The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
87
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structure length |
87
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Chain Sequence |
HSSGHIDDDDKHMAERLSEEEIGGLKELFKMIDTDNSGTITFDELKDGLKRVGSELMESEIKDLMDAADIDKSGTIDYGEFIAATVH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure and Backbone Dynamics of the N-Terminal Region of the Calcium Regulatory Domain from Soybean Calcium-Dependent Protein Kinase alpha
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Calcium-dependent protein kinase SK5
|
| source organism |
Glycine max
|
| molecule tags |
Transferase, plant protein
|
| total genus |
10
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| structure length |
87
|
| sequence length |
87
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2004-01-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00036 | EF-hand_1 | EF hand |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Recoverin; domain 1 | EF-hand |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SR6 B; 2D8N A; 2M0R A; 1A2X A; 2BKH B; 4FQO A; 1SL8 A; 1JFK A; 2KI4 C; 3LLE A; 2BEC A; 1QS7 A; 3HX4 A; 2HPS A; 1TNQ A; 1IQ5 A; 2TN4 A; 4PE0 A; 4C0L A; 5KU1 A; 1IG5 A; 3EKH A; 1F71 A; 2NZ0 A; 2M7N A; 2CXJ A; 3AAJ A; 1QXP A; 5PAL A; 3PSR A; 3D0Y A; 3K21 A; 1L7Z A; 1M45 A; 1S6J A; 5AAN A; 5IBW A; 4P5O E; 1OSA A; 2ZKM X; 3EVV A; 1K9P A; 3FIA A; 1PK0 D; 3HCM A; 1X02 A; 2KQY A; 1OMR A; 2KHN A; 1K93 D; 4UPG A; 1SRA A; 3NXA A; 2MHH A; 2JT0 A; 2Y1N A; 3E3R A; 3WHT B; 1A29 A; 1IGV A; 2BBN A; 4XYN A; 3I5G B; 2PSR A; 2LVI A; 4F0Z B; 2Q91 A; 1LA0 A; 2OTG B; 3AKB A; 3BQ3 A; 1SKT A; 1CKK A; 1NYA A; 2SCP A; 2BCB A; 3EK4 A; 3BOW A; 1C7W A; 4JWQ A; 1W7J B; 1YVH A; 2BKI B; 2Y1M A; 4OR9 B; 1PRW A; 3GK1 A; 3JTD C; 2NCP A; 4GBA A; 1S6I A; 2R2I A; 2JTT A; 2K8M B; 1M63 B; 2VRG A; 3CR4 X; 1L2O B; 1XFY O; 4YGC B; 4BY4 A; 2JQ6 A; 2G2B A; 2F8P A; 1JWD A; 2LMV A; 3VRO A; 2L4I A; 4P2Y B; 1QX7 A; 1ALW A; 2CCM A; 2KAV A; 5GQQ C; 1J7O A; 1XA5 A; 1U5I B; 1S5G Y; 1WRZ A; 2JT3 A; 5CSN A; 3CWG A; 4IL1 A; 1NCZ A; 1B8L A; 1WY9 A; 2I18 A; 5BPJ A; 1UHH A; 2COL B; 2E6W A; 1NWD A; 1A4P A; 2MA2 A; 2JT8 A; 2BBM A; 2LLT A; 4I5J A; 1K9U A; 3SIA A; 3EVR A; 2EGD A; 3I5H C; 1DGV A; 4AOM A; 3D0Y B; 3CGA A; 2L0P A; 1CFP A; 1DJZ A; 1OOJ A; 4D1E A; 1M46 A; 2KGB C; 4I5L B; 1MXE A; 1KWO B; 1Y1U A; 1EXR A; 5DKN A; 3KF9 A; 1OZO A; 1JF0 A; 2G9B A; 4CLN A; 1J1E A; 4XJK A; 1V1F A; 1TRF A; 4MZJ A; 2LHI A; 3SIB A; 5G08 A; 2KFG A; 2KI6 D; 5I2Q A; 4MVF A; 2L4H A; 2M1K B; 2F33 A; 4U8D A; 2OS8 B; 2F3Z A; 1TIZ A; 3GK2 A; 1WDC B; 2WC8 A; 1IWQ A; 2NXQ A; 3H4S E; 4E68 A; 1UHK A; 1ODB A; 4NDC A; 1BOD A; 4NQG A; 1KK7 Z; 2BE4 A; 1QTX A; 1CDP A; 2JZI A; 2WCB A; 1K8U A; 3RM1 A; 3GOF A; 4OKH A; 1QV1 A; 2FJU B; 2LAP A; 2IS9 A; 3VRQ A; 4ORB B; 2O5G A; 2MJW B; 3CTN A; 3LK0 A; 1YUU A; 1EG3 A; 4GFT A; 1K9K A; 1QAS A; 1K2H A; 3TDI A; 1YRU B; 1Y1X A; 2KQ6 A; 4JPZ B; 1Y6W A; 1SK6 D; 2P6B B; 5KTY A; 3PN7 C; 1BR1 B; 4C0J A; 1YRT B; 2CT9 A; 4DRW A; 2MRD A; 3OX6 A; 1KK8 B; 2PAS A; 2L98 A; 5CSF A; 1PVB A; 1QIV A; 2M49 B; 3OB1 B; 1OE9 B; 2KDH A; 1CLM A; 2CBL A; 3BYA A; 3IQO A; 2KGR A; 4ICB A; 3O2P A; 2LMU A; 1OZS A; 1N65 A; 1A03 A; 1KK7 Y; 4MEW A; 1B4C A; 2B1U A; 1SW8 A; 3BUO B; 1W7I B; 1KQM B; 2LVV A; 4HRE E; 2JRF A; 2M8U A; 3KEV A; 2LLU A; 1PUL A; 1YX8 A; 1LKJ A; 1SCM C; 1YUS A; 4YRU A; 1N2D A; 3I5I C; 1EL4 A; 1N0Y A; 1WLM A; 4ZCV A; 1DJI A; 1F8H A; 1AJ5 A; 4AQI A; 1CM1 A; 1TNX A; 3EKJ A; 1YTZ C; 4ETO A; 1E8A A; 1CMG A; 1KQV A; 2LUC A; 2JU0 A; 1XO5 A; 2ZND A; 1BR4 B; 2H61 C; 1M31 A; 2BE6 A; 2WCE A; 1AP4 A; 1TN4 A; 2QPT A; 3RLZ A; 2JNX A; 2M9G A; 4MZK A; 3DVE A; 5HLO A; 1JSA A; 3PM8 A; 1J7R A; 4OVN F; 1FW4 A; 2HF5 A; 1F4Q A; 1MQ1 A; 2KFH A; 1ZMZ A; 2ZN9 A; 1BJF A; 1YR5 A; 2LE9 B; 1ZOT B; 2MAZ A; 4YBH B; 5JOL A; 1SL7 A; 2I7A A; 4MBE A; 3I5F B; 2WOS A; 1SR6 C; 2SAS A; 1DJH A; 2JUL A; 3SJS A; 2EC6 B; 3TUY B; 1K95 A; 2I94 A; 1DJW A; 1LVC D; 3O6B A; 2K2A A; 4MZL A; 3ZWH A; 3ICB A; 1FBV A; 3SG3 A; 1BU3 A; 3SG2 A; 1NP8 A; 1NCX A; 4ZCU A; 2JOJ A; 5J3X A; 1DT7 B; 1KFU S; 1RTP 1; 2K7C A; 1QVI Z; 2ZRS A; 1EJ3 A; 2M97 A; 2KAY A; 3I5H B; 1S26 D; 1F70 A; 2F2P A; 1YVL A; 1BT6 A; 2KSP A; 2Q4U A; 2V53 A; 3DVK A; 3JVT B; 1K96 A; 2O60 A; 1CTR A; 3SG4 A; 2LNK A; 1CLB A; 2HQW A; 2KOT A; 2ZRT A; 1VRK A; 5B8I B; 4N5X A; 1FI6 A; 1KFU L; 3I5G C; 1RJV A; 1CM4 A; 2K7D A; 1AVS A; 1K90 D; 1QJT A; 1SCV A; 1A75 A; 1S6C A; 5CSI A; 4PE7 A; 2OTG C; 4A4B A; 1KFX S; 1AUI B; 1JUO A; 1D1O A; 4GPL B; 2FOT A; 3EVU A; 1NCY A; 1ALV A; 4DUQ A; 4YGB B; 2EHB A; 4PE4 A; 1QVI Y; 5HKZ A; 1OMV A; 1L2O C; 1NX2 A; 2AAO A; 1IH0 A; 1REC A; 4C0K A; 1XK4 C; 1DF0 A; 3VRN A; 4YGA A; 1UHN A; 1KSM A; 2FCD A; 1KFX L; 1MXL C; 5HYD A; 1ZAC A; 1CNP A; 1FI5 A; 1B8C A; 3F45 A; 1XYD A; 1H8B A; 1S3P A; 1QX5 B; 2WCF A; 3DF0 A; 3O4Y A; 3BOW B; 4PCW A; 1YX7 A; 2LLS A; 5TNC A; 4OCI A; 1CFD A; 1TCF A; 5AER A; 1KSO A; 1SY9 A; 1IQ3 A; 1UP5 A; 3CZT X; 5I8N A; 4AQJ A; 4BY5 A; 1PSB A; 1EH2 A; 1GQM A; 1UWO A; 1XFW O; 1S1E A; 2K7O A; 2PMY A; 1PAL A; 4FTG A; 2JC2 A; 2KBM A; 1IRJ A; 1F4O A; 2GGZ A; 1B1G A; 3KHE A; 2BL0 B; 1XFZ O; 2JWW A; 1TNP A; 4QJ3 B; 1KWO C; 1TOP A; 2KYC A; 3TDZ A; 1CDN A; 3VRR A; 4YGE B; 2M1U A; 3TS5 B; 4CFQ A; 1B7T Z; 4NDD A; 2A4J A; 2LUX A; 4PHN A; 1M39 A; 2KI4 B; 1DJX A; 1K94 A; 4L9M A; 1RFJ A; 2LVK A; 1SPY A; 1BF5 A; 1QLS A; 1XVJ A; 2KI6 C; 1A75 B; 1DJG A; 2QAC A; 3EK8 A; 1OMD A; 1CB1 A; 1HQV A; 4I5K A; 3FWB A; 1WDC C; 1F54 A; 1NUB A; 1NPQ A; 4PDZ A; 3WXA A; 1RK9 A; 3DD4 A; 5KSZ A; 2E30 A; 2H2K A; 2PVB A; 1BG1 A; 3IQQ A; 2M7L A; 1LIN A; 1DF0 B; 4DCK A; 1XK4 A; 1J55 A; 4XJK B; 2ZFD A; 3NSI A; 1B7T Y; 1R6P A; 2KAX A; 5DKR A; 2L51 A; 4N1G A; 1CDM A; 3SG6 A; 3BUW B; 4GNK B; 4PE1 A; 2LVJ A; 2DOQ A; 2K7B A; 5ER5 A; 3WHU B; 1GJY A; 3NSO A; 5CSJ A; 3DF0 B; 1UHI A; 2LMT A; 1KK8 C; 2LHL A; 2ISD A; 4NDB A; 4DIR A; 2PRU A; 3JTD B; 3LL8 B; 2LP3 A; 2WOR A; 3CS1 A; 1B8R A; 5HLV A; 1G8I A; 4R1E A; 4GGF C; 1KQM C; 3KO0 A; 1WLZ A; 2HET A; 1CLL A; 3TZ1 A; 4CID A; 5F6T A; 3C1V A; 2LP2 A; 3QRX A; 1XFU O; 1J1D A; 5D7F A; 4WRI A; 3LCP C; 2M3W A; 1JC2 A; 2AUC A; 4GGN A; 5I2L A; 1FPW A; 3A8R A; 3IF7 A; 2PAL A; 1G4Y R; 1S5G Z; 2LC5 A; 1QV0 A; 1CFC A; 1UUR A; 3BUN B; 3OHM B; 3D10 A; 4WQ2 A; 1IJ6 A; 4PHM A; 1SBJ A; 5CPV A; 3OB2 B; 1WRL A; 1YUR A; 1S36 A; 2CNP A; 2JXC A; 4WQ3 A; 4MLW A; 4PHJ A; 3O78 A; 2F3Y A; 1J7P A; 1NX3 A; 1PVA A; 2K61 A; 2NCO A; 3KPX A; 3SG5 A; 4TNC A; 3FS7 A; 1DGU A; 1IJ5 A; 2L5X B; 5HKY A; 1TNW A; 1YUT A; 2K0J A; 4M2O A; 1BMO A; 3GK4 X; 2GV5 A; 2L2E A; 1FF1 A; 5HKW A; 2JTZ A; 5DKQ A; 3CR5 X; 1NSH A; 3I5F C; 5JJG A; 1NIW A; 1AJ4 A; 5AFP A; 4CFR A; 1J7Q A; 1IKU A; 2EC6 C; 3VGO A; 3TUY C; 1TTX A; 1HT9 A; 1CFF A; 1AHR A; 2NLN A; 3MSE B; 1UUS A; 3LK1 A; 2KBI A; 4PAL A; 5K89 A; 3PAL A; 2H61 A; 2BCA A; 3OP0 A; 1JF2 A; 3PLF B; 1B47 A; 1MR8 A; 3FWC A; 1MF8 B; 1V1G A; 1TCO B; 2JPT A; 2LCP A; 4MRY A; 2F2O A; 3BXK A; 1RWY A; 4HRG A; 2MBX A; 3NSL A; 2CTN A; 3WNX B; 3ZNI A; 3EK7 A; 3JVT C; 4OV2 A; 3BUX B; 4GGF A; 4M2Q A; 2L50 A; 2BCX A; 1H4B A; 1R2U A; 3DVJ A; 3AKA A; 2KYF A; 1UHJ A; 1NX1 A; 4MSP A; 1MUX A; 2MLF C; 4ORC B; 2LAN A; 5D69 A; 2ZNE A; 1B9A A; 1LXF C; 1Q80 A; 3PN7 B; 1C7V A; 1CDL A; 2LM5 A; 1DJY A; 1GGZ A; 2JNF A; 4PHK A; 2GGM A; 1PSR A; 3TDU A; 4YGD B; 2M29 A; 1MWN A; 4N1F A; 4GUK A; 2AMI A; 4HSZ A; 1WRK A; 3OX5 A; 5I2O A; 2LV7 A; 2KNE A; 5AEQ A; 1LA3 A; 5FYX A; 1KCY A; 2K2F A; 2FCE A; 2ZN8 A; 1JFJ A; 4CPV A; 1QAT A; 3DVM A; 1SCM B; 3PAT A; 3I5I B; 2WND A; 3SG7 A; 1QLK A; 1F55 A; 1EG4 A; 1BLQ A; 1GGW A; 4QJ5 B; 4GAO A; 1Y0V H; 2OS8 C; 1JBA A; 2JXL A; 1NX0 A; 3PFV A; 1SNL A; 2KFF A; 4ORA B; 4QJ4 B; 2Y5I A; 4USL A; 1BOC A; 1SL9 A; 3NSK A; 1Y1A A; 1DTL A; 1SMG A; 4JQ0 D; 4MRX A; 3BUM B; 4YI8 A; 1OQP A; 1SYM A; 1G33 A; 1QX2 A; 3VRP A; 1AK8 A; 1C07 A; 2I2R E; 3CR2 A; 3A4U B; 4I5N B; 2MLE C; 1DMO A; 1DVI A; 1ZUZ A; 4YI9 A; 5ER4 X; 2BL0 C; 4Q04 A; 3CLN A; 5AXI A; 1CMF A; 4M2P A; 1MHO A; 3AAK A; 1RRO A; 1U5I A; 2OPO A; 1ZFS A; 3M0W A; 4MN0 A; 1XFV O; 2Y4Q A; 4HRH A; 4A4C A; 4DS7 A; 3TS5 C; 1XFX O; 2HQ8 A; 1QIW A; 2RGI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1SR6 B; 2D8N A; 2M0R A; 1A2X A; 2BKH B; 4FQO A; 1SL8 A; 1JFK A; 2KI4 C; 3LLE A; 5D3O A; 2PQL A; 2BEC A; 1QS7 A; 3HX4 A; 2HPS A; 2P70 A; 1TNQ A; 3R1O A; 1IQ5 A; 2TN4 A; 3D76 A; 4PE0 A; 4C0L A; 1IG5 A; 5KU1 A; 3EKH A; 1F71 A; 2NZ0 A; 2M7N A; 2CXJ A; 3AAJ A; 1QXP A; 5PAL A; 3PSR A; 3D0Y A; 3K21 A; 1L7Z A; 1M45 A; 1S6J A; 5AAN A; 3FE8 A; 5IBW A; 4P5O E; 4OZD A; 1OSA A; 1DEL A; 2ZKM X; 4F7F A; 3EVV A; 1K9P A; 3FIA A; 1PK0 D; 3HCM A; 1SSE B; 1X02 A; 3CAB A; 3S0D A; 2KQY A; 1OMR A; 2KHN A; 1K93 D; 4UPG A; 1SRA A; 3NXA A; 2MHH A; 2JT0 A; 2Y1N A; 3E3R A; 3WHT B; 1A29 A; 1IGV A; 2BBN A; 4XYN A; 3I5G B; 2PSR A; 2LVI A; 3L4L A; 4F0Z B; 2Q91 A; 1LA0 A; 2OTG B; 3AKB A; 3BQ3 A; 1SKT A; 1CKK A; 1NYA A; 3Q8I A; 2SCP A; 2BCB A; 3EK4 A; 3BOW A; 1C7W A; 4JWQ A; 1W7J B; 1YVH A; 2BKI B; 2Y1M A; 4OR9 B; 1PRW A; 3GK1 A; 3JTD C; 2NCP A; 4GBA A; 1S6I A; 2R2I A; 2JTT A; 2K8M B; 1M63 B; 2VRG A; 3CR4 X; 1L2O B; 1XFY O; 4YGC B; 4BY4 A; 2JQ6 A; 2G2B A; 2F8P A; 1JWD A; 2LMV A; 1XFR A; 3BFB A; 3VRO A; 5I94 A; 2L4I A; 4P2Y B; 1QX7 A; 1ALW A; 2CCM A; 2KAV A; 5GQQ C; 1J7O A; 1XA5 A; 1U5I B; 1S5G Y; 1WRZ A; 2QEB A; 1C3Z A; 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