4O5FA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
MSGVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Type III pantothenate kinase
publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
rcsb
source organism Burkholderia thailandensis
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA02
4WQ5A 5AQMA 3GDQA 1QQOA 4H0OA 2IVOA 3WXLA 5AQFA 3UKUA 3LDLA 1BG3A 3QFUA 3FZFA 2FSJA 5AQIA 2P9NB 2P9PB 3MDQA 1XQSC 3IFRA 2Q1NA 3OHRA 3R8EA 4L3QA 4H03B 2BTFA 5ELZA 3DXMA 3BP8A 4LC9B 5AQPA 5F0XA 3M6GA 2J4RA 3HBTA 2V7YA 3FR0A 4JHDA 1GLFO 2CGJA 2QWQA 1KAZA 2W40A 4BRLA 2A42A 4JD2B 1LOTB 2Q0RA 5AQQA 3L4IA 3QDKA 4CZJA 3BF1A 1T6DA 1J6ZA 2PBDA 2E8AA 1Y64A 3BUZB 3DWLA 3QMLA 4FWPA 4FWSA 1IJJA 5AQZA 2Q36A 4WQ4A 3ULEB 4BR0A 3HI0A 3VGMA 3KZBA 2Q0UA 3A5OC 2FF3B 3ID8A 1IG8A 2CH6A 5JLHA 1NGFA 2A6AA 3O4WA 3ZETB 3DXKA 2P9IB 3WQUA 1XUPO 3CERA 2ZWHA 1E4FT 2P9UA 3M3ZA 1ATSA 2GUPA 4CD3A 3CQYA 3LDOA 5E26A 3FGUA 4H5TA 1X9JA 2E2QA 1T44A 3WXKA 4CZLA 4EHUA 3CJCA 3SK3A 3VEWA 3S41A 4AM6A 5AZJB 2ZGYA 4I6MA 2A40A 3DAWA 4O5FA 4BR7A 2A41A 4H5RA 3H6EA 3R9PA 2E1YA 2D4WA 5BN8A 5BPLA 5AQTA 4FWMA 3H46O 2FSKA 2CH5A 3MN5A 3LDQA 5AQWA 2YHXA 4M7XA 4CZIA 3GG4A 5JMVA 1D4XA 3MCPA 1QZ6A 1BOTO 3WUHA 3EKSA 2CGKA 2YJFA 4WQ5C 3A8YA 4CZEA 1HX1A 4EIAA 3QBWA 1JCEA 3D7EO 1TYQA 1LCUA 2A3ZA 1HJOA 4M63C 5FPMA 3WEEA 4BRQA 2QXLA 3RSEA 3WXIA 2YHWA 3VERA 3D2EA 3CJ9A 4HWIA 3O6WA 3FLCO 1Z6RA 5AQLA 4FWRA 3MN6A 5BRFA 3UB5A 5AQUA 4B9QA 3AY9A 1RFQA 3ZX2A 3C0BA 4NO7A 4DCHA 5BN9A 3LDNA 2ASMA 4FOEA 5AZIB 4PKHA 2ITMA 5AQKA 2QW9A 2DPNA 3CIPA 2FSNA 4CZHA 4ISEA 3UKRA 4J8FA 4K43A 4XH5A 4CBXA 3VEYA 4M7YA 4CI6A 4A2BA 4FWKA 5AQRA 2Q2RA 2D0PA 4BRIA 3SJHA 1QZ5A 3FZKA 4WQ4C 1BA0A 4ISFA 5CE3A 2QWOA 4FL9A 3MN7A 3QICA 4BGAA 2YJEA 3R6MA 4K42A 1DKGD 1MDUB 3M1FA 5E84A 5AQXA 4H0TB 1K8KB 4FWNA 4B1WB 5AFUA 2GELA 5AR0A 2NRHA 3CI5A 4JAXA 3JXUA 4YDUC 3LL3A 3VGLA 4B1UB 4H5WA 3VETA 2QWRA 2D0OA 1BU6O 1C0GA 3FFKB 3EL2A 3ZEUB 3DJCA 3ZX0A 4EAHD 4BRCA 2YCHA 4EFHA 2AP1A 2ASOA 1NM1A 2W41A 1YUWA 4BQLA 1BUPA 1HPMA 3FZHA 5AQJA 4KBOA 2P9SA 4MLEA 4BROA 1ESVA 4IWVA 3A0IX 1XC3A 4H0PA 3DXKB 4PKIA 1WOQA 4H5NA 4BR5A 1NGGA 3WT0A 5ADXA 1BDGA 4H0XB 4BVPA 1U6ZA 4A62A 4CZMA 5AQNA 5EX5A 5F2RA 2QWLA 2I7NA 1C0FA 2P9NA 2P9PA 4B1XB 4YDUA 4E1JA 5AFUH 4BC3A 4BQZA 4NB4A 1HUXA 1HKCA 1QQMA 2HF3A 4BRHA 4BG9A 4BC2A 3H3OB 3O8MA 3A5MC 4B1VA 4GY2B 4HTLA 5EOYA 2P9KA 3ENHA 4JD2A 4EHTA 3VESA 1CZAN 2QM1A 1MWKA 2OANA 3D2FB 4RCHA 2Q97A 4XEIA 3HTVA 4C23A 5TKYA 2IIRA 4BR2A 1SQKA 3U8XA 4FWOA 1QQNA 3WEEB 3FZLA 3VEZA 3TU5A 4FWQA 1RDWX 3VEVA 4BC5A 4BRPA 3ZX3A 3H45C 1V4TA 1U2VB 2ZF5O 5ADXH 3L6QA 4BRKA 4IJNA 1X3MA 5BREA 1NGJA 4BRNA 2VCPA 2E2PA 2P9LB 5AQYA 3ZETA 3I33A 2P9IA 4BGBA 5LJVA 3O5BA 3QFPA 3EKUA 3CHWA 2NLXA 3HM8A 4QS7A 1NWKA 1ATNA 4IJAA 1EQYA 3SMPA 1GLCG 3GOIA 2WUSA 4WYBA 4BRGA 3EO3A 3CJAA 5AZJA 4IZ9A 4BRDA 2V7ZA 3BF3A 3I8BA 1S22A 3ATUA 3AAQA 3UKUB 4DB3A 1ZXOA 2E2NA 1DEJA 3VPZA 4BRFA 4RWTA 1TUUA 4GNIA 3GL1A 4JN4A 1YXQA 1SZ2A 3DXMB 5AQOA 4PL7A 5KPRA 1E4GT 3U9ZA 3MN9A 3A5LC 4H0VB 1BA1A 3O08A 1MA9B 4FO0A 3O1BA 3MK6A 4JHDB 4CBWA 5EVZA 4FOIA 1OKJA 3SLCA 3P4IA 1RGIA 1T6CA 3CQXA 1WUAA 1V4SA 3MMVA 4BG8A 2PAVA 4K25A 4AM7A 2YI1A 3VF4A 4IXCA 2FXUA 4ISGA 3BEXA 3C7NA 3IDHA 2F9WA 1NLVA 4B1YB 2GEMA 5BPMA 5EY4A 3J8AA 2E88A 5AZIA 3O1WA 4DQ8A 3WQTA 2FLOA 2BUPA 3KVGA 2HMPA 4H5VA 3EZWA 5BR9A 1MWMA 5KPTA 1GLLO 2UYTA 3LDPA 2ZGZA 1NGEA 5AQHA 4F9OA 3FE1A 1YVNA 3H3NO 3UE5A 1X3NA 3IMXA 3EN9A 2P9UB 3A5NC 1K8KA 2NZTA 3GBTA 4CZKA 2HOEA 5KQDA 2P9KB 5LY3A 2EWSA 3VF6A 4A61A 2QWMA 1GLAG 1DGKN 4H0YB 3QB0A 5BRDA 3HSCA 5AQVA 3VF2A 4I6MB 1GLJO 3W0LA 4A2AA 2E1ZA 2ASPA 3GE1A 4XH4A 4MO5A 1P8ZA 4BRAA 3ENOA 3ZEUA 3VOVA 4Z94A 2QWPA 4K41A 1Z05A 3LM2A 3TPQA 1NGBA 3CJ1A 4XH1A 4IO8A 5FPDA 4Y0WA 5KQ8A 1YAGA 3W3DA 2V52B 4CD1A 1GLDG 4CZFA 1TYQB 5BPNA 3ULEA 5JLFA 2GWJA 3CJ7A 5KPZA 3RSEB 2E20A 1GLEG 1KXPA 1JCFA 3VENA 3D2EB 2IVPA 4FPAA 3F9MA 5FPEA 1NGIA 1ZBSA 3JS6A 5AQSA 4JNEA 4QS9A 1HLUA 4PL8A 1JCGA 2F9TA 3B8AX 4BR9A 4BREA 1H1VA 3U9DA 1HKGA 3KHYA 4QS8A 2D1KA 5EXWA 3UKRB 5LJWA 3AAPA 4CJ7A 3HZ6A 4FSVA 4BRMA 2V51B 1NBWA 5B8HA 2CGLA 1NGHA 2AA4A 2H3GX 2QWNA 3H1QA 5FPNA 4CBUA 4MLHA 3QBXA 3U4LA 2A5XA 3CJBA 3D2FA 3AARA 4BC4A 1SAZA 1TUYA 3CETA 4CZGA 4DHYA 1NGDA 1G99A 2KHOA 1NGCA 3IUCA 2HF4A 1ATRA 2FF6A 3SMSA 1NGAA 4BVOA 5BRHA 1NMDA 1U2VA 3VEOA 5AQGA 1R59O 3C7NB 3VGKA 1Q18A 3H1VX 5I9EB 2Q31A 3VEXA 4FPBA 2P9LA 2VWBA 3G25A 4MO4A 1QHAA 4O8KA 4PKGA 4BR4A 1BO5O 1BWFO 4B1ZA 3FZMA 1S3XA 1ZC6A 5JICA 3LM9A 3L0QA 4FWLA 1KAXA 2P9SB 2VYPA 2I7PA 5F1XA 2YHYA 2IVNA 1KAYA 2E2OA 2GTDA 3WXJA 1GLBG 4RTFD 1HKBA 2GWKA 3O80A 3ATVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WQ5A 4M3UA 4B8CA 1C0MA 3WXLA 3Q7CA 3UKUA 3MEEA 4Q5VA 2Y1JA 1BG3A 2P9NB 3CCEN 1XQSC 1W97L 4DSFA 3S9HA 1RBSA 4GMJB 2BTFA 4GV9A 2O8BA 4J2AA 2LSNA 3M6GA 2NUBA 4ELTA 3VQ9A 2QA4N 1W9HA 5KGWA 5CHIA 2CGJA 1UA1A 1IBLK 4N47A 5AQQA 3L4IA 4CZJA 3KK2A 4ZTJA 1SL1A 1Y64A 4FWPA 4Z0UA 4RG8A 4MFBA 3PIPL 3TANA 1JJ2M 1RNHA 3CCQN 4RW9A 4OLBA 3ULDA 1DTTA 3AA2A 4BR0A 1CLQA 1N8RO 1SS6A 2VQFK 2XY8A 3IRXA 3LWMA 3QEWA 4CEQA 4B3RK 3PV8A 5FRMA 3A5OC 2RE2A 2G8IA 3ID8A 4IOCL 4XIUA 3KD1E 1NMNA 4ILGB 2A6AA 1RTHA 3SV3A 1QSLA 2P9IB 1XUPO 3CERA 3V1RA 2ZWHA 1BHLA 1REVA 3AVLA 5M1QA 3PO4A 2GUPA 4IO9L 3CQYA 3LDOA 3HVRA 3FGUA 3ZT2A 1D9DA 1KFSA 3WXKA 4EHUA 4KAZA 1EETA 3SK3A 3S41A 5C24A 3NMUA 2A40A 3MAQA 4O5FA 1VQ5N 4JI6K 3F73A 2A41A 3IG1A 3U3GA 2E1YA 1Q9YA 1TK0A 4F8RA 2FSKA 5C10A 4V19S 2VQEK 3QLHA 4CGGA 3THWB 2O8DA 4FK2A 4G9ZA 3NH2A 4DV0K 4JK8A 1YI2N 4JI4K 4YNQA 3AVMA 4O44A 1SKRA 4AF1A 5GAHP 1HJOA 4BRQA 2FBXA 3WXIA 3TI0A 3CJ9A 3OVNA 4CF1A 1QSYA 1ZBFA 3AY9A 1J54A 3B6OA 4DCHA 2ITMA 4PKHA 3NFAA 2FSNA 3SZ2A 3JSMA 3UKRA 4J8FA 3SPYA 4CI6A 3N4QA 2Q2RA 4BWJA 3K2PA 1SL2A 3SJHA 3OYCA 1S1TA 4ISFA 2QWOA 4FL9A 3K59A 5KRTA 3TSPA 4DU1A 3ZSZA 1DT9A 4B3SK 4OKEA 2I5JA 2NRHA 3QERA 2P1JA 1JLFA 1T03A 3JXUA 3OYBA 3D0PA 3VGLA 4CFDA 4DQRA 3DYAA 1VQ6N 3RTVA 3K9KA 1KC8O 4M3TA 1BISA 4EAHD 1U4BA 4DQSA 4E7HA 3TAEA 2VGMA 4BQLA 1HPMA 5AQJA 4KBOA 2P9SA 5I3UA 4NCBA 3OYHA 1FXXA 3QESA 3O9RA 3DLBA 4H0PA 3OYDA 2ZJRL 3SV4A 4E7JA 4H5NA 5KRSA 3G4SN 1G15A 4H0XB 4BVPA 1HQUA 1U6ZA 3AO2A 3SBTA 3RVCA 4FYDA 4CJKA 4JS5A 5F2RA 1I3AA 3HPOA 2P9PA 5C2FA 4E1JA 5AFUH 3I56N 3E9PA 3P39A 4BQZA 2RN2A 4DR2K 1QQMA 4KHWA 4BG9A 3V1OA 3A5MC 3ZYYX 4Z4GA 3J7AP 4GY2B 5GIPA 4HTLA 5HBMA 1IBMK 2G8KA 2ITGA 3KD5E 1JXEA 2HHWA 1RBUA 1VSHA 1HNIA 3D2FB 2Q97A 4DTOA 3V4IA 1Y97A 3L2VA 4H8KA 4FWOA 3S3OA 1L3TA 3VTIA 4NCGA 3FFIA 2FBTA 2OTJN 4CGDA 4FJ8A 3PLAA 3VEVA 4BC5A 4BRPA 1KTQA 5ADXH 4BRKA 1ZBUA 4H4OA 3CXCM 1NGJA 2ETJA 4BRNA 4DSJA 2E2PA 3CCLN 3ZETA 3AVFA 4K0KK 1OH5A 3EKUA 3CHWA 1M90O 1EP4A 4DLGA 4KTQA 4Z4EA 3SMPA 3EYZA 1GLCG 5AZJA 4W5QA 4BRDA 3BF3A 1ASUA 1LW0A 4CGFA 4KPYA 1UAXA 1ZXOA 2E5LK 2BANA 3O9SA 1TUUA 3HO1A 1KSPA 4OPJA 1TL3A 3WNFA 4C8MA 3HXMA 1BA1A 1MA9B 1TK5A 4FO0A 3MK6A 4FOIA 4KH6A 1RGIA 1IH7A 1S72N 2PAVA 4AM7A 1VRUA 1T8EA 1NJIO 5M1NA 2DY4A 2HHSA 2FXUA 3DRSA 4R5PA 4ISGA 1UOCA 1DLOA 1RTDA 2GEMA 4DR7K 1VSFA 4B3OA 4YOUA 5EY4A 4ELVA 2E88A 5AZIA 3O1WA 4DQ8A 3WQTA 3QNOA 4CF8A 1BI4B 4FLXA 1XNQK 4AILC 2FLOA 2BUPA 3KVGA 4FJGA 4CGHA 4C8OA 4H5VA 3EZWA 1MWMA 3SCXA 5AQHA 2OZMA 1NGEA 3SAHA 5GAEP 2X6SA 3FE1A 3LALA 1X3NA 2KQ2A 5CYMA 3EN9A 3I0RA 2P9UB 1I39A 3BGRA 3K57A 3MXJA 5KQDA 3NF9A 3VF6A 4CHQA 4X66K 1FW6A 1ILYA 5AQVA 3VQ8A 3W0LA 1GLJO 3DOLA 3RMAA 1W0HA 2E1ZA 4CHOA 1TV6A 3GE1A 4XH4A 1X1PA 3SQ2A 4J2BA 1LW2A 3VOVA 1RBTA 4IG3A 2YNGA 1Q86O 4J2DA 4CJRA 3C94A 4IO8A 4CJSA 5T7BA 3AVAA 4KI4A 1XMOK 3G0ZA 5LMNK 3W3DA 2V52B 4CD1A 1GLDG 4O4GA 4CZFA 1TYQB 3AVJA 4G1QA 4KTWA 4I9LA 3CFPA 3HOSA 1KXPA 3PUFA 1JCFA 4YOTA 4JI2K 2QKKA 2B4JA 2IOCA 3JS6A 1HLUA 4AH9A 3NGYA 3O3GA 4BREA 1H1VA 1EWRA 2NRVA 3AAPA 4CJ7A 3E9OA 4FLZA 1RDAA 2KFNA 3HZ6A 4FSVA 4BRMA 4PY5A 2HW3A 1XHZA 5LL6Z 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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