2A3ZA

Ternary complex of the wh2 domain of wasp with actin-dnase i
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
total genus 120
structure length 360
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a3zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a3zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a3zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a3zA04
5KPRA 2FSJA 4EIAA 5BPNA 3DAWA 1NGBA 4M63C 4H5TA 3TU5A 3UKUB 4BGBA 3H45C 5EX5A 4BROA 4CBXA 4FPAA 3A5OC 3FZHA 1GLLO 3H3NO 4IJNA 2Q2RA 4CZIA 1HLUA 5BN9A 2CH6A 1JCFA 1QQMA 4NO7A 4CZEA 5ADXA 3UE5A 4CBUA 1TUYA 5B8HA 2PBDA 1IG8A 1GLFO 2A6AA 4PKHA 4CZMA 1J6ZA 4H5VA 2J4RA 4FWQA 3DJCA 3CQXA 4BVOA 1BWFO 3M3ZA 1YVNA 2E8AA 3U9ZA 4BG9A 1ESVA 5AFUA 5AQHA 2V52B 3RSEA 3SMPA 3VGKA 1C0GA 3P4IA 1Z6RA 4B1ZA 3VERA 3R9PA 1HKCA 2W41A 4BC3A 4K42A 4BRNA 4BREA 3O08A 2YHXA 4DCHA 2HMPA 3MMVA 2YHWA 3GG4A 5AQIA 1GLJO 1ATRA 3H1VX 1JCGA 1X9JA 5KPTA 2YJEA 4AM6A 2NLXA 3GE1A 4K43A 4K41A 3U9DA 1QZ6A 3CJ9A 3SLCA 1DKGD 3MCPA 5AQQA 1JCEA 4O8KA 3WUHA 4CZGA 2E20A 4FPBA 2P9LB 2DPNA 4BRKA 1WUAA 4BRLA 1QQOA 5E84A 1LOTB 2H3GX 3QB0A 3ULEA 1SQKA 1SAZA 2VYPA 3LDPA 2P9UA 4YDUC 4A61A 3SJHA 4PL7A 2YJFA 1TYQA 3D2FA 4YDUA 3VEOA 5AZJA 3FZFA 2D1KA 2KHOA 4FWRA 2FXUA 4DHYA 3VEVA 4JHDA 5AFUH 4H0PA 3UKRA 3AAPA 3DWLA 1KAXA 4I6MA 1P8ZA 1K8KA 2GWKA 2AA4A 2QXLA 1KAYA 3ZETB 3D2EA 4CBWA 4FWOA 1R59O 1E4FT 3ATVA 1NWKA 3A8YA 3R8EA 3VF2A 4WQ4C 5FPNA 1BG3A 1NM1A 3QMLA 5BRHA 4FWLA 5LY3A 2ZGYA 5FPMA 3UKUA 4WQ4A 3MN6A 2FSNA 3CJ7A 3VPZA 3AY9A 1NGHA 1QZ5A 2BUPA 4QS9A 5AQOA 5LJWA 4KBOA 4QS7A 4A2AA 3A5NC 5I9EB 4RTFD 3MDQA 3QICA 3KHYA 3GL1A 1MA9B 3L6QA 4FL9A 1BA1A 2V7YA 5AQYA 4BRGA 4L3QA 3ENHA 3SMSA 5FPDA 2Q1NA 5E26A 2A42A 1ZC6A 1GLCG 3VGLA 3ID8A 2F9WA 4RWTA 1WOQA 1X3NA 2YI1A 5BRFA 1T6CA 2E2PA 4MLHA 3CJBA 4BC5A 1Q18A 1HUXA 4EHTA 5FPEA 2GWJA 2ITMA 3A5LC 3IDHA 3U4LA 2P9IA 1QHAA 4BG8A 4B9QA 4K25A 3H46O 5F2RA 1BOTO 4CZKA 2QWQA 2I7NA 4DB3A 4E1JA 3MK6A 1HKGA 4ISEA 4BR5A 3G25A 4H0VB 2HOEA 3AARA 3ENOA 4BQLA 3EKUA 1T44A 4Y0WA 4HWIA 3O8MA 4FWSA 4HTLA 1ATSA 4BRAA 5BRDA 3MN7A 2P9PA 3LDNA 1V4SA 3VGMA 2CGJA 2D0PA 2P9LA 1X3MA 2QM1A 4ISGA 3M6GA 5EVZA 4NB4A 5AQVA 4BRFA 1DGKN 3C7NA 3KVGA 1RGIA 4Z94A 4BRQA 4BR4A 4M7YA 1GLBG 5AQRA 3EO3A 2EWSA 3FGUA 3QFUA 2E1YA 4CI6A 1NGGA 1IJJA 2NZTA 4BR7A 5BPMA 3LDOA 2QW9A 4FOEA 3ZETA 1U6ZA 3WXLA 3C0BA 5KQ8A 3BUZB 4JD2B 1MWKA 2YCHA 3A5MC 5AQJA 4CD3A 5EXWA 3S41A 3ZX0A 5CE3A 5AQWA 3FFKB 3H1QA 4JAXA 2QWMA 4BC4A 1D4XA 2ZF5O 5AQMA 4FWPA 1KAZA 2F9TA 4WQ5A 4BC2A 5ADXH 3H3OB 3U8XA 4H5RA 2GEMA 5AQFA 4BVPA 4FOIA 3HM8A 4BGAA 3VETA 1NGFA 1V4TA 3VEWA 3WXKA 3F9MA 1GLAG 5F1XA 3QDKA 2WUSA 1XC3A 4EAHD 4ISFA 1SZ2A 2P9KA 3BEXA 2P9SB 3FZMA 3HI0A 3RSEB 1T6DA 4DQ8A 3JS6A 1YAGA 3BF1A 2ASPA 4CZJA 3WT0A 4PL8A 3WQUA 1ATNA 4F9OA 4AM7A 2Q31A 3CQYA 2FLOA 2CGKA 3LM2A 2A3ZA 3R6MA 4CJ7A 1OKJA 2FF3B 1TUUA 2VWBA 5AQUA 4XH4A 1E4GT 3VF6A 4WYBA 2NRHA 4MLEA 3L0QA 2A41A 4H03B 2FSKA 2IIRA 3VENA 3ZEUB 3AAQA 2GUPA 2V7ZA 3OHRA 1NGDA 2QWOA 3W0LA 5BREA 4XH5A 3J8AA 2BTFA 1C0FA 1XUPO 4A2BA 2CGLA 4FWNA 4H5WA 3BP8A 2W40A 3GOIA 1BDGA 2P9UB 3LDQA 3D2FB 1S22A 5AZJB 3WEEB 5JICA 3DXKB 1NGJA 1YXQA 5KPZA 2IVNA 2E1ZA 1NGAA 2Q0UA 2HF4A 2P9NB 2AP1A 4LC9B 4B1XB 5BPLA 4MO4A 3FR0A 3TPQA 4H0XB 4BR2A 4FO0A 1YUWA 5AZIB 3QBWA 2A5XA 4J8FA 3CHWA 1U2VB 3FLCO 2GTDA 3MN9A 5EY4A 2E2QA 3IUCA 4EHUA 2FF6A 1BU6O 3B8AX 2Q97A 3O5BA 3SK3A 5LJVA 4BRIA 3CJAA 4A62A 2PAVA 2ASMA 2Q0RA 4H0OA 3CI5A 4FWKA 5F0XA 5AQXA 1DEJA 4GNIA 3VF4A 3DXMB 5EOYA 3VESA 3QFPA 2IVOA 3CERA 3O6WA 1QQNA 2QWLA 3ZX3A 2P9SA 3HTVA 2ASOA 5JLFA 1Z05A 4C23A 3FZLA 5AQSA 1G99A 3GBTA 1MWMA 2E2NA 3I33A 4H5NA 1HPMA 1NGIA 3CJ1A 3IMXA 5AQLA 2P9IB 1Y64A 3GDQA 3LDLA 3EN9A 1BA0A 4WQ5C 5TKYA 1H1VA 1LCUA 5AQPA 3HSCA 5AQZA 3CIPA 1BUPA 3LM9A 3KZBA 1NLVA 1RDWX 2A40A 4B1WB 2HF3A 3O1WA 4IWVA 1NGEA 3O4WA 4IZ9A 4CZLA 2E88A 3ZEUA 4MO5A 3D7EO 4IJAA 3I8BA 3W3DA 3VEYA 3ZX2A 2OANA 3HZ6A 5JLHA 1HJOA 2P9PB 4H0YB 3LL3A 4H0TB 3FZKA 3M1FA 3WXJA 4BRCA 3EKSA 4JNEA 1NGCA 2ZGZA 4IO8A 3C7NB 4M7XA 5AQTA 3WEEA 2GELA 3DXKA 3MN5A 2E2OA 3VEZA 3CJCA 3BF3A 4RCHA 4B1VA 1RFQA 4PKIA 1S3XA 3HBTA 2IVPA 4B1YB 1GLDG 1EQYA 2P9NA 3L4IA 4CD1A 1NMDA 2Q36A 1GLEG 5AZIA 5BR9A 1BO5O 1HKBA 4BRPA 1U2VA 1MDUB 1HX1A 1XQSC 1ZBSA 2QWRA 5KQDA 4FSVA 5AR0A 1ZXOA 5AQGA 4XH1A 2D4WA 4BRDA 4PKGA 4EFHA 1CZAN 3WQTA 5AQNA 4BRMA 5BN8A 3JXUA 3VEXA 2ZWHA 1NBWA 3CETA 3ULEB 3UB5A 3QBXA 3EZWA 5JMVA 1TYQB 2UYTA 2CH5A 3O1BA 1KXPA 4FWMA 3A0IX 4QS8A 3ATUA 3VOVA 3DXMA 3O80A 4CZFA 4IXCA 4BR9A 3H6EA 2VCPA 4JHDB 4JN4A 3WXIA 4CZHA 3FE1A 3UKRB 2QWNA 2QWPA 3EL2A 2I7PA 4I6MB 1K8KB 2V51B 4GY2B 4BRHA 4BQZA 4BR0A 4XEIA 3D2EB 2P9KB 4O5FA 5AQKA 4B1UB 3IFRA 5ELZA 2D0OA 2YHYA 4JD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DFMA 3KK3A 2UU9K 4HUGA 2HHTA 3UKUB 3VQEA 3H45C 2RF2A 4BROA 3FZHA 1GLLO 3EE8A 1HLUA 1HNVA 1Q9XA 1JCFA 4CZEA 3EZ5A 5ADXA 3TAEA 1X9WA 1WAJA 4CBUA 2QEXN 5B8HA 2PBDA 2X78A 4M3RA 2A6AA 1RTDA 4DQRA 1ZBIA 2J4RA 5M1QA 3DJCA 3OYIA 3MXJA 1HRHA 2OPRA 1Q7YO 5AFUA 4DTSA 4DTMA 3SYZA 3P4IA 3VN5A 1OH8A 3NF7A 4YOTA 3SPZA 4E3SA 3AO5A 4BC3A 4K42A 1RDCA 4BRNA 4WFBL 2YHXA 4DU4A 2G8UA 2HMPA 3MMVA 3GG4A 3TAQA 3P38A 1GLJO 3O9UA 4DLEA 1X9JA 3ALYA 4AM6A 4E7IA 3U9DA 4NCBA 2QI2A 1QZ6A 3CJ9A 3C6UA 3KK1A 2HW3A 2UUCK 3LZJA 1DKGD 2OCEA 2O8DA 1A5XA 4FZZA 4O8KA 2O8CB 4DF4A 2X74A 3THVA 1YTAA 1JXEA 5E84A 1QHTA 3OYFA 2IOCA 3LDPA 3F9KA 2YJFA 3FZFA 2X6SA 4DHYA 2NRWA 1W9HA 5AFUH 3SAFA 3S3OA 4I6MA 2AA4A 1K8KA 3Q7BA 4E7JA 4CBWA 4GMJB 1E4FT 2UXBK 4BWMA 3A8YA 3R8EA 5FPNA 2D0BA 1BG3A 2GBZA 5LY3A 4BDPA 2JWLA 4B9LA 4HVJA 2ZGYA 2HHHK 3UKUA 4DSKA 4BDZA 4JI0K 3MEGA 1XMOK 1NGHA 3MAQA 1QZ5A 2BUPA 1TK0A 1YTUA 1VQLN 3LP0A 1EO1A 3DLHA 4KBOA 4QS7A 3OW2M 3CCMN 3RVCA 4W5OA 3GL1A 4CJVA 4FCYA 3OS1A 4IO9L 1A5VA 1RT4A 4NLBA 3VGLA 5EU7A 2F9WA 1RDDA 1T6CA 1CLQA 4MLHA 1J5EK 4BC5A 4CGIA 3VQBA 4KH6A 4EHTA 5FPEA 2ZJQL 3AVGA 1EETA 1LWFA 5MLCQ 4O0IA 4K25A 3QNNA 2KFZA 4WFAL 3AV9A 4FJNA 5F2RA 1C0TA 1RDUA 3L4QA 2B5JA 4EP5A 3MEDA 3PX6A 3MK6A 1HKGA 1VSDA 3N4QA 3J7YP 4BR5A 5JENA 4CF8A 1BCOA 2ZQBA 3BY5A 2P1JA 2QK9A 3EKUA 4HWIA 4FWSA 1D8YA 4E72A 4B9VA 1Q9YA 2O8CA 2P9PA 1V4SA 2YHAA 4DFJA 4CEOA 1J54A 4DR3K 4F8RA 2HB5A 2QM1A 3I8DA 3THWB 4DFKA 1K8AO 2C1IA 5AQVA 1T05A 5HRRA 4HCCA 1RGIA 4BRQA 4Y1CA 4U7BA 3VA3A 3WXMB 2B6AA 3MXMA 5M1KA 5J2PA 1NK5A 4B3TK 2E1YA 1CXQA 1NGGA 2NZTA 4C8NA 2QW9A 3LWMA 2YV0X 2O8EB 3BZKA 4ICLA 3NF9A 1KVAA 3SV4A 4KRFA 3V9ZA 3BUZB 1MWKA 2PFUA 4CD3A 3PLAA 5EXWA 3S41A 5A2QO 4OPAA 5J2MA 4O55A 3SAHA 4J2EA 3UIQA 4QCLA 3DYAA 4WQ5A 4F3OA 3H3OB 2GEMA 3NMUA 4CF0A 2VGMA 4LD0A 2E6LA 4FOIA 3L3UA 1QSLA 3AVMA 1NGFA 5CHIA 4N76A 2G8HA 3NVMA 3WXKA 3F9MA 1OVYA 3LDSA 3QDKA 1L3TA 3ZSYA 1TK5A 5BR8K 1LAWA 2KFNA 2HBJA 2P9KA 4DV6K 4DV1K 1FXXA 1KCFA 4DQ8A 1YAGA 1IV0A 3MX5A 4CZJA 3FFIA 3T69A 4CJKA 3LZIA 5T7BA 4CK1A 4DV7K 4FK4A 1JLAA 4FK0A 1RTHA 4N41A 4HUEA 4KHNA 5I3UA 3ZSQA 3P1GA 3AA4A 3PX4A 3VQPA 4MLEA 1WAFA 5GIOA 1X9SA 1S6QA 3VENA 1C6VA 1KLNA 4LFCK 3BZCA 3L2RA 3CFPA 2QWOA 4XH5A 2BTFA 3RR8A 4FJHA 3I56N 4O8UA 3THWA 1T8EA 4JK8A 4B3MK 1BDGA 3KK7A 3JSMA 3HPHA 1WNSA 4CF9A 3RMCA 3D2FB 1S22A 1QS4A 3DXKB 1NGJA 1YXQA 3HSTB 5KPZA 2E1ZA 2FC0A 1NGAA 2Q0UA 4DQPA 3CCEN 1JLCA 1YVUA 2ITGA 3LP2A 3VTHA 3CC2N 2O8EA 1YI2N 4BR2A 4H0XB 1A5WA 3CM5A 2VWKA 5AZIB 1XI1A 3HRGA 4CIFA 3M8SA 2O8FB 2E2QA 4FLYA 2FF6A 1BU6O 3BDPA 1VRUA 5LJVA 4A62A 2PAVA 3PO5A 2C1GA 1HJRA 4JK9A 4BE7B 2Z1JA 2Q0RA 4Z4IA 3CI5A 3PUFA 5LMUK 5F0XA 4GNIA 3VF4A 3KWGA 1NJZA 3M8QA 3VESA 5GAGP 2JLEA 5HBMA 4HTUA 4QOZB 4JKGB 2HNYA 3AVKA 5HP1A 2NRRA 3LP1A 4CGFA 1Z05A 3LPUA 5AQSA 5GINA 1HYSA 3GBTA 1VQON 2P9IB 3M8PA 5AQZA 3K59A 3O9SA 3C95A 3LM9A 3Q7CA 3OJSA 1KLMA 1NLVA 2A40A 2XY8A 4H4OA 3NBPA 4IZ9A 3V1RA 5M1NA 1FKOA 3VQ4A 1QTMA 4IJAA 3K5MA 2BH1A 1NKBA 3ZX2A 2OANA 3F73A 3C6AA 3DLBA 1GOBA 4H0YB 1N8RO 3VQ8A 4RG8A 3HOSA 4XJXA 3EKSA 4JK7A 4B8AB 1ZBUA 4Z4GA 4M42A 2ZGZA 3C7NB 3O3FA 1RBUA 3EE9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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