2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
3GG4A 1IJJA 3FGUA 1T6DA 2D4WA 4BRCA 3ID8A 4RTFD 5AQTA 5AFUA 4B1YB 3HBTA 5AQLA 5AQYA 4CI6A 1NGHA 1RFQA 2FF3B 3VESA 5JLFA 4CZIA 1V4SA 2CGJA 4AM7A 4WYBA 4BRLA 1QZ5A 4B1ZA 5AFUH 1BUPA 2A6AA 4B9QA 3UKRA 3U9DA 2E1ZA 5F2RA 4FPBA 4O5FA 3WXLA 3FLCO 3IUCA 3UKRB 4H5WA 1E4FT 1XC3A 3QMLA 2BUPA 4J8FA 5BRHA 3QDKA 4NO7A 4CZMA 1ZC6A 5EVZA 1SZ2A 5BPNA 1KXPA 3DJCA 4IXCA 3H3OB 4FWOA 3AAPA 2A3ZA 5E26A 3JS6A 3TU5A 2FSNA 1ZXOA 3GDQA 3VGKA 4LC9B 2NZTA 5KQDA 4FOEA 3G25A 2ZF5O 1NGJA 1E4GT 1K8KA 3SK3A 4PKHA 2VYPA 3FZHA 3GE1A 5AQSA 3GL1A 2D1KA 3VF4A 1K8KB 2GWKA 4DB3A 5AQPA 3IMXA 3CERA 3HI0A 2CGKA 4IWVA 1H1VA 3CJCA 3LL3A 3MN5A 3VENA 3AY9A 4CZJA 2YHYA 2A40A 1MWKA 3CJAA 5AQJA 4XEIA 3L0QA 3D2EA 1GLBG 3QICA 2ITMA 3QBXA 4JN4A 4PL7A 4BRGA 4FOIA 2YJEA 3D2EB 3WXIA 3MCPA 5AQOA 5FPNA 3TPQA 4H5TA 1HJOA 3M1FA 1TUUA 1KAXA 2P9KA 2P9NA 3LDPA 4K41A 2FLOA 2ZGZA 3M3ZA 4MLEA 4BRDA 4B1WB 3DXKA 1JCFA 4FPAA 5FPDA 2ASOA 2CGLA 3HM8A 1Z05A 2P9KB 2P9NB 4Y0WA 3DXKB 1BOTO 2E2QA 4BRAA 3R6MA 1CZAN 4CBWA 4O8KA 1BU6O 2IVPA 4K43A 5BPMA 2FSJA 1BA1A 4M7YA 1NBWA 3U4LA 1NGBA 4M63C 5BN9A 3MN7A 1HLUA 4IJNA 3VF6A 2YHXA 4FWSA 1QZ6A 3VGLA 5BRFA 3HZ6A 2OANA 4A62A 2P9LA 5AQVA 2P9SA 3A5OC 3SLCA 4PL8A 1J6ZA 3KZBA 4FWRA 1GLFO 2P9LB 3UB5A 2P9SB 4JD2A 3L6QA 3JXUA 4JD2B 1BWFO 4ISGA 4QS8A 3VPZA 4XH1A 3CJBA 2YHWA 3U8XA 2ZGYA 3O8MA 3O08A 4XH5A 4H5VA 1TYQA 3H1VX 2Q2RA 2HOEA 4DHYA 2FF6A 2ASMA 4CZHA 4CZGA 4F9OA 3DXMA 1TYQB 1C0FA 4ISEA 5AQZA 2E2OA 1T6CA 4FWPA 3DXMB 3BEXA 1NGIA 1GLJO 1DGKN 4BGAA 1D4XA 2QW9A 5AQIA 4XH4A 2E20A 3A5NC 1BDGA 1SQKA 2IIRA 2HF3A 1X3NA 3IDHA 1ATRA 2ZWHA 1HPMA 3GOIA 3LDNA 1R59O 4CZLA 4B1VA 3DAWA 2IVNA 5BPLA 3HTVA 3ZEUA 1V4TA 3M6GA 4BQLA 4FWQA 1Y64A 1ATSA 4BG8A 4BC3A 1YXQA 1NWKA 5KPRA 3WXJA 3ZEUB 4EIAA 5JLHA 5LY3A 1SAZA 2QXLA 3EO3A 4BRIA 4FWNA 2PBDA 4GNIA 3WT0A 3WUHA 4BR2A 2BTFA 2DPNA 5TKYA 3VEWA 1DKGD 5AZIA 5LJWA 1C0GA 3F9MA 3VGMA 2A42A 1WOQA 4K25A 4BRQA 5AZIB 3H6EA 3AARA 5F1XA 2YI1A 5KPZA 2Q1NA 5BR9A 3MN9A 2ASPA 3ENHA 3WQUA 1GLCG 5LJVA 3ZX0A 1BG3A 4AM6A 1GLDG 3BF1A 2WUSA 1MDUB 4BRMA 5JMVA 3O6WA 3QBWA 2QM1A 2IVOA 3FE1A 3O1WA 1ESVA 4MO5A 5EY4A 3S41A 4B1UB 4BC4A 1QHAA 3D2FA 5AZJA 3EZWA 2GUPA 2W40A 3D2FB 5AR0A 3ZX3A 5AZJB 2GEMA 4H0OA 5KQ8A 1OKJA 2Q0UA 5AQWA 5FPMA 1BO5O 4IJAA 4WQ5A 2CH5A 3SJHA 2E88A 4BRNA 4BRPA 4H0TB 4H0VB 3SMPA 3J8AA 1NGEA 5I9EB 3I33A 5B8HA 3CETA 5ELZA 4JAXA 2W41A 1YVNA 2P9UA 2VCPA 3B8AX 3WQTA 1P8ZA 4RWTA 1U2VA 3CJ9A 2KHOA 4KBOA 1NLVA 4M7XA 3CI5A 2P9UB 4WQ4A 2AP1A 4CD3A 2NRHA 1U2VB 2E8AA 2PAVA 5AQHA 3L4IA 1QQNA 4BVPA 4BR9A 4A2AA 2NLXA 2J4RA 1NM1A 2GWJA 4L3QA 3VEXA 3C7NA 4PKGA 4BROA 5BN8A 4NB4A 4BQZA 2A41A 3P4IA 2Q97A 5JICA 3H46O 4BR4A 3ENOA 2H3GX 2QWLA 2QWPA 3O80A 1NMDA 2D0PA 3U9ZA 3VETA 4DQ8A 3LDQA 3MK6A 1Q18A 3FZFA 3QFPA 3CQYA 2V51B 4EHUA 1EQYA 3CJ1A 3MDQA 1S22A 3LDLA 3A5LC 5AQNA 4BRKA 2CH6A 2Q0RA 4YDUA 3ZETA 4CBUA 2V52B 1HKBA 5AQKA 2HMPA 4I6MA 3ZETB 4CD1A 4EFHA 1Z6RA 2VWBA 5E84A 4I6MB 3EN9A 2YCHA 5BRDA 4JNEA 1IG8A 4ISFA 3UE5A 4FWMA 4BVOA 4CJ7A 3FFKB 2GTDA 1LCUA 3R8EA 1GLAG 4QS7A 3W3DA 4BRFA 2Q36A 1DEJA 1TUYA 3UKUA 4E1JA 2A5XA 4C23A 3GBTA 2E1YA 4BGBA 2V7YA 3UKUB 3H3NO 4GY2B 4BC2A 3A5MC 1T44A 1RGIA 3O1BA 1S3XA 5KPTA 5AQRA 1X9JA 4A61A 5AQMA 5AQFA 4IZ9A 1NGGA 3VOVA 4H5RA 1GLEG 4CZEA 2EWSA 2UYTA 1ZBSA 1RDWX 1YAGA 3FZLA 3FZKA 5CE3A 2E2NA 3DWLA 4HWIA 3VF2A 1KAYA 3VERA 3RSEA 4Z94A 1GLLO 5ADXA 1NGAA 3SMSA 4FWKA 4QS9A 3RSEB 1NGCA 4H0XB 2QWQA 1YUWA 1QQMA 1NGFA 5FPEA 4RCHA 4BR0A 5ADXH 3VEYA 3ZX2A 4IO8A 3MN6A 5F0XA 2E2PA 3D7EO 4FWLA 3AAQA 2I7NA 4CBXA 3WEEA 3R9PA 1BA0A 3KHYA 1XQSC 3CQXA 5EX5A 4BR5A 1QQOA 3WEEB 3VEOA 2GELA 5AQXA 4B1XB 4FSVA 2AA4A 2QWMA 2V7ZA 3A8YA 3CJ7A 3BP8A 2QWNA 3VEZA 1WUAA 3FR0A 4HTLA 1JCGA 1LOTB 2Q31A 2FSKA 1NGDA 3HSCA 4K42A 3ULEA 3WXKA 2HF4A 1HX1A 4CZFA 2YJFA 1JCEA 4EAHD 3ULEB 1ATNA 2P9IA 3FZMA 3EKSA 4BREA 3CHWA 3O5BA 1XUPO 3EKUA 5BREA 2P9IB 3H1QA 4WQ5C 1HKCA 4BC5A 2F9WA 3QFUA 3BUZB 2D0OA 2QWOA 5EXWA 1HUXA 3CIPA 4FL9A 3C7NB 4PKIA 5AQUA 4H03B 3EL2A 5AQGA 4H0YB 3W0LA 3I8BA 4WQ4C 3LM9A 1HKGA 2F9TA 2QWRA 2FXUA 4JHDA 2I7PA 1U6ZA 3A0IX 1KAZA 4CZKA 3ATVA 3QB0A 3O4WA 5EOYA 4FO0A 3ATUA 3LM2A 4JHDB 4EHTA 3C0BA 4A2BA 3KVGA 3BF3A 3OHRA 1MA9B 3LDOA 2P9PA 4H0PA 4BG9A 3IFRA 1G99A 4MLHA 4BR7A 1MWMA 4DCHA 2P9PB 3VEVA 4H5NA 1X3MA 3H45C 3MMVA 4MO4A 4YDUC 4BRHA 5AQQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BCMA 3OYHA 1T6DA 3D45A 2D4WA 2WBNA 3G71N 4YOUA 5FRMA 1HR0K 4Y1CA 3TAQA 1XWLA 4CZIA 3OYEA 3SAFA 4WYBA 1QZ5A 4B1ZA 4ELUA 4B9QA 3DLEA 3CCVN 3UKRA 3U9DA 4DR3K 2E1ZA 3CM5A 2PYJA 4JI3K 3NF9A 2XO7A 2G8FA 1K6YA 3T19A 1WAFA 3QDKA 4X62K 4K8ZA 3DJCA 4IXCA 3CQ8A 3H3OB 3CCLN 1QE1A 1ZBUA 4KHWA 1RBRA 3JS6A 4FW1A 4BEBA 4M3TA 3AVFA 1E3MA 3VGKA 2ZF5O 1EKEA 4V19S 2IS3A 3AA3A 4PKHA 5AQSA 4CHPA 3OYDA 3PX6A 4DR1K 4DB3A 1KD1O 1O13A 1NJYA 1H1VA 3RRGA 1QHTA 3OJSA 2W6KA 4CZJA 3NAEA 3UIQA 5AQJA 2E4LA 1KTQA 3TARA 1HYZA 3D2EA 3QBXA 1YI2N 5D3GA 4DR4K 4B9MA 3MCPA 3TPQA 4H5TA 3M1FA 1BI4A 1TUUA 2P9KA 3LDPA 2FLOA 1S1XA 3SV3A 3LAKA 2IDOA 1R0AA 3P5JA 1X9MA 3R6MA 1QVFM 1BU6O 4K43A 3ISNC 3KK1A 1BA1A 1WSHA 1NBWA 3EE8A 3U4LA 3VF6A 1QZ6A 3VGLA 3HZ6A 2W42A 4KKOA 3CPEA 3SLCA 1J6ZA 2P9LB 3UB5A 1I94K 2PZSA 5C12A 3DOLA 5C2DA 2ITGA 3VA3A 4CK2A 4U7BA 3OYFA 1BWFO 5DM6L 3CJBA 1VQON 1C1BA 3KJVA 4NYFA 3T7ZA 4CHYA 3O08A 3IKMA 2HHVA 1TYQA 3H1VX 2Q2RA 2RKIA 2ASMA 4F9OA 2BH1A 4FCYA 3SJJA 4E72A 3P39A 3NVMA 1DTTA 5AQZA 2D5RA 3DM2A 1GLJO 2JWLA 4IOAL 1D4XA 4PWDA 5AQIA 1BDGA 4R79A 4RW8A 4OLAA 1WSFA 2HF3A 4RW7A 1S5JA 4FW2A 3HVRA 3SPYA 4CECA 3NH0A 4CZLA 4LFAK 4KI6A 1EWQA 2IVNA 5BPLA 4L8RB 1JLEA 1VSLA 4BQLA 3CMAN 3CCQN 3S3OA 3KKRA 3OBYA 1DT9A 4GV9A 3CFRA 4O0JA 4BRIA 1S9EA 1S1TA 4FWNA 4LF9K 2FC0A 3LZJA 1RT4A 1KQSM 4CHOA 3VQ5A 4FJJA 1Z26A 1WOQA 4K25A 2JWKA 1VQ9N 4CEDA 1LW2A 2Q1NA 5BR9A 3BGRA 4DLEA 3WQUA 3EE9A 3K59A 4DTNA 3SUNA 3QBWA 3AO5A 4JKCA 4A57A 4CIEA 3S41A 3O1WA 5EY4A 4LH4A 4BC4A 4E89A 3O9UA 4CHNA 3D2FA 2KW4A 3QNNA 1QVGM 5GAGP 3TAMA 3C65A 1NK5A 3K57A 5AZJB 4G9ZA 4GV6A 3M8QA 5AJ3K 2Q0UA 1WN7A 3CD6N 3O9TA 4CF9A 4IJAA 4WQ5A 2CH5A 3AVMA 1RBTA 1UOCA 2KFNA 4WF9L 1B9FA 4BRNA 3TWHA 4CJPA 3VQDA 4CEEA 3KK2A 5I9EB 3I33A 5B8HA 3PO4A 4JAXA 1YTAA 1YVNA 3B8AX 2FBYA 1U2VA 2KHOA 3AVLA 3MXIA 4KHNA 2YHBA 4E7KA 2O8DA 3CI5A 5IT9O 4DV2K 2X74A 1JLBA 4ID5A 3QEPA 4BVPA 4CJ3A 3J7AP 4F3TA 2J4RA 3ZSQA 3AVNA 4L3QA 3VQ9A 3ZSWA 4BQZA 1RTDA 2A41A 3P4IA 2Q97A 4BR4A 3CCEN 1VQ4N 2QWPA 3E1YA 3O80A 4C1NI 1KFDA 3V9UA 2AJQA 1NMDA 4LD0A 3LDQA 3MK6A 3E66A 4AHRA 1BISA 3A5LC 2HVIA 4EZ9A 4N56A 4CBUA 2V52B 1HKBA 3AVAA 2HMPA 1HNVA 4IOXA 3ZETB 1TL3A 4B8CA 2NRXA 3ULDA 1K8AO 1LWFA 3AVIA 1RDDA 3ITHA 3SZ2A 3MXJA 4M41A 1J53A 1N5YA 4BECA 1QSYA 1EO1A 2UUCK 3RR8A 2O8FA 3UE5A 4PUOA 4FWMA 3L2WA 4BVOA 4IBNA 4E7LA 1LCUA 3R8EA 4QS7A 3W3DA 4CGGA 1DEJA 2GBZA 1Z25A 1TUYA 4E1JA 2UXCK 4C23A 4LF4K 3GBTA 3HPGA 2O8CB 4BGBA 3UKUB 3H3NO 3A5MC 3AGRA 2O8EB 2NNWA 3OA9A 4FJHA 4CJWA 3O1BA 5KPTA 4JK7A 3K5NA 4A61A 4DTUA 2QKKA 4DTSA 5AQFA 1NGGA 3HO1A 3ZYYX 1RDWX 1YAGA 5CYQA 1HNIA 3OYBA 5MLCQ 4LFBK 3C95A 4HVJA 1C0UA 3VF2A 2VWKA 4GW6A 3RSEA 4RG8A 1T3VA 5ADXA 1NGAA 3SMSA 1S6PA 1NGCA 1TV6A 1KVAA 2YNGA 4H0XB 5I42A 3TTDA 3ZT3A 5FPEA 4DSIA 3ZX2A 2IOCA 4IO8A 3K0SA 4KH5A 3ZSRA 1OH6A 5GADP 1KCFA 4DUZK 4DKWA 3VQAA 1N33K 3OYIA 4DTOA 5LL6Z 4DU4A 1C0MA 4FJ8A 3WEEB 3VEOA 2YX6A 3WNGA 5C10A 3HXMA 2VGMA 4JRPA 1TKZA 2QWMA 4JK9A 3L2UA 3BP8A 2QWNA 3V81A 2HHHK 3FR0A 3V9XA 4LF6K 4HTLA 1MU2A 1G15A 3DRSA 1U47A 1VQMN 1ZBLA 4CJRA 3PX0A 3CCMN 3THVA 2HBLA 3O4QA 4CGJA 4CZFA 3V9SA 4FM1A 4PY5A 1JCEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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