5BPNA

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
376
structure length
372
Chain Sequence
AIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVLNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 372
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpnA04
3FLCO 2QWPA 4H03B 3MMVA 4L3QA 1DEJA 2CH5A 4ISFA 4BC2A 4CZLA 4AM7A 2GUPA 2P9NA 4FO0A 3KVGA 3L6QA 3VF4A 1HPMA 3RSEB 4BC3A 1YAGA 3LM9A 3QFPA 1C0GA 5AQRA 2QWLA 1BOTO 2YI1A 1BO5O 2E20A 5AQYA 2FF6A 1V4TA 1BG3A 3VPZA 3FZLA 2ZWHA 3SMPA 4PL7A 1SQKA 3VEZA 1NWKA 4XH5A 4QS7A 1ATRA 3A0IX 1BU6O 2BUPA 1NGDA 4O8KA 1H1VA 3B8AX 2QWQA 4BRAA 1GLBG 3BF3A 3DWLA 4WQ5C 1HKGA 4H0YB 3VEXA 4FWRA 4HWIA 3ULEB 3I33A 3RSEA 1GLJO 3R8EA 3LL3A 5AZIB 3CI5A 1S22A 3U4LA 4I6MB 1R59O 4IJNA 2GWKA 2Q36A 5AQVA 4K41A 3GE1A 4BR5A 4CZKA 3ZX3A 3O6WA 1Z05A 4MLHA 3WT0A 2ZGYA 3O1BA 1QQOA 4A62A 4FWPA 2P9SB 3MN9A 3AAQA 4FWOA 2IIRA 4IWVA 4XEIA 4A2AA 2A3ZA 3GL1A 4MO5A 2Q0RA 4KBOA 3LDLA 3DXMB 5F1XA 4IXCA 4BRHA 5ADXA 3EN9A 3FZMA 3GG4A 5ELZA 3H3OB 4M7XA 4BR0A 1HX1A 4IZ9A 3ULEA 4BRKA 1GLDG 2FLOA 2PAVA 3BP8A 1NM1A 3MN5A 4WQ4A 5EOYA 5KQDA 4BG9A 5F2RA 5AZIA 3O8MA 3CERA 3CQYA 3WUHA 4I6MA 3A5MC 3VGMA 5KPTA 4YDUC 1NLVA 3QFUA 3SJHA 3MCPA 4LC9B 2CGJA 3O08A 2BTFA 1GLCG 3R6MA 1BA0A 1MDUB 4NO7A 4C23A 1NGEA 1LOTB 5BN8A 5EXWA 2P9SA 3SMSA 2E8AA 3DXKB 3O5BA 4EHTA 5BPMA 3DAWA 3HM8A 2HF4A 3VEOA 3VENA 5ADXH 3EZWA 4BVOA 3DXMA 2P9NB 3CQXA 1HLUA 3AAPA 1LCUA 1MWKA 2P9UB 2V52B 3OHRA 4XH4A 3MN7A 1YUWA 2A6AA 4DHYA 4FL9A 5LJWA 3FGUA 4FOEA 5FPNA 5CE3A 2AP1A 3TPQA 3KHYA 4PL8A 1KAZA 1C0FA 2YCHA 3WQTA 1Y64A 4J8FA 1QZ5A 2E2QA 3D2EB 4H5RA 3CETA 5EVZA 4B1UB 5AQMA 1TYQB 2ZF5O 4FSVA 2F9TA 3H1VX 2A40A 1DKGD 1NGHA 4A61A 4CBUA 4FPBA 5AZJB 4WQ4C 2YHWA 4FOIA 3DXKA 4BGAA 4BREA 4BRMA 2KHOA 4FWSA 4XH1A 3VEWA 3FZFA 3GDQA 3CJCA 1SZ2A 1T6CA 2P9UA 5LJVA 3FZHA 1T44A 3HSCA 2Q31A 4BVPA 5BRHA 5BREA 2FF3B 2QW9A 4DQ8A 5BPNA 4FWQA 5BR9A 1YXQA 4CBWA 1KAXA 4GNIA 4BRLA 4CZIA 4CZHA 3D2EA 3QDKA 2QXLA 5E26A 2P9PB 5KPZA 1HKBA 4ISEA 4GY2B 1TYQA 2FSJA 2V7YA 1MA9B 2ASOA 2GTDA 2GWJA 1K8KB 2YHXA 4BROA 4BQLA 5B8HA 5AZJA 2HOEA 4H0PA 3U9DA 4DB3A 1Z6RA 4IO8A 2A5XA 3P4IA 4YDUA 5FPDA 3C0BA 3VF2A 2E1YA 3WXKA 3QICA 2Q0UA 4FPAA 3CJAA 2DPNA 4WYBA 5F0XA 3LDQA 2J4RA 2W41A 1IG8A 2CH6A 1DGKN 1XQSC 4BRPA 1HKCA 1KAYA 2IVNA 1D4XA 5AQIA 4EHUA 4CD1A 5BRFA 3DJCA 2P9PA 2HMPA 2F9WA 4H5NA 4CZFA 3MN6A 4CI6A 3LM2A 1X9JA 1K8KA 4MLEA 4H5TA 2FSNA 3FZKA 1GLEG 5EX5A 3ATVA 3UE5A 2YJFA 3KZBA 4DCHA 3ID8A 3CHWA 3A5NC 3LDPA 5AQZA 4CZMA 4PKIA 2PBDA 1WOQA 2OANA 4JNEA 1GLFO 3FFKB 1SAZA 1RDWX 4B1WB 3VGLA 3BF1A 1HJOA 2P9IA 4EFHA 3QBXA 1GLAG 1YVNA 3ENOA 4BRQA 3H1QA 4Y0WA 1BA1A 2GELA 4B9QA 5AQJA 2I7NA 2UYTA 3SLCA 3VEYA 2V7ZA 3QB0A 3A8YA 1QZ6A 2E2NA 4FWMA 2WUSA 3C7NB 5E84A 3HI0A 4B1VA 4BRCA 4BR2A 4CZJA 1P8ZA 2D4WA 1EQYA 2NLXA 3UKUB 1TUUA 3BEXA 1JCFA 2Q97A 2VCPA 4Z94A 4BG8A 5AQGA 5AQWA 3EKUA 3W3DA 4CBXA 4FWNA 5BN9A 2V51B 3WXIA 3VOVA 5JLFA 5BPLA 1BDGA 1ZXOA 3HTVA 1NGCA 2QWNA 3H3NO 4BQZA 4A2BA 2HF3A 4B1XB 3VGKA 2P9LA 2D0PA 3EL2A 4AM6A 5AQPA 2ASMA 2E1ZA 3UKRB 4H5WA 4M7YA 3C7NA 3IFRA 3WXJA 1ESVA 3CJBA 4H5VA 1BWFO 3ZX2A 1NMDA 2AA4A 2E2PA 3EKSA 3AARA 3UKUA 4BRNA 2E88A 3AY9A 4BRFA 4BRGA 5I9EB 4K25A 1JCEA 3M1FA 5AQHA 2P9KB 4B1YB 2QWMA 3ZX0A 2FXUA 1T6DA 1J6ZA 1HUXA 5AQTA 3WXLA 1ATSA 2YHYA 4BC5A 4JN4A 3QBWA 4BRDA 2A41A 1QQNA 4EAHD 4H0OA 2Q1NA 4BRIA 3I8BA 3BUZB 1OKJA 4EIAA 4JAXA 3UKRA 3G25A 5JLHA 4IJAA 3CJ1A 1JCGA 3QMLA 3M6GA 1RFQA 1WUAA 5AR0A 4H0TB 4RCHA 1E4GT 3D2FB 2W40A 5BRDA 4HTLA 1NGJA 5EY4A 1NBWA 2QWRA 2P9KA 3IDHA 2NRHA 4JHDB 2Q2RA 4CJ7A 2P9IB 1NGAA 2IVOA 4RTFD 5AQSA 5JMVA 3W0LA 3O4WA 2EWSA 1BUPA 4BR9A 1X3MA 4CZEA 3GBTA 1GLLO 1ZBSA 2NZTA 3TU5A 3H6EA 3HZ6A 3UB5A 5JICA 3WEEB 1MWMA 3MDQA 1CZAN 2GEMA 5AQOA 4H0VB 3WQUA 2FSKA 2H3GX 2VYPA 4PKGA 3D2FA 3LDOA 3H45C 3F9MA 4BGBA 3ZEUB 3VEVA 3U9ZA 4JD2B 4JHDA 4M63C 4B1ZA 4QS8A 5AQUA 5AQLA 3GOIA 4E1JA 1V4SA 5TKYA 4QS9A 3A5OC 2P9LB 1ATNA 3M3ZA 2A42A 5KPRA 1NGBA 3CIPA 3S41A 1X3NA 4CD3A 2IVPA 3JS6A 3O80A 5AFUA 2ASPA 3FR0A 3L4IA 1IJJA 1RGIA 4BC4A 3WEEA 4NB4A 3VESA 1NGIA 2ZGZA 1U2VB 2QWOA 4PKHA 3ZETB 3MK6A 3J8AA 1NGGA 3A5LC 1XC3A 3U8XA 4CZGA 3EO3A 3R9PA 3ZEUA 1TUYA 4JD2A 2D1KA 2QM1A 5KQ8A 4MO4A 1ZC6A 3H46O 2D0OA 2I7PA 1KXPA 3SK3A 4K42A 5FPEA 4BR4A 5AQKA 4FWLA 1XUPO 5AQQA 4RWTA 3VERA 1G99A 4H0XB 3LDNA 2E2OA 4O5FA 2VWBA 3VETA 5AFUH 5FPMA 5AQFA 3ATUA 2CGKA 1S3XA 3O1WA 4ISGA 3L0QA 3HBTA 1QQMA 1QHAA 3VF6A 4BR7A 2YJEA 5LY3A 3ENHA 2CGLA 1E4FT 3CJ7A 5AQXA 1U2VA 3FE1A 3JXUA 3ZETA 4FWKA 2ITMA 3D7EO 4WQ5A 3IMXA 4F9OA 1Q18A 5AQNA 3CJ9A 1NGFA 3IUCA 4K43A 1U6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RRGA 3OS0A 1DEJA 2CH5A 4ISFA 1CN2A 4AM7A 2GUPA 2P9NA 1AYJA 3L6QA 4X62K 1C55A 3NCIA 1Q81O 4OX9K 1NK8A 3O9RA 4DV1K 3SPYA 4FM0A 1TK5A 1GPTA 3TSUA 3MWPA 4JRQA 2P5GA 3TI0A 3O4NA 1JJ2M 4OLAA 2YIOA 4CVNE 3TAFA 5DMRA 1U48A 2AJQA 1HNZK 3K5NA 1BG3A 1LWFA 3FZLA 3SMPA 3VEZA 3ZSYA 4XH5A 3ZSXA 1ATRA 3OYBA 2W6LA 1W2BM 2YX6A 2B5JA 1GLBG 3TTCA 4HWIA 3ULEB 1DTTA 3LL3A 1C6VA 4BY9C 1S22A 3C6TA 4AF1A 1R59O 5GAHP 2Q36A 1RILA 5AQVA 1VSFA 4BR5A 3ZX3A 3O6WA 5HRNA 1HYSA 1VRTA 5LMNK 4JKCA 3S9HA 4A62A 3MN9A 3AAQA 3TAMA 3KLEA 1S9EA 3RMBA 1C1CA 4MO5A 1K8BA 3AA4A 2HHVA 4KBOA 1RDDA 3LWLA 4LF7K 3ZSZA 5ADXA 1HNXK 2IOCA 4KHNA 3FZMA 3BZCA 4G9ZA 3PLAA 4DV6K 1JLEA 1ZYQA 4B9MA 3ULEA 4I9QA 4KV8A 3BP8A 4WQ4A 5KQDA 3KHWA 1HPZA 2HNYA 3L2UA 5MLCQ 4KTWA 2NRZA 2IC3A 1PE4A 3PY8A 3HXMA 2LY5A 3SJHA 3MCPA 4LC9B 4X65K 1DJTA 1I94K 1L3UA 1BA0A 4JK7A 3HRGA 2XO7A 1LOTB 4AQYK 3V9SA 4DLGA 5AJ3K 4YNQA 3DAWA 3OA9A 3VEOA 4IG0A 3VENA 3U6FA 3SJJA 3V9UA 4BVOA 3CQXA 1VQLN 4C8MA 3P38A 1HLUA 3AAPA 2V52B 4CF2A 3MN7A 2A6AA 2YV0X 1RTJA 3FGUA 3AA2A 3VQ9A 5CE3A 2AP1A 5J2MA 1S1WA 1KAZA 2YCHA 4A59A 1RDBA 4DFMA 1N8RO 1VQ5N 3D2EB 4H5RA 3QINA 3L4QA 4B1UB 4FM1A 4DR7K 1TYQB 3NH2A 4FSVA 5H1SQ 4CGJA 3ZYYX 3H1VX 3S3OA 4CBUA 4FPBA 4WQ4C 5J2PA 3OYJA 1KFSA 4CJPA 3CC7N 4HCCA 3VEWA 4LF9K 4CFAA 4ELTA 1YVUA 4A5AA 1YI2N 5LJVA 3LANA 3AVKA 4U67L 3QI7A 3Q7CA 2Q31A 4BVPA 4IEEA 3HT3A 4DQ8A 5BR9A 1RNHA 1YXQA 4GNIA 1AHOA 4CZIA 3D2EA 5C10A 5E26A 2KPYA 1HKBA 1TYQA 4GVMA 2V7YA 4RG8A 1EWRA 4HHTA 2ZJRL 2GWJA 3K9KA 4A5BA 3U9DA 1T7EA 1T1TA 1IKWA 4BEBA 4FLUA 1Z6RA 5M1QA 3THVA 3P4IA 4KH5A 4FJ5A 1VSDA 4OKEA 3WXKA 4DTRA 4JI5K 4OJRA 5BR8K 3E9LA 4DSJA 1UAXA 3LDQA 1EETA 3CCQN 2W41A 2CH6A 1XQSC 1UGLA 2VG5A 3V6DA 3O3FA 2YNIA 2IVNA 2NY9X 3CFPA 2O8BB 1WSFA 4Z4GA 5BRFA 3E7UX 2HMPA 4JKAA 3AVIA 4CI6A 1VRUA 2FSNA 4MFBA 2PY5A 2HBJA 1KQSM 4PUOA 4IO9L 4HE7A 3VA3A 4C8KA 3A5NC 1IBMK 1RBTA 1GOBA 5AQZA 4GV6A 1N6QA 4PKIA 1RT2A 2OANA 1GLFO 3HP6A 3E66A 3C6AA 3VGLA 3BF1A 3V1QA 2VG7A 2O8BA 4BRQA 4Y0WA 4KRFA 4CJTA 2GELA 3P31A 5AQJA 2UYTA 2SN3A 1NK5A 4UAFE 3QB0A 4FWMA 1QZ6A 1ZU3A 3C7NB 3JAMO 3KD5E 1QHTA 2D4WA 1LWEA 1L3SA 1ASUA 1EQYA 1VSJA 2Q97A 4FLZA 4LH5A 4FLTA 4OLBA 2E0HA 4CBXA 4E3SA 4FWNA 4IDKA 4KB1A 5CYMA 4DV2K 4CIFA 3CF5L 4AHRA 3HTVA 4XIUA 4DQSA 1KC8O 4IFEA 1WBBA 1NOZA 2QKKA 4JS5A 1JLQA 4E1NA 1WSHA 1SN1A 2KBKA 3L56A 3C7NA 3L2WA 3KOWA 1ESVA 4WCEL 3HL8A 2D56A 1BWFO 2OA8A 1OVQA 3H08A 3TSPA 3AARA 4OPJA 5J2QA 1D9DA 4M3XA 4JS4A 1I6GA 1A5VA 4I7FA 4W5OA 3DLHA 4DG1A 3OYLA 5I9EB 4N56A 4CK1A 3DLLL 3EE9A 4CJSA 3NGZA 1SKWA 3CW4A 4CGGA 3N4QA 2UXBK 4FYDA 1HUXA 2IGIA 3K0SA 4FK0A 4IFVA 3WXLA 1ATSA 1NKEA 2G2KA 4JN4A 3QBWA 2E4LA 2GMOA 4H0OA 5FLXO 4B8CA 4AAZA 5C12A 4CHNA 3AVLA 5C42A 4JAXA 3G25A 4IJAA 2RF2A 2HSTA 1VNAA 4H0TB 1RBSA 1WLJA 3MX5A 1NK4A 1NJIO 3Q7BA 4YOTA 1E4GT 2W40A 5BRDA 4HTLA 4JI6K 3THXB 3P1GA 5C2DA 3SI6A 5I3UA 2KGQA 2OCEA 4JHDB 1SKSA 2X74A 2IS3A 3MAQA 1RTDA 1NGAA 3AVJA 4DLEA 4RTFD 4CJEA 2Q3SA 3O4WA 3EY1A 4BR9A 1NH5A 4AHSA 3OS1A 4F2RA 2GBZA 3NVKA 3CC2N 1I2UA 3PX0A 1SKRA 4UY8O 1ZBSA 2NZTA 3IAYA 2HHHK 4O5BA 1KVAA 1GOAA 4N5SA 3K9JA 3WEEB 1G15A 3MDQA 2BE2A 2GEMA 5AQOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RRG A;  3OS0 A;  1DEJ A;  2CH5 A;  4ISF A;  1CN2 A;  4AM7 A;  2GUP A;  2P9N A;  1AYJ A;  3L6Q A;  4X62 K;  1C55 A;  3NCI A;  1Q81 O;  4OX9 K;  1NK8 A;  3O9R A;  4DV1 K;  3SPY A;  4FM0 A;  1TK5 A;  1GPT A;  3TSU A;  3MWP A;  4JRQ A;  2P5G A;  3TI0 A;  3O4N A;  1JJ2 M;  4OLA A;  2YIO A;  4CVN E;  3TAF A;  5DMR A;  1U48 A;  2AJQ A;  1HNZ K;  3K5N A;  1BG3 A;  1LWF A;  3FZL A;  3SMP A;  3VEZ A;  3ZSY A;  4XH5 A;  3ZSX A;  1ATR A;  3OYB A;  2W6L A;  1W2B M;  2YX6 A;  2B5J A;  1GLB G;  3TTC A;  4HWI A;  3ULE B;  1DTT A;  3LL3 A;  1C6V A;  4BY9 C;  1S22 A;  3C6T A;  4AF1 A;  1R59 O;  5GAH P;  2Q36 A;  1RIL A;  5AQV A;  1VSF A;  4BR5 A;  3ZX3 A;  3O6W A;  5HRN A;  1HYS A;  1VRT A;  5LMN K;  4JKC A;  3S9H A;  4A62 A;  3MN9 A;  3AAQ A;  3TAM A;  3KLE A;  1S9E A;  3RMB A;  1C1C A;  4MO5 A;  1K8B A;  3AA4 A;  2HHV A;  4KBO A;  1RDD A;  3LWL A;  4LF7 K;  3ZSZ A;  5ADX A;  1HNX K;  2IOC A;  4KHN A;  3FZM A;  3BZC A;  4G9Z A;  3PLA A;  4DV6 K;  1JLE A;  1ZYQ A;  4B9M A;  3ULE A;  4I9Q A;  4KV8 A;  3BP8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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