The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
40
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sequence length |
117
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structure length |
117
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Chain Sequence |
QEHKPKKDDFRNEFDHLLIEQANHAIEKGEHQLLYLQHQLDELNENKSKELQEKIIRELDVVCAMIEGAQGALERELKRTDLNILERFNYEEAQTLSKILLKDLKETEQKVKDIQTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Roles of Structure and Structural Dynamics in the Antibody Recognition of the Allergen Proteins: An NMR Study on Blomia tropicalis Major Allergen
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Mite allergen Blo t 5
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| molecule tags |
Allergen
|
| source organism |
Blomia tropicalis
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| total genus |
40
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| structure length |
117
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| sequence length |
117
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JMH A; 2JRK A; 2LM9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2L9Q A; 5AQI B; 2D9D A; 3ZYM A; 3UUB A; 5ABF B; 2G0U A; 1ZV4 X; 4OHF A; 2H89 A; 1YD8 G; 5ABE A; 4MFR A; 4O4I E; 3MJX A; 2MPK A; 4LML A; 1IBK T; 4IDP A; 2SPC A; 3J7Y q; 3NVO A; 4JI2 T; 2DCF A; 3VRA A; 2UXC T; 4DBQ A; 2EHO C; 5L3D B; 4N78 D; 4OFZ A; 4DV6 T; 1YKH B; 2YN6 A; 3UTK A; 4L5G A; 1IJ5 A; 3ABV A; 3PJA J; 1W09 A; 1HFA A; 3AEC A; 3AE2 A; 5HCJ A; 5HXH A; 4JI7 T; 3X1D A; 3ZKR A; 4P0B A; 1ZEE A; 1M7K A; 4E7S A; 5ETW A; 4DBR A; 2BZB A; 3FBZ A; 4ZXL A; 4QH5 A; 3K1S A; 1HX8 A; 4QXC B; 3CX6 B; 1S94 A; 1D0Y A; 3PUA A; 4TN7 B; 2P9B A; 3H37 A; 3OTO T; 2LM9 A; 3ZMS B; 4LF4 T; 2QGS A; 2XAS B; 4H9Q C; 5LHI B; 4JV5 T; 4KHP T; 3ONJ A; 5HCM A; 4EB6 E; 4XBF B; 5LG4 A; 4GIW A; 4NXM T; 5LGU B; 3K3N A; 4DV7 T; 4G2A A; 4CXY A; 5BR8 T; 1FJG T; 3ZLI A; 1D1C A; 1MND A; 2KWI B; 2UXB T; 1R8I A; 5LMN T; 3OBV E; 3V5S A; 2LRK A; 2Q9Q A; 1FMW A; 3CQC B; 3AEF A; 3SFE A; 2KSR A; 3UU8 A; 2KWH A; 4X20 E; 2QVA A; 2CXL A; 4HFI A; 3IHR A; 5AQM B; 3TLU A; 5DJQ C; 3LSV A; 2CPT A; 2VUR A; 1MIY A; 2KIN B; 4U7I A; 2RP4 A; 4ILC A; 4WNK A; 2YDR A; 3UUX B; 3GN5 B; 4M1P A; 5EK2 A; 5IUX A; 4U74 A; 2L3L A; 1ZKE A; 2YKS A; 2LHN A; 3MA9 A; 4QX8 B; 3ZN0 B; 4TV9 E; 3RLF F; 4EED A; 5HAX A; 3N2G E; 4IE6 A; 1UCU A; 5CB4 E; 4IE5 A; 4ILU A; 5CA1 E; 5FL1 A; 2ES0 A; 5LGT B; 4HFH A; 4CZZ B; 3B13 A; 3TLS A; 3N5L A; 2I0M A; 2UU9 T; 4X66 T; 3R84 B; 2NW7 A; 3RIU C; 1HCI A; 2X0H A; 1T8B A; 5LCY A; 3DTO A; 1OED B; 3ZEF B; 4JI3 T; 2X9X A; 2XQ4 A; 5JRE A; 5JR9 A; 3HR0 A; 2LSG A; 2VL8 A; 1XMQ T; 2IAK A; 2MYS A; 3P4Q A; 4IRE A; 2M6B A; 4ZS3 A; 1W0B A; 4HFV A; 5JDG A; 4O2B E; 2F4V T; 3AAI A; 2X66 A; 4I55 E; 4B6X A; 3HKB E; 3AE7 A; 4F6R C; 3UQ7 A; 4C90 A; 3L09 A; 2IIU A; 5FMN A; 4L0R A; 5EZY E; 4J2C A; 4PK5 A; 2WMN A; 3OJA A; 2XQ8 A; 3UFG A; 2DWK A; 3PUV F; 3AB3 B; 5FXV A; 2WY2 A; 4TWD A; 1N32 T; 3N2K E; 2N1G A; 3PUY F; 4TV8 E; 3ZJ1 A; 2W62 A; 4Z8X A; 1WR6 A; 2A72 A; 2XPK A; 2KXP B; 3QB5 K; 5LP6 E; 2IML A; 2BG9 B; 3LFM A; 2XM1 A; 2CBI A; 2VAS A; 3EDV A; 2ZM8 A; 2E9X D; 3VKH A; 2WB5 A; 2W0G A; 4ZZB A; 1AJ3 A; 2X0L B; 1L0V A; 5JRC B; 3P7I A; 5FNV E; 1KNR A; 4LF7 T; 3HL6 A; 1N34 T; 4DUY T; 3CML A; 4HKA A; 2R6G F; 3A7M A; 5J2U E; 3P8C D; 2XY8 B; 2CRB A; 5A1L A; 1XNQ T; 3LDQ B; 4UF0 A; 4PK4 A; 2E2A A; 4LF5 T; 2JQH A; 4AKG A; 1J1J A; 5ABH A; 4GKK T; 1SE7 A; 3O1H A; 4UXN B; 1CHU A; 2LLY A; 5AQU B; 3UU5 A; 2UUA T; 4KX6 A; 4PK6 A; 5HXS A; 4B3S T; 4AQF C; 3AE9 A; 4O4H E; 4HGA A; 3ZCJ A; 2LE8 A; 3RF1 A; 2V8S V; 3P4W A; 3L3P A; 3AA0 B; 4V1A v; 1N33 T; 3FZM B; 4EGW A; 2FJA A; 3WI3 A; 1E1H B; 2WS3 A; 5KX5 E; 3A8Y C; 4HFD A; 2DL1 A; 3L8R A; 4TX5 A; 4JI5 T; 2Y48 B; 4ZI2 D; 1BR4 A; 4PW8 A; 1KK7 A; 3GWH A; 3KV5 A; 1W9R A; 2LSI A; 4AI6 A; 2V7I A; 4NIQ A; 1D0Z A; 3P50 A; 4O2A E; 3UU4 A; 4QHO A; 4LFA T; 4KP3 C; 3FHN A; 2XQ3 A; 4A56 A; 3NRX A; 2B1E A; 2GK9 A; 5L47 A; 2MBG A; 3KBU A; 2WWU A; 1E2A A; 1E7P A; 1XDO A; 3F2E A; 3PTR B; 4H9R C; 4KI0 F; 1G73 A; 5FY1 A; 2LT3 A; 4COF A; 2JQ9 A; 2J4G A; 5HEU A; 1YXR A; 3KFW X; 1T72 A; 4IE4 A; 3AVS A; 5FY7 A; 4U3C A; 5CGM A; 4I0U A; 3M3Z B; 3RGL A; 3AA6 B; 4DV2 T; 3AA1 B; 3DJB A; 2V5D A; 5EK3 A; 5LGN B; 4PJN A; 5AQF B; 2Y6X A; 2CEA A; 3BQI A; 1U5P A; 1FMV A; 2V5C A; 3N9M A; 3OPC A; 1I6Z A; 5FL0 A; 3CK6 A; 3LBX B; 4ISS A; 1EZ3 A; 2RA1 A; 3T8O A; 1ZOY A; 1VCT A; 4IDN A; 1SHZ C; 4O8S A; 5M4Y A; 3ONL C; 2UXX B; 3SWH A; 1HR0 T; 4FJO A; 3N9P A; 3E0Z A; 4UVA B; 2BKN A; 2FBW A; 3WAJ A; 5JTG A; 3I1A A; 2XQA A; 3MXZ A; 5JDH A; 5L3C B; 2H7O A; 3N9L A; 3CWZ B; 5LJN A; 3M65 A; 4DR2 T; 3RKG A; 2IHR 1; 3HKD E; 4IHJ E; 2FJB A; 1HG2 A; 2W66 A; 2CWY A; 1OED C; 2PG8 A; 3IF8 B; 2NR4 A; 2CXF A; 4MLK A; 4JEU B; 2BKO A; 3I9Y A; 2XTL A; 3B5M A; 2ODU A; 2W00 A; 3Q5E A; 3C4W A; 3QUJ A; 5CA0 E; 1XZY A; 3FBL A; 3NZP A; 4GYS A; 3TLV A; 5AQS B; 3EAB A; 1Y64 B; 3ANW B; 3B57 A; 5FP3 A; 4DID B; 2CXD A; 4OYK A; 4DVD A; 5LNK A; 2XAF B; 5AQL B; 3NWI A; 3TLW A; 2M67 A; 5AQK B; 2OA5 A; 5JH7 E; 5JDQ A; 4P0A A; 4NXN T; 2E9X A; 2BVL A; 1X79 A; 3C98 B; 1OWA A; 2XAJ B; 3JC6 C; 2W61 A; 4P1N A; 4EAH A; 4U7Y A; 3CX8 B; 4DV3 T; 3TKL B; 2V6Y A; 2YDQ A; 3DP7 A; 3PU3 A; 3ZJ2 A; 1QUU A; 4EZH A; 2BG9 C; 4JI6 T; 2D0T A; 2CM0 A; 2V26 A; 2E5V A; 5JQG E; 4YLH A; 3O9X A; 4HFB A; 5LBM A; 5C2T A; 2BKP A; 2WWV A; 4F8H A; 2CLY C; 5BMV E; 3PUX F; 5DQV A; 4I43 B; 1XDP A; 1VCS A; 3GN5 A; 4LMK A; 4YTN A; 4TWF A; 1FIO A; 2YU2 A; 2UUC T; 2K9A A; 4DV1 T; 4LFC T; 3EAM A; 3UQ4 A; 2UXN B; 2NW9 A; 1KNP A; 2J62 A; 2AE9 A; 4NPP A; 2D5U A; 4IDO A; 1WYB A; 5LJM A; 3I0Q A; 4ASK A; 5FKY A; 1N36 T; 3AEG A; 3RC8 A; 2V1D B; 3PJA A; 4JI4 T; 2QRX A; 2XUE A; 3U78 A; 2C5K T; 4A5X A; 5IWA T; 4B3M T; 3EHZ A; 5ABG A; 2H7V C; 2MAW A; 2XQ7 A; 3PUZ F; 2BVM A; 3IEE A; 2QYW A; 2WU5 A; 1LRZ A; 2A2F X; 2W2U A; 1BR2 A; 5L4H A; 4JI1 T; 4UR9 A; 4TZ4 C; 2WDR A; 3ETV A; 4AKH A; 3AE6 A; 1US7 B; 3S4U A; 3RYI E; 4DUZ T; 1YQ4 A; 2EHO A; 3KV4 A; 2JMH A; 1NAF A; 2Q9Q B; 3A5X A; 2E5L T; 3RYF E; 4GOU A; 2XAH B; 4CI2 B; 2YEV C; 4CI3 B; 2VKO A; 3ESL A; 4BAY B; 5HXE A; 1QLB A; 2W67 A; 2C5J A; 3UUM A; 2VQE T; 1G8X A; 3JCF A; 3T1H T; 4AQG A; 5HEG A; 2JPF A; 2PTF A; 1CUN A; 1YQ3 A; 2Y8D A; 1BR0 A; 5L3F B; 4YTP A; 5DAB A; 4HE8 A; 1MIW A; 4BJN A; 3RIF A; 4CN6 A; 1ZHC A; 2ZLY A; 2AXD S; 4PAG A; 4GK0 E; 5L4E A; 1M62 A; 1HTJ F; 4KHZ F; 4X65 T; 3PDY A; 3AEE A; 2HN1 A; 4WBO A; 4YY3 T; 4H9S E; 4UV9 B; 4BJM A; 4QH4 A; 3VR9 A; 1DU2 A; 3SS1 A; 3RQW A; 5H6Q B; 3C51 A; 1XMO T; 1HX1 B; 1Y01 A; 2XM2 A; 3CVR A; 5AQH B; 5HWY A; 4IST A; 2CLY B; 4PFP A; 4A97 A; 5L2L A; 5E0O A; 1V9D A; 4AKL A; 3H3A A; 2UXD T; 4JUY A; 5J0Z A; 3RPU A; 3ZC1 A; 2CCQ A; 5LHH B; 1IBL T; 3LG7 A; 4ZI3 D; 1Z8U A; 4ZS2 A; 1UGO A; 4WW0 A; 4DR3 T; 2DHR A; 2K48 A; 3N9N A; 2XJ7 A; 4LF9 T; 4ERR A; 5AFU L; 5JVD E; 4DR6 T; 4NUV A; 3C4X A; 3VKG A; 3AE4 A; 2YU1 A; 3ZMZ B; 5LBQ B; 1O3X A; 4TWH A; 4IT4 A; 4UEL A; 3J9X 1; 5JDM A; 4QWN B; 2PBI A; 3V5U A; 1WFD A; 2H3R A; 2LSJ A; 2HN2 A; 3KV9 A; 5AQJ B; 4JEH B; 4U72 A; 3KIN B; 3C4Z A; 1WRD A; 4IGU A; 4DR7 T; 3C64 A; 2J1D G; 3RIU A; 3BQK A; 3JAD A; 5J2T E; 2WQY A; 2X9Y A; 3CQG B; 4XAX B; 4ZZC A; 2WMO A; 3OKQ A; 2IW5 B; 2YOE A; 4G63 A; 4U31 A; 5AQT B; 4BA9 A; 1IJ6 A; 2XSB A; 2FJE A; 5HXC A; 4HWD A; 4KUM B; 5HXR A; 4A98 A; 5EK4 A; 3RC3 A; 4X1K E; 4ZEY A; 2Q9Q D; 1OXZ A; 3K3Q C; 4X5T A; 4JBW F; 4U2Y A; 2BDE A; 2X9W A; 3RIA A; 5DQW A; 3Q2M A; 3PUW F; 3AE5 A; 4HFE A; 4KBM B; 1NEN A; 3JAE A; 3Q5X A; 3GMI A; 3P4S A; 3Q5D A; 2WDQ A; 2V7M A; 3QNU A; 5C3J A; 3AXJ B; 3PE0 A; 2K3W A; 2HHH T; 1UX5 A; 3IA3 A; 4IE0 A; 3LBX A; 1VOM A; 2LKG A; 3RRC A; 4DMV A; 2RPA A; 1SUM B; 3K8P C; 5J1G A; 4AKR B; 4OX9 T; 1HNZ T; 2YIN A; 4Z90 A; 3RRW A; 4ZI3 C; 3O1J A; 3JC6 D; 5CFB A; 1SA0 E; 2N9D A; 1XWM A; 4YHH T; 2WDV A; 4UEM A; 1T98 A; 2D2S A; 2JMK A; 2JIW A; 2E8I A; 2M6I A; 2CHO A; 4H9P C; 1HS7 A; 3SFD A; 3CPZ A; 4HTE A; 4U2Z A; 2LKH A; 4TUY E; 4PJM A; 4IL9 A; 1GQE A; 4WBN E; 4MBQ A; 3AA7 B; 5ABF A; 4EIW A; 4UIG A; 2FJD A; 4AIU A; 2ACX A; 2QA7 A; 2DWG A; 2I6H A; 3O1I A; 5AQO B; 4NUU A; 4DV4 T; 1UK5 A; 1KEY A; 3MK7 C; 4AQF A; 4PJL A; 2ODV A; 4UVC B; 3RX6 A; 2X9H A; 1WYC A; 2CBJ A; 3EI0 A; 2HPJ A; 4WYV A; 2X67 A; 5HEO A; 2Q9Q C; 3CIR A; 2XQ6 A; 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