4CI6A

Mechanisms of crippling actin-dependent phagocytosis by yopo
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNSPAMHVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAAASTSLEKSYELPDGQVIAIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETVYNSIMKCDVDIRKDLYANTVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTIKTKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPGIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/structural protein
molecule keywords ACTIN
publication title Yersinia Effector Yopo Uses Actin as Bait to Phosphorylate Proteins that Regulate Actin Polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia enterocolitica
total genus 114
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ci6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ci6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4ci6A03
4FWKA 2ZGZA 3O1BA 3S41A 2FSKA 5AQVA 4BR2A 4LC9B 4RCHA 3JXUA 4CI6A 4CZKA 3WT0A 4FWQA 2P9NB 4FPAA 3WQTA 2CH6A 3JS6A 5AZJB 3ENOA 3UKUA 3QFPA 5BN9A 3LDNA 5AQFA 4F9OA 3VEOA 1NGJA 1GLEG 2CGKA 3O08A 1KAXA 2ZF5O 1YXQA 5AQIA 3L6QA 2GWJA 4BC4A 5FPEA 3FFKB 1JCFA 3O6WA 5AQUA 2WUSA 5AQPA 3VOVA 3U9DA 3L4IA 1RFQA 3D2FB 4MLEA 1NGIA 2QWQA 1H1VA 4PKGA 2E1ZA 1Z05A 2F9WA 3HM8A 1QHAA 3DWLA 5BPNA 4K43A 3KHYA 4K42A 2P9LB 2VYPA 2IVPA 4CBXA 4PL8A 4EAHD 1DGKN 3EL2A 2GELA 2IIRA 3VENA 5CE3A 3SJHA 3VPZA 1NMDA 3ZETB 1ZC6A 1HKGA 1GLJO 2QWRA 3A5MC 3U9ZA 4DHYA 4BR4A 3CERA 4WYBA 3OHRA 3VESA 3BUZB 3FZFA 1XUPO 3H3OB 3VF2A 5AQMA 5AQLA 4BRMA 1V4TA 1OKJA 2PBDA 5AZIB 2E2QA 4FWPA 4H0PA 1TUYA 4PKIA 1MDUB 1BOTO 1XC3A 3ZETA 4BRIA 4CD1A 3WXJA 4EHUA 1YAGA 2H3GX 3WUHA 3HSCA 4CZHA 4H0VB 1HKBA 4DB3A 1WUAA 1NGCA 3L0QA 4H03B 4FWLA 2BTFA 3UB5A 3D7EO 4EFHA 3R6MA 4XEIA 2A3ZA 2QWNA 2D1KA 4FO0A 3UKRB 4H0YB 3H1QA 3MK6A 4B1UB 2I7NA 1ATNA 4BC3A 4XH4A 4H5RA 5AQQA 4JD2B 5BREA 2P9IA 2Q1NA 4YDUC 4BC5A 3VEYA 3CJCA 4BR7A 3SK3A 4CD3A 3LM2A 5TKYA 2YJFA 3TU5A 4CBUA 3BEXA 3DXKB 3FZHA 3FZMA 2FXUA 2J4RA 1GLCG 5F1XA 2QWOA 2NLXA 3TPQA 4H5VA 4FWRA 3UKRA 1E4FT 4I6MB 4DCHA 3FE1A 3RSEB 3BF1A 2HF4A 2P9UB 1IJJA 2Q2RA 5E26A 3B8AX 4A2AA 5I9EB 2P9SB 4GNIA 3DXMB 3WQUA 2GEMA 2CGJA 3A5LC 1HPMA 3O4WA 3MN6A 3CQYA 3MMVA 4H0OA 5BRFA 4JNEA 3EKUA 3A8YA 4QS8A 4H5WA 2IVNA 5EX5A 3ULEB 3VEZA 5LY3A 1U2VB 4A2BA 1QZ5A 1X3NA 2GWKA 5KPZA 4PKHA 2QM1A 3RSEA 1NWKA 3P4IA 3VEWA 4BRCA 1TYQA 5FPMA 1MWMA 3ZX2A 3GG4A 1S3XA 2GUPA 3O1WA 4H0XB 3MCPA 3GL1A 5E84A 2PAVA 4BRHA 2DPNA 5JLHA 3EN9A 2OANA 3FR0A 3U4LA 4XH5A 2Q31A 3GE1A 3VGMA 2V7ZA 3CQXA 1GLLO 5AQYA 3ZEUB 3ULEA 1U2VA 4RWTA 4IXCA 4HTLA 4HWIA 1WOQA 3VF6A 2P9NA 1T6CA 3KVGA 4Y0WA 1ZBSA 3CETA 5BPLA 5AZJA 4FOIA 1JCEA 4WQ5A 1BA0A 1NM1A 2ASMA 1SZ2A 4BQZA 3IFRA 4B9QA 5JMVA 2D4WA 5LJVA 4BRGA 2EWSA 2W41A 2BUPA 3AARA 3EO3A 3SLCA 3CIPA 3D2FA 2FF3B 3QFUA 4IJNA 3ZEUA 3ZX3A 4FL9A 5JLFA 3U8XA 5AQWA 4CZMA 3VGLA 4CJ7A 3QBWA 1QQOA 2P9LA 1EQYA 3D2EB 4H5TA 3C7NB 1XQSC 3IUCA 3BF3A 2D0PA 1LCUA 1ATSA 5BRDA 4BG9A 4BR5A 4BRLA 1E4GT 4EIAA 4M7XA 5AQXA 5FPDA 5B8HA 2E88A 3LL3A 1NBWA 1GLDG 2FSNA 1NGAA 5KQ8A 2QW9A 2A5XA 3O5BA 1D4XA 1G99A 2A42A 1DEJA 4A61A 3GDQA 4MLHA 3ATVA 5AQHA 4FSVA 3C7NA 5AZIA 4QS9A 3UE5A 3LDLA 1HX1A 4BR9A 3MN9A 3AY9A 4FWMA 1BO5O 4BRKA 4WQ4A 2FSJA 4A62A 1HJOA 1MWKA 2CH5A 4CZIA 4BQLA 5FPNA 4BROA 3IDHA 4NO7A 1U6ZA 3FGUA 5JICA 1BU6O 1ESVA 2F9TA 1KXPA 5AQGA 4J8FA 5ADXH 2Q0UA 3HI0A 5AQNA 2NZTA 3WXKA 4FWOA 2A41A 4B1XB 1YUWA 5EVZA 4GY2B 4QS7A 5BN8A 4MO4A 2P9PB 3A0IX 3CI5A 4AM6A 2VCPA 3H45C 1V4SA 3A5OC 3ATUA 3J8AA 1JCGA 1SAZA 3O80A 5AQOA 4BREA 4BGAA 1BA1A 4JD2A 1R59O 3VF4A 1QQMA 1P8ZA 1NGFA 1J6ZA 2W40A 1TUUA 1QZ6A 1QQNA 2QXLA 4M7YA 3R9PA 2ASOA 3H46O 5BR9A 1LOTB 3DXKA 2E1YA 3FZKA 3F9MA 4BRPA 2UYTA 1Q18A 4CZGA 1RDWX 3H6EA 1HKCA 4IWVA 3CHWA 4AM7A 4IJAA 4I6MA 1S22A 3UKUB 5AQRA 3QBXA 5ELZA 2P9UA 4BVOA 1GLBG 4BRNA 2P9SA 2E2OA 3DXMA 3HTVA 4O5FA 2YJEA 2HOEA 1ATRA 3I8BA 4BGBA 5AFUH 1YVNA 1KAZA 2YHYA 4FPBA 2ZWHA 3GOIA 3DAWA 3EKSA 3LDPA 2E8AA 4BR0A 5BPMA 2KHOA 1CZAN 4L3QA 4CZFA 3W3DA 1HUXA 4FWNA 2ITMA 4IO8A 3HBTA 2HF3A 1GLAG 5ADXA 4E1JA 1DKGD 4BG8A 5F0XA 4BRAA 2AP1A 3M3ZA 1Z6RA 2QWLA 5KPTA 3MDQA 4BRDA 4DQ8A 1BWFO 1NGDA 3C0BA 4M63C 4Z94A 3VEVA 3VETA 4BVPA 3DJCA 4WQ5C 5AQZA 1BG3A 2P9KB 1GLFO 2ZGYA 2FF6A 3HZ6A 3WEEB 3LDQA 1X3MA 4JHDB 2E2NA 4BC2A 3MN5A 4H0TB 3WXIA 1KAYA 4B1YB 4RTFD 3VERA 1NGBA 2YCHA 2YI1A 4B1VA 3G25A 2V7YA 1C0FA 4JAXA 3KZBA 4K25A 2Q36A 4JN4A 2QWMA 2V51B 5AQTA 4CBWA 4IZ9A 2QWPA 3M6GA 3CJBA 4ISFA 3FLCO 2A40A 2I7PA 2P9KA 5KQDA 1C0GA 3CJ9A 3QICA 1T6DA 1BDGA 5AFUA 3ID8A 2AA4A 3WEEA 2YHXA 4JHDA 1T44A 1SQKA 1Y64A 2CGLA 5EXWA 4CZLA 3D2EA 2GTDA 3AAPA 3GBTA 1MA9B 4H5NA 5BRHA 2E2PA 2Q0RA 3BP8A 1K8KB 4B1ZA 3CJ1A 3R8EA 2P9IB 3SMSA 1HLUA 3VGKA 1ZXOA 2NRHA 3LDOA 3FZLA 4C23A 3QB0A 4WQ4C 4BRFA 4CZJA 5AR0A 3A5NC 5EOYA 3WXLA 3MN7A 3LM9A 3M1FA 3ENHA 4BRQA 2A6AA 4XH1A 2V52B 1NGGA 3CJAA 2ASPA 4YDUA 4PL7A 4CZEA 2VWBA 2D0OA 5AQKA 2FLOA 1K8KA 2Q97A 4B1WB 4EHTA 5EY4A 3O8MA 3IMXA 5AQSA 5KPRA 4FWSA 3I33A 5AQJA 3VEXA 1NGHA 1X9JA 4O8KA 3QDKA 2IVOA 3H1VX 2YHWA 1NLVA 3EZWA 4FOEA 5LJWA 3CJ7A 3SMPA 2P9PA 4MO5A 1TYQB 2E20A 1RGIA 4NB4A 5F2RA 4KBOA 3QMLA 4ISGA 4ISEA 3AAQA 1BUPA 3H3NO 2HMPA 1NGEA 3W0LA 3ZX0A 4K41A 1IG8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KVAA 4FWKA 3V9XA 2KFZA 4BR2A 3QINA 2QKKA 4PWDA 4F4KA 4CJ5A 3JS6A 3EY1A 2F8TA 1YI2N 5AQFA 1GLEG 4IBNA 1YXQA 3O9TA 2GWJA 4UQGA 4BE0A 3TANA 5AQPA 1VQ9N 3LALA 3L4IA 4FJ8A 3D2FB 3ALYA 4CGDA 1S6PA 2G8HA 2E1ZA 1Z05A 1Q8IA 4M41A 4YOTA 5BPNA 4W5QA 4DUYK 3KHYA 2P9LB 2VYPA 1XWLA 4PL8A 4FK0A 2RKIA 2NRVA 5HBMA 1R0AA 3HYFA 4DV7K 1TKXA 5KI6A 4FJLA 2Q3SA 4IG0A 2QWRA 4DHYA 3CERA 2VWJA 1SKSA 3CFRA 4WYBA 4Z4HA 3K9JA 4OX9K 3BUZB 3RMDA 1OH6A 4F2SA 5J2PA 1V4TA 4J2DA 4W5TA 2VQEK 3ZLJA 4OKEA 3CC4N 3QLHA 4C8KA 3CM5A 4FWPA 4RW7A 3SQ0A 1VSDA 3HJFA 3NDKA 1Q9XA 4BRIA 2NRXA 4KO0A 4CD1A 4DV1K 2HHHK 2H3GX 4CZHA 4CGFA 4H0VB 1Q7YO 4CJSA 1SL0A 3HM9A 4FWLA 3KD5E 3V1RA 1K9MO 2YNGA 3PX4A 1BI4A 1ZBLA 4H0YB 3H1QA 2I7NA 4CEQA 4BE7B 2WTUA 4DR3K 3CC7N 2HNYA 4O0JA 4BC5A 3OYDA 4BR7A 2HHWA 3FZHA 3CCLN 2HB5A 2J4RA 2HNDA 3PX6A 2NLXA 4H5VA 3OYGA 4YOYA 4DCHA 4CF2A 4I6MB 4CGIA 4U7BA 3FE1A 3WNGA 1J5OA 5FLXO 1VRTA 2CGJA 3MN6A 1Q82O 4H0OA 2DFEA 4G1QA 4DU1A 3KLIA 4CE9A 5LMNK 1N33K 4LD0A 4JI3K 4OGCA 4H5WA 5FRNA 5FDLA 4JKBA 4E0DA 4CF8A 4DSJA 4FJ5A 3ZYYX 4PKHA 3VQ7A 3SNNA 1MWMA 3ZX2A 4JI2K 1ZBUA 3AO2A 4H0XB 4IDHA 2O8BA 1KTQA 2DPNA 3EN9A 1K73O 2FC0A 1TL1A 2XY5A 3ZEUB 4HTLA 4E7KA 2IC3A 5BPLA 3CETA 3E1YA 3F2KA 5HRNA 1BA0A 3RTVA 4CHQA 2OPRA 4FW1A 5D3GA 3AVNA 1NK5A 1O13A 3KD1E 3C6HA 2D0AA 5LJVA 4B3SK 2EWSA 4DMNA 4IFVA 4G9ZA 4GVMA 2BUPA 1HMVA 5FROA 1BISA 4OPKA 1S1WA 2F96A 4X64K 4CJUA 3K5MA 3CQ8A 4CEAA 3ZEUA 4FL9A 3ISNC 5AQWA 5GINA 3T3FA 2X78A 3AO3A 3DLHA 2FBVA 3OJUA 4W5NA 1KSPA 4KH6A 2KQ2A 5J2QA 4DS5A 4K0KK 1RDUA 3BF3A 3PUFA 4JI1K 3TWHA 4BR5A 1U04A 1JLCA 4M7XA 1ZBFA 1D9FA 3T69A 3OY9A 1NBWA 3E66A 4B9SA 3KKRA 2FSNA 1NGAA 2QW9A 3LWMA 3BZKA 5CYMA 3L3UA 1HJRA 1N32K 1DEJA 3PIPL 3LDSA 3NCIA 3UE5A 4CCHA 1T7PA 4OGEA 3AY9A 3KLFA 3ZSRA 4IOCL 1JKHA 2FSJA 1XC9A 4A62A 1TAUA 1HJOA 4DG1A 4I9QA 3ENBA 3ZSOA 4BROA 4NO7A 3FGUA 4DFPA 1CZ9A 4GKKK 2NZTA 3WXKA 1WSJA 5EVZA 4DTMA 4MO4A 2P9PB 3A0IX 3THXB 2VWKA 1U49A 2R7YA 2W6LA 4QOZB 4IG3A 3PO4A 1V4SA 3EE9A 1JCGA 3O80A 2BDPA 3WXMB 3T1AA 1QQMA 1NJYA 1NGFA 1W9HA 3J7YP 1TUUA 4DQPA 3D45A 4M7YA 2ASOA 2E1YA 1YIJN 4HUEA 2UYTA 1Q18A 5SWMA 4B9LA 4GV6A 4ILHA 1I3AA 4E19A 2RE2A 1S22A 4DLEA 3THXA 5AQRA 3QERA 1VQMN 2P9SA 3PSIA 3DM2A 2W6KA 2YJEA 3V9SA 4JS4A 2HOEA 3OJSA 4BGBA 4B3MK 2OPSA 1C1CA 1O1WA 4JKGB 5JVGL 1JLFA 3AA2A 4CHOA 3DAWA 2IDOA 1FKPA 3LDPA 4CEEA 2YNIA 4CZFA 4FWNA 2WC9A 1DKGD 2YKNA 3AGRA 3M3ZA 2XY6A 4DV5K 3HVTA 4CJ3A 5KPTA 1HYZA 1LWCA 3MX5A 3MDQA 4DQ8A 4FLTA 3QETA 1NGDA 4KAZA 4BDYA 4CW7B 3CC2N 5HL7L 3DJCA 1RDCA 4N56A 4E7IA 4CIGA 1KC8O 1Q9YA 4CESA 3I8DA 2Z1GA 3NH0A 4NCBA 4FJGA 2YHAA 2O8DA 4ELTA 3F73A 4J2EA 4WFBL 4DSLA 4DWIA 4J2AA 4CJVA 3NVMA 4BC2A 1HNZK 5GAHP 1NGBA 2YCHA 2YI1A 4B1VA 3G25A 2V7YA 4BECA 2HVIA 4X62K 4JN4A 3TABA 3L2VA 2QWMA 2HBJA 2QWPA 3CPWM 3QESA 2ZE2A 4DR1K 4CVNE 4N76A 1VSKA 3CJ9A 1T6DA 2UUBK 2AA4A 1OVQA 4JRPA 1EWRA 1Y64A 5EXWA 2CGLA 3D2EA 3K58A 4OLBA 4WFNL 5C42A 3AAPA 2E2PA 2OTLN 4AF1A 2KZMA 4B1ZA 4KHYA 3SBGA 2O8EB 3SAGA 1NJIO 3MXJA 3SMSA 1IKWA 2A1RA 3CCEN 4CJ4A 2NRHA 4CZJA 4Z4IA 4BRFA 3HP9A 1NKBA 3A5NC 1IH7A 3WXLA 1NJZA 3ZSZA 4EZ6A 3LM9A 4CF0A 4IO9L 3M8PA 1T8EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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