The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
45
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sequence length |
102
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structure length |
102
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Chain Sequence |
MNTEELQVAAFEIILNSGNARSIVHEAFDAMREKNYILAEQKLQEANDELLKAHQAQTDLLQEYASGTEIKIEIIMVHAQDHLMTTMTLREVAIEMLELYKK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The crystal structure of PtcA from Streptococcus mutans
rcsb |
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Streptococcus mutans
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| molecule keywords |
Putative PTS system, cellobiose-specific IIA component
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| total genus |
45
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| structure length |
102
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| sequence length |
102
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature |
ec
2.7.1.69: Transferred entry: 2.7.1.191, 2.7.1.192, 2.7.1.193, 2.7.1.194, 2.7.1.195, |
| pdb deposition date | 2010-01-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02255 | PTS_IIA | PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIA subunit |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Phosphotransferase system, lactose/cellobiose-type IIA subunit |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1E2A A; 3L8R A; 2E2A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5L3F B; 2HPL A; 2CBJ A; 1WR6 A; 4AI6 A; 5AQN B; 4L5G A; 4COF A; 4HWH A; 4TUY E; 4HFE A; 2W63 A; 2CA5 A; 1Z8U A; 5FYM A; 4IDP A; 2LLY A; 5AQK B; 3C98 B; 3UU6 A; 4NXN T; 3ZST A; 1XZY A; 2I59 A; 1HS7 A; 3AE1 A; 4JI3 T; 3N9P A; 4LMJ A; 2C5J A; 4TV8 E; 3C64 A; 4WBN E; 4DV1 T; 2YEV C; 3VU7 H; 2JRK A; 2BG9 A; 1Z0P A; 5ABE A; 3ZYM A; 5LOV E; 3M65 A; 2WB5 A; 1AJ3 A; 4DMW A; 2K3W A; 1D0Z A; 4PNI A; 3HL6 A; 4IIJ E; 5L3D B; 4UEM A; 3E0Z A; 5AQO B; 4KX6 A; 3RC3 A; 3AE8 A; 2KLQ A; 3ZT7 A; 3F31 A; 2Y8D A; 3KBU A; 5J0Z A; 3C4X A; 2M6B A; 1W0B A; 4YHH T; 3FBL A; 4HFI A; 2IDO B; 3VKH A; 5JR9 C; 5AQU B; 5FY7 A; 2RP4 A; 2A9U A; 4L0R A; 4HFV A; 3KV4 A; 3PUY F; 1FEW A; 3EHZ A; 3UUB A; 5L3B B; 4UXN B; 4F8H A; 2W62 A; 3ZC1 A; 4C90 A; 2XSB A; 3KBT A; 4EOZ B; 2XAG B; 4DV6 T; 3RI5 A; 1XNQ T; 5HYA A; 3LFM A; 3RIU C; 2ZM6 T; 5F8P A; 3KDS E; 3RRW A; 5DJQ C; 3P7I A; 4U74 A; 4DID B; 3RX6 A; 2ZM8 A; 2YK0 A; 1S35 A; 4DR7 T; 2V7L A; 4G63 A; 3LDQ B; 5ADX L; 3SOL A; 2JIW A; 3CQX C; 4ZZB A; 2BVL A; 4YY3 T; 4QHO A; 2YU1 A; 4JV5 T; 1NEK A; 3MXZ A; 4ZXL A; 2VKJ A; 1ZOY A; 1Y01 A; 2IML A; 3RQW A; 3AEA A; 2XAS B; 4UVA B; 1YXR A; 4ILA A; 2QYW A; 1UCU A; 4Q25 A; 2NTX A; 2E9X A; 5AQT B; 4YLH A; 4PJJ A; 1G73 A; 1E2A A; 3AXJ B; 3ZMV B; 3UUM A; 2YDQ A; 2JQH A; 4JUY A; 1ZEE A; 3QB5 A; 3LK4 2; 3KVB A; 2X9H A; 3AEG A; 1IAP A; 2JQK A; 2CBI A; 1MMD A; 1MIY A; 2VKH A; 3N2K E; 5HEH A; 2LRL A; 2DCF A; 5JDG A; 2V5C A; 2WCA A; 2YKS A; 5M4Y A; 2XJ7 A; 3FZL B; 4HTE A; 4YSY A; 4MBQ A; 2P9B A; 1HR0 T; 5CFB A; 3CX8 B; 4V1A v; 4DV0 T; 2X0L B; 1LVF A; 5LP6 E; 2UXC T; 2OV9 A; 2SPC A; 2CHO A; 2I0M A; 4EED A; 4JLE A; 4GK0 E; 4O2B E; 3SS1 A; 1EZ3 A; 1WYB A; 1OED E; 3O4X E; 3CQC B; 5H6R B; 2J47 A; 3PUS A; 5TAO A; 2X0Y A; 4DV3 T; 1M7K A; 3X1D A; 3ONL C; 1IZN B; 2CLY B; 5LGT B; 5LA6 E; 3UU8 A; 3VRB A; 2XTL A; 5ETW A; 1IBL T; 1U5P A; 4X62 T; 4EB6 E; 1MND A; 5JH7 E; 4LF7 T; 3ZEF B; 4NXM T; 3LBX B; 2OLT A; 4YJ3 E; 3ZT6 A; 2C0S A; 3AE5 A; 4ZEY A; 4PFO A; 4KP3 C; 4BJM A; 4H9N C; 1N33 T; 1MMN A; 3TLU A; 3VKG A; 1OWA A; 3AE3 A; 2LHR A; 4EV6 A; 2ZLY A; 4WBO A; 2WAU A; 3TLS A; 1ZV4 X; 5HEJ A; 2UU9 T; 5JR9 A; 3RPU A; 2N2N A; 5A1L A; 1D1C A; 1W09 A; 3B13 A; 2XUE A; 2XAJ B; 3JC6 D; 4IDO A; 3E08 A; 2L9Q A; 2XQA A; 4HFB A; 3I9W A; 1H7C A; 2HN2 A; 1V9D A; 1J1J A; 1BR4 A; 2H89 A; 2E9X D; 4LFB T; 1HX8 A; 3VHL A; 3ZCJ A; 4OYK A; 5HEU A; 3AA7 B; 2X9X A; 3RQU A; 3LSV A; 3RIU A; 1UX5 A; 3U78 A; 3IBP A; 3I1A A; 2EHO D; 2FBW A; 3W15 B; 1HNZ T; 3PUV F; 4TX5 A; 3RYI E; 1YW0 A; 2DI4 A; 4NPP A; 2VB6 A; 3DP7 A; 4JI5 T; 1OED B; 4MLK A; 5FXW A; 4JI1 T; 4LF4 T; 3NZP A; 2H88 A; 4LF6 T; 3P8C D; 4PJN A; 3M3Z B; 2KND A; 3UQ7 A; 2LT3 A; 5J1G A; 5HXC A; 3OPC A; 4H63 V; 2FJA A; 3AE7 A; 2BG9 E; 2DNX A; 3P4Q A; 3MK7 C; 5L4H A; 5DAB A; 1FMV A; 4OFZ A; 3H3A A; 3FZH B; 4GYS A; 4KHP T; 1KNR A; 4AXP A; 3B57 A; 3GN5 A; 2LKH A; 2HHH T; 3HKB E; 2CWO A; 4DV2 T; 2YN6 A; 5IYZ E; 1SA0 E; 1G8X A; 2VVN A; 3LJC A; 3C51 A; 1Y64 B; 2ES0 A; 4JEH B; 4HGA A; 4LFC T; 1D0Y A; 5ABF A; 2JQ9 A; 4JI2 T; 3U3I A; 2V6Y A; 5L3G B; 3AE9 A; 2FJB A; 4ISS A; 1MMG A; 4DR2 T; 5LMU T; 3RYC E; 1SHZ C; 2KXP B; 4DR4 T; 2A72 A; 4U7I A; 2K48 A; 5HEO A; 4C91 A; 4IE7 A; 3OKQ A; 3JC6 C; 4CQI A; 4FI5 A; 3UUX B; 4IL4 A; 4B3R T; 4HWD A; 2XM2 A; 4CXW A; 2CCQ A; 2WDR A; 4H9S E; 4DO0 A; 5CA1 E; 5JTG A; 3RRC A; 4E7Z A; 2X0H A; 4PK4 A; 5LXT E; 5AQM B; 2H7O A; 2V26 A; 4DR1 T; 1WCR A; 4H9Q C; 4P0B A; 3PUW F; 1HNX T; 2EHO C; 1UUS A; 3ZCI A; 4IGU A; 1UK5 A; 4IDN A; 2K9A A; 4OK0 A; 4TV9 E; 4P0A A; 1W9R A; 4B3M T; 3CK6 A; 4PK5 A; 3N9Q A; 1QLB A; 1OXZ A; 3GA8 A; 3JAF A; 4DBQ A; 3J7Y q; 3K3N A; 4H9R C; 1ZKE A; 5JRC A; 1T98 A; 1KK7 A; 2LKG A; 4IE4 A; 2NP9 A; 2BS4 A; 2F4V T; 3BQL A; 3P4S A; 3C50 A; 2VAS A; 2BG9 B; 2WMN A; 4A98 A; 2XQ4 A; 2QRX A; 3Q5D A; 1YD8 G; 5LYJ E; 1L0V A; 5LMN T; 1MIV A; 2WZH A; 5DQW A; 2QVA A; 4ERR A; 2YIN A; 4EYU A; 4I4T E; 4X5T A; 4U72 A; 5IHY A; 2PFV A; 5C2T A; 2XPK A; 1FJG T; 2V5D A; 3ZMS B; 4CXX A; 1I94 T; 3CWZ B; 2NOX A; 5LJN A; 4HWF A; 4UV9 B; 2LM2 A; 2C5I T; 1KF6 A; 4U31 A; 1I6Z A; 4GIW A; 4CI2 B; 2R6G F; 1HTJ F; 3O1J A; 2Z6E A; 4I0U A; 2KWH A; 1CUN A; 5AQJ B; 1N34 T; 3O1I A; 3N2G E; 2K5B B; 4G2A A; 3RYF E; 1BR2 A; 3UU5 A; 4AKG A; 1D0X A; 4DUZ T; 2IAK A; 2LJL A; 4QWN B; 3Q5W A; 4AQG A; 3HKC E; 5IUX A; 4U7Y A; 4E7S A; 3GWH A; 4ZHQ E; 4PJL A; 3L09 A; 2E2A A; 4DV7 T; 2V6X A; 5AFU L; 3CML A; 5F5W A; 3HA4 A; 3UU3 A; 5LBQ B; 4ILB A; 1QSD A; 5IWA T; 2QGS A; 2CRB A; 2MBG A; 2VWA A; 2BS2 A; 5KXJ A; 2WU2 A; 1R8I A; 2ZMA A; 4TNV A; 4X20 E; 4DND A; 2E8I A; 4TWD A; 2E9X B; 2N1G A; 5FVL A; 2A2F X; 4O4L E; 2XY8 B; 3I9Y A; 4GOU A; 2WS3 A; 2LHN A; 2X66 A; 4X1I E; 4YSZ A; 4EIW A; 3NBX X; 5HXE A; 5JDN A; 3H37 A; 4ILU A; 3SFD A; 2Q9Q A; 2K24 A; 1MMA A; 5HCM A; 4UEL A; 5AQV B; 2L8K A; 5KMG P; 2BKP A; 4K0U A; 1B7T A; 4YFS A; 3O9X A; 2X51 A; 3HR0 A; 5ABG A; 2ZM2 A; 5DQV A; 2MPK A; 1E1H B; 2EHO A; 2JMH A; 1YKE B; 3UFG A; 3RKG A; 1D1A A; 3S4U A; 2WM9 A; 5JRE A; 1HFA A; 2VQE T; 2UXD T; 3KV9 A; 3I0Q A; 1HF8 A; 3K8P C; 2V7J A; 4GK5 E; 3AA0 B; 2VVS A; 3AEB A; 5FVK A; 2XHE B; 2E5V A; 1BR1 A; 4X64 T; 1KEY A; 3PE0 A; 3Q5X A; 4CXY A; 4CI3 B; 3MAC A; 4I43 B; 1HCI A; 1BR0 A; 4IST A; 5FMN A; 4PK6 A; 4HWI B; 2XQY A; 3O1H A; 3AA6 B; 2VUR A; 4P09 A; 3EI0 A; 3AEF A; 3MJX A; 2CXD A; 1O3X A; 1HG2 A; 3ONX A; 3PUA A; 5E0O A; 5L4E A; 2FJD A; 2YDS A; 2N9D A; 2KT9 A; 4ILC A; 2MOZ A; 3K1S A; 2V1D B; 3LK3 B; 4CZZ B; 4QX7 B; 2C5K T; 4A97 A; 5FKY A; 4DBR A; 3C4Z A; 3LG7 A; 4O8S A; 2LSG A; 5LBM A; 3NVO A; 3ZPO A; 2ZM0 A; 5JR9 B; 4ZOL E; 4TZ4 C; 3TKL B; 2V7I A; 2J62 A; 3R6N A; 4OYJ A; 3ESL A; 4PW8 A; 2M6I A; 3EDV A; 3RYH E; 2XAH B; 3K3Q C; 3CIR A; 4IE5 A; 5AQR B; 1GQE A; 2JQQ A; 2PJQ A; 2JPF A; 1XWM A; 2UXN B; 2KMF A; 1J5E T; 3NWI A; 2A3D A; 4K0K T; 3VR9 A; 2LSI A; 3OJA A; 4HKA A; 2IC6 A; 3PJA J; 2ODU A; 4YSX A; 3N9N A; 3RIA A; 2Q9Q D; 4HN9 A; 4UF0 A; 5C3J A; 4Z8X A; 5BMV E; 3ONJ A; 3FXD B; 2V8S V; 2XQ5 A; 3JAE A; 5FL1 A; 1E7P A; 3PU8 A; 2CMR A; 2RPA A; 4KI0 F; 3P50 A; 3PUR A; 2CXF A; 3AB3 B; 4EYY R; 4PJM A; 3UFE A; 4AQF C; 3A8Y C; 5EK2 A; 3RHW A; 5JDL A; 4DR5 T; 3GN5 B; 3KV6 A; 1X79 A; 3QNU A; 3P4R A; 3QUJ A; 2DL1 A; 1W0A A; 2PG8 A; 5FL0 A; 2CXL A; 5FY0 A; 3QK6 A; 5ABF B; 1MIW A; 3UUL A; 4AIS A; 3UQ4 A; 2V6Y B; 3V5U A; 2VL0 A; 2XQ6 A; 3TLW A; 4ANJ A; 2BDE A; 2W66 A; 4BA9 A; 3CX7 B; 4CI1 B; 5EK4 A; 1FMW A; 3I0O A; 2DHR A; 2IHR 1; 3P4P A; 5HXH A; 3MA9 A; 3FXE B; 2D2S A; 4A5X A; 2D0T A; 1OED A; 3K3O A; 3SRZ A; 4EZH A; 1MNE A; 4YHJ A; 2LOP A; 4LF9 T; 3ANW A; 5FNV E; 1UUR A; 2NTY A; 1SE7 A; 2OA5 A; 4FJO A; 2XQ7 A; 4MFR A; 5AQG B; 3AED A; 3OTO T; 3ZMU B; 2KIN B; 3PUX F; 2NW9 A; 3ZMT B; 3J9X 1; 3RF1 A; 5L47 A; 4KBM B; 2XAF B; 4O4H E; 4DVD A; 5LCY A; 1SUM B; 4GYR A; 2LSJ A; 3ZKR A; 2BKN A; 3TLT A; 3ETU A; 1CHU A; 2WWU A; 4EXT A; 2Q9Q C; 4U2Y A; 2DWG A; 4H63 H; 5JDH A; 4CN6 A; 3ZJ2 A; 2D0U A; 5HXR A; 5LHH B; 5JRC B; 3P4W A; 3Q5E A; 5FXV A; 3MZK B; 2W4X A; 1WR0 A; 2CM0 A; 2J4G A; 4MAL A; 4YJ2 E; 4Z91 A; 4JI7 T; 4N78 D; 2X68 A; 4QH5 A; 3ZLI A; 2W0G A; 3EVY A; 5LJM A; 3N2O A; 3FZM B; 3TLV A; 4X1Y E; 3UT5 E; 3CX6 B; 3N9M A; 4UIG A; 1KNZ A; 1NWM X; 5LGN B; 1N32 T; 4ZI7 E; 1XNR T; 4EEB A; 3A5X A; 3NRX A; 4EZ4 A; 3AA1 B; 2HH7 A; 4TWH A; 3RGL A; 3PUQ A; 2LSY A; 3LK2 B; 4IHJ E; 3L8R A; 2UXX B; 3ZMZ B; 3BQI A; 2CE7 A; 4IL9 A; 2VKO A; 4P1N A; 4TWF A; 1NEN A; 1IJ5 A; 2AXD S; 4Z90 A; 3Q9D A; 2UUB T; 5ABH A; 2WBL A; 4KUM B; 2PTF A; 1WLX A; 3CVR A; 4IDQ A; 1UGO A; 3BQK A; 4BJN A; 1VRB A; 1ZP0 A; 2GK9 A; 4O4I E; 4H9P C; 3ZT5 A; 3AEE A; 4DMV A; 3EAB A; 4IE6 A; 2LM9 A; 2JJ9 A; 4CN4 A; 5C8Y E; 5HWY A; 4DUY T; 1HG5 A; 5L3C B; 4B6X A; 3JAD A; 4QXC B; 4AQF A; 4KHZ F; 2JMK A; 1FIO A; 4ADZ A; 2DLR A; 4AKI A; 4JI6 T; 5AQQ B; 5JDQ A; 3KV5 A; 1M62 A; 4YXD A; 5KDM C; 1YQ3 A; 2UUC T; 2W00 A; 1WYC A; 5LNK A; 2IC9 A; 4MHC A; 4ZZC A; 1HX1 B; 5CGM A; 3CPZ A; 3OYZ A; 5HXS A; 4KMC A; 3OBV E; 5CA0 E; 3UUN A; 2CLY C; 2RA1 A; 4O4J E; 5HAX A; 2W67 A; 3T1Y T; 2V7M A; 3OVU A; 3IF8 B; 2BBH A; 3EUH A; 4BAY B; 2FUP A; 4AKR B; 4TN7 B; 4WW0 A; 4OX9 T; 4M1P A; 3NRY A; 3PTR B; 3RKO A; 4AKH A; 3T1H T; 2Q9Q B; 3IA3 A; 2IW5 B; 3L39 A; 2H7V C; 3JCF A; 2LEH A; 3PUG A; 3UU4 A; 3AAE B; 5L3E B; 5JDM A; 4QXB B; 5LB7 B; 4ZI2 D; 5AQL B; 5HWX A; 3H3M A; 1ZHC A; 3EAM A; 4EGW A; 5KX5 E; 2EHO B; 2XAQ B; 3QOF A; 1XMQ T; 4ZI3 D; 4JBW F; 3G06 A; 3BK9 A; 4WNK A; 2D5U A; 4XZC A; 2IIU A; 3AVR A; 2Y48 B; 3ZN0 B; 4UVC B; 3ZC0 A; 3FZK B; 1JNZ A; 2X9W A; 1VCS A; 4X1K E; 4UVB B; 4WYV A; 4DV4 T; 2ACZ A; 2NWB A; 4IE0 A; 4U3C A; 4F6R C; 3CQG B; 1NAF A; 3AE6 A; 4UV8 B; 3AVS A; 4B3T T; 4ASK A; 2E5L T; 4HFD A; 2WDV A; 1OED C; 5HEG A; 4HE8 A; 5AQS B; 4QXH B; 1S94 A; 4NUU A; 2NW8 A; 2M67 A; 3AE4 A; 3RIF A; 3MKD A; 3F57 A; 4HFC A; 2UUA T; 3ZN1 B; 3FB2 A; 2VK9 A; 3DTO A; 3FHN A; 3PU3 A; 3RH3 A; 4YTP A; 2BS3 A; 4DV5 T; 2HN1 A; 2ACX A; 3AXJ A; 5FXZ A; 2DWK A; 4DR3 T; 4PAG A; 5EK3 A; 4U2Z A; 2YU2 A; 3HKD E; 3VRA A; 2BZB A; 3ZYL A; 4EAH A; 5AQF B; 5HCJ A; 1XDP A; 3PDY A; 3N5L A; 4U33 A; 3E22 E; 3ETV A; 1HNW T; 1KFY A; 2L3L A; 2I6H A; 4LMK A; 2CEA A; 3WAJ A; 4ZS3 A; 4ZI2 C; 2PBI A; 3KFW X; 4UR9 A; 2YOE A; 2QA7 A; 4XAX B; 2J1D G; 3N9L A; 4I50 E; 4ZI3 C; 5JQG E; 3AAA B; 4HFH A; 2WDQ A; 2B76 A; 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