The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
107
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structure length |
96
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Chain Sequence |
ETKYDVEEFVSELCKGFSLLADPERHLITAESLRRNSGILGIEGMSKEDAQGMVREGDLDGDGALNQTEFCVLMVRLSPEMMEDAETWLEKALTQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the complex of a mitotic kinesin with its calcium binding regulator.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Motor protein/calcium binding protein
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| source organism |
Arabidopsis thaliana
|
| molecule keywords |
Kinesin-like calmodulin-binding protein
|
| total genus |
30
|
| structure length |
96
|
| sequence length |
107
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-04-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Recoverin; domain 1 | EF-hand |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KI4 C; 2JTZ A; 3DVJ A; 2NCP A; 1RRO A; 1S5G Z; 3OHM B; 2LP2 A; 5DKQ A; 1F54 A; 1PK0 D; 1KSO A; 2FCD A; 3NSL A; 3TUY B; 5I8N A; 1YUR A; 1YVH A; 2MRD A; 2K61 A; 4YGE B; 4HSZ A; 1UP5 A; 2LHI A; 1JFJ A; 1K9U A; 4ORB B; 5FYX A; 5HYD A; 2MLE C; 5D69 A; 2WCF A; 1CKK A; 1ZOT B; 4GAO A; 4D1E A; 1CMG A; 3PAT A; 3A8R A; 3SIA A; 3JTD B; 2I2R E; 1ALV A; 2I7A A; 4HRG A; 5HKY A; 2BEC A; 1DJW A; 3FIA A; 1OZO A; 1WRL A; 1NPQ A; 5AEQ A; 3VRR A; 2ZN8 A; 1S26 D; 1B1G A; 1C7W A; 1QV0 A; 1XVJ A; 1XFZ O; 1MXL C; 4DIR A; 1F71 A; 1ZAC A; 2HQ8 A; 1SL9 A; 5IBW A; 2F33 A; 1JC2 A; 2AUC A; 2KI4 B; 1A75 B; 1NX0 A; 2JU0 A; 4WQ2 A; 1SK6 D; 1B8R A; 2ZFD A; 2BKH B; 2M9G A; 2KYF A; 1DF0 B; 3EK7 A; 3BXK A; 2Y1N A; 3D0Y B; 3SIB A; 1B7T Y; 3O78 A; 1KCY A; 3TZ1 A; 1QVI Z; 1NX1 A; 1JWD A; 4IL1 A; 5CPV A; 2M7L A; 2LMT A; 1CMF A; 2KBI A; 1BU3 A; 3OX5 A; 5K89 A; 2BCB A; 1YUS A; 2LAP A; 2NZ0 A; 4BY5 A; 4WQ3 A; 4OV2 A; 2L98 A; 2KFF A; 3CZT X; 1FF1 A; 4USL A; 3JVT C; 4ZCV A; 1IKU A; 3NSO A; 2VRG A; 3K21 A; 4HRE E; 1PSR A; 4AOM A; 1SNL A; 1M45 A; 1QTX A; 2EHB A; 2M97 A; 4PHN A; 1ALW A; 3A4U B; 1FI5 A; 3CGA A; 2COL B; 3LLE A; 1UHN A; 1DJH A; 1OSA A; 1EG4 A; 1KQM C; 1FBV A; 2KFH A; 1J7P A; 4M2O A; 4GUK A; 1UHH A; 2HF5 A; 2E30 A; 3CR4 X; 4N5X A; 4NDD A; 2HQW A; 2L50 A; 3NSK A; 4QJ3 B; 4NDC A; 1K90 D; 1C7V A; 1QX2 A; 1XO5 A; 1SMG A; 3TS5 C; 1MWN A; 5KTY A; 2LLU A; 2BE6 A; 2M0R A; 4OR9 B; 4PE4 A; 1JSA A; 1SY9 A; 3WHU B; 1NX3 A; 3KO0 A; 4PE0 A; 1DJI A; 1TCO B; 1EL4 A; 1J7O A; 2Y4Q A; 2R2I A; 1MHO A; 1ZFS A; 5BPJ A; 1YRU B; 1QJT A; 2AAO A; 2M49 B; 3LCP C; 1SCV A; 1YX8 A; 3OP0 A; 1J1D A; 3GK2 A; 3JVT B; 4PE7 A; 4YGB B; 2MHH A; 1CLL A; 1XA5 A; 1EXR A; 1BLQ A; 1X02 A; 2K0J A; 4I5K A; 3BUN B; 4WRI A; 4P2Y B; 3TDU A; 3VRP A; 3QRX A; 1WLZ A; 1EG3 A; 3O2P A; 3BOW A; 1CLB A; 3EVR A; 1JUO A; 1XFX O; 3SG4 A; 1AK8 A; 1KQM B; 3E3R A; 1IJ5 A; 1DJG A; 1SL8 A; 3O6B A; 4OKH A; 2JXL A; 2PVB A; 3CTN A; 5CSJ A; 1UHK A; 3PAL A; 1R2U A; 2K7C A; 5ER5 A; 1A2X A; 1CFF A; 3TS5 B; 2KBM A; 1K8U A; 2BBN A; 5CSI A; 1NIW A; 1S1E A; 3VRN A; 3WNX B; 2LP3 A; 3SJS A; 1MUX A; 1XFV O; 1CFP A; 5ER4 X; 2OPO A; 3HCM A; 2K2F A; 3CS1 A; 1OQP A; 5HKW A; 2F3Z A; 1QX7 A; 1IGV A; 1SYM A; 1TOP A; 1YX7 A; 1QIW A; 1L2O C; 2K8M B; 1N65 A; 4MSP A; 4MZK A; 1Y1A A; 5AAN A; 3SG2 A; 2K7B A; 1W7J B; 3OB2 B; 1V1G A; 4CFR A; 2CXJ A; 3LK0 A; 1F55 A; 5DKN A; 1KK8 C; 1OE9 B; 1K9P A; 1IJ6 A; 3NSI A; 3BQ3 A; 2M8U A; 2QAC A; 1FPW A; 1G8I A; 1UWO A; 3BOW B; 1UUS A; 2AMI A; 2MBX A; 1WDC C; 1CFD A; 2F8P A; 4E68 A; 1DTL A; 1RWY A; 1C07 A; 1A4P A; 2WOR A; 4CPV A; 1SCM C; 3HX4 A; 2BCA A; 1B7T Z; 2G2B A; 1PVA A; 1AJ5 A; 1K95 A; 2L4H A; 4JWQ A; 1MR8 A; 1QX5 B; 2CCM A; 2TN4 A; 1M31 A; 2SCP A; 1J55 A; 3EVU A; 2LAN A; 5F6T A; 4PE1 A; 1CFC A; 4YI9 A; 2MJW B; 3OB1 B; 2LCP A; 1XFW O; 4Q04 A; 1IQ3 A; 3PM8 A; 1L2O B; 2HPS A; 1NYA A; 1UHJ A; 3BUW B; 2WOS A; 1F70 A; 1KFX S; 2SAS A; 2L5X B; 1U5I A; 2FJU B; 1BMO A; 5I2Q A; 1DT7 B; 4HRH A; 1Y6W A; 1TNQ A; 4YRU A; 1KK8 B; 1L7Z A; 1OOJ A; 1ZUZ A; 2Y1M A; 5I2O A; 3EK4 A; 1GJY A; 1IG5 A; 1K93 D; 1DGV A; 2MLF C; 5B8I B; 4AQJ A; 2BCX A; 1WDC B; 1AHR A; 2FOT A; 3I5I C; 1DJX A; 4FTG A; 1SCM B; 1Y1U A; 1K94 A; 4I5L B; 2BE4 A; 4L9M A; 2LLS A; 1REC A; 4GGF A; 1LXF C; 4MLW A; 2PAS A; 1R6P A; 3CR2 A; 3LK1 A; 4GGN A; 1GGZ A; 4ETO A; 2M1U A; 1BOD A; 2JNX A; 2WND A; 2KAY A; 1H8B A; 2KGB C; 1PVB A; 3FS7 A; 1NCZ A; 1SW8 A; 3EK8 A; 3KPX A; 4GGF C; 4N1G A; 3TDZ A; 5HKZ A; 3VRQ A; 1H4B A; 2LVJ A; 2M1K B; 2BBM A; 2KNE A; 1KSM A; 1QLK A; 1B47 A; 4C0L A; 1SR6 C; 2EGD A; 2JOJ A; 3VGO A; 3I5F C; 1B4C A; 3BUX B; 3BUO B; 4MRX A; 1NCX A; 1DMO A; 2KYC A; 2LHL A; 2NXQ A; 1QAT A; 2O5G A; 1LA3 A; 1SBJ A; 4GNK B; 2KFG A; 1J1E A; 1TRF A; 1YVL A; 2LM5 A; 1KFX L; 1AJ4 A; 1VRK A; 2LC5 A; 1QLS A; 3DVK A; 2GV5 A; 3GK1 A; 2PMY A; 1U5I B; 3VRO A; 3I5I B; 3IF7 A; 1WRK A; 4DCK A; 1NSH A; 2RGI A; 1AUI B; 1KK7 Y; 3D10 A; 1YTZ C; 5CSF A; 4A4C A; 2JZI A; 4C0K A; 1M46 A; 2BKI B; 4FQO A; 2OS8 C; 2WC8 A; 3RLZ A; 1WY9 A; 1RK9 A; 2P6B B; 3GK4 X; 1WRZ A; 1BG1 A; 2LUX A; 5I2L A; 4C0J A; 1D1O A; 1RJV A; 5GQQ C; 1TCF A; 1TIZ A; 1V1F A; 2M29 A; 2Q4U A; 4A4B A; 4MZL A; 1Q80 A; 1CTR A; 2CNP A; 2KAV A; 1QS7 A; 2V53 A; 4CLN A; 1SR6 B; 5AER A; 4CID A; 1M63 B; 2WCE A; 3I5F B; 3TDI A; 3I5H C; 1BOC A; 1Y1X A; 3EKJ A; 5PAL A; 3BYA A; 1ZMZ A; 4TNC A; 1SKT A; 1DJY A; 1S6J A; 3CLN A; 4XYN A; 1TNW A; 2K7D A; 2ZKM X; 1CM4 A; 2F2P A; 2NLN A; 2I18 A; 2LVK A; 1FW4 A; 3EKH A; 1CM1 A; 4YBH B; 1OZS A; 2K7O A; 4I5J A; 2LNK A; 1WLM A; 2L2E A; 3AAK A; 3MSE B; 2Y5I A; 2H2K A; 1LIN A; 1QXP A; 3PN7 C; 4YGD B; 1TNP A; 2B1U A; 5TNC A; 1MF8 B; 3OX6 A; 3SG5 A; 4ZCU A; 2OS8 B; 4CFQ A; 1IRJ A; 1TTX A; 3BUM B; 1M39 A; 1BR4 B; 2WCB A; 1BR1 B; 2JT3 A; 3D0Y A; 1BF5 A; 1F4O A; 3LL8 B; 5CSN A; 3AKB A; 2ZND A; 2G9B A; 3PLF B; 3ZNI A; 4OCI A; 5DKR A; 2KOT A; 1FI6 A; 1MQ1 A; 1GQM A; 1QIV A; 2PAL A; 4UPG A; 1YR5 A; 3I5G C; 1NX2 A; 1IH0 A; 1RFJ A; 1ODB A; 3I5H B; 2JNF A; 2M7N A; 4OVN F; 3DF0 A; 2PRU A; 4JPZ B; 1S5G Y; 1JFK A; 1F8H A; 4R1E A; 1OMV A; 1CDP A; 5JOL A; 1A29 A; 1G33 A; 2DOQ A; 1KQV A; 2D8N A; 2I94 A; 4XJK A; 1AVS A; 1OMD A; 1XK4 A; 4QJ4 B; 1CNP A; 3O4Y A; 5AXI A; 2IS9 A; 3PN7 B; 5HLO A; 1DVI A; 2MA2 A; 2MAZ A; 4ICB A; 2PSR A; 3WHT B; 1PUL A; 1G4Y R; 1TN4 A; 2LVI A; 5JJG A; 1BJF A; 2KHN A; 1SPY A; 1K9K A; 4PHJ A; 4U8D A; 4GBA A; 2LMV A; 1XK4 C; 4MN0 A; 1OMR A; 4PDZ A; 1KWO C; 2E6W A; 3WXA A; 3PFV A; 2KI6 C; 2A4J A; 2ZRT A; 3ZWH A; 1LA0 A; 1S3P A; 2ZNE A; 1YUT A; 1RTP 1; 2BL0 C; 2JPT A; 3CR5 X; 4MZJ A; 3F45 A; 2LVV A; 3I5G B; 4F0Z B; 3PSR A; 2LUC A; 2CBL A; 5AFP A; 4YI8 A; 1KFU S; 2LLT A; 3C1V A; 2KI6 D; 4DRW A; 1DJZ A; 1S36 A; 3GOF A; 1B9A A; 2F2O A; 3AAJ A; 1S6C A; 3IQQ A; 2GGZ A; 2NCO A; 2KQY A; 2L0P A; 2L51 A; 4GFT A; 2HET A; 2M3W A; 2OTG C; 4ORC B; 2LMU A; 3DF0 B; 1N2D A; 4MVF A; 1QVI Y; 2L4I A; 2JC2 A; 4GPL B; 1AP4 A; 1HT9 A; 3AKA A; 1BT6 A; 5J3X A; 2ZRS A; 1QAS A; 4XJK B; 1XYD A; 1KK7 Z; 3EVV A; 1KWO B; 4NDB A; 2Q91 A; 3KHE A; 3FWC A; 1IWQ A; 1UHI A; 3DVE A; 4NQG A; 1NP8 A; 2BL0 B; 2H61 A; 2KGR A; 2JT8 A; 4M2Q A; 1NUB A; 1GGW A; 1CDL A; 2JWW A; 1LKJ A; 5KU1 A; 1IQ5 A; 2JTT A; 4PHK A; 4BY4 A; 2LV7 A; 1N0Y A; 2KAX A; 3SG7 A; 2JT0 A; 2K2A A; 2ISD A; 2CT9 A; 1JBA A; 1PRW A; 2JQ6 A; 3ICB A; 3DVM A; 2EC6 C; 4PCW A; 2H61 C; 3SG6 A; 1QV1 A; 1S6I A; 2KDH A; 2CTN A; 1KFU L; 1NCY A; 2F3Y A; 5G08 A; 4DUQ A; 1YRT B; 1XFY O; 4PHM A; 3KF9 A; 4MBE A; 3TUY C; 2OTG B; 4PAL A; 4ORA B; 3M0W A; 2QPT A; 2LE9 B; 4MEW A; 1JF0 A; 4AQI A; 1LVC D; 2FCE A; 3NXA A; 1DGU A; 4YGC B; 1MXE A; 1B8C A; 1PAL A; 1F4Q A; 1UUR A; 1W7I B; 1Y0V H; 1CDM A; 5KSZ A; 2JXC A; 3DD4 A; 1A03 A; 1K2H A; 2JRF A; 4M2P A; 4I5N B; 1CB1 A; 4P5O E; 4YGA A; 1EJ3 A; 1JF2 A; 3FWB A; 3JTD C; 3RM1 A; 2KQ6 A; 4DS7 A; 1SL7 A; 1EH2 A; 1CLM A; 5D7F A; 1B8L A; 3KEV A; 3IQO A; 4QJ5 B; 1CDN A; 1YUU A; 1HQV A; 3SG3 A; 1A75 A; 4MRY A; 2O60 A; 1XFU O; 1PSB A; 1K96 A; 1SRA A; 2ZN9 A; 3CWG A; 4N1F A; 1NWD A; 5HLV A; 1J7R A; 1E8A A; 4JQ0 D; 1J7Q A; 1DF0 A; 1TNX A; 2GGM A; 3H4S E; 2EC6 B; 2JUL A; 2KSP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KI4 C; 2JTZ A; 3DVJ A; 2NCP A; 3S0B A; 1RRO A; 1S5G Z; 3OHM B; 2LP2 A; 3PM2 A; 4IJ7 A; 5DKQ A; 1F54 A; 1PK0 D; 1KSO A; 2FCD A; 3NSL A; 3TUY B; 5I8N A; 1YUR A; 2YGU A; 1YVH A; 2MRD A; 2K61 A; 4YGE B; 4HSZ A; 3B6X A; 1GM0 A; 1UP5 A; 3DYE A; 2LHI A; 1JFJ A; 1K9U A; 4ORB B; 5FYX A; 5HYD A; 2MLE C; 5D69 A; 2WCF A; 1CKK A; 1ZOT B; 4GAO A; 4D1E A; 1CMG A; 3PAT A; 3A8R A; 3SIA A; 3JTD B; 2I2R E; 1ALV A; 2I7A A; 4HRG A; 5HKY A; 2BEC A; 1DJW A; 3FIA A; 1OZO A; 1WRL A; 1NPQ A; 1SSE B; 2P70 A; 3CZ0 A; 5AEQ A; 2ZN8 A; 3VRR A; 3S0E A; 1S26 D; 1B1G A; 1C7W A; 1QV0 A; 1XVJ A; 3L4A A; 1XFZ O; 1MXL C; 3B86 A; 4DIR A; 1F71 A; 1ZAC A; 2HQ8 A; 1SL9 A; 2WCL A; 2F33 A; 5IBW A; 1JC2 A; 2AUC A; 2KI4 B; 1A75 B; 1NX0 A; 2JU0 A; 4WQ2 A; 5EL2 A; 1SK6 D; 1B8R A; 2ZFD A; 2BKH B; 2M9G A; 2KYF A; 1DF0 B; 3EK7 A; 3BXK A; 2Y1N A; 3D0Y B; 2JPO A; 3SIB A; 1B7T Y; 3O78 A; 1KCY A; 3TZ1 A; 1QVI Z; 1DC1 A; 1NX1 A; 1JWD A; 4IL1 A; 5CPV A; 2M7L A; 2LMT A; 1CMF A; 2KBI A; 1BU3 A; 3OX5 A; 5K89 A; 2BCB A; 1YUS A; 2LAP A; 2NZ0 A; 4BY5 A; 4WQ3 A; 4OV2 A; 2L98 A; 2KFF A; 3K1E A; 3CZT X; 3DZT A; 3SS3 A; 3IVT A; 4USL A; 1FF1 A; 3JVT C; 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