2W41A

Crystal structure of plasmodium falciparum glycerol kinase with adp
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
506
structure length
506
Chain Sequence
SEFGSMNVILSIDQSTQSTKVFFYDEELNIVHSNNLNHEQKCLKPGWYEHDPIEIMTNLYNLMNEGIKVLKDKYTSVIIKCIGITNQRETVIIWDRITGKPLYNAIVWLDTRVEELVTEFSAKYNNNDIQKKTGTYFNTYFSAFKILWLIQNNPEIKQKIDDGTAVIGNINTWLIFNLTKGNCYTDVTNASRTLLMDINTLQWDEKMCKIFNITNMSVLPEIKSNCSNFGLVKSEHVPDYLNIPITGCIGDQQSACIGQAIFDEGEAKCTYGTGVFLLINTGEKVVYSTCGLITTICYKFNDNDKPKYALEGSIGTAGSGVSWLLKNKLIDDPSEASDIMEKCENTTGVIFVPAFSGLYAPRWRSDARASIYGMTFNTERSHIVRALLEGIAFQLNEIVDSLTSDMGIEMLHVLRCDGGMTKNKPFMQFNSDIINTKIEVSKYKEVTSLGAAVLAGLEVKIWDSLDSVKSLLRRSDAVFHSKMDDKKRKKKTSEWNKAVERTLIQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords GLYCEROL KINASE, PUTATIVE
publication title Structure and Non-Essential Function of Glycerol Kinase in Plasmodium Falciparum Blood Stages.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 185
structure length 506
sequence length 506
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2w41A01
4B1ZA 4BR5A 1C0FA 3LDQA 2Q97A 3ATUA 3MDQA 4BRCA 3H46O 1NGDA 2QWLA 2ASMA 2NLXA 4WYBA 3U9DA 5JMVA 4L3QA 4BRIA 4BR0A 3BF3A 2UYTA 3MCPA 4CZLA 5BR9A 2NZTA 5FPEA 2P9LA 2QWPA 3ZEUB 3D7EO 2AA4A 4O5FA 3R8EA 2P9SB 4EAHD 1JCFA 4DQ8A 3LDNA 3EZWA 3VEYA 4I6MA 2QXLA 3EO3A 1NMDA 3WEEB 1MWMA 5AQVA 1QHAA 1EQYA 2FXUA 3MN5A 4BC2A 3O6WA 3QMLA 1P8ZA 3EL2A 3VF2A 4B9QA 4BRFA 4CZGA 3DXKA 5EXWA 2GWKA 4BGAA 3LDOA 3VGMA 5AQQA 4HWIA 2A42A 3JS6A 3U4LA 5EOYA 3FFKB 1CZAN 5F0XA 1WUAA 1NGJA 2PAVA 5TKYA 4IXCA 4A62A 3DJCA 4K41A 1G99A 3J8AA 2I7NA 4FPAA 5KPTA 4BREA 4BR2A 4LC9B 3WUHA 3HM8A 4FO0A 4M63C 4EFHA 1T44A 2P9LB 4FWQA 1MA9B 4C23A 2W40A 3BEXA 5EY4A 1V4TA 1SQKA 4RWTA 3QFUA 4FWMA 1T6CA 5B8HA 3HZ6A 4I6MB 3C7NA 3CJAA 3G25A 5E26A 4CZFA 4BGBA 3FZFA 5EVZA 5AQOA 1BA1A 5CE3A 3ATVA 2A40A 1NGHA 1IG8A 2FF6A 3MN6A 4K42A 4XEIA 4FOEA 4BG8A 5BPNA 3IMXA 5BN9A 3SMSA 1QQNA 1NBWA 3DXKB 1BA0A 3IFRA 3L6QA 3O1BA 1NGEA 4ISEA 4JD2A 3LM2A 2ZWHA 1V4SA 3VERA 1YUWA 2P9KA 2P9NA 3EKUA 4WQ5A 3U8XA 4BR7A 2QWMA 4PKHA 1GLEG 5AQGA 1ESVA 4FPBA 4BQLA 4JAXA 5BRFA 3VEWA 2AP1A 3AY9A 1Q18A 4DB3A 2EWSA 4K25A 2FSKA 5E84A 4FWNA 5AQTA 5AQZA 3M1FA 1U6ZA 1BG3A 1Z6RA 2QWQA 3KZBA 4H5TA 4BRPA 4BRDA 5ELZA 3VETA 1BUPA 2ASPA 2DPNA 3CIPA 1RDWX 3C7NB 3VEZA 1KAYA 1JCEA 5KQDA 3QBWA 1GLAG 3GG4A 4IJNA 2QWRA 4BRQA 1BU6O 1YAGA 3GDQA 3H6EA 4JNEA 5AZIA 1YXQA 3IDHA 3EKSA 4F9OA 4BVOA 3O8MA 1HX1A 3L4IA 4JD2B 3CQXA 2D4WA 2VWBA 3H1VX 2BTFA 2P9KB 2P9NB 1KAZA 3O4WA 4BRGA 4BRKA 1LOTB 2F9WA 3VEVA 4MO5A 2CH5A 3MN7A 3O1WA 2A5XA 4QS8A 3A5OC 3O08A 4JHDA 4FWRA 3CQYA 5AQUA 3QICA 2HF4A 3B8AX 1BOTO 4M7YA 5LJVA 3TPQA 1Z05A 4BG9A 5FPMA 3EN9A 1TUUA 3L0QA 4H5VA 3SLCA 5EX5A 4PL7A 3GE1A 5AZIB 4BC5A 5AQJA 2BUPA 4H0VB 4BR4A 4IZ9A 1E4FT 3F9MA 1GLJO 2IVOA 4DHYA 4H0PA 5AZJA 4FSVA 3UB5A 3HSCA 3VEOA 3A5NC 3AAPA 1J6ZA 3WT0A 2F9TA 1ATRA 4FWSA 4MO4A 3WXLA 1S22A 2FF3B 3DAWA 2E8AA 3VPZA 4JHDB 4H0XB 2IIRA 1HLUA 5AR0A 2FLOA 1JCGA 2YJFA 4B1XB 1X3NA 3ZETA 3ZX2A 2ITMA 5KPRA 4BRHA 2ASOA 4BROA 4CBXA 3A0IX 5ADXA 1MDUB 4FOIA 1NGBA 4QS7A 2GTDA 4AM7A 1HUXA 4CI6A 2HOEA 2D0PA 3CHWA 2A6AA 4EIAA 3CETA 3CJCA 3WQUA 4EHUA 5AQWA 3DXMA 4FWKA 4A2AA 4B1YB 1X9JA 4AM6A 2QWOA 3A5LC 2WUSA 3HI0A 4H03B 5AZJB 4H0TB 3QB0A 4M7XA 2OANA 3BUZB 1HJOA 1GLBG 3I8BA 4XH1A 3ENOA 4EHTA 3RSEA 2P9UA 3GOIA 1ZC6A 4IO8A 3LL3A 2KHOA 4H5NA 1IJJA 4FL9A 3R6MA 3D2FA 4CZEA 3MN9A 5BPLA 3OHRA 5BN8A 2CGJA 3CJBA 2YJEA 4BC4A 2A41A 3M6GA 4PKIA 4Z94A 4NB4A 3ZETB 5KQ8A 4PL8A 4CZIA 1OKJA 4CZMA 3QBXA 5AQFA 4WQ4C 3GL1A 3VGLA 3LM9A 4B1WB 5BREA 1GLCG 4BRLA 4DCHA 5KPZA 4GY2B 3U9ZA 1LCUA 3I33A 3ULEA 2CGLA 2HMPA 2I7PA 5BPMA 3DXMB 4BQZA 1ZXOA 4CJ7A 2NRHA 2V7YA 2QWNA 3TU5A 4B1UB 1NGIA 1NGCA 3VESA 2YCHA 1XUPO 3VENA 4PKGA 3SK3A 3RSEB 1C0GA 2P9UB 4H0OA 1S3XA 4ISFA 3M3ZA 3FZKA 3WXJA 1XC3A 3R9PA 3AARA 4KBOA 2YI1A 3D2FB 5AQNA 4J8FA 1NGAA 3S41A 1XQSC 1BO5O 1SZ2A 3CERA 4CZKA 1KAXA 5AFUH 3W0LA 3CI5A 3A5MC 3CJ9A 4CD3A 5LJWA 2VCPA 2Q31A 1RGIA 2GEMA 2E2OA 1K8KA 4NO7A 3LDLA 3FZHA 3VGKA 3ULEB 3FE1A 1HKGA 1NM1A 3FZLA 5FPDA 3D2EA 4Y0WA 1BDGA 4YDUC 2E88A 5AQIA 3FR0A 1R59O 2FSNA 2Q2RA 2YHYA 2PBDA 5BRHA 4BC3A 4WQ5C 2E1YA 3GBTA 4GNIA 1Y64A 1HKBA 2E2PA 2E2NA 5AQXA 3JXUA 3UE5A 2W41A 3HTVA 4WQ4A 3VF4A 4A2BA 2E1ZA 1X3MA 1KXPA 1DKGD 1T6DA 3SMPA 1MWKA 2J4RA 4ISGA 3ID8A 5JLHA 2P9PA 2CGKA 2YHXA 3A8YA 3H1QA 4B1VA 3DWLA 1NGGA 1D4XA 2Q0RA 3FGUA 3H3NO 4BVPA 2FSJA 5AQKA 3KVGA 3MK6A 4H5WA 3H3OB 5AQPA 2D0OA 3FLCO 4BRNA 4BR9A 2E20A 2IVPA 1E4GT 1K8KB 4HTLA 5F1XA 5I9EB 4BRMA 1DGKN 3HBTA 2CH6A 1ATNA 4QS9A 5F2RA 4IJAA 1TYQA 3C0BA 2Q1NA 2V52B 3D2EB 1ATSA 4FWOA 4IWVA 1H1VA 1RFQA 3ENHA 4CBWA 4CZJA 3CJ7A 5AQMA 2Q0UA 2YHWA 2V7ZA 5AQYA 3QFPA 3UKRA 3W3DA 5JLFA 1GLFO 5AQLA 3VF6A 4E1JA 2GWJA 2A3ZA 3FZMA 4FWPA 3ZX0A 1QZ5A 1HPMA 3P4IA 3KHYA 3H45C 4XH4A 1U2VA 4JN4A 2QW9A 2ZGYA 2GUPA 2GELA 2P9PB 3UKUA 4A61A 3VOVA 2P9IA 5LY3A 1YVNA 3WQTA 2QM1A 4YDUA 3BP8A 3SJHA 3MMVA 1ZBSA 1GLDG 1HKCA 1NLVA 1GLLO 4H0YB 4BRAA 3O80A 3AAQA 2Q36A 3CJ1A 3QDKA 1BWFO 1NGFA 2V51B 4FWLA 4MLEA 4CD1A 2E2QA 4CZHA 3LDPA 3BF1A 2VYPA 1TYQB 4CBUA 2IVNA 5AFUA 2H3GX 3ZX3A 5ADXH 1QQOA 1DEJA 3UKRB 1NWKA 4RTFD 3ZEUA 5BRDA 1TUYA 4O8KA 2P9SA 2ZF5O 3WXKA 3WXIA 5AQSA 1WOQA 5JICA 1QQMA 5AQHA 4XH5A 3WEEA 1U2VB 5AQRA 3IUCA 3O5BA 3UKUB 4K43A 4MLHA 4RCHA 2P9IB 1SAZA 3VEXA 4H5RA 2HF3A 2D1KA 2ZGZA 5FPNA 1QZ6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BR5A 4M3XA 4KRFA 3Q7BA 2Q97A 3ATUA 2P1JA 4TSXA 3H46O 1WNSA 1LWFA 3LWLA 1TL3A 3R3LA 1CLQA 4W5RA 3QERA 5BR9A 2NZTA 5FPEA 5FROA 4DSJA 4NXNK 3LALA 2NRTA 1C1AA 3AA2A 1JL2A 3EO3A 1NMDA 1ZBLA 3QINA 3D6RA 5LL6Z 3LPTA 1KSPA 3ITHA 2DY4A 1QHAA 3VQ4A 4BE1A 2KLAA 1EQYA 3MN5A 4LD0A 4BC2A 3FFIA 1E3MA 1HMVA 4KH6A 4BRFA 1ASVA 1BGXT 3DLLL 5DM6L 1WSJA 3LDOA 2ITGA 2G8VA 2A42A 3JS6A 3SQ4A 4DV7K 4CEEA 3DRPA 3QNOA 4DR3K 1OH8A 1CZAN 1WUAA 3M8QA 4CF1A 2PAVA 4CJEA 3PUFA 5KPTA 4BREA 3DM2A 3SYZA 3VQDA 1T44A 3KLGA 2O8CA 1J53A 3J7ZO 3J7YP 4C23A 1BHLA 2LSNA 4JKFA 2W40A 4DR5K 4FM2A 5I42A 3OJSA 3HJFA 1SQKA 1Z25A 3ZT4A 2YV0X 1T6CA 4CFAA 1EWRA 4OPAA 4ELUA 4CK3A 3O4QA 5CE3A 4FJ7A 4BY9C 4R5PA 3V9XA 2FF6A 4BG8A 1VHXA 1N5YA 4XEIA 2HVHA 1U47A 3IMXA 3I0SA 3JYTA 1QQNA 5C15A 1TK0A 4FZXC 1TL1A 5K14A 4HHTA 4JD2A 4DQSA 1QE1A 3VERA 1SUQA 2P9KA 4BR7A 4CEFA 4N56A 1GLEG 4FPBA 3L2QA 1U4BA 1S5JA 3UIQA 4JAXA 2AP1A 4R79A 1Q18A 3M8RA 1SKWA 4DV1K 2EWSA 4IG3A 3AVCA 5C2FA 4MDAA 4C8KA 1WSFA 4U67L 1HNIA 2IDOA 5AQTA 1ASWA 5AQZA 4B9MA 1BG3A 2ASPA 1RDWX 1EXQA 3VEZA 4DV6K 2XY6A 2HHQA 2E6LA 3TARA 4W5QA 2ZD1A 1L3VA 2HHXA 2PY5A 2OPRA 3P39A 1TKDA 3H6EA 4JNEA 3NGIA 1YXQA 2Z1GA 1Q86O 1WSEA 4DTNA 1KVAA 3O8MA 4WF9L 4FCYA 1YI2N 4JD2B 4OJRA 3H1VX 2G8UA 3VTIA 2P9KB 4FK4A 2NNWA 3O4WA 1HQEA 3E01A 4DR1K 4OKJA 4WFNL 3HYFA 2CH5A 2A5XA 4QS8A 1EETA 2NRWA 4JHDA 2Q3SA 4W5TA 4ID1A 3TAEA 3CQYA 5AQUA 3OS0A 5LJVA 2P5GA 4HCBA 1K9MO 1YHQN 2P5OA 1Z05A 1SL2A 3PX0A 3ID6A 3T1HK 1NNEA 4PL7A 4BR4A 2G8FA 3V9UA 1NJXA 4E7LA 2IVOA 2X78A 1RT3A 4H0PA 2GV9A 4FJLA 3DOKA 3HSCA 3AVJA 5HLFA 3NFAA 2KZMA 2F9TA 3ASMA 1FXXA 4OKEA 1S22A 3ZSWA 2FF3B 3WNEA 4OGCA 4JHDB 4Z4GA 4LFAK 4B1XB 4YY3K 2ITMA 4N47A 3F73A 1IO2A 4X66K 3A0IX 5ADXA 4KO0A 3AVLA 4FOIA 1N36K 1NGBA 4QS7A 2GTDA 4EIAA 4DKWA 3CETA 1JLQA 5AQWA 1TAQA 4DTOA 4YOTA 3A5LC 2ZJQL 4CFCA 4PY5A 3NF6A 5KRSA 3OYIA 3QB0A 4M7XA 5C2DA 3S3MA 3CM6A 5KTQA 1HYZA 4JI8K 4PQUA 4DTUA 1C0MA 4CJRA 4G9ZA 2P9UA 1XI1A 1KVCA 3LL3A 4Z4FA 2KHOA 4H5NA 3LZIA 5C25A 2GX9A 2CGJA 1TAUA 1BI4A 4PL8A 4A57A 1S1WA 4CZMA 3QBXA 3OYDA 2NRZA 4BDYA 3GL1A 3VGLA 4UY8O 4NCAA 1RT1A 5KPZA 1B9FA 4DTSA 1EX4A 4E1NA 5LMUK 4B9LA 4LF6K 1YITN 4KI6A 4YNQA 2VG6A 3V9WA 1YF5L 4B1UB 3OS1A 4E0DA 3VESA 3SUNA 4PKGA 4KB1A 3T1YK 4JI0K 2P9UB 4H0OA 2UU9K 2QA4N 3AARA 5EU7A 2YI1A 2WC9A 4J8FA 4V19S 3KK3A 1NGAA 1BO5O 1BI4B 3CERA 4CZKA 3W0LA 4C1NK 1RDCA 4GV3A 3CJ9A 4CD3A 4DR7K 4RW4A 2ATQA 3F2KA 2GEMA 4JYAK 4YFUA 5GIPA 3OBYA 1WSHA 3AO2A 3SQ0A 1C0UA 3MX5A 3FE1A 1HKGA 1ITGA 4JI6K 1W7AA 3D2EA 3LZJA 2E88A 5AQIA 1TVRA 3O9RA 3DRSA 1YVUA 4EP5A 2E1YA 4M45A 3DLBA 2W41A 3HTVA 4WQ4A 4DS5A 4I9LA 3KLEA 2D0CA 1T6DA 4IKFA 2J4RA 2NRVA 3NF8A 3WNHA 3CG7A 3O3HA 4LF7K 3HPHA 4ISGA 5JLHA 2YHXA 3H1QA 4B1VA 3DWLA 2Q0RA 4BVPA 2FSJA 3HOSA 4YORA 3HP9A 3CCRN 3PLAA 3HL8A 3HPGA 5F1XA 4K0KK 4LSLA 1ATNA 3CC2N 1TYQA 2V52B 3D2EB 4IWVA 4DR4K 2OTJN 2OA8A 5AQMA 2Q0UA 3O3FA 4DV5K 2O8BA 3K5OA 1IV0A 1NKCA 1GLFO 1X1PA 1VAZA 4FJ9A 3EYZA 2F7TA 2WOMA 3P1GA 3T19A 4GKKK 4FWPA 2HMIA 5GADP 4XH4A 4CJTA 4DSLA 4CECA 2QW9A 4E7HA 3ZSQA 3VQQA 3OYAA 3MEGA 1YTAA 3ZSVA 3SV3A 4QCLA 5LY3A 1C6VA 1YVNA 3Q7CA 3M5RA 1NOYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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