The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
MSLQMIVENVKLAREYALLGNYDSAMVYYQGVLDQMNKYLYSVKDTHLRQKWQQVWQEINVEAKQVKDIMKTLESFKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Microtubule minus-end regulation at spindle poles by an ASPM-katanin complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1
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| molecule tags |
Hydrolase
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| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
34
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| ec nomenclature |
ec
5.6.1.1: Microtubule-severing ATPase. |
| pdb deposition date | 2016-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Hypothetical protein 1500032h18. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4CN1 A; 1YXR A; 1WFD A; 4P1N A; 4U7I A; 5CGM A; 2CRB A; 2V6Y B; 4U3C A; 4U2Z A; 2WWV A; 2LRK A; 5CJ5 A; 3ZT7 A; 4U33 A; 2W2U A; 5FVK A; 5FVL A; 3ZT6 A; 2JQH A; 4NIQ A; 2XZE A; 4ZEY A; 4U2Y A; 4IT4 A; 2LRL A; 4U31 A; 4A5X A; 3ZSS A; 5LB7 B; 2JQK A; 3EAB A; 4CN4 A; 4CN6 A; 3K1S A; 2CPT A; 2V6Y A; 2DL1 A; 2K3W A; 2MPK A; 3ZT5 A; 2WY2 A; 2V6X A; 1WCR A; 1WR0 A; 2JQ9 A; 4WZX A; 3ZST A; 2A9U A; 2RPA A; 4U7Y A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EUH A; 4HN9 A; 2E9X D; 4CQI A; 2XSB A; 2A2F X; 4QXH B; 3P7I A; 1HG2 A; 2Q9Q C; 2ES0 A; 3K1S A; 4IL9 A; 1XMQ T; 5AQI B; 5HEJ A; 5J1G A; 2X9W A; 3FZL B; 5CB4 E; 3EDV A; 3AXJ B; 2FJB A; 3K3N A; 5TAO A; 5AQL B; 1MMN A; 1J5E T; 4Z8X A; 3AVS A; 3UFE A; 4EIW A; 3RPU A; 3KBU A; 5AFU L; 2VWA A; 3RYI E; 2V7I A; 2WB5 A; 2LSK A; 1N32 T; 3UQ7 A; 3AEE A; 4YTP A; 3ZC1 A; 5LBQ B; 1OED C; 5FYM A; 2LM2 A; 4OYK A; 5L3C B; 4DV4 T; 2MAW A; 3P4P A; 5AQM B; 2MPK A; 2W66 A; 4GKK T; 3IHR A; 5LNK A; 4CI2 B; 4JI2 T; 4DO0 A; 2BG9 A; 1D1A A; 3PUZ F; 3OYX A; 2K5B B; 2X66 A; 4TNW A; 2R6G F; 5JH7 E; 1T72 A; 2BG9 C; 3KV5 A; 5CA1 E; 5EK3 A; 1FMW A; 2JMK A; 3O1I A; 4KHP T; 4C90 A; 2ODU A; 4ILU A; 5ABF B; 2ZM8 A; 3NWI A; 4PFP A; 2ZM2 A; 2XAG B; 1WR0 A; 3I0O A; 5CA0 E; 1T98 A; 1VCS A; 3T1H T; 3I1A A; 3KV9 A; 3ZCI A; 1MMD A; 4EEB A; 3QB5 A; 5LJM A; 4ERR A; 3PV0 F; 4ZEY A; 3CX8 B; 3C4Z A; 5LYJ E; 2HPJ A; 4ZI2 C; 5LHG B; 4EED A; 4CI1 B; 5L3E B; 3AEA A; 4IE0 A; 4Z91 A; 4UXN B; 4OYJ A; 4AKG A; 2CHN A; 2X68 A; 2PFV A; 1IBK T; 3SFE A; 3ZEF B; 3ZPO A; 1HX1 B; 2VL8 A; 4H9S E; 1FEW A; 1NEN A; 2LLY A; 3AE2 A; 4DV7 T; 2CXL A; 2RP4 A; 4B3R T; 2XM2 A; 4HWF A; 3AA7 B; 1N33 T; 4NUV A; 4H63 H; 2BVM A; 5HXH A; 2XUE A; 3K3Q C; 3UUX B; 1OED E; 3ONJ A; 1Y01 A; 3AEG A; 2JQK A; 4JEH B; 1MIW A; 3RYH E; 3IA3 A; 4AQY T; 5EK2 A; 5JQG E; 2ZLY A; 3KBT A; 2QVA A; 4UF0 A; 1SUM B; 2DWK A; 3ZN0 B; 4IDN A; 3ETV A; 3Q5E A; 4MBQ A; 4DR3 T; 2ZMA A; 5FL1 A; 5LJN A; 1D1B A; 2J62 A; 3ZCJ A; 2BG9 E; 4DR1 T; 1YQ3 A; 3A8Y C; 4TN7 B; 3F57 A; 4B6X A; 2XZE A; 1M7K A; 4DBQ A; 5L3B B; 1YQ4 A; 2JIW A; 4JYA T; 2NW8 A; 5J2U E; 2CWY A; 4IST A; 4O4H E; 3JCF A; 4TX5 A; 4DUY T; 4ZZC A; 4JI4 T; 3PUQ A; 3ZST A; 2VB6 A; 4DUZ T; 1X79 A; 2WWV A; 3V5U A; 2W2U A; 4AKH A; 3CPZ A; 4DBR A; 3HKD E; 4DR5 T; 2JRK A; 3PUG A; 4GK0 E; 4ILA A; 5ETW A; 4UV9 B; 2K48 A; 2CPT A; 3NRY A; 4MLK A; 5KX5 E; 2JPF A; 4ZI3 C; 3UQ4 A; 3PUA A; 4I55 E; 3CX7 B; 3FZF B; 5FVK A; 4NIQ A; 2IC6 A; 4KX6 A; 1JNR A; 4PAG A; 2MOZ A; 4X1K E; 4ILC A; 3OYZ A; 4DV2 T; 3CKD A; 2V6X A; 4L5G A; 3PUX F; 4JV5 T; 3HL6 A; 4IE5 A; 3L3P A; 3E08 A; 2E5V A; 5LBM A; 2LKG A; 2B1E A; 3QB5 K; 4TWD A; 4LML A; 4F6R C; 2NTY A; 4AKL A; 2G0U A; 2NW9 A; 2BS4 A; 4B3M T; 3SWH A; 2YIN A; 4PK4 A; 1AJ3 A; 2OA5 A; 4PJJ A; 3FZM B; 2WMN A; 3RLF F; 2IW5 B; 2E9X A; 2NOX A; 2VKJ A; 4H9P C; 4IE7 A; 2JQQ A; 3DJB A; 5LGT B; 4QH1 A; 2YU1 A; 2CLY B; 4O4J E; 1D1C A; 3N9O A; 3C4W A; 2IDO B; 2EHO A; 1Y64 B; 3H3M A; 3AAA B; 4CXW A; 4QWN B; 4TNV A; 3ZMV B; 2BKN A; 3N9L A; 3P4S A; 3JAF A; 4JI1 T; 4QH4 A; 3K3O A; 3PU8 A; 3N2G E; 3NVO A; 1J1J A; 3M3Z B; 3ZYM A; 2I0M A; 2I6H A; 3MA9 A; 4LMJ A; 3AVR A; 1E2A A; 4HTE A; 2C0S A; 3EI0 A; 3ZJ1 A; 3I9Y A; 1UUR A; 2JMH A; 2BKP A; 3AEF A; 2KZ7 B; 3OTO T; 4DV1 T; 3UU8 A; 2WM9 A; 2ACX A; 3O1J A; 4HWC A; 5LHI B; 2VVN A; 2WY2 A; 1ZOY A; 1SA0 E; 3SS1 A; 1CHU A; 2D0U A; 4DMV A; 1HNZ T; 2CXF A; 4DV5 T; 1ZKE A; 4UIG A; 4HEA A; 4IGU A; 2PTF A; 3JC6 D; 2W62 A; 3GA8 A; 4GOU A; 4A98 A; 4YJ2 E; 3ZT5 A; 3MAC A; 5AQH B; 2L9Q A; 5LGU B; 1IZN B; 2W0G A; 4AQF A; 5HAX A; 5ABH A; 4LF6 T; 2FJA A; 3ZSS A; 4HFE A; 4LF8 T; 3RKO A; 4YTN A; 4P1N A; 1R8I A; 4U7I A; 2XTL A; 3NKZ A; 3PUV F; 5DJQ C; 2XAS B; 2YDS A; 5JR9 B; 3LK4 2; 2XQ3 A; 3KV6 A; 2CEA A; 4JUY A; 3FZK B; 3RHW A; 3PJA A; 1LVK A; 4K0U A; 3AE9 A; 2V7J A; 3N9M A; 2Q9Q A; 1HNW T; 3FXE B; 2WS3 A; 1HR0 T; 2N9D A; 2PG8 A; 3VR8 A; 2WZH A; 3ZMT B; 2BBH A; 2BDE A; 3PJA J; 4YSY A; 3PDY A; 5AQN B; 1HS7 A; 4COF A; 2VK9 A; 2MBG A; 1UGO A; 4YTM A; 1QSD A; 2AXD S; 2XQ9 A; 2LM9 A; 4IHJ E; 4JLE A; 5HEG A; 3KFW X; 4HWI B; 2NW7 A; 4ZS3 A; 3EAM A; 2YKS A; 2XJ7 A; 4HFV A; 5DQW A; 3RX6 A; 4YSX A; 1YW0 A; 2DWG A; 5FMN A; 1OED A; 1Z0P A; 3TLW A; 3QOF A; 3IBP A; 5HEO A; 2W61 A; 1XWM A; 3FZH B; 4HFD A; 4KBM B; 2L8K A; 2X0L B; 2V26 A; 3H3A A; 2ODV A; 5AQP B; 4WBO A; 2XAH B; 1VCT A; 4ANJ A; 4PFO A; 4IRE A; 3HKB E; 3WAJ A; 1WYC A; 2XQ6 A; 3P4R A; 4AI6 A; 4YFS A; 5HXC A; 2MTQ A; 1HFA A; 2LSJ A; 5HYA A; 3RIU C; 3ABV A; 1HG5 A; 5LOV E; 5LXT E; 2E2A A; 3TKL B; 4TV9 E; 4ZOL E; 3F31 A; 3CML A; 5JDQ A; 2WU2 A; 4U2Z A; 5F8P A; 3JAE A; 3CQX C; 3AEB A; 4PJN A; 1T8B A; 4OK0 A; 4WW0 A; 5JR9 C; 4X64 T; 5JRE A; 2VAS A; 5AQR B; 4UF0 B; 5FXZ A; 4HE8 A; 2DI4 A; 4YHJ A; 5E0O A; 4FI5 A; 1MNE A; 4XBF B; 3GMI A; 5CJ5 A; 5L4H A; 3P50 A; 2B76 A; 2F4V T; 4AQG A; 4MFR A; 4JI0 T; 5BR8 T; 1IJ5 A; 2WSS V; 2H88 A; 4EAH A; 2YEV C; 1H7C A; 3N5L A; 3NZP A; 3VRB A; 3UUM A; 1T7S A; 3IF8 B; 4IT4 A; 3NRX A; 2P9B A; 4O4L E; 3P4Q A; 2M6B A; 2W4X A; 4IIJ E; 1HX8 A; 5LB7 B; 1U4Q A; 3AED A; 4A56 A; 5L3F B; 3J9X 1; 5AQS B; 2XQ5 A; 3AE1 A; 2XQ8 A; 4A97 A; 1X9B A; 1QUU A; 3N9Q A; 4BA9 A; 2A9U A; 4AXP A; 4YXD A; 4O2B E; 5JDN A; 3AAI A; 1W09 A; 2V5C A; 1SHZ C; 4HWH A; 5HCJ A; 4U3C A; 3KVB A; 4YSZ A; 2LSI A; 5F5W A; 3LBX B; 1BR2 A; 4DR6 T; 5L3D B; 2WMO A; 4QXC B; 4CXY A; 3ANW A; 1GQE A; 1UX5 A; 5AQG B; 2WAU A; 3RF1 A; 5FKY A; 4HWD A; 2L3L A; 3LK2 B; 2DNX A; 5C3J A; 1UK5 A; 4X62 T; 3LSV A; 2YDR A; 1O3X A; 1NAF A; 2WDQ A; 4NPP A; 1VRB A; 3L09 A; 4GYR A; 1BR4 A; 4I50 E; 4U72 A; 1WFD A; 3FB2 A; 4H9R C; 3UU4 A; 5CGM A; 3E22 E; 4IDQ A; 5JDH A; 2PJQ A; 1OXZ A; 3LFM A; 3N2O A; 3M65 A; 2XHE B; 3VR9 A; 2D5U A; 5AQO B; 4HKA A; 3QK6 A; 4JI6 T; 4KP3 C; 2H7O A; 1U5P A; 2QRX A; 5AQQ B; 4HGA A; 4JBW F; 4X66 T; 5JDG A; 4DR7 T; 1UUS A; 3F2E A; 3ZN1 B; 3BQL A; 4JEU B; 4F8H A; 4LFB T; 3BQK A; 1MIV A; 4CI3 B; 4J2C A; 2WP9 A; 5LGN B; 4LF9 T; 1I94 T; 2EHO B; 1YXR A; 2WCA A; 1KK7 A; 1S35 A; 4I43 B; 3VRA A; 2X9X A; 4HFC A; 3JC6 C; 4JI8 T; 2KXP B; 2X9H A; 4NXM T; 3GN5 A; 3UU3 A; 3AE3 A; 3EDU A; 3L8R A; 3B57 A; 3C51 A; 5H6R B; 3BK9 A; 1MMA A; 1ZEE A; 3N2K E; 2CWO A; 2WQY A; 2X0H A; 3EHZ A; 2WWU A; 3CVR A; 4U74 A; 3T1Y T; 5FXV A; 3RIA A; 4AIU A; 3VU7 H; 2N1G A; 3HR0 A; 3AE6 A; 2LSY A; 4PK5 A; 3B13 A; 3UTK A; 2IHR 1; 1XMO T; 4L0R A; 1LVF A; 1B7T A; 5LMU T; 3RYC E; 4U31 A; 2SPC A; 3RGL A; 2A72 A; 4WZX A; 2HHH T; 5FL0 A; 4E7Z A; 4QX8 B; 1G73 A; 2LHN A; 5C8Y E; 4ILB A; 2UXN B; 2A3D A; 5HEH A; 4EYY R; 5FNV E; 4IE4 A; 5LHH B; 3MJX A; 3J7Y q; 1E1H B; 4XZC A; 4BJM A; 3CX6 B; 1IJ6 A; 1XZY A; 2KWI B; 4ZZB A; 2K9A A; 1FMV A; 3UUB A; 3LDQ B; 5LG4 A; 3LJC A; 4HFB A; 3ZMS B; 2XQ4 A; 3AE7 A; 1XDO A; 2XQY A; 5JDM A; 4OHF A; 5ABE A; 3VKH A; 4CXX A; 3W15 B; 4UEM A; 5FY7 A; 4ISS A; 4B3S T; 3ZYK A; 1IBM T; 2J4G A; 1US7 B; 3GWH A; 3LG7 A; 2LKH A; 2FBW A; 3X1D A; 4EB6 E; 3MK7 C; 3PUW F; 3AA1 B; 2FJD A; 2YN6 A; 3ZT7 A; 3SRZ A; 5FVL A; 5L4E A; 2ACZ A; 1IAP A; 3TLS A; 4U2Y A; 4PJM A; 4IL4 A; 4HFH A; 3RH3 A; 2LRL A; 3UFG A; 4YHH T; 3T8O A; 3FBZ A; 4K0K T; 2UU9 T; 3H37 A; 2K24 A; 3V5S A; 3FHN A; 2QYW A; 5KMG P; 4OFZ A; 1S94 A; 2W63 A; 3RQU A; 4N78 D; 4JI5 T; 2CMR A; 1KNP A; 1MMG A; 3RRC A; 3ZJ2 A; 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