5AQQA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqqA04
4H0OA 3R6MA 1T6DA 4K41A 1WOQA 1NGJA 4M7XA 3WEEA 2P9NA 4A2BA 3HBTA 4FWMA 3EZWA 3ZETA 5KPZA 3UKRB 2QWRA 4FWKA 3VF2A 5KQ8A 4MLEA 2P9SB 1ESVA 5AQHA 3O80A 1LCUA 3MMVA 5BPNA 4BR5A 4BR4A 2DPNA 4BRAA 4CBWA 4QS7A 2D0OA 5FPNA 3SLCA 1ATRA 3H6EA 1NGHA 2QW9A 1Z6RA 3GG4A 2E2OA 4WYBA 1NGDA 4EHUA 3MDQA 3ENOA 1ZC6A 1MDUB 2QWQA 4PL8A 4AM6A 4HWIA 2KHOA 5BN9A 4RCHA 1BA0A 3RSEA 4BR9A 3FE1A 3QMLA 2W40A 5F0XA 3CJCA 1JCFA 4C23A 3MCPA 5AQOA 3AAPA 3I8BA 4XEIA 3VESA 2F9TA 4PKHA 2YHWA 4RWTA 5BRHA 3A5OC 4A62A 3H45C 2FSKA 3VENA 1C0FA 2E20A 3CI5A 1X3NA 3UB5A 3U9DA 3AARA 2P9KB 1GLJO 3EO3A 3O08A 3FZHA 2FLOA 2VWBA 4EFHA 5I9EB 5E84A 1BDGA 2HMPA 3H3NO 4H5TA 3D2FB 3AY9A 4E1JA 3EKUA 1YUWA 1NGEA 3CETA 2HF4A 3DXMA 2BTFA 3WUHA 2V52B 3QB0A 3M6GA 1HUXA 1RFQA 1BWFO 3O8MA 3D2EA 2P9UB 3GOIA 1HKCA 2QWMA 2NLXA 1D4XA 3A5LC 3QBWA 4CZLA 1E4FT 4FO0A 2W41A 2A6AA 3HM8A 3VGLA 3GL1A 1C0GA 1JCEA 1J6ZA 3A0IX 3HTVA 1SAZA 1NBWA 2I7PA 3R8EA 1LOTB 2ASMA 3ZX0A 2E2QA 4B1ZA 3CJBA 2ASOA 4JNEA 1GLAG 5FPEA 2HOEA 4BROA 3L6QA 5AQKA 2Q2RA 4CD1A 5AQZA 1KXPA 4H0VB 4H5RA 3ULEB 4CD3A 5EOYA 1KAXA 1IJJA 3HI0A 4H0XB 5AQSA 4CI6A 2V7YA 1NGAA 3WQTA 1GLEG 5AZJA 4H5WA 2P9PB 3C0BA 4FL9A 2AP1A 3VEZA 1NGGA 4H0PA 4JD2A 4BR2A 2Q31A 2D0PA 1ZBSA 1BO5O 4K43A 4YDUC 3VPZA 4BG9A 4NB4A 4ISFA 1RGIA 3O4WA 1QQOA 1BUPA 1XUPO 5CE3A 4A2AA 2ZF5O 4FWNA 4CZGA 2A41A 3JS6A 1K8KB 5AQRA 5AQIA 3J8AA 3BF3A 3IMXA 3VF4A 2GUPA 2D4WA 4BRDA 4KBOA 4IO8A 2YHXA 3H1VX 2Q0UA 4CZFA 3CIPA 3C7NA 3VEVA 3KZBA 4EIAA 3MN5A 1S3XA 1P8ZA 2YJEA 4NO7A 3LDOA 4K42A 1QZ5A 4BRIA 3D7EO 1NWKA 5FPDA 1GLLO 1XQSC 3FZKA 3GE1A 3O6WA 3ZEUB 3LL3A 4CZMA 3L0QA 5AQQA 5EVZA 2A40A 2F9WA 3MN7A 4GY2B 4FWPA 4CZJA 2P9IA 2ZGYA 2QWPA 4BRQA 2QM1A 3QDKA 4JHDB 3FZLA 3EKSA 2IVNA 5EXWA 4BR7A 1BA1A 1TYQA 3WXJA 4B1YB 4Z94A 3H46O 5FPMA 4BC3A 3L4IA 1Z05A 3BP8A 4IWVA 4DHYA 3UKUB 2E2NA 2E2PA 2QWNA 1CZAN 2CH5A 4BQLA 5F2RA 5BPLA 5AFUA 1HKGA 3DXKB 3FLCO 4BRFA 3QICA 3HSCA 2EWSA 3ENHA 3UKRA 3WT0A 5ELZA 3M1FA 5BR9A 4BGAA 5BN8A 2P9SA 1QZ6A 4M63C 1Y64A 3VEOA 1EQYA 5AQMA 5BREA 2FXUA 4JAXA 3WQUA 2FSNA 5E26A 3G25A 4M7YA 5AQVA 5AQUA 2CGJA 4BQZA 1U2VB 3EN9A 4FOIA 3QFUA 3B8AX 3F9MA 1V4TA 3MN9A 3U4LA 2GTDA 3A5MC 4EAHD 2ITMA 4K25A 3KVGA 5JICA 1ATNA 1KAYA 3LDQA 4L3QA 3A8YA 3MK6A 5BRDA 2BUPA 2P9LB 1HKBA 5AZIB 3WXIA 4H5NA 4BC2A 1NGCA 4BR0A 2CGLA 4BRGA 3S41A 2P9KA 4GNIA 2GEMA 4IXCA 4B1UB 3FZFA 3VEXA 1MWMA 1NLVA 1X3MA 1BG3A 4FWLA 3VETA 3D2FA 3MN6A 2NZTA 4WQ5C 2Q1NA 5AQPA 4BG8A 3LDNA 3EL2A 3TPQA 1V4SA 3ATUA 3SMPA 1QHAA 3CQXA 2IVPA 3WEEB 1NGBA 1Q18A 2P9NB 1X9JA 4Y0WA 3SMSA 4LC9B 2P9UA 3ZETB 4FWQA 4CZKA 4WQ4C 2GWKA 3VERA 1HPMA 4YDUA 2CGKA 4QS9A 4RTFD 1NGIA 2OANA 2YI1A 5AQWA 5AQJA 1T44A 4IJNA 3U9ZA 5BPMA 4BC5A 4BRNA 3U8XA 5AR0A 4FPBA 4DB3A 5AFUH 2ZWHA 5JLHA 2WUSA 2E1YA 4XH1A 2QXLA 2VCPA 1G99A 3H3OB 3VEWA 3I33A 4FWSA 1GLFO 4FOEA 3M3ZA 3ULEA 4J8FA 2IVOA 3RSEB 1TUYA 3FR0A 4BRHA 4CZHA 3SK3A 5EX5A 5LJWA 5JLFA 5AQXA 2I7NA 5BRFA 2A5XA 2E1ZA 3VGKA 5KPRA 1SZ2A 2P9PA 1KAZA 3VOVA 2V51B 5AQGA 4EHTA 1ZXOA 4XH4A 4I6MA 2YJFA 3CQYA 1QQNA 3BF1A 1T6CA 4BRLA 3JXUA 5ADXA 3CJ1A 4BRKA 4MLHA 3CJAA 4IZ9A 1YAGA 5B8HA 3HZ6A 1QQMA 4B1XB 2FF6A 3LM2A 4QS8A 1K8KA 4MO4A 4ISEA 2HF3A 1HX1A 3DXMB 3IFRA 2ZGZA 4IJAA 3SJHA 3O5BA 4AM7A 3ATVA 3W0LA 1DKGD 2ASPA 3D2EB 2D1KA 1ATSA 2FSJA 3VGMA 3ID8A 1GLBG 5F1XA 3DJCA 1DGKN 5TKYA 2E88A 1WUAA 3H1QA 4BVOA 1NGFA 2AA4A 2UYTA 3FZMA 3ZEUA 5EY4A 5AQNA 1S22A 2QWLA 4CZEA 5AQLA 1XC3A 4BREA 1DEJA 1JCGA 3A5NC 3CJ9A 4H5VA 3IUCA 3AAQA 2E8AA 2V7ZA 4JHDA 4BVPA 2IIRA 4FWRA 5LY3A 3GBTA 4CZIA 2NRHA 1YXQA 3BEXA 3OHRA 3GDQA 4CBXA 1IG8A 3VF6A 2A42A 4B1WB 4ISGA 3LDPA 5AZJB 3TU5A 3CERA 1SQKA 3P4IA 2FF3B 4BRMA 3BUZB 2YCHA 5LJVA 4XH5A 3UKUA 4H0YB 4JD2B 1H1VA 5KQDA 4CBUA 3LM9A 3DXKA 5AQTA 3QFPA 3O1WA 2A3ZA 3LDLA 3DWLA 3WXKA 4PL7A 4FPAA 1NMDA 4H0TB 2QWOA 1NM1A 4B1VA 4B9QA 1OKJA 3CHWA 2CH6A 4CJ7A 2J4RA 5ADXH 4DQ8A 4WQ5A 5AQFA 1U2VA 1TUUA 1GLCG 1MA9B 3C7NB 4MO5A 2PAVA 5AQYA 4FSVA 2Q0RA 3FGUA 1HLUA 1BU6O 3W3DA 1E4GT 1BOTO 4WQ4A 3VEYA 4A61A 4BRPA 2Q36A 1R59O 2P9LA 2H3GX 2VYPA 3QBXA 4FWOA 5AZIA 5JMVA 2YHYA 1MWKA 2P9IB 3ZX2A 4PKIA 4I6MB 2GELA 4H03B 4O5FA 4O8KA 4JN4A 4F9OA 2GWJA 4BC4A 3O1BA 3UE5A 2Q97A 2PBDA 3DAWA 3KHYA 5KPTA 3IDHA 3FFKB 3CJ7A 3R9PA 3WXLA 1YVNA 1TYQB 4DCHA 4PKGA 1RDWX 1HJOA 3ZX3A 4BRCA 4BGBA 1GLDG 1U6ZA 4HTLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U3YA 4E1NA 3KIOA 4M41A 1RBUA 3E66A 4A2BA 4CK3A 4FWMA 3EZWA 4DFMA 1CHZA 3MWPA 1BCMA 4AHTA 3K0SA 3BZKA 4YOUA 3O80A 2KLAA 5KRSA 3K57A 1WBDA 1GPTA 4JKEA 4DUZK 2DPNA 4QS7A 2D0OA 3OJUA 2LY6A 1XI1A 3O4NA 3THYB 3GG4A 2VY6A 2YNGA 4ILGB 4HWIA 3LZIA 3V1OA 4CJQA 4AH9A 4LFAK 3E9OA 3PIOL 4Q0BA 4PKHA 5BRHA 1WSEA 3A5OC 4A62A 4IBNA 4CJTA 1XC9A 3NGZA 4Z4GA 2ASCA 4KHWA 1S5JA 3UB5A 3U9DA 4Z4CA 3MXJA 1NK0A 1NNEA 3EO3A 2KGQA 3O08A 4FJXA 1QTMA 1BQNA 4FK4A 2RPIA 2HBLA 3D2FB 1JLEA 3SPYA 4EZ9A 4RW4A 4AQYK 1NGEA 3BZCA 3DXMA 3VTHA 2V52B 4O55A 1ILYA 4CGJA 3K5OA 3PX0A 4ID5A 3KC6A 3QBWA 4DTUA 1U45A 1A5WA 4DQSA 2OZSA 3ZT3A 2E5LK 2YIPA 2W41A 4HUFA 2A6AA 1RT3A 3VGLA 1Q9XA 1JCEA 1SS6A 3S9HA 4QCLA 3ZSYA 2NRZA 2KFNA 1L5UA 1DT9A 5JVGL 1N4NA 3TAPA 2ASOA 1GLAG 4DV6K 4YFUA 3MEEA 3L6QA 5AQKA 1VHXA 4YOVA 3SPZA 2PFUA 2ETJA 4I9LA 4CCHA 3T69A 3CM5A 3SUNA 4H0VB 5TKWA 4CD3A 1RT5A 5M1FA 4H0XB 5AQSA 3OYIA 2I61A 1QHTA 4JKDA 3ASMA 2AJQA 1GLEG 5AZJA 4KAZA 3SF4D 4H5WA 3DMJA 1JLBA 4FL9A 1CN2A 2AP1A 4H0PA 1C1AA 3LWLA 3AVHA 2D0PA 4K43A 3SNNA 3HL8A 1IBMK 5J2QA 3AA2A 4FZXC 1JJ2M 3ENBA 2O8CA 1K8KB 2OPRA 1VQPN 5HL7L 3DRSA 1N33K 2W00A 4Z4IA 3CYMA 3M5RA 2OYQA 3VF4A 4DV0K 2GUPA 3S5TA 4OPJA 3OS1A 3LP2A 1TAQA 2QI2A 3KD5E 3MX5A 5C2FA 3LDOA 3HM9A 4A5AA 4DV3K 3AA3A 3CC2N 4X64K 5FPDA 1GLLO 1XQSC 3FZKA 3KP1A 1LQHA 2A40A 2ZJPL 4DU3A 1TK5A 5H1SQ 4GY2B 3MN7A 2ZGYA 4ELUA 2E6MA 3EKSA 4CJFA 1U47A 1T03A 2NY8X 2G8IA 3CYGA 2C1IA 3R2VA 3MX2A 3LP3A 4FJLA 4CEBA 4CGIA 1IV0A 1VSHA 3BP8A 4YOXA 4OJRA 1QS4A 2E2PA 2NRTA 4B9VA 4BQLA 4M3TA 3ZSVA 5AFUA 1TI5A 3FLCO 4FM2A 3QICA 1XMQK 3ULDA 2UXCK 1REVA 2HSTA 5CY4A 3VQ8A 4BY9C 3ENHA 3QIPA 4DFKA 4WFBL 2LY5A 1S9GA 4M42A 5JS1A 4BGAA 2QK9A 2O8FA 5HOOA 1Y64A 1EQYA 1WLJA 2EHGA 3PSIA 2O8EB 3K5NA 3KLIA 2NY9X 2LR3A 1OH6A 1K8AO 3IG1A 4K8ZA 2E0HA 4DR3K 1BCGA 4M7YA 4UQGA 3MCAB 4AB0A 4BQZA 2DY4A 1U2VB 3EN9A 2NRWA 5M1PA 3OYHA 2Z1JA 3QFUA 3F9MA 5M1NA 1IBKK 1D9DA 3A5MC 5I42A 4K25A 1J53A 1ATNA 5JICA 4YHHK 3PLAA 3LDQA 3CCSN 2MBKA 3CMEN 1D5AA 2BUPA 2P9LB 2ZE2A 3OYBA 2P51A 2LJ7A 4OGCA 2XRIA 3S41A 1SUQA 2P9KA 4DKWA 1Q7YO 2GEMA 3CXCM 2NRRA 2YV0X 3G6EN 3VEXA 2G8FA 1KVAA 2HMIA 1X3MA 3C6HA 1VQ6N 4IEIA 3VETA 1NJWA 2NZTA 4KHNA 2Q1NA 4AHUA 5D3GA 3KHWA 3M8SA 4E1MA 3TSUA 1P0AA 3ZETB 4WQ4C 4E7LA 4RW9A 1E3MA 4A59A 4KHSA 4IG3A 5FROA 2WC9A 4KHPK 4O4GA 1L3VA 4IO9L 4DR6K 3M8PA 5AQWA 5AQJA 1T44A 3VQ7A 4BC5A 2VG5A 3U8XA 5AR0A 1BK8A 2WUSA 2E1YA 3D0PA 1S1TA 4Z4FA 4CF8A 2NRVA 1G99A 3DLKA 3VEWA 4FWSA 1GLFO 4FOEA 4FVMA 4HCBA 3J80O 4JKHA 3RSEB 4CZHA 5LJWA 4DSLA 4W5RA 4KH4A 4AHCA 4CFDA 5BRFA 3NHGA 1FXXA 1SZ2A 2P9PA 3CG7A 5M1QA 1QVGM 3NE6A 4DU1A 3PY8A 1TK0A 4DFJA 4JI6K 4B9LA 2IGIA 4BRLA 3JXUA 5ADXA 2YNIA 2B4JA 3CJ1A 4JI2K 1J5EK 3LM2A 1JXBA 4E7KA 4ISEA 1BI4A 2HF3A 3CCMN 4X65K 2FBXA 4IJAA 4PA1A 2HNDA 4DUYK 3D2EB 2D1KA 2VGMA 3KOXA 1S72N 2DFHA 3CCRN 3SV3A 1I6GA 3ID8A 1VQ7N 1NG9A 3CC7N 1DGKN 5TKYA 4CGGA 3SJJA 3V9XA 3H1QA 4CJWA 3CCUN 1XWLA 1NGFA 2AA4A 3FZMA 3ZEUA 5AQNA 4CZEA 4BREA 1JCGA 4CIFA 3PUFA 4M3WA 2WBNA 1NU0A 4FLZA 3K5LA 4CJSA 3G71N 1BGXT 1IKYA 3NF6A 1MU2A 3RTVA 3L2WA 4QOZB 4DF8A 1S1XA 1YXQA 4CBXA 3RR7A 2R7YA 5DM6L 3F9KA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3U3Y A;  4E1N A;  3KIO A;  4M41 A;  1RBU A;  3E66 A;  4A2B A;  4CK3 A;  4FWM A;  3EZW A;  4DFM A;  1CHZ A;  3MWP A;  1BCM A;  4AHT A;  3K0S A;  3BZK A;  4YOU A;  3O80 A;  2KLA A;  5KRS A;  3K57 A;  1WBD A;  1GPT A;  4JKE A;  4DUZ K;  2DPN A;  4QS7 A;  2D0O A;  3OJU A;  2LY6 A;  1XI1 A;  3O4N A;  3THY B;  3GG4 A;  2VY6 A;  2YNG A;  4ILG B;  4HWI A;  3LZI A;  3V1O A;  4CJQ A;  4AH9 A;  4LFA K;  3E9O A;  3PIO L;  4Q0B A;  4PKH A;  5BRH A;  1WSE A;  3A5O C;  4A62 A;  4IBN A;  4CJT A;  1XC9 A;  3NGZ A;  4Z4G A;  2ASC A;  4KHW A;  1S5J A;  3UB5 A;  3U9D A;  4Z4C A;  3MXJ A;  1NK0 A;  1NNE A;  3EO3 A;  2KGQ A;  3O08 A;  4FJX A;  1QTM A;  1BQN A;  4FK4 A;  2RPI A;  2HBL A;  3D2F B;  1JLE A;  3SPY A;  4EZ9 A;  4RW4 A;  4AQY K;  1NGE A;  3BZC A;  3DXM A;  3VTH A;  2V52 B;  4O55 A;  1ILY A;  4CGJ A;  3K5O A;  3PX0 A;  4ID5 A;  3KC6 A;  3QBW A;  4DTU A;  1U45 A;  1A5W A;  4DQS A;  2OZS A;  3ZT3 A;  2E5L K;  2YIP A;  2W41 A;  4HUF A;  2A6A A;  1RT3 A;  3VGL A;  1Q9X A;  1JCE A;  1SS6 A;  3S9H A;  4QCL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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