2P9NA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
415
structure length
397
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 123
structure length 397
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9nA03
1JCEA 1LCUA 2AP1A 3I33A 3W0LA 4CZEA 4A2AA 3U9DA 3DXMB 3ENOA 1TYQB 2VYPA 4IJAA 5EX5A 3O1BA 3ULEA 2QWLA 2P9PA 1NGHA 3KVGA 2GWJA 1NGEA 1NGDA 1Z05A 4H0VB 4A2BA 1KAYA 5AZJB 1NLVA 5AQXA 4BRKA 4EHUA 2P9UA 5AQNA 1C0FA 1BDGA 3JS6A 1ZBSA 1BU6O 4B1YB 2FLOA 4BRIA 3GG4A 1ZC6A 4CD3A 3AY9A 4EAHD 4BC3A 3FZLA 2YI1A 3A5LC 1NMDA 4BRAA 1BA1A 2E88A 4FOIA 1XQSC 1P8ZA 5ADXH 4BRDA 2CH6A 4M7YA 5FPEA 1U2VA 2HOEA 2IIRA 4PKHA 1NGGA 4BGBA 4WQ4A 4GY2B 1HKGA 3VF6A 4BC2A 1C0GA 2Q97A 5F2RA 3WEEB 1GLJO 2ZWHA 3DAWA 4CD1A 4B1UB 1D4XA 2GUPA 2Q2RA 3LDNA 4FWKA 3ENHA 3GL1A 2P9NB 5AQQA 3L6QA 3VEVA 1MA9B 3VENA 3FE1A 3CJAA 5AQGA 5AQOA 2FF3B 5FPNA 4BVPA 4BREA 4JHDB 4B9QA 5AFUA 5AQMA 4Z94A 3ZEUB 4K43A 2E1YA 1IG8A 3WQUA 3M3ZA 2QWMA 5AZIB 3VEZA 3UKRB 2AA4A 3BP8A 4IWVA 1ATRA 4ISGA 4IZ9A 3MCPA 1MWMA 5E84A 2FXUA 4CBXA 3VESA 3HSCA 2GTDA 2YHXA 3CERA 2OANA 3EO3A 1X3MA 3R6MA 2PAVA 5AQZA 3CI5A 5AQWA 2GWKA 1R59O 3L4IA 4EIAA 2A40A 4BR9A 4KBOA 3DXKB 3ZETB 2J4RA 2A42A 3CQYA 4CZGA 2YCHA 3SK3A 3SMPA 4PL8A 2BTFA 1GLBG 2Q31A 4K41A 4XH1A 4IXCA 3VGLA 3I8BA 4FWQA 2QWPA 2FSJA 4BRGA 3CJ9A 4BR2A 3ZX2A 2W41A 3RSEB 1BWFO 3GDQA 1X9JA 2WUSA 4FO0A 4J8FA 4RWTA 3L0QA 2NZTA 1RFQA 3HBTA 4JAXA 5AQUA 5BREA 3EN9A 3EKSA 4BG8A 2V7YA 3QMLA 5AQIA 2E1ZA 3JXUA 4MLHA 1NGJA 5AQYA 2I7PA 2P9SA 1GLLO 1T44A 2YJFA 5AQLA 3LDOA 4JN4A 5BN8A 2P9LA 3BF3A 3U9ZA 4BRHA 1HX1A 2D4WA 4B1ZA 2FSNA 3VOVA 1K8KA 5EY4A 1NGBA 3VEXA 4BR4A 5LY3A 2CGLA 2A3ZA 4BR5A 1V4SA 4BC4A 1NGCA 3AAPA 3UKUA 2V7ZA 4BRMA 4BRNA 4GNIA 3D7EO 4O5FA 3LM9A 2F9WA 3EZWA 2HMPA 5AQTA 2ASMA 2IVOA 4CBUA 2E2NA 4A62A 4M7XA 3ZX3A 4CZLA 4H0TB 2P9KB 3WXKA 3D2EB 2GELA 1NGAA 3O80A 3W3DA 3LDLA 5EVZA 3DXMA 4H5TA 1KXPA 1TYQA 4BROA 4BRQA 4K42A 4WQ5A 5AR0A 4FWMA 5ADXA 2Q1NA 5JLFA 2UYTA 4K25A 3H3NO 1BUPA 1GLCG 1S22A 1ESVA 3MMVA 5AZJA 1QHAA 3C0BA 2PBDA 1V4TA 4XEIA 1DGKN 3UE5A 3CETA 3LDQA 5JICA 1DKGD 1H1VA 1HPMA 4CZFA 3IDHA 3TU5A 1YVNA 3GBTA 3MN5A 2CGJA 1S3XA 3VERA 1KAZA 2YHYA 1NBWA 1IJJA 1SQKA 2HF3A 1XC3A 1G99A 3HZ6A 1JCGA 1Q18A 1T6CA 3H45C 1LOTB 4CZKA 1YXQA 3A5NC 3VGKA 3ATUA 4YDUC 3C7NB 3WEEA 3D2FB 3CJ1A 2QW9A 3QBXA 3FFKB 4Y0WA 4XH5A 3CJBA 4FWLA 3G25A 2P9NA 3CIPA 1NM1A 4ISEA 5AQSA 3SMSA 4M63C 3IUCA 3CJCA 4DCHA 4H0XB 4JHDA 2DPNA 4BRPA 1Z6RA 2E2OA 1YUWA 4IJNA 4XH4A 2D0OA 2QWRA 3U8XA 3O8MA 2NRHA 2A5XA 3O6WA 3F9MA 4I6MB 5AZIA 3VF2A 5BRFA 2ZF5O 5ELZA 3UKRA 3A0IX 2D0PA 2Q0UA 3IMXA 4BQZA 3MK6A 4AM6A 3R9PA 2I7NA 3QBWA 4H5NA 4QS8A 1QZ6A 4WQ4C 1KAXA 1U6ZA 2ASOA 5KPRA 2IVNA 1JCFA 3VPZA 3WUHA 4WYBA 3SJHA 2YJEA 3ZETA 3H46O 1J6ZA 1OKJA 1E4FT 4RCHA 4CZHA 3MN6A 2VCPA 3EKUA 4AM7A 3LL3A 4B1WB 1BOTO 4JD2B 3QFPA 5KPTA 2P9IB 5AQPA 4BRLA 5KQ8A 1BA0A 3O08A 3BEXA 3VF4A 1SZ2A 2QXLA 4LC9B 3RSEA 3WXJA 3GOIA 5FPMA 3P4IA 5F0XA 3U4LA 3WXLA 2YHWA 4BR0A 4BC5A 4MO4A 4CBWA 1SAZA 4PL7A 2FF6A 3S41A 4FPBA 4MLEA 1MWKA 1GLAG 3FGUA 3WT0A 3ULEB 4B1VA 4BG9A 2P9PB 3GE1A 2KHOA 3HTVA 4H0OA 1WOQA 2FSKA 4NO7A 5BPLA 1XUPO 1RGIA 5TKYA 4EFHA 2P9UB 3FZKA 3WQTA 4DHYA 4BGAA 3H1QA 3H6EA 4C23A 3MDQA 4CZMA 3FR0A 2VWBA 3ZX0A 2CGKA 2A41A 1WUAA 4CJ7A 1CZAN 4FWRA 3ID8A 4YDUA 4HTLA 1NGIA 1GLDG 4H0PA 4MO5A 3HI0A 5AQRA 5BN9A 3FZMA 2IVPA 4QS7A 2Q36A 4ISFA 4H5VA 3J8AA 4BRFA 1HKBA 1U2VB 3FLCO 2ITMA 4L3QA 4H5WA 1QQNA 1YAGA 4E1JA 4JNEA 2QWNA 4F9OA 2P9KA 1EQYA 1GLFO 3H3OB 3D2EA 3BUZB 1QZ5A 2ASPA 5BPMA 4BR7A 3EL2A 5FPDA 2Q0RA 3CHWA 1NGFA 3CJ7A 5LJVA 1T6DA 2EWSA 4PKIA 5I9EB 1TUYA 4PKGA 2ZGYA 3VEOA 3O5BA 3FZHA 3LDPA 4BVOA 3M1FA 4H0YB 1MDUB 2E2PA 4FWNA 3QFUA 4QS9A 5AQKA 5JMVA 3TPQA 3A5MC 3BF1A 5KQDA 3AARA 2GEMA 4CI6A 1HJOA 3UB5A 4BRCA 3HM8A 3H1VX 3A8YA 4DQ8A 2H3GX 3CQXA 5AQHA 4FOEA 3A5OC 2BUPA 5EXWA 5AQFA 3VETA 2NLXA 5CE3A 1NWKA 2F9TA 3VGMA 4DB3A 3FZFA 4O8KA 4CZIA 5LJWA 4H5RA 3ZEUA 5AFUH 1ATNA 5AQJA 2E2QA 3C7NA 3D2FA 4FWPA 4WQ5C 4H03B 5BR9A 3KZBA 1HKCA 3QDKA 5F1XA 2D1KA 3QICA 4B1XB 3DJCA 3MN7A 4FSVA 3WXIA 3O1WA 2E8AA 3OHRA 1ATSA 5EOYA 4BQLA 4RTFD 3B8AX 5BRDA 3DXKA 4CZJA 1BG3A 1HUXA 2V52B 1X3NA 4I6MA 2QWOA 4NB4A 3LM2A 5E26A 3ATVA 5KPZA 3VEWA 3IFRA 1E4GT 2CH5A 1DEJA 3QB0A 4A61A 3MN9A 4IO8A 1ZXOA 2P9SB 2ZGZA 1Y64A 4EHTA 5BPNA 2QWQA 1QQOA 2W40A 1BO5O 2HF4A 4FWOA 4HWIA 4FL9A 2P9LB 3M6GA 5B8HA 2QM1A 3VEYA 1QQMA 2A6AA 1K8KB 3SLCA 3R8EA 5AQVA 1HLUA 3KHYA 3O4WA 2E20A 1TUUA 1RDWX 5JLHA 3UKUB 3AAQA 3DWLA 4FPAA 4JD2A 5BRHA 2P9IA 1GLEG 2V51B 4FWSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C65A 1U49A 1YITN 4LF6K 3I33A 2GX9A 4FCYA 2BANA 4A2AA 4CJTA 2FBVA 3DXMB 1TYQB 4J2DA 1RT6A 4DQSA 4BDZA 3ULEA 2QWLA 3NVMA 1KQSM 4H0VB 4E89A 2YNHA 4BRKA 3CM5A 4CJWA 1BDGA 3JS6A 4BRIA 2FLOA 1N8RO 1LAWA 2P51A 4H4OA 3L2VA 4CD3A 1YI2N 4EAHD 2IS3A 4BC3A 2YI1A 3SYZA 4YOYA 1N32K 1NK5A 3BDPA 1XQSC 2CH6A 4M7YA 1U2VA 5IT9O 4JYAK 1S5JA 4GY2B 1VQPN 4V19S 3BZKA 1GLJO 3DAWA 4ELVA 3LDNA 1GOCA 4O4GA 1FJGK 2P9NB 4CK1A 3VEVA 1MA9B 2QK9A 2FF3B 5FPNA 4BREA 4DV1K 4B9QA 2KTQA 5AQMA 4Z94A 3TANA 4DF4A 3ZEUB 2XY7A 2HVIA 1Q8IA 3TSUA 3HP6A 3QEPA 4BECA 2AA4A 1ATRA 3K5LA 4ISGA 5M1FA 4FZXC 3MCPA 3VESA 4Z4FA 4JI2K 1X3MA 4JK8A 3CPEA 5AQZA 3CI5A 5AQWA 3OJUA 5T7BA 3V4IA 4EIAA 2A40A 4BR9A 1BISA 4JKBA 3ZETB 3G4SN 2A42A 3CQYA 4A59A 4HUFA 3SMPA 4ZHRA 4PL8A 1IO2A 4CIEA 3V6DA 4ILJA 4FJ9A 4DTRA 4IFEA 3NF7A 2C1GA 5GADP 2FSJA 3L2QA 5FRNA 5FLXO 4BR2A 2QKBA 1HNZK 4DQIA 4KFBA 4J8FA 3GDQA 4R79A 4GKKK 3K57A 4CF8A 3OJSA 4C8OA 4JAXA 3DYAA 2NRXA 3WNEA 2VQEK 2OYQA 5BREA 4M3UA 2IOCA 5AQIA 4DS4A 4C1NK 5AQYA 2P9SA 3HPHA 3KKRA 4JI4K 4DSIA 2G8FA 3VA3A 3AVNA 2YHBA 2P5GA 4BRHA 4CW7B 2D4WA 1A5XA 3VEXA 4CF0A 4CJVA 5LY3A 4BR5A 2GBZA 3QIOA 3AAPA 2QXFA 1ZBHA 3D7EO 3LM9A 4PUOA 2HNDA 3EZWA 4LY7A 4HCBA 5DM7L 2FBTA 1JLFA 1J9AA 4CZLA 4H0TB 3KIOA 4FJXA 2ATQA 3D2EB 3O80A 3LDLA 4H5TA 3O4NA 2D0CA 3AV9A 4HUEA 4BROA 3DOLA 1VSFA 4M3YA 5J2QA 4WQ5A 4X66K 5AR0A 3PIPL 3CF5L 2UYTA 4KTWA 4JEPA 4CGFA 4IEIA 3ZSXA 1TKZA 4YOWA 3MMVA 4DQPA 1P90A 3AVHA 3E9LA 3VQPA 4OPKA 1W9HA 1QHAA 1V4TA 4AHTA 3JYTA 4X65K 3CPWM 1WSJA 3QNNA 1S1UA 2ETJA 4CEZA 1HPMA 3PLAA 3IDHA 3GBTA 4J2EA 4QOZB 1S3XA 3E9OA 3VERA 3T69A 4MDBA 4JI3K 4N41A 4OLAA 1SQKA 3V9SA 5M1NA 1XC3A 4LF5K 1T6CA 1LOTB 1YXQA 4DR6K 3O9SA 3ATUA 3WEEA 3C7NB 3ZSZA 4FYDA 3HM9A 3CMAN 2HHSA 4FWLA 3OVNA 1QSYA 3CIPA 4ISEA 4CF2A 3SMSA 4M63C 3KWIA 4DR1K 4JHDA 2DPNA 3AO2A 4B9TA 5A2QO 1YUWA 3KD5E 4IJNA 3QEWA 4XH4A 1HQEA 2WFBA 3U8XA 3O6WA 4I6MB 1IV0A 3LP0A 3UKRA 5ELZA 4N56A 3A0IX 2IC3A 1N6QA 3IMXA 1WSFA 3U3GA 4BQZA 3MK6A 3D45A 2JGUA 1VSEA 4WCEL 3IAYA 4KHUA 4UY8O 4F8RA 1KAXA 1WBDA 3MWTA 3VPZA 3IS9A 2D5RA 4DV7K 1TGOA 4LH5A 1J6ZA 2X6NA 3LWLA 4ZTJA 4AM7A 3LL3A 2ZJRL 2Q3SA 1HQUA 1X9WA 1YT3A 4FM1A 2O4IA 1LWFA 5KPTA 2R7YA 3BEXA 2XHBA 4M3RA 3AVCA 1IKXA 3WXJA 3KWGA 3P4IA 4IOXA 2OCEA 4BR0A 4DFPA 4MO4A 4HUGA 3LALA 1VRUA 3FGUA 3P1GA 4LF9K 3RMCA 1Q7YO 4BG9A 3GE1A 1OVYA 3HTVA 2FSKA 1NMNA 5BPLA 4KH4A 4EFHA 5KGXA 2BH1A 4MFBA 5DK5A 3CCMN 1OH5A 4CZMA 2YNGA 3T3FA 3RR8A 4UQGA 4Z4GA 1NOZA 1J5EK 4CJRA 4WF9L 4O0JA 1LAVA 3ID8A 4DQRA 4RW8A 5KTQA 1D9DA 3FZMA 2ZJPL 4FJ8A 3NH0A 2Q36A 4ISFA 4YFUA 4BRFA 3OS2A 1WAFA 1QQNA 1WLJA 4F9OA 2P9KA 2A1SA 1GLFO 5BPMA 2WONA 3P83D 4GW6A 1NGFA 3CJ7A 5LJVA 1YHQN 1RDAA 1T6DA 2EWSA 4PKIA 3TAPA 3RRGA 3LPUA 4HCCA 1NJYA 4BE1A 3S3NA 4J2BA 3ZSOA 4JKGB 2WTUA 3D0PA 4QS9A 2B4JA 4BE7B 1QS4A 3AARA 4EZ9A 3UB5A 5KGWA 4IG0A 3K2PA 3HM8A 3PO4A 4FOEA 1WSGA 3LP1A 4QCLA 2WOMA 3DRSA 3VETA 4DMNA 5K14A 1RCHA 3OYLA 3PIOL 1IKWA 3FZFA 5HOOA 2HBKA 4H5RA 4ZTFA 4ELTA 1ATNA 4FJ7A 3CYGA 3K5NA 1KVCA 3QDKA 1W97L 2E5LK 2G8KA 3PSFA 3MN7A 4DV0K 4RW7A 3V1RA 5EOYA 4BQLA 2RHKA 4JKDA 1QQCA 1C0UA 4G1QA 4FLXA 1DTTA 3AVJA 3DXKA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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