The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
46
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
GDDQVSEFKEAFELFDSERTGFITKEGLQTVLKQFGVRVEPAAFNEMFNEADATGNGKIQFPEFLSMMGRRMKQTTSEDILRQAFRTFDPEGTGYIPKAALQDALLNLGDRLKPHEFAEFLGITETEKGQIRYDNFINTMFT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Muscle protein
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| source organism |
Physarum polycephalum
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| publication title |
Structural Evidence for Non-Canonical Binding of Ca2+ to a Canonical EF-Hand of a Conventional Myosin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MAJOR PLASMODIAL MYOSIN HEAVY CHAIN
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| total genus |
46
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| ec nomenclature |
ec
3.6.1.32: Transferred entry: 5.6.1.8. |
| pdb deposition date | 2005-02-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF13499 | EF-hand_7 | EF-hand domain pair |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Recoverin; domain 1 | EF-hand | ||
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Recoverin; domain 1 | EF-hand |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WY9 A; 5ER5 A; 5B8I B; 1KFX S; 3MSE B; 2L4H A; 1JUO A; 2AUC A; 5KSZ A; 4ORC B; 1OMV A; 4N1G A; 3I5I B; 1K93 D; 2F8P A; 5AEQ A; 1FBV A; 4P2Y B; 3IQO A; 1MR8 A; 1GGZ A; 1IGV A; 1Y0V H; 1SR6 C; 2O60 A; 2E30 A; 1A2X A; 1QLS A; 2JNX A; 4PHN A; 3EVR A; 1LA0 A; 1EG3 A; 1R6P A; 3PLF B; 2M49 B; 4I5K A; 3TDZ A; 3HX4 A; 1FW4 A; 2JOJ A; 1K8U A; 1K9U A; 1KK7 Z; 2WCE A; 3BQ3 A; 2L0P A; 1TNQ A; 2F2P A; 5D69 A; 1TN4 A; 3VRQ A; 2JXC A; 2JRF A; 2B1U A; 2KHN A; 1CKK A; 4GNK B; 3JVT B; 4FQO A; 3KO0 A; 1YVH A; 2F33 A; 1OSA A; 1J7Q A; 4MZL A; 2KI4 C; 3O4Y A; 2LAP A; 1M63 B; 2F2O A; 3FWB A; 3KPX A; 2JTT A; 3JTD B; 3CGA A; 5CSI A; 2L2E A; 2BKH B; 1JC2 A; 1UHJ A; 3GOF A; 1WRK A; 4GPL B; 1CFF A; 1DGU A; 1NIW A; 1K9K A; 2TN4 A; 3SIB A; 1NX2 A; 1M31 A; 2WCF A; 3BOW A; 4N1F A; 1JF2 A; 1PVA A; 1A29 A; 1IRJ A; 4MSP A; 2EC6 C; 1YUR A; 4CFQ A; 2KAX A; 1OZO A; 2PMY A; 1SCM B; 4MLW A; 1FPW A; 3AKB A; 1RFJ A; 2P6B B; 2K2F A; 4A4C A; 1BT6 A; 3I5G B; 1C7V A; 4CLN A; 3E3R A; 4CPV A; 2L98 A; 2LVJ A; 2KAV A; 2FCD A; 1OMD A; 2KDH A; 1CDN A; 2OTG C; 1NWD A; 3OP0 A; 4FTG A; 1F71 A; 2Y1N A; 5BPJ A; 1OOJ A; 3TUY C; 2M29 A; 2BEC A; 1CDP A; 1EH2 A; 4OVN F; 3LLE A; 1TNW A; 1KWO B; 2MJW B; 3I5I C; 3O6B A; 4JWQ A; 1TIZ A; 3PAT A; 1WDC B; 3SIA A; 1B1G A; 3BUN B; 3WHT B; 4I5N B; 4JPZ B; 2EHB A; 1Y1U A; 1YUU A; 1NCY A; 4MEW A; 5PAL A; 1QX2 A; 4PE0 A; 4M2Q A; 1CFD A; 1ZFS A; 1DF0 B; 1V1F A; 3LK1 A; 5HKZ A; 1BOC A; 3TZ1 A; 1K96 A; 2QPT A; 1BG1 A; 1NPQ A; 5KU1 A; 1LKJ A; 1XFY O; 1KK7 Y; 1XYD A; 5CPV A; 3JVT C; 1N2D A; 1S26 D; 1TNX A; 1X02 A; 1SL8 A; 3LCP C; 1JF0 A; 1SW8 A; 2I18 A; 3LK0 A; 1UHN A; 2RGI A; 1DJI A; 1NCZ A; 1LA3 A; 2ZN8 A; 2F3Z A; 4MZJ A; 1PRW A; 1Q80 A; 1CTR A; 2LVK A; 1NX3 A; 2BKI B; 3WHU B; 3FIA A; 3SG4 A; 1XVJ A; 2BBN A; 1EG4 A; 1MUX A; 2FJU B; 1WRZ A; 1LVC D; 5CSN A; 2FCE A; 3I5F B; 3EKH A; 3DD4 A; 2M97 A; 2EGD A; 1SCM C; 2BL0 B; 2NCO A; 3OHM B; 2LMU A; 2HPS A; 1A75 A; 2LHI A; 4HSZ A; 4M2O A; 5F6T A; 1MWN A; 2MBX A; 1ALW A; 2M7N A; 2E6W A; 2BCA A; 3SG5 A; 1S6J A; 1G4Y R; 1HT9 A; 4YGD B; 1BJF A; 5I2L A; 1S6C A; 3DVM A; 2KGR A; 1SCV A; 4CFR A; 2NXQ A; 3TS5 C; 1L2O B; 4QJ4 B; 2ZKM X; 4PE1 A; 2K8M B; 1B4C A; 1OE9 B; 2I2R E; 4NDD A; 4PAL A; 4NDC A; 4C0K A; 1KWO C; 2LNK A; 1F4Q A; 4P5O E; 4OCI A; 2M0R A; 3BXK A; 1J55 A; 2A4J A; 1XFU O; 1KFU S; 3F45 A; 2Y5I A; 3EK8 A; 3KEV A; 1WDC C; 4M2P A; 2LLS A; 1DVI A; 3CR2 A; 4F0Z B; 1PVB A; 1WLM A; 4GGN A; 1KFX L; 1M46 A; 2G9B A; 2MLE C; 1C07 A; 1BOD A; 1F54 A; 2KBM A; 2GV5 A; 2KNE A; 3EK7 A; 1NYA A; 2KQY A; 4OV2 A; 2JXL A; 3BUM B; 1AVS A; 1B8C A; 3EK4 A; 1UHH A; 4DCK A; 1MHO A; 2HQ8 A; 3PN7 C; 1SYM A; 2MRD A; 1SMG A; 2JNF A; 5I8N A; 1CLB A; 3CTN A; 1YX8 A; 5I2Q A; 1K90 D; 5GQQ C; 3NSK A; 2M9G A; 1H8B A; 4XJK B; 1FI6 A; 2AMI A; 4OR9 B; 1UP5 A; 5HKW A; 1IG5 A; 2BCB A; 1RWY A; 1S1E A; 3DF0 A; 4GUK A; 3RM1 A; 4AQI A; 4QJ5 B; 1KQM B; 1YTZ C; 3GK1 A; 4GFT A; 3SJS A; 4A4B A; 3I5F C; 1DF0 A; 2MHH A; 1REC A; 1F55 A; 2HET A; 2ZRT A; 3OB1 B; 1R2U A; 2MAZ A; 3CS1 A; 1UHI A; 1CMG A; 1TCO B; 4MRX A; 3CR5 X; 2ZNE A; 1DTL A; 1QV1 A; 3CWG A; 3FWC A; 2Q4U A; 3ZNI A; 1G33 A; 1J7P A; 3AKA A; 1QTX A; 1SY9 A; 1L2O C; 5DKN A; 4YGE B; 2KBI A; 2CCM A; 3VRP A; 4YGA A; 2Y1M A; 1QJT A; 1F70 A; 1PK0 D; 4MRY A; 3RLZ A; 1HQV A; 1B8L A; 1CDM A; 3QRX A; 1K9P A; 1QS7 A; 2PSR A; 1SL7 A; 1KK8 B; 1TNP A; 2KFG A; 3VRO A; 2JQ6 A; 1W7J B; 2K7D A; 4ORA B; 2WCB A; 3AAJ A; 1M39 A; 1QVI Z; 1C7W A; 3CZT X; 1B7T Y; 1LXF C; 2DOQ A; 4USL A; 3EVV A; 1PUL A; 2PVB A; 3NSL A; 1QIW A; 2LHL A; 3NSO A; 4YI8 A; 1K2H A; 3EVU A; 5J3X A; 1NX0 A; 2KQ6 A; 2KYF A; 2NLN A; 2O5G A; 4I5J A; 5JOL A; 4HRE E; 3VGO A; 1CM1 A; 4CID A; 1KQV A; 1J7R A; 3FS7 A; 4NDB A; 4YGB B; 2H61 C; 2WND A; 3I5H B; 1S5G Y; 3JTD C; 1CB1 A; 1SPY A; 4MN0 A; 4GGF C; 1UWO A; 1OQP A; 1AK8 A; 1DJY A; 1J1D A; 1WLZ A; 1NX1 A; 2JC2 A; 2ZRS A; 4NQG A; 1JFJ A; 3WNX B; 3NSI A; 1DJH A; 2NZ0 A; 2LUC A; 1BMO A; 1BR1 B; 1KQM C; 1KSM A; 3VRR A; 3AAK A; 4N5X A; 1JFK A; 3SG2 A; 1FI5 A; 4WQ3 A; 1G8I A; 4YRU A; 3DVJ A; 3WXA A; 1ZUZ A; 1QXP A; 1KCY A; 5AXI A; 3KHE A; 1XFZ O; 5D7F A; 1DGV A; 2WOS A; 1YUT A; 2KYC A; 3I5G C; 4OKH A; 1YUS A; 5AAN A; 2LVV A; 4U8D A; 2K0J A; 2F3Y A; 4PE7 A; 1A4P A; 4PHJ A; 4L9M A; 3BYA A; 2K2A A; 2KSP A; 4XYN A; 5HYD A; 4GGF A; 4R1E A; 5DKQ A; 1BLQ A; 1CNP A; 1DMO A; 4XJK A; 4YGC B; 2I94 A; 1QX7 A; 1IKU A; 1M45 A; 1MXL C; 3TDI A; 2OS8 B; 2I7A A; 3OB2 B; 1NUB A; 2IS9 A; 4TNC A; 2NCP A; 2M1U A; 1OZS A; 3D0Y B; 5CSF A; 3BUX B; 4IL1 A; 1UHK A; 3BUO B; 2M7L A; 1UUS A; 4ETO A; 2CNP A; 2CT9 A; 3KF9 A; 2BBM A; 1U5I B; 1DJZ A; 1KK8 C; 3PFV A; 1GQM A; 1QAT A; 1AP4 A; 1B7T Z; 1GJY A; 3ZWH A; 4D1E A; 5IBW A; 2JT0 A; 4PCW A; 1CLM A; 2LM5 A; 3OX5 A; 2L5X B; 1B8R A; 1YR5 A; 2KAY A; 2HQW A; 3SG7 A; 5FYX A; 2PAS A; 2ZN9 A; 1SBJ A; 5HLV A; 1QLK A; 2JUL A; 1AJ4 A; 3TUY B; 1QVI Y; 4YBH B; 1XO5 A; 1S5G Z; 1KFU L; 2L50 A; 3C1V A; 1DJG A; 1SKT A; 3CLN A; 1DJW A; 1JWD A; 2LCP A; 3EKJ A; 2L51 A; 3I5H C; 1B9A A; 2LV7 A; 2CBL A; 2COL B; 1QAS A; 2KI6 D; 4GAO A; 1Y1X A; 2LP2 A; 4DS7 A; 2HF5 A; 1F8H A; 4PDZ A; 3IQQ A; 2K61 A; 1CFC A; 1JSA A; 1E8A A; 1K94 A; 1QX5 B; 4MVF A; 1N0Y A; 1A75 B; 1SK6 D; 2BL0 C; 1TOP A; 2V53 A; 4AQJ A; 2MLF C; 2BE4 A; 1CLL A; 2JTZ A; 1EXR A; 2JPT A; 2K7O A; 3A4U B; 4PHK A; 1CFP A; 4DIR A; 1RK9 A; 1XK4 C; 2H2K A; 1XFV O; 5CSJ A; 1JBA A; 1TRF A; 3PM8 A; 3O78 A; 2BE6 A; 4I5L B; 4DUQ A; 1AJ5 A; 2K7C A; 3PAL A; 1XFX O; 1BU3 A; 4C0L A; 3DVK A; 1S6I A; 2LLU A; 2CTN A; 1ZOT B; 2OS8 C; 4ZCU A; 1CM4 A; 1ZMZ A; 1PAL A; 1SRA A; 2KI6 C; 2LP3 A; 2PRU A; 1MF8 B; 2Q91 A; 4QJ3 B; 4BY5 A; 1IJ6 A; 4Q04 A; 1B47 A; 1IQ3 A; 2PAL A; 1PSR A; 1BF5 A; 3SG6 A; 2JZI A; 5AFP A; 1J7O A; 2VRG A; 1F4O A; 2KFF A; 2SAS A; 3OX6 A; 2K7B A; 1EL4 A; 4PE4 A; 5HKY A; 2SCP A; 1MQ1 A; 1SNL A; 3K21 A; 3GK2 A; 5TNC A; 1XK4 A; 2D8N A; 2LC5 A; 2LE9 B; 2R2I A; 3BUW B; 3VRN A; 1WRL A; 5DKR A; 2ZFD A; 2M8U A; 3TS5 B; 2AAO A; 3M0W A; 3O2P A; 2JT3 A; 1AHR A; 3TDU A; 4ICB A; 2G2B A; 2LMT A; 1XFW O; 2OPO A; 4DRW A; 2M3W A; 1TTX A; 1ALV A; 1DJX A; 1V1G A; 3D0Y A; 1MXE A; 2KGB C; 1D1O A; 1KSO A; 3H4S E; 3HCM A; 1RJV A; 4ORB B; 5ER4 X; 1A03 A; 4AOM A; 1BR4 B; 2JWW A; 3LL8 B; 1NCX A; 1YRT B; 1SR6 B; 4WQ2 A; 5HLO A; 2LVI A; 5AER A; 1EJ3 A; 1PSB A; 1U5I A; 3ICB A; 1CMF A; 3DF0 B; 4UPG A; 1VRK A; 1H4B A; 2ISD A; 3BOW B; 2FOT A; 2LLT A; 1XA5 A; 1ZAC A; 2LUX A; 4HRG A; 3SG3 A; 1IJ5 A; 2KOT A; 1S3P A; 4HRH A; 3PSR A; 2QAC A; 3CR4 X; 3GK4 X; 1GGW A; 2CXJ A; 4BY4 A; 1Y1A A; 1UUR A; 3PN7 B; 1ODB A; 2ZND A; 2KI4 B; 1RTP 1; 2L4I A; 2H61 A; 5I2O A; 3DVE A; 4YI9 A; 1J1E A; 1RRO A; 5K89 A; 1Y6W A; 1QV0 A; 4MBE A; 1NSH A; 2LAN A; 3NXA A; 1NP8 A; 1SL9 A; 4C0J A; 4GBA A; 1K95 A; 1L7Z A; 1S36 A; 5JJG A; 1YVL A; 1AUI B; 1W7I B; 4WRI A; 1YX7 A; 2EC6 B; 2GGZ A; 2WC8 A; 3IF7 A; 4MZK A; 1OMR A; 2KFH A; 1YRU B; 2M1K B; 1N65 A; 3A8R A; 2Y4Q A; 4E68 A; 4ZCV A; 2LMV A; 1TCF A; 1IWQ A; 4JQ0 D; 2BCX A; 2JT8 A; 2GGM A; 1IH0 A; 3D10 A; 4PHM A; 2JU0 A; 1CDL A; 2MA2 A; 1LIN A; 1QIV A; 1FF1 A; 1DT7 B; 5KTY A; 5G08 A; 1IQ5 A; 2WOR A; 2OTG B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WY9 A; 5ER5 A; 5B8I B; 1KFX S; 3MSE B; 2L4H A; 1JUO A; 2AUC A; 5KSZ A; 4ORC B; 1OMV A; 4N1G A; 3I5I B; 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