2VCPA

Crystal structure of n-wasp vc domain in complex with skeletal actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Interactions of isolated C-terminal fragments of neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) with actin and Arp2/3 complex.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 370
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2vcpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2vcpA04
5BPLA 4BR7A 3H46O 4H0TB 3FFKB 3LDLA 5BREA 5AR0A 2P9LA 1TYQB 3VEYA 5FPDA 1S3XA 5KPTA 3MN9A 3HM8A 2VYPA 3VEVA 5AQGA 4H5NA 1MA9B 3R6MA 4B1ZA 4DB3A 4EHTA 1X3NA 2F9TA 2QWPA 3A8YA 4BRMA 3VERA 4AM7A 3ZX2A 4DCHA 3DXKB 1E4GT 1QZ5A 4A62A 3AAPA 4BRDA 3QFUA 4ISGA 1NBWA 5AQTA 2NRHA 4NO7A 3U8XA 5KPZA 1K8KB 4IZ9A 2F9WA 3KZBA 4K41A 2CH5A 5AQKA 3VOVA 1TYQA 2H3GX 1Z6RA 2WUSA 4BRLA 4BR2A 5BPNA 3U4LA 1QHAA 2HF3A 3DJCA 2ZWHA 3O4WA 5BN9A 3H3NO 3BF1A 4XH4A 5AQRA 4BRGA 4KBOA 5AQZA 4L3QA 4RTFD 3FZMA 4PKIA 1HX1A 4FL9A 2GEMA 1H1VA 4FSVA 3KHYA 3H1VX 4BROA 4CZGA 4HTLA 3MN5A 4MO4A 4FWNA 1ZC6A 4XEIA 3EL2A 5AQLA 5AQJA 2Q2RA 4B1UB 1HPMA 4FPBA 2CH6A 2QXLA 1NGIA 3D2EB 1U6ZA 1BU6O 3VF2A 4BR0A 3O08A 1GLDG 2D0PA 4CJ7A 4H5TA 2ZF5O 2Q97A 3U9ZA 5AQMA 1KAZA 1TUUA 4BGBA 4ISFA 2ZGZA 4K42A 3R8EA 2PAVA 4BR4A 5E84A 1QQNA 2V7ZA 3H3OB 4FOEA 2PBDA 2CGLA 4MLHA 4WQ5A 4A61A 1BWFO 3CI5A 4BG9A 4Y0WA 1SZ2A 2CGJA 1YUWA 3M1FA 3RSEB 5AQNA 1MWKA 3A5OC 3D2EA 5TKYA 1NGBA 1NGDA 1LCUA 4FWPA 4CBWA 4CZIA 4FWOA 3AY9A 2IVNA 4Z94A 3U9DA 4DHYA 1ESVA 4BRHA 3VEXA 1T6CA 3CHWA 3VENA 5BPMA 3GE1A 2EWSA 2E2QA 3B8AX 3MN6A 3O80A 3P4IA 1OKJA 4WQ4A 3FZKA 5JICA 5AQOA 4DQ8A 1ATSA 4EAHD 4FO0A 1NM1A 4H0XB 3WXJA 3LM2A 3DXMA 3VGMA 4CZEA 5BRHA 4FOIA 4CZLA 3ENHA 1BG3A 5ADXH 3JS6A 3CJBA 1D4XA 1RGIA 3H1QA 4C23A 5BN8A 5AFUH 3HSCA 3AAQA 4IJNA 2YHYA 3BP8A 4B9QA 4CBXA 4CZHA 4H0YB 4H03B 2P9UA 4MLEA 2A3ZA 2NZTA 2W40A 3ZETB 1GLLO 2Q31A 3BF3A 3DWLA 3FZFA 4BRIA 4RCHA 3G25A 3VEZA 4QS9A 3SLCA 3QMLA 1YAGA 1QQMA 1DGKN 4JNEA 2E1ZA 3MCPA 3HZ6A 2YCHA 3CJCA 3UKRA 5EX5A 3VGLA 2E8AA 1TUYA 2KHOA 2DPNA 5AQHA 3MN7A 1NGFA 4PKGA 2E2NA 2Q36A 3M3ZA 4YDUC 3VF4A 2P9NB 2FLOA 3C7NB 3I8BA 2HMPA 3I33A 1KXPA 3CQYA 4FWSA 4EIAA 3ZETA 2A5XA 1HKGA 2QW9A 1BUPA 4FWMA 2VWBA 1BOTO 3HBTA 2YJFA 3VEWA 2UYTA 1JCFA 4BR5A 3CJ7A 1GLEG 4B1YB 1WOQA 5AQIA 4EHUA 2V52B 5AQYA 5FPEA 4CD3A 4K43A 5AQSA 4RWTA 1HKBA 3O1WA 4JD2B 1IJJA 3WQTA 3VESA 2QWLA 4BRNA 1X9JA 2P9SB 4A2AA 2P9KA 1HJOA 1MWMA 3JXUA 3MDQA 4CI6A 4BG8A 4IJAA 1NLVA 4A2BA 4BC5A 4CZMA 4BVOA 5KQDA 3A5NC 2P9NA 2GTDA 5E26A 5AQPA 3C7NA 1T44A 1C0FA 1BO5O 5BRDA 3A0IX 2VCPA 4IXCA 1R59O 2ASOA 4BQLA 3VGKA 4BR9A 3FR0A 4MO5A 3WXIA 2FXUA 2YI1A 2AA4A 2E20A 1IG8A 4BQZA 2YHWA 4O5FA 3QDKA 4JAXA 4H0PA 4JD2A 3MK6A 1QZ6A 2Q0UA 3HTVA 3SJHA 1J6ZA 3VF6A 2P9SA 2GELA 3QB0A 3IFRA 4M7YA 2A6AA 2ASMA 3QFPA 3TU5A 5F2RA 4BRAA 4BRPA 4WYBA 1XUPO 4I6MA 3KVGA 1P8ZA 1KAYA 1BA1A 3DXMB 2QWRA 5FPNA 5FPMA 3FLCO 2I7PA 2QWNA 4BREA 1WUAA 3D7EO 3O8MA 3EKUA 1DKGD 3ZX3A 4CZFA 3IMXA 3GOIA 1ZBSA 2P9IA 3AARA 4ISEA 3QICA 5AQVA 5F1XA 3TPQA 3A5MC 5EVZA 2ITMA 5EOYA 5F0XA 2BTFA 2P9UB 3WUHA 1SQKA 4H0OA 2CGKA 3UB5A 1HKCA 1NGCA 4IWVA 3H45C 3WXLA 4JN4A 1Z05A 5AZJA 1SAZA 3VEOA 2A41A 4NB4A 4BRQA 2D0OA 3UKRB 2GUPA 3M6GA 5LJVA 4B1WB 4HWIA 3LDQA 5LJWA 3IDHA 2E1YA 4GNIA 3CERA 4FPAA 5ADXA 3UKUA 2A40A 3QBXA 5AFUA 2QM1A 4AM6A 3CJ9A 1ATNA 1HUXA 1GLCG 1GLJO 3W0LA 2IIRA 4BC2A 4BRCA 3GBTA 1GLAG 3EKSA 3LDNA 2GWJA 2YHXA 2AP1A 4IO8A 3CIPA 5EY4A 4XH1A 4H5RA 1BDGA 5ELZA 1NGGA 1V4SA 4H0VB 4CZKA 1JCGA 3VPZA 4XH5A 1U2VB 3FGUA 3OHRA 2P9KB 3O5BA 3R9PA 3GDQA 3ENOA 1CZAN 3GL1A 2FSJA 3O6WA 5EXWA 2W41A 5JMVA 4J8FA 3IUCA 3SMSA 1Q18A 3H6EA 5LY3A 1EQYA 4YDUA 2I7NA 4FWKA 2IVPA 1QQOA 5AZIB 5AQQA 2ASPA 3A5LC 1C0GA 3ID8A 2NLXA 4FWRA 1G99A 3BUZB 1YXQA 3C0BA 3GG4A 3EO3A 1DEJA 3ULEB 4PL7A 4JHDB 3BEXA 4LC9B 1U2VA 4M63C 1NWKA 3O1BA 4CZJA 4BRFA 3CQXA 3S41A 1BA0A 4BRKA 1JCEA 3J8AA 1NGEA 1NGAA 4I6MB 2Q0RA 5AQUA 3WEEB 4FWLA 4BGAA 1NGJA 2BUPA 5I9EB 4H5VA 5AZIA 4O8KA 3VETA 1ZXOA 5AQXA 2D1KA 4CBUA 3DXKA 1T6DA 1X3MA 3F9MA 2OANA 1RDWX 4PL8A 5KPRA 2YJEA 4B1VA 3FZLA 2P9IB 3W3DA 3ULEA 4JHDA 3WQUA 4H5WA 1K8KA 2P9PB 4QS8A 1E4FT 2V51B 4F9OA 4B1XB 1YVNA 3WT0A 4BC3A 1XQSC 2A42A 1KAXA 5AQFA 3ATVA 3FZHA 4M7XA 5AZJB 1NGHA 3WEEA 5BRFA 1GLFO 1Y64A 3ZEUB 2D4WA 1HLUA 1XC3A 2FF6A 5JLFA 2E88A 1LOTB 2QWOA 3D2FB 4BC4A 3EZWA 4FWQA 2V7YA 3L0QA 4BVPA 2GWKA 4WQ5C 3SMPA 4EFHA 1V4TA 3WXKA 5B8HA 2P9PA 2ZGYA 3UKUB 3QBWA 4GY2B 5CE3A 2HF4A 3LDOA 4CD1A 2FSKA 2QWQA 3ATUA 3FE1A 5KQ8A 1NMDA 2E2OA 4PKHA 4K25A 3LM9A 1S22A 3MMVA 2Q1NA 4E1JA 2FSNA 2J4RA 3ZEUA 2P9LB 2QWMA 3D2FA 3CJAA 4QS7A 3DAWA 1RFQA 2IVOA 4WQ4C 3ZX0A 3L6QA 5BR9A 3LDPA 1GLBG 3EN9A 3CETA 3LL3A 3CJ1A 3L4IA 5JLHA 1ATRA 2HOEA 5AQWA 3SK3A 3RSEA 3HI0A 2FF3B 1MDUB 3UE5A 2E2PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DSJA 5BPLA 2HHQA 5GIPA 3LDLA 1HQUA 4LY7A 1TYQB 4KB0A 4KHNA 3ZT4A 1U48A 3HM8A 2DY4A 4B3TK 3VA3A 4Z4FA 2BANA 3LP1A 2O8EA 1RTJA 1MA9B 3R6MA 4B1ZA 3RWUA 2QWPA 3MX5A 1KCFA 1K8AO 3DXKB 3MEGA 1E4GT 2O4GA 1IBMK 4DR5K 4BRDA 5M1FA 5AQTA 2OPPA 3DLEA 3MEDA 3IRXA 3EYZA 4K41A 5FLXO 5AQKA 1HJRA 4CESA 3VOVA 2WUSA 2XY6A 3TAPA 4BRLA 3L4QA 3ZT0A 5BPNA 1QHAA 2HF3A 4KPYA 2ZWHA 3AVLA 4YHHK 3ZCMA 5J2QA 4KBOA 4CHOA 1LWCA 4FJJA 4L3QA 4FJHA 4HUFA 1D5AA 3DLGA 3NF7A 1IBKK 1WLJA 2GEMA 3C65A 4FSVA 3HOSA 4DQIA 1GOAA 3PSFA 3MN5A 4FWNA 1J53A 3U3YA 1BIUA 4OPJA 1JLCA 3BZKA 2CH6A 2EHGA 3K0SA 2QXLA 1LAWA 1U6ZA 3LP3A 4N76A 4CJ7A 3CC7N 1JL1A 4DFMA 1WN7A 1YT3A 4DTSA 3P1GA 4E3SA 2ZGZA 2PAVA 4BR4A 4KHUA 1QQNA 4JI2K 3PSIA 3VQAA 4KO0A 2V7ZA 1BI4A 3E66A 2PBDA 4MLHA 4A61A 4JI4K 1BWFO 5DMRA 5KRSA 3LZIA 4Y0WA 4Q5VA 2CGJA 4L8RB 5AQNA 1MWKA 3PV8A 1K6YA 3A5OC 2E4LA 3SQ4A 4MDAA 3D2EA 5TKYA 4F3OA 4CZIA 4CBWA 3SCXA 2IVNA 1M90O 4DHYA 5JS1A 3T69A 2F96A 5CZ2A 4H8KA 3D0PA 3VEXA 3VENA 3TWHA 3GE1A 2UXDK 4CJ3A 2E2QA 3MN6A 3IKMA 3O80A 2PY5A 2YX6A 1KFSA 3VQQA 4FO0A 3WXJA 3LM2A 4CGDA 5BRHA 1N33K 4JKEA 4FOIA 1JL2A 3QETA 4CZLA 5C15A 1BG3A 1TKZA 3JS6A 1D8YA 1D4XA 1TKXA 3HPHA 2YHYA 4OJRA 1X9WA 4WE1A 4I9LA 5CYMA 4H03B 2IDOA 2A3ZA 2NZTA 2W40A 1RCHA 3OYIA 4OLBA 1NKEA 3G25A 2QKKA 4R79A 4DLGA 3QMLA 1CZBA 3TABA 3AVCA 1DGKN 2VG7A 1QSSA 2YCHA 3UKRA 3E01A 4E89A 4W5QA 3VGLA 3SAFA 3I55N 2KW4A 1WBBA 3HYFA 1TUYA 5CHIA 1KFDA 3J80O 1Z26A 3MN7A 4JEPA 2QI2A 3THXA 2E2NA 1VQLN 3G4SN 1W7AA 3N4QA 1N6QA 1RTHA 3C7NB 3E1YA 3I33A 4CEOA 3SUQA 2PYJA 4EIAA 3ZETA 1Q8IA 4BR5A 3VQEA 1NJZA 1GLEG 4B1YB 1WOQA 4EHUA 5FPEA 3Q7CA 1IJJA 2HHIA 1NU0A 4A5BA 3D6RA 3M8RA 1RT5A 3WNEA 3DRSA 2B5JA 3JXUA 1T7PA 1I94K 4IJAA 4A2BA 4E7IA 4DSEA 3QEIA 3O4NA 3A5NC 4PQUA 5C24A 1BO5O 2G8IA 2YNHA 2VCPA 1NK4A 3S3MA 4BR9A 4MO5A 4AHVA 2FXUA 2YI1A 2AA4A 2E20A 3VQCA 1RILA 2YHWA 3QDKA 3VQBA 2Q0UA 3AA3A 3HOTA 2C1IA 2A1SA 3IFRA 4R5PA 1E3MA 2A6AA 3V9WA 4CERA 4BRAA 4FJ5A 4WYBA 3K9KA 4FLVA 3KVGA 4CFDA 2X6SA 1BA1A 1OH8A 2QA4N 2QWRA 4B3OA 3IG1A 4DR4K 2HNZA 4FJKA 3TARA 4DSKA 1RDCA 4CZFA 4FJ9A 3KD1E 3AGRA 3AARA 5AQVA 2IC3A 4FLXA 4DSLA 2WOMA 5EVZA 2NRTA 2ITMA 4AHCA 2ZD1A 4O0IA 3WUHA 2R7YA 3THYA 3UB5A 1NGCA 4CJUA 4EZ6A 3DLKA 5M1KA 3J81O 5CZ1A 1Z05A 5AZJA 3SNNA 1RT7A 1RT6A 3VEOA 4FK0A 4LH5A 4MQ3A 5JVHL 1N34K 3OS0A 5DM7L 4FJXA 4CHYA 2E1YA 1FKOA 5K14A 3KJVA 3OYJA 1G15A 4M3WA 4JKGA 2A40A 3O9SA 3OW2M 3NAEA 2ZQBA 4AM6A 4CHZA 3AO1A 4BC2A 1CXQA 2IIRA 3PIOL 4X65K 3GBTA 4FJMA 3TTFA 5KI6A 3SAGA 4XH1A 1BDGA 1EO1A 1WSEA 4DTXA 4H0VB 2HVHA 3VMFB 4JKFA 1JLFA 1JCGA 3OHRA 3O5BA 1VQ9N 1XHZA 2W6KA 1FKPA 2GV9A 4CEDA 1IH7A 4JLHA 3O6WA 4KFBA 1P90A 5JMVA 4J8FA 5GINA 4CGHA 4YDUA 5AZIB 1QQOA 3K58A 4FWRA 4YOTA 4OGEA 1RBTA 4GW6A 3C0BA 3LALA 3V1RA 3EO3A 4O0JA 4GVMA 4DU4A 4CK3A 2VWJA 5C0YA 3O1BA 4DTUA 1BCMA 3CQXA 3PY8A 4YNQA 4CJKA 1QVFM 1TVRA 3P83D 4ID1A 1JCEA 1NGAA 2WONA 4FXDA 4N41A 5AQUA 4PHTX 1WBDA 2KFZA 4O8KA 3CG7A 3DXKA 1W97L 1GOCA 4FZZA 1X3MA 1VQKN 4IOAL 4PL8A 2P9IB 4CHQA 3ULEA 2KZZA 1KLNA 4M45A 4DU1A 4QS8A 4NXNK 3DLBA 4B9TA 3CXCM 2P5GA 4RW4A 3NCIA 2WBNA 4KH6A 4X62K 4JKBA 1YITN 4N56A 4QAGA 1GLFO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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