The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
38
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sequence length |
127
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structure length |
125
|
Chain Sequence |
KDMFNTKSSKLRIEDASHNARKLGLAPSSTDEKKIRDLYGDSLTYEQYLEYLTMCVHDRDNMEELIKMFSHFDNNSSGFLTKNQMKNILTTWGDALTEQEANDALNAFSSEDRINYKLFCEDILS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The structure of the D3 domain of Plasmodium falciparum myosin tail interacting protein MTIP in complex with a nanobody.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myosin A tail domain interacting protein MTIP
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Plasmodium knowlesi
|
| total genus |
38
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| structure length |
125
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| sequence length |
127
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| chains with identical sequence |
B, C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-08-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Recoverin; domain 1 | EF-hand |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5DKN A; 1DJZ A; 1BOD A; 1W7J B; 3AAK A; 1R6P A; 2G9B A; 2WCE A; 2HQ8 A; 2Y1M A; 4JQ0 D; 1XFY O; 4D1E A; 4GFT A; 1QIW A; 3KO0 A; 1CFC A; 1NYA A; 5HLV A; 1JSA A; 1Q80 A; 2BKI B; 3O6B A; 1F55 A; 4YGD B; 1MXE A; 1IGV A; 4ORA B; 1XFU O; 2MA2 A; 3WHT B; 1WLM A; 2K2F A; 1DJI A; 5D69 A; 1QXP A; 2L4I A; 1JFJ A; 4XJK A; 1SCM B; 4MEW A; 1PRW A; 3BOW B; 1S1E A; 1N0Y A; 1MQ1 A; 2K0J A; 4R1E A; 4FQO A; 1AJ4 A; 2BCX A; 2MAZ A; 1VRK A; 1YUU A; 5G08 A; 3AKA A; 2GGZ A; 1AP4 A; 3LK1 A; 1YR5 A; 2KHN A; 3DVE A; 3RM1 A; 4DS7 A; 1QS7 A; 1K9K A; 1B7T Z; 1CTR A; 1DTL A; 1A29 A; 2HET A; 1MXL C; 2OS8 B; 4P2Y B; 3RLZ A; 1QJT A; 4GNK B; 3HCM A; 3FIA A; 5CSN A; 2H2K A; 3DVK A; 5TNC A; 1H4B A; 5BPJ A; 3JVT C; 1JF0 A; 1CKK A; 1K2H A; 3E3R A; 1D1O A; 1K96 A; 1SCV A; 2I2R E; 1RWY A; 1SR6 B; 4C0K A; 1MR8 A; 3SG4 A; 1U5I B; 4UPG A; 1ZUZ A; 1F70 A; 1KFX L; 1WRK A; 2QPT A; 1B8R A; 3BQ3 A; 1CFF A; 2WCB A; 1M63 B; 1KSO A; 1NCZ A; 2K61 A; 1CM1 A; 1KQV A; 2EGD A; 1CDN A; 2BCA A; 1WDC B; 4NDD A; 4PE4 A; 3WHU B; 4M2Q A; 1PSB A; 1TTX A; 3TUY B; 3CR2 A; 4GGF A; 3I5H C; 4WQ3 A; 1SBJ A; 5HKZ A; 1F8H A; 1Y1U A; 3BUM B; 4YI8 A; 3BXK A; 1X02 A; 1KCY A; 1PAL A; 2ZFD A; 1BT6 A; 1KWO C; 1XK4 C; 5JJG A; 1PK0 D; 2JC2 A; 1TIZ A; 2L4H A; 3EK8 A; 4MRY A; 4F0Z B; 1M31 A; 2LP3 A; 3C1V A; 2LHL A; 1QAS A; 1IG5 A; 4OCI A; 5CSF A; 3DF0 B; 1OQP A; 2LLS A; 3SG3 A; 1SL9 A; 2M49 B; 2KYF A; 3SG6 A; 3PM8 A; 1XO5 A; 2JXL A; 4L9M A; 1NX0 A; 1GJY A; 2ISD A; 1DJX A; 1JWD A; 3WNX B; 3TS5 C; 1AUI B; 2LLT A; 2ZKM X; 4DCK A; 1RTP 1; 1G8I A; 1IJ6 A; 1AVS A; 2CT9 A; 1KK7 Z; 1CFD A; 1BR4 B; 2Y1N A; 4OR9 B; 1YRT B; 1V1F A; 5I8N A; 1Y1A A; 2JQ6 A; 2LNK A; 2JWW A; 5I2L A; 2KQY A; 3OB1 B; 1SNL A; 1IQ3 A; 1TNP A; 2L98 A; 1ZMZ A; 4PE1 A; 2LM5 A; 1YRU B; 1M39 A; 2K7O A; 1S36 A; 3CTN A; 2Q91 A; 4PHN A; 3OHM B; 2JU0 A; 2WOR A; 1V1G A; 1YTZ C; 1IRJ A; 3KF9 A; 1YVL A; 3KPX A; 4PHK A; 2KFH A; 3I5H B; 2WOS A; 4M2O A; 2CNP A; 3FWC A; 2H61 A; 2KAX A; 3WXA A; 2FJU B; 1UP5 A; 1WRL A; 4MZL A; 3OP0 A; 1JC2 A; 3EKH A; 2LV7 A; 4ICB A; 5ER4 X; 1N2D A; 2CTN A; 2LVI A; 4MSP A; 1L2O C; 1FI5 A; 4ZCU A; 1AJ5 A; 1U5I A; 2F8P A; 2ZRT A; 2HQW A; 2MJW B; 4USL A; 2KNE A; 5AER A; 4E68 A; 3SG7 A; 2OTG C; 1TNQ A; 5HLO A; 3GK2 A; 5KSZ A; 1F54 A; 1KQM B; 3KEV A; 3PAT A; 2EC6 B; 3TS5 B; 3K21 A; 1J55 A; 1S6C A; 5CPV A; 1DMO A; 1SL7 A; 3EK7 A; 4N5X A; 3FWB A; 1A03 A; 2M7L A; 2ZN8 A; 1S5G Z; 1CNP A; 5FYX A; 2E30 A; 2KBM A; 2I94 A; 3BUX B; 3PN7 B; 1EH2 A; 3BUN B; 2LVJ A; 1KK8 B; 2L5X B; 2IS9 A; 2MLF C; 2PAS A; 3LL8 B; 1BLQ A; 3DD4 A; 2M9G A; 1QX7 A; 4PDZ A; 4I5K A; 1B4C A; 1NX2 A; 2AUC A; 1DF0 B; 3GK4 X; 4GGN A; 2GV5 A; 4HRG A; 5DKQ A; 1GGW A; 1IH0 A; 1QIV A; 4YGB B; 3CS1 A; 4YI9 A; 3SJS A; 1IWQ A; 2LUX A; 3D10 A; 2LMT A; 2MRD A; 2KGB C; 2PVB A; 2CXJ A; 1SW8 A; 4AOM A; 3EVU A; 3DVJ A; 3LCP C; 1DJY A; 1QLK A; 2E6W A; 4PCW A; 1UUS A; 1FW4 A; 4MZK A; 2Q4U A; 1JF2 A; 2BL0 B; 2F2O A; 2LC5 A; 2MHH A; 4PHM A; 2AMI A; 1NP8 A; 5CSJ A; 2JXC A; 1XVJ A; 1SYM A; 1LIN A; 1TNW A; 3NSL A; 1JFK A; 3D0Y B; 4M2P A; 2LVV A; 1HT9 A; 1YUT A; 1FBV A; 1YUS A; 1AK8 A; 1TN4 A; 2OTG B; 4NQG A; 3M0W A; 1TNX A; 1TCF A; 1CDL A; 1NIW A; 1A75 A; 2F2P A; 4YGA A; 3F45 A; 1DT7 B; 1K94 A; 4TNC A; 2P6B B; 3IF7 A; 2QAC A; 2A4J A; 1SL8 A; 1TOP A; 3ICB A; 1EL4 A; 1ALW A; 1QVI Z; 2F3Y A; 1MUX A; 4A4C A; 1DVI A; 1EG4 A; 1J7P A; 1C7V A; 2JTT A; 1UUR A; 1LKJ A; 1DJW A; 1IKU A; 1HQV A; 2NLN A; 3JTD C; 1B1G A; 1C07 A; 2NCP A; 3HX4 A; 1BOC A; 1TRF A; 4ORB B; 1BU3 A; 1LA0 A; 2JT3 A; 2BCB A; 3OX5 A; 2CCM A; 1M46 A; 1MF8 B; 1DGV A; 1XFV O; 2KAV A; 1B7T Y; 1OSA A; 2LUC A; 2ZN9 A; 3BUO B; 5D7F A; 4GGF C; 2PRU A; 1CLB A; 1YUR A; 3EKJ A; 4HRE E; 3I5I C; 1QX5 B; 2MBX A; 1ODB A; 1GGZ A; 3JVT B; 1NCX A; 3IQQ A; 4PE7 A; 2JOJ A; 2KDH A; 3O78 A; 3OB2 B; 1DF0 A; 4Q04 A; 2R2I A; 1KFU L; 1L7Z A; 2KI4 C; 1IJ5 A; 1NPQ A; 4MVF A; 3ZWH A; 2LMU A; 2M1K B; 2K2A A; 1Y6W A; 4XJK B; 3I5G C; 1RFJ A; 2NZ0 A; 3BOW A; 2M97 A; 1CLM A; 1NWD A; 2K7B A; 3TZ1 A; 1G33 A; 4MLW A; 4A4B A; 5I2O A; 4DUQ A; 1OOJ A; 4PHJ A; 1B47 A; 2LCP A; 3PAL A; 1Y0V H; 5B8I B; 4JWQ A; 2BE4 A; 1KWO B; 1SPY A; 2JRF A; 2LVK A; 2O5G A; 4CLN A; 1CDM A; 1ZFS A; 1XFX O; 2KBI A; 3PFV A; 2TN4 A; 1QAT A; 5I2Q A; 1A4P A; 3BUW B; 2K8M B; 2LP2 A; 2ZRS A; 3CZT X; 4BY4 A; 1DGU A; 5J3X A; 1SCM C; 2PSR A; 2L51 A; 1RK9 A; 5KU1 A; 2LE9 B; 3LLE A; 1KK7 Y; 1UHK A; 3ZNI A; 1N65 A; 1OZS A; 4N1G A; 2EHB A; 1UHJ A; 1QTX A; 4MZJ A; 1KSM A; 4QJ4 B; 1BF5 A; 4CPV A; 1XYD A; 4YGE B; 2M1U A; 2H61 C; 2NCO A; 2KOT A; 4PAL A; 3I5F C; 1NCY A; 1LA3 A; 1IQ5 A; 2O60 A; 3CWG A; 2BBM A; 5AEQ A; 2OPO A; 3VRP A; 2JT8 A; 4PE0 A; 3KHE A; 2KI4 B; 2KI6 C; 3DF0 A; 3SIB A; 1OMD A; 4ORC B; 4YGC B; 2MLE C; 1JBA A; 2FCE A; 4HRH A; 1OE9 B; 1J7O A; 4BY5 A; 2F3Z A; 2K7D A; 5ER5 A; 1LVC D; 1S6I A; 1R2U A; 4GBA A; 3VRR A; 1CMF A; 3CR5 X; 2COL B; 4AQJ A; 3TDZ A; 1WDC C; 1LXF C; 1J7R A; 2LAN A; 3TUY C; 4ETO A; 5AXI A; 4MN0 A; 1DJG A; 3OX6 A; 2M3W A; 1UHI A; 2WC8 A; 1A2X A; 2BKH B; 3FS7 A; 2RGI A; 1K95 A; 3TDI A; 2BBN A; 1AHR A; 1CDP A; 1L2O B; 4WQ2 A; 5CSI A; 2PMY A; 1H8B A; 2BEC A; 4OVN F; 2WND A; 1UHN A; 2M0R A; 1M45 A; 4C0L A; 1CB1 A; 2I7A A; 1UWO A; 2KGR A; 3DVM A; 5IBW A; 2Y5I A; 4FTG A; 3SG2 A; 1NX1 A; 1G4Y R; 1EG3 A; 5AFP A; 2JPT A; 2JNF A; 4CFQ A; 4N1F A; 3CGA A; 1S5G Y; 1SK6 D; 2KI6 D; 5F6T A; 1CFP A; 1J1E A; 3A4U B; 1QV1 A; 4XYN A; 1YX7 A; 3NSK A; 3NXA A; 1SMG A; 2WCF A; 2Y4Q A; 3I5F B; 1XK4 A; 4JPZ B; 5GQQ C; 3LK0 A; 1C7W A; 2KYC A; 2HF5 A; 1PVB A; 2F33 A; 2L2E A; 2VRG A; 1FF1 A; 3CLN A; 4U8D A; 2D8N A; 2BE6 A; 1BG1 A; 1XA5 A; 1WRZ A; 4I5N B; 4HSZ A; 4QJ3 B; 4ZCV A; 5AAN A; 1WY9 A; 1F71 A; 1CM4 A; 1S26 D; 1W7I B; 2GGM A; 1QV0 A; 2KQ6 A; 1PVA A; 4C0J A; 1J7Q A; 1OZO A; 2JT0 A; 2KAY A; 5PAL A; 1NUB A; 4QJ5 B; 3NSI A; 1BJF A; 2JZI A; 3O4Y A; 2L50 A; 5DKR A; 3EVR A; 2KFF A; 4DRW A; 2M7N A; 5KTY A; 3VGO A; 1XFW O; 2JUL A; 3H4S E; 1OMV A; 2B1U A; 2FCD A; 1OMR A; 3O2P A; 2ZND A; 3CR4 X; 1ZAC A; 1JUO A; 1KFX S; 2KSP A; 4GUK A; 1F4Q A; 2LAP A; 4GPL B; 1NSH A; 2JNX A; 2K7C A; 3TDU A; 3VRO A; 1QX2 A; 1QLS A; 1K90 D; 1SKT A; 3EVV A; 2M29 A; 1KQM C; 3BYA A; 1QVI Y; 2EC6 C; 2JTZ A; 1K9U A; 5JOL A; 3SIA A; 2LHI A; 1B8C A; 4I5J A; 4GAO A; 3GK1 A; 1NX3 A; 3VRN A; 4YBH B; 2FOT A; 2ZNE A; 1J1D A; 2HPS A; 2I18 A; 4OV2 A; 1S6J A; 1EJ3 A; 2G2B A; 3A8R A; 3PN7 C; 3PSR A; 3NSO A; 1FPW A; 1KK8 C; 3VRQ A; 4DIR A; 3GOF A; 5K89 A; 3JTD B; 1B8L A; 4NDB A; 1MWN A; 5HKW A; 3D0Y A; 1EXR A; 2KFG A; 3QRX A; 1CMG A; 2CBL A; 1CLL A; 4YRU A; 4CFR A; 1FI6 A; 5HYD A; 5HKY A; 2NXQ A; 1YVH A; 3AKB A; 4I5L B; 2LMV A; 1A75 B; 1F4O A; 1SY9 A; 3EK4 A; 3SG5 A; 2SCP A; 2LLU A; 2SAS A; 2M8U A; 3AAJ A; 1BR1 B; 2L0P A; 4CID A; 1TCO B; 2AAO A; 3PLF B; 2BL0 C; 1RJV A; 3I5I B; 1YX8 A; 1ZOT B; 4IL1 A; 4WRI A; 1K93 D; 1KFU S; 1WLZ A; 2OS8 C; 1E8A A; 1S3P A; 4NDC A; 1UHH A; 1GQM A; 4P5O E; 1BMO A; 4OKH A; 1K8U A; 2DOQ A; 3IQO A; 1PUL A; 1SR6 C; 4MBE A; 1REC A; 1B9A A; 2V53 A; 1XFZ O; 2PAL A; 3I5G B; 1ALV A; 1K9P A; 1DJH A; 4AQI A; 1PSR A; 3MSE B; 1MHO A; 1SRA A; 4MRX A; 1Y1X A; 1RRO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5DKN A; 1DJZ A; 1BOD A; 1W7J B; 3AAK A; 1R6P A; 2G9B A; 2WCE A; 2HQ8 A; 2Y1M A; 4JQ0 D; 2GTE A; 1XFY O; 4D1E A; 4GFT A; 1XFR A; 1QIW A; 3KO0 A; 1CFC A; 1NYA A; 5HLV A; 1JSA A; 1Q80 A; 2BKI B; 3O6B A; 1F55 A; 1W9Z A; 1MXE A; 4YGD B; 1IGV A; 4ORA B; 1XFU O; 2MA2 A; 3WHT B; 1WLM A; 2K2F A; 3S0A A; 1DJI A; 5D69 A; 1QXP A; 2L4I A; 1JFJ A; 4XJK A; 3UNW A; 1SCM B; 4MEW A; 1PRW A; 3BOW B; 1S1E A; 1N0Y A; 1MQ1 A; 2K0J A; 4R1E A; 4FQO A; 1AJ4 A; 2BCX A; 2MAZ A; 1VRK A; 1YUU A; 5G08 A; 3AKA A; 2GGZ A; 1AP4 A; 3LK1 A; 1YR5 A; 2KHN A; 3DVE A; 3RM1 A; 4DS7 A; 1QS7 A; 3OBV A; 1K9K A; 1B7T Z; 1CTR A; 1DTL A; 1A29 A; 2HET A; 1MXL C; 2OS8 B; 4P2Y B; 3RLZ A; 1QJT A; 4GNK B; 3HCM A; 3FIA A; 5CSN A; 2H2K A; 3DVK A; 5TNC A; 1H4B A; 5BPJ A; 3JVT C; 1JF0 A; 1CKK A; 1K2H A; 3E3R A; 1D1O A; 1K96 A; 1SCV A; 2BAP A; 1RWY A; 1SR6 B; 2I2R E; 1DQE A; 1MR8 A; 3SG4 A; 2L2C A; 1U5I B; 3K1E A; 4C0K A; 4UPG A; 1ZUZ A; 3S0F A; 1F70 A; 1KFX L; 1WRK A; 2QPT A; 1B8R A; 3BQ3 A; 1CFF A; 2WCB A; 1M63 B; 1KSO A; 1NCZ A; 2K61 A; 1CM1 A; 1KQV A; 2EGD A; 1CDN A; 2BCA A; 1WDC B; 4NDD A; 4PE4 A; 3WHU B; 3RZS A; 4M2Q A; 1PSB A; 1TTX A; 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