8ICC | Genus

Total Genus 104

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	104
sequence length	327
structure length	327
Chain Sequence	ETLNGGITDMLTELANFEKNVSQAIHKYNAYRKAASVIAKYPHKIKSGAEAKKLPGVGTKIAEKIDEFLATGKLRKLEKIRQDDTSSSINFLTRVSGIGPSAARKFVDEGIKTLEDLRKNEDKLNHHQRIGLKYFGDFEKRIPREEMLQMQDIVLNEVKKVDSEYIATVCGSFRRGAESSGDMDVLLTHPSFTSESTKQPKLLHQVVEQLQKVHFITDTLSKGETKFMGVCQLPSKNDEKEYPHRRIDIRLIPKDQYYCGVLYFTGSDIFNKNMRAHALEKGFTINEYTIRPLGVTGVAGEPLPVDSEKDIFDYIQWKYREPKDRSE

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__1151528987977444__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__1151528987977444__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/8icc/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__1151528987977444__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"1151528987977444","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/8icc/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__1151528987977444__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5d273aa51d0f92ced8a2ecd4/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5d273aa51d0f92ced8a2ecd4/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5d273aa51d0f92ced8a2ecd4/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5d273aa51d0f92ced8a2ecd4/pdb.gz): 76 ms

reading 327 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

327 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 25 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:326});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/dna
source organism	Homo sapiens
publication title	Characterization of the metal ion binding helix-hairpin-helix motifs in human DNA polymerase beta by X-ray structural analysis. pubmed doi rcsb
molecule keywords	DNA (5'-D(CPAPTPTPAPGPAPA)-3')
total genus	104
structure length	327
sequence length	327
ec nomenclature	ec 2.7.7.7: DNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date	1996-04-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF10391	DNA_pol_lambd_f	Fingers domain of DNA polymerase lambda
A	PF14716	HHH_8	Helix-hairpin-helix domain
A	PF14791	DNA_pol_B_thumb	DNA polymerase beta thumb
A	PF14792	DNA_pol_B_palm	DNA polymerase beta palm

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.150.20	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	DNA polymerase; domain 1	5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain	8iccA02
1.10.150.110	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	DNA polymerase; domain 1	DNA polymerase beta, N-terminal domain-like	8iccA01
3.30.210.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Beta Polymerase; domain 3	DNA polymerase, thumb domain	8iccA04
3.30.460.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Beta Polymerase; domain 2	Beta Polymerase, domain 2	8iccA03

4MFCA 4F4KA 4KLLA 4QZDA 4GC6A 2ZTDA 1TFRA 4YMMA 7ICIA 1XSLA 2DVIA 2PXIA 3TAQA 3OVBA 4O5KA 1LV5A 2DRAA 4DF4A 4DQRA 1ZQOA 1KNYA 5KG3A 4RNMA 3EZ5A 1NK7A 2FLLA 1FA0A 2JEIA 4UAZA 3C5GA 4C8OA 4DOBA 3PX0A 4EP7A 1JQRA 4ED1A 5J0YA 2JEFA 3HW8A 3GV7B 1Y88A 9ICVA 2J6TA 5J0TA 3EPIA 1X9WA 2IHMA 2AJQA 1JAJA 5DDYA 1TAUA 1NKBA 1JX4A 3RB3A 3B0XA 4C8LA 4UD5A 4X4RA 3AU2A 5KG2A 4KN4A 2W9AA 4F4ZA 4RNOA 1L5UA 5KFIA 5KFHA 5J2HA 4R66A 3BDPA 4FO6A 5IIKA 4KTQA 4PGQA 4K4GA 5HRBA 5HRGA 5J0WA 4XQ7A 2ZH6A 2P6UA 4IG8A 1XO1A 2BCUA 1ZQPA 4FHVA 3M9OB 4TQSA 3T5HA 2DPJA 3RJIA 4UB1A 4DQIA 2BE3A 5KFWA 5KFLA 3ISCA 1BPBA 4AT9B 4F4XA 3MR5A 8ICBA 2FLPA 3MFHA 4RWPA 3T3FA 5L1KA 7ICHA 4F5NA 2V4RA 1UT8A 4KLMA 7ICJA 4Q8EA 1UT5A 1SKWA 4B9UA 2HHQA 4LZDA 2M2VA 3K4GA 4KLTA 4X4QA 4M2YA 5DB6A 4RWOA 3C23A 5KTQA 4EBEA 4UAWA 4Z6DA 3PVXA 4PH5A 3MR6A 4J9MA 2R8JA 3H3AA 8ICZA 4R8UA 8ICYA 1ZQZA 3GILA 2HVHA 3OVSA 1ZQHA 5DB8A 2NRKA 5HRHA 5KG1A 4RPYA 4F50A 4K4HA 2BR0A 4RWQA 3PW0A 2FPMA 3M9NB 1UA1A 8ICJA 5J2GA 1KTQA 2ZUDA 4MEYA 4DL6A 1S0MA 3RJGA 1WOTA 4WC5A 3ZDEA 4BGDA 3OVAA 1VFGA 4BXOA 9ICGA 4F3OA 4UB4A 1ZQDA 4R8UB 4QZCA 4EBJA 1SKRA 4ELTA 2ZHBA 1A76A 3C2LA 4K4IA 1ZQWA 9ICEA 4WCWA 4YXMA 3NYBA 1U45A 8ICMA 1CUKA 3AQKA 4ECVA 4UD4A 4J9NA 8ICAA 5DLGA 5J2BA 3M8SA 4F4YA 7ICEA 1DOQA 2BCSA 8ICTA 1TFWA 1XS9D 4NLNA 4IR9A 2BKEA 4RQ7A 4YMOA 3OJSA 3OSNA 1XSNA 2KZ3A 3C2MA 1MSWD 4XRHA 4NXZA 4WBZA 5HRLA 4BXOB 4QZAA 1JN3A 1NK4A 4DL3A 1NJYA 1TK8A 3H8JA 5HR9A 3SZ2A 4YVZA 4Q43A 2DR7A 5KG4A 4UB2A 1KFDA 5DECA 2MUTA 2H5XA 4JWMA 1BGXT 3THVA 3SYZA 1QLNA 4RQ3A 4O3SA 3GIIA 1QSYA 4I2AA 2DFLA 2PI5A 2M2WA 3H8SA 3C2KA 1KRPA 5F9NA 3TAPA 3HIYA 4R63A 2V4QA 8ICSA 8ICIA 2ISPA 4KLDA 7ICMA 1XSPA 5DQIA 2ZH1A 2NRXA 3ZDBA 5J2IA 3FYHA 3IHQB 1R8AA 7ICKA 4B9NA 4E80A 3HP6A 2ASJA 3RR7A 4ECUA 4M9HA 9ICUA 4M6WA 4F5PA 1SL1A 1TAQA 4I27A 3GV5B 5KFMA 4YCXA 3Q8KA 4KLIA 1K1QA 5TZVA 4DL2A 4FBTA 4M9GA 2W9MA 1ZQJA 3G6XA 3WFQE 2NRVA 2HHUA 4YD2A 2UVVA 2PI4A 5DB9A 4KLJA 1UETA 4DSLA 4PGYA 4Z6CA 5IIOA 3SV3A 7ICNA 5J2CA 1RPLA 3GDXA 1RZTA 9ICAA 4JV0A 3JPRA 4O0IA 1MIYA 4M6WB 8ICFA 1NJXA 1UEVA 2FPKA 2C2EA 4EYHB 5J0QA 4DL7A 3ZDDA 2Q0ZX 3UPQA 3OSPA 3RJEA 3E2EA 4KN7A 5KFGA 4DQPA 5J0RA 2ZH4A 3PW2A 5IINA 3PV8A 3HWTA 5EWGA 1IM4A 4ED3A 2FLNA 4E0DA 3C5FA 3FDSA 5KFSA 3AU6A 4XA5A 4X4PA 4NKTA 1RXVA 3AQLA 3JPOA 4ELVA 1HJPA 4QW8A 4ELUA 8ICKA 4DF8A 4F2SA 3KHRA 7ICOA 2KP7A 4YN4A 5BOMA 4ECSA 4DSJA 4RQ0A 4QW9A 3MABA 1XC9A 2KN7A 2ISOA 1NZPA 4QWDA 4KMUA 4DL4A 3HJ1A 3RH4A 3RAXA 5KFRA 3PX6A 2XCPA 3H7IA 2KTQA 1NK5A 4J9PA 3HJ4A 4FHWA 2XO7A 4GXKA 7ICFA 2F1JA 5J2JA 4DL5A 5CR0A 1ZJNA 4DFMA 5DG7A 4ED6A 1SL0A 4GC7A 1NK0A 4R65A 4YR3A 3EYZA 2I9GA 1V4AA 3ISBA 2W8LA 8ICEA 4IQVA 9ICLA 1XWLA 3KHLA 1D8LA 2JEGA 3C18A 3UPSA 5IIMA 4J9LA 1H38A 3QEAZ 1B22A 2WTFA 4WC0A 9ICCA 2BGWA 2FMQA 4I2JA 2DR5A 1ZQNA 4TUPA 3JPNA 3BQ1A 4TQRA 1HUZA 4F92B 3H8WA 2HHWA 4QZ8A 3JPTA 1WCNA 4QWEA 4F4WA 4Q8FA 8ICQA 4RZRA 1IXRA 4YD1A 1NJZA 4KLEA 3G6VA 3T5JA 4DLEA 3SV4A 4NLZA 1ZQYA 4DEZA 3Q8MA 1ZQFA 4WC3A 4NLGA 5KFOA 3BJYA 4UQGA 2XC9A 5KFYA 2PFNA 4B9MA 3M9MB 1K1SA 5J2FA 1ZQEA 1ZQLA 5EOZA 2BHNA 2BQUA 4RNNA 1AROP 4RT3A 4FS2A 2C2RA 1NKEA 1MQ3A 2P66A 3RAQA 9ICSA 4FBUA 2ZH8A 3C1YA 5DKWA 4YG2A 4Z6EA 1L3UA 1ZQQA 1ZQSA 7ICLA 4QZGA 3BQ2A 3EWAA 3T5KA 2J6UA 3LDAA 4Q45A 4ED2A 2ZUBA 1UA0A 4M9NA 8ICRA 5DBAA 1T8EA 1DK3A 8ICGA 4QZBA 4E7XA 2J6SA 4WC1A 3N4MB 2Y1JA 1EXNA 5F9LA 2VA2A 4KLQA 4X4TA 1ZQXA 9ICJA 9ICWA 3PX4A 2HHXA 1BVSA 2M2TA 4I29A 5DBBA 4WC4A 2R8KA 2FMPA 1DK2A 5J0UA 1U4BA 2IBKA 3PO5A 4O5EA 1UEUA 2AQ4A 4E8FA 4F91B 3HT3A 1MQ2A 1KLNA 1BNOA 3GFKB 4UB3A 1S97A 2BDPA 3PO4A 4F8RA 1TVAA 3OUYA 3Q8LA 1L3SA 4ATBA 4DFKA 4WBYA 4RQ8A 4X4VA 3Q8PB 4MFFA 5KFVA 2C22A 1XU4A 2ZJ8A 3BQ0A 3ZDAA 1SZPA 4ECYA 2OWOA 4JV2A 4RQ2A 2W9BA 3ISDA 4EBCA 3OV7A 4ED7A 4R64A 2BPCA 3BQTA 4PHAA 3LK9A 4X4SA 3OUYB 3TQ1A 4TURA 1T3NA 3UQ0A 4ATBB 4X4NA 4FHXA 4C8MA 3WFOA 5J0XA 3MDCA 1R8BA 4F5OA 2ASLA 1CEZA 4JUZA 1ZQAA 8ICVA 2DR8A 2UVWA 2XY6A 5KFTA 4GXIA 3QEBZ 2MUTB 2W9BB 1D9FA 2KZZA 1ZETA 2R8GA 3L9DA 5J2EA 1LB2B 4IRDA 4C8KA 3MGHA 3PW4A 3PW7A 4DLGA 1QSLA 1OU5A 4RQ4A 4DO9A 1S0OA 9ICKA 4DSIA 3MR2A 4FH3A 3V7KA 4I28A 3PR4A 5CHGA 3RB4A 3JZ0A 3EW9A 2BQRA 4TUQA 5L1LA 1N48A 1NO5A 2ZJAA 4O3OA 2ALZA 3GIKA 3QE9Y 1JIHA 5DG8A 3RRGA 5DEDA 5HHHA 2A1JA 4YP3A 4LVSA 4GLXA 3C1ZA 1VJ7A 5KG0A 1BPZA 3KTQA 2ZH5A 4KLFA 5CWRA 3Q8RB 4MEXA 3H40A 1A77A 4FHYA 4P4PA 4AT8A 3MFIA 3V6HA 2UVRA 2PFOA 1YLQA 3RJKA 4NY8A 5KFUA 4F5RA 4X5VA 2P6RA 2FMSA 3PMLA 5CA7A 4PHDA 3TFSA 4O3NA 4RQ5A 1RYRA 4YXJA 5KFNA 5KG6A 4YR0A 1WCLA 5J0PA 5KT3A 3RH6A 9ICMA 1F5AA 1KSPA 4HYKA 7ICTA 2A1JB 4IQTA 4MFAA 4DOCA 3JYYA 2HW3A 2XY5A 5DQHA 4EZ9A 3N97B 2XGQA 4KITB 4RPZA 9ICPA 5HREA 4RWNA 4AT8B 4I2DA 5DBCA 2C28A 5KFQA 2VA8A 3H4BA 4TUSA 4YFKA 3HX0A 1ZQIA 5DQGA 2BPGA 1TFYA 4J9KA 5HP4A 4JV1A 1NJWA 4UAYA 3RTVA 3WFSC 2MAXA 9ICHA 4YQWA 1U9LA 5KT6A 1BPEA 4RU9A 1S76D 3RBEA 2Y1IA 4S3NA 1ZJMA 5CJ7A 4CCHA 4UBCA 3TI0A 4FH5A 2ZH3A 2M9NA 4P4MA 5DB7A 3QZ8A 5HRFA 7ICVA 9ICFA 1COOA 4IRKA 5DG9A 5BOLA 2HHSA 1MIWA 1DGSA 1ZQKA 3RJHA 4PHPA 2ZTEA 4EBDA 2BQ3A 3PMNA 5L9XA 3RRHA 2XY7A 2NRZA 4BWJA 1TK5A 5KFDA 2C2DA 4G3IA 2O5AA 4WC7A 1NK9A 2BCRA 5JUMA 2ID1A 3T5LA 4M04A 2ZH7A 1S10A 5KFFA 4YMNA 2W8KA 4RPXA 2IHNA 1X9MA 4EZ6A 4AT9A 4BDPA 4UB5A 5IIIA 2AGOA 3H38A 5KFEA 4DFJA 1JMSA 3PW5A 5DLFA 9ICTA 4QZEA 1BNPA 1NOMA 2F1HA 5KFAA 3HPOA 4WC6A 4X0BA 4P4OA 4Z6FA 3PR5B 4F2RA 3TFRA 4KLSA 4KLOA 2DR9A 1Q79A 5KG5A 3V7JA 4F5QA 4DSKA 3GQCA 4QWAA 7ICGA 5DGAA 5KT5A 3C21A 4Q44A 2BCQA 5J2DA 3JPSA 5D4BA 1ZQRA 2VA3A 4O9MA 1Z00A 2HHVA 1PZNA 2NRTA 2M2UA 3V6JA 4KLUA 1RYSA 8ICPA 3AQNA 3H37A 4QZFA 3OJUA 4I2IA 1ZQCA 4NM2A 3GV8B 2IA6A 4AT7A 4RT2A 9ICIA 8ICUA 5HHIA 2KFZA 4I2HA 3RJJA 5CB1A 3TARA 3TANA 7ICUA 3JPPA 4QZHA 4GXJA 2R8IA 1D9DA 1U47A 3KHGA 2HHTA 3MR3A 2LYHA 2ASDA 1MC8A 2ZJ5A 3KHHA 3ORYA 2AQ0A 3UXPA 4ECTA 1SL2A 1S9FA 4ECZA 1Z00B 4FHPA 4RUCA 2KZMA 4ZH4A 3ZD9A 5L1IA 4ED8A 4J9SA 3ZD8A 4DSEA 5KFCA 3SI8A 1NK6A 3MGIA 4DWIA 4AT7B 3OGUA 2GWSA 4DQQA 1T7PA 2JZBA 4RQ1A 1MIVA 5EWFA 1PX5A 3LWLA 4J9OA 1S77D 5J2AA 3QZ7A 4LZGA 8ICXA 3H39A 2AU0A 4B9SA 2PFPA 2FPLA 7ICRA 3JPQA 3AQMA 3LWMA 1RXWA 3H4DA 2DPIA 4B9VA 4IQWA 3B0YA 4B9TA 4DS5A 4I2BA 4MF2A 9ICBA 2HHPA 2RFFA 4NLKA 1U48A 2AGQA 2F1IA 3UXOA 4X0AA 3PY8A 3ETLA 1Z3EB 1C7YA 5KT7A 3IM1A 5L1JA 1ZQMA 1ZQTA 4F93B 4NM1A 2JZBB 4O5CA 3M8RA 1S0NA 3V7LA 2HVIA 2BCVA 7ICQA 1V9PA 4MF8A 3ZDCA 5IIJA 3UQ2A 1KFTA 1TK0A 3LQCB 5KFPA 9ICXA 2RDIA 1ZQVA 4IQUA 1ZYQA 4JK1A 4M9LA 1B43A 1R89A 2XGPA 1Q78A 1BPXA 4X4OA 5BPCA 3GIMA 5DDMA 2ATLA 3RR8A 3Q8SB 4X4UA 4XQ8A 7ICPA 5HC9A 3V72A 4ECWA 4IR1A 3OHBA 8ICLA 1KDHA 4XUSA 1QTMA 5C5JA 1N56A 1D8YA 1X9SA 5HRIA 4RQ6A 1HUOA 5HMLA 4DS4A 3RB0A 7ICSA 4B9LA 8ICWA 3G6YA 2NRWA 5IILA 8ICHA 3AUOA 1QSSA 2PFQA 1X2IA 5HNKA 5J2KA 4QZIA 4KLHA 2B21A 4QWBA 4M47A 3PNCA 3RJFA 4M9JA 4KLGA 4P2HA 4M5DA 2ZH9A 2AGPA 2DRBA 5HMMA 1ZQGA 3Q8QB 1ZQBA 4JWNA 4O3PA 5KG7A 4YR2A 5KT4A 4EBKA 5KT2A 4J9RA 4EYIB 4FS1A 4ECRA 3RH5A 4LT6A 4M0AA 1TKDA 4I2GA 1TV9A 5D46A 5J0SA 3EPGA 2ZUCA 4BWMA 9ICNA 2O1PA 2Q66A 5EWEA 1S0VA 3UXNA 4I2CA 5KFXA 1KEJA 1NK8A 2JEJA 1KFSA 4O3QA 4DFPA 3V6KA 4I2EA 5KFZA 4ED0A 2ZTCA 4DSFA 2W9CA 3K75D 5J0OA 2KFNA 2I1QA 4QZ9A 4J9QA 5F2VO 1BPYA 3GIJA 4C8NA 5D49A 2ZHAA 4DQSA 9ICQA 4ECXA 2ZH2A 2UVUA 4QWCA 1T4GA 1ZQUA 5KFKA 5J29A 4PGXA 3RB6A 2IMWP 1L3TA 4WC2A 4EEYA 9ICRA 2BPFA 4NKUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2JEJ A;  1KFS A;  4O3Q A;  4DFP A;  3V6K A;  4I2E A;  5KFZ A;  4ED0 A;  2ZTC A;  4DSF A;  2W9C A;  3K75 D;  5J0O A;  2KFN A;  2I1Q A;  4QZ9 A;  4J9Q A;  5F2V O;  1BPY A;  3GIJ A;  4C8N A;  5D49 A;  2ZHA A;  4DQS A;  9ICQ A;  4ECX A;  2ZH2 A;  2UVU A;  4QWC A;  1T4G A;  1ZQU A;  5KFK A;  5J29 A;  4PGX A;  3RB6 A;  2IMW P;  1L3T A;  4WC2 A;  4EEY A;  9ICR A;  2BPF A;  4NKU A;  4RUA A;  1R8C A;  5KFJ A;  1BPD A;  1NKC A;  3NTU A;  4PPX A;  1JXE A;  1U49 A;  8ICC A;  2RDJ A;  3MBY A;  4IRC A;  5KFB A;  1SKS A;  3WFP A;  3NGD A;  5HRD A;  2W9C B;  5DGB A;  4O3R A;  4DOA A;  4ECQ A;  8ICO A;  1JXL A;  8ICN A;  9ICO A;  5HRK A;  3OHA A;  2V9W A;  2VAN A;  5CP2 A;  3C66 A;  1L3V A;  2PBE A;  4UBB A;  3WFR E;  2XCA A;  2R8H A;  4PHE A;  3RBD A;  3MDA A;  4I2F A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4MFC A;  4KLL A;  4RWQ A;  4GC6 A;  3NVW A;  2ZTD A;  1TFR A;  3KFU F;  2DVI A;  2PKE A;  1A0P A;  1ZQO A;  2FLL A;  2JEI A;  2DGZ A;  2DF4 B;  4OJL A;  3GV7 B;  2I6X A;  1Y88 A;  1YZ6 A;  1X9W A;  2AJQ A;  1TAU A;  4UD5 A;  3B0X A;  4X4R A;  2W9A A;  4RNO A;  5KAI U;  4FO6 A;  4K4G A;  4XQ7 A;  4TQS A;  3T5H A;  3RJI A;  5KFW A;  5ALD A;  2HOQ A;  5KFL A;  3MR5 A;  4RWP A;  5ALG A;  2ES6 A;  2KHV A;  2V4R A;  4G9B A;  2HHQ A;  3U26 A;  2M2V A;  3K4G A;  2A3V A;  3N7R C;  5D62 A;  1RG6 A;  4RWO A;  5KTQ A;  2G09 A;  4NWI A;  5ALQ A;  1ZQZ A;  2OEH A;  2BR0 A;  2LI6 A;  2EAO A;  2DWQ A;  1VFG A;  3ZDE A;  5AHX A;  2KE7 A;  4BXO A;  4ZOH C;  3IP4 B;  1SKR A;  4Y2Q A;  4NLB A;  1CUK A;  3AQK A;  1FEZ A;  2W03 A;  5J2B A;  2BCS A;  8ICT A;  1IV8 A;  1TFW A;  1XS9 D;  2BKE A;  1XSN A;  3C2M A;  4WBZ A;  2WB1 F;  4UB2 A;  1O03 A;  4JWM A;  3CNH A;  3I28 A;  4C4R A;  1QSY A;  4R63 A;  8ICI A;  3UMC A;  1T94 A;  2ZH1 A;  3ZDB A;  3HP6 A;  4M9H A;  9ICU A;  5KL8 B;  4I27 A;  3DEE A;  4NL9 A;  2QLT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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8ICCA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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