2ASOA

Structure of rabbit actin in complex with sphinxolide b
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
total genus 129
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asoA03
3ATVA 3LM9A 2P9LB 4A61A 1ATNA 3ENHA 3WUHA 2E20A 3H46O 1XQSC 4XH4A 2ZGYA 4H5NA 2YHXA 4BQZA 3CQXA 1NGIA 5FPNA 5ADXA 2W41A 3H45C 2P9KB 3MN7A 4CZKA 1V4SA 5EVZA 4RCHA 4BR2A 1GLCG 1HUXA 3O4WA 3H6EA 4MLEA 5F2RA 5AQOA 5JLFA 1BO5O 2E88A 1QZ6A 2V7YA 1NGJA 5BPMA 3DAWA 3AY9A 4H5RA 5LJVA 4M7YA 2GUPA 2AA4A 5AQNA 5AZJB 3RSEA 3QB0A 4IJAA 4K25A 3I8BA 4JN4A 5EOYA 4BROA 3KZBA 4JAXA 4BRQA 4BVPA 3EL2A 4A2BA 3CJCA 5BR9A 4CZGA 4BRNA 1DKGD 1WUAA 3CETA 4H0OA 4BRAA 1NMDA 3VESA 1NGDA 3VENA 1HLUA 1P8ZA 2HOEA 5B8HA 2FSKA 3WEEB 3ZEUA 3WXJA 3CERA 1X3NA 3MDQA 1CZAN 1D4XA 1Z6RA 4PKIA 3IFRA 4QS7A 3IMXA 3SJHA 4FWNA 4BRHA 3M1FA 3VEVA 3HZ6A 4HWIA 5AFUH 2CGKA 3SK3A 5AQHA 4O5FA 3ZX2A 4XEIA 1EQYA 3U8XA 4FWLA 2V51B 3H3NO 3LDLA 4JD2B 3WXLA 3WXIA 2GEMA 1ZC6A 2P9UB 2P9NA 5BN8A 1K8KB 4FSVA 1C0FA 3MCPA 4CZFA 1TUYA 1LOTB 2CH6A 2QWMA 1SAZA 3CQYA 3UE5A 3CJAA 4AM6A 1GLBG 2QWPA 2CGLA 4BRDA 1ZXOA 5AQIA 3QBXA 2AP1A 1E4GT 2PBDA 5AQWA 1BG3A 3FZFA 4FWOA 1BOTO 3A0IX 3TU5A 1TYQB 4K41A 1LCUA 3ZX3A 3QMLA 1GLAG 3FZLA 3MN6A 3R8EA 1NM1A 5AQMA 4EFHA 4QS8A 5AR0A 3UKUB 2GWJA 2GWKA 4FWRA 1YXQA 3D2EB 4Y0WA 2QWRA 3C0BA 5CE3A 2A42A 3S41A 1NGAA 1BWFO 3H1QA 4IJNA 5FPDA 5AQTA 4WQ5A 3L0QA 3DXKA 3VEYA 1JCFA 3J8AA 4FOEA 1HKBA 1QQMA 2HMPA 2VWBA 2P9LA 3O1BA 5EXWA 3ZETB 4E1JA 1ZBSA 3BF3A 3ENOA 3VF4A 1ATRA 4BQLA 3FLCO 3A5LC 3DXMB 4FWKA 2W40A 4H0PA 4CBUA 3SMPA 1U2VB 3DWLA 2YCHA 5I9EB 3CIPA 1QZ5A 5AZIB 1YAGA 4YDUC 3HBTA 4O8KA 3AAPA 3OHRA 5AQQA 1X3MA 2CH5A 2Q0UA 2NRHA 3B8AX 4HTLA 2HF3A 3FZMA 4EHUA 5AZJA 2HF4A 3LDPA 5BN9A 4EIAA 1MWMA 1QHAA 3GL1A 3LL3A 4CZMA 5AQPA 1BDGA 4BREA 4H0XB 1NWKA 2IVPA 3H3OB 4BR9A 2Q31A 5AQGA 3A5MC 4JNEA 1NGHA 4B1YB 3D2FA 1G99A 3MN5A 3ID8A 4CBXA 5KPZA 3ATUA 5AQYA 4WQ5C 2QM1A 4F9OA 2GTDA 3U9ZA 4IZ9A 3AARA 5E26A 2KHOA 4ISEA 4Z94A 4CJ7A 4DQ8A 2FSNA 2QWNA 1X9JA 4WQ4A 4JD2A 4DCHA 4LC9B 2E1ZA 4BR0A 4MO5A 1JCGA 3QDKA 2P9UA 4I6MB 2P9IB 1K8KA 3VOVA 4CZEA 4MLHA 1YVNA 4B1ZA 3GG4A 1KAXA 4BC5A 1MDUB 2D4WA 1XC3A 3VEOA 3I33A 1HKGA 5KPTA 5ELZA 1BA1A 3WQTA 5AQZA 4GNIA 3R6MA 2BUPA 4PL7A 4XH5A 3VGLA 5BRHA 1NBWA 3O8MA 3A8YA 1RGIA 4CZHA 2YJFA 1HKCA 2YI1A 3R9PA 2P9SB 3VEWA 1TYQA 3LDQA 4H03B 3GOIA 3VGKA 1WOQA 2IVNA 4B9QA 2V7ZA 4PL8A 4NB4A 2EWSA 4BC4A 1OKJA 4BRGA 1BUPA 3L4IA 3UKUA 5KQDA 4FOIA 4H5VA 1NGCA 5F1XA 1ATSA 3D2EA 4BG8A 5BRFA 3IDHA 3ULEB 4FPAA 5AQUA 2P9PB 3QICA 3WQUA 2YHYA 5BRDA 4BC2A 3HI0A 3WXKA 3O08A 2DPNA 5ADXH 3DJCA 1H1VA 4H5WA 3EO3A 2FSJA 4CZJA 3G25A 3ZETA 5KPRA 1MA9B 3QFPA 1KAZA 1SQKA 2FLOA 1BA0A 5AQXA 3DXMA 5AQLA 1IG8A 2A3ZA 3FFKB 2ASPA 4BRIA 5AQRA 1U2VA 2ASOA 4BRKA 4FO0A 3VETA 3BUZB 1S3XA 3BP8A 1QQNA 1T6DA 1GLEG 1R59O 2VCPA 3CI5A 2YJEA 3P4IA 4B1VA 2P9KA 3A5NC 3W0LA 3HM8A 2PAVA 4H0TB 4JHDB 3MN9A 4WYBA 1GLFO 4BR4A 3UKRB 4PKHA 3EZWA 1QQOA 4PKGA 4BGAA 4DB3A 4IWVA 2Q2RA 3L6QA 5FPEA 1HX1A 4IO8A 3SLCA 3F9MA 3BF1A 3HTVA 4J8FA 2A6AA 2IIRA 4EHTA 4CZLA 3VEZA 3IUCA 4B1UB 4M7XA 2E2OA 3CJ7A 3FE1A 3EN9A 3QBWA 4FL9A 3LM2A 4KBOA 5LJWA 1NGFA 1NGEA 4M63C 3SMSA 3C7NB 5TKYA 2A40A 3WEEA 1NLVA 2FF3B 3MMVA 4K43A 5AQJA 2BTFA 4DHYA 1JCEA 4BVOA 3FR0A 2A5XA 1E4FT 5BREA 3CHWA 3MK6A 3M6GA 4I6MA 2P9IA 3CJ9A 2ZWHA 1MWKA 2Q36A 3O80A 5FPMA 2FXUA 4B1WB 5AQKA 4MO4A 4ISFA 2E8AA 2QW9A 2IVOA 1NGBA 3FZKA 4FPBA 4CD3A 1U6ZA 3BEXA 2E2PA 2Q1NA 3H1VX 3HSCA 4H0VB 2E2NA 2QWLA 5EX5A 2FF6A 3KHYA 1Y64A 5EY4A 2P9SA 2D0PA 3EKUA 2YHWA 3D2FB 2H3GX 4BRFA 3KVGA 4FWMA 4H0YB 3RSEB 3U9DA 4C23A 2E2QA 5LY3A 5KQ8A 4BRPA 4FWPA 1V4TA 2V52B 5BPNA 3AAQA 2F9TA 3QFUA 5BPLA 3W3DA 1NGGA 4A2AA 3O1WA 3LDOA 3ULEA 2P9PA 2QWQA 3M3ZA 2D1KA 2J4RA 4B1XB 3GE1A 3ZEUB 3VF2A 4H5TA 3JS6A 2UYTA 3VERA 4GY2B 4NO7A 3TPQA 4BRCA 2A41A 2VYPA 3D7EO 3FZHA 2E1YA 2I7PA 2WUSA 4BG9A 3VGMA 3GBTA 4FWQA 4IXCA 1YUWA 1SZ2A 2I7NA 2QWOA 4AM7A 3VF6A 1KAYA 3GDQA 3EKSA 4YDUA 3A5OC 4WQ4C 4BR5A 5E84A 1J6ZA 1Z05A 4BRLA 1GLLO 2P9NB 5AQFA 4BRMA 4BGBA 1RDWX 4FWSA 5F0XA 1DEJA 3O6WA 2D0OA 2QXLA 1T6CA 4K42A 4L3QA 1ESVA 4JHDA 3U4LA 4A62A 3VEXA 4ISGA 2ZF5O 3UKRA 5AZIA 4QS9A 4BC3A 1DGKN 1HPMA 1XUPO 5AFUA 1KXPA 4EAHD 2ITMA 3LDNA 1TUUA 3WT0A 3UB5A 1RFQA 3CJBA 2NZTA 5JLHA 2GELA 2NLXA 3CJ1A 2CGJA 1BU6O 4RTFD 2ZGZA 2OANA 1GLJO 5JICA 4CZIA 3ZX0A 2Q97A 2ASMA 4CI6A 4XH1A 1S22A 1Q18A 4CBWA 4RWTA 3VPZA 5AQVA 3C7NA 1C0GA 3O5BA 2F9WA 3DXKB 5JMVA 1IJJA 1HJOA 1T44A 3JXUA 5AQSA 3FGUA 2Q0RA 4CD1A 1GLDG 4BR7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O4QA 1YT3A 3C65A 4RG8A 4JV5K 4DSJA 3ZSXA 3H46O 1F21A 4A5BA 5M1PA 3CQXA 2OTLN 3CQ8A 2P9KB 4CZKA 3KLFA 4JK7A 4BECA 4FJNA 2OZMA 3H6EA 4MLEA 2IOCA 3AGKA 4J2AA 2KZMA 3DAWA 3DLRA 3CF5L 2C1IA 4M7YA 5A2QO 5AQNA 3RSEA 3Q7CA 3QB0A 4IJAA 4ILGB 3I8BA 4BROA 3KZBA 4BVPA 4M42A 3NMUA 5BR9A 3DLKA 2O4IA 3HVTA 4CZGA 1HMVA 1W2BM 1J53A 3VENA 3C6TA 2HMIA 5B8HA 3MWTA 3WXJA 1RBUA 3CERA 1X3NA 4DQPA 2DTUA 4FJ9A 3TTFA 4E72A 2ATQA 4M3XA 2QXFA 3IMXA 1Q7YO 3PSIA 1WLJA 5LMUK 1QS4A 4X66K 3UIQA 3HPOA 3ZX2A 3DLEA 3DOKA 4JI7K 3D0PA 2V51B 1T8EA 1YJWN 4JS4A 2GEMA 3BZCA 2HHWA 4FSVA 1C0FA 1I3AA 4FLYA 2QWMA 1O1WA 2O8FB 2W6LA 1DLOA 1ZBHA 2C1GA 2QWPA 4YOTA 3OW2M 1WAJA 1S9GA 4DTUA 1YTUA 1FXXA 4FWOA 3AO5A 3QNNA 1WSEA 3A0IX 3TU5A 1TYQB 3QMLA 1VQ6N 3PO5A 4PUOA 1Q86O 1A5WA 2HBLA 3O9SA 4N5SA 1TKXA 2G8HA 4IDHA 1N36K 3UKUB 2BDPA 3D2EB 1NJYA 4Y0WA 2HNZA 3C0BA 4EP5A 5CE3A 2A42A 4KI6A 3S41A 3ASMA 2DFHA 4WQ5A 1N8RO 4FLTA 4LFCK 1JCFA 1IKVA 3KKSA 3OYCA 3NE6A 4DQRA 2HMPA 3S3MA 1ASUA 1HYZA 4FVMA 1O13A 1M1KO 4GW6A 1OH6A 1ZBSA 3BF3A 4CGGA 3IRXA 1FK9A 1DTTA 4FWKA 5HRPA 1RT4A 4CEQA 2NRVA 3SMPA 3DWLA 1HNVA 3OYNA 1K73O 4BDPA 3V81A 1B9DA 1JLBA 1QZ5A 4C8KA 2KKZA 2UU9K 4KREA 4YDUC 3PLAA 3BZKA 4CCHA 1TL3A 4O8KA 1TL1A 3AAPA 3OHRA 5AQQA 4CF8A 4CGFA 3O9QA 4CJKA 4N47A 3RRGA 3ZSRA 3VQ9A 5AQPA 1BDGA 3H3OB 3F2KA 2YNHA 5BR8K 2F96A 3ATUA 1NKCA 1VQ8N 5CZ1A 4ELVA 4CEFA 4FM0A 1VRTA 3AVJA 3T1YK 1RDDA 3U9ZA 4RW8A 4FJ8A 1SKWA 1IO2A 1WSIA 3E01A 2KHOA 2FBVA 4DQ8A 2FSNA 2QWNA 3P5JA 4WQ4A 4CIGA 4LC9B 4FLXA 1IKYA 3QDKA 4I6MB 4R5PA 4KHWA 1Y97A 4MLHA 2VGMA 1SV5A 3NH1A 2O8FA 3VEOA 3I33A 1TK5A 1RTDA 3HJFA 2G8UA 3KWIA 5KPTA 3VQDA 3R6MA 1FKOA 3TARA 3O3HA 3VGLA 5BRHA 1NBWA 3O8MA 1NJWA 2F8TA 1OVYA 1YJNN 4OLAA 3KK3A 2KFZA 2OTJN 2P9SB 1HYVA 1TYQA 2E5LK 3KJVA 4B9QA 1EP4A 4DFPA 1S1VA 1C1CA 3LAKA 3CYGA 4NB4A 4BC4A 1VSEA 1OKJA 4BRGA 3L4IA 3UKUA 4FOIA 3D2EA 4AHUA 3IDHA 5C10A 2VG5A 4NYNA 3NF8A 4B9TA 3ZSQA 1RDBA 3O08A 3TSQA 3HOTA 1H1VA 3D45A 2FSJA 5D3GA 3G25A 2B6AA 5HOOA 1MA9B 1JXEA 4NLBA 1KFSA 3NVKA 4FW1A 1XNQK 1BA0A 4LH5A 2KTQA 1BQNA 1E3MA 1ZBIA 5AQLA 3M5RA 5JVHL 1I94K 2A3ZA 2VWJA 1JKHA 3M8SA 1RBSA 2ZE2A 4DR5K 3SQ0A 4QCLA 2RN2A 1IH7A 4FO0A 3VETA 3N4QA 3RVCA 1U49A 3BP8A 1T6DA 1QTMA 1GLEG 2GUIA 1IBKK 3AVGA 1R59O 2PY5A 2VCPA 3P4IA 4B1VA 4CJRA 2PAVA 4WYBA 3VQAA 4YOXA 1NK4A 1VSDA 4DLEA 4PKHA 3VQCA 1SKRA 4IO8A 4LF8K 3F9MA 4E7HA 4FM2A 2E4LA 3HTVA 2A6AA 3WNEA 4AILC 3CFRA 1EWRA 3VTHA 4EHTA 1JLEA 4CZLA 1IBLK 4KHSA 1W97L 4CJQA 4IKFA 3ZYYX 3NHGA 3CJ7A 1VQ9N 4FVUA 3LM2A 2OCEA 1N6QA 4HUEA 2O8CB 3C7NB 3WEEA 2FF3B 1FW6A 2A5XA 4JRPA 3MAQA 4LFBK 1EXQA 3MK6A 4DV1K 4RW7A 4DTSA 1KLNA 4I6MA 2BH1A 3VA3A 4DV4K 2QKBA 3VQ6A 2Q3SA 4DTXA 3MXMA 3O80A 4FJ5A 4WFAL 2FXUA 4IO9L 4I2PA 4MO4A 5AQKA 5J2QA 2YNFA 1U04A 3JAMO 1GOAA 3QERA 1U6ZA 4H0VB 3TAEA 1Y64A 5EY4A 2HHQA 2P9SA 3T69A 5J2NA 2YHWA 3AO2A 3KVGA 3U9DA 2E2QA 5KQ8A 4FWPA 4XJXA 1V4TA 1EWQA 4JI6K 1LWEA 3GE1A 1XI1A 3JS6A 3CFOA 3AO4A 3VERA 3TPQA 5FDLA 2IGIA 5KRSA 1M90O 2A41A 3FZHA 3K5MA 3RTVA 2E1YA 2JWKA 2I7PA 4DV5K 3I8DA 2F8SA 2HHVA 3DYAA 4FWQA 3VGMA 2W42A 5IT9O 3CMAN 1YUWA 3O3GA 1SZ2A 4M3TA 3BY5A 4ELTA 3AVFA 4AM7A 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2CGLA 4CIFA 1VQLN 1SUQA 4BRDA 1ZXOA 2X78A 5AQIA 2UXCK 1TGOA 3QBXA 2AP1A 5AQWA 1BOTO 3L3VA 4K41A 2KLAA 3DRPA 1GLAG 4QOZB 3MN6A 1NM1A 5C15A 4Z4GA 4LD0A 3NH2A 4EFHA 4FJ7A 3OVNA 5AR0A 5HBMA 3THXA 1OH5A 1YXQA 3R3LA 2O8EB 3TI0A 3NFAA 3LANA 4CIEA 3ENBA 4GV3A 3MCAB 2XRIA 4OGEA 1IG9A 3J8AA 4ID1A 2IDOA 1HKBA 5K14A 1QQMA 3AVBA 2NUBA 3ZETB 3NF7A 1T7PA 3TSPA 1X9WA 4AHRA 3DMJA 4KH4A 3A5LC 2W40A 2JWLA 2NRZA 4MFBA 4H0PA 4BY9C 1U2VB 2YCHA 3O3FA 5AZIB 2GX9A 3QIOA 1HNXK 3F9KA 5M1OA 4H4MA 3ULDA 1RNHA 1RILA 4CF2A 1C6VA 2G8FA 3TTDA 3VN5A 2Q0UA 2NRHA 2WTUA 2HF3A 2D5RA 3FZMA 4EHUA 5BN9A 5GADP 2ZM6K 2QTDA 4CEOA 1QHAA 3C6UA 3GL1A 3LL3A 5M1KA 1QSSA 2YV0X 3QO9A 2Y1JA 1NWKA 1S1UA 2IVPA 2O8BA 4BR9A 2QK9A 2Q31A 5AQGA 4JNEA 4AQYK 4YY3K 1G99A 1TK8A 1U48A 3ID8A 4CBXA 3KD1E 5KPZA 4C8OA 4DU4A 4DS4A 4CJ4A 4WQ5C 2PZSA 4KB1A 3PX6A 2QM1A 5GAGP 1K6YA 4JEPA 4W5RA 3AARA 4DMNA 4B3MK 5E26A 1TKDA 4IDKA 4ISEA 5E41A 4CJ7A 4A5AA 3RMAA 1X9JA 4E1NA 3QEIA 3TAPA 2E1ZA 4BR0A 1JCGA 2P9IB 1K8KA 4CZEA 1TAQA 1KAXA 1MDUB 3QINA 4JKGB 3VQ5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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