1HKGA

Structural dynamics of yeast hexokinase during catalysis
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
457
structure length
457
Chain Sequence
AASXDXSLVEVHXXVFIVPPXILQAVVSIATTRXDDXDSAAASIPMVPGWVLKQVXGSQAGSFLAIVMGGGDLEVILIXLAGYQESSIXASRSLAASMXTTAIPSDLWGNXAXSNAAFSSXEFSSXAGSVPLGFTFXEAGAKEXVIKGQITXQAXAFSLAXLXKLISAMXNAXFPAGDXXXXVADIXDSHGILXXVNYTDAXIKMGIIFGSGVNAAYWCDSTXIADAADAGXXGGAGXMXVCCXQDSFRKAFPSLPQIXYXXTLNXXSPXAXKTFEKNSXAKNXGQSLRDVLMXYKXXGQXHXXXAXDFXAANVENSSYPAKIQKLPHFDLRXXXDLFXGDQGIAXKTXMKXVVRRXLFLIAAYAFRLVVCXIXAICQKKGYSSGHIAAXGSXRDYSGFSXNSATXNXNIYGWPQSAXXSKPIXITPAIDGEGAAXXVIXSIASSQXXXAXXSAXXA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords HEXOKINASE A
publication title Structural dynamics of yeast hexokinase during catalysis.
pubmed rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 72
structure length 457
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1980-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkgA03
3CQYA 4CZMA 3VEVA 1NGBA 3VETA 3EL2A 1U2VB 1V4SA 5JICA 1ATSA 2A3ZA 2HF3A 4MO5A 5AQZA 1NBWA 1TUUA 4O8KA 4CZEA 2P9LA 5AQYA 1S3XA 2F9TA 5AQWA 4A61A 4EHUA 3QDKA 4MO4A 3DXKB 1XQSC 1GLCG 5EVZA 3A0IX 3DXMB 5BRHA 3LDOA 3J8AA 1QZ5A 2IVOA 4JHDA 4Z94A 3M1FA 3ZX2A 4BRHA 2NLXA 3VGLA 2V7YA 3GG4A 2I7NA 3FFKB 5AQQA 3C7NB 4BRLA 3ZEUB 1NGDA 4RCHA 3WUHA 4JN4A 2DPNA 3LDPA 1BDGA 1KAXA 3L6QA 2CH6A 2D0OA 2QW9A 1DEJA 2I7PA 3HI0A 1V4TA 3ID8A 1HLUA 3KVGA 3CJ9A 2Q2RA 5AQLA 5AZJA 2AP1A 4BC3A 4QS9A 3WXKA 5BRFA 4FWRA 5E84A 2IIRA 4GY2B 4PKIA 3GL1A 3H3NO 4MLEA 4BREA 2VYPA 4JHDB 3H1VX 4ISFA 4BRDA 1X9JA 4FO0A 1MWKA 5AR0A 3VEXA 3GDQA 3LDLA 3CI5A 4CZHA 4BC4A 4QS7A 5BREA 5E26A 5AFUA 5AQFA 3DJCA 3IUCA 1C0GA 1P8ZA 2IVNA 3CETA 4FOEA 1SAZA 2QWNA 4HTLA 5BN8A 2PAVA 1MDUB 2ZGZA 3MMVA 3IFRA 4BVPA 3O6WA 3EKUA 1Q18A 3LM2A 1ZC6A 4FWKA 3WXLA 4CZIA 4BRQA 2ZF5O 4CI6A 4IJAA 2V7ZA 4EAHD 2KHOA 3CHWA 3SMPA 3VEOA 5ADXA 3U4LA 4H5WA 2GWKA 3WT0A 1GLBG 1T6CA 4CD3A 4WQ4C 1CZAN 4GNIA 3LDNA 5JLHA 4XH5A 3CIPA 1G99A 1RFQA 3FR0A 5EX5A 3WQUA 4BRMA 2Q36A 5AQNA 1RGIA 3CJ7A 3ZETA 4JNEA 3O1BA 5BRDA 1GLAG 3QFUA 5FPDA 3SJHA 2VCPA 3UB5A 3TPQA 1NGFA 1SZ2A 2Q97A 4CZLA 2QWQA 3O1WA 2EWSA 4MLHA 4BRKA 1H1VA 4H0OA 3C7NA 3ZEUA 4FWSA 4ISGA 2FSNA 2E88A 1NGAA 3AAPA 4FPAA 3TU5A 1BUPA 4B1VA 4ISEA 2PBDA 4NB4A 4M63C 4WQ5C 1J6ZA 4HWIA 5AQRA 4BR4A 3GOIA 4K25A 5KPRA 4H0VB 4FWNA 1D4XA 1S22A 2ITMA 3MN7A 4CBXA 3EKSA 3SK3A 1BWFO 3UKRA 1DKGD 2NZTA 3EZWA 3FZKA 2AA4A 5KPTA 5AQKA 3ZETB 3EN9A 4B1XB 1OKJA 5AQIA 3C0BA 1KXPA 2A5XA 4H5RA 4YDUC 5BPMA 4QS8A 2E1YA 4BRNA 2E2QA 3I8BA 2P9UB 5AQUA 5LY3A 3VEWA 4RWTA 3HBTA 1T6DA 1IJJA 1NWKA 4BR9A 4FWLA 2ASMA 2E1ZA 3MN9A 4IXCA 3O80A 4FWPA 1ATNA 2V52B 3BF1A 3M6GA 3MN6A 4BROA 2P9KA 1XUPO 3KZBA 1NMDA 1NGHA 4I6MA 2YHWA 5AQJA 3UKRB 1MWMA 3U9ZA 5F1XA 3AY9A 4WYBA 2ZWHA 2P9SA 3SMSA 5AQSA 1NLVA 2E20A 3FZMA 2FSJA 5TKYA 3FGUA 2J4RA 3UE5A 5AQGA 4B9QA 5BR9A 5FPEA 4CBUA 2GTDA 4BQLA 1HX1A 3O08A 5KPZA 3ENHA 3VEYA 3VEZA 1GLJO 1Y64A 2HF4A 2VWBA 1HUXA 4O5FA 3O4WA 3L4IA 3VF4A 1HKBA 4J8FA 4BR0A 1YUWA 4KBOA 3A5NC 3HSCA 4XH4A 3D2EA 3FLCO 1NGCA 2BUPA 1QQNA 4EFHA 2P9NB 4DB3A 4XH1A 3LL3A 2P9KB 4CZGA 5JMVA 4I6MB 2A42A 1WOQA 3QBWA 2CH5A 3S41A 3ATVA 2ZGYA 1SQKA 4H5NA 2YHYA 3HZ6A 5EOYA 3WXJA 4IWVA 2P9SB 4H0PA 3JXUA 4DHYA 4H5TA 1JCEA 3VERA 1ZBSA 1EQYA 4BR2A 1LOTB 4BGBA 4BRAA 3A8YA 3R8EA 3MDQA 1X3NA 3OHRA 4BRIA 2E2NA 5BN9A 3WEEB 3CJAA 2YI1A 3UKUB 4H5VA 3A5LC 3CJBA 3MCPA 5LJWA 3DAWA 3D2EB 3ULEA 3DWLA 1U6ZA 1BG3A 4AM7A 4FOIA 3LM9A 3I33A 4C23A 4A2AA 3G25A 3CJCA 1NGIA 3O8MA 5EY4A 4L3QA 2QWMA 4IO8A 3KHYA 5CE3A 3BUZB 3QMLA 1GLEG 5FPMA 3P4IA 2CGLA 2V51B 2P9UA 3FZHA 1YAGA 5AQPA 3VESA 1BO5O 2Q1NA 1BU6O 2QWPA 3BEXA 1NGEA 1HKCA 2Q0UA 2QWLA 3BF3A 2E2OA 1Z05A 3R9PA 1BA0A 1TUYA 4B1YB 2GELA 2FXUA 4IZ9A 3ULEB 4BGAA 5BPNA 3AAQA 5AZIA 1QZ6A 3MK6A 1ATRA 4BG8A 1K8KA 3CERA 2WUSA 2GEMA 1YXQA 3R6MA 1HPMA 4H0YB 3HM8A 4FPBA 4BC2A 2YCHA 4CZJA 1MA9B 5AQOA 5F0XA 2GUPA 5KQDA 3A5MC 1R59O 1C0FA 2A6AA 2YHXA 2UYTA 4IJNA 3VENA 3GE1A 1T44A 1QQOA 2BTFA 3FZFA 4BR7A 1KAZA 4CZKA 4H0XB 4Y0WA 2QWRA 4PL8A 2Q0RA 4FWQA 3VGKA 2P9NA 1ESVA 4BRFA 1WUAA 2D0PA 2P9PB 4M7XA 5AZIB 3CJ1A 3L0QA 3GBTA 4FWOA 4A62A 1K8KB 3H6EA 4K42A 4RTFD 4LC9B 5FPNA 2FF3B 4B1WB 3H46O 2QWOA 3QB0A 4AM6A 2D4WA 1KAYA 1LCUA 2CGJA 3SLCA 1HJOA 2D1KA 2A41A 3M3ZA 1X3MA 2Q31A 1E4GT 3QBXA 5AQVA 1GLLO 3VOVA 3D2FA 2P9LB 2FLOA 4NO7A 3W0LA 3U9DA 3WEEA 1DGKN 3UKUA 3ATUA 2GWJA 3WXIA 3FE1A 4B1ZA 2YJEA 3VF2A 4K41A 2H3GX 3A5OC 4FL9A 1XC3A 3RSEA 5AFUH 4FSVA 4K43A 3QICA 5F2RA 4CBWA 5LJVA 1GLFO 2QXLA 5KQ8A 3ENOA 4BRGA 3HTVA 3IMXA 2F9WA 1QQMA 2ASOA 3JS6A 4WQ4A 5EXWA 4PKHA 4BRPA 3ZX3A 4F9OA 3QFPA 1BA1A 1JCFA 4CD1A 4EIAA 3H3OB 4BG9A 5AZJB 3EO3A 4BRCA 3D2FB 3VGMA 4BVOA 3B8AX 4CJ7A 3VPZA 3BP8A 5JLFA 2FSKA 4JAXA 3CQXA 3H45C 5ADXH 3D7EO 2E2PA 5AQMA 3RSEB 2P9IA 2YJFA 3F9MA 4BC5A 3MN5A 4BR5A 3U8XA 1E4FT 4JD2A 3LDQA 3H1QA 2A40A 1TYQA 4DQ8A 2HOEA 2W41A 3O5BA 4EHTA 4WQ5A 3W3DA 1U2VA 5ELZA 2FF6A 2IVPA 3FZLA 4PKGA 4H03B 4M7YA 1ZXOA 1IG8A 4BQZA 5AQHA 3IDHA 4E1JA 3DXKA 5AQTA 5I9EB 4XEIA 4PL7A 2E8AA 4A2BA 2OANA 3DXMA 3WQTA 4DCHA 1QHAA 1Z6RA 1NGJA 2NRHA 2CGKA 4FWMA 1RDWX 4H0TB 4YDUA 1BOTO 3VF6A 3ZX0A 1NGGA 5BPLA 2P9PA 2P9IB 1GLDG 4B1UB 1YVNA 5B8HA 3AARA 2W40A 1JCGA 1HKGA 4JD2B 5AQXA 2ASPA 2QM1A 1NM1A 4CZFA 1TYQB 2HMPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CQYA 1RBVA 4B08A 3VEVA 4KTZA 4OKKA 5C42A 4F3OA 5KGXA 1TV6A 4B3TK 4FZYA 3O4QA 3NGZA 1NBWA 5J2PA 3ZT4A 3THWA 5AQYA 4A61A 3QDKA 4EP5A 3DXKB 2QKBA 4KHQA 1B92A 3TSUA 3A0IX 4OLAA 2PZSA 4A5AA 4IFYA 4FJ5A 4Z94A 5FRMA 4FLVA 3M1FA 4CFBA 4JI2K 1JLEA 4DG1A 4YFUA 3E9PA 3AA4A 3VQEA 4BRLA 3ZEUB 3MXIA 1BQMA 4JN4A 1RT2A 1TK8A 4O44A 1BDGA 3I0SA 4KAZA 2D0OA 1U48A 3KKSA 3LPTA 1T8EA 2Q2RA 4CJUA 1KFSA 1Z26A 5AZJA 1NJYA 1L3SA 3THWB 3WXKA 1O1WA 3QETA 5BRFA 2HHWA 1QSYA 3CCMN 3H3NO 4W5QA 3NBPA 4FM1A 4BREA 4DFMA 4F3TA 2QXFA 3VTHA 4ISFA 3NH1A 3CFRA 4BRDA 1Q8IA 4FO0A 1MWKA 4CHZA 1LW0A 4J2DA 3CI5A 2RF2A 4DV3K 1C0GA 3N4QA 2IVNA 3OS1A 4FLTA 4FOEA 1SAZA 2QWNA 4HTLA 2PAVA 2ZGZA 3AVMA 2BE2A 4DTNA 3O9UA 1VQ8N 3WXLA 1U49A 3QEVA 4CI6A 4FJXA 4B9NA 4CHNA 4EAHD 2VGNA 3VEOA 2IDOA 2JLEA 3TSQA 3U4LA 4A5BA 3VQBA 3U6FA 3RR8A 2GWKA 1GLBG 3HOTA 2YHAA 1IKXA 4WQ4C 3TAGA 4HCBA 3WQUA 2HHHK 1VQ7N 3DOLA 5JVGL 3PLAA 2Q36A 5AQNA 4CEQA 3CJ7A 3O9QA 4DKWA 3F73A 3QLHA 4JNEA 3QFUA 3HVRA 3TPQA 1SZ2A 5C2FA 3DLLL 1VQON 3O1WA 5HL7L 4MLHA 3NVMA 4HVJA 1T05A 4C1NK 3WNGA 4DF8A 4N41A 3NGYA 4W5RA 4IDKA 3DYAA 3LDSA 1HMVA 4LF9K 3HT3A 3ZSZA 1D4XA 4DV2K 3TAEA 5KGWA 5CR4A 4CBXA 4FJJA 3EKSA 4DQRA 4Z4CA 3UKRA 2VQEK 4OX9K 2AA4A 3QIOA 4IBNA 3EN9A 1NJZA 2A5XA 1JL1A 4QS8A 1L3TA 4NXNK 1DTTA 5HOOA 1XI1A 3TTFA 1VSHA 4ZHRA 1VHXA 1CLQA 4MFBA 5I3UA 4Z4GA 1NWKA 5J1EA 4CGHA 3OYKA 4A59A 1B9FA 2E1ZA 2E6LA 3NH0A 4E7LA 1EX4A 2X6NA 2F96A 2V52B 3BF1A 2GX9A 3ASMA 3M6GA 3MWTA 4YOTA 4FLZA 2P9KA 1XUPO 3SI6A 4JKEA 3G0ZA 1NMDA 1ASVA 3BZKA 3UKRB 3VQ4A 4KB0A 2E6MA 3AY9A 4WYBA 1HR0K 2VG7A 3SMSA 5AQSA 1SV5A 1ASUA 2FSJA 1K73O 2J4RA 3DOKA 3EEQA 3UE5A 2BDPA 2ZD1A 4BQLA 2KQ2A 2YKNA 3O08A 3VEYA 1U04A 4DTSA 4JS5A 1HUXA 3AVJA 4QAGA 2OTJN 4J8FA 1JLQA 4XH4A 4HTUA 3D2EA 3VA0A 1NGCA 3FLCO 3O9RA 1QQNA 4F4KA 2P9NB 3B6PA 3OYCA 1LWCA 2P9KB 2DFFA 3KLHA 2A42A 1HPZA 1VK0A 5HRPA 3S41A 1KVCA 1VSIA 4O4GA 4FJIA 3CC2N 4IFEA 3VQDA 4H0PA 3JXUA 2D0AA 1UOCA 3VERA 2YKMA 4OPKA 3ZCMA 4BR2A 3TWHA 2ZM6K 5GADP 3Q7CA 2G8HA 4GVEA 3R8EA 1U45A 1X3NA 3U3YA 5BN9A 3WEEB 2DFEA 3ISNC 4B9SA 4OPJA 3CJBA 3O9SA 3DAWA 4LFBK 3D2EB 3ULEA 3KK7A 4E19A 2FBTA 4JK7A 2HHVA 1ZBIA 3MAQA 4L3QA 3KK1A 3SBGA 1JLGA 3KHYA 1FK9A 4B8CA 1QHTA 4N76A 4FJNA 3FZHA 4DTOA 5AQPA 1BO5O 4RW7A 1NGEA 1SUQA 1Z05A 2HB5A 4CEFA 4M3RA 4B1YB 3EYZA 1K6YA 1VSKA 3ULEB 1JKHA 3TSPA 3QIPA 5BPNA 3MK6A 1ATRA 1K8KA 3F5TA 3CERA 2WUSA 1HPMA 3CCRN 4FPBA 4F2RA 2YCHA 1J5OA 1SKWA 1TL1A 4KHSA 2HNZA 3A5MC 3CCVN 3OW2M 3THYB 1C1BA 3I0RA 3IAYA 5J2QA 2UYTA 2DFHA 4IG0A 3KLIA 3T1AA 2BTFA 3FZFA 2F7TA 3L8BA 2QWRA 4X66K 3HK2A 2XHBA 4NLCA 1K9MO 4BE1A 3N4PA 1WUAA 4DV1K 4LFCK 4M7XA 4BE0A 3L0QA 1K8KB 2HBKA 1NK9A 1NKCA 4CFCA 3NE6A 4FM2A 2CGJA 4FCYA 4NXMK 4JKFA 1N36K 2Q31A 2YV0X 1E4GT 1BGXT 5AQVA 1C0UA 4ZTFA 3UKUA 3FE1A 4B1ZA 3CXCM 2YJEA 4GKJK 4CK2A 3A5OC 1X9MA 3RSEA 4DR7K 3QICA 4CBWA 5LJVA 2QXLA 3ENOA 1S1WA 2DTUA 1QQMA 2BH1A 1J9AA 4FYDA 5EXWA 4PKHA 1NOZA 3SQ0A 3QFPA 3C95A 4I2PA 3QEWA 5KI6A 1HRHA 3EO3A 1VQ6N 3MECA 4BVOA 4KHUA 1IH7A 1FKOA 1VQNN 2HHTA 3ALYA 3K5OA 1VQ5N 4B3SK 4OPAA 3H45C 5JS2A 2OZSA 3ZSXA 4Z4FA 4FJLA 3V9ZA 1YT3A 3RSEB 4YNQA 2O8BA 4BR5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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