2WZHA

Btgh84 d242n in complex with meumb-derived oxazoline
Total Genus 223
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
223
sequence length
585
structure length
572
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFNDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Visualizing the Reaction Coordinate of an O-Glcnac Hydrolase
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 223
structure length 572
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2009-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2wzhA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2wzhA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2wzhA01
1W1PA 2CCRA 2NT1A 2VRJA 2WZIA 2CEQA 2ZICA 1JZ8A 5LYRA 4JFTA 3GYCA 4X0VA 3CZKA 3U5YA 1ITXA 2JF7A 3MMDA 4CN1A 4FLRA 2QPUA 4HA4A 3WD3A 5KZ6A 1WPCA 2FGLA 3N13A 2EEXA 3MUY1 7CGTA 1C91A 3K46A 1NOFA 1LG2A 2WYSA 1LLOA 1VFUA 1WDRA 3GNOA 4AW7A 4A3HA 1FH8A 2XVKA 2AMGA 4N42A 4AMCA 3WD1A 1BPLB 4PCSA 1DP0A 1H09A 4XV0A 4RE4A 1MWOA 3NCOA 2AOSA 1GOIA 2RGMA 3POHA 3VGFA 1QHOA 3AHVA 2WCAA 4NF7A 2EPOA 2QMKA 2CPUA 5DF0A 3AMLA 2PWDA 4W8BA 3L4UA 3WD2A 4B9ZA 1JF5A 1ZU8A 2J7GA 1A47A 1K9TA 1TE1A 1BG4A 1ZBKA 1DWGM 2BHUA 1V6WA 1EIBA 4AIOA 5D9PA 5A3HA 1HT6A 4OBSA 2WANA 3UCQA 1UR2A 2E8ZA 1M7XA 1W1YA 2E9MA 1B90A 1ISXA 3W82A 4TVCA 1H2JA 3M46A 2EXOA 3AIWA 3N04A 3WNKA 1CBGA 4U2ZA 3ZR6A 1JXKA 1US2A 5EB8A 3GZAA 3WSUA 3SCNA 3W38A 1R7AA 2HVMA 1E6ZA 2YA0A 1Q6CA 1OGBA 4MB4A 1OD0A 1CGUA 2VR5A 1CXHA 5E0CA 2WLYA 4UZUA 4P7LA 1EOMA 4CN4A 3VIOA 4EK7A 3CZLA 3OZPA 2CYGA 1JNEA 1OT2A 4MADA 1EXPA 1JNDA 3OLGA 1GUVA 4AZCA 2CBJA 1VBRA 4MPKA 1R85A 3DYOA 4HZ6A 3ZSSA 4P8VA 1AQ0A 3SCPA 4PUEA 1S46A 4CD7A 3O2LA 2XG9A 4GIAA 2JE8A 4PN2A 1GOKA 5AYBA 4Z2IA 4A4AA 4J3XA 5CPQA 3W28A 3WNLA 3N1AA 2IUZA 4N0RA 1C8QA 5CQ1A 3VDHA 3WMBA 1E3ZA 3EMCA 4AZCB 1W3HA 1XSKA 5CLTA 2VCCA 3ZT5A 2QHAA 2D0FA 1TA3A 2X0HA 3VVGA 2VZVA 3VDBA 3QHMA 5BXPA 2YA2A 5FIPA 3VIHA 1XYZA 4MJ2A 1OIMA 4Y7EA 3THDA 1W3KA 1Z32X 4CCCA 4W7WA 1KXQA 1NM9A 4DUXA 2GDUA 4JKMA 4HZ8A 3WDIA 3OLEA 3WNNA 2D22A 4BQ3A 1TA3B 2OWXA 4E8DA 2TAAA 3VIIA 2XFRA 1ISVA 4ZENA 1HN1A 1TVPA 4BA0A 3WF4A 4M80A 3MKKA 4AEFA 4HMCA 4MDOA 1KQYA 3T2PA 4GKLA 4H41A 3BCFA 3FN9A 3SCTA 2J77A 3CUFA 1ZJAA 1UUQA 2G3IA 3WNPA 3EDFA 1CENA 1J18A 5FOOA 2V5DA 2EPNA 4UQDA 3WQ8A 2ZIDA 3WUGA 1MW3A 2E0PA 1E43A 4MJ4A 5I0DA 5A6SA 4J3UA 2ZX9A 3TTYA 3BAJA 5I24A 4W8LA 1JD7A 2C8NA 2VR4A 1JYXA 1JDAA 4AD1A 4J7RA 1MQQA 3ARWA 5E0FA 2VCBA 4KGLA 2B31A 3VKKA 4IPLA 3E1F1 1PPIA 2DGAA 2E3ZA 5GNZA 1V6YA 2BY2A 2FHBA 3L4WA 4W7UA 2BY1A 2XVNA 2WMFA 4KRUA 5A69A 2OYKA 1UD6A 2Y8KA 4UQAA 4H8UA 1J0YA 2ESCA 1KGUA 1HP5A 1CYGA 2QLYA 1MQRA 1CGWA 2VVNA 5GNXA 1WB0A 5DT5A 3S6TA 4ZEPA 4TUFA 2WHLA 2DSZA 5FCZA 2VI0A 3HMCA 1QNOA 1V6XA 1WCGA 9CGTA 1XC6A 2W63A 1E73M 1CGTA 1KR1A 4AD4A 1BLIA 2DSKA 1JF6A 2DT3A 2VJXA 2YIHA 1E55A 1KQZA 3VGBA 4XZBA 1G9HA 2GVYA 2PI6A 1NARA 3RM9A 4MAZA 1DWIM 2CERA 3RM4A 3WY1A 4L4PA 3VTRA 4UNIA 1W9UA 4ACZB 3WN6A 1OBAA 4LGXA 3T09A 4GZIA 3UR7A 1HF6A 3MU7A 1KCKA 4BQ4A 2DDXA 1CDGA 4BZYA 3WDQA 1K9DA 1JDCA 1ECEA 3KL0A 3SEPA 1CECA 1CNVA 1HNYA 3L4XA 3BGAA 1TMQA 1QNPA 4CVWA 1E4NA 3WKZA 2BXYA 1GQLA 3IJ8A 1DWFM 1TZ7A 3WUFA 1NWRA 3A4WA 3CGTA 2PWEA 1B30A 4J27A 3QGVA 2CESA 2JALA 3MSGA 3W6MA 3ALGA 1E0XA 3ZT7A 4ZXOA 2WBKA 2J7EA 4QLKA 4ATWA 1ZJBA 4CD8A 2WHKA 2DSUA 4NRSA 4UQBA 1R7OA 3AIVA 8A3HA 1EHAA 4GINA 3N9KA 2DPEA 3ZT6A 1BVNP 1XHGA 5LA0A 1JFHA 2XPKA 3MUZ1 2VX4A 5AYIA 1OT1A 5IFPA 2RGLA 2ZXBA 1BGAA 1CXEA 3GXIA 3VMPA 1SMAA 3KZSA 1MVYA 4W5ZA 1E72M 4PCTA 1QHZA 1UKPA 2WVSA 4GI9A 1TR1A 5JBFA 4E4PA 2XIBA 3K1DA 4B16A 1XH1A 1E0WA 1ZB5A 5HDRA 1IT0A 3PZUA 4JL1A 1ITCA 2W91A 4U2YA 1C3FA 5AC5A 4CKQA 1OINA 3CZ8A 2YBTA 3UESA 5CSYA 1B31A 2XM2A 3KEHA 3AMCA 3RJYA 5CZKA 1E6PA 4JFVA 1V6UA 3SCUA 4GO8A 3ARSA 1WDSA 3GDBA 2J25A 3RMEA 4W86A 4PMRA 1M53A 3SUTA 3W29A 1VB9A 3VX1A 1UG6A 2WNWA 1GHRA 4JFWA 1VF8A 4D6HA 1UKQA 1AMYA 2A3CA 1HJUA 5ABEA 4PTVA 3FAXA 3WDHA 1X1NA 2ZUTA 2WZHA 3CZEA 1B3YA 1IV8A 4URIA 2WWCA 3ZOAA 2V3EA 4WKHA 2D3LA 3ALFA 3VILA 4QCEA 3ZIZA 1UKSA 4OOUA 1M01A 3A3HA 2PC8A 3WH5A 4PRWA 4R27A 1HKJA 3T0BA 3ZQ9A 2XM1A 1UYQA 2PWGA 4LX4A 1W9PA 2J7DA 3WF2A 1LJYA 4E2OA 5M3WA 1MW0A 4TX8A 1B3ZA 4KWUA 4UQCA 1GORA 1V0KA 2BXZA 1JL8A 1M04A 1B3VA 4IUGA 3WF0A 1QBBA 2GFTA 3TTSA 4AIEA 2YJQA 3WFZA 1U33A 4UFIA 4YHEA 3PZVA 3AHTA 5M17A 4QP0A 1O7AA 2PWFA 4GO9A 2JEPA 3ZO9A 1VFMA 3VIPA 4WIWA 3VO0A 5BWFA 2XIIA 1NP0A 4J3VA 4KRTA 1RH9A 1FHDA 4CD5A 2ZUVA 4UOQA 1TG7A 5A8PA 3WH7A 1Q6GA 1V02E 1WDQA 4GZEA 2DIEA 1E70M 3J7HA 3W4RA 1WZKA 3L2MA 1QI3A 5A6BA 1V3JA 2CNCA 4RL3A 1W9DM 2YL9A 4FF5A 3LMYA 4CCDA 2VURA 1EH9A 1C8XA 2BHYA 1QVBA 3GNPA 2V38A 2WMGA 1XSIA 2J7HA 1W91A 2OLHA 4B3KA 4PMQA 1UZ4A 3UG4A 1PBGA 1E4IA 2XVLA 1Q6EA 3IJ9A 2NSXA 1J01A 3VDAA 4H04A 3FHQA 1H4PA 3VGEA 4BQ5A 4Z2KA 3A6OA 4PBGA 2CETA 3IJ7A 3I3EA 5IDIA 3VOCA 3BLPX 3RO8A 1UR8A 4KMQA 5I77A 3ZMRA 2X09A 5I78A 2W67A 1DWAM 1CXFA 2OSYA 2FH6A 3AXHA 2J74A 2BY3A 1RP8A 4HTYA 4MB3A 1GZJA 1HKIA 3GTNA 2GSJA 3EMZA 1E9LA 1EQPA 3WIJA 1US3A 1EOKA 3IANA 3AIUA 4LPCA 5D4YA 3BSHA 3WENA 1QI4A 2X05A 4H7VA 5A8MA 5JIWA 1VBUA 2ZUMA 5GNYA 1CEOA 1MXDA 2MANA 4W84A 1LL4A 1L8NA 1YQ2A 1GW1A 4MTVA 4K68A 1UR9A 4FLSA 1KFWA 3MV11 1H0GA 1CTNA 2YL8A 1EO7A 1H0IA 1OCQA 1LF1A 5A6BD 3VINA 2G3JA 2VX6A 1SYTA 4PEEA 4PMOA 3QOKA 4PTWA 3NYDA 4M82A 3F5JA 1OWQA 2DQXA 6TAAA 1UH2A 2XHYA 3CPUA 2WB5A 1XSJA 3AQUA 3TTQA 1J0KA 1B9ZA 4JFSA 3IAQA 3UG3A 1J9YA 1DTUA 2D20A 3WQ5A 2J75A 3VGHA 3S2CA 3GH7A 1V3IA 2J8FA 3HN3A 1ZL1A 3GXMA 2C7FA 2VZOA 1TCMA 1HXJA 3MUAA 2O9RA 3K8LA 3SCQA 3OGSA 3GH4A 1BYDA 4HPHA 1ISZA 4Z2HA 3L4TA 1UD3A 1V3HA 5BCAA 1VENA 4TX6A 4UZSA 2ZXAA 3LPFA 3SUSA 5E9AA 1V0LA 1C7TA 4TTUA 1JYVA 3RM8A 2PWHA 4UR9A 1ZBWA 5HPOA 2ZUWA 2GJRA 1NP2A 3SCRA 4F9DA 1UD5A 2JIEA 4V28A 1J12A 2F2HA 2G4FA 3NDYA 1CGVA 1E6NA 1QW8A 2WMJA 3U7BA 1BYAA 3U7VA 1HP4A 3CMJA 3VIMA 3U57A 4F79A 1WZLA 1GOMA 4PMNA 2ZWYA 4DM1A 3VGGA 2J4GA 3KL3A 4C7GA 1CXLA 7A3HA 5GQBA 1ZS2A 1E5JA 2XUCA 4D6JA 3EBVA 1KXVA 3G6LA 2XWDA 1H11A 2VTFA 2WWDA 1E71M 1TUXA 4D72A 1UKOA 1W32A 4HU0A 2YA1A 1E40A 3BAXA 1UZ1A 4CU8A 4FLQA 1FHLA 1R8LA 5DFAA 3BAYA 1WAWA 1R87A 4QCFA 1UR1A 3WNOA 1QNRA 4LYPA 3PZTA 4B9YA 5JIPA 4YPJA 5BROA 3WDJA 4DWSA 4D6EA 2WMIA 2NW0A 4HOXA 4V2XA 4IM4A 4MNKA 2W5FA 1TVNA 1CGYA 4OUEA 3AMKA 1KBBA 4PSPA 3IK2A 1JIBA 1QW9A 1W2PA 3HU7A 4OOZA 4X0NA 3VX0A 4DWSB 5BRQA 3SCSA 1VRXA 3FAWA 1M03A 5F7UA 1K9EA 1H41A 4AZBA 2XSBA 3G6MA 3CHEA 2O92A 4HOZA 2YDSA 3EDDA 4CUCA 1HJQA 4DWSC 1LQ0A 4J28A 2G3NA 4M29A 2F61A 3AS1A 2GJXA 5HPCA 1VJZA 1GONA 3LPOA 2NT0A 3VGDA 4QLLA 1JD9A 3OLDA 1D3CA 3UERA 1VIWA 2WK2A 3BAKA 4MNMA 2CHOA 1UWRA 4GZJA 1OSEA 5CLWA 2J7FA 3OLIA 3CUGA 4Z2JA 4QDMA 2WLZA 2YDQA 1RP9A 2VCAA 5JUVA 2IXUA 3WL0A 2GJXB 4CD6A 4H8VA 4DUVA 4OJYA 3ZJ6A 1PX4A 4M1RA 3ARVA 4CU7A 3I3BA 1O6IA 2YDRA 2CKRA 3VD5A 1E0VA 4JIEA 3GBDA 2J78A 3VNZA 2F8QA 2BVYA 1BQCA 5ABFA 4DWSD 3AHYA 3MS8A 5C71A 1C8YA 2VZSA 3WUBA 3AMDA 2FGZA 1AVAA 4UFLA 3O6AA 4PTXA 3VMOA 3VD9A 1V0NA 2J7BA 3D3AA 3DHUA 3T08A 4XB3A 1UQYA 3NIYA 1JG9A 3WH8A 2FDMA 1FOBA 5A8QA 1XRVA 1J0HA 1QHPA 5ABFB 1CIUA 1HL8A 3RIKA 1NQ6A 1Q6DA 3DYMA 4WSJA 3VUPA 4KGJA 3NJ3A 2VZUA 4CD4A 1JZ7A 3AIQA 4H2CA 1E56A 4ZFMA 1K9FA 4D6FA 5CXPA 1YHTA 1MQPA 3BSGA 1QNSA 1VFOA 1HKMA 3AHZA 1BTCA 2V3GA 2VC9A 3VMNA 3AZRA 4AWEA 1PIFA 4XUYA 3WF3A 4S3JA 3N15A 2Y2WA 2AAAA 4D1IA 1WKYA 4W8AA 1L0PA 2D1ZA 3BC9A 3APGA 1D7FA 3II1A 1FA2A 3THCA 1NOWA 5E09A 3CHFA 3SCVA 3M7SA 1UWIA 3ARXA 3OIHA 1SFSA 4C90A 4OKDA 3RJXA 2UY4A 2PF0A 1VEOA 2J8GA 3AISA 1H3GA 4CGTA 1G0CA 5IHSA 3FY1A 3W25A 3WELA 3VM7A 4LYQA 1G1YA 3L2LA 1UD4A 2A3EA 2WMKA 3VD7A 2YLLA 4CN6A 1QBAA 3EDJA 1JXJA 4D6GA 3WD0A 1BAGA 2JIWA 4Q7NA 1QI5A 4WKAA 3WDPP 4TXEA 1WNOA 1I1WA 4UFJA 2WC3A 4JHOA 3ARYA 4EANA 3MANA 2ZX8A 5DO8A 2QV4A 3RDKA 5BYWA 1PX3A 3VDCA 5EFFA 1WZMA 1XCXA 4W85A 3WFLA 2BS9A 2ZOXA 1GQIA 5BXRA 5A95A 2OWCA 5BXTA 1J0ZA 3PZNA 1E1EA 4QFUA 1LL6A 2A3BA 1W1TA 1UH3A 3D5HA 1F4AA 5M03A 2DH2A 4M81A 1IZJA 2FHFA 1OD8A 1GVIA 1JYNA 3W0KA 1W9BM 2DSWA 3GXFA 3CLWA 3M07A 1KR0A 2WVUA 4C91A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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