4Z0UA

Rnase hi/ssb-ct complex
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/peptide
molecule keywords Ribonuclease H
publication title Interaction with Single-stranded DNA-binding Protein Stimulates Escherichia coli Ribonuclease HI Enzymatic Activity.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o139:h28
total genus 49
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2015-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4z0uA00
2E6LA 3C94A 3G10A 1TK8A 4FXDA 1B92A 1RT7A 4ZHRA 2YNFA 4JRQA 3V1OA 4BE2A 1W9HA 4FZZA 2P51A 1Q9XA 3TAMA 2AJQA 3QINA 1CZBA 3KLGA 3VA0A 4CJ3A 1SL0A 4RW7A 4NYFA 3OJUA 3DLHA 3ZT0A 2OZMA 2EHGA 3AVFA 4KO0A 1MU2A 4CJRA 3RMCA 1ZBLA 3M8SA 4ELTA 5JS2A 4CGHA 2ZE2A 4YNQA 4DTUA 5HLFA 1ASVA 3K58A 4M3WA 1XI1A 1RTHA 3CQ8A 1L3UA 3AVMA 3HL8A 5D3GA 3KD1E 3VQ4A 2YNHA 4BE1A 3CM6A 4KV8A 4B8CA 4NCAA 3NGIA 1RT6A 3VQAA 3QNNA 4KHNA 2KTQA 4FK0A 2HHTA 4CGJA 3ZSOA 3K5MA 1UA1A 3M8RA 4DQPA 2IDOA 4BE0A 1L3SA 4G1QA 4M3YA 4E1MA 1S1UA 2E4LA 4Z4GA 1RT3A 4B9SA 4IDKA 2F8TA 1GOBA 1S5JA 4KTWA 4CGFA 4B9NA 4LH4A 4DTSA 4CF2A 1VRUA 2IS3A 4IBNA 4CHYA 3PY8A 1C6VA 1GOAA 3AO4A 4CJLA 3RMDA 1KRPA 4CERA 1RBSA 4R5PA 2DFEA 3WNFA 4CIEA 3HT3A 1VSIA 3EYZA 4FJJA 3O4QA 3T3FA 1TGOA 3DLGA 1VK0A 3MXIA 4CGIA 3AVNA 3OYFA 3ZSQA 3ZT3A 4C8MA 1NKBA 2F96A 5HBMA 4M42A 1KCFA 3IS9A 3P1GA 2ITGA 4ELVA 1IO2A 1RILA 1NOZA 1BL3A 3VQEA 4LSLA 4FJ8A 1NK6A 1DTQA 1VSKA 1TAQA 3NAEA 2D0AA 3B6PA 4DSJA 1SL2A 1WSGA 2G8WA 4F2SA 2PYLA 1U45A 1RT4A 3OYMA 5CYMA 4E0DA 1CXUA 4B08A 4M3TA 2D5RA 4FLZA 3KK1A 4M45A 5CYQA 3OYLA 5C24A 2G8HA 3KD5E 4M3ZA 1L5UA 1S9GA 1QSLA 5KGXA 3EY1A 3TABA 4FM0A 3PX6A 4CEZA 1NK8A 1VSHA 1BCOA 3MEGA 1S1VA 3OYEA 4O44A 4CCHA 4CK1A 4L8RB 1JLQA 4I9LA 3OY9A 2DFHA 4Z4CA 4NCGA 3T1AA 3ZSWA 4CJKA 3NF8A 1U49A 1CLQA 4O0IA 3V6DA 1BISA 3OJSA 4BACA 2XY5A 1C1AA 4FYDA 1TVRA 3KIOA 2XO7A 4NCBA 4LY7A 4KI6A 3VQQA 3UIQA 3KKRA 2QXFA 4N47A 4W5TA 4EP4A 1S1TA 1SKWA 2RPIA 4K8XA 4N41A 2HW3A 3QETA 3NCIA 3SQ0A 1VSJA 1T7PA 4FJXA 3NGZA 4Q0BA 1HNVA 3DRPA 1JLCA 3TANA 4LH5A 2VWKA 2HNZA 2Z1IA 3V9XA 5JS1A 4J2BA 5SWMA 3OYBA 3V9ZA 1KVBA 4F4KA 3KK3A 4OPJA 2FBTA 3E01A 4RW4A 3ZT2A 3AVAA 4JS4A 3LP1A 1NJWA 3IG1A 2YV0X 1IKWA 1C0MA 3NF7A 3SUPA 3DOKA 4FK2A 2Z1JA 1UAXA 3HP9A 3LAKA 4E3SA 4F8RA 3NE6A 3QIOA 1VSFA 3OVNA 1HQEA 3K5LA 3AVIA 1LWCA 3HPGA 4DSEA 4DSIA 2YHBA 3VQ6A 1SKRA 1RBTA 1RDDA 3DOLA 4GVMA 1NKEA 1J5OA 2RKIA 2ATQA 4KKOA 3AA2A 2A1SA 3VQDA 4F3TA 1VSLA 1JLGA 4O0JA 3AO3A 3P83D 3SQ1A 4TSXA 4FJHA 1TKXA 4OLBA 1NK4A 4KI4A 4CEAA 1IKXA 4CJPA 1RTJA 3O4NA 1NKCA 1BIUA 4KHSA 3HPHA 4XIUA 5FRMA 1Z26A 4CF1A 4DU1A 1KLNA 2G8UA 4DTRA 4RW9A 3DRSA 2PY5A 4DSFA 3AVBA 2B4JA 1EXQA 5J2NA 4ELUA 2O4GA 2IC3A 4B9LA 4CJ4A 3TAFA 4OKKA 1U48A 1HNIA 3DMJA 2HHXA 2FBXA 3RR7A 4KB1A 3DM2A 2HHWA 4QAGA 5HP1A 3K5OA 4EP5A 3QESA 2YNGA 3LP3A 2YKNA 5HRPA 2EX3A 1NK0A 3V1RA 1YTUA 5CZ1A 3OYNA 3I8DA 2R7YA 3BDPA 2JGUA 1T03A 2Q3SA 4Q5VA 4PY5A 1EX4A 3FFIA 1U04A 4DS4A 3CM5A 1JL2A 1TKZA 4H8KA 2DY4A 3S3MA 1B9DA 1KTQA 3VN5A 1NK5A 3ZCMA 4DS5A 4E19A 1ZYQA 3QIPA 4DF8A 3L2WA 2Y1IA 1VSMA 2KZZA 1RTDA 1QTMA 3S9HA 3HXMA 4O4GA 4GMJB 2IOCA 3LPUA 4JLHA 4DG1A 4FZXC 3ZT1A 4B3OA 1YTAA 3V9UA 4BDZA 2RF2A 3MECA 1X9WA 1TV6A 4HTUA 4H4OA 4MQ3A 1IKYA 4AILC 5DMRA 1NK9A 4I2PA 3NFAA 3L3VA 2YHAA 2P1JA 3DYAA 3NH1A 4FLWA 1D9FA 2KQ2A 1ITGA 1DTTA 2D0CA 4FCYA 4DSKA 1EKEA 4HUFA 3SNNA 3L8BA 1A5XA 4JS5A 3SV3A 4DTMA 4Y1CA 1ASWA 3K59A 4HUGA 4C8NA 2GUIA 3K2PA 3ZSVA 3O3HA 2KW4A 1TKDA 3PO4A 2BDPA 2GV9A 3A2FA 3OYCA 2PYJA 1A5VA 3D45A 3K57A 1EP4A 5J2PA 1NJXA 2YNIA 4KHYA 5J1EA 4KFBA 3L3UA 3HYFA 4DLGA 2F8SA 3C95A 3QLHA 3OYAA 4DQQA 1RT2A 1C1BA 1QE1A 1RT1A 3NHGA 1TK0A 4M3XA 3AA3A 4CGDA 3M8QA 4CEEA 2Y1JA 4OPKA 1KFDA 1JLBA 3P5JA 4FVMA 4DFJA 4ICLA 3QEPA 1LW2A 2OPRA 3SUOA 3HJFA 4FJGA 3AVLA 1HRHA 3PV8A 1ZBUA 3VA3A 1UWBA 4DMNA 2ZD1A 1JLEA 1RDCA 5K14A 1N6QA 4CF0A 4O55A 3AO1A 1VSDA 3VQBA 3HPOA 1QQCA 3V81A 1BQMA 3WNGA 3RMBA 4I9QA 4W5NA 3O3FA 1FKPA 4BWMA 4HUEA 1TK5A 1I3AA 4C8OA 1JLFA 4J2DA 2XRIA 4RG8A 3SQ2A 4M41A 1WSIA 1WSHA 5HRSA 1KFSA 3ALYA 1HYSA 4FJLA 3AA4A 4ID1A 1WSFA 3DLBA 5KRSA 4CECA 4CF8A 3PX4A 3SUQA 1D5AA 4KREA 5T7BA 2P5OA 1X1PA 4IKFA 2G8FA 4FJNA 1RBUA 3PUFA 3OYIA 3U3YA 1EETA 2G8KA 3KLIA 4OGEA 3DLEA 4MFBA 5FRNA 1BI4B 1U47A 1B9FA 2Z1HA 4AH9A 3PX0A 1IG9A 1KVAA 3KKSA 3HK2A 2B6AA 3TAQA 4QOZB 4CGGA 4WE1A 4CF9A 4Z4HA 3L2UA 3RR8A 3QNOA 4KRFA 2IAJA 4CFDA 3S3OA 4Y1DA 1LWEA 4CJUA 3L2RA 2X6NA 3VQPA 3HP6A 4B9VA 4Z4IA 2OZSA 3MEDA 1C1CA 1YVUA 1FXXA 4OJRA 3AA5X 3SZ2A 3TAPA 3NH2A 4CHZA 4CJVA 4CEDA 3LALA 3AVKA 1K6YA 1IH7A 4RW6A 3ASMA 3NBPA 5KGWA 1WLJA 1X9MA 4B9MA 4AHVA 3DLKA 1LV5A 2VG6A 4CJEA 1NOYA 1BCMA 1UOCA 1T8EA 4HHTA 1S6QA 1SUQA 4F3OA 2PZSA 3AVGA 2IGIA 4FJ5A 1I39A 3VQ8A 2OPPA 3KLHA 3K5NA 4W5QA 4OKJA 4O5BA 1F21A 5I42A 3H08A 1NJZA 1XWLA 3LZJA 4J2AA 1J9AA 5SZTA 1JL1A 1TL3A 2O4IA 2WOMA 3LAMA 3AO5A 5J2MA 3SI6A 2A1RA 2G8VA 2JLEA 3SQ4A 3NH0A 3F9KA 3I0RA 3HM9A 1DLOA 4AHSA 2HB5A 1A5WA 3ZSXA 4N56A 2QKKA 2BGGA 2OPQA 3BGRA 1BIZA 1S9EA 2XY8A 4FW1A 5C25A 4DTXA 4AHCA 2D0BA 3V9WA 4JRPA 5CZ2A 4N76A 3HVRA 1JLAA 1X9SA 5EU7A 4E89A 2BANA 3JSMA 4DTOA 4PUOA 1XHXA 2WONA 2FBYA 1JXEA 4CEBA 1VSEA 4DFKA 2BE2A 3VQCA 2OA8A 2HVIA 1WN7A 3G0ZA 4YFUA 1C0UA 1WNSA 1QSSA 2G8IA 4RW8A 1LAWA 2E6MA 3NF6A 1S6PA 1S1WA 4CJTA 4K8ZA 1Y97A 3S3NA 2KFZA 4CJ5A 3KLEA 5HRRA 5E41A 4CFAA 4CE9A 3KTQA 3SYZA 4UQGA 5J2QA 1HQUA 1LWFA 1O1WA 2X78A 3LP2A 5FDLA 3V1QA 4FJIA 3B6OA 3D0PA 3OYDA 4FJMA 3IRXA 3TARA 2Z1GA 2XY7A 2HHQA 2HNDA 4B8AB 3MAQA 3OYJA 5KTQA 3NDKA 1JKHA 4C8KA 3ULDA 2FC0A 3DI6A 3CYMA 3O3GA 1LAVA 4CEQA 3SCXA 3VQ7A 1HPZA 3U3GA 4FM2A 4FJ7A 4H4MA 1Q8IA 3ZSRA 1FK9A 4ID5A 3LWLA 4CHOA 1SV5A 4E7KA 3LP0A 4DQIA 3TR8A 3QEVA 1FKOA 4CESA 3CFPA 4LSNA 4CJWA 1KSPA 4PQUA 1RCHA 1D9DA 4M3UA 1TAUA 1YT3A 2FBVA 4FLTA 1WAFA 3IAYA 3AVCA 4BWJA 4J2EA 3DLRA 4FJKA 4M3RA 2HHSA 2HHVA 3LPTA 4OKEA 4CFBA 4E1NA 2VG7A 4N5SA 3HSTB 2RN2A 4CK2A 2VG5A 2VWJA 4E7HA 1SL1A 3ISNC 1TKTA 3L2VA 4GW6A 1RTIA 3VQ5A 4DFPA 1XC9A 3T19A 4AHUA 3PO5A 3MEEA 2NUBA 3QO9A 1WAJA 3CFRA 3ZSZA 3OYGA 3KLFA 4FW2A 4CK3A 4DFMA 4CJFA 2W42A 2OPSA 4DTPA 4KHWA 4Z4EA 4CEOA 5C42A 1UA0A 4CFCA 1RBRA 1QSYA 4HCCA 3SUNA 3OS0A 3LWMA 5HROA 3TWHA 2HHUA 4W5RA 4IG0A 2X74A 3OYHA 4DWIA 1HYVA 2P5GA 2OYQA 3QEWA 1J53A 3U6FA 1Q9YA 2QKBA 5KI6A 4W5OA 3MXJA 4KHQA 1IKVA 3TAGA 4HCBA 4CHPA 3LZIA 3KK2A 1SKSA 4KTZA 2HMIA 1J54A 4DTJA 4E7JA 1L3VA 3KJVA 4ZTFA 3RRGA 5DK5A 4KTQA 1U4BA 5KRTA 3OS2A 4KAZA 2HVHA 3C6TA 5FROA 1D8YA 4KHUA 4DQSA 4E7IA 4CIFA 4DQRA 1XHZA 3AVHA 1RBVA 2XY6A 3SJJA 1KLMA 4C8LA 1VRTA 3F73A 4NYNA 3AO2A 4B9TA 2LSNA 3V9SA 4CIGA 3HVTA 3WNEA 4LD0A 3THVA 3HO1A 4CJSA 2B5JA 4QCLA 1NK7A 4IFYA 4ZTJA 3RMAA 1KVCA 3JYTA 3WNHA 3L2QA 3SPYA 4FLVA 4DU3A 4PA1A 2ETJA 3I0SA 1RT5A 1REVA 2ZQBA 1QHTA 3AV9A 3LANA 3ZT4A 4OVLA 4CHNA 4HVJA 1ASUA 4FLXA 2QK9A 3V4IA 4KB0A 4AHRA 4DTNA 4CJQA 4EZ9A 4FJ9A 4OGCA 3NGYA 3NF9A 4F2RA 3AVJA 4DU4A 3VQ9A 4Z4FA 3LDSA 1HYZA 1R0AA 3QERA 2HNYA 3M8PA 1LW0A 1BQNA 4CHQA 3SPZA 1CXQA 1N5YA 1RNHA 3MXMA 2DTUA 4FK4A 5HRNA 1ZBIA 1HMVA 3RWUA 4FLUA 4FM1A 1G15A 2YKMA 4DSLA 1ZBHA 3OS1A 3TAEA 1BGXT 3QEXA 2KFNA 5I3UA 4B9UA 1ZBFA 1WSJA 3EZ5A 1JXBA 1RDBA 4IFVA 1T05A 1NJYA 1CZ9A 4CEFA 3RTVA 3RRHA 4EZ6A 1C0TA 1RDAA 1BI4A 4BDPA 3CFOA 4IG3A 4KPYA 3DRRA 1L3TA 4I7FA 4DLEA 4BDYA 4PWDA 2DFFA 3ZSYA 4FLYA 2XHBA 1TL1A 1WSEA 1S1XA 2KZMA 2I5JA 1Z25A 2GBZA 3CG7A 3C6UA 3OYKA 3SV4A 4E7LA 3QEIA 3TI0A 4FZYA 1W0HA 1GOCA 4Z0UA 4OLAA 4I2QA 1QS4A 4DF4A 3ITHA 2X6SA 5CY4A 1BHLA 4AHTA 1HJRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E6LA 1TK8A 4LF4K 3TAMA 3HSCA 4PKIA 3ZT0A 3AVFA 1HNWK 3RMCA 4GNIA 4DV7K 5JLFA 2GEMA 2ZE2A 4YNQA 1ASVA 4JN4A 1L3UA 1RTHA 3AVMA 3HL8A 3O8MA 4GV3A 3IUCA 1IV0A 2IVNA 4IOAL 3CM6A 1N32K 3QBWA 1RT6A 3VQAA 3QNNA 3Q7CA 3EKSA 4JKGB 4NB4A 4KHNA 4CGJA 2HHTA 3ZSOA 3M8RA 3W3DA 3QMLA 4JHDA 1H1VA 4Z4GA 2W41A 2ZGZA 1GOBA 3EO3A 4B1ZA 2ASOA 4LF7K 4IBNA 1E3MA 1IBLK 3PY8A 1VQLN 4OX9K 3VETA 1KD1O 1RBSA 2IVOA 4CIEA 1VSIA 3O4QA 3WT0A 3DLGA 1OH5A 1HJOA 1NGJA 5HBMA 3U4LA 5KPZA 4ELVA 2FSJA 1IO2A 1RILA 4JKEA 3DXKA 3SK3A 4FJ8A 4LSLA 1VSKA 1O13A 1TAQA 4FWOA 4A62A 2PYLA 4M3TA 1ATSA 5BREA 1S9GA 2VQEK 1BCOA 1JLQA 4I9LA 2OCEA 1U49A 3NF8A 4FYDA 1TVRA 3E66A 3KIOA 2VYPA 4NCBA 4LY7A 1CZAN 3SAGA 3ULEA 3D6RA 4N47A 4EP4A 3M3ZA 5AQTA 3QETA 3NCIA 4ILHA 1T7PA 3NGZA 3TSQA 3TANA 1JLCA 2VWKA 3V9XA 5AZIB 3CCVN 4XH1A 3KK3A 3E01A 4RW4A 3AVAA 4H03B 3LP1A 1C0MA 3NF7A 4JI8K 4BRLA 2Z1JA 1GLEG 1LWCA 5BN9A 3CIPA 4WYBA 5AQSA 3DOLA 1LCUA 2RKIA 3LDLA 4WQ4C 3AO3A 3D7EO 3DXMA 3WXIA 2NRTA 4OLBA 1NK4A 4KI4A 1IKXA 4CJPA 1KAYA 4BGBA 4KHSA 1XQSC 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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