2P9SB

Structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp/mg2+
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
TGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 54
structure length 197
sequence length 197
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9sB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9sB02
2P9KB 2HF4A 2P9SA 5JLFA 5AQJA 5AQNA 1NGGA 2VYPA 1GLEG 4AM7A 4MO4A 1TUYA 3UE5A 5AZIB 4QS8A 1NLVA 3C0BA 4H0XB 2YI1A 2FSNA 3HSCA 3SMSA 5BN8A 3L4IA 4CZKA 3JXUA 3UKRA 5AQHA 3RSEA 4FSVA 4JAXA 2D4WA 3EO3A 3O1WA 3MN5A 4I6MA 4CZLA 3MCPA 1SQKA 2E2PA 1BA0A 2CGLA 3CETA 4FOIA 4JD2B 4JHDA 2GEMA 5KQDA 2A40A 3LDQA 3FZFA 5EY4A 2F9TA 3IUCA 5ELZA 3ZX3A 3A0IX 3ENOA 4B1YB 4XH1A 1GLLO 2OANA 3U9DA 4BRAA 3FR0A 1ZXOA 4BQLA 1QQMA 3FFKB 5BRFA 3R8EA 2FF6A 4CBXA 4CZHA 1V4TA 2CGJA 3LDNA 3ATVA 5AQRA 4BGAA 3I33A 3BEXA 4BC4A 1GLAG 3HTVA 1MWKA 3UKUA 4A2AA 2AA4A 4PL7A 3O4WA 1K8KB 2KHOA 3VEVA 4O5FA 1GLDG 3VGLA 5I9EB 5KQ8A 4ISFA 3LL3A 2NLXA 2VCPA 3ULEA 1DKGD 2QWMA 1J6ZA 4BQZA 1Z6RA 4CBWA 3CJ7A 5FPMA 1T44A 3O8MA 2YHWA 4PKGA 5AZJA 1T6DA 3KVGA 3LM2A 4E1JA 1JCFA 2BTFA 3EKUA 4CZGA 3O5BA 1X3NA 1YXQA 4FPAA 3GE1A 2ASMA 1D4XA 4EFHA 1GLBG 2YHXA 3KHYA 1NBWA 2D0PA 1BDGA 1NM1A 3DXKB 3ENHA 1GLFO 2IVPA 5KPZA 5EVZA 5EX5A 1NGCA 3FE1A 3VPZA 3AY9A 3CERA 5E26A 3QMLA 2A42A 3WQTA 1NWKA 1MWMA 5AQZA 3H3NO 2E1YA 1KAYA 1C0GA 1Y64A 1NGHA 2FSKA 4BRLA 3D2FB 4IJNA 2YHYA 3TU5A 2I7PA 2YCHA 3GG4A 3L0QA 3MDQA 4J8FA 3VF4A 2Q31A 4K41A 1G99A 4BRMA 5E84A 5AQMA 3A5OC 3DAWA 1GLJO 5AQIA 3AARA 4CD3A 2J4RA 3R6MA 4WYBA 4EHUA 2P9KA 4M7YA 4H5WA 4BR4A 5AQGA 3HI0A 2A6AA 4FWNA 1S3XA 2QWRA 5AQFA 3VGKA 1MA9B 2QWPA 5AFUA 3HM8A 2V7ZA 2Q1NA 5BR9A 5BPNA 4ISGA 4QS7A 1NGIA 2QWOA 4B1VA 4H5NA 2FLOA 4NO7A 3JS6A 3W3DA 2W41A 3A5NC 4JNEA 5JICA 3CJ9A 3O80A 4HWIA 4CZMA 1BO5O 1KAXA 3D7EO 4YDUA 5JLHA 4FWPA 4B1WB 4BG8A 3CHWA 4CI6A 1JCGA 3CJCA 2V52B 4JN4A 2F9WA 2DPNA 3VENA 2E1ZA 3WXKA 1JCEA 3IMXA 1EQYA 4FWOA 4BVPA 2UYTA 3CI5A 4EAHD 5FPDA 5LJVA 2P9PA 3ZX2A 3AAQA 4DCHA 1ATRA 1HKGA 2WUSA 2Q2RA 3FZMA 1HX1A 2P9LA 1H1VA 3TPQA 5AQOA 1SZ2A 2Q97A 3WEEB 5BRDA 5AQSA 3FGUA 2NRHA 4FWLA 3ZEUB 1HPMA 1ATSA 2FSJA 4IWVA 1DGKN 2Q36A 5BPLA 4RWTA 2I7NA 3U4LA 3C7NA 3QFUA 1HUXA 4B1UB 1U2VA 2P9SB 3QFPA 2Q0UA 3ZETA 4CD1A 1MDUB 3LM9A 1NGAA 3VEXA 4CBUA 3LDLA 4Z94A 1ZBSA 4MLEA 5CE3A 2V7YA 3QICA 4BRKA 4H5TA 3H46O 3R9PA 1TUUA 3ATUA 4H5RA 3UKRB 3FLCO 3SJHA 3HZ6A 4ISEA 4WQ4A 3RSEB 1BWFO 1HKCA 2FXUA 2P9NA 2P9UA 3ZX0A 5BREA 4IO8A 1KXPA 1ESVA 4I6MB 3H45C 5EXWA 3A5LC 4PL8A 4FWMA 3D2EA 1SAZA 5F1XA 4JHDB 1CZAN 3CQYA 4FL9A 2P9IA 5ADXA 4PKIA 3CJAA 1BOTO 1WUAA 3M3ZA 3BUZB 4GNIA 4BROA 3H1QA 3D2FA 1HJOA 3CQXA 3GL1A 4BRGA 4BRIA 4FPBA 2GWKA 3CIPA 4WQ5A 3WXIA 3FZHA 4B1XB 3VF2A 2CGKA 4HTLA 4BC5A 3FZLA 3VESA 5LY3A 1C0FA 2IIRA 3SK3A 2QWNA 4BR5A 1BG3A 5AQWA 3S41A 3G25A 3BP8A 5AQPA 4BR9A 3L6QA 3H1VX 4K42A 4GY2B 3UKUB 3DWLA 3MN6A 2E8AA 1OKJA 3EKSA 4WQ4C 4BR0A 4K43A 3LDPA 2ZGZA 3WXLA 1X9JA 1HKBA 3O6WA 2E2OA 2GTDA 1NGFA 2H3GX 1IJJA 1NGEA 2HOEA 4O8KA 1YVNA 3J8AA 5AZJB 5AZIA 3VEZA 4FWRA 1YUWA 1Q18A 1QHAA 2IVOA 3HBTA 3MN7A 3U9ZA 1QQNA 4BREA 4RCHA 3MK6A 5AQQA 3B8AX 5BRHA 4A2BA 3DXMB 3P4IA 5AQUA 2A41A 3DJCA 4H5VA 4CZFA 1NMDA 2HF3A 2YJFA 5BPMA 4JD2A 2E2QA 4L3QA 2CH6A 3CJ1A 1HLUA 3AAPA 2E88A 4K25A 4BC3A 4H0TB 1DEJA 3UB5A 3CJBA 1QQOA 1TYQB 2AP1A 4C23A 1RGIA 1XC3A 4CZIA 3VERA 3QBWA 4B9QA 2D1KA 2VWBA 4F9OA 4BGBA 2FF3B 3M6GA 1V4SA 4A61A 1BUPA 1WOQA 5AQTA 2QWLA 4M7XA 3VEYA 5AQLA 1GLCG 3VOVA 1R59O 5AQYA 3OHRA 2W40A 4XEIA 2GWJA 1K8KA 4FO0A 4FWQA 4XH5A 1E4FT 4BRPA 3GOIA 2A5XA 4IZ9A 4BRHA 4DHYA 4Y0WA 3W0LA 1LOTB 1BA1A 1E4GT 4MO5A 5ADXH 3FZKA 5AR0A 3VEOA 3O08A 2QXLA 3VEWA 1Z05A 1BU6O 5AQVA 4FWSA 4PKHA 5AQXA 2ASPA 3QB0A 4A62A 3WQUA 2BUPA 4YDUC 3ID8A 4BRCA 3H3OB 4IJAA 1XQSC 3A5MC 5EOYA 2ZWHA 2NZTA 4MLHA 2ZGYA 4CZEA 4EHTA 3EL2A 3IFRA 3O1BA 3BF3A 2ASOA 3DXKA 4BC2A 2E2NA 3SMPA 2IVNA 3F9MA 2P9PB 3KZBA 5FPEA 4DB3A 5LJWA 1U6ZA 2P9LB 4EIAA 2QWQA 2ZF5O 4B1ZA 3QDKA 4FWKA 4AM6A 2GELA 4BVOA 5TKYA 5F2RA 4H03B 3GDQA 5AFUH 2ITMA 1QZ5A 4BR2A 4BRDA 3C7NB 3EN9A 5B8HA 1U2VB 3ZETB 3VETA 2E20A 4RTFD 4FOEA 1RFQA 4H0PA 1KAZA 2A3ZA 3U8XA 3WXJA 1X3MA 5KPRA 4BRQA 1NGDA 3GBTA 1ZC6A 2PBDA 3DXMA 1YAGA 2P9NB 2P9UB 3MN9A 4H0VB 4KBOA 4BRNA 5JMVA 2PAVA 3ULEB 3D2EB 3VGMA 4BRFA 2D0OA 1LCUA 3WUHA 1XUPO 4H0OA 2P9IB 1NGJA 4M63C 5AQKA 1TYQA 2V51B 1RDWX 5KPTA 2YJEA 4WQ5C 4LC9B 5F0XA 4CZJA 1NGBA 2EWSA 2GUPA 1IG8A 4BG9A 3EZWA 2QW9A 1S22A 4H0YB 3M1FA 4IXCA 3H6EA 3MMVA 4BR7A 3LDOA 3I8BA 1P8ZA 2HMPA 4XH4A 3SLCA 2QM1A 3WT0A 3BF1A 3WEEA 5BN9A 1ATNA 4CJ7A 4DQ8A 2CH5A 3ZEUA 4NB4A 3IDHA 1QZ6A 3VF6A 1T6CA 5FPNA 3A8YA 2Q0RA 4QS9A 3QBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9KB 2P9SA 3I0SA 5AQJA 1IH7A 2VWKA 3NH2A 3AVFA 1GLEG 4AM7A 2QI2A 4MO4A 4HTUA 4WCEL 4H0XB 2FSNA 1X9WA 3L2QA 3JXUA 4BDYA 2D4WA 1KFSA 1D9FA 3EO3A 4KRFA 3O4QA 4I6MA 1N8RO 1SQKA 1VAZA 2E2PA 3AVMA 3HPGA 4IFVA 2RPIA 3C6HA 3CETA 4JI8K 2GEMA 5AJ3K 4LSNA 2JWLA 2R7YA 5ELZA 1DTQA 2NRWA 2DFHA 4OKJA 4XH1A 3VQEA 5M1NA 1QQMA 3ZCMA 5BRFA 1YHQN 4K8ZA 4CHQA 3R8EA 2YHAA 4CHYA 3TAFA 1HNZK 1V4TA 3SUOA 4BE0A 2OZMA 3I33A 1RBSA 4MDBA 4DV0K 2FBXA 2E5LK 3HK2A 4FJIA 4IKFA 4CEQA 4DV4K 1S9EA 2RF2A 4CJ5A 2ITGA 3V1OA 4PUOA 4CGFA 5I9EB 2XY5A 5FROA 3LL3A 4BQZA 3QNNA 3TTCA 1Z6RA 4CBWA 5FPMA 1A5XA 3KVGA 2VWJA 1NK8A 4CIFA 4CE9A 4FPAA 3GE1A 4M3UA 3QERA 4EFHA 3KHYA 4LF6K 2D0PA 3NF8A 4Z4EA 2VQEK 1FW6A 3OYMA 3DXKB 3L3UA 2IVPA 4U67L 4OJRA 3FE1A 3CERA 4DTJA 3H3NO 1N6QA 4FVMA 2FSKA 4GV9A 1RT5A 4IJNA 3VF4A 2Q31A 5E84A 5K14A 5AQIA 1WBBA 4GKKK 4WYBA 4FLYA 2P9KA 1W9HA 5CZ2A 1VQ8N 4M7YA 4CJ4A 4BR4A 2WOMA 2A6AA 2D5RA 1EX4A 2QKBA 3MEDA 2QWRA 1ASUA 2KFZA 5AFUA 2O8DA 2A1SA 1HQUA 3QO9A 3RR8A 3O3HA 4XJXA 1WSIA 4H5NA 1RT4A 4DR3K 4N47A 2XHBA 4GV3A 4K0KK 1NJXA 3CJ9A 4KKOA 4CK2A 4DSJA 4JKAA 3D7EO 5JLHA 4TSXA 2GUIA 2DPNA 5KGXA 3PLAA 3MECA 4BE2A 2UXBK 5GIOA 1EQYA 4FWOA 2JGUA 5LJVA 3PIOL 1ATRA 4JI7K 4DG1A 3OYKA 1H1VA 1IG9A 3P39A 1KD1O 5AQOA 5C2FA 2VG5A 4E3SA 4CFAA 5BRDA 1QVGM 5AQSA 3MXIA 4FWLA 1ATSA 4IWVA 2Q36A 1N5YA 5BPLA 4RWTA 2I7NA 4KHQA 2HSTA 4LY7A 5DM7L 4K8XA 1U2VA 3NVKA 1RT1A 3QFPA 4QAGA 1BQMA 2XY6A 3LM9A 1NGAA 1OH5A 3MAQA 3OYIA 3PSIA 4Z94A 2HBMA 1VQKN 3C95A 3P31A 2DFEA 4AQYK 4E7HA 3CMAN 1RT6A 4JK7A 3R9PA 1TUUA 3ATUA 3BZKA 3HZ6A 4ISEA 4E1NA 4QCLA 4KI4A 4JLHA 3QETA 4IO8A 4CFDA 4PL8A 2YX6A 3K9KA 4JHDB 1CZAN 1JL1A 3NGZA 4JKGA 4OO1J 3CCQN 3S3MA 4BROA 3KLFA 1HNXK 2G8HA 4CFBA 5DMRA 4KH5A 4B1XB 3FZLA 4FLWA 1J54A 1SS6A 1MU2A 5LY3A 3S41A 3PY8A 4DR1K 3DLGA 2O8FB 4IOXA 3L6QA 4K42A 2O8CB 3DWLA 3DLEA 3I0RA 4CEOA 5JVHL 1QS4A 3OYFA 4HHTA 2E8AA 4BR0A 3M8RA 2ZGZA 3WXLA 3P38A 2D0CA 3RRGA 4A5BA 4ILJA 4DQIA 3TSQA 4DR2K 1NGEA 4O8KA 1YVNA 4B8CA 1NMNA 2W42A 3CMEN 2X6SA 4B3SK 1Q18A 4F3TA 3U9ZA 1QQNA 4C8LA 4RCHA 1TL1A 4DSEA 2A41A 2AJQA 3DJCA 4H5VA 1Q81O 4JD2A 5LL6Z 2P5GA 4M45A 4CF8A 1HYZA 4FM0A 4K25A 3RWUA 1DEJA 3UB5A 1ILYA 1QQOA 2AP1A 4B9VA 3OJUA 4CZIA 3VERA 3QBWA 2D1KA 4F9OA 3SUNA 2FF3B 1E3MA 4X62K 1GOCA 1V4SA 4E0DA 1GLCG 3VOVA 1IV0A 5AQYA 1SUQA 4JKCA 2JWKA 2YNFA 1DT9A 3THXA 3OVNA 4FWQA 3SQ2A 1FKOA 3GOIA 4IZ9A 4CFCA 2Y1IA 4Y0WA 3W0LA 4FZYA 3T69A 4KI6A 4W5NA 1U47A 4NXMK 3B6OA 1U49A 3L2UA 1VQ7N 3FZKA 4O0JA 4DTMA 5IT9O 3CM6A 4PKHA 4A62A 4IJAA 5GAEP 4E7LA 4HUEA 3VA0A 3DM2A 3NCIA 5JS2A 4PA1A 4O0IA 4MLHA 1NJZA 1WAJA 4CZEA 4AHTA 3LANA 3IFRA 1UA1A 4KREA 3SQ1A 4FJHA 3KIOA 4DV5K 3SMPA 2IVNA 4LH4A 2O8FA 4KV8A 3KZBA 5FPEA 4DB3A 2O8CA 3BZCA 5LJWA 4MFBA 2ZF5O 3QDKA 3CC7N 4GV6A 2Z1HA 4JS5A 4AM6A 5KI6A 2ZQBA 4LFAK 4BVOA 4HUFA 5F2RA 4BEBA 4H03B 4FZZA 1EP4A 1NK5A 1I3AA 3E9LA 3K9JA 3V9XA 1L3TA 3DRRA 3SBTA 3CCJN 3DMJA 4F8RA 3ZETB 1ASVA 3VETA 3SQ0A 4FW2A 2A3ZA 4CJVA 3WNFA 3WXJA 1X3MA 3NMUA 3DI6A 2Y1JA 2HBKA 4UQGA 3GBTA 3T1HK 3AVJA 4Q0BA 2YKNA 3ZT0A 2P9NB 3Q7BA 4KBOA 1Q9XA 1KLNA 3ULEB 3VGMA 4YOVA 4JRQA 2D0OA 4H0OA 5C25A 1NGJA 4M63C 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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