5AQKA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqkA04
1U2VA 4BVPA 5EOYA 2HF3A 4CD1A 3GOIA 1NGGA 3ZETB 1ZXOA 4FWLA 3ZX0A 1P8ZA 1BA0A 4H5VA 3U8XA 4JHDB 3AAPA 4F9OA 4H5RA 2W40A 4RWTA 3C7NA 2W41A 2A6AA 5AQSA 4YDUA 2Q1NA 3BUZB 3W0LA 1ZC6A 2P9IA 3RSEA 1QQNA 5BRFA 1RDWX 3WEEA 3H3NO 2AA4A 3VGLA 4BQLA 1K8KA 4A62A 4FWPA 2VYPA 3D2FB 2A41A 3QICA 5KQ8A 5ADXH 1X9JA 3F9MA 5AQQA 1V4TA 1BO5O 3A5NC 3UKRA 1LCUA 5FPMA 2FF6A 1U2VB 1SAZA 4B1ZA 1KAZA 4WQ5C 4H5NA 5AQGA 1QZ5A 4BRGA 3FZLA 3L0QA 1GLFO 3C7NB 5AQWA 4H0PA 4K41A 2GWJA 2P9IB 2QWNA 3RSEB 2IVPA 2J4RA 2BTFA 2ZGZA 3WEEB 3ATUA 5AZJA 1GLAG 1NM1A 1K8KB 2QXLA 3CJ1A 1LOTB 5BPLA 1NLVA 3VEVA 2VCPA 3J8AA 4MLEA 4FSVA 3MCPA 4ISFA 5AFUH 3VEYA 5EX5A 3ZX2A 5EXWA 3UKRB 3LL3A 3WT0A 3SMSA 1KAXA 2WUSA 2CGLA 2FF3B 2I7NA 4B1VA 2PBDA 3EKUA 5KPZA 3L4IA 1BUPA 3HTVA 5JICA 2A42A 4QS7A 4IZ9A 3WXLA 2FSJA 5E26A 3SMPA 1HJOA 1DKGD 4HWIA 3R6MA 4EHUA 3IDHA 5AQIA 2HOEA 3BP8A 4BC5A 4H03B 5AZJB 1BWFO 4O5FA 3UB5A 1Y64A 2GUPA 4BRNA 4DHYA 1R59O 5AQUA 4RCHA 3BF3A 5AQRA 2Q97A 4FWSA 4BRFA 1E4FT 3MDQA 4LC9B 3H46O 2QWOA 4BR4A 5AQZA 2I7PA 1NGDA 2E20A 4ISEA 4IJAA 3VF2A 5AQNA 1TUYA 1BG3A 2ZF5O 3EO3A 4B9QA 5AFUA 2P9NA 2NRHA 4H0TB 1YVNA 4GNIA 1C0FA 1WOQA 3FZHA 3VF6A 1QZ6A 3FR0A 2YHXA 1MA9B 1NGAA 5AR0A 1Z6RA 2IIRA 3W3DA 4B1UB 3C0BA 2YJEA 3ZEUA 3QFUA 4BRPA 1NGIA 3VEXA 4CZHA 2F9TA 5AQPA 3SLCA 1MDUB 3ID8A 1NGCA 2V51B 1HKGA 2P9PA 3CJ7A 3A5MC 3UKUA 2QWRA 2YI1A 2EWSA 3H6EA 4PKGA 4XH5A 3SK3A 1YXQA 1HPMA 5F0XA 1U6ZA 3JS6A 3M3ZA 2ASOA 2P9NB 4FWNA 4MO5A 3O5BA 2HMPA 3A5OC 4PKHA 3FZKA 5AQMA 3U9ZA 2IVNA 5AQJA 4FWRA 2IVOA 2Q0UA 4H0YB 2V7YA 5AQTA 4L3QA 2E1YA 4HTLA 3FZMA 1HLUA 2ZGYA 4FWQA 1ATSA 4K43A 3MN9A 1MWMA 4J8FA 3ZEUB 2YCHA 4BR9A 4BGAA 1QQMA 2A40A 2E1ZA 3O6WA 3VOVA 4BRCA 2CGJA 3CJCA 3ENOA 3AAQA 3MN6A 2CH5A 5LJVA 4CZGA 1GLLO 3UKUB 2P9PB 3VPZA 3WXIA 4EFHA 5FPNA 4A2BA 5BRDA 3U9DA 3A8YA 4Y0WA 3HBTA 4YDUC 4WQ5A 2GEMA 4M7YA 5LY3A 2FSNA 3HI0A 1XUPO 2E2OA 3UE5A 4JNEA 4WQ4A 3A5LC 5AQYA 1QQOA 2UYTA 2D0PA 4RTFD 3U4LA 2D1KA 4CBWA 3LDPA 1D4XA 4FOEA 1T6CA 3VF4A 4CD3A 2ZWHA 3GL1A 4PL7A 5FPDA 4A2AA 3VENA 4EHTA 5BRHA 2ASPA 3WUHA 3O1BA 1JCFA 3H3OB 4QS8A 2E8AA 2Q0RA 5EY4A 5FPEA 5I9EB 4BRAA 4BRLA 1T44A 2Q36A 4BREA 5LJWA 3KZBA 3O80A 3ATVA 2QW9A 3DXKA 3VESA 5JLHA 1NGJA 3LM2A 4H0OA 1NWKA 3WXKA 4BC4A 1HUXA 3FGUA 4H0VB 5BR9A 3GBTA 3QBXA 1XQSC 4GY2B 4ISGA 2D4WA 1RGIA 4XH4A 3EKSA 4MLHA 5F1XA 1CZAN 3LDOA 4CZLA 3OHRA 3I8BA 4BC2A 5EVZA 1EQYA 4B1XB 4CZKA 2E2PA 3D2EA 3FLCO 3ENHA 4FPAA 4CZFA 1ESVA 3H1QA 3DXKB 3S41A 4M63C 1YUWA 3IUCA 4JN4A 4BRMA 1ATNA 2NZTA 5TKYA 3ZX3A 1Z05A 4BR5A 1BA1A 1MWKA 4BRIA 2CGKA 4CBUA 4IJNA 5B8HA 2HF4A 4M7XA 1Q18A 4EIAA 4BQZA 5AQVA 3IMXA 3R8EA 3MN5A 3I33A 2E2QA 4BRQA 1DGKN 1JCEA 4B1YB 4PKIA 3CJBA 1WUAA 1GLDG 1TYQA 5AQLA 3HZ6A 3KHYA 3AY9A 4Z94A 2AP1A 5ELZA 3D2EB 3GDQA 2YHYA 3MMVA 2H3GX 1IG8A 1NGEA 1HX1A 1S3XA 3LDLA 3QB0A 4CZEA 4H5TA 4FWOA 4QS9A 1X3MA 3M6GA 4FPBA 3VGKA 2P9SA 2E2NA 2GTDA 2FXUA 5KQDA 5KPTA 1HKBA 3JXUA 3B8AX 4BRHA 3CERA 4MO4A 5CE3A 2QWLA 4BGBA 4O8KA 1OKJA 2ASMA 2OANA 3QDKA 1TYQB 4AM6A 1DEJA 2E88A 3MK6A 5AZIA 1C0GA 1NMDA 3H45C 5JLFA 3DAWA 3VGMA 5BN9A 1KXPA 3CJAA 3TU5A 1H1VA 1S22A 2Q2RA 3ULEA 3KVGA 3DXMA 2QWQA 3VEOA 1E4GT 3DJCA 2KHOA 3O08A 1BDGA 4DCHA 1SZ2A 2P9SB 3G25A 3O1WA 3LDQA 4CZMA 1NGHA 5AQHA 1ZBSA 4BR2A 4FO0A 4CZIA 4DB3A 5JMVA 4DQ8A 2F9WA 3QMLA 3CIPA 4FL9A 4I6MA 2QM1A 5KPRA 4BVOA 1RFQA 3FE1A 1HKCA 1BOTO 2DPNA 2P9KA 5AZIB 4BROA 1V4SA 2GWKA 3VEZA 3M1FA 3DWLA 4WQ4C 5AQFA 1KAYA 1JCGA 2QWMA 3SJHA 4FOIA 3ULEB 1G99A 3DXMB 3H1VX 4XH1A 4BRDA 4CBXA 4CI6A 3R9PA 2YHWA 3HM8A 4A61A 1NGBA 3BEXA 2P9LA 2VWBA 4BRKA 2A5XA 1TUUA 3VEWA 2FSKA 1IJJA 3EN9A 1YAGA 5AQOA 1J6ZA 1X3NA 4JAXA 3FZFA 4BR0A 1BU6O 4I6MB 4K25A 3QBWA 4H5WA 2PAVA 3VERA 3WQUA 5BPMA 4JD2A 5ADXA 3O8MA 5BN8A 1XC3A 4C23A 1QHAA 4AM7A 2P9KB 1T6DA 3CI5A 3GG4A 2P9UA 2V52B 4EAHD 3LDNA 5AQKA 4FWKA 3CJ9A 5BREA 3EL2A 4CZJA 3GE1A 2BUPA 3EZWA 5F2RA 2P9LB 1NGFA 3CQYA 2ITMA 1ATRA 3P4IA 2Q31A 3D7EO 4PL8A 5E84A 3TPQA 4FWMA 5AQXA 4BC3A 4XEIA 3ZETA 4NB4A 4BG9A 3LM9A 4JD2B 3WXJA 1NBWA 3QFPA 4JHDA 2D0OA 2CH6A 1GLBG 2QWPA 2YJFA 3A0IX 4IXCA 3FFKB 3HSCA 3WQTA 2P9UB 3CETA 1SQKA 4H0XB 3L6QA 2FLOA 4BR7A 3O4WA 4K42A 4NO7A 4E1JA 3BF1A 4CJ7A 1GLJO 4BG8A 2GELA 2NLXA 3VETA 5BPNA 4IWVA 2A3ZA 2V7ZA 1GLEG 3D2FA 3IFRA 3CHWA 3AARA 3MN7A 4IO8A 4KBOA 1GLCG 4B1WB 4WYBA 3CQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K8XA 3QI7A 1U2VA 3EZ5A 2HF3A 3QERA 3CMEN 1NGGA 4BE1A 5SZTA 3V9ZA 4E72A 2NRXA 1TAQA 4O0IA 4DSEA 3U8XA 1N5YA 4F9OA 3AAPA 1WSIA 5C25A 3NF6A 2IS3A 1NK8A 4RWTA 3C7NA 5GAGP 5AQSA 4FZXC 4YDUA 3OYDA 3BUZB 1S1VA 3W0LA 1QQNA 5BRFA 1RDWX 2OPRA 4DQPA 4LY7A 4CERA 5CY0A 3SAFA 3QICA 3TAMA 5KQ8A 1NE5A 1UOCA 3F9MA 1TL3A 3UKRA 1QS4A 1ZBLA 4YOYA 1SAZA 4GVEA 3V9WA 4WFBL 1I2VA 4HCBA 3FZLA 3ITHA 4CJRA 1RT4A 5T7BA 4CJSA 4JKGA 4H0PA 4B9VA 2YV0X 3RSEB 2BTFA 3WEEB 1JKHA 3K5OA 5AZJA 2NY9X 3GKUA 3THYA 1NM1A 1K8KB 4AHRA 3TTFA 3VEVA 4LFAK 4FSVA 2OYQA 3MCPA 3KKSA 4ISFA 4ICLA 3LL3A 2HNZA 2FF3B 1QTMA 3K9KA 4DSJA 4CCHA 3L4IA 4YORA 3L2RA 3LZJA 1XNRK 4DF8A 4QS7A 1HMVA 5E26A 3SMPA 5GAHP 1HJOA 1DKGD 1HQEA 2YHBA 4M41A 3V1OA 4BC5A 3VQ6A 5J2NA 4QAGA 1Y64A 2X74A 3DI6A 1R59O 3M5RA 4JI3K 2KZZA 3EYZA 4LF5K 5D3GA 4BRFA 4OX9K 4LC9B 3H46O 1S9EA 2BRZA 1NGDA 3OVNA 4CGIA 1KVBA 4M42A 5AQNA 1TUYA 3SUNA 1W7AA 3J7AP 4B9QA 4FVUA 5AFUA 5KK4A 2NRHA 4JK9A 4CF2A 2PFUA 3HT3A 3SF4D 3UIQA 4KYPA 3FR0A 1WSJA 1NGAA 4KRFA 4DUYK 2FC0A 2C1IA 1HQUA 4AQYK 4B1UB 2MBKA 2WONA 4HE7A 4FJMA 4M3TA 3ZT1A 2QWRA 3AVIA 2EWSA 2D5RA 4DMNA 1EKEA 1HPMA 3HJFA 3FZKA 1YIJN 5LL6Z 5C15A 3K59A 2V7YA 3TWHA 1GOCA 3C94A 3LALA 1IG9A 1IKYA 1ATSA 1U47A 1S1UA 3DOKA 4J8FA 4DV3K 2A40A 3O6WA 2CGJA 1B3CA 3CJCA 3AA4A 3CYGA 4B3SK 4YOXA 2P9PB 3WXIA 3BGRA 1VQ6N 1RDDA 2HSTA 4LD0A 4W5TA 4M7YA 1K6YA 2YIOA 4FCYA 1YJ9N 1NOYA 5FROA 1XUPO 2BH1A 4IFVA 1JLBA 1D9FA 3CC7N 4KI6A 2K35A 1FK9A 2WFBA 1K9MO 1QQOA 1RTDA 3K5NA 2D0PA 3U4LA 3LDPA 1D4XA 1RT2A 3QIPA 5C12A 1T6CA 3RTVA 4M3UA 1BQNA 3VF4A 5FPDA 2OA8A 3AVAA 3IS9A 3WUHA 2QEXN 5DM6L 3AVNA 3KJVA 2E8AA 5I9EB 1C55A 4R79A 4ELUA 4OLAA 4BREA 5LJWA 3KZBA 3DXKA 5JLHA 1JLCA 3NBPA 3VQBA 1HUXA 1L3SA 4LSLA 1BI4B 4B8CA 3TARA 1C1BA 4DV1K 3EKSA 1CZAN 3LDOA 1Q82O 2XRIA 3SCXA 4JYAK 5HP1A 3QEXA 1EQYA 1MU2A 4LF6K 1UWBA 2KW4A 3FLCO 3O9TA 3S41A 4BRMA 4RG8A 1LAWA 1LW0A 2NZTA 5TKYA 4B3OA 3KLHA 3B6OA 1BA1A 4BRIA 1JJ2M 1IKXA 4IJNA 1WWNA 5B8HA 2DTUA 3HPHA 3SBGA 4EIAA 1YTUA 1WT7A 3AO2A 3R8EA 5CYMA 1EO1A 2E2QA 4BRQA 3SNNA 3T69A 4K0KK 2EX3A 4W5QA 1JLGA 4KV8A 4B1YB 3LZIA 3CJBA 2Y1IA 2IOCA 4KREA 3LP2A 1T0ZA 5HRRA 3CCMN 2P5GA 2OPSA 3THWA 1IG8A 2A1SA 5M1OA 1N4NA 3CQ8A 1FW6A 4FWOA 3L2UA 1C6VA 4E7JA 1X3MA 2PZSA 1IV0A 2LR3A 4FPBA 4FJ7A 2P9SA 1S9GA 3HSTB 2GTDA 2HHTA 4KHQA 3S5TA 5KQDA 1Q7YO 1S5JA 1CZBA 2RN2A 2D0BA 4BRHA 3CERA 3E1YA 4O8KA 3C65A 2HHVA 4AF1A 2O8DB 1S1XA 1RT5A 1IH7A 1LWFA 4O44A 2YNHA 4AAZA 4IFEA 1NMDA 3J7YP 3K57A 1XMQK 3DAWA 3VGMA 4Z4CA 2UXCK 3QO9A 4CJPA 3TU5A 2Q2RA 3HYFA 2VWJA 2NUBA 2KJAA 3AV9A 2VWKA 2KHOA 3DYAA 4V19S 4E7IA 2HHXA 4CZMA 3L3UA 5M1KA 1VQLN 5AQHA 1KCFA 4BR2A 3L2WA 4CZIA 3G71N 1TV6A 3NH1A 4ELVA 3NVKA 3KWGA 3DMJA 3D45A 3RR7A 3O9QA 2HBMA 3KWIA 5KPRA 4BVOA 3PO4A 2ZQBA 3OYKA 1HKCA 2O8FA 1HRHA 3OS0A 3HVTA 1Z26A 3VEZA 4C8KA 3M1FA 3F73A 4LH5A 1IBMK 4KB0A 4G1QA 5AQFA 1KAYA 5C2DA 4BDZA 1XMOK 3BY5A 4CBXA 4CI6A 4KHYA 4NCBA 3HM8A 3EEQA 4A61A 4UJ0A 3WNGA 2P9LA 2VWBA 4F3OA 1NK9A 1IJJA 3EN9A 1JL2A 1J6ZA 1T8EA 1X3NA 3DRSA 4CEZA 1POIA 4Z4IA 3KP1A 3MX5A 3ZT4A 4FK0A 4I6MB 3QBWA 4O0JA 3VQQA 1RTHA 1T7PA 3VERA 3WQUA 5JVHL 3VQEA 1K8AO 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4K8X A;  3QI7 A;  1U2V A;  3EZ5 A;  2HF3 A;  3QER A;  3CME N;  1NGG A;  4BE1 A;  5SZT A;  3V9Z A;  4E72 A;  2NRX A;  1TAQ A;  4O0I A;  4DSE A;  3U8X A;  1N5Y A;  4F9O A;  3AAP A;  1WSI A;  5C25 A;  3NF6 A;  2IS3 A;  1NK8 A;  4RWT A;  3C7N A;  5GAG P;  5AQS A;  4FZX C;  4YDU A;  3OYD A;  3BUZ B;  1S1V A;  3W0L A;  1QQN A;  5BRF A;  1RDW X;  2OPR A;  4DQP A;  4LY7 A;  4CER A;  5CY0 A;  3SAF A;  3QIC A;  3TAM A;  5KQ8 A;  1NE5 A;  1UOC A;  3F9M A;  1TL3 A;  3UKR A;  1QS4 A;  1ZBL A;  4YOY A;  1SAZ A;  4GVE A;  3V9W A;  4WFB L;  1I2V A;  4HCB A;  3FZL A;  3ITH A;  4CJR A;  1RT4 A;  5T7B A;  4CJS A;  4JKG A;  4H0P A;  4B9V A;  2YV0 X;  3RSE B;  2BTF A;  3WEE B;  1JKH A;  3K5O A;  5AZJ A;  2NY9 X;  3GKU A;  3THY A;  1NM1 A;  1K8K B;  4AHR A;  3TTF A;  3VEV A;  4LFA K;  4FSV A;  2OYQ A;  3MCP A;  3KKS A;  4ISF A;  4ICL A;  3LL3 A;  2HNZ A;  2FF3 B;  1QTM A;  3K9K A;  4DSJ A;  4CCH A;  3L4I A;  4YOR A;  3L2R A;  3LZJ A;  1XNR K;  4DF8 A;  4QS7 A;  1HMV A;  5E26 A;  3SMP A;  5GAH P;  1HJO A;  1DKG D; 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