VA 2DIEA 1JZ7A 3GZAA 3U57A 4NF7A 3NDYA 3BAYA 5E6YA 2YLAA 3RPMA 4AD0A 4FLQA 2VX6A 1WZMA 2OWWA 2E9BA 4UFLA 3AMDA 4AEEA 1UA7A 2OSXA 3SIMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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