2RN2A

Structural details of ribonuclease h from escherichia coli as refined to an atomic resolution
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
molecule keywords RIBONUCLEASE H
publication title Structural details of ribonuclease H from Escherichia coli as refined to an atomic resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 51
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1992-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2rn2A00
1SKWA 2VG7A 4M3YA 4AH9A 1ITGA 1B92A 3QINA 3OYMA 1SKSA 2FBTA 5C25A 4DQSA 4CEFA 1VSDA 5J2QA 5J2PA 2RN2A 5HRPA 2AJQA 1CZ9A 3ZSYA 3PY8A 1UWBA 4I2PA 4B08A 4CHZA 3KLIA 2E6LA 1SL2A 4FYDA 1Z25A 1CXQA 4HTUA 1RT6A 1YTAA 4FM0A 3V4IA 2I5JA 4CGDA 2KZZA 4AHUA 1FKPA 3M8PA 5SZTA 2YNGA 2XHBA 1K6YA 3HVRA 2HNDA 4HCCA 4B9LA 3OYAA 3LP1A 1U48A 3U3GA 1LW0A 4BDYA 1UOCA 1N6QA 4E7IA 1RTDA 3LDSA 1TAQA 2ZD1A 3QNNA 3CFPA 4GMJB 4EP5A 4CEAA 1KRPA 4F3OA 3HP6A 3I0SA 3ZCMA 4Z4FA 3SZ2A 4KTQA 4BWJA 3TAFA 4C8KA 4Y1DA 3AA2A 5CYQA 4FZXC 1HMVA 2BE2A 1XI1A 4KHYA 1NK5A 4DSEA 4DU1A 4DTNA 4CEZA 3ALYA 4JS5A 3SV4A 3KLGA 3SQ0A 3M8QA 1J54A 2IOCA 3HM9A 3KIOA 4OVLA 5J2NA 1BIUA 3T1AA 4B9MA 3KKSA 2Z1GA 3TAPA 1B9FA 1L3SA 4FLTA 2W42A 4L8RB 3AVIA 2DFHA 3HSTB 4M42A 3NF9A 4M45A 4ZTFA 3TAGA 3KLHA 1EKEA 1J5OA 2Z1HA 2RPIA 1ZBUA 1KCFA 4B8CA 1QSYA 3B6PA 1TV6A 1L3UA 3F9KA 4YFUA 3VQ6A 4M3ZA 3C95A 3OYDA 1ZBHA 4I7FA 3QLHA 3MEGA 4O0JA 4PY5A 4DS5A 3SJJA 4RW4A 4DU3A 1LAVA 3CYMA 4CHYA 2HNZA 3RMDA 4KHSA 4ELTA 1BISA 3TAMA 3OYGA 1WSJA 4B9VA 1WSEA 3DLRA 1NJXA 1RTJA 3AA5X 4DTXA 4Z4IA 2YV0X 1CXUA 1A5VA 1TL1A 1HNIA 4H4MA 3NCIA 4CF1A 1S5JA 2NUBA 4LSLA 5FRNA 3SUQA 3T19A 3PX6A 1ZBLA 4KTWA 5I3UA 1X9WA 2YHAA 3LAKA 3L3UA 3OJUA 4DSLA 4M3RA 4CGFA 1RNHA 2QXFA 5KGXA 1L3TA 1SV5A 4KHUA 2VG5A 3HVTA 5C24A 4FLWA 2XY5A 3VQBA 2PZSA 3HT3A 1JLQA 5EU7A 2OZMA 3L8BA 1UA0A 3S3NA 3L3VA 5C42A 1TK5A 4HUGA 3IAYA 4QAGA 4I9QA 1BHLA 4UQGA 3SUOA 1RT7A 4DWIA 3HPHA 1UAXA 4I9LA 4CF9A 3BGRA 1C0UA 3ZT0A 3AO3A 4CEDA 3VQAA 4CEBA 1HQEA 3DYAA 5E41A 2VWJA 1QE1A 3NBPA 3V81A 4EZ6A 1WSHA 3NF6A 1WLJA 4CJEA 4H8KA 3EZ5A 4B9TA 4OLBA 3NGZA 5CY4A 2YKNA 1TGOA 1S1XA 3HPGA 4Z4HA 1HNVA 3O3GA 2X6SA 4LD0A 3V1QA 5KRTA 1L3VA 4E89A 1VSMA 3QO9A 1VSLA 4KB1A 1NKCA 4Z4EA 2HHVA 5JS1A 3CM6A 4CGJA 1ZYQA 2ITGA 4N41A 3LZIA 5HLFA 1LWFA 4C8NA 2QKKA 1C1CA 4QOZB 1LW2A 3DLHA 4ELUA 4OKKA 4FLYA 1RBTA 3QEXA 4FZZA 3AVKA 2OPQA 1U4BA 3L2UA 3QEWA 3PX4A 4DSFA 3U6FA 3FFIA 3RTVA 1I39A 3TR8A 3D0PA 3VQEA 4AHCA 2OPRA 1GOBA 5HBMA 3ZSVA 5CZ1A 1JLFA 1G15A 2B4JA 4CFAA 4JS4A 4DLEA 5HRSA 3DMJA 3ZSZA 4Z4CA 1Q9YA 4W5QA 1J9AA 2LSNA 4AHRA 4BWMA 2EHGA 3VQCA 4FJ9A 1VRTA 3DLKA 1QHTA 2F96A 4OKJA 4F4KA 1S1UA 2HHWA 1BCOA 3ITHA 4PWDA 1BQMA 1C0MA 2HHSA 4DF4A 4KV8A 3LP0A 1XWLA 1YTUA 3ZSRA 3DRRA 3V9ZA 4CJ3A 2KW4A 1SL0A 4DTMA 1KTQA 4RW7A 2FBYA 2G8WA 1NK9A 1NJZA 2VG6A 4E7JA 1RTHA 1C6VA 4O4GA 3ZSOA 3AA3A 3TAQA 4HVJA 1LV5A 1REVA 2BDPA 3RR7A 4CHPA 1N5YA 1IH7A 1HYVA 3IG1A 4CJKA 4EZ9A 4KPYA 2O4GA 1EXQA 4M3WA 4ICLA 4IG0A 4DS4A 1BCMA 1KFDA 5CYMA 3RR8A 4KRFA 2HHQA 1TAUA 3AVCA 4NYFA 1W0HA 1ASWA 1TKTA 1RT1A 1ASUA 2RKIA 4PQUA 2HVIA 3IRXA 4CHNA 4FW2A 3MAQA 2XY6A 1DLOA 2P1JA 1QSLA 3AVFA 1WAJA 4HUFA 5J1EA 1RDDA 3DM2A 1GOCA 2X74A 3AVBA 4DG1A 3NDKA 3OYFA 4DFJA 4JRPA 3S3OA 3KKRA 3HP9A 1RBRA 4G1QA 4DSJA 4DU4A 4DF8A 2E4LA 1A5WA 1DTQA 4CEQA 2G8VA 1NKBA 3RMBA 5T7BA 3WNGA 1QQCA 5CZ2A 4DLGA 3NH0A 2D0CA 3M8RA 3F73A 1RBVA 4CJPA 3OJSA 3KJVA 4DFPA 4K8ZA 3NGYA 1TK8A 4M3UA 1U47A 4Q0BA 1NK4A 1U45A 4KI6A 1VSEA 4FLUA 1JLBA 3OYEA 4FJ7A 3O4NA 1D5AA 4AHVA 2ZQBA 2Q3SA 3SI6A 1BI4B 3QIOA 4CESA 3NGIA 3E01A 3PUFA 1IKWA 4J2EA 1BGXT 1XHXA 3B6OA 4IKFA 2VWKA 1XC9A 1R0AA 3O3HA 3AVHA 4AHTA 4CJWA 4CJQA 2IS3A 3VQ4A 1VSHA 3OYCA 3LALA 3RMCA 1NJWA 4F2SA 4FLZA 4Z4GA 3VN5A 4LSNA 4K8XA 2HB5A 1S1WA 4RW9A 3VQ8A 1ZBIA 2G8IA 3PV8A 1QSSA 4CHQA 3UIQA 4B3OA 2Z1IA 1KVAA 3IS9A 3V9SA 3ZSQA 3K57A 3CM5A 3OYLA 4DTSA 5HRNA 3O4QA 2GUIA 2BGGA 1HPZA 4W5OA 1U49A 3G0ZA 3WNHA 4CIFA 3SQ4A 2KQ2A 2XY8A 3NF8A 2GBZA 2HHTA 1D9DA 3NFAA 4N56A 1BIZA 4IBNA 1RBSA 3ZSWA 4DQRA 5FRMA 1F21A 1IKVA 4LH4A 4B8AB 3QESA 3ULDA 3ISNC 4ZHRA 2G8HA 4BDZA 4KREA 1LWEA 4CJRA 1NK7A 3H08A 4JRQA 1FXXA 4B9UA 1VSKA 3VQQA 2KZMA 1IKYA 4QCLA 4FJ8A 4E7KA 4DTPA 4Q5VA 3SNNA 4J2BA 1Q9XA 4FW1A 2ETJA 4M3XA 4BDPA 5FROA 2IDOA 3AVMA 4KHNA 5I42A 1JXEA 1S6PA 4DSKA 1L5UA 1A5XA 3WNFA 4CJUA 4CIEA 4DTRA 3AVJA 5DK5A 3KK2A 1EX4A 3PO5A 4DQIA 3K5NA 4CERA 5SWMA 3OS1A 4FJIA 2DY4A 1IO2A 3LWMA 1TK0A 4B9NA 5HRRA 3JYTA 3MEDA 3P83D 3ZT4A 4BACA 4FLXA 4JLHA 5DMRA 4DTJA 3DRPA 1ASVA 3KK3A 4KAZA 4RW8A 1TKXA 3AO5A 4WE1A 4R5PA 1CLQA 1CZBA 5K14A 2PYJA 2HHUA 1HQUA 1LAWA 5J2MA 3EYZA 3P5JA 4ID1A 4M3TA 3AVNA 2OPPA 4CFBA 4KHQA 1JLCA 2YNIA 3CQ8A 3QEIA 3DOLA 4CCHA 1C1AA 3O3FA 1RT4A 3TI0A 2IC3A 1WAFA 4C8OA 3OY9A 3OYNA 4IG3A 4DQQA 1JLAA 3K5LA 3MXMA 2G8FA 4FK2A 1J53A 3LPTA 3HO1A 3AVLA 3K5OA 4DMNA 1T7PA 4N5SA 4O55A 4AHSA 4O0IA 2HMIA 1ZBFA 3WNEA 1RILA 1X1PA 3NH1A 1QTMA 3OYJA 4GW6A 3V9WA 2PYLA 4OGEA 4NCAA 1B9DA 2HNYA 3TANA 1EP4A 2P5GA 2E6MA 4CE9A 3DI6A 4KTZA 3U3YA 3BDPA 1TL3A 1TKZA 4FVMA 5KTQA 2Y1JA 5HROA 1HYZA 4AILC 3QETA 3SQ2A 1X9MA 3SV3A 3CFRA 3A2FA 3NH2A 4H4OA 3V9XA 1HJRA 1RTIA 4CEOA 4CK1A 4CJTA 4CGIA 4CFDA 2P51A 1BI4A 4HUEA 4FJGA 2DTUA 2IAJA 4CK2A 4IDKA 3QIPA 4OPJA 3NF7A 4B9SA 4HCBA 3OYIA 4CJ5A 3NHGA 1HYSA 4CK3A 3I8DA 5JS2A 4FK0A 3ZT3A 4M41A 3EY1A 3TAEA 1NOZA 3AA4A 1SL1A 4W5NA 3D45A 3SCXA 2F8TA 2HVHA 2XRIA 4FM2A 3LP3A 4CJ4A 4FJHA 3TWHA 2DFFA 1S9EA 3KLEA 2PY5A 4DSIA 3KLFA 2O4IA 3AO4A 1W9HA 1UA1A 1JL1A 4FCYA 3SYZA 1WSGA 3VA3A 3L2RA 4F8RA 3RMAA 4J2AA 2X78A 1KSPA 1QS4A 4N47A 2HHXA 2XY7A 1BQNA 4IFVA 3SQ1A 2FBXA 1NK0A 4FJMA 1RDBA 4PUOA 1TVRA 2X6NA 3CFOA 2OZSA 2KFNA 1VSIA 2JGUA 1FKOA 3V9UA 3ASMA 4Z0UA 3VQDA 4OLAA 1KLNA 1VSFA 2YHBA 1S6QA 3VQ5A 3OYBA 3CG7A 4E1NA 3AO2A 4BE0A 1KLMA 1O1WA 1VRUA 4FZYA 1WN7A 3L2QA 3PX0A 4E19A 1VSJA 3M8SA 2OYQA 3VQ7A 1I3AA 2FBVA 1D9FA 4E7HA 3QEVA 4ID5A 4DTOA 3LANA 3OS2A 4EP4A 3OVNA 1IKXA 1RDCA 1Y97A 1RDAA 4HHTA 3AVAA 3HK2A 1S9GA 3DLGA 3ZSXA 2B5JA 4KFBA 3ZT1A 3LP2A 4OJRA 3LAMA 4J2DA 4NYNA 1WSIA 2QK9A 4DFMA 1WNSA 4FJKA 1MU2A 2GV9A 1C0TA 4Y1CA 1RT5A 4CF2A 3LWLA 2P5OA 4FJ5A 2OA8A 2D0AA 1RCHA 4CJVA 1NOYA 2EX3A 2D5RA 3I0RA 4F2RA 3HL8A 3DRSA 4BE1A 4RW6A 3LZJA 2Y1IA 3L2VA 2ATQA 3MEEA 3RWUA 4O5BA 1JXBA 2BANA 3DLBA 5FDLA 2A1SA 4CEEA 3KK1A 1T03A 1T05A 3HXMA 4KI4A 2A1RA 4OPKA 2RF2A 1RT3A 3SUPA 3DLEA 3QNOA 1SKRA 1D8YA 4YNQA 4CJFA 3MXJA 3KD5E 4OKEA 1NKEA 4LH5A 4FJJA 4ELVA 4E0DA 4RG8A 3K2PA 3OYHA 1IG9A 2DFEA 4KHWA 3SPZA 2FC0A 4W5TA 1RBUA 1C1BA 5KRSA 3RRHA 4CJLA 4DFKA 4ZTJA 3SUNA 1WSFA 2KFZA 2R7YA 3L2WA 2ZE2A 3DOKA 3VQ9A 2OPSA 3K59A 4FK4A 2YKMA 4PA1A 3VQPA 4CJSA 4FXDA 4IFYA 2HW3A 1JLGA 1TKDA 3MXIA 4N76A 4W5RA 1HRHA 2B6AA 3V1OA 3P1GA 4FLVA 3G10A 2Z1JA 4E3SA 4FJNA 4E7LA 1NJYA 3K5MA 1U04A 2YNFA 1NK6A 4FJXA 2QKBA 3HYFA 5KGWA 5KI6A 3C6TA 3AVGA 3HJFA 3K58A 4MQ3A 4FJLA 1JLEA 4NCBA 1FK9A 4DTUA 1GOAA 4KKOA 3V6DA 1Q8IA 4LY7A 3TABA 1X9SA 4FM1A 4CFCA 4CF8A 3S9HA 5HP1A 1XHZA 1T8EA 3KD1E 4CGHA 3TARA 1KVBA 3NE6A 4I2QA 2KTQA 2JLEA 4DQPA 1KFSA 3THVA 1NK8A 3V1RA 4BE2A 3T3FA 3OS0A 3ZT2A 3AO1A 1Z26A 3QERA 1SUQA 3HPOA 4C8MA 1RT2A 5D3GA 3LPUA 4XIUA 2IGIA 2WONA 1VK0A 2F8SA 3C6UA 2D0BA 4NCGA 1DTTA 3VA0A 1YT3A 4KO0A 1YVUA 4KB0A 3MECA 3RRGA 2WOMA 4TSXA 3OYKA 4E1MA 4F3TA 4CECA 2G8UA 3QEPA 3SPYA 4C8LA 1LWCA 2XO7A 1S1TA 3AV9A 4CF0A 3PO4A 2G8KA 1KVCA 4MFBA 1EETA 1S1VA 4GVMA 3C94A 1JKHA 4OGCA 4O44A 4CGGA 4CHOA 1JL2A 2YNHA 4CIGA 3JSMA 3KTQA 3NAEA 1BL3A 3S3MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O1WA 4AH9A 1ITGA 1B92A 2FBTA 3OTOK 5C25A 4DQSA 3HTVA 3SAGA 3ZSYA 4BQLA 4CHZA 3ZX2A 2YJFA 2ZWHA 2XHBA 2A5XA 4B9LA 5EVZA 3OYAA 4BRMA 4BDYA 3THYB 3P38A 4E7IA 1RTDA 3LDSA 1R59O 3ATUA 4JHDB 4KTQA 3F9MA 5AQQA 3TAFA 5C2DA 4PKIA 2IIRA 4C8KA 1XI1A 3MMVA 3ALYA 3KLGA 5AQIA 4KHPK 3K9KA 4RTFD 3KKSA 1L3SA 3QB0A 2DFHA 3H6EA 4RWTA 4CZEA 1XMQK 4M42A 2I7NA 2GTDA 1ZBUA 2RPIA 5CE3A 3J7AP 1IJJA 4YFUA 3OYDA 1ZBHA 3MEGA 4RCHA 4DS5A 3MN6A 4CHYA 2HNZA 2OTJN 1WSEA 1ZXOA 3AA5X 2YV0X 1CXUA 1GLBG 1U2VA 5FRNA 4YHHK 1K8KA 3ENHA 3U8XA 1T6CA 1RNHA 5AQLA 2XY5A 2Q97A 1HLUA 3HT3A 2UYTA 1JLQA 1HKGA 5EU7A 4B3TK 1BHLA 4CD3A 4CF9A 3DLLL 3KWGA 1DKGD 3VPZA 5E41A 3NBPA 4JK8A 4EZ6A 3NF6A 1WLJA 4CJEA 4B9TA 4BC3A 1G99A 1VQPN 3HPGA 2FLOA 2HBKA 5FPDA 4E89A 5KRTA 3ULEB 1VSMA 3DJCA 4KB1A 5JS1A 1YUWA 3UKRA 4CGJA 1ZYQA 1HX1A 1HNZK 3CERA 4C8NA 4QOZB 1JCFA 1LW2A 3DLHA 3QEXA 3QEWA 3U6FA 3HRGA 1OH8A 1V4SA 3D2EB 4WFBL 4IXCA 3TPQA 1JLFA 4DLEA 4FO0A 5HRSA 2Q36A 3DMJA 3ZSZA 3THYA 4BWMA 4WFAL 2F96A 3G4SN 3DXMB 4F4KA 2RHKA 3TSPA 2HHWA 3ITHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O1W A;  4AH9 A;  1ITG A;  1B92 A;  2FBT A;  3OTO K;  5C25 A;  4DQS A;  3HTV A;  3SAG A;  3ZSY A;  4BQL A;  4CHZ A;  3ZX2 A;  2YJF A;  2ZWH A;  2XHB A;  2A5X A;  4B9L A;  5EVZ A;  3OYA A;  4BRM A;  4BDY A;  3THY B;  3P38 A;  4E7I A;  1RTD A;  3LDS A;  1R59 O;  3ATU A;  4JHD B;  4KTQ A;  3F9M A;  5AQQ A;  3TAF A;  5C2D A;  4PKI A;  2IIR A;  4C8K A;  1XI1 A;  3MMV A;  3ALY A;  3KLG A;  5AQI A;  4KHP K;  3K9K A;  4RTF D;  3KKS A;  1L3S A;  3QB0 A;  2DFH A;  3H6E A;  4RWT A;  4CZE A;  1XMQ K;  4M42 A;  2I7N A;  2GTD A;  1ZBU A;  2RPI A;  5CE3 A;  3J7A P;  1IJJ A;  4YFU A;  3OYD A;  1ZBH A;  3MEG A;  4RCH A;  4DS5 A;  3MN6 A;  4CHY A;  2HNZ A;  2OTJ N;  1WSE A;  1ZXO A;  3AA5 X;  2YV0 X;  1CXU A;  1GLB G;  1U2V A;  5FRN A;  4YHH K;  1K8K A;  3ENH A;  3U8X A;  1T6C A;  1RNH A;  5AQL A;  2XY5 A;  2Q97 A;  1HLU A;  3HT3 A;  2UYT A;  1JLQ A;  1HKG A;  5EU7 A;  4B3T K;  1BHL A;  4CD3 A;  4CF9 A;  3DLL L;  3KWG A;  1DKG D;  3VPZ A;  5E41 A;  3NBP A;  4JK8 A;  4EZ6 A;  3NF6 A;  1WLJ A;  4CJE A;  4B9T A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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