2P9PA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
412
structure length
388
Chain Sequence
GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGKWIKQYTGINAKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 124
structure length 388
sequence length 412
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9pA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9pA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9pA03
4L3QA 4O8KA 5AQNA 2QWOA 2OANA 4BR4A 3GL1A 3CJ9A 1XUPO 2P9LA 2NZTA 3OHRA 1Q18A 5BPMA 3FFKB 5I9EB 3CI5A 2E8AA 4DQ8A 5AQYA 1KAXA 3ATVA 4H0OA 4AM7A 5BN8A 5BPNA 4BVPA 4BRGA 3O80A 3J8AA 1GLEG 2YJFA 3IUCA 3UKUB 3VGLA 2P9SA 2HF3A 3MDQA 3HM8A 3R9PA 4BRHA 4CZJA 2A5XA 1R59O 3WT0A 3VGKA 1DEJA 3R8EA 2Q31A 1NLVA 4C23A 4Y0WA 3DJCA 3ZETB 3TPQA 3ENHA 4CI6A 2D1KA 3WXJA 1GLAG 1X9JA 2A6AA 2GTDA 4IO8A 1Y64A 5ELZA 3CJBA 4FWKA 1ATNA 2YJEA 4CJ7A 5KQDA 5E26A 2EWSA 3L0QA 5BRDA 1GLBG 5AQKA 2P9UB 1QZ5A 4BG8A 3ZX3A 5AQZA 3KZBA 4GY2B 4PL8A 4B1WB 3A5LC 4BR5A 5E84A 4DB3A 1Z6RA 3WQUA 4B1UB 4CZKA 1S3XA 4BQLA 1HLUA 3QB0A 4B1XB 3BP8A 1U2VA 3G25A 2DPNA 3AAQA 4ISEA 2HOEA 3EKUA 5KPTA 2A42A 2P9KA 1GLJO 2KHOA 3A5OC 3VETA 3UKRA 1NM1A 2CH6A 2E2PA 2HMPA 3FZMA 2E88A 2YHYA 3HBTA 5KPRA 4BR2A 3L6QA 3ULEB 4I6MB 4H5NA 3KHYA 4B1YB 3DXMB 1NWKA 3WXIA 3W3DA 4FWPA 4EHUA 3QBXA 5AZJA 4BRKA 3VEOA 2QWMA 5ADXA 5BR9A 2E2OA 3VF6A 2VWBA 3FZKA 3D2FA 5LJWA 3F9MA 3SJHA 1S22A 5AQJA 2E20A 4BR7A 4A2AA 3GOIA 3UB5A 2P9IA 2E1ZA 3ID8A 2P9NB 4Z94A 1J6ZA 4XH1A 1GLFO 1RDWX 4ISFA 1KAZA 4FOEA 1SZ2A 3DXKB 3H1VX 1YXQA 3FGUA 4KBOA 3LDOA 2BUPA 4BGAA 4ISGA 2FXUA 4CZMA 4BRMA 2GELA 2YHWA 4H5WA 2IVNA 3H45C 1NGHA 3LM9A 3WEEB 3H3OB 3JXUA 3VPZA 1X3NA 1KXPA 3DWLA 4K43A 4O5FA 1MWKA 4WQ4C 2V51B 4A2BA 3HI0A 2FSKA 3U9ZA 1K8KB 3GG4A 3KVGA 2Q1NA 3CIPA 1JCGA 1TYQA 3C7NB 3VGMA 5B8HA 4CBWA 4FSVA 1NGJA 3CJ7A 1QQNA 3LL3A 3BF3A 1T44A 1TUUA 1U6ZA 1DKGD 1T6CA 4PKIA 3D7EO 5JICA 4BGBA 2ASMA 1QQOA 1WOQA 4MLEA 1BO5O 3QICA 2GUPA 5JMVA 3QFUA 5AQOA 3O6WA 3I33A 4JD2A 4EFHA 1HX1A 3MK6A 4EHTA 1GLLO 2P9PA 2V52B 4WQ4A 5AQMA 3WUHA 1H1VA 1ATRA 3RSEA 2CGLA 4HWIA 1GLCG 2A3ZA 5AZIB 3U4LA 3FZLA 3VEVA 1BA1A 5AQVA 4CBXA 1TUYA 5EVZA 1SAZA 3A5MC 2GWJA 3U9DA 1GLDG 2CGKA 3P4IA 2I7NA 4RCHA 2Q0UA 4FWMA 5AR0A 5AFUH 3IFRA 3UKUA 3MN5A 4BC2A 3QBWA 4MO5A 4XH5A 1NGBA 4BREA 1YVNA 2ZGYA 3D2EB 4FWOA 1NGCA 3ZX0A 1D4XA 5EXWA 4AM6A 4XEIA 3O1BA 1WUAA 1OKJA 3I8BA 4FPBA 4QS9A 4FWRA 3ZETA 4JN4A 3EN9A 3VEXA 3VOVA 3M6GA 4K41A 4H5TA 3O8MA 2AP1A 3A8YA 5F1XA 2FLOA 5EY4A 2IIRA 3B8AX 3MMVA 4J8FA 3MN6A 3CQYA 3O4WA 4QS8A 3R6MA 4H0VB 4A62A 2AA4A 3VEWA 3WXLA 2ZGZA 1ZBSA 4JHDB 2BTFA 2A40A 2PAVA 2P9UA 4IXCA 4LC9B 2D0PA 2ZWHA 3C0BA 4GNIA 4H0TB 5F2RA 2NLXA 4DCHA 5AQLA 1DGKN 3LDQA 5AQGA 5KPZA 4NB4A 3BEXA 2QWPA 4BRQA 3ATUA 3QMLA 1HKGA 4IJAA 4M63C 5CE3A 5F0XA 1NGGA 3WXKA 3M1FA 4BQZA 4CZIA 1HJOA 4H5RA 1HKBA 3VERA 1NGAA 3IDHA 4H0XB 5AQHA 2W41A 3CERA 1Z05A 5LJVA 3H46O 2UYTA 3BF1A 1NGDA 4I6MA 4M7XA 3ULEA 4CBUA 1IG8A 1MA9B 1LCUA 2QWQA 3FLCO 3DXMA 4RTFD 4EIAA 4PKGA 4BC4A 3CETA 1E4GT 5AQFA 2H3GX 4YDUC 2WUSA 2YHXA 3VEZA 4BROA 1G99A 2QWNA 3ZEUB 3HSCA 3ENOA 2YI1A 1BOTO 2FSJA 5AQRA 2YCHA 3AY9A 4FO0A 2P9LB 4BRLA 3M3ZA 4FWLA 3JS6A 3H3NO 2PBDA 5FPEA 4A61A 3CJAA 5ADXH 3HTVA 2ITMA 4BRDA 3BUZB 3VESA 1ATSA 3WQTA 2P9SB 4DHYA 3QDKA 3LDPA 2Q97A 3DXKA 4JD2B 4EAHD 1NMDA 5BPLA 3GDQA 3ZX2A 4BRCA 2HF4A 1BDGA 1BUPA 5FPDA 2E1YA 2E2QA 5AQUA 3WEEA 4RWTA 2QWRA 5AQTA 4QS7A 1IJJA 1ESVA 3AARA 3MN9A 3H6EA 1EQYA 1K8KA 3EL2A 3C7NA 2V7YA 3A5NC 4CD1A 2Q36A 5FPMA 4K42A 2GWKA 5AQWA 3AAPA 4FWNA 1C0FA 5AQPA 2FSNA 3DAWA 5BREA 1HKCA 1HPMA 4NO7A 3EKSA 4B1VA 4WYBA 3LDNA 4HTLA 3TU5A 1E4FT 5AQSA 3SMPA 1XQSC 1RGIA 2IVOA 4IZ9A 3VF4A 3FR0A 3L4IA 1U2VB 1BU6O 3SK3A 2QM1A 2ASOA 3H1QA 4PKHA 1BWFO 3VF2A 1MWMA 4F9OA 2P9KB 4WQ5C 3SMSA 3CQXA 3LDLA 4BRFA 3UKRB 5AQXA 4M7YA 1C0GA 2F9TA 4XH4A 3GBTA 4CZHA 2VCPA 3FE1A 5AZIA 2IVPA 3GE1A 4CZFA 4K25A 5TKYA 4PL7A 3LM2A 5BN9A 5AZJB 3O5BA 2GEMA 1KAYA 4BR9A 1CZAN 2QWLA 3HZ6A 4FWQA 1XC3A 4BG9A 3O1WA 4BRIA 1QZ6A 1QQMA 3D2FB 2FF3B 3D2EA 3O08A 2VYPA 3W0LA 2D0OA 5BRFA 1BA0A 3MN7A 4WQ5A 1JCFA 3VENA 4FL9A 1RFQA 3EZWA 2F9WA 3UE5A 1QHAA 2P9IB 4MLHA 3S41A 2I7PA 2J4RA 5EX5A 1V4TA 4BC5A 1MDUB 2V7ZA 5BRHA 4CD3A 1BG3A 4IWVA 4BRPA 3IMXA 3CJ1A 5KQ8A 3CJCA 4CZGA 2CH5A 4JHDA 1YUWA 1ZC6A 5JLFA 4BRNA 4IJNA 1NGFA 1P8ZA 3MCPA 5EOYA 4H5VA 2CGJA 4FOIA 1SQKA 2E2NA 1LOTB 4FWSA 1V4SA 3EO3A 4B1ZA 4JNEA 5FPNA 3U8XA 4MO4A 4CZEA 1YAGA 4FPAA 2A41A 1TYQB 3A0IX 4H0YB 1ZXOA 4H0PA 4H03B 4E1JA 5LY3A 2ASPA 3QFPA 3SLCA 1HUXA 1NGIA 2D4WA 2P9NA 4BRAA 3CHWA 3VEYA 1X3MA 4BC3A 5JLHA 5AQQA 2FF6A 4CZLA 2ZF5O 2Q2RA 1T6DA 2NRHA 2W40A 3FZHA 1JCEA 4BR0A 4JAXA 4BVOA 1NBWA 2QXLA 5AQIA 4YDUA 2Q0RA 4B9QA 2P9PB 2QW9A 5AFUA 1NGEA 3FZFA 3ZEUA 3RSEB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OANA 5KRSA 3NE6A 3NGIA 2NZTA 3OHRA 1Q18A 3FFKB 3CI5A 2E8AA 3HSTB 1KAXA 5BPNA 3KLGA 3ZSQA 4BRHA 4CZJA 3OYHA 3PX0A 3M8RA 4IG0A 4YY3K 3OJUA 3HJFA 1DEJA 3CG7A 3KK1A 3Q7BA 2F8TA 3M8QA 4C23A 4L8RB 3L2QA 2D1KA 3WXJA 1GLAG 1RT3A 1X9JA 4B8AB 3THYB 3VQBA 3CJBA 4FWKA 4CHYA 4FJ8A 4CJ7A 5E26A 4E0DA 4WCEL 2KFNA 3VN5A 3C6HA 4BG8A 1N36K 1Q86O 1VSDA 3AVKA 5CHIA 3PIOL 5I42A 4DU3A 2Z1JA 4FK2A 4DB3A 3IG1A 5DMRA 4J2DA 1C6VA 4CZKA 4BQLA 1HLUA 2NNWA 3DRSA 1WSEA 4JI2K 3AAQA 3L3VA 3THWB 4HUEA 1VSFA 2A42A 1BL3A 1QTMA 5DM7L 3MWPA 4MDAA 3EZ5A 3E9OA 3VETA 1NM1A 2E2PA 2ZM6K 2YHYA 4NYFA 2ZQBA 4BR2A 3NVMA 3AVHA 4CHQA 4RW8A 4BRKA 3VEOA 1VQMN 5BR9A 3VQEA 1BIUA 5TKWA 2GUIA 3MEEA 3FZKA 4X62K 3E66A 2QKKA 1G15A 4NLCA 1S22A 1BQMA 4A2AA 1QSLA 1VSKA 3GOIA 1SL1A 1DT9A 1X9SA 2P9IA 3ID8A 2P9NB 1VAZA 1J6ZA 4OVLA 4XH1A 3CYMA 4R5PA 4J2BA 1J54A 5KTQA 1KAZA 1SZ2A 3H1VX 4IFEA 3LDOA 2BUPA 1ASUA 4BGAA 3RR7A 2FXUA 1QSYA 3CQ8A 3HT3A 4KI4A 4H5WA 1KRPA 4Z4IA 3H45C 3LM9A 4PQUA 3QESA 5JS2A 3DWLA 5JENA 3PX4A 1Q8IA 2NRTA 5JVGL 3KLHA 2FBYA 1TYQA 4CBWA 1KSPA 1NG9A 4DSEA 3CCLN 1L3VA 1T44A 1TUUA 3MCAB 4M3RA 2OPRA 3AVAA 1OH6A 4C8NA 1U4BA 4ELVA 2YKNA 3M5RA 2XY6A 1QQOA 4ELTA 3I0RA 2GUPA 2JWKA 3QNOA 3QFUA 4IFYA 5AQOA 1YHQN 4JD2A 3LP3A 1HX1A 4EFHA 3WNHA 4E7IA 4EHTA 3WUHA 2P9PA 1K73O 1H1VA 1WNSA 1ATRA 1X1PA 3NBPA 2CGLA 4HWIA 1GLCG 5AZIB 2F7TA 4F2SA 5FRNA 4FVMA 4OKEA 1KLMA 3QIPA 5AQVA 1WSIA 4DV3K 1SAZA 2Z1IA 1RTHA 2E4LA 3DLBA 3RWUA 4DQQA 3V4IA 3T1HK 5HL7L 4M3UA 4M45A 5GINA 5AR0A 4IDKA 5AFUH 3IFRA 4DSKA 3UKUA 4BC2A 3VQ8A 1S1VA 4BREA 2ZGYA 2PFUA 3AO3A 2OPSA 4LF8K 3C65A 1RDUA 3THXA 1E3MA 1WUAA 4FJ5A 3TSQA 1OKJA 4HHTA 4CESA 4KV8A 4H5TA 3NGYA 3MN6A 3O4WA 4H0VB 4A62A 1HNVA 1VQPN 1JXEA 4JI6K 2P9UA 3FFIA 4C8OA 3C0BA 4JI0K 1NOZA 4FM0A 5LMNK 5F2RA 2NLXA 3QLHA 3SBTA 4JKFA 1XI1A 1EP4A 5FRMA 1C1AA 5AQGA 5KPZA 3OTOK 1HNWK 1WBBA 1TVRA 1K6YA 3WNGA 1XHXA 5CE3A 3OYIA 4DFMA 1NGGA 3RMCA 5J2QA 1BIZA 4CFAA 3LZIA 4H5RA 3OJSA 3KD1E 2BANA 5AQHA 2W41A 5LJVA 3H46O 3ULEA 4M7XA 1WSHA 3SAHA 1XWLA 2QWQA 4RTFD 4FJGA 2HBJA 2WC9A 3HXMA 2BGGA 3CETA 1E4GT 4KREA 1RT7A 1Q7YO 5AQFA 4DSJA 1VRTA 3KK7A 4BROA 4KH6A 4CIFA 3L3UA 4YOVA 4CHNA 3OYFA 2OZMA 1MU2A 4FWLA 2C1IA 3ISNC 1WAJA 3CCMN 4A61A 3CJAA 3ZSOA 1W0HA 1GOCA 5M1QA 4DUYK 2ITMA 1UA0A 4HUFA 3J80O 5JVHL 4DHYA 5GIOA 1XMOK 2VG6A 1NMDA 4CJ5A 3CCUN 2UXDK 3ASMA 3OYBA 1BDGA 2WOMA 3S3NA 3I55N 2YNGA 3JSMA 1O13A 4RWTA 4RW6A 1NK6A 2G8FA 5T7BA 5AQTA 1IJJA 2Q3SA 4GMJB 4NYNA 2NRXA 1M1KO 3SV3A 1BCMA 3A5NC 1KQSM 2Q36A 5GAHP 3OYNA 3WNFA 1JLQA 2GWKA 4FWNA 3HP9A 4NO7A 4B1VA 1KC8O 3P39A 5AQSA 3SMPA 1RGIA 3ZYYX 3L4IA 3MX2A 1BU6O 3J81O 2RE2A 1MWMA 4GV9A 4F9OA 2G8UA 4WQ5C 1RBSA 3OYAA 1RTIA 5M1OA 4IFVA 2OCEA 2HHSA 3VA0A 4F3TA 3LP1A 3JAMO 3F9KA 4JRQA 4PL7A 1J5EK 3LANA 4QAGA 3TTFA 5J2NA 3TAFA 3NAEA 2GEMA 1CZAN 2HHIA 1RBVA 4FWQA 3SUNA 4FJIA 1QZ6A 3ZT2A 3MEDA 3P83D 3D0PA 3T1YK 5A2QO 3AA2A 4WQ5A 3E9LA 3CM5A 4H4OA 1RFQA 4PA1A 4W5QA 2F9WA 4DQSA 1QHAA 2P9IB 1B9DA 1YF5L 4CFDA 3AVNA 4OGCA 1HR0K 3SJJA 1M90O 2V7ZA 3K57A 2X78A 4CD3A 4CEOA 1BG3A 3IS9A 3IMXA 1R0AA 1RILA 4JHDA 4AHSA 3O4NA 4YFUA 2XY8A 4BRNA 1P8ZA 4E19A 3WXMB 3MCPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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