The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
33
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
LKANKDLISAGLKEFSVLLNQQVFNDPLVSEEDMVTVVEDWMNFYINYYRQQVTGEPQERDKALQELRQELNTLANPFLAKYRDFLKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A new haem pocket structure in alpha-haemoglobin
rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport/protein binding
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Alpha-hemoglobin-stabilizing protein
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| total genus |
33
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| structure length |
88
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| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09236 | AHSP | Alpha-haemoglobin stabilising protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | AHSP |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Z8U A; 4IDO A; 3Q5E A; 4IDN A; 3QNU A; 4IDQ A; 1W0B A; 1XZY A; 3IA3 A; 1W09 A; 3X1D A; 3OVU A; 1Y01 A; 1W0A A; 3Q5D A; 3QOF A; 4IDP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3K1S A; 5EK3 A; 2BG9 C; 4X1K E; 1U5P A; 2XQ8 A; 3O9X A; 3QNU A; 2WQY A; 4DR6 T; 2WWU A; 2E5V A; 1Z8U A; 1WR6 A; 3U78 A; 2JQK A; 4TWD A; 2VWA A; 4YTM A; 4WYV A; 4ILB A; 2CA5 A; 2UXC T; 2V5D A; 3I9Y A; 4IE7 A; 3AA1 B; 5J2T E; 5BMV E; 3EAM A; 2F4V T; 2X0Y A; 4O4J E; 4TUY E; 2NWB A; 1Z0P A; 2R6G F; 4XZC A; 2C5K T; 2CWY A; 3HI2 A; 2XAH B; 2ES0 A; 2VUR A; 5HAX A; 4U3C A; 1HR0 T; 4I4T E; 1T98 A; 3CQX C; 2LSK A; 4IHJ E; 2BG9 B; 4JBW F; 2X9Y A; 5JDQ A; 5LJM A; 2N2N A; 4U2Y A; 1IBL T; 1YKH B; 2OLT A; 5HYA A; 1MIW A; 5H6R B; 3AA0 B; 1YKE B; 2LSY A; 2WU2 A; 3CVR A; 2DWK A; 4IRE A; 3N9N A; 4WBN E; 5JR9 B; 2ZM0 A; 4DO0 A; 3CWZ B; 5LJN A; 3IEE A; 2YU2 A; 1QLB A; 2P9B A; 4ISS A; 2D5U A; 5FXV A; 2L3L A; 4U33 A; 4HGA A; 5LXT E; 1XZY A; 2Q9Q B; 3PV0 F; 3H3M A; 2E5L T; 5ETW A; 4NXN T; 4ILA A; 1WR0 A; 3RC8 A; 4U72 A; 1HX8 A; 5IWA T; 5LG3 A; 2I6H A; 2V7J A; 1KNZ A; 3ZKR A; 3C98 B; 4LF8 T; 4HWI B; 5AQJ B; 4Z91 A; 2YIN A; 3TLS A; 3T1Y T; 3LFM A; 2XQY A; 2WCA A; 2Q9Q D; 5HEJ A; 3IHR A; 2LRK A; 1ZEE A; 5DAB A; 1WFD A; 2VB6 A; 3AAA B; 3KV9 A; 2A2F X; 3SFD A; 1XNR T; 2VKO A; 3VKG A; 3KVA A; 2A72 A; 4IE5 A; 4DV3 T; 3AEA A; 4YJ3 E; 4UF0 B; 3Q5X A; 2YDS A; 4OYJ A; 4WZX A; 1OED B; 3CKD A; 3O1H A; 2D2S A; 4L9I A; 2YOE A; 2XQ3 A; 3LBX B; 4OHF A; 3NVO A; 2CEA A; 1B7T A; 2JPF A; 4IT4 A; 4CN4 A; 3B5M A; 2A3D A; 2XAG B; 4H63 V; 4ILU A; 1FMV A; 5FVL A; 4CXY A; 4FJO A; 4U2Z A; 4J2C A; 3CML A; 4K0U A; 5LHI B; 3HKE E; 3TLV A; 3PU8 A; 4P09 A; 5AFU L; 4C90 A; 4EED A; 2BS2 A; 4ZI2 D; 4LF4 T; 1FJG T; 4AXP A; 2ODV A; 4I0U A; 4JI2 T; 2UXD T; 2DL1 A; 2YU1 A; 4H9P C; 4DBQ A; 4KP3 C; 2MYS A; 1V9D A; 2BKO A; 1HTJ F; 3IA3 A; 3AE7 A; 4GKK T; 1AJ3 A; 1CHU A; 2IML A; 3IF8 B; 3QK6 A; 3KV5 A; 4O2A E; 2PTF A; 1Y64 B; 3ZYK A; 4ADZ A; 4NXM T; 2DCF A; 2XAF B; 3AEE A; 2XQ7 A; 5C3J A; 2KXP B; 2E2A A; 4GK0 E; 5AQM B; 2WU5 A; 1US7 B; 1OWA A; 3JC6 C; 3H37 A; 4G2A A; 1O3X A; 5AQI B; 3EUH A; 3RQW A; 4L5G A; 2NTX A; 4ZZB A; 1ZKE A; 3C51 A; 4GK5 E; 2LM2 A; 3RQU A; 1MMD A; 2DLR A; 4AKG A; 2JRK A; 3LDQ B; 5F8P A; 1T8B A; 5C8Y E; 5AQO B; 3PUX F; 3ZYL A; 3I9W A; 3QB5 A; 1MIY A; 2CWO A; 3PU3 A; 1YXR A; 4Z90 A; 4MLK A; 3CQG B; 4X1Y E; 5M4Y A; 3PUA A; 2PFV A; 1N33 T; 4U7Y A; 2NTY A; 1IJ5 A; 1G8X A; 5LGU B; 4WBO A; 3ZT7 A; 3IBP A; 4UIG A; 3LK4 2; 1ZHC A; 3PE0 A; 2LM9 A; 4CI2 B; 4YXD A; 4B3M T; 3FXD B; 1MMN A; 3SFE A; 2M6I A; 2JMH A; 2RPA A; 4B3S T; 3QOF A; 1JNZ A; 2H89 A; 4ZEY A; 3K3O A; 3ONL C; 3JC6 D; 4X65 T; 5F3J A; 5FNV E; 3JAF A; 3WI3 A; 3Q9D A; 5IUX A; 3W15 B; 2X67 A; 4KHP T; 3RIA A; 2LOP A; 3UT5 E; 4TZ4 C; 1I6Z A; 3FZF B; 5ADX L; 3UUB A; 4GIW A; 3NRX A; 4QXC B; 2ZM2 A; 2ACZ A; 2XY8 B; 4JEU B; 1NWM X; 2XQA A; 2KLQ A; 2C5J A; 4JI8 T; 4UR9 A; 5LA6 E; 3AED A; 4GKJ T; 4H9R C; 4ZS3 A; 4O2B E; 3VR8 A; 1VOM A; 1IJ6 A; 1VCT A; 5HXS A; 4IDZ A; 4X66 T; 4E7S A; 5BR8 T; 3ZMV B; 1WLX A; 2QGS A; 3ABV A; 2I0M A; 2V6Y A; 2XHE B; 2X9X A; 2WP9 A; 1ZV4 X; 2HN1 A; 3K3Q C; 2E9X C; 4H9Q C; 1SUM B; 3RPU A; 4A5X A; 2VL8 A; 3VHL A; 3UU5 A; 4IE4 A; 4P0A A; 3F31 A; 2UXB T; 5AQL B; 4YJ2 E; 4LF6 T; 3ZC1 A; 2QYW A; 2ZMA A; 2SPC A; 3A7M A; 4HTE A; 4PK4 A; 1WYB A; 4X5T A; 4BJN A; 4A97 A; 4YLH A; 5HWX A; 3OYZ A; 3AB3 B; 4QH5 A; 3L39 A; 4UXN B; 1N34 T; 1UGO A; 5L3G B; 2K24 A; 5JDG A; 4TX5 A; 3OKQ A; 1WRD A; 3ZST A; 4ZOL E; 4DV2 T; 4AQY T; 5IHY A; 3MZK B; 4HFH A; 5FY1 A; 2YKS A; 3MJX A; 5AQS B; 4CQI A; 3VRB A; 1UUS A; 2X66 A; 1M7K A; 4U31 A; 3AE8 A; 4QXB B; 1E7P A; 4TV8 E; 5AQN B; 3E08 A; 2VKD A; 4HE8 A; 4A98 A; 5LMN T; 4V1A v; 1BR4 A; 1N36 T; 3KBT A; 2M67 A; 5FXZ A; 3AVR A; 4AKH A; 3O1I A; 4PFO A; 2CLY B; 4QWN B; 2XJ7 A; 5AQG B; 1LRZ A; 2LSJ A; 2MBG A; 2H7O A; 2V26 A; 1HNZ T; 5FP3 A; 2LSI A; 5AQH B; 4ZI3 C; 2IC9 A; 1E2A A; 1VRB A; 1R8I A; 5LGT B; 3PJA J; 2B1E A; 1W9R A; 3FB2 A; 3AE3 A; 1KNP A; 4LF9 T; 5L47 A; 3H3A A; 3CX6 B; 5JQG E; 2HPL A; 3AA6 B; 2FJE A; 1GQE A; 2X0L B; 2J62 A; 4LF5 T; 2HN2 A; 1QSD A; 2CXF A; 4DV6 T; 2D0U A; 3TKL B; 5HEO A; 4IE6 A; 2Y6X A; 2UUA T; 5E0O A; 3P4S A; 3N5L A; 2MOZ A; 2CPT A; 3TLU A; 4IDQ A; 4DUZ T; 4AIS A; 2DI4 A; 3HKD E; 3I1A A; 3T1H T; 2RP4 A; 4TWH A; 3SWH A; 2CM0 A; 5J0Z A; 2LSG A; 4U7I A; 4JI0 T; 3VRA A; 4LMJ A; 2JQQ A; 5FVK A; 1M62 A; 4IDN A; 2CE7 A; 3VKH A; 4KX6 A; 1DU2 A; 4HFE A; 2LKH A; 4JUY A; 2CXL A; 2IDO B; 3CPZ A; 4G63 A; 3F2E A; 4ZI3 D; 3LSV A; 4XBF B; 1D0X A; 2IW5 B; 3AEF A; 4GOU A; 2BG9 E; 2K48 A; 5JDH A; 1X9B A; 3C50 A; 1HG2 A; 2NOX A; 1BR1 A; 3HL6 A; 2JQ9 A; 3RF1 A; 2VL0 A; 4HEA A; 1HS7 A; 3VU7 H; 3P4R A; 1YQ3 A; 2I59 A; 4AKL A; 4PJL A; 4DR1 T; 5LG4 A; 1HNX T; 4HWC A; 5L3C B; 1W0B A; 3EHZ A; 3AE4 A; 3K3N A; 2DHR A; 5AQQ B; 3P4Q A; 5ABE A; 2XTL A; 5CA1 E; 4E7Z A; 2FUP A; 3TLT A; 3WAJ A; 5JDM A; 3AEC A; 2LKG A; 2BKP A; 4EB6 E; 3E0Z A; 3ZJ2 A; 2MAW A; 1XMO T; 2ACX A; 5CA0 E; 1SE7 A; 2V6Y B; 4ZS2 A; 3M65 A; 5FL1 A; 1XMQ T; 2H88 A; 3AEB A; 4HFV A; 5HEH A; 3BQK A; 2H7V C; 4EAH A; 3AAI A; 2EHO A; 5HXC A; 3C4Z A; 4UV9 B; 3UUM A; 5LGN B; 2X51 A; 3FZL B; 2QVA A; 2E9X A; 3UUL A; 3GMI A; 4MHC A; 3PDY A; 4CXW A; 1HNW T; 2MTQ A; 2J47 A; 2L8K A; 2V7I A; 4A56 A; 3HR0 A; 2JQH A; 4DV7 T; 4XAX B; 3CIR A; 1U4Q A; 5L3B B; 3KV6 A; 3P4W A; 1OED E; 2K3W A; 4F8H A; 3BQL A; 2W61 A; 3PUZ F; 3RI5 A; 1D1C A; 2FJA A; 4MAL A; 5HCM A; 3V5U A; 4WW0 A; 5LHH B; 3K8P C; 2J1D G; 4PJN A; 2G0U A; 5TAO A; 3DJB A; 3KDS E; 3JAE A; 4KI0 F; 4EEB A; 3AE6 A; 2WY2 A; 1I94 T; 1UX4 A; 3C64 A; 4B3T T; 3P8C D; 3UU4 A; 3UU8 A; 1NEN A; 1J1J A; 5H6Q B; 3NWI A; 4UVA B; 2JMK A; 5CFB A; 4HWD A; 3Q5W A; 2BVM A; 5J1G A; 3RYH E; 4DID B; 3AE2 A; 3MXZ A; 3A5X A; 5J2U E; 2J4G A; 4LML A; 2WDR A; 3N9O A; 2DWG A; 4JI4 T; 3RIF A; 2UUC T; 2VVN A; 2UUB T; 4DR3 T; 2IIU A; 3ZJ1 A; 3NKZ A; 1IZN B; 3FHN A; 4DBR A; 3BK9 A; 5HEU A; 4BJM A; 3B57 A; 4HFI A; 2LHR A; 3ONJ A; 5HEG A; 4TWF A; 1FEW A; 4BA9 A; 4Q25 A; 1Y01 A; 3NBX X; 3F57 A; 5L2L A; 1MNE A; 3PUV F; 2VQE T; 4P0B A; 4CI3 B; 4IL4 A; 4DND A; 3PUW F; 3ZEF B; 3UTK A; 2KSR A; 4LFA T; 3MAC A; 2AE9 A; 1QUU A; 3FZM B; 3QUJ A; 5CB4 E; 2PJQ A; 4YT0 A; 2X0H A; 3KFW X; 2YDQ A; 2CCQ A; 1FMW A; 2LE8 A; 1YW0 A; 2W63 A; 4GYS A; 4HKA A; 4YSY A; 3RKO A; 3CK6 A; 4LMK A; 1D1A A; 4U74 A; 5KX5 E; 4TNW A; 4CXX A; 4IIJ E; 4DR4 T; 4DR2 T; 1HFA A; 1S35 A; 2UU9 T; 3G06 A; 4C91 A; 4DV4 T; 5L4H A; 3DP7 A; 3RH3 A; 4TV9 E; 5KXJ A; 2W67 A; 5AQR B; 2HH7 A; 5F5W A; 2KWI B; 2FJB A; 1XDP A; 3ZN0 B; 1MMG A; 2V7M A; 3A8Y C; 3WAK A; 3GWH A; 4FI5 A; 1H7C A; 3DTO A; 2KZ7 B; 3SRZ A; 3PUR A; 2CMR A; 2W0G A; 2XM2 A; 2LT3 A; 2EHO C; 1J5W A; 2WWV A; 4JI7 T; 3O4X E; 3RRC A; 2W62 A; 4DV0 T; 5EK4 A; 3ZYM A; 3E22 E; 2XSB A; 3ZCJ A; 5ABH A; 5DJQ C; 5LBQ B; 3JCF A; 2V6X A; 3LJC A; 4I55 E; 4OK0 A; 1XDO A; 4JYA T; 1KNR A; 2CRB A; 3ZT5 A; 4YTN A; 1XWM A; 4COF A; 4Z8X A; 4IL9 A; 4AKR B; 3LG7 A; 2W00 A; 3GA8 A; 4YFS A; 5AQT B; 3HA4 A; 4HFB A; 1BR0 A; 3RLF F; 2EHO B; 2V1D B; 3AE9 A; 5LCY A; 3ESL A; 1JNR A; 2E9X B; 1MND A; 3N2O A; 3B13 A; 2W66 A; 2VAS A; 2BBJ A; 1UK5 A; 1OXZ A; 3I0O A; 3UU6 A; 4O4L E; 4PJM A; 2HPJ A; 3ANW A; 3U3I A; 4K0K T; 3O1J A; 4IGU A; 3ZC0 A; 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5JVD E; 4DR7 T; 1S94 A; 1HF8 A; 2PBI A; 4GYR A; 2K9A A; 4B6X A; 3R6N A; 4EYU A; 2WAU A; 4X20 E; 1YD8 G; 3RYI E; 3Q2M A; 1OED C; 4AQF C; 4TN7 B; 3AE5 A; 1W0A A; 4UVC B; 3N2G E; 3RX6 A; 2WDV A; 2ZM8 A; 4ZI2 C; 2YN6 A; 4X1I E; 2C5I T; 2NR4 A; 2GK9 A; 1WYC A; 3RIU C; 3NZP A; 3ZMU B; 2Y8D A; 4NIQ A; 2C0S A; 4EZH A; 3MKD A; 3FZH B; 2WMN A; 2XQ6 A; 1WCR A; 1UX5 A; 5JH7 E; 2VQF T; 3SOL A; 5JTG A; 2H3R A; 4CZZ B; 4PAG A; 3ZPO A; 1CUN A; 3X1D A; 2LLY A; 2ZLY A; 4L0R A; 2XUE A; 5JDL A; 5AQP B; 4ZZC A; 3J7Y q; 5ABG A; 2FBW A; 3AXJ A; 4YHH T; 4YSX A; 3P7I A; 3GN5 A; 2KT9 A; 4EV6 A; 1HX1 B; 3EDV A; 3FBL A; 4LFB T; 5KDM C; 5JRE A; 4X64 T; 2KWH A; 4YSZ A; 4EIW A; 4F6R C; 4YY3 T; 5LHG B; 3OVU A; 5FMN A; 1BR2 A; 1ZOY A; 5HCJ A; 3RHW A; 1EZ3 A; 5ABF A; 1W09 A; 5HWY A; 2E8I A; 3UQ7 A; 2WSS V; 3PUY F; 4LFC T; 5JRC A; 3ANW B; 3PUQ A; 4QX8 B; 3T8O A; 4PK6 A; 2VKH A; 2D9D A; 3RRW A; 4HWF A; 3ZMS B; 4IE0 A; 1NEK A; 4JI6 T; 2N1G A; 5AQK B; 5FY0 A; 3EAB A; 5CGM A; 3PJA A; 5JDN A; 4HFD A; 4DV1 T; 4CN6 A; 3TLW A; 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