1GLJO

Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
498
structure length
494
Chain Sequence
EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSWTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphotransferase
molecule keywords GLYCEROL KINASE
publication title Crystal structures of Escherichia coli glycerol kinase variant S58-->W in complex with nonhydrolyzable ATP analogues reveal a putative active conformation of the enzyme as a result of domain motion.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 165
structure length 494
sequence length 498
chains with identical sequence Y
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gljO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1gljO01
3R6MA 1E4FT 2KHOA 2ZWHA 2GELA 4O8KA 1SAZA 4WQ4C 5EOYA 5AZJA 3B8AX 4H5TA 3FGUA 3WUHA 2GEMA 4FWRA 4ISEA 4BR2A 2F9WA 4FPBA 2IVNA 1C0FA 1LCUA 3VGKA 2P9PB 4H0XB 3CJBA 3UB5A 2FF3B 3VETA 3H46O 1JCEA 2QWPA 4K25A 4EAHD 4F9OA 4B1VA 2BUPA 3LL3A 5TKYA 5FPNA 4BR7A 4ISGA 3H3NO 3WQTA 5AFUA 4A62A 2P9LB 1Z6RA 4RTFD 4BRPA 4DB3A 4Z94A 3MCPA 4FPAA 4NB4A 3WT0A 1V4SA 3JS6A 2D0PA 3OHRA 1HLUA 4XEIA 2CGJA 3LM2A 4BC2A 4BQLA 3GL1A 5BRHA 5FPDA 1HKCA 1NGBA 1KAZA 3FLCO 2CH6A 3H45C 4B1UB 3BP8A 3UKUB 4CJ7A 5KQ8A 1D4XA 4BR9A 1BG3A 3WXLA 1T44A 2ZGYA 4JD2B 3CERA 3GE1A 4MO5A 4JHDB 4H0OA 3ENHA 3SMPA 5F0XA 2D1KA 4K42A 3GBTA 2VCPA 3CETA 5EX5A 1GLAG 3M3ZA 1ZBSA 3D2EB 4WQ5C 4FOEA 3VEXA 3FFKB 3VEYA 3UKRA 2CGLA 1YUWA 3ZEUB 4AM7A 5JLFA 5LJVA 2Q97A 4H03B 2GWKA 5CE3A 1S3XA 4H0PA 3L4IA 2P9KB 1MDUB 5KPTA 1QQMA 4E1JA 3GDQA 3CJ7A 4WQ4A 2P9IA 2FLOA 2Q0RA 4BRDA 2QWQA 2IIRA 1GLFO 2E20A 4BROA 1T6DA 5ADXA 2QWLA 3D7EO 4JAXA 5LY3A 3D2FA 1V4TA 2P9NB 2H3GX 2Q36A 4BRFA 3CJAA 5F1XA 2UYTA 4BRQA 3ENOA 4PKIA 4FWSA 3SK3A 5AQOA 2YHYA 3VENA 3WQUA 1BU6O 3CJ9A 2Q0UA 3QFUA 4C23A 4BRAA 2V7ZA 4K43A 2YCHA 4CZGA 3HSCA 3VEWA 4CZEA 5BPLA 5JICA 2ASOA 2Q2RA 4BRHA 2QW9A 3VOVA 3L0QA 4CBXA 4DQ8A 4BR5A 4FWNA 1KAXA 4MLHA 4JNEA 3KVGA 1RGIA 2W41A 2W40A 3HI0A 1GLBG 1NM1A 2V7YA 4ISFA 4O5FA 2IVOA 4FWKA 3WXJA 4QS9A 2FF6A 2PBDA 3WEEB 2FSKA 3CQXA 2GWJA 2P9PA 2A40A 4XH4A 1HKGA 4WQ5A 3VGLA 4AM6A 4RCHA 2P9LA 1P8ZA 2YI1A 1NGAA 1Y64A 4BC3A 2V51B 1C0GA 5FPMA 5BR9A 2E8AA 5BPMA 2QWOA 2QWRA 1QZ5A 1U2VB 1ATRA 1NLVA 3M6GA 2E1ZA 3DAWA 2F9TA 3CJCA 3MN6A 4IO8A 3UKUA 2HOEA 4FWQA 4H0VB 4H0TB 1IJJA 3C7NB 3FR0A 5BREA 4CZLA 2HMPA 4JD2A 1NGIA 3H1VX 5AQXA 4JHDA 2FXUA 3A8YA 4FSVA 4H0YB 3WXKA 1MA9B 4FWPA 1RFQA 2D4WA 4FO0A 3ZX3A 4BRLA 3LDOA 3D2EA 1BOTO 5AQVA 3AAQA 3ZEUA 1TUYA 3DWLA 1QQNA 3SLCA 3H1QA 4B1XB 5E26A 1T6CA 3O5BA 2E1YA 2ITMA 4BVPA 3RSEB 1BA1A 1K8KB 2P9KA 4B9QA 4BGBA 4EIAA 2AP1A 1WUAA 1ZC6A 4YDUC 4BRGA 2VWBA 1WOQA 3EL2A 3C0BA 5AQZA 4M7XA 1XUPO 5BN9A 3VF4A 3QMLA 4IJNA 3S41A 1GLEG 3IMXA 4Y0WA 3QDKA 4JN4A 1RDWX 4H5NA 4QS7A 1QZ6A 1OKJA 4FWMA 3LDNA 3EO3A 2P9NA 1Q18A 3KHYA 4BRNA 4H5WA 4I6MA 4CZHA 4EHUA 3CIPA 1J6ZA 5AQRA 1Z05A 5LJWA 2QXLA 3H6EA 5AQQA 2FSNA 3O1BA 3L6QA 2BTFA 4FL9A 1KXPA 1DGKN 4BC4A 3AAPA 3DXKB 1DKGD 3MN7A 3I33A 3TPQA 3O80A 4M63C 4FWLA 3FZKA 2E2NA 3IFRA 1TYQB 1ATSA 1BO5O 5AQUA 1SZ2A 3A0IX 2Q1NA 1X3NA 4BREA 5BPNA 2A6AA 1XQSC 1YXQA 1NGJA 1QQOA 3VESA 3VEVA 3QFPA 4B1ZA 1BDGA 3U9ZA 3VPZA 1IG8A 2P9SB 1X9JA 3FZFA 5KPRA 2QWNA 5I9EB 2P9UB 3WEEA 1MWKA 3U4LA 4A2AA 3MN9A 3QB0A 5AQLA 3BF3A 3FZHA 3VEOA 4BRKA 3QBXA 2V52B 5AZIB 1SQKA 2FSJA 1X3MA 3W3DA 2YJFA 3FZLA 3EZWA 5AQJA 3R9PA 4BQZA 5AQNA 1TUUA 5EXWA 5AQMA 3MN5A 5AQFA 1U2VA 2EWSA 5B8HA 3ZETB 4YDUA 1MWMA 4LC9B 4H5VA 3HM8A 5AQYA 2PAVA 4L3QA 2A41A 3LM9A 2I7NA 4XH5A 3EKUA 4BVOA 4WYBA 1QHAA 3ATVA 3C7NA 3EN9A 1NWKA 1JCGA 3GOIA 3JXUA 4QS8A 3VEZA 4EFHA 1R59O 3DXMB 5AFUH 3CHWA 4BR4A 4XH1A 3VERA 5AR0A 2A5XA 2WUSA 4HTLA 2E2OA 4J8FA 3AARA 3O1WA 4BR0A 2OANA 4GNIA 4DCHA 4RWTA 5JMVA 3BUZB 3AY9A 5AQKA 3ZX0A 4A2BA 3MMVA 4BRIA 4CZMA 4NO7A 2I7PA 3BEXA 4BG8A 5KPZA 3ULEB 3TU5A 3VGMA 1ZXOA 2AA4A 4B1WB 1S22A 3RSEA 1K8KA 3UE5A 1GLDG 3HTVA 5AQWA 5KQDA 4CD1A 5AZJB 1ATNA 3QICA 3SMSA 4A61A 3HZ6A 3ID8A 3LDQA 4PKHA 3O6WA 5E84A 5AQTA 5BN8A 4CD3A 4KBOA 4HWIA 4CZFA 1HJOA 2J4RA 3HBTA 4CZIA 3O8MA 4PL7A 4IWVA 4BGAA 1EQYA 5JLHA 1U6ZA 1BWFO 1NGCA 3J8AA 3WXIA 4CZKA 2NZTA 3F9MA 1DEJA 4FOIA 4IJAA 3LDLA 5AQSA 3DXKA 3U8XA 2HF4A 4IZ9A 4CI6A 1BUPA 1GLJO 3O4WA 2CH5A 3SJHA 1NGHA 2VYPA 3A5NC 2DPNA 3ATUA 1TYQA 1LOTB 4BC5A 1KAYA 4BRMA 1NGEA 3GG4A 3I8BA 2QWMA 5ADXH 4CZJA 2E2PA 3ZX2A 3M1FA 3DJCA 1CZAN 2D0OA 3MDQA 5F2RA 4CBUA 5AQPA 2YJEA 4IXCA 1NBWA 1NGFA 3VF2A 2P9SA 3IDHA 4MLEA 4BG9A 2Q31A 3EKSA 3FZMA 1JCFA 3BF1A 3QBWA 4MO4A 2GUPA 2P9UA 5AQHA 2NRHA 3A5MC 5FPEA 1E4GT 2HF3A 2NLXA 2ASMA 5AQIA 3VF6A 1H1VA 3UKRB 5AQGA 3LDPA 3P4IA 5AZIA 1G99A 1HPMA 3O08A 2E88A 5BRDA 3FE1A 1YAGA 2E2QA 5BRFA 3CI5A 4BRCA 4I6MB 1GLLO 1XC3A 3CQYA 3ZETA 3A5LC 3A5OC 3CJ1A 3MK6A 2P9IB 2CGKA 1NMDA 2ZF5O 3IUCA 1GLCG 5EVZA 4CBWA 1NGDA 3W0LA 1HUXA 2ASPA 5EY4A 2A42A 3D2FB 5ELZA 1HX1A 3DXMA 3H3OB 1HKBA 3KZBA 1YVNA 4M7YA 1BA0A 3R8EA 2YHXA 1NGGA 2QM1A 4GY2B 4H5RA 3U9DA 4PL8A 4DHYA 2A3ZA 4EHTA 2IVPA 2YHWA 2GTDA 2ZGZA 1ESVA 4B1YB 4PKGA 3G25A 4K41A 3ULEA 4FWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OA8A 5HRPA 2KHOA 2HBKA 2GV9A 3VQCA 1RILA 3V4IA 4OKJA 3B8AX 3ZSWA 3LDSA 3K5OA 3EZ5A 1BCMA 3L8BA 3WUHA 3OS0A 1TV6A 3VQ4A 4RW6A 5CZ2A 1NKEA 2IVNA 2Z1JA 4Q5VA 1SKWA 2FF3B 1C1CA 4F9OA 4LY7A 2BUPA 3VQ7A 3WQTA 4A62A 3CM5A 4RTFD 3MCPA 3WNFA 3G0ZA 2E6MA 3OBYA 1LAWA 2RN2A 2O4IA 1NKCA 1QS4A 2O8BA 4BDZA 4E3SA 4H4OA 1NU0A 2I5JA 5GAHP 3CPWM 1NGBA 2RPIA 1NK4A 2F96A 2ITGA 1ZBIA 1D4XA 5DK5A 3LP2A 1T44A 4JHDB 4AH9A 4OPJA 3C6UA 3OBWA 4B3OA 2W6LA 2VCPA 3CETA 3THWA 3BDPA 3M3ZA 3VEXA 2X6SA 1RT1A 1YUWA 2F8SA 4CJEA 4OPHA 3VTHA 2UUAK 4DQRA 1M1KO 1XMQK 2GWKA 5J1EA 3SQ2A 1S3XA 3L4IA 1KVBA 5HRRA 3C6TA 3M8SA 3RMBA 1MDUB 2VGMA 1YJ9N 2QEXN 1JLBA 1QQMA 3CJ7A 3O4NA 3NGIA 4DF4A 1DTQA 3NBPA 2FLOA 3LPTA 4BRDA 2QWQA 4NCGA 4B8AB 2IIRA 3J80O 4A5BA 4W5TA 4F4KA 4IOXA 4JAXA 5GIPA 5MLCQ 3D2FA 2Y1JA 1V4TA 2DY4A 1S6PA 2QXFA 3O4QA 3P5JA 1VRUA 4FWSA 3SK3A 4LSNA 5AQOA 5GINA 3CJ9A 1GOCA 4FZZA 2X74A 3VMFB 3J7YP 4K43A 5DM6L 1RT5A 3VEWA 5J2PA 4Z4HA 2QW9A 4JI7K 1JXBA 2BGGA 2VG6A 2NRVA 4PUOA 3V9SA 2KFNA 4NYNA 2VQEK 2W41A 2W40A 4ISFA 1TKTA 4FCYA 1JLEA 3J81O 1BIUA 3OVNA 3VQPA 3WXJA 4FWKA 4DSJA 2PBDA 4CHOA 1S1VA 2GWJA 2P9PA 1HPZA 3NCIA 3MAQA 4J2DA 3VGLA 1HKGA 3CCSN 4KHNA 1C0MA 3HL8A 5M1OA 5CY4A 4E1MA 3T1YK 3DOLA 1Y64A 2V51B 3BZCA 2E8AA 5BPMA 4FJMA 1QZ5A 1U2VB 1KVAA 1NLVA 3M6GA 3DAWA 4CGGA 3SAHA 3OS1A 2P51A 3OYMA 4H0TB 2BH1A 3C7NB 4YOWA 4KAZA 3MWPA 1UA0A 5AQXA 2FXUA 1CZ9A 3AVGA 4V19S 2P1JA 1U45A 1RFQA 2D4WA 1NKBA 3LDOA 3CXCM 1BOTO 5AQVA 3KK3A 3T3FA 3QNOA 1TUYA 3THXB 3P1GA 1Q7YO 2E1YA 3M5RA 4OLAA 4BVPA 4O0IA 1BA1A 4JI6K 4B9QA 2HHHK 2HNYA 4BGBA 4YDUC 2VWBA 3CCEN 1WOQA 4IG0A 3EL2A 1XUPO 1ASVA 4FLWA 3S41A 4DR3K 3NF6A 1NK7A 4FWMA 1SKRA 1EX4A 2P9NA 4DR5K 5JS2A 4I6MA 2WTUA 5AQRA 4CGFA 2FSNA 2F8TA 4BE1A 4NYFA 4CF2A 1RT7A 1DGKN 1TKXA 3TPQA 2QK9A 1RTIA 3DYAA 3FZKA 1YJWN 3AVIA 4DR7K 3O9TA 3NF8A 3TR8A 3OTOK 4YOVA 3T19A 1NGJA 1QQOA 4MFBA 3DLGA 2PY5A 1UA1A 3OYIA 5DMRA 1QVGM 3M8QA 1L3SA 2IOCA 1IG8A 3ISNC 4LF6K 1W7AA 3FZFA 3HPHA 1U47A 3SNNA 4OKEA 2P9UB 4A2AA 3VQAA 4FZXC 2YNHA 2ATQA 1VSJA 3FZHA 3NFAA 3VEOA 3QBXA 1LW0A 1Q82O 4KI4A 4B9SA 4AHUA 5C15A 1SQKA 1D9DA 1BI4A 1X3MA 1Q81O 2YJFA 5GAEP 4A5AA 3EZWA 4HUFA 1KD1O 2Z1GA 4M3UA 2VG5A 5AQJA 3R9PA 4DTRA 3OYLA 2YNIA 4LF5K 1ASWA 4LH5A 3L2VA 1MWMA 4L3QA 3DRPA 3KKRA 3ATVA 3GOIA 3QINA 3EN9A 3VEZA 2LSNA 3HK2A 4DTOA 4DKWA 4BR4A 4XH1A 1G15A 3VERA 4FK0A 2RKIA 2HSTA 2Z1HA 4DU1A 1VK0A 3BUZB 3ZX0A 3MMVA 4BRIA 3WXMB 3ULEB 3TU5A 3VGMA 2O8EA 1S22A 3RSEA 1K8KA 5KQDA 4EZ9A 5HLFA 1KCFA 2F4VK 4CD1A 4WFAL 4DTUA 1Q9XA 1ATNA 3QICA 1NK5A 4JI4K 4A61A 4FJJA 2B6AA 3HZ6A 3ID8A 3LDQA 3VQ9A 4DQPA 4J2BA 5EU7A 3EEQA 3DLEA 4CIFA 1IO2A 2NRZA 3E9PA 2W42A 4HCCA 4CJVA 3C94A 2O8CB 5JLHA 1SUQA 1VSIA 3U3GA 4CZKA 4CJWA 2QI2A 4IJAA 3LDLA 5AQSA 3O9SA 2P5OA 4M3TA 2HF4A 3K5NA 4IZ9A 4CI6A 1BUPA 1GLJO 1F21A 1HNXK 2VYPA 2XY5A 3ATUA 1TYQA 3V9XA 4WFNL 4BE0A 3KTQA 4DR4K 1OH6A 3ZT4A 3ASMA 3M1FA 3DJCA 2D0OA 4CBUA 1KRPA 5AQPA 1T03A 4I2QA 4IOAL 2P9SA 4DTMA 4LFAK 3O9RA 2NNWA 4MO4A 4OPKA 2FBVA 1JJ2M 2NRHA 4CJ5A 2XY8A 2HF3A 2ASMA 3VF6A 1QSLA 2P5GA 3UKRB 2W6KA 5AQGA 1U49A 1YIJN 5JS1A 3CCMN 3DLKA 1N36K 1O13A 2OZMA 3DRSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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