1NWKA

Crystal structure of monomeric actin in the atp state
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Crystal structure of monomeric actin in the ATP state. Structural basis of nucleotide-dependent actin dynamics.
pubmed doi rcsb
total genus 118
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1nwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nwkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nwkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nwkA04
1RGIA 3WQTA 2FSKA 3VERA 1KAZA 4FSVA 4IWVA 2OANA 1TUYA 3H3NO 2P9SA 4A2AA 3VEYA 1GLEG 4JAXA 2ZWHA 3CERA 1G99A 1NMDA 2CH6A 1T6DA 2A5XA 4RCHA 2E2OA 2P9SB 3VF6A 3SMPA 4BR9A 4CZIA 1C0FA 3VEWA 4B1XB 3CJBA 2Q1NA 3CETA 3A8YA 1Z05A 2Q2RA 2WUSA 5AR0A 2GWJA 2QM1A 1GLJO 4FWKA 4CBXA 5TKYA 3MN5A 4H0OA 3ZX0A 2YJFA 3IDHA 2I7NA 2BTFA 4EFHA 3QBWA 4DB3A 3WUHA 1Y64A 2YI1A 3RSEA 2CGLA 3HM8A 2IVOA 1BWFO 4PKGA 3AAPA 3FZFA 4BR7A 4FWQA 3CJAA 3DJCA 3GE1A 4BRFA 4FWMA 3RSEB 3VF4A 4JN4A 3M3ZA 1WUAA 4FWOA 4GY2B 3H1QA 1H1VA 2E1YA 4IZ9A 2FXUA 5EVZA 2A3ZA 1YVNA 3IUCA 5AQWA 5JMVA 3R9PA 3MN7A 4K43A 5EOYA 2A40A 3R8EA 3A5MC 4WYBA 5AZJA 4B9QA 3H3OB 1BDGA 5LY3A 1Q18A 1X3MA 3VPZA 5AZJB 2YHXA 4BRMA 3EN9A 4FWSA 5BN9A 3WQUA 3ZX3A 2P9NB 2GWKA 5E26A 4NO7A 3BP8A 1NGBA 3BEXA 2NLXA 4H5NA 4CZLA 4BVPA 3IFRA 4FPBA 3UKUB 1Z6RA 4BROA 5AQLA 5BREA 2HF4A 3HZ6A 1JCEA 2CGKA 3MCPA 3OHRA 3WEEA 3D2FA 3VF2A 4QS8A 3QICA 1MWKA 5BPNA 3EZWA 3D7EO 4CI6A 1NLVA 3WEEB 3G25A 4M7XA 4KBOA 5AFUA 2NZTA 2KHOA 3BUZB 4BREA 2FF3B 4EHUA 4BRAA 3SMSA 1NGDA 4XH5A 1SZ2A 4H5TA 5F2RA 1OKJA 4B1UB 2E20A 2W41A 3VEZA 2Q0RA 2YCHA 1KAYA 4K25A 3H6EA 1HX1A 3VEXA 3GOIA 3CQXA 5B8HA 5I9EB 2A42A 4H03B 4FWRA 2FLOA 3ZETA 2ITMA 1U6ZA 2Q0UA 3HTVA 4AM7A 4FL9A 3F9MA 3MK6A 1BOTO 5F0XA 3ZETB 2ZGZA 3VOVA 5AQKA 3U4LA 5BRDA 3H1VX 5AQZA 5FPMA 4PKHA 1XUPO 4CBWA 5AQNA 5FPNA 3GDQA 4ISEA 5AQOA 3EKSA 1QQOA 1SAZA 3VEVA 1HUXA 4JD2B 4IO8A 1U2VA 5JLFA 4K42A 3O1WA 2ASPA 3CJ1A 4H0TB 1V4SA 1HJOA 2DPNA 1U2VB 3A5OC 2V7YA 1QHAA 3FZLA 1HKBA 4BC5A 2E8AA 1NGHA 1DGKN 3CIPA 2Q36A 1ATRA 4M63C 3TPQA 4QS7A 3SLCA 4BRQA 2F9WA 4DHYA 3R6MA 5AQMA 2V7ZA 1IJJA 1YAGA 3MN6A 2GELA 1ZC6A 4H0YB 4M7YA 5ADXH 3J8AA 2YJEA 3P4IA 4BGAA 1NGIA 4GNIA 4XEIA 3HBTA 4BR4A 3HI0A 5AQRA 1QZ5A 2AA4A 1E4FT 4BRLA 2BUPA 5F1XA 1RFQA 3KZBA 1NGEA 1YXQA 5EY4A 2PBDA 4CZJA 3O5BA 5AFUH 1BU6O 3CHWA 1NGAA 4BGBA 2W40A 3VEOA 1NGCA 5CE3A 1QQNA 2F9TA 3ID8A 5KPRA 5FPDA 2P9NA 1TUUA 4H0XB 4H5RA 2QWRA 2NRHA 1GLFO 2FSNA 4MO5A 2IIRA 2P9LA 4BR5A 3MDQA 1BA1A 1X3NA 5AQXA 3O80A 2QWOA 4CZKA 4CZGA 3I33A 3UKUA 2CGJA 3FZMA 3A5NC 4JHDB 1NBWA 2EWSA 2P9LB 3FE1A 3FZKA 4L3QA 3D2EA 3UE5A 3MN9A 4FWLA 5BRFA 5ADXA 4O8KA 5ELZA 3CI5A 1QQMA 5AQHA 2UYTA 3U9DA 4FWPA 3D2EB 3VENA 4B1ZA 5BRHA 2P9KA 2GUPA 1V4TA 5AQYA 3W3DA 2V51B 3ENOA 4WQ4C 1MDUB 3FR0A 2P9PB 4BRDA 1KXPA 2P9KB 3VETA 3QBXA 4HTLA 4E1JA 1HKGA 2QWQA 3AAQA 4MLHA 2VCPA 4A61A 4ISGA 5AQJA 1SQKA 3LM9A 3WXIA 4NB4A 3O6WA 5AQSA 5LJWA 3QFUA 1T6CA 3DWLA 5AQTA 5LJVA 4CD1A 3L0QA 4J8FA 3QB0A 3O8MA 3LM2A 4BQLA 4EHTA 3H46O 4YDUA 4BC4A 4BRNA 3MMVA 3VGLA 3SK3A 3ZX2A 3LDPA 4BRIA 1QZ6A 1MWMA 1D4XA 3O4WA 1NWKA 1EQYA 1DEJA 2Q97A 5FPEA 1CZAN 2D4WA 3BF1A 4JD2A 4EIAA 4HWIA 3WXLA 1LCUA 2QWNA 1NGFA 3BF3A 4IXCA 4WQ5A 3WXJA 5BPLA 2ASMA 3I8BA 5BR9A 3ZEUA 4C23A 3C0BA 3KHYA 4B1YB 5EXWA 3H45C 4BC2A 3ZEUB 5AQFA 3FGUA 2D1KA 5KPZA 1TYQA 2CH5A 4QS9A 3UKRB 3EKUA 4PKIA 2PAVA 1S22A 1NGJA 2A6AA 2ZF5O 3LDLA 1ESVA 2P9UA 1TYQB 2QWPA 4F9OA 5JICA 4FPAA 3O1BA 3C7NA 3IMXA 4B1VA 5AQPA 1GLAG 2P9UB 2QW9A 1GLLO 3M1FA 2HMPA 4WQ4A 3C7NB 1GLBG 4O5FA 4YDUC 2D0PA 2VWBA 1XC3A 3LDOA 1E4GT 4BQZA 2E1ZA 2AP1A 1P8ZA 2A41A 4CJ7A 2IVPA 3DXMA 3O08A 3U8XA 3WXKA 1GLCG 5BN8A 3AARA 4BRCA 1HLUA 4DQ8A 3CJ7A 4Y0WA 4H5VA 3DXMB 4CZHA 1JCFA 4BRGA 4AM6A 1RDWX 1ZXOA 3UB5A 4ISFA 4LC9B 4Z94A 3QDKA 4WQ5C 4CBUA 3LL3A 1DKGD 4CD3A 4A2BA 5E84A 1IG8A 1X9JA 4BR2A 5KQ8A 3ENHA 4MO4A 3AY9A 3EL2A 3ULEA 1K8KA 3QMLA 4JHDA 5AQVA 1BG3A 1BO5O 1NGGA 1J6ZA 4CZEA 3ULEB 3JS6A 1K8KB 3WT0A 1R59O 1LOTB 3FFKB 2Q31A 2I7PA 2YHYA 4RWTA 1T44A 4BRKA 4RTFD 5KQDA 4IJAA 3EO3A 4FWNA 3HSCA 2QWLA 1NM1A 3B8AX 5JLHA 1KAXA 3CJ9A 4IJNA 2D0OA 5KPTA 2P9PA 1JCGA 2HOEA 2QWMA 2E2QA 1ZBSA 4H0PA 3L4IA 1WOQA 3A0IX 4EAHD 2ZGYA 5AQQA 3ATUA 5AQUA 4B1WB 4BG9A 2J4RA 2QXLA 3QFPA 4BRPA 3JXUA 2V52B 1C0GA 4BR0A 1XQSC 4DCHA 3DXKA 2P9IA 3FZHA 5BPMA 1GLDG 3VGMA 1ATNA 3VGKA 2E2NA 3DXKB 2P9IB 3L6QA 4XH4A 3TU5A 2E2PA 4BG8A 3D2FB 4FO0A 3FLCO 2IVNA 2FF6A 3S41A 1BA0A 4XH1A 4BRHA 3ATVA 5AZIA 2VYPA 1ATSA 3LDNA 4K41A 5AQGA 3CQYA 3W0LA 3VESA 1HKCA 2FSJA 1HPMA 2H3GX 1MA9B 2YHWA 3GG4A 3M6GA 5EX5A 3CJCA 4FOIA 4H5WA 1S3XA 4MLEA 5AZIB 4CZMA 4I6MA 3GBTA 3GL1A 1BUPA 2E88A 4CZFA 2GEMA 3SJHA 3KVGA 3LDQA 2HF3A 1YUWA 4A62A 3A5LC 4PL7A 4H0VB 4JNEA 4I6MB 5AQIA 4BC3A 2ASOA 3DAWA 4BVOA 3U9ZA 4PL8A 4FOEA 3UKRA 2GTDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IS9A 1YT3A 1VSFA 4JK7A 4KHYA 4WE1A 4IWVA 1WB9A 3MEEA 4A2AA 4N47A 3FFIA 4OPJA 1NMDA 3F9KA 4OKEA 4JKAA 2Q1NA 3L4QA 3A8YA 5BR8K 1LW2A 4FWKA 1SS6A 1N34K 4FLXA 2F8TA 1VQ6N 3RWUA 4RW4A 3IDHA 3AVIA 3NCIA 2CGLA 3HM8A 4WFNL 1KSPA 4BR7A 4FJ9A 1J5EK 5C2DA 3GE1A 4JN4A 4DV7K 3THVA 3H1QA 1BGXT 1H1VA 5MLCQ 1NK4A 4JI1K 4IG3A 5M1NA 2FC0A 2OA8A 3ZSQA 1DLOA 4B9MA 3RR8A 2A40A 1XHZA 4JK9A 4DV2K 4DV4K 4N76A 1RBVA 4Z4IA 1RT3A 1BHLA 4HTUA 1NOZA 5LY3A 2XY5A 5C15A 2YHXA 3MAQA 3KLHA 1SV5A 4BE7B 4NO7A 3VQ9A 3DLKA 2HNDA 3LPTA 1LV5A 4BDYA 4O0JA 1J53A 4WCEL 4Y1CA 3VQ7A 3IFRA 4JI5K 5BREA 5AQLA 4K8ZA 2HF4A 3HZ6A 1KFDA 3WEEA 2P1JA 3AVCA 4QS8A 3KLIA 4CEEA 5C42A 4JLHA 4CI6A 4OPKA 3WEEB 1JLBA 4DUZK 3PLAA 4M7XA 4KBOA 4BREA 2FF3B 2HHWA 3QERA 5KRSA 3E9PA 4B3OA 2HBKA 3MXJA 4KB1A 1L5UA 4KHWA 2E20A 3VEZA 3MWTA 4JI4K 5HOOA 3H6EA 3GOIA 5B8HA 2A42A 4E7IA 3J7AP 2KFNA 2IAJA 3HTVA 3VQ5A 1NK0A 3MK6A 4AHRA 4CGIA 2UUBK 3V4IA 3U4LA 1VSMA 1C1BA 1VSEA 2YNHA 3QLHA 4PKHA 3UIQA 2NRRA 5AQNA 3EKSA 4FCYA 3OYFA 4H4MA 4IO8A 4CJUA 1IBMK 5JLFA 1Q81O 5J2MA 4H0TB 5LMUK 4FVMA 3A5OC 3CCRN 2IDOA 3K57A 1HKBA 3KTQA 1TKDA 3CIPA 2Q36A 1ATRA 2A1SA 3TAGA 4M63C 4OJRA 4DHYA 2OPPA 4GV9A 1VRUA 2V7ZA 2XRIA 5HL7L 1Q9YA 2O8BB 2HW3A 1VHXA 3PX4A 4X64K 1NK7A 1LW0A 2YNIA 4B3SK 1ZC6A 2BE2A 4H0YB 1TVRA 5JS2A 1R0AA 1QZ5A 2AA4A 1D9DA 1U45A 4I9LA 2VQFK 1NGEA 4NXNK 1YXQA 3BZCA 4M45A 1TAUA 3SI6A 3TTDA 3O5BA 5DK5A 4KH5A 3VQ8A 3Q7CA 3AO5A 1HYZA 3CHWA 5CYMA 3VEOA 1NGCA 5CE3A 1QQNA 3QETA 5KPRA 2P9NA 3DMJA 2NRXA 3DLRA 4H0XB 4H5RA 4B9SA 3RRHA 4DR5K 2ZJQL 2FSNA 4M3XA 3MDQA 1HMVA 5GAHP 3ZT0A 3DLBA 1NJIO 3IKMA 3FZMA 1NBWA 4I2PA 1OH8A 4DTJA 1TK5A 1VQ9N 1ASVA 5BRFA 5ADXA 1S6PA 5DM6L 1WSJA 1J5OA 4LH5A 3U9DA 3OYAA 4IBNA 4CGFA 4LSNA 4F2RA 1LWFA 2GUPA 4NCAA 2V51B 1ZBIA 3K5NA 3C6AA 3FR0A 2O8FA 5FRNA 4JKDA 3L3VA 4DU3A 4A61A 2OZSA 4ISGA 3TSPA 4K8XA 3KD1E 3AVHA 1JLFA 3C94A 4B9TA 2O8FB 4CGHA 4X65K 4AQYK 5LJWA 4F2SA 3SBGA 5AQTA 5LJVA 4NCBA 3T1HK 4YDUA 4WF9L 3IRXA 3LDPA 2F4VK 1U04A 3U6FA 1RBRA 1D4XA 3O4WA 4YORA 3ZT1A 5M1FA 3OW2M 4KPYA 4CJLA 2VG6A 4EIAA 1ILYA 1FKOA 4HWIA 4CJ5A 2QWNA 5IT9O 4NYFA 3IAYA 3BF3A 3CCSN 3NGIA 4AHUA 3SUPA 4IOCL 2HVHA 1RT2A 4L8RB 3H45C 3OYEA 3M5RA 3EE8A 3SCXA 1VSHA 3CQ8A 5CHIA 2RN2A 1TL1A 1IKXA 2A1RA 2KZZA 1VSJA 4QS9A 4CEOA 4PKIA 3VQPA 2PAVA 1NGJA 2UXBK 4IDKA 2ZF5O 1VSIA 1ESVA 1RBSA 1KTQA 2QWPA 3AGRA 1U48A 4F9OA 4FPAA 3AVKA 3IMXA 4B1VA 3RMBA 4CIEA 5D3GA 1W7AA 4GKJK 4O5FA 2FBTA 3T19A 2D0PA 4BQZA 3TABA 2PYLA 2E1ZA 2A41A 4WFAL 4Z4FA 3VMFB 1FXXA 3AARA 4CEAA 3KK7A 1HLUA 5GIPA 3KWGA 4DQ8A 1A5WA 3F5TA 4JI2K 3NAEA 1JCFA 4GV6A 2QKKA 1RDBA 3RMDA 4CJSA 4CK1A 3CPWM 4WQ5C 1YJNN 3CCLN 4BE1A 4BR2A 4MO4A 3ULEA 1K8KA 3SV4A 5FDLA 3AVLA 1BO5O 4Z4CA 5KRTA 1YTAA 4CZEA 4CERA 3ULEB 1K8KB 4LF9K 3SAGA 2VWJA 4BRKA 4J2DA 1VSLA 3O9TA 4IJAA 4ILJA 1A5XA 3WNEA 3HSCA 2QWLA 4I7FA 5AJ3K 2O8DA 5JLHA 2QK9A 4IJNA 1BCMA 2D0OA 2E2QA 4H0PA 3J80O 4EAHD 3EZ5A 2O8DB 4ICLA 3O3GA 3KKSA 4CEQA 3E1YA 3PO5A 3LZJA 3BGRA 4E89A 2QXLA 4DQQA 3T7ZA 1C0GA 1HNWK 2P9IA 4DQPA 3LWLA 4E0DA 2E5LK 3VGKA 2E2NA 2P9IB 3CG7A 1N8RO 2IVNA 3S41A 5FLXO 3ATVA 4DR1K 1RT5A 3MWPA 3VESA 3L2RA 3GG4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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