4GNIA

Structure of the ssz1 atpase bound to atp and magnesium
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
391
structure length
385
Chain Sequence
RVVIGITFGNSNSSIAHTVDDKAEVIANEDGDRQIPTILSYVDGDEYYGQQAKNFLVRNPKNTVAYFRDILGQDFKSVDPTHNHASAHPQEAGDNVVFTIKDKAEEDAEPSTLTVSEIATRYLRRLVGAASEYLGKKVTSAVITIPTNFTEKQKAALIAAAAAADLEVLQLISEPAAAVLAYDASDKIIVVADLGGSRSDVTVLASRSGMYTILATVHDYEYHGIALDKVLIDHFSKEFLKKNPGAKDPRENPRSLAKLRLEAESTKRALSRSTNASFSVESLIDGLDFASTINRLRYETIARTVFEGFNRLVESAVKKAGLDPLDVDEVIMSGGTSNTPRIAANFRYIFPESTRILAPSTDPSALNPSELQARGAALQASLIQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Putative heat shock protein
publication title Structural characterization of a eukaryotic chaperone-the ribosome-associated complex.
pubmed doi rcsb
source organism Chaetomium thermophilum var. thermophilum dsm 1495
total genus 131
structure length 385
sequence length 391
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-08-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4gniA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gniA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4gniA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4gniA04
2IIRA 3QICA 3TU5A 5FPNA 3WQTA 3A5LC 3KHYA 2QWPA 3C0BA 1G99A 3H6EA 3QBXA 3FZHA 1H1VA 2F9WA 4BRQA 4IJNA 3WXLA 5AQGA 2FSKA 2D4WA 4RWTA 3EKUA 3R8EA 3H1QA 4M63C 4K25A 1QHAA 1RGIA 2E2OA 3VGKA 4JHDA 4BQLA 1MA9B 2GWJA 2GWKA 4F9OA 3VEXA 4DQ8A 3VF6A 2VCPA 3U4LA 5BR9A 3FZKA 5BN9A 4B1YB 4B1WB 4PL7A 3O80A 3FR0A 5TKYA 5AQHA 3GG4A 1IG8A 3FE1A 1V4SA 4AM6A 1QQOA 3RSEB 2E2NA 4K42A 1X3MA 3VEWA 1BDGA 1ATSA 2ZWHA 4FWMA 1LOTB 4FO0A 4BGBA 3TPQA 3QBWA 4BRFA 1JCEA 5AR0A 3O5BA 4FWOA 3VF4A 4AM7A 3FZMA 3IUCA 3MDQA 4B9QA 2V51B 2KHOA 2ASPA 3AAPA 1S3XA 3A8YA 1MWMA 1GLBG 3WT0A 4B1UB 3ZETA 2E1YA 4E1JA 2AA4A 3QFPA 4PKHA 4BRLA 2VWBA 2A3ZA 3LDOA 3ZETB 2Q2RA 1NBWA 4H0VB 4H03B 1BA1A 5EOYA 3VERA 3VEVA 3IFRA 3WXIA 3M6GA 4FPBA 3CETA 4CD3A 2QWMA 3A5OC 1XC3A 3L4IA 4XEIA 4I6MA 2W41A 3LDNA 1YXQA 1NGHA 3ENOA 2A40A 3GL1A 1TUYA 4NB4A 4I6MB 3U9ZA 4CZKA 4EFHA 4FL9A 3BF3A 5AFUA 4XH1A 1JCGA 3SLCA 4FWRA 2FSJA 3UB5A 1D4XA 2A6AA 4EIAA 4FWLA 4BRIA 2Q0UA 5KPRA 3GOIA 3O4WA 2Q0RA 4BC4A 1ZXOA 3WEEB 1YVNA 4H0OA 3BF1A 1GLCG 4Y0WA 2A42A 4CBXA 2I7PA 1E4FT 2WUSA 5F1XA 3ZEUA 5LJVA 4BR0A 4FPAA 3ZX2A 3ZX3A 2QW9A 3LM9A 5AQSA 3ZEUB 3OHRA 2EWSA 1ESVA 3AAQA 1KAYA 5AQKA 2J4RA 2Q97A 4IZ9A 5BPMA 1DKGD 3BUZB 2I7NA 4CJ7A 1J6ZA 1RFQA 2IVPA 1NGEA 5EX5A 1NGDA 1TUUA 3MN7A 4BVOA 1YAGA 2UYTA 3HZ6A 4H5RA 1E4GT 2V52B 4CZIA 4LC9B 3QB0A 4RTFD 3AARA 1SAZA 4BG9A 3VESA 3VGLA 2YHWA 3MK6A 5E26A 1HPMA 3UKUA 4CZLA 3B8AX 4CD1A 2Q1NA 1NWKA 3D2EA 2E2PA 3UKUB 1WOQA 5CE3A 2QXLA 1C0GA 5F0XA 4K43A 3W3DA 3HM8A 4CBUA 5ADXH 4B1XB 2A5XA 1BU6O 4FWPA 4WQ5C 1HKCA 3UKRA 5FPMA 1BOTO 1R59O 3CIPA 4JHDB 4WQ4C 3VGMA 5BN8A 4BR4A 4WQ5A 4BRPA 4BRCA 4EHTA 3UKRB 5AQIA 4WQ4A 1GLDG 4PKGA 4CBWA 1X9JA 1CZAN 1MWKA 1X3NA 1ATRA 3EN9A 4IXCA 1QZ5A 5AQJA 3I8BA 5KQDA 5BPLA 3ULEA 3HSCA 1BA0A 2E8AA 2FF3B 4IJAA 3VENA 3WQUA 1XUPO 2ASMA 3ULEB 2W40A 3FLCO 3C7NA 1QZ6A 2CH6A 2P9KA 2HF4A 4XH4A 2QWLA 3C7NB 3DWLA 2P9KB 3H46O 1NGCA 5AQNA 4M7YA 5AZIA 4FWKA 2CH5A 1OKJA 3VEOA 4BRKA 5FPDA 4A2AA 4BR2A 1QQMA 3GE1A 3JXUA 5AZIB 4CZHA 3BP8A 3M1FA 2GELA 1SQKA 3P4IA 2E88A 1YUWA 3AY9A 3I33A 5AQLA 4BR5A 4GNIA 2A41A 3MN9A 1HKBA 3LDQA 1SZ2A 2Q31A 4BRMA 2Q36A 4FWQA 4J8FA 4C23A 4L3QA 1HUXA 2P9SA 3CERA 4QS8A 2GTDA 4BRHA 5AQVA 3IDHA 5BPNA 2P9SB 1GLAG 3R9PA 3O1WA 4H5NA 1XQSC 5JLFA 3QMLA 3U9DA 4BG8A 3ZX0A 5AQXA 4CI6A 4BGAA 4EAHD 3CQXA 3WUHA 3H3NO 1NM1A 3HBTA 2QWOA 3LM2A 4FOEA 1KAXA 4PKIA 3DAWA 2VYPA 4O8KA 3EZWA 1Z05A 1TYQA 3M3ZA 5BRHA 3MCPA 1HX1A 3EL2A 4H0PA 1T44A 1TYQB 1GLFO 5ADXA 3BEXA 3R6MA 1S22A 4CZGA 3FGUA 4BC5A 2ZGYA 4FWNA 1Z6RA 4H5VA 3KZBA 3O8MA 4HWIA 1Y64A 3D2FA 2FXUA 4FWSA 4H0XB 1HKGA 4BR7A 2HMPA 4A61A 2E1ZA 2FLOA 2BUPA 3D2FB 1NGGA 5AQZA 1ZC6A 1BUPA 3O08A 4ISEA 5AQYA 1V4TA 2P9LA 1NGJA 2YHXA 3D7EO 3W0LA 5FPEA 1DEJA 2P9LB 3O6WA 1U2VA 3S41A 3CJBA 3MN5A 3CQYA 2PBDA 4KBOA 3D2EB 2PAVA 3VPZA 5I9EB 4JD2A 1ZBSA 3ATUA 2NRHA 2D0PA 3U8XA 5AQFA 5LJWA 4BRGA 5B8HA 3VEZA 1GLLO 1LCUA 4IWVA 4JD2B 5BRDA 1NLVA 4WYBA 4Z94A 2D0OA 2CGKA 3CHWA 5AQMA 2QWNA 1DGKN 2YJEA 3H45C 5AZJA 2GEMA 2CGJA 3ENHA 1EQYA 3DJCA 4CZEA 2IVNA 2AP1A 5AQUA 5AZJB 3SK3A 1Q18A 5E84A 2OANA 2P9PA 3H3OB 1IJJA 2CGLA 4BRNA 3A5MC 4BC3A 2NZTA 2P9PB 4A62A 4BVPA 3IMXA 3RSEA 2QWRA 3A5NC 3ID8A 3QDKA 3H1VX 3WXKA 4M7XA 3CI5A 1RDWX 1NGAA 2IVOA 3KVGA 4B1VA 5ELZA 3SJHA 2YCHA 3VOVA 2V7ZA 4BRDA 3MMVA 3CJ9A 4BRAA 1QQNA 2V7YA 3A0IX 3LL3A 4CZMA 3DXMA 4XH5A 3MN6A 5AQOA 3LDLA 2F9TA 1NGIA 2BTFA 3DXMB 3EKSA 1K8KA 1U6ZA 4MO5A 4FSVA 1P8ZA 5AQTA 4CZFA 3FFKB 5BREA 1K8KB 3JS6A 5KPZA 1GLEG 4JAXA 3O1BA 3CJ7A 4ISGA 3CJCA 2P9IA 5EY4A 1NGBA 1HLUA 1KAZA 2FF6A 4GY2B 4BQZA 3J8AA 4RCHA 2NLXA 2P9IB 2ITMA 4ISFA 4EHUA 1T6CA 4B1ZA 1JCFA 4JN4A 5KQ8A 3DXKA 2DPNA 3EO3A 3L6QA 2H3GX 1T6DA 4PL8A 4H0YB 2ZGZA 1BG3A 4HTLA 4BC2A 3DXKB 3SMPA 3F9MA 3LDPA 1MDUB 5AQWA 2P9NA 5JMVA 5AQRA 4YDUC 1BWFO 3HTVA 3SMSA 1NGFA 2E20A 2YHYA 4JNEA 3WEEA 2P9NB 5EXWA 5F2RA 4YDUA 1KXPA 5AQPA 2QWQA 5JICA 1C0FA 1WUAA 3ATVA 4H0TB 4K41A 1GLJO 4BR9A 2HOEA 3VEYA 3FZFA 2YI1A 2ZF5O 5KPTA 2YJFA 2HF3A 2P9UA 4O5FA 3CJAA 3FZLA 1NMDA 1HJOA 4H5TA 4MLHA 5AQQA 2D1KA 2QM1A 3WXJA 4BREA 2FSNA 2P9UB 2ASOA 4FOIA 3L0QA 5AFUH 2E2QA 5LY3A 4IO8A 3GBTA 4DCHA 3QFUA 4H5WA 2GUPA 4DHYA 3CJ1A 4NO7A 4QS7A 3UE5A 3HI0A 4DB3A 5JLHA 4MO4A 3GDQA 3VETA 3G25A 1ATNA 3VF2A 4CZJA 5EVZA 1BO5O 4QS9A 4A2BA 4MLEA 4BROA 5BRFA 1U2VB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LWEA 4M3YA 2PYLA 4PA1A 1TL1A 4NYFA 2YHAA 4HUFA 4BDYA 3NDKA 3WXLA 2NRZA 4DLEA 5AQGA 2D4WA 4RWTA 3VQ7A 3E9LA 3H1QA 3HOSA 1ASUA 2E2OA 1RGIA 3AV9A 4BQLA 1MA9B 4F9OA 3HPGA 4DQ8A 3OYEA 4OLAA 1ZVEA 1RTJA 4JI6K 4RW4A 1NJIO 3O80A 2IS3A 3FR0A 1LWCA 3GG4A 3PUFA 4H4OA 1T7PA 1QQOA 2N2QA 1IKVA 1X3MA 4RW9A 2OTJN 4M3RA 1NJWA 1WBBA 3SAFA 1Q7YO 3O4QA 4AILC 4XIUA 1JZBA 1JCEA 3S9HA 1DTTA 2R7YA 5M1KA 3IUCA 1WN7A 1S5JA 2KHOA 4CIEA 2LR3A 4E1JA 2Q3SA 5J2QA 4BRLA 2VWBA 2A3ZA 3E01A 3ZETB 1NH5A 1QSLA 4CJTA 1X9WA 4CK1A 3KOWA 3ZT1A 1LQHA 4DLGA 3VERA 4DQPA 4FPBA 3D0PA 3LAMA 1XMOK 4E7LA 3GL1A 4HVJA 4Z4HA 4N56A 2O8CA 1YIJN 2OCEA 4FL9A 1NU0A 4CERA 1IBLK 1ZYVA 1T05A 1TKDA 4DR7K 1ZBIA 2BDPA 2FSJA 2HBKA 4KV8A 1WSHA 1WSIA 1HYZA 4FZZA 2YNFA 4LF8K 2ATBA 4BRIA 3WNHA 4CJVA 3PLAA 3O4WA 3PV8A 2C1GA 2Q0RA 4LD0A 1ZXOA 3JAMO 3DYAA 1EWQA 1RTIA 2XY5A 4YOTA 3TR8A 5J1EA 2VQEK 1PE4A 1IV0A 4FPAA 3ZX3A 4E7KA 2QW9A 3LM9A 4KHYA 4GMJB 2JGUA 4HUEA 3AAQA 3HSTB 1VQLN 2HBLA 1VQPN 4CJ7A 1RFQA 3O4NA 2ZE2A 1BI4B 1DLOA 1NGDA 3AVLA 3DRSA 4B08A 2KLAA 1ZFUA 1T7EA 4RTFD 1YVUA 3AARA 4JI3K 3JSMA 4AHVA 4ELUA 4KRFA 3WNEA 4CEEA 1UWBA 4PQUA 2PZSA 1PX9A 4AF1A 5CE3A 1C0GA 4IFEA 1I6FA 3AVCA 1A5XA 3HM8A 4M42A 3QEIA 3V9SA 4LY7A 1NOYA 2GV9A 3UKRA 2Y1IA 3CIPA 3PIPL 4BRCA 3OYDA 3KHWA 3P38A 1L3SA 3NVKA 4DUZK 3AA4A 4GVEA 1CZAN 2YIOA 1ATRA 1S6PA 3O9TA 2G8HA 3OYNA 3V9ZA 5BPLA 3HSCA 2D0AA 2E8AA 1YHQN 2K35A 1NK0A 3MCAB 4DSKA 2FBXA 4GV6A 3ULEB 4CGIA 3L2QA 1RDDA 4N47A 4BWMA 3SQ1A 4JLHA 3QLHA 4IKFA 5SZTA 2E2FA 1AHOA 4J2DA 1ZBUA 2WBNA 3DWLA 3KP0A 3TTFA 3PX0A 5I42A 1NGCA 1RBSA 1TL3A 4FWKA 2QKBA 3RVCA 1RNHA 2N2RA 4C1NK 2B3CA 3P4IA 3AY9A 1MR4A 1REVA 4BR5A 4GNIA 3M5RA 1SZ2A 4FJHA 2X78A 4J8FA 4C23A 1HUXA 3NVMA 1ILYA 4CHOA 4BRHA 3J7ZO 2P9SB 5T7BA 2W42A 3OVNA 4DV7K 2HHVA 4C8LA 4G9ZA 5M1PA 4DKWA 1VQNN 3U9DA 3RMDA 1ASWA 1VQKN 4DSFA 4DV0K 1U48A 1NM1A 3HBTA 3K5NA 2QWOA 1KAXA 2YILA 4IBNA 4ELVA 1U45A 3OYIA 2XY8A 1Z05A 3AVAA 2KFNA 1T7AA 3EL2A 2YX6A 2KZMA 4Q5VA 5ADXA 4EZ9A 3OJSA 1VQMN 3KLFA 1KRPA 3THWB 3L8BA 4FJNA 1S22A 4CZGA 1M1KO 4KTZA 4DF4A 4FJKA 2ZGYA 2E5LK 1QS4A 1RDCA 1Z6RA 1ICAA 2XY7A 1ZBLA 3OW2M 4HWIA 3M8QA 2X6SA 3C65A 4H0XB 4BR7A 4CK3A 3HP6A 2FLOA 3CC2N 4CK2A 1ZC6A 1BCGA 1BUPA 1KFSA 4ISEA 2HHUA 5AQYA 1V4TA 1JL2A 3D7EO 3J81O 1NMNA 2KBKA 3O6WA 4C8MA 1U04A 3CJBA 4L8RB 4FJGA 5E41A 4CIFA 3D2EB 4CJ4A 1QSYA 1ZBSA 2NRHA 1JLBA 4CEBA 1A5WA 1LW0A 1G15A 4FLUA 1GLLO 4CF0A 4CJLA 2KW4A 5BRDA 4OKEA 4O8UA 1NPIA 2D0OA 2CGKA 3CHWA 2NRRA 1UGLA 2JWKA 3RRHA 1FK9A 4FW1A 3BY5A 1DGKN 1B3CA 2YJEA 4E7IA 3ENHA 2UUAK 3MAQA 5JVHL 1PTXA 4TSXA 1MYNA 4DSEA 2W6LA 1RT2A 1Q9XA 3AO3A 1RT6A 5C2FA 1IJJA 1CHZA 4OKJA 2VY6A 4MFBA 4DV4K 2D0BA 3A5MC 4BC3A 2A1RA 5DMRA 2QWRA 3A5NC 4J2EA 1HJRA 3HM9A 3VQCA 1P0AA 3S3MA 5CYQA 1YJ9N 2O8FB 1NGAA 2OZMA 3OBWA 3K0SA 2YC1C 2JDQD 2FBTA 2YNGA 4DQIA 4CCHA 1QQNA 4CZMA 3QIOA 3LAKA 2EHGA 3ZSWA 4KHWA 4B9NA 1I2UA 4KH5A 4X64K 3J7AP 4DFKA 1K8KA 1TKTA 4NCBA 1FXXA 4U67L 1BMRA 1T8EA 5AQTA 1IKXA 3NH0A 4CZFA 3FFKB 5BREA 3SF4D 4JAXA 4KKOA 1BIZA 3CJ7A 5J2NA 4FLTA 3N4PA 5CZ2A 1XMQK 3IAYA 4GY2B 4BQZA 4RCHA 2ITMA 4CGFA 3BK3C 3KIOA 3P5JA 3VQ4A 2DPNA 1T6DA 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1U2VB 3I56N
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LWE A;  4M3Y A;  2PYL A;  4PA1 A;  1TL1 A;  4NYF A;  2YHA A;  4HUF A;  4BDY A;  3NDK A;  3WXL A;  2NRZ A;  4DLE A;  5AQG A;  2D4W A;  4RWT A;  3VQ7 A;  3E9L A;  3H1Q A;  3HOS A;  1ASU A;  2E2O A;  1RGI A;  3AV9 A;  4BQL A;  1MA9 B;  4F9O A;  3HPG A;  4DQ8 A;  3OYE A;  4OLA A;  1ZVE A;  1RTJ A;  4JI6 K;  4RW4 A;  1NJI O;  3O80 A;  2IS3 A;  3FR0 A;  1LWC A;  3GG4 A;  3PUF A;  4H4O A;  1T7P A;  1QQO A;  2N2Q A;  1IKV A;  1X3M A;  4RW9 A;  2OTJ N;  4M3R A;  1NJW A;  1WBB A;  3SAF A;  1Q7Y O;  3O4Q A;  4AIL C;  4XIU A;  1JZB A;  1JCE A;  3S9H A;  1DTT A;  2R7Y A;  5M1K A;  3IUC A;  1WN7 A;  1S5J A;  2KHO A;  4CIE A;  2LR3 A;  4E1J A;  2Q3S A;  5J2Q A;  4BRL A;  2VWB A;  2A3Z A;  3E01 A;  3ZET B;  1NH5 A;  1QSL A;  4CJT A;  1X9W A;  4CK1 A;  3KOW A;  3ZT1 A;  1LQH A;  4DLG A;  3VER A;  4DQP A;  4FPB A;  3D0P A;  3LAM A;  1XMO K;  4E7L A;  3GL1 A;  4HVJ A;  4Z4H A;  4N56 A;  2O8C A;  1YIJ N;  2OCE A;  4FL9 A;  1NU0 A;  4CER A;  1IBL K;  1ZYV A;  1T05 A;  1TKD A;  4DR7 K;  1ZBI A;  2BDP A;  2FSJ A; 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