3MN7A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 108
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn7A03
2Q0UA 1TYQB 3R6MA 3L0QA 3J8AA 2QWNA 3SMSA 5JLFA 5TKYA 3EN9A 3D2EA 3D7EO 4H0XB 1KAZA 4JD2A 4BRCA 2FLOA 1JCEA 4H5VA 5AQLA 3BF3A 1BO5O 3UKUA 4BR2A 1BWFO 4AM7A 3CIPA 1NGDA 3U8XA 2E1ZA 4EFHA 3HTVA 2EWSA 3D2EB 1QQNA 1NWKA 4H0PA 3HBTA 3M3ZA 4JD2B 3MK6A 5EOYA 3VEZA 2W41A 4PKHA 1NLVA 2P9IA 4B1WB 2ZF5O 3B8AX 4XH4A 1ZBSA 3ZX3A 4JHDA 2FF6A 3R8EA 4FPBA 5LJVA 4K42A 1YUWA 4FWLA 3M1FA 1SAZA 2A5XA 3QFUA 5E26A 2E1YA 5AR0A 2ASPA 1G99A 3HM8A 2VWBA 5AQMA 4H0VB 5EVZA 4XH1A 4BVOA 2VCPA 4E1JA 3AAQA 4QS8A 1JCFA 3LDLA 2NRHA 2QW9A 3QFPA 1BG3A 2YHWA 2Q36A 4C23A 4B1VA 5JICA 4FWRA 3CJ9A 4I6MA 1NBWA 3VEYA 4B9QA 3S41A 4RWTA 1WOQA 4QS7A 4H5RA 4J8FA 3O5BA 3FR0A 4CBWA 5AQPA 3UE5A 1MDUB 4CZFA 1K8KB 5ADXA 5AQNA 5AZJB 3GOIA 3FFKB 3CJCA 2P9SA 1C0GA 3EKUA 4I6MB 4H5TA 1MWMA 5BRHA 5I9EB 5AQRA 3UKRA 1NMDA 4H5NA 3MCPA 2P9NB 4BRPA 5AQTA 4DHYA 4AM6A 1YVNA 1HJOA 3LDOA 3SJHA 4CD3A 2QM1A 1GLBG 4BR5A 1IJJA 4PKGA 3VESA 2IVOA 5B8HA 2P9SB 2HF3A 1TUYA 2CGLA 4H03B 4BRAA 4BG8A 1Z05A 3MN7A 1U2VB 3KHYA 3IDHA 4A61A 3VEWA 1MA9B 3LDPA 2CH6A 2A6AA 4JN4A 4BR7A 2GWKA 4CZKA 4CZMA 1X3MA 3EZWA 4BREA 3C7NA 3FZKA 3H1QA 2FSJA 3AAPA 3GBTA 3H1VX 4FOEA 2D0OA 3WEEB 5BN8A 2KHOA 1ESVA 1NGJA 5LY3A 2QWLA 1KAXA 4PKIA 4EHUA 4FWPA 4BROA 5KQ8A 4RTFD 3ZX2A 3DAWA 5BPMA 1V4SA 3FGUA 3LM9A 5BRFA 5LJWA 3CJAA 2D0PA 3DXMA 3MN9A 5AQHA 5CE3A 2VYPA 5FPEA 4WQ4A 1GLEG 3A0IX 1R59O 1H1VA 2V7YA 3ATUA 4IO8A 2ZGYA 3D2FA 2E8AA 3DXKA 2CGKA 2QXLA 3FLCO 1NGCA 3LDNA 4LC9B 5EX5A 2PAVA 1HX1A 4ISFA 1XUPO 3UB5A 3DXMB 3DJCA 3VERA 4BGAA 3AARA 3RSEB 2GTDA 3H6EA 4O5FA 2F9WA 3AY9A 5ELZA 3OHRA 3CERA 3GE1A 4DB3A 3H46O 3D2FB 4M7XA 3WXKA 5AQIA 3BP8A 1NGBA 3C0BA 1HUXA 1D4XA 3EO3A 4IXCA 2NLXA 2OANA 2P9LA 3ZEUA 4FWMA 4BRIA 4BVPA 3JXUA 3A5OC 1QHAA 3FZLA 1DGKN 3UKUB 4BRGA 4BC5A 1QQOA 3LDQA 5KQDA 1EQYA 1NGHA 2I7PA 5AQFA 2YJFA 1DEJA 3HSCA 4CZLA 1GLFO 2P9LB 4WQ4C 3A5LC 2P9IB 3VGMA 1X3NA 1HPMA 4GNIA 4XEIA 4JHDB 5AQOA 2GWJA 3EL2A 3VGKA 2YCHA 4CZJA 3O6WA 2E2PA 3TPQA 4MLHA 5KPRA 3WUHA 4FSVA 5BPLA 1NM1A 4CD1A 3A5NC 5EY4A 5JLHA 2V51B 1IG8A 1P8ZA 3LL3A 4FWKA 3CQXA 1E4GT 2P9UA 4BRMA 1NGAA 1CZAN 3FZHA 4IZ9A 2P9KA 1RDWX 2E88A 2YJEA 3MDQA 1NGFA 2E2OA 2ZWHA 2PBDA 1BA1A 3GG4A 4MLEA 5E84A 3U9DA 1S3XA 3QBXA 4GY2B 4B1XB 4CZIA 4A2AA 3ATVA 4XH5A 1HKGA 2P9UB 4PL7A 2HMPA 1HLUA 4BC4A 2V7ZA 1ATNA 5F0XA 5KPTA 1HKBA 2IVPA 5AQJA 5AQWA 3UKRB 1SZ2A 2FSNA 2A40A 3O1WA 2ITMA 3GL1A 1NGGA 4EHTA 5AFUA 4YDUA 1Q18A 2CGJA 2P9PA 3W0LA 2AA4A 4FPAA 2E20A 3CQYA 5ADXH 3A5MC 2IVNA 1GLJO 4BRQA 4WYBA 3O1BA 1BA0A 2A41A 3QMLA 4RCHA 5AQUA 4B1ZA 4CI6A 5BPNA 1SQKA 4H5WA 4KBOA 3VEOA 4BC2A 3QBWA 1BUPA 3HZ6A 4BRNA 2GEMA 4BR4A 4M7YA 5AQVA 4H0TB 3O4WA 3ENHA 3C7NB 4FWQA 4NO7A 1HKCA 1GLAG 3P4IA 3L4IA 2E2NA 2Q0RA 5F2RA 2ZGZA 3WT0A 4BQLA 5AQQA 1YXQA 3H3OB 4EAHD 1LCUA 3VEXA 4FL9A 2HF4A 3WXIA 5AQGA 4BRDA 4DQ8A 1V4TA 1XC3A 4BGBA 1TYQA 3CHWA 5BRDA 2E2QA 1QQMA 1KXPA 3SLCA 4HTLA 3BUZB 2W40A 1C0FA 1ZXOA 4Y0WA 3TU5A 3CJBA 3WQTA 2YI1A 1QZ6A 1T6DA 4BRLA 4YDUC 3DXKB 2IIRA 3CETA 4CZGA 1GLLO 3KZBA 5BR9A 3VGLA 2Q1NA 4IJNA 4K41A 3FZFA 2QWOA 3ZX0A 5JMVA 3BEXA 1NGIA 1BU6O 2J4RA 2CH5A 3U9ZA 2Q2RA 4K43A 1X9JA 1QZ5A 2F9TA 3SMPA 1S22A 4EIAA 2V52B 1BOTO 3SK3A 2Q31A 4FWNA 4FO0A 4CBXA 4ISGA 4ISEA 1Y64A 4BQZA 4BR9A 5BREA 5AQYA 3ZEUB 4HWIA 1WUAA 1E4FT 4BG9A 1RGIA 2BUPA 3U4LA 2GUPA 1YAGA 4JNEA 3VOVA 4FWOA 3ULEA 3IUCA 2I7NA 3JS6A 5AZIA 4JAXA 4CJ7A 4K25A 2QWQA 1XQSC 3ZETA 4H0YB 3MN6A 4WQ5C 4DCHA 5AQSA 4MO5A 2A42A 3F9MA 1K8KA 3I33A 5AZJA 3VPZA 3QDKA 4FOIA 2D1KA 2WUSA 2NZTA 3ULEB 3IFRA 3FZMA 1T6CA 5BN9A 5AZIB 2FF3B 2P9NA 4PL8A 3ZETB 3A8YA 1KAYA 1T44A 3O08A 1OKJA 3FE1A 1DKGD 3VEVA 1J6ZA 4CZEA 4Z94A 3O80A 2BTFA 2QWPA 4NB4A 3G25A 4QS9A 2P9KB 3WXJA 1LOTB 4B1UB 3GDQA 3MMVA 3HI0A 2QWMA 1U2VA 2A3ZA 5AQKA 5AQZA 5AQXA 3O8MA 4BRKA 1GLCG 5F1XA 3QICA 2FXUA 3I8BA 4M63C 3R9PA 1BDGA 4F9OA 3WEEA 5FPNA 3QB0A 3VETA 5EXWA 3EKSA 2H3GX 2UYTA 3BF1A 3L6QA 4FWSA 4H0OA 3VENA 4BRFA 4BR0A 2P9PB 4MO4A 2FSKA 4BRHA 4O8KA 3LM2A 3MN5A 1ATRA 1GLDG 1TUUA 4A62A 2AP1A 1RFQA 2DPNA 2ASOA 3CI5A 5FPDA 2YHYA 3CJ7A 4BC3A 3VF6A 4B1YB 1NGEA 3VF2A 1MWKA 3IMXA 3WQUA 3KVGA 3CJ1A 2HOEA 3WXLA 2D4WA 2YHXA 3ENOA 3W3DA 2Q97A 3M6GA 4L3QA 5KPZA 2QWRA 5AFUH 5FPMA 3ID8A 1JCGA 4IWVA 4IJAA 3VF4A 2ASMA 4WQ5A 4CZHA 1ATSA 3DWLA 2GELA 1U6ZA 3H3NO 3RSEA 3H45C 1Z6RA 4A2BA 4CBUA 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UA1A 1VRUA 2QKBA 1VQ4N 3R6MA 5TKYA 3D2EA 3KLHA 4H0XB 4JD2A 3NH1A 2HBMA 1NNEA 1JCEA 5CYQA 3HYFA 4ZTFA 1WSIA 3PX4A 3EEQA 4FLUA 4N47A 4FK2A 4PA1A 4IOCL 1RBRA 4DSLA 4M45A 1QQNA 4GMJB 1NWKA 3MK6A 2W41A 4PKHA 1K6YA 4FZZA 4B1WB 2OYQA 3KLEA 5FROA 3ZLJA 3QEVA 4LFAK 3CCJN 2FF6A 3R8EA 4K42A 5GADP 1JLFA 4FWLA 4FJNA 3QFUA 2NNWA 1DTTA 4DFKA 2E1YA 4DKWA 2E5LK 3HM8A 3MX2A 4JI1K 3U3GA 2HVHA 3RR7A 3AAQA 4QS8A 1XHXA 1KLMA 4RW4A 3H08A 3SPYA 2YHWA 1KVCA 3HVRA 4B1VA 1JLEA 3RRHA 2OPSA 4DR5K 1YTUA 3U3YA 3S41A 2KZZA 4M3WA 1IBMK 3CM5A 4EZ9A 4CHYA 4J8FA 4YNQA 4DU4A 3MEGA 4CBWA 3UE5A 2GBZA 4CZFA 4YOUA 5AZJB 1VRTA 4CFBA 3L8BA 3MWTA 3SV3A 4IFVA 4LF8K 1TL1A 2A1SA 3SBGA 1C0GA 1CXUA 4CGIA 2IAJA 3THXB 4H5TA 4DS5A 3UKRA 1U47A 1JLAA 4DHYA 1HJOA 1HJRA 1NMNA 5M1FA 3QLHA 3RMCA 4JYAK 1Q81O 2IVOA 2P9SB 4CJEA 2F7TA 1NJIO 2CGLA 3TTDA 3NF8A 3LP3A 3IDHA 4OJRA 4F4KA 1MA9B 2FBVA 1EX4A 5HBMA 1W0HA 3QETA 3CYMA 4CZMA 2Z1HA 2O8EA 3GBTA 5CHIA 3E9OA 4B3OA 4IG3A 4OPAA 2KHOA 1NGJA 5JENA 2UXCK 4FJXA 2ZE2A 4PKIA 4L8RB 3SUNA 2WC9A 5J1EA 4NLCA 4RTFD 2D0BA 4I9QA 4BDYA 5BPMA 1TKTA 5C12A 2PFUA 1F21A 3IG1A 3QEXA 4K8ZA 2EHGA 3CJAA 2D0PA 3DXMA 5C25A 3ZSWA 1GLEG 2G8VA 3ZCMA 1H1VA 2A1RA 3TAFA 1TAUA 3S5TA 1JXBA 4JS5A 1NJXA 1WBDA 4F3TA 2CGKA 3THYA 2PAVA 2PY5A 1ITGA 4R5PA 4KFBA 3DJCA 4PQUA 1HYSA 1N33K 4BWJA 3RSEB 3H6EA 3AY9A 4HVJA 3CG7A 2KQ2A 3CERA 1WSEA 3H46O 1VSFA 4M7XA 1N5YA 3WXKA 2NRTA 3LDSA 1T7PA 2OANA 3TWHA 3KLIA 3ZEUA 4FWMA 4HUFA 4BVPA 1Q8IA 4BC5A 1WAJA 3LDQA 1C6VA 3U6FA 3HSCA 4Y1CA 4CZLA 1FK9A 3S3MA 4K8XA 2P9LB 1S6QA 4OPJA 3K0SA 5FRNA 3V4IA 4XEIA 1NJWA 3MXMA 3OYLA 2YCHA 3BDPA 1NK5A 2E2PA 4I9LA 4IEIA 3SUQA 4DTXA 4J2DA 5EY4A 1G15A 1P8ZA 1C1BA 3LL3A 3L2QA 1S1TA 3L2UA 5IT9O 3FZHA 3M8QA 2E88A 3KLGA 3CFRA 1D9DA 1NGFA 3OYFA 1BA1A 4EP4A 3C6TA 4DF4A 1Z26A 3G0ZA 4WFAL 3U9DA 4TSXA 1ZBFA 4GY2B 4B1XB 3OBYA 3ATVA 1HKGA 2BE2A 2P9UB 3TTFA 4FVMA 4FW1A 4IG0A 4KHPK 1HLUA 3K59A 1U4BA 2V7ZA 5F0XA 5KPTA 2C1GA 5AQWA 4ILHA 3UKRB 1SKWA 1BL3A 3QIOA 2A40A 3O1WA 3GL1A 2G8FA 4PY5A 4DTRA 2P9PA 2AA4A 1BQNA 3CQYA 1QQCA 4JKGA 3KK1A 4GVMA 4BRQA 4CJ5A 4WYBA 4CJWA 3MXIA 3LANA 1VSMA 4X64K 3PUFA 4JLHA 4BWMA 4DV0K 2RHKA 1SQKA 3VEOA 4K0KK 4I2QA 2Z1GA 5C2DA 3RWUA 2HHIA 4E7JA 1NG9A 2O8FA 2GEMA 3AO4A 3ENHA 3TI0A 3P4IA 4DTUA 4DSIA 4CK1A 2D0CA 3LPTA 3VQ7A 5AQQA 2OTLN 4QAGA 1J54A 3PLAA 1WNSA 4Z4HA 4DQ8A 3CHWA 3NHGA 2IGIA 2GUIA 3BUZB 4HTLA 1Z25A 1ZXOA 4MQ3A 4Y0WA 4KAZA 2YI1A 2X74A 5M1NA 4BRLA 1VSKA 4LF5K 3THYB 4NYNA 2KZMA 3CETA 3DLHA 3BY5A 3KZBA 3VGLA 4FZXC 2Q1NA 3SQ2A 4KHUA 4K41A 4FM1A 1LAVA 2KTQA 4IO9L 4WCEL 3J7YP 2CH5A 4K43A 5KTQA 3HJFA 1S22A 2RN2A 3AO5A 1HNVA 3IAYA 3MEEA 2HBJA 3SAHA 3VQCA 1TK8A 2EX3A 4KTZA 2YNHA 4KH4A 4NCGA 3PV8A 3AVJA 1VSEA 4JI2K 4DF8A 4ISEA 2G8IA 2E6LA 5BREA 3ZEUB 4JKBA 4XIUA 4CJLA 4I2PA 4C8KA 1IBLK 2X6SA 1S9EA 3AVBA 3DOLA 3VOVA 4FWOA 4BE1A 3OYBA 1SL0A 3ZETA 4DCHA 4LH5A 3F9MA 3J7ZO 4W5TA 1K8KA 3OYCA 4CIFA 4JKFA 4O55A 3DI6A 2WUSA 3ULEB 5BN9A 5AZIB 2FF3B 1BI4A 1A5VA 2P9NA 3IRXA 3AA4A 3S3NA 2HVIA 1KAYA 1T44A 3O3GA 4E7HA 3VN5A 4C1NI 3NVMA 1DKGD 4LFCK 4DTMA 2ITGA 4C8OA 3LP1A 4A59A 5JVGL 4CJVA 5C10A 4CJPA 2XY8A 3GDQA 1TV6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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