The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
125
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structure length |
125
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Chain Sequence |
DTTPRRDAEYPPPELLEALKPLHDICLGKTGVTEEAIKKFSDEEIHEDEKLKCYMNCLFHEAKVVDDNGDVHLEKLHDSLPSSMHDIAMHMGKRCLYPEGETLCDKAFWLHKCWKQSDPKHYFLV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Anopheles gambiae
|
| publication title |
Anopheles gambiae odorant binding protein crystal complex with the synthetic repellent DEET: implications for structure-based design of novel mosquito repellents.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Odorant binding protein
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| total genus |
44
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| structure length |
125
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| sequence length |
125
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01395 | PBP_GOBP | PBP/GOBP family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Recoverin; domain 1 | Pheromone/general odorant binding protein domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1C3Z A; 4PT1 A; 2WCL A; 3DZT A; 3L4L A; 2QEB A; 1LS8 A; 3NHI A; 3DY9 A; 2GTE A; 4F7F A; 3R1O A; 2WCH A; 2WC6 A; 3D77 A; 3N7H A; 3NGV A; 2WCJ A; 2QDI A; 3B7A A; 3NHT A; 1OOI X; 3S0F A; 1OOG A; 3S0B A; 3S0G A; 3DYE A; 5EL2 A; 3BFA A; 2L2C A; 1ORG A; 3OGN A; 1QWV A; 3R1V A; 3B87 A; 3R72 A; 2WC5 A; 1T14 A; 2H8V A; 3CZ1 A; 4INW A; 2P70 A; 3D75 A; 1DQE A; 3FE9 A; 2P71 A; 3BFB A; 3BFH A; 1XFR A; 2QEO A; 1P28 A; 3PJI A; 3S0E A; 3RZS A; 2QEV A; 3B6X A; 3BJH A; 1TUJ A; 3CAB A; 3VB1 A; 3D76 A; 3S0D A; 4FQT A; 3D73 A; 1OW4 A; 3D74 A; 3DXL A; 2WCM A; 2JPO A; 3L47 A; 3CZ0 A; 1OOF A; 1TWO A; 1GM0 A; 1C3Y A; 3CYZ A; 2ERB A; 3Q8I A; 3V2L A; 3FE8 A; 4JD9 A; 3CDN A; 2WCK A; 2QEH A; 3L4A A; 3R1P A; 3CZ2 A; 3D78 A; 2KPH A; 3S0A A; 3B86 A; 4OZD A; 5DIC A; 3FE6 A; 1OOH A; 3B88 A; 2PQL A; 3K1E A; 3QME A; 2FJY A; 4INX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M2Q A; 2LHI A; 1DJI A; 1C3Z A; 2I18 A; 4JQ0 D; 1DMO A; 3DZT A; 2KOT A; 1SL7 A; 4F7F A; 2H61 A; 2MLE C; 2KQ6 A; 5I94 A; 1DVI A; 3OX5 A; 1YUR A; 2ZFD A; 1KWO C; 4GGN A; 2OTG C; 1K8U A; 1CFD A; 1CB1 A; 1DGV A; 1CLB A; 2M97 A; 4P5O E; 2F33 A; 1R2U A; 2BE4 A; 1F55 A; 1BLQ A; 1N0Y A; 1PVB A; 3OB1 B; 1NSH A; 4L9M A; 2FCE A; 2JQ6 A; 1R6P A; 2HPS A; 1SPY A; 3OX6 A; 3S0G A; 3VRN A; 1G4Y R; 1FI5 A; 5JOL A; 3E3R A; 3NSI A; 1XFW O; 4YRU A; 4HRG A; 3IVT A; 5CSF A; 1M63 B; 1KK8 C; 1AHR A; 3BFA A; 3OP0 A; 3WHT B; 1Y0V H; 1B8C A; 5BPJ A; 1H8B A; 1K95 A; 1LA3 A; 1OQP A; 1QWV A; 3SIB A; 3R1V A; 1X02 A; 4NDD A; 5AXI A; 4OKH A; 1IQ5 A; 2K61 A; 1CMF A; 1MUX A; 1YUT A; 2JNF A; 2PRU A; 4XJK B; 4IJ7 A; 3CR2 A; 1S3P A; 3PN7 B; 2P6B B; 1BR4 B; 1PSR A; 2H8V A; 3PAL A; 3BUX B; 4OV2 A; 2KSP A; 2BL0 B; 5D3O A; 4CPV A; 2ZNE A; 3CLN A; 2WCE A; 2BKH B; 1K90 D; 4N5X A; 3EK8 A; 2WCF A; 2I94 A; 3D0Y A; 1N2D A; 2LMV A; 4YGB B; 1DF0 A; 2KFF A; 2LVJ A; 2YGU A; 4QJ5 B; 1B1G A; 3FE9 A; 1IKU A; 1ZMZ A; 1PAL A; 1YVL A; 5DKR A; 3SG2 A; 2KNE A; 1J7O A; 3BFB A; 3BFH A; 1K96 A; 1QTX A; 1P28 A; 1CDP A; 2MJW B; 1Y1U A; 3I5G B; 4CFQ A; 1CFP A; 1IIO A; 4WQ2 A; 3NSK A; 1PVA A; 2CCM A; 3RZS A; 1EL4 A; 2K7C A; 3I5H B; 1LVC D; 1NYA A; 2MBX A; 1S1E A; 3VB1 A; 1QJT A; 2KGB C; 4YI9 A; 1QX2 A; 1TUZ A; 3D74 A; 5CSI A; 5HLV A; 2WCM A; 1F71 A; 3O4X A; 1CMG A; 1IJ5 A; 2PYQ A; 3OBV A; 3CZ0 A; 3HCM A; 3VRR A; 3IF7 A; 1KFU S; 2NLN A; 3EKH A; 2EC6 B; 1UWO A; 1FI6 A; 2ZND A; 1SL8 A; 5D7F A; 1BT6 A; 1WLZ A; 2ERB A; 4R1E A; 3DVK A; 2MLF C; 3EVR A; 1J7Q A; 3V2L A; 3FE8 A; 1DEK A; 3BQ3 A; 2LHL A; 1CFC A; 4ZCV A; 1D1O A; 3SJS A; 3RM1 A; 3KF9 A; 1AP4 A; 3MSE B; 4GFT A; 2CTN A; 2F2P A; 3D78 A; 3AAJ A; 3TDZ A; 1DT7 B; 1LIN A; 3LK0 A; 3TDU A; 4OZD A; 4BY5 A; 3TUY B; 1YX7 A; 3SIA A; 1A2X A; 3O2P A; 1ODB A; 4NQG A; 2M7L A; 2O60 A; 1Y6W A; 1TRF A; 1LXF C; 4HSZ A; 1NWD A; 5FYX A; 3QME A; 1JC2 A; 4YGD B; 2FJY A; 3C1V A; 5FI7 A; 1CNP A; 1FF1 A; 3EVU A; 2K0J A; 1W7J B; 4INX A; 5JJG A; 1FPW A; 4PE1 A; 1L2O C; 4MZK A; 1J1D A; 4GNK B; 4PCW A; 1GGZ A; 2COL B; 2KI4 C; 2WCL A; 1B8R A; 1RJV A; 1UHJ A; 2PSR A; 1LS8 A; 2KBI A; 3DY9 A; 1IQ3 A; 5KU1 A; 2GTE A; 1CM1 A; 2JTT A; 1QIV A; 3FS7 A; 1RRO A; 3GK2 A; 3A4U B; 1QX7 A; 1BJF A; 3JVT C; 1K9P A; 1IH0 A; 4ORB B; 3JTD C; 3TDI A; 2M1K B; 1OMD A; 3GOF A; 1ZUZ A; 4MSP A; 1SCV A; 3OHM B; 1S5G Z; 1OE9 B; 3NGV A; 1OZS A; 2WCJ A; 3BOW B; 4JKT A; 1KFU L; 2QDI A; 4F0Z B; 3NHT A; 4ETO A; 1UUS A; 2JZI A; 4Q04 A; 2M7N A; 2NZ0 A; 3CR4 X; 1B7T Y; 4DS7 A; 1U5I B; 2JTZ A; 1A4P A; 1NX1 A; 1NCY A; 2JT8 A; 2PVB A; 3EK7 A; 2LP3 A; 2Y4Q A; 1M45 A; 1ZFS A; 1SCM B; 1WY9 A; 2LUC A; 1NX3 A; 3DVM A; 3SS3 A; 3CWG A; 1H4B A; 2M29 A; 2L2C A; 1XYD A; 2H61 C; 2PAL A; 4D1E A; 2IS9 A; 5ER5 A; 2JRF A; 2KLE A; 3B87 A; 1HT9 A; 2HF5 A; 4I5J A; 4MN0 A; 1EH2 A; 1QLS A; 1LKJ A; 4OR9 B; 1YVH A; 3R72 A; 2EHB A; 1IGV A; 1W7I B; 4MZJ A; 5ER4 X; 2F8P A; 3TS5 B; 1AK8 A; 1IG5 A; 2LCP A; 4U8D A; 1YX8 A; 2RGI A; 2WCB A; 2M49 B; 1JF2 A; 4GGF C; 2LUX A; 5CPV A; 3SG4 A; 2M1U A; 4C0L A; 2P70 A; 2JOJ A; 1YUS A; 4MEW A; 4JPZ B; 1GQM A; 4PHM A; 1SMG A; 4FTG A; 4GPL B; 3O6B A; 3D75 A; 1Y1A A; 1DQE A; 1SY9 A; 5HKY A; 2ZRT A; 2SAS A; 4PHN A; 1XVJ A; 4HRH A; 3TZ1 A; 1AVS A; 2KFH A; 1XFR A; 3PN7 C; 3PJI A; 1A75 A; 4MVF A; 3NSO A; 2K7D A; 2JT0 A; 3NSL A; 3S0E A; 1MF8 B; 2KAX A; 2BL0 C; 2JU0 A; 2D8N A; 1XFV O; 2LM5 A; 1NX2 A; 1RFJ A; 1QX5 B; 1SYM A; 2AUC A; 4MZL A; 3H4S E; 1V1G A; 2NXQ A; 2K60 A; 3D73 A; 4GUK A; 1SR6 B; 1B4C A; 2BBM A; 2G9B A; 4YGA A; 1DEL A; 1JWD A; 1NCX A; 1B47 A; 2JPO A; 1JFK A; 3L47 A; 3I5G C; 3SS5 A; 1OOF A; 1UHI A; 1TWO A; 5AER A; 5I8N A; 1J7P A; 1SL9 A; 1YRT B; 4BY4 A; 1QS7 A; 2JXC A; 1TOP A; 2L51 A; 1AJ5 A; 2K8M B; 3I5H C; 3PSR A; 4JWQ A; 1SRA A; 2L50 A; 3Q8I A; 1GGW A; 1RK9 A; 4AOM A; 3VGO A; 1SK6 D; 2DOQ A; 4JD9 A; 5GQQ C; 3ZNI A; 4AQJ A; 3QRX A; 1S36 A; 3UO9 A; 4WQ3 A; 2I2R E; 1FW4 A; 3UNW A; 1MR8 A; 2WCK A; 4MBE A; 5J3X A; 1JF0 A; 5HKW A; 2KHN A; 1K94 A; 5PAL A; 1K93 D; 1TNQ A; 3D0Y B; 2KPH A; 5DKQ A; 1OMV A; 2EC6 C; 1DF0 B; 1F54 A; 1CTR A; 1QVI Z; 1QV1 A; 5KSZ A; 1K9K A; 1OOH A; 5B8I B; 3GK4 X; 3D10 A; 1F4O A; 4C0J A; 1TNW A; 2ZN8 A; 1MWN A; 4I5L B; 1C07 A; 3SG6 A; 2GGM A; 1MXE A; 3ICB A; 2LAP A; 1SNL A; 2M0R A; 2L0P A; 3IQQ A; 1RWY A; 1DJW A; 3CS1 A; 2L4H A; 3L4L A; 2WOS A; 1J55 A; 3NHI A; 3TUY C; 1OOJ A; 3AAK A; 1KQM B; 1E8A A; 1SSE B; 3F45 A; 3R1O A; 1TCF A; 2LMT A; 3PAT A; 3WHU B; 1XFY O; 5FI2 A; 2E6W A; 5CSJ A; 1C7V A; 1WRK A; 2JWW A; 4DCK A; 2LMU A; 2WC8 A; 3FWB A; 3EKJ A; 1XFU O; 2JC2 A; 4MRY A; 1TN4 A; 2M9G A; 1SKT A; 1YUU A; 3B7A A; 1OOI X; 1KK7 Z; 3ZWH A; 2ISD A; 1OOG A; 1EXR A; 4N1F A; 3CR5 X; 3I5F B; 1TCO B; 2LLS A; 1UUR A; 1KCY A; 3DF0 A; 1BOC A; 3PFV A; 1PSB A; 3O4Y A; 1CLL A; 3DYE A; 1NX0 A; 3NXA A; 2FJU B; 1L7Z A; 1DJZ A; 1MHO A; 3PM2 A; 3DD4 A; 3OGN A; 2KFG A; 1B8L A; 5HKZ A; 1QLK A; 1UHK A; 2F3Y A; 4PDZ A; 2AAO A; 1FBV A; 1KSO A; 2I7A A; 2M8U A; 2O5G A; 1BR1 B; 2K2F A; 2A4J A; 1S5G Y; 2BAP A; 2F2O A; 1DC1 A; 1XK4 A; 1F4Q A; 4OVN F; 4PE4 A; 2KAY A; 1SCM C; 3CZ1 A; 3BUM B; 5HLO A; 4UPG A; 4INW A; 1C7W A; 1QXP A; 2LLU A; 1EJ3 A; 2KLD A; 1S6J A; 2LAN A; 2V53 A; 4P2Y B; 4E68 A; 2LC5 A; 2Y5I A; 1KFX S; 4DIR A; 2NCP A; 1WDC B; 2B1U A; 2P71 A; 3AKA A; 3CGA A; 1ZOT B; 3PLF B; 4CFR A; 2KGR A; 3TS5 C; 1S6I A; 2QEO A; 5I2L A; 2HET A; 3VRQ A; 3K21 A; 3EG5 B; 4YGE B; 2JT3 A; 2QEV A; 3B6X A; 2QAC A; 3BJH A; 3CAB A; 2QPT A; 3FIA A; 2OS8 C; 1NCZ A; 1A29 A; 1S6C A; 2JUL A; 3D76 A; 3S0D A; 5KTY A; 1NPQ A; 1KSM A; 4QJ4 B; 1QAS A; 1IRJ A; 1Q80 A; 3RLZ A; 3I5I B; 1N65 A; 4PHJ A; 3KHE A; 2KYF A; 4TNC A; 2ZKM X; 1CLM A; 2BCA A; 1RTP 1; 2G2B A; 4QJ3 B; 4PAL A; 1GM0 A; 1BG1 A; 2KDH A; 2OS8 B; 1V1F A; 2Q4U A; 3CYZ A; 3M0W A; 5TNC A; 5DKN A; 1C3Y A; 4IL1 A; 5HYD A; 2LNK A; 4ICB A; 3A8R A; 2HQ8 A; 1BF5 A; 5I2O A; 1SR6 C; 2FOT A; 1REC A; 3KPX A; 3BUO B; 3CDN A; 5D69 A; 4GBA A; 1WLM A; 2QEH A; 4FQO A; 2K2A A; 3SS4 A; 1SBJ A; 3R1P A; 1WRL A; 4MRX A; 1BU3 A; 4YGC B; 1CFF A; 5DIC A; 1QIW A; 2GGZ A; 3KEV A; 1TIZ A; 2KAV A; 3DVJ A; 5K89 A; 1J1E A; 4GGF A; 1M39 A; 2E30 A; 1ALV A; 1TNX A; 1A75 B; 1XFZ O; 2KI6 C; 3BYA A; 3GK1 A; 3SG5 A; 2GV5 A; 1YRU B; 3SG7 A; 1NUB A; 2H2K A; 3LLE A; 4M2P A; 1KFX L; 1KWO B; 2OTG B; 1IWQ A; 4PHK A; 1OSA A; 2ZRS A; 1HQV A; 4PT1 A; 4XJK A; 1YTZ C; 4HRE E; 2LVV A; 2QEB A; 2VRG A; 2WND A; 1BOD A; 1ZAC A; 2EGD A; 1CDM A; 2LV7 A; 4PE0 A; 5AEQ A; 1EG3 A; 2MRD A; 1JUO A; 2L5Y A; 2WCH A; 1G8I A; 4N1G A; 1DJG A; 2WC6 A; 4DRW A; 3D77 A; 2LLT A; 2MHH A; 1XO5 A; 1TNP A; 2CNP A; 3N7H A; 1Z4H A; 5CSN A; 2JPT A; 2MAZ A; 1XA5 A; 1KK8 B; 1QVI Y; 4GAO A; 2Y1N A; 1TTX A; 2KI6 D; 2F3Z A; 4CLN A; 5HL1 A; 4WRI A; 1MQ1 A; 3OB2 B; 5I2Q A; 1KQM C; 3S0F A; 2K7B A; 4YI8 A; 3BUW B; 1IJ6 A; 1WRZ A; 3S0B A; 2ZN9 A; 3O78 A; 1ALW A; 1W9Z A; 1DGU A; 1DJY A; 2BKI B; 5EL2 A; 2PAS A; 3KO0 A; 1OZO A; 1K9U A; 1ORG A; 3BUN B; 2BNX A; 3EK4 A; 2KYC A; 3AKB A; 1Y1X A; 4MLW A; 2AMI A; 2LP2 A; 4KYN A; 3BXK A; 3I5F C; 4ORC B; 4AQI A; 3LCP C; 4C0K A; 2WC5 A; 1M31 A; 2CT9 A; 1T14 A; 1PRW A; 4I5N B; 5IBW A; 3LK1 A; 1VRK A; 2NCO A; 1B9A A; 2L2E A; 2CXJ A; 5G08 A; 1KK7 Y; 1UHH A; 4OCI A; 2BBN A; 1BMO A; 2K7O A; 1G33 A; 2KBM A; 1CDL A; 2TN4 A; 2R2I A; 3EVV A; 3WXA A; 3CTN A; 4ZCU A; 2L4I A; 1OMR A; 2Y1M A; 1JBA A; 3WNX B; 2BE6 A; 4A4B A; 2JNX A; 1CKK A; 3HX4 A; 1KQV A; 1TUJ A; 1XFX O; 4NDC A; 4ORA B; 3SG3 A; 1UP5 A; 2MA2 A; 2L5X B; 3DF0 B; 4FQT A; 1OW4 A; 2BCB A; 3DXL A; 1WDC C; 4PE7 A; 1QAT A; 1XK4 C; 1M46 A; 1UHN A; 1LA0 A; 1JSA A; 2FCD A; 2JXL A; 2L98 A; 5AAN A; 4DUQ A; 1DJX A; 3DVE A; 1EG4 A; 2BEC A; 2M3W A; 1PUL A; 2SCP A; 2WOR A; 1F70 A; 3CZT X; 4CID A; 3VRP A; 5FI6 A; 1DTL A; 4XYN A; 1AUI B; 1F8H A; 3BOW A; 1CM4 A; 1A03 A; 3FWC A; 2OPO A; 1K2H A; 2CBL A; 1S26 D; 2PMY A; 4I5K A; 3I5I C; 3LL8 B; 1GJY A; 2BCX A; 1L2O B; 4NDB A; 1NIW A; 1NP8 A; 3IQO A; 1U5I A; 3L4A A; 2LVI A; 3CZ2 A; 1MXL C; 1QV0 A; 2KI4 B; 4YBH B; 4A4C A; 2Q91 A; 3S0A A; 3B86 A; 4USL A; 5AFP A; 3JTD B; 1AJ4 A; 1PK0 D; 2HQW A; 3FE6 A; 3PM8 A; 1CDN A; 2KQY A; 3VRO A; 1JFJ A; 3JVT B; 3B88 A; 2PQL A; 3K1E A; 1Z2C B; 2LVK A; 5F6T A; 1DJH A; 1B7T Z; 1YR5 A; 2LE9 B; 1SW8 A; 4M2O A; 1J7R A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1C3Z A; 4PT1 A; 2WCL A; 3DZT A; 3L4L A; 2QEB A; 1LS8 A; 3NHI A; 3DY9 A; 2GTE A; 4F7F A; 3R1O A; 2WCH A; 2WC6 A; 3D77 A; 3N7H A; 3NGV A; 2WCJ A; 2QDI A; 3B7A A; 3NHT A; 1OOI X; 3S0F A; 1OOG A; 3S0B A; 3S0G A; 3DYE A; 5EL2 A; 3BFA A; 2L2C A; 1ORG A; 3OGN A; 1QWV A; 3R1V A; 3B87 A; 3R72 A; 2WC5 A; 1T14 A; 2H8V A; 3CZ1 A; 4INW A; 2P70 A; 3D75 A; 1DQE A; 3FE9 A; 2P71 A; 3BFB A; 3BFH A; 1XFR A; 2QEO A; 1P28 A; 3PJI A; 3S0E A; 3RZS A; 2QEV A; 3B6X A; 3BJH A; 1TUJ A; 3CAB A; 3VB1 A; 3D76 A; 3S0D A; 4FQT A; 3D73 A; 1OW4 A; 3D74 A; 3DXL A; 2WCM A; 2JPO A; 3L47 A; 3CZ0 A; 1OOF A; 1TWO A; 1GM0 A; 1C3Y A; 3CYZ A; 2ERB A; 3Q8I A; 3V2L A; 3FE8 A; 4JD9 A; 3CDN A; 2WCK A; 2QEH A; 3L4A A; 3R1P A; 3CZ2 A; 3D78 A; 2KPH A; 3S0A A; 3B86 A; 4OZD A; 5DIC A; 3FE6 A; 1OOH A; 3B88 A; 2PQL A; 3K1E A; 3QME A; 2FJY A; 4INX A;
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