1D4XA

Crystal structure of caenorhabditis elegans mg-atp actin complexed with human gelsolin segment 1 at 1.75 a resolution.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
368
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGVVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITVGNERFRCPEAMFQPSFLGMESAGIHETSYNSIMKCDIDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords C. ELEGANS ACTIN 1/3
publication title The structure of nonvertebrate actin: implications for the ATP hydrolytic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Caenorhabditis elegans
total genus 116
structure length 368
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1d4xA03
1TUUA 5BRHA 4EIAA 4A62A 1NGDA 2D1KA 3H45C 4AM7A 5KPZA 3I8BA 5F2RA 2E1ZA 2F9WA 3B8AX 3LM2A 3OHRA 3R9PA 2Q0UA 4CZJA 4BG8A 3VOVA 3M6GA 1G99A 4O5FA 3ZEUA 4EAHD 4BRIA 4CD3A 2V51B 4ISEA 4CZHA 1Y64A 4BR7A 1TYQB 5AZJA 1NGHA 3DJCA 3H1QA 4CI6A 2VWBA 3QFUA 1YAGA 3L4IA 2P9LA 4FWOA 3VESA 1NGBA 3UB5A 1QZ6A 3EZWA 2FSNA 2QWOA 5FPDA 3WEEA 1GLLO 4M63C 3JXUA 1Z6RA 3FR0A 4QS9A 1GLEG 4BRFA 3O5BA 5ADXA 3EO3A 3DXMB 3IFRA 4JNEA 3QBXA 5EOYA 3VF2A 2YJFA 2GTDA 1GLDG 4MO5A 2A5XA 3CJ7A 4H03B 1Z05A 2I7NA 2P9SA 3GBTA 3A5LC 2P9IA 3VGKA 3D2FA 5B8HA 3BEXA 4FOIA 5AQVA 4H0XB 2NZTA 4FPBA 2D0OA 3H46O 4FWNA 5JICA 2I7PA 3QMLA 4BREA 2NRHA 3AAQA 1HKCA 4QS7A 1X9JA 4BR9A 1YVNA 3BF1A 4I6MB 1RFQA 1BDGA 3MN9A 1XC3A 4BG9A 1MWKA 3GDQA 1DKGD 3EL2A 4IWVA 4NO7A 4XH1A 3W0LA 4PL7A 2QWMA 3C7NB 4PKHA 1E4FT 4CBWA 3BP8A 2AA4A 5AQUA 4PKGA 5AZIB 3H1VX 3O6WA 1ATNA 1TYQA 2Q1NA 1OKJA 2GELA 3ID8A 1ESVA 5KQ8A 4F9OA 4BC5A 2HMPA 3GE1A 3VPZA 4CZIA 1HJOA 4BRKA 1BU6O 3VERA 3ULEB 2FSJA 3CJCA 1K8KB 2UYTA 3CJ1A 3FZFA 3L0QA 4A2BA 4H5NA 3BF3A 3BUZB 1BWFO 3O80A 3AY9A 1C0FA 3UKRB 5ADXH 4DQ8A 1U6ZA 1IG8A 3D7EO 2CGKA 4CD1A 4GY2B 5FPEA 1R59O 4K41A 4K42A 4FOEA 4B1WB 4MO4A 2A6AA 4BC3A 4FWQA 1J6ZA 3DXMA 1U2VB 4FO0A 4YDUC 4ISGA 4QS8A 2ASMA 2IVPA 3LL3A 4L3QA 1KAYA 2FF6A 3WXIA 5JMVA 3UE5A 4CZGA 2YHXA 3CQYA 4FSVA 2FXUA 5AQJA 2QWNA 3HSCA 1KXPA 5E84A 3M1FA 2YHWA 4H0VB 4BGBA 3O08A 5E26A 3VEYA 3D2EB 3F9MA 4J8FA 5AFUA 4Y0WA 4DCHA 5F0XA 4I6MA 5CE3A 3ZETB 1S22A 1HX1A 3M3ZA 3U4LA 3CETA 4ISFA 1BG3A 4FPAA 3VEXA 3C7NA 3U8XA 1LCUA 4BVPA 4FWSA 3ATVA 4H0YB 3MCPA 1NGGA 4JD2B 4BRLA 2D0PA 5AZIA 5TKYA 5AQLA 3FFKB 1MDUB 2NLXA 3A0IX 4IZ9A 2A40A 3GOIA 3S41A 2QXLA 3IUCA 2ZWHA 1T6DA 3FZLA 4KBOA 1X3NA 3H6EA 2E2QA 2P9UB 3A5OC 3KVGA 3QFPA 2VCPA 4WQ5C 2V7YA 3FZMA 5ELZA 4B1YB 3CIPA 4BR0A 3LM9A 3VENA 3ULEA 5EX5A 1K8KA 2E2NA 3UKRA 1NGCA 2P9NB 4BQLA 3H3OB 3CJAA 5KPTA 5KQDA 2IVNA 1NBWA 5BR9A 1U2VA 5KPRA 1HLUA 4B9QA 3GG4A 3R6MA 1NMDA 4BRMA 4BRDA 4A61A 2QWRA 3O1WA 1KAXA 4B1XB 1V4TA 2EWSA 1D4XA 2DPNA 1BOTO 4FWPA 4IXCA 4MLEA 3WT0A 2ZGYA 2F9TA 3LDNA 1DGKN 1GLCG 3FE1A 4WQ4C 5AFUH 3SLCA 3VF6A 4CJ7A 4BRQA 5AQSA 3D2EA 1T6CA 3DWLA 4K25A 4PKIA 3HM8A 1E4GT 2E2PA 2GUPA 3KHYA 2QWLA 3ZETA 4JAXA 2WUSA 2FLOA 4IJAA 2E20A 5AQKA 2FF3B 1QQOA 3CQXA 3TPQA 3VGMA 4JD2A 3A5MC 4YDUA 4BROA 4O8KA 1NM1A 1CZAN 3LDQA 1X3MA 4XH4A 5AQZA 5BPLA 5EVZA 3SMSA 3P4IA 2GEMA 2P9PB 4H5WA 1SAZA 2P9UA 4A2AA 1JCEA 1NWKA 3HZ6A 5BRFA 2ASOA 4BRNA 1EQYA 1ATRA 3FZHA 4H5RA 3W3DA 4CBXA 4EHTA 4BR4A 3ATUA 2W41A 1WOQA 5LJWA 5EY4A 3CHWA 4RWTA 2P9NA 5BPNA 1ZC6A 3VEOA 3RSEB 4BGAA 3MDQA 4CZLA 5AQQA 2HOEA 2HF4A 2Q97A 5EXWA 3G25A 1HUXA 2BTFA 3EKUA 4BRGA 2GWKA 4H5VA 3MN7A 3HI0A 3QB0A 1BA0A 1ATSA 1BO5O 3JS6A 1BUPA 1C0GA 3QICA 3L6QA 4MLHA 5AQRA 3WXKA 2HF3A 4JN4A 2QWQA 4E1JA 1ZBSA 2E1YA 3C0BA 1NGIA 2CH6A 4CZKA 3A8YA 1QHAA 5JLHA 4WQ5A 1NGJA 1QQNA 5AQYA 2Q0RA 1SZ2A 4BRHA 2ASPA 1QQMA 4H0PA 4CBUA 3WXLA 4M7XA 2QW9A 2QWPA 5AQTA 4AM6A 3MN5A 1JCGA 3I33A 1NLVA 3VETA 2YJEA 4DB3A 1TUYA 2Q36A 3CERA 4B1VA 3R8EA 2H3GX 5AQOA 3A5NC 2V7ZA 5LY3A 2P9KB 2P9PA 3QDKA 1XUPO 1ZXOA 3LDLA 5AQNA 1GLFO 2CGLA 5AR0A 1GLJO 3FGUA 2J4RA 4H0OA 3O1BA 4WQ4A 5AQFA 4FL9A 1RDWX 1IJJA 3O4WA 1YXQA 2ITMA 5AQGA 1QZ5A 3GL1A 4FWKA 3VF4A 3RSEA 1JCFA 2YCHA 3IDHA 2ZF5O 3ZX3A 5AQHA 5AQPA 5AQMA 3AAPA 2FSKA 2V52B 5BPMA 3AARA 3KZBA 2E2OA 3WQTA 4BRAA 4BRCA 3O8MA 3VEWA 5BN8A 1H1VA 3MN6A 4LC9B 5AQIA 4B1ZA 4GNIA 4FWLA 1RGIA 4CZEA 4IJNA 1S3XA 5BN9A 2A42A 5FPNA 1GLAG 3DXKB 4IO8A 2W40A 3UKUB 1MA9B 2OANA 1V4SA 2QM1A 1SQKA 1GLBG 4JHDB 2IVOA 3EN9A 3MK6A 4PL8A 3CI5A 4NB4A 2PBDA 2YI1A 3WXJA 2IIRA 3VEVA 1YUWA 3CJBA 3LDOA 1NGFA 2BUPA 2Q31A 3SMPA 3ZEUB 4H0TB 3WQUA 2KHOA 3ENHA 2AP1A 2P9KA 4Z94A 3LDPA 3WUHA 5AQWA 5AZJB 4CZMA 5JLFA 3J8AA 1HPMA 2ZGZA 1MWMA 4BC4A 4BR5A 5BRDA 4RCHA 4HTLA 3QBWA 5FPMA 2P9LB 1Q18A 3HTVA 1P8ZA 3DAWA 1WUAA 3H3NO 4DHYA 5F1XA 2GWJA 4HWIA 4RTFD 3ZX2A 3WEEB 3ZX0A 4H5TA 1DEJA 3VGLA 2E88A 3MMVA 3U9ZA 4BVOA 3VEZA 5LJVA 2A3ZA 3FLCO 4B1UB 3TU5A 3IMXA 4K43A 1HKGA 1XQSC 2D4WA 2P9SB 3CJ9A 2P9IB 2YHYA 4WYBA 3HBTA 3D2FB 1NGEA 1HKBA 1NGAA 2A41A 5BREA 4EHUA 2Q2RA 3U9DA 4BQZA 4BR2A 2E8AA 4EFHA 2PAVA 3EKSA 3SK3A 4C23A 4XEIA 4FWMA 2VYPA 4M7YA 4XH5A 2CGJA 4FWRA 5AQXA 3DXKA 1KAZA 3FZKA 3UKUA 1LOTB 4CZFA 1T44A 1BA1A 2CH5A 4BC2A 3SJHA 4BRPA 3ENOA 5I9EB 4JHDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A62A 4CEQA 3H45C 1U49A 4CGIA 2WC9A 4CESA 3I8BA 5F2RA 4LF6K 2F9WA 3CCQN 3R9PA 2Q0UA 1TKZA 4BG8A 4XJXA 4O0IA 1A5XA 1NGHA 1RBUA 3LANA 4ID1A 4CI6A 2KQ2A 1WAJA 3V9WA 1C6VA 2X6NA 4OLBA 1VRTA 4X66K 4O5BA 3UB5A 1BHLA 1C1AA 3WEEA 3LPUA 4M3RA 4QS9A 3O5BA 3TTFA 4CFBA 4DV1K 4JNEA 3QBXA 3VF2A 2WFBA 1J54A 1GLDG 2RHKA 2RKIA 4Z0UA 4B9VA 4MO5A 2OZMA 1WB9A 4CK2A 3GBTA 3VGKA 4A5BA 4C8LA 3AVCA 4CK3A 2NRZA 3QESA 1J5EK 2I7PA 4BREA 1QTMA 1VRUA 4LF8K 3ZT0A 3AAQA 3KK2A 1X9JA 4BR9A 1BDGA 4M3TA 1XC3A 4BG9A 3W0LA 4IWVA 5TKWA 3S3NA 5M1NA 2FBXA 3C7NB 1F21A 4PKHA 3BP8A 3U3YA 2EHGA 1VQPN 5AZIB 2BANA 3L2WA 2QA4N 1NJYA 1DT9A 4BC5A 4CZIA 4YY3K 1HJOA 4BRKA 1N33K 2G8KA 4KTZA 3L0QA 4A2BA 1CXQA 4CF1A 4FK4A 3BUZB 3V9ZA 4KKOA 1U6ZA 1NU0A 1S1XA 1NNEA 3OYHA 4B1WB 4IFYA 4E0DA 3QIPA 2RN2A 3RR7A 4FCYA 4FO0A 4YDUC 1WBDA 4QS8A 2Y1JA 1C1CA 3OYJA 3OTOK 4DTOA 4R79A 3CM5A 2YHXA 5JVHL 4FSVA 4DQPA 4I9LA 1VSKA 2QWNA 3K9JA 1C0TA 4EZ6A 4JK8A 2YHWA 4B3TK 4H0VB 4DSJA 4LF9K 3F9MA 1LAVA 1I3AA 4O44A 1S9GA 1HX1A 3U4LA 1HR0K 1SV5A 4NYNA 4BDPA 3J7ZO 3C7NA 4U7BA 3U8XA 3L2VA 4CJ4A 3U6FA 4H0YB 3MCPA 4F2SA 1HQEA 4JD2B 4DS4A 5AZIA 2HB5A 5SWMA 2A40A 3GOIA 3SI6A 2QXLA 4KHYA 1X3NA 4B8AB 2P9UB 3OYDA 3KIOA 4FJIA 3C6UA 5ELZA 2QEXN 1VQ4N 2Y1IA 4IOAL 3LM9A 3CCJN 5EX5A 4CEDA 3S3MA 3NDKA 2YNHA 5M1KA 4GKKK 1QE1A 3MCAB 3ZSXA 5KPTA 3CJAA 4FXDA 5KQDA 1IH7A 1VQON 1SKWA 1RT2A 3M5RA 5BR9A 3PO5A 5KPRA 5FROA 3RR8A 2HW3A 4BRMA 4DU4A 1Q82O 4AHCA 1V4TA 2G8IA 1D4XA 4DWIA 4FJMA 4KHPK 4R5PA 5KRTA 2ZGYA 3LDNA 2C1GA 1GLCG 3FE1A 5AFUH 5GINA 3TARA 1LV5A 1WBBA 4DR4K 3WNGA 3O9QA 3HM8A 1N34K 1E4GT 3PY8A 2GUPA 4CEZA 4CHYA 5FRMA 2E20A 2FF3B 1RDDA 2EX3A 3AA5X 3J7AP 1Z26A 4G1QA 2IS3A 3HPOA 3VMFB 4DQQA 3QEPA 2WOMA 1KQSM 3OYCA 1I94K 2HHSA 4JD2A 1RBRA 4DTNA 3LDQA 1X3MA 1WSEA 4I2PA 1HJRA 4H5WA 2P9PB 4DQSA 5J1EA 2P9UA 4H4OA 3NVKA 4A59A 3T1YK 4HHTA 4BRNA 3W3DA 4O55A 4H5RA 3ZSOA 1BL3A 4CBXA 4DTUA 3RWUA 3VEOA 2VGNA 3QNOA 1C0UA 4H4MA 4E1MA 4DTRA 2HOEA 1G15A 5EXWA 4NCBA 3DM2A 3OVNA 4DFJA 3MN7A 3QB0A 2YNGA 5FPDA 4QCLA 3TANA 1KTQA 4E1JA 4W5QA 4NXNK 1S6PA 5DM7L 2E1YA 3MEEA 3C0BA 4F3OA 3A8YA 4FW1A 5JLHA 1NGJA 3DLGA 1TL3A 2Q0RA 2D0AA 4BRHA 4YOTA 4JK9A 3B6OA 4CEOA 3WXLA 4M7XA 3KWGA 3L2RA 4AM6A 4Z4HA 3I33A 1NLVA 1R0AA 1ZBLA 3DOLA 1TUYA 4OKKA 3CERA 3QLHA 3LWMA 5AQOA 4CJRA 1RBVA 1TV6A 2P9PA 1HQUA 1ZXOA 2Z1HA 2CGLA 3CCSN 5AR0A 1N36K 2XO7A 4J2AA 3LP3A 2IGIA 4CJPA 4DKWA 3LZIA 3TI0A 4C8MA 2WTUA 4CGJA 4PA1A 5AQHA 4BDYA 4CEFA 3RMAA 4FYDA 1T3VA 3NFAA 1NOZA 1WSGA 1IG9A 4LFCK 4NCAA 5BPMA 2XY6A 4OO1J 4M3YA 3SUQA 5BN8A 3MN6A 5AQIA 3RRGA 3HO1A 3AVNA 3WXMB 3IG1A 3NAEA 4IEEA 2O8FB 3A2FA 5FPNA 3DXKB 3KWIA 3ULDA 3U3GA 2W40A 3FFIA 1NK8A 2JWLA 1D9FA 4C8OA 4B9LA 3HT3A 1GOAA 2IVOA 3EN9A 3VQBA 1UAXA 3UIQA 3PUFA 2IIRA 4BE2A 1W7AA 2Z1IA 1VQMN 1J5OA 1NGFA 2BUPA 3P5JA 3TSPA 3EZ5A 3SPZA 3ENHA 1NK5A 3AO4A 5AQWA 3OS0A 4JRQA 2QK9A 3WNHA 1HPMA 1NJXA 4DTJA 1LW2A 4CEAA 3NBPA 4BR5A 4OPKA 3KD1E 2F96A 3QBWA 3CCMN 3HK2A 4IKFA 1BI4B 3HTVA 4ICLA 4X64K 1WUAA 3H3NO 4DHYA 5F1XA 4QAGA 2HBLA 4RTFD 4CERA 3CFRA 3DLRA 4N47A 3ZX0A 2E4LA 2W00A 3L4QA 3PIOL 3C95A 5LJVA 4DTSA 3AVMA 3FLCO 4DLGA 1XHXA 1RTJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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