5BN8A

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn8A04
1NGEA 1C0GA 4EHTA 3SMPA 3AAQA 3CERA 4BC4A 3EN9A 3M3ZA 2BUPA 3A5OC 3VGLA 2QW9A 5JLFA 2P9SA 4BGAA 1NGFA 4PKGA 3UE5A 1KAYA 2QWNA 3CJAA 1DKGD 1NM1A 4QS8A 4BC2A 4BC3A 4K41A 4QS7A 4B9QA 2YHYA 4I6MA 2IIRA 3VEVA 3WEEB 4MO5A 3J8AA 2IVNA 4BR5A 4JD2A 2P9KA 4JAXA 3KHYA 2P9IA 2Q0UA 2Q0RA 5EY4A 4BR9A 2CGJA 3ZETB 4NB4A 4JHDA 5FPDA 3LDLA 3O4WA 4FWNA 2YJFA 2AP1A 4A2AA 4H0YB 3DJCA 2BTFA 1NGAA 2P9SB 3CJ7A 3AY9A 4CBXA 3P4IA 3D2FA 4WYBA 5KQ8A 5E84A 3BEXA 5AQJA 4BRCA 2OANA 2P9NA 4H0VB 1Q18A 3VETA 5BRHA 4BRPA 3LDNA 4XH5A 4MO4A 1U2VA 1HUXA 4I6MB 3U4LA 3C7NA 4WQ4C 5AZJA 4LC9B 2WUSA 4FWKA 4JD2B 2P9KB 4DB3A 4PKHA 4WQ5A 3EL2A 3HM8A 3C0BA 4PKIA 4IWVA 2P9IB 4H0TB 5BRDA 5KPRA 2CGLA 2E2PA 1Y64A 3FZMA 1NLVA 4CZMA 4FL9A 5EX5A 1NBWA 3FE1A 4H0OA 2D0OA 3RSEA 1EQYA 2V52B 1P8ZA 4FPAA 5AQHA 4CD3A 1Z05A 3O6WA 2DPNA 3W3DA 4XEIA 1HKGA 5EXWA 2FF3B 2FLOA 2YJEA 5AQKA 1NGGA 4MLHA 4BQZA 4H5WA 4CZIA 3MN7A 4BRDA 2P9NB 3DXMA 4CZKA 2P9UA 3FLCO 3WXIA 4EIAA 2HMPA 4H5VA 4QS9A 4EHUA 3VEOA 4IJNA 3VERA 1U2VB 2H3GX 3FZLA 3VGMA 3EKUA 3C7NB 5ADXH 3VENA 3WXJA 5AZJB 3M6GA 3O8MA 2A40A 2NLXA 2VCPA 4IXCA 4FWRA 3WT0A 4Y0WA 4CJ7A 1R59O 1JCEA 1RGIA 3A0IX 4H0XB 1JCGA 1MWKA 4EAHD 3GOIA 4YDUA 2GUPA 2F9TA 2FXUA 1QHAA 3DAWA 2E88A 5AQWA 3SLCA 3JS6A 3L4IA 1CZAN 3RSEB 5AQPA 1V4TA 3VESA 1KAZA 4B1ZA 3O1BA 2QWPA 1DGKN 5AQRA 4CZHA 3GDQA 4NO7A 2Q2RA 1TUUA 2UYTA 3UKRA 4IJAA 1H1VA 3DXMB 3R6MA 1NGCA 2P9UB 4IO8A 3ID8A 3CI5A 4FWSA 1NWKA 3FGUA 1ZXOA 2CGKA 2I7NA 3ENOA 3VPZA 2VWBA 4RCHA 4HWIA 5AQMA 4BQLA 2HF4A 4BRNA 4CZJA 2GWKA 3ATUA 2A42A 3ZX3A 1YXQA 4A2BA 3O08A 3FZKA 3MN6A 1HKCA 3S41A 4AM6A 4AM7A 2D1KA 1ATRA 3OHRA 4HTLA 3H6EA 4RWTA 4IZ9A 1KAXA 3HSCA 1E4GT 4FWPA 4CI6A 1DEJA 1T6CA 2A5XA 3LDOA 2E20A 1GLJO 1SQKA 3A5MC 3EO3A 3IMXA 3BUZB 5AQLA 1TYQA 2PBDA 3UKRB 1NGDA 1X3NA 2YHWA 3ZX0A 1ZBSA 4BREA 4H0PA 4CZLA 2YCHA 1T6DA 5ELZA 3H1VX 3HZ6A 1LOTB 4DQ8A 1OKJA 1BG3A 3U9ZA 3R8EA 4BRGA 2IVPA 3EZWA 2ZGZA 3BP8A 1RDWX 4DHYA 1ATSA 3CQYA 5E26A 5BPLA 2A41A 1QZ6A 2VYPA 4BRMA 2V7ZA 4O5FA 3ATVA 3W0LA 5BN8A 4BROA 2QWRA 4K42A 3CJCA 3VF2A 1GLAG 3CJBA 3U8XA 1J6ZA 2ZGYA 3CJ9A 1TYQB 1NGJA 1YAGA 2EWSA 3F9MA 5AQTA 4RTFD 5CE3A 5BRFA 3A5NC 3U9DA 3JXUA 3MCPA 2QM1A 4CBWA 4BRLA 3GBTA 3I8BA 3VEZA 4JHDB 5LJVA 4L3QA 5JMVA 5BR9A 2D0PA 4WQ4A 1X9JA 4BRIA 2P9PA 1GLBG 2ASMA 1HX1A 3D2FB 4H5TA 1SAZA 5LJWA 3KZBA 2QWMA 3O1WA 5BREA 3LM9A 3ULEA 4F9OA 5I9EB 4FO0A 2CH5A 2P9LA 3FFKB 3UB5A 4FOEA 2A6AA 3D2EA 1T44A 1GLFO 4M63C 2E1YA 1BA1A 4EFHA 1YVNA 1S22A 1C0FA 4KBOA 4PL8A 4A62A 3DWLA 5AQOA 3G25A 5KQDA 1ZC6A 2V51B 1V4SA 3SJHA 3FZHA 4A61A 4BRHA 1NGIA 3I33A 1K8KA 3QDKA 3WXKA 2GEMA 3IDHA 4YDUC 3VGKA 1HPMA 3CIPA 2V7YA 1ESVA 1BA0A 5AFUA 3LL3A 3FZFA 3AARA 3H46O 3QBXA 5AQYA 2P9PB 5AQIA 3BF3A 4B1UB 2HF3A 2A3ZA 4BG9A 2F9WA 4C23A 3ULEB 4FWOA 4BGBA 2E2NA 1GLEG 2P9LB 1YUWA 3D2EB 5EOYA 3BF1A 1TUYA 1HKBA 3ZEUA 4JNEA 2YHXA 3TU5A 4CZGA 2NZTA 1D4XA 4ISFA 1K8KB 3VOVA 4FPBA 1XC3A 1IJJA 2ASPA 2GTDA 3HTVA 4H03B 5F2RA 3SMSA 4BC5A 4CZEA 3O80A 3LDQA 5JLHA 2KHOA 3H45C 3B8AX 4B1XB 2FSKA 1NGBA 3L0QA 1QQMA 4XH4A 5TKYA 2IVOA 3WUHA 4BRFA 3ENHA 2QWOA 1BO5O 4BVOA 4CD1A 1WUAA 1MWMA 2ZF5O 2J4RA 1U6ZA 5FPEA 3FR0A 4FWQA 1SZ2A 4O8KA 3QB0A 4BVPA 1QQNA 3EKSA 2GWJA 1X3MA 3ZEUB 3M1FA 1QQOA 5BPMA 2AA4A 1Z6RA 2E2OA 1XUPO 2QXLA 2HOEA 2ITMA 5BPNA 4XH1A 1MA9B 4JN4A 1KXPA 5BN9A 2CH6A 3MDQA 4GNIA 4BR0A 2PAVA 3UKUA 2ASOA 3H3OB 1NMDA 2W41A 3MN9A 4ISGA 5FPNA 1GLLO 2ZWHA 5AQFA 4WQ5C 4CZFA 3WQTA 1IG8A 1GLCG 2Q31A 3KVGA 3VEWA 2FF6A 4BR4A 5AZIA 5AQGA 3H3NO 5AQSA 5AQXA 3GE1A 4B1WB 3O5BA 4BG8A 2Q1NA 3IFRA 3VEYA 4GY2B 3ZX2A 1XQSC 3CJ1A 1MDUB 5F1XA 3R9PA 5F0XA 4M7YA 1G99A 4MLEA 3WQUA 5EVZA 1BOTO 1BWFO 1QZ5A 2Q97A 4E1JA 3H1QA 3A5LC 3CQXA 4FWLA 3QMLA 4PL7A 2D4WA 1BUPA 4M7XA 4BR2A 5AQQA 3CETA 5KPZA 4CBUA 5JICA 2NRHA 2FSJA 3D7EO 3UKUB 1LCUA 3AAPA 3WXLA 4BR7A 3DXKA 1NGHA 2QWQA 3MMVA 1E4FT 4FSVA 1BDGA 3QBWA 1HJOA 3LM2A 5ADXA 4FWMA 4DCHA 1BU6O 3MN5A 5AQNA 5AZIB 4J8FA 3VF6A 3TPQA 1WOQA 3GL1A 2GELA 2E1ZA 3LDPA 5AQVA 3HI0A 4ISEA 4B1VA 2FSNA 5KPTA 5AQUA 3HBTA 5AFUH 1GLDG 4K43A 4BRQA 3CHWA 5LY3A 3VF4A 2E8AA 2Q36A 2I7PA 2W40A 2YI1A 1S3XA 2E2QA 4FOIA 3WEEA 4Z94A 3IUCA 4H5RA 4BRAA 4BRKA 3QICA 3QFPA 3DXKB 5FPMA 4H5NA 3GG4A 3L6QA 3MK6A 3VEXA 5B8HA 2QWLA 5AQZA 3QFUA 4K25A 4B1YB 1ATNA 3A8YA 3SK3A 1RFQA 1JCFA 5AR0A 1HLUA 3ZETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EZ5A 4CGJA 3OYDA 1U49A 1VSKA 2YEOA 1G15A 4BC4A 5KGXA 4Z0UA 3A5OC 1OH7A 1PE4A 4CIFA 4DFMA 4HUGA 1NGFA 2QWNA 1POIA 1T0ZA 1NM1A 3QEIA 1AHOA 1NE5A 3CFOA 5KRTA 4B9QA 4YNQA 1YHQN 4CHNA 3HT3A 3M8RA 2IVNA 4YOVA 4CEQA 1WSGA 2HBMA 3DYAA 1VSLA 2Q0UA 2Q0RA 2N2QA 2HNDA 1N32K 3NH1A 1K9MO 2DFEA 1SL2A 4CW7B 4JHDA 3O4WA 1TKTA 1BRZA 3QLHA 4CIGA 1K73O 4M3TA 2KGQA 4KHQA 3AA2A 3HSTB 1WSJA 1WSHA 4ZTFA 1IBKK 1NGAA 3ENBA 4B3RK 3CCSN 4CF2A 3D2FA 4C8MA 4CJUA 3VTHA 2F4VK 2P9NA 3VETA 3QI7A 4BRPA 4DSIA 1JLCA 2XO7A 4XH5A 4Z4CA 4MO4A 2E2FA 4I6MB 3C7NA 4Z4FA 4JKFA 4Y1DA 4JD2B 3CCLN 4PKHA 1UWBA 1C0MA 3EL2A 3HM8A 4CJLA 4IDHA 2CGLA 4DR5K 2O8EA 3VQ8A 2VG6A 4H0OA 2D0OA 1WT7A 1HNWK 4YOWA 1P8ZA 2IDOA 4DS5A 1VQ6N 2HBJA 1NJZA 4CD3A 4NCAA 1Z05A 2WOMA 2DPNA 3W3DA 5TKWA 1HKGA 5EXWA 2FF3B 4MFBA 4YOTA 1VQ8N 1QSLA 5J2QA 3G4SN 3NE6A 3CC2N 3MN7A 4BRDA 1TGOA 3WXIA 4CJFA 4H5VA 4DR1K 1QVFM 3DM2A 1U2VB 2H3GX 3I0RA 4KH4A 3WXJA 4DV3K 4FK2A 3M6GA 3O8MA 1WLJA 3OBYA 3VQ9A 3A2FA 4HTUA 1JCEA 3EE9A 3CFRA 1L3UA 3QESA 4XJXA 3ZCMA 4DS4A 1QHAA 5AQWA 3SLCA 1N33K 3AVAA 3UIQA 3DLEA 3L4IA 4KFBA 4HUFA 4B8CA 1BCMA 1F21A 4JK7A 4CZHA 2Q2RA 4ILGB 1J54A 4IO9L 2YKNA 3ASMA 4BE0A 1T7EA 2JLEA 4CJPA 2LY6A 3PO5A 1NGCA 4IO8A 1NWKA 1ZXOA 4OKEA 1VRTA 2VWBA 3C6TA 4BQLA 5C2DA 4DUZK 2GWKA 3KLFA 2X74A 1JL2A 5C24A 1ASVA 4LY7A 4IEEA 3MN6A 4JI8K 2GMOA 1HRHA 2D0CA 3CXCM 1OVYA 1SV5A 1RT5A 3MCAB 2AJQA 2D1KA 1JXCA 4AAZA 5KGWA 3OS2A 1KFSA 1KAXA 3O9TA 1BI4A 1DEJA 4ELTA 1T6CA 1S1TA 2E20A 1QHTA 3EO3A 3E66A 1WB9A 1TYQA 3VQAA 2PBDA 4E7KA 4JKHA 2KQ2A 3TSUA 2YHWA 2B5JA 4OX9K 4DFJA 1RT7A 1NG9A 1NRAA 4FZXC 4FJ5A 2HHTA 1E3MA 3SQ4A 2X6NA 2ZGZA 3M8QA 4DHYA 4KRFA 1FH3A 3AVNA 4FJLA 1NJWA 4IOXA 5E26A 4E1MA 3AVBA 4RW7A 3P5JA 2YX6A 4KKOA 3QINA 1JXBA 4UADE 1C55A 2FBVA 3OS0A 3ZSVA 3PSIA 4DQQA 1J53A 3ZT0A 3O3GA 3CJBA 3U8XA 3V4IA 1VNAA 3C65A 3NF8A 2ZGYA 3CJ9A 3G71N 4YOUA 3VQ6A 5M1NA 3A5NC 3JXUA 1W2BM 5D3GA 4KHNA 4J2BA 3GBTA 5C42A 3VEZA 5BR9A 4WQ4A 1NOYA 3C6AA 4FCYA 2ASMA 2HW3A 1HX1A 1D5AA 3KZBA 3ULEA 1BMRA 1EWRA 4FJNA 1RT6A 4NYNA 4KO0A 2CH5A 3FFKB 3IS9A 4M63C 1BA1A 1ZBUA 1HQUA 4H4OA 4PL8A 5AQOA 5J2PA 1VHXA 4AHTA 1VQMN 2V51B 1A5WA 1NGIA 4GKJK 4LH4A 1K8KA 4DQPA 3VGKA 4YDUC 3CM6A 1ESVA 4X64K 1S1WA 3L56A 3LL3A 4DF4A 3FZFA 4JI6K 1B7DA 1ZBFA 5HBMA 4KI4A 2UUCK 4PWDA 4CK3A 3VQEA 4M3XA 4W5OA 2HF3A 5FRNA 4JK9A 2F9WA 3MX2A 3TABA 4JI7K 2P9LB 4F4KA 5CYMA 2WONA 5KTQA 1NK6A 5CZ1A 4CEEA 3AA4A 3ZEUA 3V81A 5SZTA 3IAYA 3CD6N 4CJEA 2Q3SA 2NZTA 1D4XA 3MXJA 4OPJA 3P31A 3AVMA 3KOWA 4KTWA 3HTVA 1TAQA 5F2RA 3TANA 1LAWA 2SN3A 4JEPA 2ATBA 1K6YA 5JLHA 2YBRC 1DTQA 4X65K 3VQDA 3PUFA 3EYZA 2FSKA 2K35A 3L0QA 1QQMA 1UGLA 2EX3A 3TAFA 2PYLA 4KHSA 2NUBA 1JL1A 3S3MA 4GVEA 4UJ0A 3THYA 1KVCA 4BVOA 4O5BA 2YNIA 5HRNA 4MDBA 3FR0A 2NRVA 2ZJPL 2WBNA 1YITN 3EKSA 4CESA 1X3MA 1YIJN 4RW8A 1FKOA 1NKBA 4B9TA 3LAMA 2QXLA 2ITMA 4B9NA 4KREA 1MA9B 3EE8A 3MDQA 4MDAA 5HOOA 4J2DA 3H3OB 3TARA 4CF1A 3SV3A 3IKMA 2LJMA 4LSNA 4DQSA 5I42A 1VQKN 2NNWA 1S1VA 2GUIA 2YHBA 2BE2A 1GLCG 3WQTA 2NRZA 4N76A 3ZT3A 1CHZA 3H3NO 1I6FA 3IFRA 4B9LA 1HNXK 4GY2B 4BE1A 1XQSC 5F1XA 3THWB 3G0ZA 1G99A 4V19S 3WQUA 1BWFO 1XHZA 3A5LC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EZ5 A;  4CGJ A;  3OYD A;  1U49 A;  1VSK A;  2YEO A;  1G15 A;  4BC4 A;  5KGX A;  4Z0U A;  3A5O C;  1OH7 A;  1PE4 A;  4CIF A;  4DFM A;  4HUG A;  1NGF A;  2QWN A;  1POI A;  1T0Z A;  1NM1 A;  3QEI A;  1AHO A;  1NE5 A;  3CFO A;  5KRT A;  4B9Q A;  4YNQ A;  1YHQ N;  4CHN A;  3HT3 A;  3M8R A;  2IVN A;  4YOV A;  4CEQ A;  1WSG A;  2HBM A;  3DYA A;  1VSL A;  2Q0U A;  2Q0R A;  2N2Q A;  2HND A;  1N32 K;  3NH1 A;  1K9M O;  2DFE A;  1SL2 A;  4CW7 B;  4JHD A;  3O4W A;  1TKT A;  1BRZ A;  3QLH A;  4CIG A;  1K73 O;  4M3T A;  2KGQ A;  4KHQ A;  3AA2 A;  3HST B;  1WSJ A;  1WSH A;  4ZTF A;  1IBK K;  1NGA A;  3ENB A;  4B3R K;  3CCS N;  4CF2 A;  3D2F A;  4C8M A;  4CJU A;  3VTH A;  2F4V K;  2P9N A;  3VET A;  3QI7 A;  4BRP A;  4DSI A;  1JLC A;  2XO7 A;  4XH5 A;  4Z4C A;  4MO4 A;  2E2F A;  4I6M B;  3C7N A;  4Z4F A;  4JKF A;  4Y1D A;  4JD2 B;  3CCL N;  4PKH A;  1UWB A;  1C0M A;  3EL2 A;  3HM8 A;  4CJL A;  4IDH A;  2CGL A;  4DR5 K;  2O8E A;  3VQ8 A;  2VG6 A;  4H0O A;  2D0O A;  1WT7 A;  1HNW K;  4YOW A;  1P8Z A;  2IDO A; 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