The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
124
|
structure length |
124
|
Chain Sequence |
MTMEQFLTSLDMIRSGCAPKFKLKTEDLDRLRVGDFNFPPSQDLMCYTKCVSLMAGTVNKKGEFNAPKALAQLPHLVPPEMMEMSRKSVEACRDTHKQFKESCERVYQTAKCFSENAAGQFMWP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Activation of pheromone-sensitive neurons is mediated by conformational activation of pheromone-binding protein.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| molecule keywords |
General odorant-binding protein lush
|
| total genus |
44
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| structure length |
124
|
| sequence length |
124
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Recoverin; domain 1 | Pheromone/general odorant binding protein domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OOF A; 3D74 A; 1T14 A; 4FQT A; 2QDI A; 3B6X A; 3DY9 A; 1TUJ A; 4INX A; 2P71 A; 3N7H A; 1OOH A; 3PJI A; 3S0F A; 3V2L A; 2WCM A; 2QEV A; 3S0D A; 3FE6 A; 3BFA A; 3CZ2 A; 1GM0 A; 3CYZ A; 3FE8 A; 1XFR A; 3D78 A; 3VB1 A; 3BFH A; 1OW4 A; 3BFB A; 3R1O A; 1QWV A; 3NGV A; 3D77 A; 2WCH A; 3DXL A; 5EL2 A; 2JPO A; 3D75 A; 3L4A A; 1P28 A; 2WCJ A; 4JD9 A; 2QEO A; 3D76 A; 3R72 A; 3CZ1 A; 3RZS A; 1DQE A; 2KPH A; 3BJH A; 3L47 A; 3B86 A; 3S0B A; 1TWO A; 2H8V A; 1C3Y A; 2WC6 A; 3CZ0 A; 2P70 A; 3L4L A; 3CDN A; 3NHI A; 2QEB A; 3DYE A; 3S0G A; 3S0A A; 3NHT A; 1LS8 A; 2PQL A; 3S0E A; 3FE9 A; 1OOG A; 2L2C A; 2WC5 A; 1C3Z A; 3R1P A; 4F7F A; 3QME A; 5DIC A; 3OGN A; 3B88 A; 2WCK A; 1OOI X; 2GTE A; 4PT1 A; 1ORG A; 3B87 A; 3R1V A; 4INW A; 2WCL A; 3D73 A; 3DZT A; 3B7A A; 3Q8I A; 2FJY A; 2QEH A; 2ERB A; 3CAB A; 3K1E A; 4OZD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KSO A; 5JOL A; 3SG5 A; 1K90 D; 2FOT A; 1OMV A; 1SL8 A; 1OOF A; 1BF5 A; 4XJK B; 5KSZ A; 1JSA A; 1C7W A; 2KLD A; 1IH0 A; 3HCM A; 1NYA A; 2LP2 A; 1CFC A; 1A4P A; 1JF2 A; 2BBM A; 1PK0 D; 1PUL A; 2F2P A; 3D10 A; 3DY9 A; 1JBA A; 3HX4 A; 1QVI Z; 1TUJ A; 3DVE A; 4INX A; 3D0Y A; 4ETO A; 3NSK A; 4ORC B; 1NX0 A; 2FCD A; 1EL4 A; 1F54 A; 2KBM A; 4DUQ A; 3EK8 A; 5D69 A; 4A4C A; 2M9G A; 2NXQ A; 1KWO C; 1TCO B; 2LM5 A; 2WCM A; 3PAL A; 2LLS A; 1AJ5 A; 1MXE A; 1UHI A; 1RJV A; 1J7Q A; 4GGF C; 3BFA A; 3I5H C; 1QX5 B; 1AVS A; 1B47 A; 1UWO A; 2HPS A; 2KGB C; 4P2Y B; 1NWD A; 1DT7 B; 1RFJ A; 1CDP A; 2KAX A; 2LV7 A; 3VB1 A; 1L2O B; 3BFB A; 4ICB A; 1BR4 B; 2H61 A; 4C0J A; 1K9K A; 1YTZ C; 1WDC C; 2JT3 A; 3D77 A; 3NSO A; 1TUZ A; 2GGZ A; 2MA2 A; 3O2P A; 1KSM A; 4PAL A; 1CLM A; 2LVI A; 4NDC A; 1JWD A; 1FW4 A; 1DJH A; 3DVK A; 1SRA A; 1UHJ A; 2BE6 A; 3DVJ A; 1SCM B; 1JFJ A; 2OS8 C; 1A29 A; 4WQ3 A; 3CZT X; 5AER A; 1ZAC A; 3BUM B; 4MZK A; 3F45 A; 1HQV A; 4MRX A; 1YX7 A; 1FI5 A; 3RZS A; 2KI4 B; 1S6C A; 1YUR A; 3FWC A; 4YI8 A; 3H4S E; 1KK8 B; 3VRR A; 5KTY A; 2LVV A; 1QAT A; 5AEQ A; 3TUY C; 1BJF A; 4OR9 B; 1B8R A; 1CDM A; 1QXP A; 1XFV O; 2K60 A; 2JUL A; 4M2P A; 1IJ6 A; 1UUS A; 3CDN A; 3FIA A; 2ZNE A; 4MZJ A; 3SIB A; 3DYE A; 1TNP A; 2L5X B; 2M97 A; 3EK4 A; 1S5G Z; 4YGA A; 1SSE B; 2KQY A; 5B8I B; 1W9Z A; 1NPQ A; 2WC8 A; 4JKT A; 1QV0 A; 3BUO B; 4ORB B; 3R1P A; 2KSP A; 1C3Z A; 1JF0 A; 3TDI A; 1SY9 A; 3LCP C; 4CPV A; 1UHN A; 2WCF A; 2LMV A; 3QME A; 2SAS A; 2LUX A; 4N5X A; 5FI6 A; 1AJ4 A; 2FCE A; 1K96 A; 2QPT A; 4CID A; 2Q91 A; 4E68 A; 4IJ7 A; 3BUX B; 2CTN A; 2BL0 C; 3A4U B; 1BOD A; 1OE9 B; 1UHH A; 1DJY A; 1FF1 A; 3EKJ A; 1XFY O; 1QAS A; 1G8I A; 1KQV A; 4JPZ B; 2L2E A; 2BBN A; 1J7P A; 4HRG A; 1CTR A; 2WCL A; 1S26 D; 4L9M A; 2PMY A; 1UUR A; 1SNL A; 1PSR A; 4QJ5 B; 2LMT A; 1KQM C; 2O60 A; 2FJY A; 3OBV A; 2ERB A; 2PSR A; 1AUI B; 1QLS A; 3PLF B; 1DJZ A; 3LK1 A; 1A75 A; 1KK7 Z; 2HET A; 1NX2 A; 2NCO A; 2KYC A; 3MSE B; 2I18 A; 1BMO A; 4JQ0 D; 1S6I A; 3D74 A; 3I5G B; 1QIV A; 1SK6 D; 1OMR A; 1QX7 A; 1RTP 1; 1YUT A; 3TS5 C; 3PN7 C; 1H4B A; 1T14 A; 5HKW A; 4FQT A; 3IQO A; 2QDI A; 2LE9 B; 1FBV A; 3QRX A; 3RLZ A; 3JTD B; 1KFX L; 1DMO A; 1WY9 A; 5FYX A; 5K89 A; 1WLM A; 1LXF C; 3N7H A; 3VRP A; 1TNW A; 1CM1 A; 2OTG B; 1YR5 A; 4OKH A; 4PHM A; 3V2L A; 3WXA A; 1SCV A; 1Y0V H; 1SL9 A; 4I5J A; 3NSL A; 3WNX B; 1JC2 A; 4GNK B; 1L7Z A; 4F0Z B; 2LVK A; 3EVR A; 4MZL A; 1U5I A; 3CR4 X; 1LIN A; 3KHE A; 4BY5 A; 2JXC A; 2KDH A; 1TTX A; 1NCZ A; 4KYN A; 1CFD A; 2Q4U A; 4NDD A; 1XFR A; 3D78 A; 3BFH A; 2B1U A; 2TN4 A; 2LUC A; 1YRU B; 3R1O A; 1VRK A; 1MF8 B; 1MR8 A; 1IJ5 A; 1NIW A; 1LKJ A; 2L5Y A; 5TNC A; 3I5I B; 2PAL A; 3OP0 A; 5AXI A; 2BCB A; 1IIO A; 5I2L A; 1DGU A; 1TNQ A; 2KQ6 A; 4GAO A; 1N0Y A; 1V1G A; 1DEL A; 2I94 A; 3GK2 A; 3CLN A; 2O5G A; 2QEO A; 2EGD A; 3D76 A; 4HSZ A; 2BCX A; 1MXL C; 1NCY A; 1QLK A; 2KI6 D; 3AAJ A; 1SR6 C; 5AAN A; 1BR1 B; 3AAK A; 3IF7 A; 3OHM B; 2H61 C; 5FI7 A; 1S3P A; 3L47 A; 4QJ4 B; 1WRK A; 3KF9 A; 2H2K A; 2LAP A; 1QJT A; 2H8V A; 5PAL A; 1B8C A; 1WLZ A; 3EKH A; 3I5F B; 2WOS A; 2E6W A; 3DD4 A; 2LMU A; 1PVB A; 1YVL A; 2QEB A; 4GPL B; 1K95 A; 2EC6 B; 3S0E A; 4PE1 A; 1Y1X A; 2KI6 C; 1A75 B; 2MLF C; 2K7C A; 2MRD A; 2BKI B; 4PE4 A; 5BPJ A; 1KFU L; 5DIC A; 2HQW A; 2GV5 A; 2P6B B; 1CM4 A; 2LVJ A; 2WND A; 3IVT A; 5CSF A; 4AQI A; 3B88 A; 2JXL A; 1MWN A; 3CTN A; 1F4O A; 4CFQ A; 3SIA A; 5ER5 A; 2MHH A; 1S1E A; 1F71 A; 2JPT A; 2ZND A; 5KU1 A; 3B87 A; 4DRW A; 3R1V A; 2ISD A; 1N2D A; 3JVT B; 1J1D A; 1XFW O; 2M0R A; 3ICB A; 1GJY A; 2F8P A; 2M1U A; 4MBE A; 5DKR A; 1OMD A; 2NZ0 A; 1XA5 A; 3OB1 B; 2K7B A; 2AMI A; 1M46 A; 1V1F A; 3O4Y A; 3OX5 A; 4MSP A; 5HLV A; 1DVI A; 1DJW A; 2EHB A; 3B7A A; 1NCX A; 2QEH A; 3VRQ A; 1S36 A; 2KAY A; 1B9A A; 4HRH A; 1U5I B; 3GK1 A; 3SJS A; 4TNC A; 3AKA A; 4PDZ A; 2K2A A; 1EG3 A; 2COL B; 4PE0 A; 3KPX A; 2ZFD A; 4MN0 A; 1ZMZ A; 5I2Q A; 1L2O C; 4I5K A; 1OSA A; 2LHL A; 1QIW A; 2F3Z A; 2Y4Q A; 3RM1 A; 1XK4 C; 2KHN A; 2BKH B; 1KFX S; 2M3W A; 2L4H A; 5G08 A; 2ZN9 A; 2WOR A; 2HQ8 A; 5I8N A; 1J1E A; 2L0P A; 3B6X A; 1G4Y R; 4PCW A; 1KCY A; 1YVH A; 2KFG A; 1B7T Y; 1BG1 A; 1M39 A; 1SCM C; 3PJI A; 1FI6 A; 1SL7 A; 3BOW B; 1MUX A; 2DOQ A; 2LC5 A; 1YRT B; 5FI2 A; 4M2Q A; 1CLB A; 1K93 D; 2ZRS A; 2E30 A; 5IBW A; 1K94 A; 3OX6 A; 4DS7 A; 1CKK A; 1K2H A; 2KI4 C; 3S0D A; 2WCB A; 2PYQ A; 1KK8 C; 4D1E A; 4NDB A; 1B7T Z; 1OZO A; 1ZFS A; 1UHK A; 5HYD A; 3CZ2 A; 1GM0 A; 1IGV A; 3FE8 A; 5F6T A; 1RK9 A; 1OW4 A; 1YUS A; 1RWY A; 5GQQ C; 1QWV A; 1HT9 A; 2WCH A; 2Y5I A; 1C07 A; 1PSB A; 1CFP A; 1EH2 A; 1EXR A; 2LAN A; 5EL2 A; 4FTG A; 4AOM A; 2JOJ A; 3L4A A; 1P28 A; 4I5L B; 2JT8 A; 2WCJ A; 3BUW B; 4PE7 A; 2F33 A; 5I94 A; 1DF0 B; 3GK4 X; 1Y1U A; 1TIZ A; 1LA3 A; 1KWO B; 1N65 A; 3R72 A; 4YRU A; 3TZ1 A; 1AP4 A; 1TCF A; 3WHU B; 1CMF A; 2F2O A; 2KFF A; 3DVM A; 1DQE A; 2KPH A; 4R1E A; 3BJH A; 3CR5 X; 1H8B A; 2GGM A; 1IG5 A; 2L51 A; 1CB1 A; 4I5N B; 4FQO A; 1F8H A; 2CXJ A; 2LP3 A; 2K61 A; 3I5H B; 3SS3 A; 1XVJ A; 2KFH A; 1REC A; 2LCP A; 1QS7 A; 3CZ0 A; 3L4L A; 1LVC D; 3SG7 A; 3NHI A; 1YUU A; 4A4B A; 3O4X A; 1K9P A; 3PAT A; 4CFR A; 1WDC B; 1DEK A; 3S0G A; 3NHT A; 4OVN F; 1LS8 A; 1KFU S; 2PQL A; 4C0L A; 2LNK A; 4YGB B; 4N1F A; 5ER4 X; 1OOG A; 2L2C A; 1A03 A; 2MAZ A; 2JWW A; 3C1V A; 3EVU A; 3BOW A; 3LL8 B; 5HKZ A; 5HLO A; 2BAP A; 4AQJ A; 2BNX A; 2OS8 B; 4F7F A; 1BLQ A; 1CDL A; 1QVI Y; 3OGN A; 3VRO A; 2WCK A; 1DGV A; 1G33 A; 1NP8 A; 3BQ3 A; 3I5G C; 2BE4 A; 1OOI X; 2KAV A; 3AKB A; 4OCI A; 3E3R A; 2WCE A; 4PT1 A; 1ALW A; 2A4J A; 1ORG A; 2JZI A; 1GGW A; 1M31 A; 5CSI A; 3JTD C; 3TUY B; 1CMG A; 1JUO A; 1IQ3 A; 1IWQ A; 3NSI A; 1ZUZ A; 2HF5 A; 3SG4 A; 1GQM A; 2NLN A; 2OTG C; 3LK0 A; 1F70 A; 3PM2 A; 1SMG A; 2L4I A; 2ZKM X; 1OOJ A; 3CAB A; 1F4Q A; 4GGN A; 5JJG A; 1B4C A; 3DF0 A; 3M0W A; 2K0J A; 4GUK A; 1XFX O; 3K1E A; 3O78 A; 4ZCV A; 4M2O A; 2JTZ A; 1TNX A; 1PVA A; 2L98 A; 2PRU A; 1NX3 A; 3FS7 A; 3FWB A; 2MBX A; 1M45 A; 4Q04 A; 3BXK A; 1DF0 A; 1J7R A; 1D1O A; 1NX1 A; 4YGE B; 1XFZ O; 2VRG A; 2KOT A; 1MHO A; 2JRF A; 1IRJ A; 3I5I C; 1DTL A; 4WRI A; 1MQ1 A; 2BL0 B; 2NCP A; 3OB2 B; 2CBL A; 4GGF A; 3SS5 A; 4N1G A; 2MJW B; 4DIR A; 2F3Y A; 5D7F A; 3TDU A; 3WHT B; 1CFF A; 1XO5 A; 2P71 A; 1IKU A; 4ZCU A; 1OOH A; 3EG5 B; 1QV1 A; 4OV2 A; 3S0F A; 1WRZ A; 1DJG A; 1KQM B; 3PFV A; 1AK8 A; 1ALV A; 4WQ2 A; 1W7I B; 2QAC A; 3VRN A; 2Y1N A; 3ZWH A; 1EG4 A; 2I2R E; 5HL1 A; 2KLE A; 1ODB A; 3K21 A; 5I2O A; 3TDZ A; 3PSR A; 2QEV A; 3CWG A; 1CNP A; 2PVB A; 3FE6 A; 4HRE E; 1SKT A; 4MEW A; 1S5G Y; 3SG3 A; 1OQP A; 1CLL A; 2YGU A; 3CYZ A; 3I5F C; 5HKY A; 3BUN B; 1TRF A; 1BT6 A; 2M7L A; 3CGA A; 1A2X A; 2MLE C; 4XJK A; 1DC1 A; 3CR2 A; 3TS5 B; 2V53 A; 1R2U A; 2G9B A; 3PN7 B; 2R2I A; 1Q80 A; 3NGV A; 4YBH B; 3SG6 A; 1F55 A; 1C7V A; 2EC6 C; 3DXL A; 2BCA A; 4YGD B; 4MRY A; 2FJU B; 4U8D A; 1M63 B; 1X02 A; 2JPO A; 2M7N A; 3D75 A; 1Y1A A; 2M29 A; 4JD9 A; 1Z2C B; 2LHI A; 1PAL A; 1NUB A; 1SW8 A; 4PHN A; 4QJ3 B; 2SCP A; 1SBJ A; 4PHJ A; 2G2B A; 3CZ1 A; 3EK7 A; 1IQ5 A; 2K2F A; 1NSH A; 2CNP A; 2LLT A; 4IL1 A; 2JNF A; 5DKQ A; 1DJI A; 1K9U A; 2IS9 A; 4JWQ A; 2JTT A; 1CDN A; 3B86 A; 1XFU O; 3KEV A; 1QX2 A; 3LLE A; 5CPV A; 3S0B A; 3GOF A; 1TWO A; 3JVT C; 2KBI A; 1K8U A; 2ZRT A; 4BY4 A; 1AHR A; 1ZOT B; 3SG2 A; 2KNE A; 2WC6 A; 3D0Y B; 1C3Y A; 2I7A A; 2P70 A; 1KK7 Y; 2CT9 A; 2M49 B; 4CLN A; 4YGC B; 1B8L A; 2LLU A; 1J55 A; 1XK4 A; 1FPW A; 3S0A A; 5J3X A; 3DF0 B; 3UO9 A; 2JU0 A; 2OPO A; 1LA0 A; 1DJX A; 1E8A A; 1R6P A; 1W7J B; 2M1K B; 3FE9 A; 4MLW A; 2WC5 A; 3VGO A; 3A8R A; 1QTX A; 2PAS A; 3IQQ A; 4P5O E; 4DCK A; 1Z4H A; 2Y1M A; 5D3O A; 1BOC A; 1JFK A; 2JQ6 A; 4GFT A; 1SR6 B; 1Y6W A; 1WRL A; 2K7O A; 3BYA A; 2GTE A; 3NXA A; 1J7O A; 1RRO A; 3UNW A; 4UPG A; 1SYM A; 2BEC A; 1OZS A; 3PM8 A; 5CSJ A; 3EVV A; 4INW A; 3SS4 A; 1UP5 A; 2CCM A; 1BU3 A; 5DKN A; 1EJ3 A; 2JNX A; 1TN4 A; 3KO0 A; 4YI9 A; 2K8M B; 1GGZ A; 2JT0 A; 2M8U A; 2JC2 A; 3D73 A; 3DZT A; 1B1G A; 1S6J A; 2ZN8 A; 3ZNI A; 2AUC A; 5AFP A; 1PRW A; 4PHK A; 1TOP A; 2AAO A; 1YX8 A; 3CS1 A; 3Q8I A; 5CSN A; 1XYD A; 4C0K A; 2D8N A; 1SPY A; 2K7D A; 2KGR A; 4MVF A; 4USL A; 4GBA A; 4OZD A; 4XYN A; 4ORA B; 2L50 A; 4NQG A; 2KYF A; 2RGI A; 3O6B A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1OOF A; 3D74 A; 1T14 A; 4FQT A; 2QDI A; 3B6X A; 3DY9 A; 1TUJ A; 4INX A; 2P71 A; 3N7H A; 1OOH A; 3PJI A; 3S0F A; 3V2L A; 2WCM A; 2QEV A; 3S0D A; 3FE6 A; 3BFA A; 3CZ2 A; 1GM0 A; 3CYZ A; 3FE8 A; 1XFR A; 3D78 A; 3VB1 A; 3BFH A; 1OW4 A; 3BFB A; 3R1O A; 1QWV A; 3NGV A; 3D77 A; 2WCH A; 3DXL A; 5EL2 A; 2JPO A; 3D75 A; 3L4A A; 1P28 A; 2WCJ A; 4JD9 A; 2QEO A; 3D76 A; 3R72 A; 3CZ1 A; 3RZS A; 1DQE A; 2KPH A; 3BJH A; 3L47 A; 3B86 A; 3S0B A; 1TWO A; 2H8V A; 1C3Y A; 2WC6 A; 3CZ0 A; 2P70 A; 3L4L A; 3CDN A; 3NHI A; 2QEB A; 3DYE A; 3S0G A; 3S0A A; 3NHT A; 1LS8 A; 2PQL A; 3S0E A; 3FE9 A; 1OOG A; 2L2C A; 2WC5 A; 1C3Z A; 3R1P A; 4F7F A; 3QME A; 5DIC A; 3OGN A; 3B88 A; 2WCK A; 1OOI X; 2GTE A; 4PT1 A; 1ORG A; 3B87 A; 3R1V A; 4INW A; 2WCL A; 3D73 A; 3DZT A; 3B7A A; 3Q8I A; 2FJY A; 2QEH A; 2ERB A; 3CAB A; 3K1E A; 4OZD A;
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