1BO5O

Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate.
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords PROTEIN (GLYCEROL KINASE)
publication title Crystal structure of a complex of Escherichia coli glycerol kinase and an allosteric effector fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 174
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bo5O01
3VEWA 1RGIA 4J8FA 4DB3A 3OHRA 5AQFA 4ISFA 4ISGA 2P9IA 5AQMA 1V4TA 3S41A 1MA9B 1X3NA 5AQGA 2W41A 5KPTA 4EHUA 3FLCO 2Q2RA 1TUYA 4CZGA 1ZBSA 3VERA 1BU6O 2J4RA 3GDQA 3FZHA 4I6MB 4LC9B 5AQRA 2E88A 4BRPA 3CJAA 3F9MA 3H6EA 3U9DA 3IFRA 2UYTA 5AQOA 4M7XA 4BRQA 1XC3A 4CZIA 3R9PA 1BWFO 1HX1A 3EKUA 1QHAA 4JD2B 3VEOA 3WEEB 1R59O 1SZ2A 4BG9A 4BRLA 3LL3A 3ZEUA 5AZJA 4A62A 4KBOA 1TYQB 3CQXA 3FZMA 3D2FB 3VGMA 3VEYA 3MN9A 2ZGZA 2QW9A 4BQLA 3H3NO 5EOYA 2P9UB 3HI0A 3DXKA 2P9NA 1YVNA 3ENOA 2OANA 4JNEA 3UB5A 4BC2A 4QS9A 2A40A 4EFHA 3BEXA 3SLCA 1GLDG 3SMPA 4BRFA 2FSJA 3WUHA 4FWMA 1LOTB 3RSEA 1RFQA 5E84A 4DQ8A 3CJBA 2E1ZA 4K41A 3I8BA 4JHDA 3ULEB 1QQOA 2QWOA 1T6CA 1CZAN 2E1YA 5AQWA 4AM6A 4BR4A 1JCFA 1ZXOA 4IO8A 3ATVA 4M63C 3QFUA 3A8YA 4PKIA 5FPDA 3C7NA 1XQSC 5AQPA 4PKHA 5KPZA 3L0QA 1GLAG 1GLBG 2V52B 1KAZA 4K42A 4BC5A 4JAXA 2QWLA 2V7YA 1J6ZA 3O6WA 4RWTA 3VEXA 1EQYA 3DXMB 3BF1A 3ZETA 4H5NA 4CD3A 3JS6A 3LDOA 3MMVA 5I9EB 1U6ZA 3AAPA 2D0OA 3FZKA 4BC4A 5FPEA 1KAXA 1Y64A 4FWOA 3KVGA 2FSKA 4HTLA 4IJAA 5AQIA 4E1JA 5KQ8A 4IJNA 4CZMA 5EXWA 4Y0WA 4XH4A 4MO4A 5ADXA 3EL2A 1NMDA 4A61A 3W0LA 2A5XA 3ID8A 2CH5A 3ZX2A 2BUPA 3KHYA 2QXLA 2NLXA 1HUXA 5EX5A 3D2EA 4BRKA 2P9PA 5AQVA 3EO3A 5AZJB 5LJVA 5AQHA 5TKYA 3BUZB 2ASOA 3H3OB 3UE5A 2H3GX 1HLUA 5AQQA 2P9KA 5EVZA 3CJ9A 5JLHA 3DXKB 3HBTA 5AQJA 3VPZA 1Q18A 5BPLA 2E2NA 3CETA 3DAWA 3J8AA 3IMXA 4MLEA 1NGIA 4BGAA 2YHXA 4BQZA 4CZKA 4B1VA 3H1QA 4BRGA 3FZFA 2ZWHA 3RSEB 2E2OA 3WT0A 1HKBA 3VF4A 2D0PA 4GNIA 5AQXA 5BR9A 3UKUB 3C0BA 4CZLA 4Z94A 1GLCG 3BF3A 4BRMA 3M3ZA 4ISEA 3GBTA 5AQUA 2ASPA 2Q97A 3C7NB 1XUPO 2Q31A 3CI5A 3HM8A 4FWPA 1QQNA 1IG8A 3A0IX 4H5VA 3VF2A 3TU5A 2PAVA 4XH5A 5E26A 5BPNA 5ADXH 2EWSA 1BUPA 5F0XA 3ZETB 1KXPA 3EZWA 4WQ4A 2P9SA 1Z05A 4YDUA 1KAYA 3CJCA 4RTFD 3VGKA 3WXIA 1JCEA 4FWSA 4BROA 5BRHA 4BVOA 1DKGD 2GEMA 3R6MA 2CH6A 4BR2A 1E4FT 1HJOA 2YJFA 3H45C 4K43A 4K25A 4WQ4C 3QBXA 2BTFA 4FPBA 4QS8A 5AQZA 2DPNA 3CJ7A 2HF4A 3HZ6A 4L3QA 2QM1A 1BG3A 1X9JA 2W40A 5AQTA 4PL8A 4YDUC 4CD1A 2ZF5O 1K8KA 1D4XA 2V51B 3GL1A 3VENA 2D1KA 1WOQA 3D2EB 1QZ5A 2FSNA 2P9PB 2NZTA 4XH1A 4PKGA 4B9QA 2FF6A 2E8AA 1BDGA 1HKCA 2P9IB 3WXKA 4PL7A 4EIAA 4IWVA 3MDQA 1NGDA 1MWKA 2A41A 4CBWA 1QZ6A 4EAHD 3QMLA 3MK6A 3AAQA 5F2RA 1NWKA 4JD2A 4DCHA 2ITMA 5JMVA 1Z6RA 5AQNA 4DHYA 3LM2A 4H5TA 1NGAA 3SJHA 5BRFA 1DEJA 1P8ZA 3CJ1A 2VYPA 3QICA 4FO0A 4F9OA 1C0FA 1TYQA 4FWQA 5AQYA 2IIRA 4BRNA 3IDHA 3O1BA 5AFUA 2HMPA 4WQ5C 4IZ9A 4C23A 4CI6A 1ATRA 2E2PA 3ATUA 4BR5A 3CQYA 3LDPA 4CBUA 5AQLA 4CZFA 4GY2B 4AM7A 2GWJA 2CGJA 2QWNA 2ASMA 1NM1A 1MWMA 2WUSA 4FWLA 5BPMA 4M7YA 3EKSA 3HTVA 3QFPA 4B1ZA 3U8XA 2V7ZA 4H0XB 1DGKN 3EN9A 3ZEUB 1YUWA 3VESA 4BVPA 1NGCA 3I33A 1ATSA 5F1XA 3VETA 4JN4A 1ATNA 2P9LA 4MO5A 5B8HA 2P9NB 4B1YB 4EHTA 1GLEG 1LCUA 1NGHA 4WYBA 5AZIA 3B8AX 1YAGA 2F9TA 5AQSA 5ELZA 2NRHA 2GELA 1T44A 1G99A 1OKJA 4H0OA 2YHYA 3A5LC 2A42A 3SK3A 3WQTA 4BGBA 2GWKA 3AARA 2D4WA 3A5MC 1RDWX 2IVNA 2Q0UA 2Q1NA 3CIPA 3O1WA 4JHDB 3DXMA 4B1UB 2I7NA 1NLVA 1ESVA 1S22A 3WXJA 1K8KB 3WQUA 3LDLA 4BREA 3LM9A 4BRCA 5CE3A 1C0GA 2Q36A 2FXUA 1NGEA 3DWLA 4FWRA 1U2VA 1NGJA 2I7PA 4BR0A 4FWKA 3O08A 3VGLA 4XEIA 3R8EA 2A3ZA 4FOIA 4NO7A 1SAZA 5AFUH 3VOVA 3MN6A 2VCPA 2ZGYA 4QS7A 3UKRA 3D7EO 3IUCA 3ENHA 4FWNA 1X3MA 4H0YB 3ZX3A 4FOEA 1NGBA 3L6QA 4IXCA 1GLJO 3TPQA 2CGKA 3FE1A 1JCGA 3H1VX 4CZJA 5BN9A 4FL9A 4BC3A 1H1VA 4B1WB 3O80A 4BRDA 2F9WA 4FPAA 2GTDA 2QWMA 2YI1A 5JLFA 2HF3A 4BR7A 3GG4A 1S3XA 4CJ7A 3O8MA 3KZBA 1GLFO 4I6MA 1TUUA 1HPMA 3FFKB 4HWIA 5FPNA 3GOIA 5AQKA 1T6DA 2AP1A 3L4IA 1NBWA 3QDKA 4CZHA 3QBWA 2YJEA 4H0TB 3WXLA 3DJCA 3M1FA 3VF6A 3U9ZA 4CBXA 3A5OC 3HSCA 3UKUA 2P9KB 2P9LB 5JICA 3CERA 1HKGA 3P4IA 4WQ5A 3WEEA 5LJWA 5FPMA 2IVOA 5KQDA 1ZC6A 5AZIB 3QB0A 4H5WA 2PBDA 1E4GT 5BN8A 3BP8A 2QWRA 3FR0A 3MN7A 4BR9A 3JXUA 1YXQA 2E2QA 2QWQA 2QWPA 1V4SA 4H0PA 3GE1A 4BRIA 5KPRA 3FGUA 3MN5A 3D2FA 2E20A 4NB4A 1NGFA 4A2AA 2IVPA 3H46O 2P9UA 2AA4A 2HOEA 3SMSA 3U4LA 1NGGA 4BG8A 4H03B 2FF3B 3M6GA 5EY4A 1BA0A 2CGLA 3LDNA 2FLOA 3O4WA 3CHWA 1BO5O 3O5BA 5LY3A 4FSVA 2VWBA 1BA1A 2Q0RA 1U2VB 3VEVA 2A6AA 4B1XB 5BREA 3VEZA 1BOTO 4RCHA 4BRAA 3A5NC 4H0VB 1QQMA 2GUPA 3FZLA 3MCPA 1SQKA 4MLHA 4O5FA 3LDQA 3ULEA 3W3DA 3ZX0A 5AR0A 1GLLO 4BRHA 2P9SB 4H5RA 1IJJA 1MDUB 1WUAA 3UKRB 2YCHA 4O8KA 4CZEA 5BRDA 4A2BA 2YHWA 3AY9A 3G25A 2KHOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VN5A 2QXFA 1RGIA 2ZQBA 5AQFA 4IFVA 4ISFA 4ISGA 4YOVA 1MA9B 4FXDA 3BDPA 4A59A 2W41A 1BGXT 4R5PA 3HPOA 4LF7K 4N41A 2AJQA 4HUGA 1BL3A 3VERA 4CGJA 4DTRA 2QI2A 3FZHA 4I6MB 3VMFB 4ZTJA 4CGDA 2UU9K 1RT3A 3O9SA 2E88A 3H6EA 1D9DA 4CE9A 4CJEA 5JS1A 4KB0A 4M7XA 4FK0A 4O4GA 3J7AP 1BWFO 1HX1A 1HNIA 1T3VA 2WC9A 4LFBK 4ELTA 4JD2B 3VQDA 1BCOA 1R59O 1SZ2A 5M1NA 4B3RK 4BRLA 3TAMA 1RCHA 3V9WA 3AA4A 4DSIA 3AV9A 4DQPA 1CXUA 3ENBA 2HBLA 2HW3A 4BQLA 3PIPL 2P9UB 3O4QA 2KFZA 3DXKA 1S9GA 5K14A 3ENOA 4BDYA 4BC2A 5M1QA 3ULDA 4OVLA 4EFHA 3NHGA 3THWB 3S9HA 4CJVA 4LSLA 3ZLJA 1GLDG 3PX0A 4BRFA 2FBTA 3CFRA 4FJXA 1WSEA 1L3SA 3DLKA 3CF5L 4DLEA 2UXDK 5E84A 2E1ZA 4H4OA 3KLFA 3CC2N 1HJRA 5KTQA 3ULEB 3I8DA 5DK5A 1K9MO 1QQOA 1WBBA 1T6CA 1CZAN 4AM6A 4BR4A 4DSFA 3AA5X 1ZXOA 1TV6A 4FJJA 4NCBA 4OO1J 4PY5A 4OPAA 3C7NA 3ITHA 2E6LA 5AQPA 4LH5A 1GLBG 1RILA 2V52B 4DR2K 2KLAA 4W5TA 4IBNA 2V7YA 5M1OA 5C25A 3O6WA 4MDBA 1IV0A 1VQ9N 1U6ZA 3AAPA 3L4QA 2ZJPL 3FZKA 4DV4K 3HPGA 5FPEA 2VGMA 4O55A 4FWOA 3KVGA 1N34K 3KKSA 1VRUA 2OTJN 5CHIA 4IO9L 2PYJA 3ISNC 4JI7K 3HYFA 3NE6A 2KKZA 3PV8A 4DQSA 4C8NA 1NMDA 4CESA 3S3MA 1L3VA 4BWMA 4E1NA 3ZX2A 1HUXA 5EX5A 1LW2A 3D2EA 2P9PA 4LF6K 5AQVA 4I9LA 5LJVA 3SYZA 1IKXA 3AVFA 2DFEA 3NFAA 2UXBK 3P1GA 2IAJA 2P9KA 5EVZA 4DV7K 3DXKB 4L8RB 1ZYQA 5BPLA 3OYIA 3CETA 4CK3A 3BGRA 1NGIA 4BQZA 2YHXA 4Z4CA 2OPRA 4DQRA 4LFAK 4CIFA 1VQ7N 1VAZA 1RDCA 3OJUA 3CC4N 1IH7A 4F2SA 5AQXA 4CZLA 3V1RA 2YKNA 4DU1A 1UA0A 3AVKA 3NBPA 4H8KA 2OPSA 3M3ZA 2BDPA 5LMNK 3SPZA 2Q97A 2O8EB 4NLBA 3C7NB 3ZSXA 5C2DA 2Q31A 4FWPA 1KQSM 4Z4GA 3A0IX 3VF2A 3ZSQA 4XH5A 5BPNA 5ADXH 3G6EN 3EZWA 4WQ4A 2P9SA 3MEEA 4C8KA 4DTOA 2IDOA 1JCEA 4KHYA 3OTOK 4DS4A 3CCUN 3THXB 1JLCA 2YJFA 3H45C 3EYZA 4K43A 3ZT4A 2HHXA 2IC3A 3CJ7A 3HZ6A 4L3QA 4OPKA 4DUYK 2QM1A 1BG3A 1X9JA 2W40A 3LAMA 5LL6Z 4KHNA 4G1QA 3ZSOA 2XO7A 1D4XA 3O9UA 3GL1A 2VGNA 2D1KA 4V19S 3D2EB 2P9PB 2NZTA 4CERA 4XH1A 4PKGA 3KJVA 2E8AA 5J1EA 3I0SA 4CEQA 3L3UA 2P9IB 4EIAA 1MWKA 3DRPA 2A41A 4CBWA 4UQGA 1SL0A 3MK6A 1Z6RA 3WXMB 1NK9A 1IKYA 3AO3A 3LM2A 5JVHL 2OYQA 4CEFA 4DFJA 1VSEA 4F3TA 4KHUA 1TYQA 5C24A 4N76A 4A57A 4FM2A 1JL2A 1S1TA 4FJKA 1EWQA 3TABA 3OYLA 2LSNA 5AFUA 1S1UA 3CC7N 4BR5A 3CQYA 3LDPA 4GY2B 2QEXN 3IKMA 5CR4A 4HVJA 4M7YA 3HTVA 4M3XA 2V7ZA 3EN9A 3ZEUB 4B9UA 4CJQA 5F1XA 4CJ4A 4JKHA 2DFFA 1ATNA 3SQ0A 1N32K 1YTAA 4RW7A 2P9NB 4CFCA 2HMIA 5AZIA 3OYHA 3T19A 4X62K 3TAGA 4CEEA 3K9JA 5ELZA 4E7LA 1QS4A 2GELA 2HB5A 2O8FA 3AVCA 4GV6A 3AARA 2D4WA 3DRSA 5E41A 1RDWX 4KTZA 2ZE2A 1DTTA 1LW0A 2I7NA 1NLVA 5C15A 3F9KA 4FM1A 3PLAA 3CCSN 4IDHA 3ZYYX 3LM9A 3CYMA 2EX3A 3DWLA 4FLXA 1ZBFA 3HM9A 3F73A 3EE9A 4CJ3A 1KRPA 4BR0A 3VGLA 3LANA 2HHUA 3VQBA 3TANA 3PX6A 2PYLA 1NK5A 4QS7A 3P31A 2O8DA 3D7EO 4JRQA 3CG7A 3MWTA 1L3UA 1RNHA 4J2BA 4FOEA 2KFNA 3DM2A 4BACA 2CGKA 4YOXA 1C1BA 4MDAA 4CECA 4B1WB 3V1OA 4BRDA 4YNQA 4ELUA 4LSNA 4DSEA 3U3GA 4E7JA 2YV0X 3O8MA 4HWIA 5FPNA 5GADP 3D45A 4I7FA 4JYAK 5HRPA 3QDKA 2YNIA 4JI6K 3DJCA 2NRRA 3ZCMA 4B9MA 3C6HA 1HKGA 1T03A 2G8IA 1S6QA 1KC8O 3WEEA 4RW8A 5AZIB 3QB0A 1GOAA 3VA3A 3BP8A 4B8AB 5DM7L 2QWRA 4BR9A 3JXUA 2E2QA 4I2QA 2QWQA 3MEDA 3TSQA 1V4SA 4H0PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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