1EQYA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin domain 1
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
359
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords GELSOLIN
publication title Structure of gelsolin segment 1-actin complex and the mechanism of filament severing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 359
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1eqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1eqyA04
3F9MA 4H03B 3SMSA 4FPBA 4PKGA 5E26A 2GTDA 4H0PA 5KQDA 4FOIA 4CBWA 4JN4A 2P9KA 4BVOA 4RTFD 3CQYA 2A3ZA 1ESVA 3ZX3A 2QM1A 2ZF5O 2V52B 1E4GT 3EO3A 5LY3A 2A40A 3A0IX 3O4WA 1DKGD 2A5XA 1OKJA 4NO7A 2FF3B 4K42A 4B9QA 4FWQA 1MWMA 1EQYA 1QQMA 4FPAA 5AQXA 4QS9A 1NGJA 2YCHA 3DXKA 4YDUA 2QWNA 3MDQA 1BWFO 4B1XB 3QBXA 2QW9A 3VEXA 3WT0A 2P9KB 1HKCA 4FSVA 5KPTA 3VF2A 3QICA 4J8FA 4IXCA 3FGUA 2E2PA 5BN8A 1C0GA 2D4WA 3CJ7A 2E1YA 4BRKA 1QZ6A 3CJAA 4IO8A 4Z94A 4XH4A 4BRIA 2IVOA 2YHYA 4K41A 5EOYA 3DXMA 2P9NB 3CHWA 1MDUB 4PKIA 2ITMA 1BDGA 1P8ZA 4YDUC 3HI0A 1TYQB 1T6DA 5I9EB 3CJCA 3ZEUA 3H6EA 3O5BA 3D2EB 3VENA 4CJ7A 3HTVA 3H1QA 5AQZA 1KAZA 2NLXA 2YHWA 4CZIA 4PL8A 4B1WB 5BPMA 5AQVA 4BRCA 3KZBA 4EHUA 4QS8A 1NLVA 5ADXH 3L0QA 3FZMA 2VYPA 3MK6A 5EXWA 3U8XA 1NBWA 4JHDB 1NGGA 4BGAA 1NGAA 4EHTA 3DWLA 4DQ8A 2NZTA 2QWQA 4BR0A 4CZMA 4M63C 4F9OA 5AFUA 3D7EO 5AQKA 3GOIA 3C7NB 1CZAN 3BF1A 4HWIA 2AA4A 3EL2A 4JD2A 1NGIA 4B1YB 1BUPA 4CBUA 3MN6A 2HF4A 3RSEB 3P4IA 5AQIA 4MO5A 5AQHA 3HBTA 5B8HA 2A42A 4H5WA 4IJNA 5ELZA 4FWKA 3VGKA 1TUYA 3BEXA 2V7YA 2YHXA 4BG9A 4MO4A 4BRDA 2KHOA 2ASMA 4ISEA 3UE5A 5JLHA 2V51B 3SLCA 1U2VA 3ZETA 2Q0UA 3ZX2A 5AQLA 3VEOA 3U9ZA 5BN9A 3WEEB 4CD1A 1RFQA 2YI1A 3QFUA 2Q97A 4BR7A 4GNIA 3AAPA 4BR2A 1GLDG 2GELA 4BG8A 4FWSA 4K43A 3CJBA 3GBTA 5AZJA 1Z05A 3VOVA 3H46O 3IUCA 3CI5A 3UB5A 3QB0A 1Z6RA 2OANA 1MA9B 5AQGA 2PBDA 2HMPA 3UKUB 1GLAG 1NGCA 3TPQA 1K8KB 4Y0WA 1WUAA 2H3GX 3ULEB 2P9PB 3MCPA 4BRGA 2I7NA 3MMVA 1V4TA 1RGIA 2FSKA 1QZ5A 2F9WA 4BRLA 5BRHA 1G99A 3LDOA 1S22A 3O08A 3FZKA 4H0VB 2CH5A 2QWLA 3H3NO 1J6ZA 2Q36A 4CD3A 3FFKB 4BR5A 3UKRA 5KPRA 3L6QA 4LC9B 2YJEA 2A6AA 3O80A 3BP8A 5EY4A 3GL1A 2YJFA 1NM1A 2P9UA 1HJOA 3MN7A 5AQFA 3VEWA 1KXPA 4BGBA 3FZFA 3WQTA 2NRHA 5BPNA 2WUSA 5JMVA 4FO0A 2ZGYA 1ATNA 3CIPA 1GLEG 2Q1NA 3CERA 3IFRA 5AR0A 3EN9A 3VEZA 3W3DA 4CBXA 2UYTA 4M7XA 4M7YA 3D2FA 1DGKN 2FLOA 5FPMA 3ATUA 4DHYA 1BU6O 4I6MA 4PKHA 3WXIA 1Y64A 4DCHA 4RWTA 1T44A 3DXKB 3ID8A 3M6GA 5TKYA 3FZLA 4AM6A 2P9IA 3U4LA 4IJAA 4WYBA 3M1FA 1GLJO 2QWRA 4CZJA 1GLLO 1QHAA 2CGKA 1IJJA 2D0PA 3B8AX 1NMDA 4QS7A 5AQRA 4GY2B 3AAQA 3DXMB 2ZGZA 4CZKA 3LDNA 1ZC6A 4FWOA 3ZEUB 3FZHA 5KQ8A 2E2OA 1YVNA 3W0LA 2BUPA 4FWMA 2ASOA 4XH5A 2QWPA 4FL9A 5AZIA 5EX5A 4FOEA 4BRFA 1X3MA 1C0FA 3ENOA 3FR0A 4BC4A 4E1JA 2GEMA 4BREA 1NGDA 3KHYA 3IDHA 2P9LA 4BRNA 5F2RA 3LM2A 4JNEA 3J8AA 3TU5A 1NGHA 4B1ZA 2HF3A 3WXJA 3OHRA 2VWBA 1Q18A 1KAYA 1QQNA 3H45C 4KBOA 3LDLA 5AFUH 1YAGA 3AY9A 4BQZA 4O8KA 4JD2B 5AQYA 3FE1A 3CETA 2J4RA 4A62A 4CZLA 4A61A 5CE3A 1JCEA 2P9SA 1NGEA 1X9JA 2EWSA 1BA0A 4AM7A 3LM9A 4H0XB 5F1XA 4BRAA 2W41A 4BC5A 4H5TA 1JCFA 3C0BA 3EZWA 5BREA 4H0OA 4NB4A 4A2BA 4BC3A 4BROA 2IVPA 4K25A 5BPLA 1U2VB 1HLUA 3ZETB 2QWOA 3IMXA 4WQ4A 1GLFO 4BR9A 3U9DA 3QFPA 4H5VA 4L3QA 4FWRA 1TUUA 3CJ9A 3GDQA 2A41A 3O1BA 4PL7A 2GWKA 3DAWA 3GE1A 5AQOA 4BRPA 1HUXA 2FSJA 5AZJB 2BTFA 4WQ5A 5FPDA 3VETA 4C23A 2E20A 1LOTB 1YUWA 4WQ4C 3VGLA 1S3XA 4EFHA 1GLBG 2IIRA 3ENHA 2Q31A 2W40A 3L4IA 4A2AA 3A5LC 3QMLA 3G25A 4IWVA 1XC3A 3WXKA 2FF6A 4BQLA 5F0XA 2E2QA 5AQMA 3FLCO 2AP1A 3KVGA 2CGJA 2E88A 3R9PA 4WQ5C 1ATRA 3QBWA 1NWKA 2ASPA 1IG8A 1BG3A 4FWLA 3LDQA 4H5RA 2D1KA 3A8YA 2P9NA 2DPNA 3VESA 1BO5O 1KAXA 3CQXA 4O5FA 4XEIA 5BRFA 1TYQA 5JICA 3A5MC 3UKRB 4BRHA 3ATVA 3A5OC 4JAXA 3A5NC 3D2EA 4CZGA 1XUPO 2HOEA 2PAVA 1BOTO 5AQWA 3LDPA 4FWNA 1WOQA 4EIAA 3VERA 2P9UB 5LJWA 1H1VA 1ATSA 3AARA 3O6WA 5ADXA 1YXQA 5FPNA 1RDWX 4DB3A 2CGLA 3GG4A 4ISGA 4JHDA 2I7PA 1SZ2A 3ZX0A 4H0TB 3EKUA 4H5NA 2Q0RA 4RCHA 3O1WA 4MLEA 5EVZA 3O8MA 3VF4A 3C7NA 3D2FB 3R8EA 1MWKA 1HKGA 2QWMA 2FXUA 3MN5A 3VGMA 4I6MB 3WQUA 2E2NA 2E8AA 1JCGA 1E4FT 3WXLA 3RSEA 3M3ZA 4MLHA 5AQTA 2P9IB 4CZFA 4CZEA 4CI6A 3JS6A 4CZHA 4XH1A 3QDKA 1T6CA 3EKSA 3HM8A 1X3NA 3SMPA 2ZWHA 1NGBA 1GLCG 4ISFA 3HZ6A 4HTLA 1HKBA 3BUZB 5JLFA 4BR4A 3JXUA 1U6ZA 3HSCA 3WEEA 3S41A 1ZBSA 2E1ZA 5AQNA 1SQKA 1HX1A 2FSNA 2CH6A 5AQUA 3DJCA 4BRQA 3LL3A 4H0YB 5AZIB 1D4XA 3I33A 1LCUA 2V7ZA 5AQSA 1HPMA 2F9TA 5KPZA 1XQSC 3VEVA 5FPEA 5LJVA 3WUHA 2Q2RA 2P9LB 1BA1A 3I8BA 4B1UB 2IVNA 3UKUA 3R6MA 4BRMA 2GWJA 1K8KA 3CJ1A 2D0OA 5AQPA 3SK3A 3ULEA 4BVPA 1NGFA 1R59O 2P9PA 5E84A 4IZ9A 4EAHD 1DEJA 4FWPA 1SAZA 4B1VA 1QQOA 1ZXOA 2GUPA 5BRDA 2VCPA 2QXLA 1V4SA 3H1VX 3SJHA 2P9SB 5AQJA 3MN9A 3H3OB 3BF3A 3VF6A 3VEYA 3VPZA 4BC2A 5BR9A 5AQQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F9MA 3SMSA 4FPBA 4LH5A 5E26A 2GTDA 1VQMN 3SQ0A 3O9QA 3NFAA 4RTFD 3CCQN 2QM1A 1HNXK 4NCAA 2HBJA 4GV3A 3K9KA 3CCVN 3O4WA 4DV4K 1RT6A 1Q9YA 2A5XA 3OA9A 2FF3B 3J7YP 1C1CA 4KHUA 2BDPA 4B9QA 3KWGA 3RTVA 1EQYA 4RG8A 4FPAA 1Q8IA 3AA2A 3KK3A 1S6PA 1JLEA 1WAJA 4AHCA 3CPEA 3V1RA 3HXMA 3WT0A 4CEOA 4DU3A 3NF6A 3K0SA 4JKGB 4NXNK 1Q86O 4J8FA 2E2PA 2E6MA 3P5JA 2D4WA 5CZ1A 1NK8A 2E1YA 2W42A 4E7LA 4Z94A 4XH4A 2O8DA 4FLYA 1SV5A 3CM6A 1MDUB 1FKOA 1Q7YO 1P8ZA 4YDUC 3TAFA 5I9EB 4CIGA 3S3MA 1EX4A 3O5BA 3D2EB 4CJ7A 3DOKA 2YHWA 4PL8A 3V6DA 1OH6A 3K9JA 4OGEA 1CXQA 4M3WA 5ADXH 1NLVA 1EP4A 3L0QA 3MK6A 3U8XA 2VYPA 5JVHL 4A59A 4JKHA 1TKXA 1NJWA 3AVLA 4Q0BA 2HHXA 4BR0A 4CZMA 5AFUA 3MWTA 2OZMA 1I39A 5JVGL 1OH8A 4HWIA 3PIOL 4JD2A 4B1YB 2KFNA 4CGDA 4EZ9A 3F73A 3AVCA 3QEPA 3MN6A 2HF4A 5AQIA 3SV4A 3PIPL 1ILYA 3HBTA 3TAMA 2Z1IA 4X66K 2P51A 5B8HA 2A42A 4H5WA 4FWKA 4E72A 2V7YA 2YHXA 2WTUA 3RMAA 2ASMA 4JI5K 5JLHA 3T1YK 4YHHK 1U2VA 3ZETA 3OYIA 4DUYK 1RBSA 4I2PA 2PZSA 4NCGA 1RFQA 4YOTA 3OY9A 2Q97A 3CMAN 4JYAK 3AAPA 2GELA 4GVMA 3CJBA 3GBTA 4KHWA 1Z05A 4JI7K 2WONA 2HNDA 3QB0A 1Z6RA 1X9MA 4GMJB 1X1PA 4CF8A 1NOZA 3UKUB 1NGCA 3NF8A 1HPZA 2IAJA 2PYLA 3OS0A 1KTQA 3VQBA 4OGCA 1L3UA 2IS3A 2RN2A 4BRLA 3L2VA 3VQ5A 2VG6A 1S22A 3EY1A 4OKJA 1WSHA 4B3TK 2QWLA 3H3NO 1J6ZA 4Z4CA 3B6PA 1K6YA 2YJEA 3BP8A 4LFBK 3E9OA 5EY4A 3GL1A 4ILHA 3MN7A 4CEQA 3VEWA 3FZFA 4B9TA 3SPZA 2WUSA 4WFAL 4H4MA 3DMJA 5JMVA 2YV0X 1GLEG 2Q1NA 1BHLA 3VEZA 3W3DA 1DGKN 4RW7A 4FJLA 4DHYA 1BU6O 4G9ZA 1HQEA 4GV6A 1KFSA 4DCHA 2QKKA 1T44A 3DXKB 4X62K 4FJKA 4AM6A 4WFNL 4OVLA 4HTUA 1GLJO 1WAFA 1EWRA 3QEVA 4CESA 1A5WA 5M1PA 1NMDA 3C94A 3OYJA 1KFDA 4DFMA 2P1JA 1IG9A 4KH6A 2DTUA 3ZSQA 3DXMB 1VSKA 3P1GA 4DQRA 2F96A 2ZGZA 3LDNA 3HSTB 4CJ5A 1WN7A 3FZHA 4FM1A 1YVNA 4CJWA 1LW0A 3HYFA 3RRHA 4C1NI 1RBUA 2QKBA 1X3MA 1C0FA 3QERA 2GEMA 3E66A 1NGDA 2PYJA 1C0UA 3AO2A 4BRNA 1NU0A 3HO1A 4KI4A 1L3SA 1Z26A 4CJFA 4YOUA 1VSMA 1KAYA 3LDLA 1QHTA 3JAMO 3M8PA 2ZQBA 4EP5A 3HL8A 3ZT0A 4KTWA 1IH7A 3CETA 3Q7CA 5BR8K 2P9SA 4Z0UA 1NGEA 1X9JA 3O9RA 2FBYA 1RBVA 2EWSA 4J2DA 5F1XA 4J2BA 4DR7K 4CF9A 5BREA 2A1SA 2O8EB 2IVPA 1NKCA 3I0SA 3IMXA 4JI2K 3HT3A 4WQ4A 3CXCM 4BR9A 2E6LA 4L3QA 1X9WA 4OLBA 3DRRA 3CJ9A 4X64K 4RW6A 2UUAK 2A41A 3CC2N 4CEBA 2FSJA 1WSGA 4CFBA 3KKRA 3VETA 1LOTB 1QSSA 1YUWA 4OX9K 3VGLA 2XY7A 1GLBG 4WE1A 1VQ8N 4KKOA 5GADP 4JKGA 4BQLA 4BACA 4NLBA 3KLGA 4HCCA 4E7KA 1LWFA 4OO1J 2CGJA 3R9PA 3PV8A 1L5UA 2I5JA 1ATRA 3QBWA 3I8DA 1RT7A 2ASPA 1BG3A 3WNGA 2HHSA 4I9LA 1LV5A 3AVGA 3FFIA 1KQSM 4XEIA 2QK9A 5JICA 3NCIA 4CW7B 4BRHA 1WNSA 2HHWA 3D2EA 3TSPA 2HOEA 3KKSA 5TKWA 1YTAA 4EIAA 1VQKN 3OS1A 2D0BA 3O6WA 1HYSA 2E4LA 1RTJA 4DB3A 3G71N 1SKSA 4DG1A 2I7PA 2A1RA 3IS9A 4PHTX 2YHAA 1OH7A 4H5NA 2HW3A 4JS4A 1JJ2M 1IBKK 3L8BA 4RCHA 5EVZA 3VF4A 3OYBA 4M45A 3R8EA 4CJTA 4FLXA 3HPHA 2FXUA 3OBYA 4YOVA 2E2NA 1EKEA 4FLZA 3WXLA 1XMQK 4K8XA 1ZBLA 2P9IB 4IEIA 4DS5A 2RKIA 4BE0A 4ELVA 2G8VA 2KFZA 3ZSRA 4FZYA 4YY3K 2EX3A 4JV5K 4DFKA 1T6CA 3EKSA 3HM8A 4HUFA 3HJFA 4LSLA 3BZCA 3HZ6A 4HTLA 4O44A 4DR1K 4JKEA 3CYGA 4BR4A 1U6ZA 1ASVA 5HRRA 1VSJA 1QVFM 1HX1A 3SQ2A 4CEZA 5AQUA 4DUZK 1C6VA 4E7JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3HP9 A;  1RBT A;  4CJQ A;  4M3Z A;  5FRO A;  2CGL A;  4KH4 A;  4OPK A;  4ID1 A;  4B8C A;  3HM9 A;  3ZX0 A;  1TL1 A;  3EKU A;  3P38 A;  2Q0R A;  3HVT A;  3O8M A;  2NRW A;  3IAY A;  5CY4 A;  1VRT A;  1MWK A;  2HBL A;  1HKG A;  3J7Z O;  2OA8 A;  2Y1J A;  1WBB A;  3NGZ A;  3WQU A;  3RSE A;  3M3Z A;  3L3V A;  4FJI A;  4CZH A;  4CK1 A;  3AA4 A;  3MXI A;  2GBZ A;  3QDK A;  4O5B A;  4XJX A;  1NGB A;  3LWM A;  5JLF A;  3DRS A;  5J1E A;  1VQ9 N;  3JXU A;  4JKC A;  1ZBS A;  1JLC A;  2P5G A;  4BRQ A;  3LL3 A;  3TWH A;  4H0Y B;  4LF8 K;  2V7Z A;  5AQS A;  1YI2 N;  1HPM A;  2X6N A;  1XQS C;  1YJ9 N;  3E9L A;  1RT5 A;  3WUH A;  2Q2R A;  4Y1C A;  2HBK A;  3VA3 A;  1SL1 A;  4KRE A;  2GWJ A;  4R5P A;  4FZZ A;  4LSN A;  4C8L A;  3CJ1 A;  3ULE A;  4H4O A;  1EXQ A;  5C2D A;  4IZ9 A;  1DEJ A;  2GUI A;  4LF6 K;  2GUP A;  5HRO A;  2VCP A;  5JEN A;  1LAW A;  4KHP K;  2Q3S A;  2P9S B;  2QTD A;  3VQQ A;  4YOR A;  4M41 A;  3MN9 A;  1TL3 A;  3BF3 A;  3M8R A;  1K9M O;  3VEY A;  4ZHR A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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