4QS9A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) mutant s177a structure in glucose-bound form
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
461
structure length
450
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFAFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSGIGAALLAASHSLYLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 155
structure length 450
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs9A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs9A01
2YHXA 2IIRA 3D2EA 5E26A 1JCEA 1U2VA 2GWJA 1DKGD 2KHOA 2P9UA 3O1WA 5BRDA 4IWVA 4BRPA 1SQKA 3M3ZA 3FZKA 3O5BA 4BRNA 3U9ZA 2Q1NA 4ISEA 4BREA 4PL8A 3DXKB 3O1BA 2P9SA 3A5LC 3CJBA 4WQ4C 1K8KB 5EOYA 3VEXA 2CH6A 3O08A 4BR7A 1DEJA 3BUZB 1Z6RA 1MA9B 2ZGZA 3R6MA 4FOEA 3IDHA 5E84A 1C0GA 5AQMA 4QS9A 2ZGYA 5AQHA 3A5MC 3CJAA 3HZ6A 3O8MA 1NMDA 3EL2A 2GELA 4JD2A 2Q97A 5AQIA 1NGGA 3SK3A 4FOIA 4CZEA 2E1YA 1TYQA 3FZMA 2VCPA 2V7ZA 3MK6A 4CZHA 3RSEA 3TPQA 1T6CA 4B1WB 3LDPA 3BF1A 4CD3A 4IJAA 3ID8A 3LM9A 2D0PA 2YI1A 1LCUA 3VEZA 4BRKA 3VETA 4B1ZA 2ASMA 3ULEB 2DPNA 3EKUA 2I7PA 4A2AA 3GBTA 3KHYA 3WXIA 3S41A 4QS8A 3GOIA 1BA0A 3WQTA 5FPNA 4CZJA 4GNIA 3H1QA 4BG9A 4BR5A 4C23A 1QHAA 4MLHA 2P9NA 2OANA 4BG8A 5I9EB 3UKRB 3QBXA 1QZ5A 4FPBA 3CJ1A 5BRHA 4BQZA 4ISGA 4XH5A 2P9LA 4K25A 1XUPO 3MN9A 2BTFA 1H1VA 3F9MA 4WQ4A 2Q31A 3FR0A 3VEYA 3UB5A 5BRFA 1QQMA 3D2FA 3MN7A 2VWBA 2ZF5O 1JCFA 3GL1A 5EXWA 1NM1A 3MN5A 4H0PA 4BRQA 3FZHA 4BC5A 1NGHA 4EIAA 2QM1A 4KBOA 1S22A 2A5XA 3ATVA 4GY2B 2CGLA 1QQOA 4CZKA 2P9PB 4CZGA 3WXKA 4WYBA 4YDUC 4O8KA 4I6MA 4FPAA 1ESVA 4JAXA 5KPRA 2D0OA 1SZ2A 2ZWHA 4DHYA 5KQ8A 3MDQA 4FWQA 3R9PA 1BDGA 3LDOA 1HKBA 3A5OC 2NZTA 1HUXA 2YHYA 3H1VX 2HF4A 3R8EA 3BP8A 1ATNA 3VF4A 1ZBSA 1KAYA 2FSKA 2QWQA 1NWKA 5AZJB 1BOTO 3A0IX 3MMVA 2HF3A 4WQ5C 3ZX0A 4CBUA 3M6GA 2W41A 3QBWA 4JHDA 3H6EA 4EFHA 2UYTA 3ZEUB 1NGEA 3U9DA 2W40A 3UKUB 5BPNA 2YJEA 1GLBG 3SLCA 3HM8A 3WT0A 3ZETA 4K43A 3L4IA 4A62A 1R59O 2FLOA 3QICA 2IVOA 5LJWA 2VYPA 1WUAA 4EHTA 5AQLA 4BC4A 4BRHA 5FPEA 4H0XB 4BRFA 2YJFA 1Z05A 3EO3A 1HPMA 4MLEA 2P9KB 3IUCA 2PBDA 5AZIA 4BGAA 1BA1A 5AQZA 2E1ZA 3WEEB 3SJHA 2PAVA 5TKYA 3SMSA 2F9TA 4BRMA 4NO7A 1YAGA 4B1YB 3UE5A 1Y64A 3B8AX 3QMLA 4MO4A 3GE1A 4YDUA 1WOQA 3HTVA 5ELZA 3HI0A 1NLVA 3ZX3A 3EKSA 5AQRA 4BRDA 3VF6A 5JLHA 1E4FT 2E20A 3O4WA 3VF2A 5ADXA 1ATSA 3FLCO 2HMPA 1MWMA 3W3DA 1YXQA 1TUYA 3AAQA 4XH4A 1RGIA 2YHWA 4RWTA 2Q0UA 2GEMA 1RDWX 5F0XA 3DXMA 2E2QA 5AR0A 4H5NA 3U8XA 1KAXA 1IJJA 2V7YA 4FWPA 2IVPA 2Q0RA 3D2EB 4WQ5A 4ISFA 4BC3A 5JICA 1U2VB 2H3GX 4BVOA 5AFUA 4RTFD 4CBWA 2ASPA 2P9UB 3WQUA 3C7NA 3LDQA 4CZLA 1HLUA 1T44A 1KAZA 3J8AA 1LOTB 4B9QA 5BN8A 1Q18A 1NGCA 5AQJA 4E1JA 3H3NO 5AQPA 2P9SB 3LL3A 4BROA 5BPMA 2A42A 4H0TB 5BR9A 2EWSA 1NGBA 3IMXA 4FSVA 4FWLA 2A3ZA 3EZWA 1YUWA 3QFPA 2WUSA 4HTLA 3TU5A 1K8KA 2V51B 5F1XA 3CERA 3VENA 3GDQA 1GLLO 5AQVA 4Z94A 1G99A 2CGJA 4CJ7A 4JD2B 1J6ZA 4M63C 1TYQB 5AQYA 2NLXA 1XC3A 3CJCA 4K42A 3RSEB 3VEVA 5FPMA 4IJNA 4A2BA 3VERA 2E8AA 3WXLA 4BRCA 2FSJA 3FFKB 1HX1A 3W0LA 3G25A 3QFUA 4CI6A 4M7XA 3WXJA 3A5NC 4CZIA 3HSCA 2E2OA 3O6WA 4BRAA 1HJOA 4IO8A 4LC9B 1D4XA 1E4GT 4DQ8A 3D7EO 3ATUA 3CI5A 5EVZA 2A41A 3ULEA 4BQLA 5AQFA 2AP1A 4NB4A 4M7YA 1TUUA 2P9NB 4IXCA 2BUPA 4BGBA 2GUPA 3H46O 4B1XB 2CGKA 1BUPA 5KPTA 5JLFA 2A6AA 3AAPA 1BO5O 3FGUA 2QWNA 2V52B 3I33A 1SAZA 2GWKA 2FXUA 2P9LB 4FL9A 4BVPA 3HBTA 4AM6A 3ZX2A 3UKRA 1NGJA 1ZXOA 4H0YB 1BWFO 2E88A 2F9WA 2FF6A 4XEIA 2AA4A 2QWRA 2P9IA 3D2FB 3MN6A 3CIPA 5BREA 3VEOA 4CBXA 4H0OA 4AM7A 4BRGA 5LY3A 3M1FA 1X3MA 3A8YA 3ENOA 2Q2RA 1EQYA 3L6QA 5AQUA 3CJ9A 1OKJA 4BRIA 3DAWA 1V4SA 4CZMA 2GTDA 3FE1A 4I6MB 5AQNA 2E2NA 2QWPA 4CD1A 1YVNA 4B1UB 4L3QA 4JN4A 4J8FA 5AQTA 3VOVA 2P9PA 4FWKA 1GLAG 2D4WA 2NRHA 1NGFA 1P8ZA 3CQYA 3BEXA 2ASOA 1S3XA 1BG3A 4JNEA 4H5VA 2QWOA 3CETA 1IG8A 4MO5A 3VGLA 1CZAN 2HOEA 4QS7A 5AQGA 5BPLA 5B8HA 3U4LA 2QWLA 1GLFO 4RCHA 3VEWA 4BR4A 1NGIA 2IVNA 3VGKA 2E2PA 4O5FA 2I7NA 3AARA 5ADXH 3L0QA 4BR9A 2FF3B 3EN9A 4JHDB 2YCHA 1GLCG 3H45C 4EHUA 5F2RA 4Y0WA 4IZ9A 4H5RA 4PKGA 4PKIA 5KQDA 3ZETB 5AZJA 3FZLA 4H5TA 3CHWA 4DB3A 3ZEUA 5AQWA 1GLJO 3UKUA 4A61A 1X3NA 1MDUB 3WUHA 5AQSA 3H3OB 1NGDA 3SMPA 1GLEG 1DGKN 3QB0A 3QDKA 5KPZA 1MWKA 5AFUH 4B1VA 2FSNA 3DXKA 2D1KA 1GLDG 1HKCA 1JCGA 4FWMA 3VESA 1XQSC 5AZIB 4BR0A 3JS6A 4F9OA 2QXLA 3P4IA 5BN9A 2P9IB 3I8BA 3CJ7A 2Q36A 3C0BA 3LM2A 5JMVA 1QQNA 1V4TA 1NGAA 2P9KA 3DJCA 1RFQA 5AQOA 1X9JA 4H5WA 1HKGA 5EX5A 1QZ6A 3CQXA 3WEEA 4FWRA 4CZFA 4PL7A 2QWMA 4HWIA 3GG4A 4K41A 5AQKA 4EAHD 1KXPA 3FZFA 3VGMA 2QW9A 3AY9A 3OHRA 1U6ZA 2A40A 4DCHA 4FWNA 5LJVA 4BC2A 5AQQA 3MCPA 4H03B 1NBWA 4FWSA 2ITMA 3KVGA 5AQXA 3DWLA 1ATRA 3KZBA 3LDNA 4BR2A 1C0FA 5FPDA 1ZC6A 2J4RA 4FO0A 3DXMB 3ENHA 4XH1A 3IFRA 3O80A 4BRLA 4PKHA 4H0VB 3JXUA 3VPZA 5EY4A 2CH5A 3LDLA 1T6DA 1BU6O 3BF3A 4FWOA 5CE3A 3C7NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CIFA 5J2MA 4FYDA 2QA4N 1JCEA 3P39A 2KTQA 2PYLA 3KK2A 4JI1K 5HLFA 2KHOA 4JKCA 2D0BA 1VHXA 4CESA 2QI2A 4BRPA 1SQKA 2VGMA 3O5BA 3U9ZA 2Q1NA 4ISEA 1VQ5N 3DXKB 1VQNN 3O1BA 1P90A 4BE2A 4DSKA 3NF7A 3CJBA 4WQ4C 1HNVA 1K8KB 4FZYA 3S3OA 4I9QA 5EOYA 3C94A 3VEXA 3QERA 4CFBA 1NKEA 4JKGA 4BR7A 4FLWA 1DEJA 2YNGA 4KHUA 2VQEK 4CJKA 2P5OA 5E84A 5I42A 1C0TA 3PSFA 3IRXA 4NLBA 4E7LA 4CFAA 4AQYK 1NMDA 2DFHA 5HRPA 2Q97A 3M8QA 1NGGA 3SK3A 4CF1A 4RW4A 1TYQA 3PO4A 5DM7L 4GVEA 2VCPA 4CVNE 4WF9L 3TPQA 4EP5A 1T6CA 3WXMB 3HP6A 3BF1A 4EZ6A 4CD3A 2NRVA 3ID8A 3IAYA 4OO1J 2PFUA 2D0PA 4Z4HA 3QEIA 1NJYA 1LCUA 4N41A 3DMJA 3CMAN 1NKBA 4RW6A 3VETA 4QOZB 4CGDA 1TAQA 4CJPA 2DPNA 3S41A 4H4OA 4JKAA 1JL2A 1BA0A 4ELTA 2DFEA 3KLGA 2B6AA 1D9FA 3THVA 1J53A 1TV6A 3I0RA 3UKRB 5BR8K 3KK3A 3L2QA 4CJFA 2VG6A 3JAMO 2ZJQL 3EE9A 4GMJB 4ISGA 2G8VA 3SPZA 2ZJRL 2O8FA 4C1NK 3HJFA 4GV6A 4WFAL 1NJZA 3UB5A 2JGUA 3PSIA 1C0UA 3RRHA 4OX9K 3D2FA 4C8LA 3CCSN 2VWBA 3PY8A 3MN5A 4KB1A 3ATVA 3TI0A 1IBLK 3OYCA 2CGLA 3OS2A 4JKEA 2RN2A 1BGXT 3L2WA 3QNNA 2HMIA 4H8KA 5KPRA 4J2BA 4ILHA 3L3VA 1SZ2A 2X74A 2ZWHA 1HJRA 5KQ8A 3HVTA 4I9LA 3UIQA 3OYDA 1C1BA 1HYZA 4WFBL 4E7IA 4FWQA 1BDGA 3LDOA 3ZSQA 3LP1A 3A5OC 3MWTA 2YHYA 3R8EA 4IOXA 4JK8A 5AZJB 1KAYA 2FSKA 1NWKA 4OKKA 3ZX0A 3M6GA 2Y1JA 2W41A 1BQMA 4JHDA 4KI6A 2UYTA 5HP1A 1Q9XA 1XHZA 4J2AA 5JS2A 4E89A 3U9DA 3UKUB 1C0MA 4JKBA 5HRRA 4ICLA 3ISNC 1SS6A 3QICA 5LJWA 1SL2A 1XNQK 2VYPA 5AQLA 2VGNA 3HK2A 5CY4A 4BRHA 4MDAA 4H0XB 2KKZA 1Z05A 5CR4A 4K8XA 3V1RA 4W5QA 3C6UA 1BA1A 5AQZA 4X66K 3VA0A 3SJHA 3F73A 3THWB 1YJWN 4NO7A 3V9SA 4DV0K 4CJVA 3JSMA 3NVKA 3UE5A 4DFMA 4RG8A 4Z4FA 3MEEA 3CM6A 3GE1A 2O4GA 4YDUA 4KPYA 3RMBA 3HTVA 1NLVA 1YJ9N 5AQRA 3SCXA 1E4FT 3TTFA 4O0JA 4N56A 2HMPA 3DOLA 1MWMA 4JI2K 3W3DA 1YXQA 4CGJA 4M3WA 3AAQA 3KWGA 4RWTA 5IWAK 1TKDA 1UWBA 2Q0UA 1NMNA 4JS4A 4AILC 3O9RA 4X65K 4DV1K 2IDOA 3OYAA 5F0XA 1WSEA 2KFNA 4R5PA 1VSIA 3U8XA 1KAXA 2IVPA 3D2EB 1HNIA 4A5AA 5M1OA 5AFUA 3SZ2A 3BZKA 2ASPA 5HL7L 4CZLA 4BY9C 5LL6Z 4DTNA 3NAEA 1T44A 4B9QA 1Q18A 4F3TA 1NGCA 5AQJA 3TTDA 2UUCK 1A5XA 4JI3K 2P5GA 3OYEA 3SAGA 1N5YA 4H0TB 4Q0BA 3IMXA 2RKIA 3D6RA 3V9UA 1HQEA 4HTLA 4DU1A 4CJLA 3VENA 1S72N 4C8NA 1GLLO 4Z94A 2JLEA 4C8OA 4JD2B 4M63C 2DY4A 5AQYA 4CK3A 2OCEA 4DFPA 3CJCA 3RSEB 3VEVA 3I56N 1NJWA 3LP2A 5IT9O 3C6TA 4FCYA 2HHSA 2E8AA 3WXLA 4BRCA 4M45A 2FSJA 3FFKB 3W0LA 3G25A 4GV3A 1K9MO 4C8MA 1KTQA 3O6WA 2KZMA 3IG1A 4FK0A 1E4GT 2E4LA 4FJ7A 4DQ8A 3D7EO 3SV4A 3ALYA 3ATUA 5EVZA 4KHQA 4OPHA 3ULEA 4RW8A 2G8FA 2AP1A 4M7YA 4QAGA 1DTTA 4BGBA 2GUPA 4F4KA 5KPTA 4B08A 4M3YA 2HHUA 4G1QA 3CC4N 3FGUA 3H08A 4BVPA 4AM6A 4N5SA 3T3FA 5GADP 4H0YB 1HNXK 1UAXA 2HHHK 4XEIA 3NF8A 3MN6A 1WSHA 3NCIA 1RDCA 3CIPA 2YHBA 2XY7A 5BREA 1B9FA 2YKMA 4DU4A 3SUQA 3F2KA 5LY3A 1YVUA 4ID1A 4E7HA 4FLVA 1Q8IA 3ENOA 2Q2RA 3L6QA 4C8KA 1OKJA 4BRIA 3DAWA 3AVIA 2GTDA 5AQNA 1IKWA 2HVHA 4CD1A 1M90O 1T05A 4B1UB 2XY6A 4JN4A 5FRMA 4FWKA 1BIZA 1P8ZA 1I39A 1S3XA 2HNDA 3CCMN 4DS5A 3C95A 4DSEA 1VRTA 4H4MA 3VQ6A 1LV5A 2Z1GA 1ITGA 1TGOA 4IOAL 5BPLA 1QE1A 4RCHA 2QK9A 3EYZA 3VGKA 1D9DA 1TKTA 2UUAK 3L0QA 4BR9A 4DKWA 3EN9A 2XRIA 1J5EK 3H45C 3OYGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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