3MXMA

Trex1 3' exonuclease v201d aicardi-goutieres syndrome mutant
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
229
structure length
226
Chain Sequence
LPHGHMQTLIFLDLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALENTSISQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASSPGSRKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDDLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/dna
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 77
structure length 226
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxmA01
3HYFA 1DLOA 3WNHA 4CGJA 3V9UA 1CLQA 1RT4A 4FLXA 3RWUA 2Z1IA 1JKHA 1VSHA 1BI4B 4CEQA 3V9WA 1TGOA 1LWFA 3SQ2A 3AO1A 1Q9YA 1D5AA 3LZJA 4C8MA 4CIFA 2G8UA 4ZTFA 4CCHA 3HSTB 1QS4A 4CEDA 1MU2A 3V6DA 3HPGA 4CF8A 1IKYA 4FJLA 3OS0A 1HJRA 3TAEA 3LP0A 1RT3A 1CXUA 1HNIA 4BE0A 1VSFA 4BE2A 1S1UA 4Z4EA 3WNEA 2RN2A 1HYZA 2FBVA 3UIQA 3M8QA 2HVHA 4CHNA 3ZT2A 4FJ5A 4DTUA 2G8HA 4CJSA 4IKFA 1JLCA 3HXMA 3SJJA 4OPJA 1VK0A 4CERA 4M3ZA 3VQPA 3CFOA 4DU4A 3QEWA 3V1QA 4KB0A 2VG6A 3ULDA 2O4GA 4FZXC 3DLRA 3OYDA 1SKRA 3WNFA 2A1RA 1L5UA 4CEBA 3THVA 1NK7A 3QEVA 4Z4GA 4CJQA 3NH1A 4FJXA 2G8VA 1JLAA 5HRRA 3SQ0A 1J5OA 3HPHA 3TAMA 5C25A 4CF1A 3V9XA 1QHTA 4B8CA 1TK0A 2P5GA 1S6PA 3VQ9A 3JYTA 4LD0A 3V4IA 4HCCA 1C0UA 3OYEA 4OPKA 4M3UA 3TR8A 4PY5A 2ITGA 4Q5VA 1U4BA 1J53A 3KD5E 1CZBA 3LP2A 5J2NA 3PO5A 1LV5A 4OLAA 2HHWA 3SUPA 4BDYA 4C8LA 3CFPA 3TARA 3OYFA 4DTOA 4KHNA 4MQ3A 3KK1A 3LWMA 4FJHA 1RDCA 3MEGA 5KGXA 4M42A 2WOMA 1UA1A 1D9DA 1S1VA 4DFKA 4FXDA 4E3SA 5DMRA 1KRPA 3ZT3A 4ELVA 4IDKA 1X9WA 2PY5A 4L8RB 4FCYA 4HHTA 1GOAA 3IAYA 3I8DA 4E0DA 2EHGA 1ASUA 1WSHA 3DLGA 4CF0A 3VQAA 4DMNA 5I3UA 3C94A 5CY4A 3OJUA 1VSJA 1VSIA 2YKMA 3NF7A 3VQBA 3NGYA 4AHUA 2F8TA 4Y1DA 5K14A 3DLEA 3G0ZA 4YNQA 3LZIA 1JL2A 3AO3A 2NUBA 5CYMA 3MEEA 1IKXA 4IBNA 4HTUA 3L3VA 1JLFA 2O4IA 1HPZA 4GW6A 2YV0X 1F21A 1LW0A 3VN5A 1QSYA 3MXMA 4DQPA 3HO1A 4M41A 4ICLA 2XY5A 1NK0A 4NCBA 1WSEA 3ZSXA 4M3WA 4OJRA 3KKSA 4DQRA 3NDKA 3DYAA 4FLWA 1FK9A 4DSEA 2DFEA 1VSEA 4CJKA 5KTQA 1RT7A 1R0AA 1D9FA 1KVAA 2EX3A 1SL2A 4E1NA 4W5TA 1KSPA 2HHUA 1VRTA 1HYVA 5D3GA 3V1RA 4CF9A 1N5YA 4N5SA 4GMJB 2PZSA 4FJGA 3L2WA 1TAQA 2KW4A 4JRPA 4AHTA 3QIOA 4FLUA 3QESA 3SUNA 4CIGA 3SYZA 2OZSA 1FKOA 3NBPA 1B9FA 2IDOA 1JLGA 1JXBA 1IO2A 4LY7A 4Z4HA 4N56A 3K58A 1A5VA 3RRGA 4M3XA 1TKZA 1YTAA 3K59A 3OYMA 4E7KA 3V9SA 4CK2A 4DU1A 4F4KA 4M3TA 2HB5A 3AVIA 4EZ9A 4OKKA 4JRQA 4HUEA 4LSLA 1K6YA 1VSDA 4J2AA 2D0BA 2Z1GA 4CJTA 4AHCA 1NK9A 3QIPA 4BACA 3K5LA 3H08A 3LPUA 1LAWA 4RW6A 4KV8A 3PY8A 3K2PA 4B08A 1IKVA 3KLIA 1C6VA 4ID5A 5J2PA 4N76A 3DMJA 3PO4A 4QOZB 4CJ5A 3RMAA 4M45A 4R5PA 3S3NA 4CHPA 5FRMA 1LW2A 4FK2A 3A2FA 1SKWA 1JL1A 4G1QA 1TKTA 1ASWA 1VSLA 3ZSOA 4W5QA 1WSGA 4W5RA 4KHSA 4B9UA 2XY6A 4CGGA 1RBUA 4DTJA 1J9AA 2FC0A 4FM2A 1BISA 4CEFA 3I0SA 1X9MA 4IFVA 2HNDA 3HP9A 1YVUA 1EX4A 2HNZA 4O0JA 2GBZA 3K5MA 1RT5A 4CHOA 5HROA 1D8YA 2HNYA 4K8ZA 3MECA 3O3HA 4DFJA 4FZYA 1BCOA 3L2QA 4DG1A 4CJPA 4FJIA 4CGFA 4E7HA 4BWJA 1S6QA 3OYIA 1T03A 1QE1A 3LPTA 5C24A 4F8RA 4J2EA 2KQ2A 4CK3A 1J54A 1RBSA 4Y1CA 5CYQA 3SNNA 4K8XA 2G8WA 3O4NA 4CJVA 1VSKA 4FM0A 5HRSA 1QTMA 4GVMA 3SZ2A 5HBMA 4EZ6A 1EP4A 1B9DA 4CHQA 3FFIA 2IC3A 3KKRA 1KLNA 1ITGA 2GUIA 4KI4A 1VRUA 1TKXA 2P51A 4EP4A 4OGCA 4F3OA 3MEDA 4CESA 4CJWA 1NJWA 1ZBIA 3L8BA 3KD1E 4OLBA 2VG7A 3OYJA 3S9HA 5FROA 4DSJA 1U48A 4FJJA 3OYAA 4DLGA 1IKWA 3KLFA 3QNNA 1I3AA 2Y1JA 5C42A 4I9LA 3SPYA 2D0AA 2BANA 3KK3A 3SV4A 3ZT0A 4KFBA 3ITHA 4KTQA 3C6TA 3KTQA 1WAJA 2HHXA 4CE9A 4PUOA 4CEZA 3HP6A 1VSMA 1ZBHA 4H4MA 3NF6A 3OYKA 3IG1A 5SWMA 2XHBA 4CEEA 4KPYA 4FVMA 3VQEA 3BDPA 1QSLA 3OJSA 3AVGA 3AA4A 1RTHA 5KGWA 3VQ6A 4H8KA 3VQQA 3L2VA 1X9SA 2D0CA 3QINA 3LALA 3U3YA 4AHSA 1CXQA 4JS4A 5I42A 2OPRA 4TSXA 3LDSA 1XWLA 4CGIA 4F2RA 4DQSA 3MAQA 1XI1A 2X6SA 4YFUA 1CZ9A 3E01A 1FKPA 3NH2A 4CK1A 1QQCA 4JS5A 1C1CA 3ZSRA 1EXQA 1BQNA 3OYHA 1LWCA 3ALYA 1T05A 5T7BA 3K5OA 4KAZA 5FRNA 1UOCA 1NK4A 4E7LA 3CM6A 4CJUA 2OA8A 3OS1A 3LP3A 4LSNA 2OZMA 4I2QA 1NJZA 1EETA 1Y97A 3NFAA 3AV9A 2R7YA 4ID1A 1WSFA 4IFYA 2DY4A 3VQ8A 3QO9A 3T19A 3PV8A 1UA0A 2AJQA 3QETA 4CIEA 5KRTA 4CJ4A 3DM2A 3QEXA 4CJFA 1ASVA 4NCGA 2IOCA 4DF4A 1UWBA 1U04A 3AO5A 4PWDA 2P1JA 2YNFA 2KTQA 3NH0A 4CJLA 4M3RA 2HMIA 4H4OA 2LSNA 3VQCA 3PUFA 4QCLA 4O4GA 3VQ4A 3DLKA 1C0TA 4NYFA 3LWLA 2WONA 3AA3A 4FM1A 2YNIA 3TAGA 1WSJA 4HVJA 4DQQA 2YNHA 1KVBA 3QNOA 4FJ9A 1JLEA 2B4JA 3KLEA 2FBYA 4CHYA 4J2DA 3MXJA 2BDPA 3DRPA 1HNVA 4DFPA 4KHQA 1SL0A 1A5WA 3VQ7A 1EKEA 1HMVA 2DFHA 4W5NA 2YKNA 4KKOA 3QERA 3KK2A 3O4QA 4BE1A 1S1XA 1YT3A 1XHZA 1U49A 4N41A 1RTJA 1ZBFA 3KJVA 1NKCA 1KVCA 4CJ3A 3QEIA 3AVAA 3DLHA 1S9EA 4B9VA 3M8RA 1TK5A 4NYNA 4WE1A 1TKDA 2Q3SA 4DSIA 2ZE2A 1KFDA 1W9HA 3EY1A 2G8KA 4ZTJA 1L3VA 3DLBA 4FZZA 5KI6A 4Z0UA 2JGUA 3KLGA 2FBTA 4OVLA 2HVIA 2DTUA 3IS9A 5HP1A 2X74A 1KTQA 1T8EA 3VA3A 1WNSA 4B9TA 4CFCA 4RG8A 2IGIA 4IG3A 3T1AA 5KRSA 2VWJA 2XY7A 3SPZA 3AVBA 1BL3A 1GOBA 1HQEA 3B6OA 3NAEA 2E6LA 4O5BA 4BWMA 4CGHA 4CJRA 3VA0A 1KFSA 1XHXA 4B9LA 4OGEA 4DTMA 4J2BA 3OYCA 3PX4A 2G8FA 2HW3A 2KFNA 4I7FA 3D0PA 3S3OA 3RRHA 3AA5X 2G8IA 1TL1A 4OKJA 3AA2A 3F73A 3ZSYA 1NK6A 3RMBA 1L3UA 3AVCA 1RBRA 5DK5A 1BHLA 2RKIA 3G10A 1S1WA 3HT3A 4E1MA 2VWKA 3PX6A 4KHYA 2DFFA 3TI0A 1NJYA 1JLBA 1KCFA 4KO0A 1QSSA 2OYQA 3IRXA 3TAQA 1YTUA 4FJ8A 3DOKA 3AO2A 1DTQA 1TK8A 4DSLA 4DTXA 2IS3A 2X78A 3RMDA 2E4LA 3AVHA 2VG5A 3AVMA 3DRSA 4XIUA 4I2PA 4DF8A 3CG7A 4FJMA 4ZHRA 1S5JA 1TVRA 3LAKA 4CHZA 3NF9A 5EU7A 4N47A 4CJEA 1X1PA 3V9ZA 3B6PA 2KFZA 3HK2A 1B92A 3TWHA 1BI4A 1KLMA 3D45A 3SV3A 3AVNA 3MXIA 1G15A 2YHBA 4DS4A 1U47A 4ELTA 4FLVA 2QK9A 3RTVA 4FW1A 1C0MA 2ETJA 1L3TA 1HRHA 4BDZA 4PA1A 2XRIA 1C1BA 4CECA 4CGDA 4DSKA 4C8OA 4ELUA 4Z4IA 4KREA 2OPPA 2RF2A 2ZD1A 4RW8A 1NK5A 4W5OA 5CZ2A 3HJFA 1HYSA 4DWIA 3P1GA 4IG0A 3OYBA 3L3UA 3U3GA 2KZMA 3OYGA 3NCIA 2B5JA 4FW2A 3K57A 1C1AA 1W0HA 1SKSA 1WLJA 2E6MA 3AVJA 1BIUA 3O3FA 3OYNA 2BE2A 2Z1HA 3SQ4A 4B9NA 4HCBA 3OS2A 1O1WA 3C95A 1BIZA 1S1TA 2XY8A 1NKBA 2W42A 1RDAA 2QKBA 3WNGA 4E19A 1DTTA 2QXFA 3AO4A 4UQGA 3CFRA 4LH4A 4OKEA 4DSFA 4Q0BA 4AHVA 3HM9A 3HL8A 1NKEA 1WN7A 4PQUA 4F3TA 1XC9A 3ZSZA 2HHQA 3NGZA 3VQDA 2PYJA 1RT6A 3L2RA 4AILC 1SL1A 4DTPA 4FK4A 2I5JA 1NJXA 1RNHA 3V1OA 3ZT4A 3SI6A 3SQ1A 1SUQA 5J1EA 1SV5A 2B6AA 3V81A 3U6FA 2Z1JA 4B3OA 2JLEA 4C8KA 3QLHA 3HPOA 3ZCMA 4E89A 5CZ1A 1BQMA 1NOZA 3M8SA 3EZ5A 2D5RA 2HHTA 4FJKA 1TAUA 3AVLA 1GOCA 5J2QA 4RW9A 3DOLA 4DU3A 3CYMA 4DLEA 4DQIA 4KHUA 1RCHA 3P5JA 2A1SA 3BGRA 3ISNC 4M3YA 3AVFA 4DS5A 4KI6A 1JXEA 3OY9A 4E7JA 3P83D 1Z26A 3TABA 4KTWA 1TV6A 1RBVA 1LWEA 1RT1A 3ASMA 3LAMA 1UAXA 1RT2A 4AHRA 3DRRA 2ZQBA 1ZBUA 1WSIA 1BGXT 2X6NA 1WAFA 4CEOA 4CFAA 5HRNA 2YHAA 1N6QA 2KZZA 3SUOA 1IG9A 3CQ8A 3ZSVA 4O44A 4B8AB 1ZYQA 3L2UA 3TAFA 1TL3A 2FBXA 3PX0A 1U45A 4BDPA 1REVA 3LANA 2HHSA 1RTDA 2P5OA 1ZBLA 3SCXA 3M8PA 4CFBA 3NF8A 4Z4CA 3DI6A 3RR8A 3EYZA 2HHVA 3JSMA 1RILA 1Z25A 3HVTA 4RW7A 3ZSWA 3K5NA 4NCAA 3NGIA 4FLZA 5FDLA 4FJNA 4B9MA 4JLHA 1LAVA 3O3GA 3ZT1A 3QEPA 1NOYA 5SZTA 2OPSA 4AH9A 2IAJA 4CEAA 2QKKA 4FJ7A 1S9GA 3VQ5A 4CFDA 4FLTA 1A5XA 2RPIA 4Z4FA 3I0RA 4O0IA 1Q8IA 1FXXA 2F96A 3SUQA 3CM5A 3NHGA 3TANA 3S3MA 1RDBA 4RW4A 4F2SA 3HVRA 3F9KA 1IH7A 4I9QA 5HRPA 1RBTA 4QAGA 2PYLA 2ATQA 2GV9A 4B9SA 4KRFA 1JLQA 4KB1A 1NK8A 4HUFA 5HLFA 4HUGA 5JS1A 1Q9XA 4FYDA 4FLYA 1T7PA 1I39A 3ZSQA 5E41A 1BCMA 3LP1A 2YNGA 4C8NA 4EP5A 3AVKA 2XO7A 4DTRA 4DTNA 1RTIA 2OPQA 3KLHA 4DFMA 3RMCA 1L3SA 3OVNA 3KIOA 3TAPA 4MFBA 5J2MA 3T3FA 2BGGA 2F8SA 3C6UA 4CF2A 1RDDA 3OYLA 4O55A 4LH5A 4KTZA 4E7IA 4DTSA 5JS2A 2Y1IA 4KHWA 1HQUA 3NE6A 3RR7A 4FK0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B3MK 3V9UA 5AZIA 3VF2A 4IOAL 4FLXA 3AAPA 3C65A 4CEQA 1BI4B 4FWQA 1U6ZA 1LWFA 4B9QA 4ZTFA 1LOTB 4CEDA 1IKYA 4JKBA 3TAEA 1RT3A 3VEVA 3UKUB 3PSFA 1VSFA 3OHRA 2E1YA 4GKJK 1QZ6A 3U9ZA 3ZT2A 1MWMA 5FPMA 5HL7L 4DTUA 2G8HA 1JLCA 3HXMA 2QI2A 2YJFA 1TYQB 4CERA 4FVUA 4JK8A 3QEWA 3V1QA 3M3ZA 2GTDA 2VG6A 4FZXC 3C6AA 1NBWA 4OPAA 3TTDA 3QEVA 3MCPA 2Q0UA 2G8VA 3TAMA 5C25A 4BRQA 1OVYA 4IO8A 1QHTA 4B8CA 2P5GA 1E4FT 3D2EA 1WBBA 2I7PA 3O8MA 1ATRA 3QBXA 1VQKN 4M3UA 4KH5A 3TR8A 1J53A 5AQKA 3KD5E 3PO5A 3BUZB 2V7ZA 3EO3A 4KHNA 3EE8A 1N32K 4MQ3A 2P9NB 4A59A 3F5TA 3MEGA 1UA1A 5TKWA 2D0OA 2A3ZA 4FXDA 4E3SA 1YJWN 1DEJA 4L8RB 4WQ4C 3MDQA 3IAYA 3I8DA 4CD3A 3OJUA 1VSJA 1QZ5A 3NGYA 2F8TA 5EOYA 1HKCA 2NUBA 5CYMA 4JI6K 1BU6O 4BC2A 2YV0X 3O9RA 1F21A 1LW0A 3VN5A 3D2FA 3HO1A 4ICLA 3IDHA 5BRHA 3DYAA 3IMXA 4MO5A 1VSEA 3QMLA 4JHDB 4CJKA 1D9FA 1KSPA 3RVCA 4W5TA 1JJ2M 3ENOA 3ENBA 3UKRA 4FJGA 2ASOA 4WFNL 4YDUA 1W7AA 2KW4A 3QESA 3SUNA 1E3MA 2YI1A 2IDOA 1JLGA 3RRGA 1NGHA 4PHTX 3PIPL 4DV2K 4M3TA 3AVIA 1NGBA 1YIJN 4OKKA 4JRQA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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