3EL2A

Crystal structure of monomeric actin bound to ca-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 118
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3el2A03
2A41A 1BU6O 2PAVA 2A42A 3ENHA 1HKBA 1K8KA 1SAZA 2D0PA 2E1ZA 2ASOA 2YCHA 3VESA 3WXKA 5B8HA 3CJAA 2I7NA 3L6QA 5AQFA 4CZGA 4MO5A 3O6WA 4BREA 5FPNA 4CBXA 5BN9A 1ZC6A 3UKUA 1LOTB 4PL7A 4BRKA 1GLCG 2P9KB 4H0TB 3LM2A 4YDUA 5AQIA 1R59O 3G25A 3DWLA 3LM9A 4XH1A 2QW9A 2A40A 5CE3A 5ELZA 2A3ZA 2VYPA 1QQMA 1V4TA 3A8YA 3U4LA 4K41A 1H1VA 3M6GA 2P9NA 3QFUA 3U9DA 3GE1A 3UB5A 4I6MB 4H5TA 4CD3A 5KPZA 3ENOA 3LDOA 5AQTA 1TYQA 3LL3A 2FF6A 3VETA 4FOEA 3A5MC 2F9WA 4FO0A 2ZF5O 3BEXA 3JXUA 4KBOA 5AZJA 3AY9A 1BO5O 3QICA 3CJ7A 4FL9A 4JN4A 2YHWA 3VF4A 5AQJA 3KHYA 4BRHA 5AQHA 3LDLA 2E88A 1NGDA 3A5OC 1J6ZA 1X3MA 1GLBG 1WUAA 4FWKA 4CZFA 1GLDG 3L4IA 3CI5A 4H0VB 3GOIA 4FWQA 5BREA 1BG3A 4ISGA 4BQZA 3IUCA 4QS8A 3JS6A 3BP8A 4FWRA 4IJNA 4BRNA 1XC3A 4ISEA 1BA0A 4H0PA 5AQMA 3DJCA 3UKUB 2BUPA 2KHOA 3ATUA 4H5NA 3FZHA 3VPZA 4PL8A 3ZX3A 5AQSA 3H3NO 3EO3A 3AAQA 3VENA 4BRLA 2P9KA 3VGMA 1GLJO 5BPLA 3IMXA 4JHDA 1HUXA 4LC9B 5JLHA 3P4IA 2A6AA 5KQDA 3L0QA 3WQUA 3CQXA 5AQZA 2P9NB 5E26A 4BQLA 1Z6RA 2I7PA 3FZMA 3QDKA 1TUUA 3O5BA 4L3QA 4PKIA 1ATRA 2Q0UA 2HOEA 5F1XA 3TU5A 1Z05A 3R8EA 3CERA 3SMSA 3KZBA 1YUWA 4F9OA 1NBWA 3EN9A 2P9IB 1MWKA 3B8AX 4CZEA 2NRHA 4IXCA 5AZJB 2IVOA 3WT0A 3MMVA 1QZ5A 2IIRA 1C0GA 3LDPA 2ITMA 4EIAA 1DGKN 3WXJA 4AM6A 5BRDA 5TKYA 4IWVA 1HX1A 4E1JA 5AR0A 1ESVA 2QXLA 2HMPA 4MLEA 3W0LA 2UYTA 3HSCA 4WQ5C 1JCGA 3R9PA 1U2VA 5BPNA 4BC3A 1MA9B 3FE1A 5EXWA 5EX5A 3VF2A 3FZFA 2CH6A 1JCEA 3BF3A 4B1ZA 4B1WB 2VWBA 4O5FA 3WQTA 2PBDA 1QQNA 5AQVA 2QWRA 1SQKA 4B1YB 4CZKA 2Q97A 1SZ2A 4CZJA 4FPBA 2CGKA 5AQGA 4M63C 4A2AA 3S41A 2NZTA 2QWNA 5AFUH 3VOVA 5AQXA 1GLFO 1ZXOA 4M7YA 4JHDB 4XEIA 4WQ5A 3A5NC 4BR5A 3HM8A 1KXPA 4B1UB 1CZAN 3GG4A 3VEYA 4BR2A 3C0BA 2E8AA 3U8XA 4BRGA 4EFHA 1P8ZA 3MN6A 4Z94A 2P9SA 1WOQA 3AAPA 3MCPA 2P9UA 2H3GX 3BF1A 3IDHA 5ADXH 3R6MA 4FOIA 3GBTA 4BR4A 2P9IA 3O1BA 3MK6A 1BUPA 2GTDA 2GEMA 3RSEA 2V51B 4CBUA 1DEJA 1T44A 2GELA 1HPMA 3FLCO 2IVPA 3VEWA 2QM1A 4DQ8A 3CJ1A 1NGEA 1NGJA 5AQPA 5AZIA 1U2VB 3GDQA 1BOTO 2Q1NA 1IG8A 1NGGA 1Q18A 4NO7A 2E2PA 5AQWA 2DPNA 2Q2RA 3ULEA 3GL1A 4DHYA 2YJFA 5BPMA 1QQOA 4JD2B 4CD1A 3FR0A 1NMDA 4K43A 2P9LA 1KAZA 4H0XB 1YAGA 3U9ZA 2CGLA 4CJ7A 3MN7A 4FWMA 2EWSA 1X3NA 5BRFA 4A2BA 3D2FB 3DXKA 4H5VA 2VCPA 2V52B 1T6DA 2P9PA 3C7NB 1OKJA 2FLOA 3ZX0A 3CJ9A 4O8KA 5AQKA 4FWLA 3VEZA 4B1XB 3ID8A 3O80A 4H03B 4CZIA 2YHXA 4Y0WA 3UKRA 5FPDA 4H0YB 3HZ6A 1NGIA 3VEOA 3O8MA 2P9SB 2AA4A 3D2EB 1XUPO 2P9UB 3DXMA 2FSKA 4FWPA 4BR7A 2GWKA 1E4FT 2D1KA 2E2NA 2QWOA 1KAYA 5JMVA 4BRMA 3VF6A 5KPRA 1QHAA 5AFUA 3RSEB 1YVNA 2E1YA 4CZMA 5KQ8A 5AZIB 1E4GT 3ULEB 4K25A 4GY2B 2WUSA 5AQLA 2P9LB 3VGKA 4WYBA 1S22A 4BR9A 4JD2A 5BN8A 3CIPA 1HLUA 3H46O 3QB0A 3QMLA 3CETA 4XH5A 3DXKB 2E2QA 4H5RA 2AP1A 5LJVA 5AQUA 2ASMA 2YJEA 3D2FA 4B9QA 2P9PB 3SMPA 5LJWA 4FWNA 4EHTA 3FZKA 5BR9A 3C7NA 1BA1A 2NLXA 4BRFA 3LDNA 4J8FA 2CGJA 3VEXA 5FPMA 1QZ6A 3UKRB 3I33A 4BRCA 2ZWHA 1LCUA 1ZBSA 3ZX2A 3QBXA 2ASPA 4A62A 1EQYA 4PKGA 1NGAA 4IJAA 2GUPA 1GLLO 3J8AA 4BC5A 3H6EA 4BGBA 3ZEUB 2BTFA 4H0OA 3ZETB 3DXMB 3EL2A 3H45C 3D2EA 3WEEB 3HI0A 4BRIA 3M1FA 4DB3A 3HBTA 1JCFA 1NGFA 3CJBA 2HF3A 2QWPA 4RTFD 2ZGYA 4CZHA 2HF4A 5AQYA 4FWOA 2FF3B 3HTVA 3QFPA 4MLHA 2FSNA 3EKUA 5FPEA 4BRAA 4BROA 3FGUA 3H1QA 4BC4A 3VERA 4EAHD 4QS7A 3OHRA 3UE5A 2Q36A 1NWKA 3CQYA 2ZGZA 3O4WA 1MWMA 5KPTA 2E2OA 3M3ZA 3MDQA 3EZWA 2E20A 4HTLA 2D4WA 2V7YA 1V4SA 4WQ4C 5E84A 4DCHA 5JICA 1HKGA 3F9MA 5EVZA 5AQQA 2QWMA 3A5LC 1U6ZA 1NGHA 3I8BA 4CBWA 5AQRA 4BR0A 5AQNA 5JLFA 1HJOA 4BVOA 2GWJA 1Y64A 3MN5A 4JAXA 4RWTA 4FSVA 2A5XA 1K8KB 4PKHA 1RDWX 4M7XA 3WXIA 3VEVA 2YHYA 3IFRA 1ATSA 2Q31A 4RCHA 3BUZB 5I9EB 3ZEUA 3WXLA 3ZETA 4BVPA 3VGLA 4ISFA 2J4RA 2W40A 3KVGA 2Q0RA 3TPQA 1BDGA 4WQ4A 2QWQA 3EKSA 3O08A 4H5WA 3SLCA 3WEEA 4A61A 3D7EO 5F0XA 3FZLA 1TUYA 2QWLA 1ATNA 1NLVA 1X9JA 2FSJA 4EHUA 4BG9A 2OANA 2V7ZA 4CZLA 4FPAA 1T6CA 1S3XA 3CHWA 1IJJA 2D0OA 3DAWA 3H1VX 1RFQA 4GNIA 3SK3A 2CH5A 1GLEG 1MDUB 1XQSC 4JNEA 4BRDA 3W3DA 3WUHA 1TYQB 4AM7A 4NB4A 3QBWA 4I6MA 5AQOA 4BRPA 3A0IX 4HWIA 5EOYA 4BGAA 4IO8A 2FXUA 3LDQA 4BG8A 5ADXA 3AARA 4MO4A 5LY3A 1NM1A 2F9TA 1YXQA 1GLAG 3CJCA 3H3OB 4BC2A 5EY4A 4CI6A 3ATVA 4XH4A 5F2RA 3O1WA 2IVNA 1C0FA 1NGBA 4YDUC 3SJHA 5BRHA 1DKGD 3MN9A 2YI1A 4C23A 1G99A 3FFKB 1KAXA 1RGIA 4IZ9A 4K42A 1BWFO 1HKCA 4B1VA 4BRQA 1D4XA 1NGCA 4FWSA 2W41A 4QS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BU6O 3C6AA 2E1ZA 1J5OA 3VESA 5B8HA 5KGXA 1WSFA 4Z4FA 2KLAA 4CEEA 1NK9A 1YF5L 1UOCA 5FPNA 3UKUA 4KKOA 4C8LA 1VQ7N 4H0TB 5A2QO 5HRRA 3NMUA 1RBUA 3V9WA 2QW9A 4GKKK 5ELZA 4KB1A 4K41A 3TANA 1LWFA 1TV6A 3CF5L 5EU7A 3ZT4A 1P90A 4QAGA 1WSGA 3ZSVA 3BEXA 2QK9A 3QNOA 2PYLA 3SBTA 4QCLA 4Z4EA 1YIJN 4FL9A 4BY9C 4JN4A 1Q9XA 3G10A 3WXMB 2YHWA 5AQJA 2F8SA 3LDLA 1ASUA 1GLBG 1WUAA 4RW9A 1LAWA 3HOTA 3HPOA 4FWQA 4IO9L 4BQZA 3OYFA 4FJ7A 4FWRA 3BP8A 4BRNA 1XC3A 1BA0A 3LPTA 3THWB 4F2SA 4I7FA 3ZSYA 3PLAA 4AHUA 3KD1E 1X1PA 4C8OA 5AQMA 1C1BA 3DJCA 4NYFA 5H1SQ 3L2RA 2ATQA 3FZHA 2RPIA 4CJEA 3ZX3A 5AQSA 3AAQA 4YOUA 1KD1O 2QTDA 4YOYA 5BPLA 3LWMA 3IMXA 5JLHA 2KZZA 3P4IA 4B9LA 4LF6K 1C6VA 2P9NB 3DLLL 1Z6RA 3FZMA 3QDKA 1TUUA 3O5BA 2HBLA 3HP6A 4AQYK 5F1XA 3TR8A 1JLGA 1S9EA 1Z05A 2UU9K 4EP5A 1YTUA 2FBYA 3KZBA 3DRRA 1NBWA 1NOYA 4JKHA 3WNGA 1QVFM 4X64K 5AZJB 3MMVA 3WNEA 4E1MA 1C0GA 3OTOK 4DG1A 1EWQA 5CR4A 4LF5K 2WFBA 3W0LA 3E1YA 3KLHA 1CXUA 4X65K 3I8DA 3LALA 3CCMN 1TK0A 3FE1A 5EXWA 1C1AA 3CYMA 3QERA 1JCEA 1BI4B 4AHVA 3OYKA 1YT3A 3I55N 2IAJA 4B1YB 4FJ8A 4W5NA 3CFRA 4DU4A 2P5GA 3L2VA 4Z4HA 4DV6K 3SV4A 3TAEA 2FC0A 4OPAA 2NZTA 2QWNA 4GV6A 5AFUH 3VOVA 5AQXA 4M7YA 1ZXOA 4XEIA 3ZSWA 1SKSA 3F9KA 3QESA 3A5NC 3TAGA 1RDAA 4W5RA 1KXPA 5DM6L 5LMUK 2OA8A 3BGRA 3VEYA 4DV1K 3C0BA 4EFHA 3VQ9A 3AVLA 3KLEA 1GOAA 4FZXC 4CEDA 2P9SA 1WOQA 4KH6A 3P1GA 2W00A 3MCPA 1KRPA 3BF1A 4UY8O 1QHTA 3IDHA 2HHSA 1EKEA 5CZ2A 3R6MA 4FOIA 4CHPA 3HL8A 2GTDA 2HHHK 3JAMO 5IT9O 1FKOA 2GEMA 2V51B 1IO2A 3FLCO 4A57A 4DQ8A 3MCAB 1U2VB 5AZIA 1RTDA 4LF8K 1TKXA 1IG8A 4CF1A 4DU1A 1Q18A 4B3RK 3PSIA 3ULEA 5BPMA 3O9TA 2YJFA 3VTIA 3OBWA 4CK1A 4JRPA 4JD2B 1UWBA 3P31A 3K5NA 1HPZA 2B6AA 1BI4A 2CGLA 4CJ7A 3MN7A 3TTCA 3O3GA 5C12A 3THYA 1NK4A 3DXKA 1Q81O 3RMAA 4H5VA 4K0KK 5C42A 4HCCA 5KI6A 2O8EA 2ZJQL 3L2WA 3V9XA 3THXB 3ID8A 4O0JA 5FLXO 1RBSA 2YHXA 4GMJB 4CHNA 4H0YB 3P39A 1ITGA 4B9NA 3HZ6A 1WAFA 3LP0A 1NGIA 4FW2A 3KLGA 3SUNA 1SUQA 2VQFK 3D2EB 4A5BA 1ZYQA 2P9UB 4DF4A 2EHGA 4FWPA 3D0PA 2XHBA 1I39A 4J2AA 4DFJA 3EEQA 5JMVA 3NFAA 2HVIA 3AVNA 4MDBA 5KPRA 1YVNA 2E1YA 2O4IA 4DU3A 5HP1A 1ZBLA 2OTLN 1B9FA 5KQ8A 1W0HA 3R3LA 1E4GT 2ITGA 4U7BA 4KTWA 1KC8O 4JK8A 2QEXN 2P9LB 1VQNN 4JD2A 4DUZK 3AVHA 3B6OA 5BN8A 3J7ZO 3QB0A 4DTPA 4XH5A 5FRMA 2E2QA 1RT2A 4H5RA 3CCUN 3V1RA 2AP1A 1S1VA 2P9PB 1IKYA 4EHTA 4KH5A 5CYMA 1BA1A 1NK6A 1J54A 3DLBA 5FPMA 4CERA 2KZMA 1QZ6A 3M8PA 3I33A 3KTQA 3THXA 4CGGA 3QBXA 4IOCL 1EQYA 1BL3A 3K0SA 2GUPA 4MQ3A 3VQ8A 4BC5A 1IV0A 3ZETB 2NRVA 4CHOA 1VAZA 1K6YA 3HOSA 3D2EA 2A1SA 4B3MK 4DB3A 1JCFA 3ZYYX 1K8AO 2O8BB 3CC2N 2HVHA 4YORA 3O4NA 1KFSA 4CJLA 1LW0A 2LSNA 3HRGA 2P5OA 3KD5E 4MLHA 3HP9A 1TK5A 3OYAA 1HYVA 2JWLA 3AO1A 4BROA 3FGUA 4LFAK 4Z0UA 3UE5A 2Q36A 3IKMA 4DR5K 3C6HA 4EZ9A 2P1JA 2ZGZA 2NNWA 3VTHA 4CESA 2QKBA 1D5AA 3ZSZA 5E84A 2V7YA 4WQ4C 5LL6Z 3J80O 5C25A 4DTSA 2F7TA 1X9WA 2VGMA 5DMRA 1NJWA 1KVAA 1J53A 1E3MA 4JKGA 2GWJA 4A59A 4E7JA 4DTUA 3CMEN 1HRHA 4FSVA 2A5XA 3S3MA 2E4LA 3MWPA 1ATSA 1NOZA 4RCHA 2RKIA 4NLCA 3ZETA 3VGLA 4ISFA 4FM2A 2W40A 1QSLA 5DK5A 4DV7K 2XY8A 1W7AA 4KTZA 2Q0RA 3CXCM 2QWQA 4HHTA 3DLEA 4A61A 3D7EO 3V4IA 3FZLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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