3CIPA

Complex of dictyostelium discoideum actin with gelsolin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
371
structure length
362
Chain Sequence
VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Major actin
publication title Modulation of actin structure and function by phosphorylation of Tyr-53 and profilin binding.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 362
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cipA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cipA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cipA03
3F9MA 3SMPA 4IJNA 1MWMA 3QDKA 5EOYA 5AZJB 5AQRA 1HKGA 1BU6O 2FSKA 1CZAN 2A40A 3ENHA 2QWRA 5E84A 2FF3B 3MN5A 1NGCA 5KQDA 1T6CA 2ZGZA 4H5TA 1YVNA 5ELZA 3LDLA 5AFUA 2BTFA 3D7EO 4A2BA 5ADXA 3HZ6A 4BGBA 2A42A 1NLVA 2ASPA 4BVPA 4JHDB 1E4FT 5AQXA 3CETA 3HM8A 4IJAA 3AAQA 3CJ7A 1BDGA 1NBWA 3W0LA 4BRKA 2CH6A 1ZXOA 3ZETA 3IFRA 3D2EB 3FZFA 3MN7A 1V4SA 4BRPA 3EN9A 5KPTA 3QFPA 1GLDG 3O8MA 4BG9A 2NZTA 3ULEA 4BRGA 4H5NA 5BRDA 2YJFA 2P9SA 3P4IA 2EWSA 1SQKA 1NGAA 2KHOA 3QB0A 3VEYA 5F0XA 3R8EA 4M7YA 2A5XA 3DXKA 4NB4A 3RSEA 4WYBA 3UKUB 4BC4A 1NGEA 3VF4A 1Z6RA 4GY2B 1QQOA 3O5BA 2IIRA 3ZETB 3U8XA 5BPLA 3H3NO 4BRLA 1G99A 3ATUA 3SK3A 5EX5A 3LM9A 3QICA 3IMXA 5KQ8A 3VENA 4FL9A 2BUPA 3EZWA 4H5WA 3WXKA 4EAHD 4XEIA 4QS8A 3ULEB 3WT0A 3VGLA 4EIAA 3H3OB 4O8KA 4FWMA 2UYTA 2P9SB 1OKJA 4ISEA 5LJVA 3CHWA 1C0GA 3AY9A 3DXKB 5F2RA 3U9DA 4JNEA 1Q18A 4BQZA 1HUXA 2D4WA 4A2AA 2CGKA 2YI1A 3ENOA 4HWIA 4NO7A 3FLCO 3ZEUA 2QWPA 3CJ9A 4KBOA 1NGFA 3R9PA 4B1XB 2W40A 5EY4A 4BR5A 3CJAA 2A41A 5LJWA 4CD1A 4BC5A 4CZFA 5AQWA 3VESA 4BGAA 1T6DA 2P9UA 1GLFO 4WQ5C 2P9LB 4MLEA 3FGUA 3KZBA 1GLCG 1NGGA 1EQYA 1HPMA 1K8KB 5BREA 2Q2RA 2D1KA 3VGKA 3EL2A 5I9EB 1NM1A 2IVNA 3WEEB 3A5LC 5TKYA 1JCEA 1QHAA 3GDQA 2PBDA 4BQLA 4CBXA 1GLBG 1ESVA 3UE5A 3M3ZA 4Z94A 3W3DA 3H1QA 2P9PA 3C7NA 5BPNA 2H3GX 3EKUA 1ZC6A 3OHRA 1DGKN 2P9UB 4F9OA 5BN8A 3DXMA 4B1UB 5AQNA 2GWJA 1GLJO 3CI5A 4JD2A 5AQIA 5AQQA 3C0BA 4K42A 1ATSA 2OANA 1HKCA 2E88A 1BWFO 3BEXA 4B9QA 4ISGA 1P8ZA 2NRHA 3VOVA 4DHYA 5BRHA 4JAXA 4CI6A 2F9TA 1QZ6A 4FSVA 4BRAA 4PKGA 4H03B 3UKRB 4JN4A 5LY3A 4BR0A 5FPNA 4CJ7A 4H5VA 2P9PB 4YDUA 2FF6A 3VF2A 3MK6A 5AR0A 3DXMB 1BO5O 2QWOA 3BF1A 4H0XB 3I33A 4JD2B 4CZMA 2J4RA 2ASMA 2W41A 5FPDA 4H0PA 5AFUH 2F9WA 1GLLO 3M6GA 2CH5A 5AQUA 3VEWA 1KXPA 5ADXH 2P9IA 1BG3A 1LCUA 1JCGA 2CGLA 1TYQA 5AQVA 1JCFA 4PL8A 4BRNA 3DJCA 1DEJA 5BR9A 1QZ5A 2AP1A 3SMSA 3QMLA 4XH1A 5BN9A 2QWLA 1KAYA 2V52B 2A6AA 3HBTA 5AQGA 3L0QA 5EVZA 1XUPO 2Q97A 4BC3A 2GEMA 2WUSA 3L6QA 4EHUA 2E1ZA 4L3QA 4LC9B 2ASOA 1NGBA 1V4TA 4FPBA 2VYPA 1NGDA 3FFKB 3VPZA 2FSJA 3LM2A 3CIPA 2QW9A 4FWNA 1YUWA 3M1FA 1NGHA 4XH4A 2HF4A 1WUAA 5BRFA 3WXJA 3CJCA 3O6WA 3VF6A 3R6MA 5JICA 5AQPA 4CZEA 4CBUA 3SJHA 1TYQB 1NGJA 3TU5A 2E2NA 3A0IX 2GTDA 3H1VX 4BR9A 1H1VA 4WQ5A 1MWKA 1YAGA 3S41A 3RSEB 1XC3A 1BA1A 3ZX3A 1GLEG 1C0FA 1U2VA 2FLOA 2V51B 3WXLA 5F1XA 4DB3A 2Q36A 2E2QA 3KVGA 3VEZA 2V7YA 2IVOA 4BRDA 2IVPA 3EO3A 4A62A 2QWMA 3VETA 3A5MC 3UB5A 3A8YA 1NMDA 3CJBA 5AQMA 4MO5A 1HKBA 1X3MA 1E4GT 1T44A 4J8FA 2QWQA 1RGIA 4BVOA 4I6MA 5AQLA 4FWQA 4XH5A 1LOTB 3IUCA 1Y64A 3AAPA 4DCHA 4WQ4C 3U4LA 1BUPA 3AARA 1Z05A 1U2VB 3CERA 3MMVA 3ZEUB 1QQNA 4K43A 4CZLA 5CE3A 2E8AA 3BP8A 4B1VA 3GE1A 4IZ9A 4H0YB 3B8AX 5EXWA 3HI0A 1J6ZA 4GNIA 3GOIA 3HSCA 3CQXA 3MN6A 2ZGYA 5BPMA 2ZWHA 3H46O 4FO0A 4K25A 4DQ8A 3VEOA 4I6MB 5AZIA 3MDQA 5B8HA 5JMVA 3EKSA 4MO4A 3FZHA 1HLUA 4EHTA 4RCHA 2FXUA 1SAZA 1TUUA 3O1BA 2VCPA 4H5RA 4JHDA 4PKIA 4CBWA 4BRFA 4Y0WA 2GELA 4BR2A 1RFQA 4FWLA 3O08A 1NWKA 1X9JA 4BRCA 2GUPA 1MDUB 3D2EA 2E20A 2YHXA 4B1ZA 1NGIA 2Q31A 4B1WB 3C7NB 1YXQA 2NLXA 3ATVA 1S3XA 3D2FA 2P9KA 2QM1A 3FR0A 4CZHA 2CGJA 2HF3A 4A61A 3BF3A 5AQTA 1ZBSA 5KPRA 4BR4A 3DWLA 1DKGD 3FZLA 4MLHA 5AZIB 1MA9B 2YHYA 5AQHA 5FPMA 3GG4A 3UKUA 1S22A 4BRMA 3TPQA 3QBXA 2HMPA 3MCPA 4BR7A 1KAXA 3QBWA 5AQFA 3IDHA 2E2OA 2YCHA 2E2PA 4H0VB 4FPAA 5AQYA 5AQJA 3VERA 3ZX2A 4PL7A 3LL3A 4IXCA 3LDPA 4CZGA 4AM7A 2I7NA 4B1YB 4BROA 3WQUA 5JLHA 3VEVA 2Q0UA 3D2FB 2P9KB 3ID8A 4IO8A 3I8BA 3CJ1A 5JLFA 2ITMA 4BG8A 5KPZA 4PKHA 1IJJA 4BRHA 4RWTA 4CZIA 2YHWA 3VEXA 4FWOA 3O1WA 3FE1A 2PAVA 4M63C 4YDUC 3WUHA 5E26A 5AQOA 3O4WA 4FWPA 2P9IB 1ATRA 3LDOA 4FOEA 4QS9A 3GBTA 4H0TB 1GLAG 5AQKA 4FWRA 3WXIA 2P9NA 4E1JA 1SZ2A 4EFHA 2I7PA 4FOIA 3G25A 4M7XA 1D4XA 3BUZB 1R59O 1ATNA 4BC2A 4CZJA 3DAWA 4C23A 4CZKA 3U9ZA 4WQ4A 4CD3A 2D0OA 2P9LA 1KAZA 2V7ZA 2HOEA 5FPEA 3L4IA 2QXLA 4BRQA 4BRIA 1K8KA 4K41A 5AQSA 4AM6A 1BOTO 4ISFA 3CQYA 3WEEA 3FZKA 3H6EA 3FZMA 1IG8A 1X3NA 2AA4A 3J8AA 1QQMA 3A5NC 1RDWX 2P9NB 3JXUA 2E1YA 3GL1A 1XQSC 5AQZA 4RTFD 4FWSA 2GWKA 2Q0RA 3LDNA 5AZJA 3A5OC 1HJOA 3MN9A 3H45C 3HTVA 2ZF5O 3ZX0A 2QWNA 4FWKA 3JS6A 2A3ZA 1U6ZA 4O5FA 3O80A 2FSNA 1BA0A 3VGMA 4HTLA 3LDQA 2YJEA 2D0PA 2Q1NA 3KHYA 1HX1A 2VWBA 1WOQA 4QS7A 2DPNA 1TUYA 3WQTA 3QFUA 3SLCA 3UKRA 4BREA 4IWVA 4H0OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Q7YO 1VSLA 1U49A 5EOYA 5AZJB 4BE2A 4FLZA 1WN7A 5AQRA 2VGMA 4GVEA 2FSKA 4JKDA 4DS4A 1VQMN 3MEDA 4DFKA 3ZSWA 1VQLN 1SS6A 4FJHA 3ID6A 5GAHP 4H5TA 4KKOA 5ELZA 2RE2A 1W97L 3TTCA 4BGBA 5LMNK 3THXA 2YX6A 1WSJA 4JHDB 3RMBA 5AQXA 3CETA 3HM8A 5LL6Z 1BDGA 1ZXOA 3ZETA 3J7YP 3IFRA 4AHRA 3KLFA 1RDDA 2XO7A 1NJXA 5J2PA 2HHTA 4ELTA 1GLDG 4MDAA 5M1KA 4BRGA 4N56A 2XY5A 2ZD1A 4IOAL 1ZBHA 2XY8A 3CMEN 4M7YA 3DXKA 2RPIA 3AVHA 4DLEA 2EHGA 3QEVA 4ILJA 4M3UA 2IIRA 1VAZA 3U8XA 2ATQA 3VTIA 1G99A 3SK3A 4FJXA 1N33K 3LM9A 1TL3A 1WSIA 3CCQN 1D8YA 4IEEA 4CF0A 1UA1A 4CGDA 1ASWA 4BWJA 4XEIA 4EIAA 3WT0A 3D0PA 2RF2A 4B8CA 4YFUA 2UYTA 4CJ5A 3TAGA 3LP2A 3RWUA 2Z1IA 3J80O 5F2RA 2E4LA 3V9XA 4BQZA 4V19S 1F21A 2Z1HA 4FJGA 4A2AA 3OJUA 5TKWA 1JXEA 2QWPA 3C6HA 2Z1GA 4ZHRA 4O55A 4DWIA 3MWTA 1K6YA 4M3WA 5EY4A 1ILYA 3CJAA 4BC5A 4BGAA 1GLFO 1VQON 4JKBA 1YJWN 2HVIA 2P9LB 4K0KK 3NH1A 3F73A 3KZBA 4DU1A 1GLCG 1HPMA 3ZSXA 3EEQA 4CIEA 2Q2RA 2D1KA 1JLEA 2B5JA 1BIZA 2IVNA 3VQCA 3NBPA 4G1QA 5TKYA 1RBSA 3LAKA 2PBDA 4Z94A 3M3ZA 5IT9O 4AHUA 2P9PA 2P9UB 4B3OA 5BN8A 2IOCA 2GWJA 4KV8A 4JD2A 2D5RA 1HNWK 3C0BA 3VMFB 1HKCA 4B9QA 4ISGA 1P8ZA 2NRHA 3SAHA 4GV6A 3VOVA 3F2KA 4X65K 4M42A 1KTQA 3JSMA 3TWHA 1QQCA 4LSNA 3G0ZA 4B3RK 4FVUA 4HUGA 4BR0A 5M1PA 5C24A 4CJ7A 4H5VA 4MFBA 5HLFA 3CMAN 3VF2A 5AR0A 4JKFA 3VQAA 2QWOA 3ZT3A 4CZMA 3EYZA 1NJZA 4CJSA 5AFUH 4EZ9A 4CHPA 4CEZA 4FJ5A 3LWLA 4O0IA 4DQIA 2CGLA 1B9FA 4CJQA 3HK2A 1JCFA 4PL8A 3LDSA 3DJCA 4F3TA 5BR9A 1LW0A 2DY4A 4XH1A 5AQGA 5EVZA 3L0QA 3AVMA 1UA0A 2RHKA 4JI3K 3CCSN 4LC9B 2ASOA 5GAGP 3QEPA 2IGIA 3CM5A 3VPZA 4WFAL 4O44A 3SQ0A 1FXXA 2FSJA 2P5OA 3CIPA 1YUWA 1NGHA 3QEWA 2P5GA 3SJHA 1NGJA 3TU5A 2DTUA 1C6VA 4BR9A 4IFYA 4WQ5A 1YAGA 4JEPA 3RSEB 1XC3A 4CJPA 1QHTA 3N4PA 4LFCK 3I55N 3KK7A 1U4BA 1IKVA 4DQPA 2FLOA 4CJKA 3V9UA 5F1XA 1N36K 1VQ6N 4DB3A 2Q36A 2E2QA 2X6SA 4PQUA 3DLBA 2IVOA 4BY9C 1QE1A 1CXQA 3ZLJA 4HCBA 3A5MC 4A5BA 3K57A 3A8YA 1NMDA 3CJBA 3OVNA 1X3MA 2QWQA 4AHCA 4Y1DA 4E3SA 3IS9A 4NLCA 4GV9A 3AGRA 4WQ4C 3Q7CA 4OO1J 1BUPA 3EE8A 3AARA 1Z05A 3V1OA 4CFCA 3VN5A 2XY6A 1QQNA 1RBUA 1QVGM 2UXCK 3UIQA 4FJ9A 1K73O 4OKKA 2HHVA 4DR5K 1J6ZA 1NMNA 4GNIA 1HQEA 3I8DA 4K25A 4DQ8A 4IBNA 5M1FA 3E1YA 5JMVA 1HRHA 4LF9K 3FZHA 1S9GA 3OYFA 2QK9A 3O1BA 2VCPA 3SBGA 4JHDA 3RR7A 4XJXA 4BR2A 1RFQA 4FWLA 2PYJA 4WE1A 2VG7A 1A5VA 2GUPA 5CZ2A 4DSEA 1BGXT 1RT5A 3OTOK 4B9MA 4B1ZA 2OPRA 1LAWA 3C7NB 3THYB 3D2FA 2QM1A 4JI8K 4CZHA 3EZ5A 2CGJA 2HF3A 1L5UA 3VQQA 4CGFA 4BR4A 4Z4CA 3DWLA 2O8CB 1DKGD 1XWLA 1C1AA 1MA9B 4LF7K 4Y1CA 4ILGB 5AQHA 4CEBA 3GG4A 5SWMA 3TPQA 3QBXA 2JGUA 1TGOA 2HMPA 3MCPA 3KK2A 3L2RA 3IDHA 1RT2A 3HRGA 4H0VB 5AQJA 4IXCA 5T7BA 4FZYA 4C1NK 1NKEA 4LFBK 3VEVA 4H8KA 2P9KB 5JVHL 3RVCA 1EX4A 4CEAA 4RW7A 4DUZK 4RWTA 4HCCA 1UOCA 4M63C 5AQOA 1L3VA 3NMUA 3ASMA 2G8KA 4FLWA 4NYFA 4JKEA 3PV8A 3O4NA 4BDZA 1GOCA 4I9QA 5AQKA 4AF1A 3NDKA 4W5NA 3M8PA 1N8RO 1SZ2A 3WNFA 1O13A 4EFHA 4M7XA 4FOIA 3G25A 4DR3K 1QSLA 4CE9A 3BUZB 4HUFA 4E89A 2OCEA 4OVLA 4AHVA 3U9ZA 5FLXO 3SI6A 4CD3A 1Q82O 2P9LA 2YKNA 1YT3A 3L4IA 1D9DA 4LD0A 5MLCQ 3TSQA 2C1IA 3K9KA 1CLQA 3NF6A 1BOTO 1WSEA 4KTZA 4CJ3A 1CZBA 3H6EA 3K58A 1NK0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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