2FBTA

Wrn exonuclease
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Werner syndrome helicase
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 61
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbtA00
3DI6A 4DFKA 3OYCA 1FKOA 1S9EA 1S6PA 2PYLA 3ZSOA 1RBVA 4JRQA 4JRPA 4LSLA 3D45A 4CJVA 1KFSA 4DTRA 3AO1A 1RBSA 3K5OA 2GV9A 4F2SA 2A1SA 3PV8A 4DSIA 4M3WA 3RR8A 1O1WA 1C1CA 1RDAA 1S1TA 2LSNA 1VSIA 3B6PA 4IFYA 4CGFA 4DQPA 1HJRA 1TKTA 4FJKA 4QAGA 4JS4A 1N6QA 1S5JA 4E3SA 4FXDA 4B9UA 1ZBLA 2VWKA 3RMAA 3WNHA 4DSEA 1ASVA 1VSLA 3K2PA 3L2UA 3QNOA 1LV5A 2DTUA 3NF7A 1T05A 5CYMA 2YNIA 3IG1A 3LPUA 1G15A 3L3VA 4OKKA 1QTMA 3KJVA 5J2PA 1B9DA 3QERA 5C25A 4N56A 2KZZA 1IH7A 4E7IA 4KHWA 3CM6A 5KGWA 3NGIA 3HVTA 4PY5A 4GVMA 4CJUA 4B9TA 3VQEA 3LP2A 4CESA 1LW0A 1HYVA 4CK1A 5JS2A 1IG9A 4DFMA 1DLOA 1RTDA 3DLKA 1BCMA 4JS5A 4M3XA 4FLWA 3K58A 2Z1JA 3IS9A 1NK4A 3PY8A 3S3OA 5JS1A 3V4IA 4OPKA 4XIUA 1TAUA 3RMCA 3K59A 1QHTA 1VSFA 3MEEA 3AVNA 3LPTA 4RG8A 1TAQA 4IFVA 4IG3A 4FLVA 4F2RA 4CFBA 4KREA 1B92A 1QSYA 4DSJA 1KVAA 4ELVA 1RTJA 3VN5A 3KLFA 4CFDA 3MEGA 4FLYA 4FYDA 2EX3A 4DTXA 2FC0A 3SNNA 3TAEA 1ASWA 1A5VA 1VRUA 2QKBA 4E0DA 2VG6A 4HCBA 5FDLA 1DTTA 4CJLA 2KFZA 1NKCA 1KLMA 2G8UA 4KHSA 3ULDA 2OYQA 2OZSA 1IKXA 2FBXA 2E4LA 3NH0A 3MECA 3VQBA 4Q5VA 3CG7A 3ZT4A 3HM9A 3EZ5A 3TAQA 4DTOA 4PUOA 3OYKA 3OJSA 3OYJA 3LDSA 3B6OA 3LANA 1ZBUA 3VQ5A 4AH9A 4E19A 4DTNA 3V9WA 4CHOA 3EY1A 3M8RA 1BL3A 1RDDA 2WOMA 3AVHA 2QK9A 2D0CA 2ZQBA 1C1AA 1RDCA 4Z4EA 1HPZA 4CGDA 1RTHA 3F9KA 5I42A 1RDBA 4EZ6A 2FBTA 2OA8A 1CZBA 3SI6A 1X9MA 3MEDA 4AILC 2DFHA 1U4BA 3O3FA 3LZJA 1X9SA 4DQSA 4J2EA 1ZBHA 4DTMA 3DLEA 3V1RA 4BE0A 4Z4FA 1HQUA 2RF2A 3T1AA 2BGGA 4FJXA 3KLHA 4H4OA 3RRHA 3HYFA 5FROA 2IGIA 3DRSA 1CLQA 4KI4A 2IDOA 3ZCMA 4B9SA 4WE1A 1SL2A 3AVAA 3ZT3A 4BDPA 4DSFA 1GOCA 3RR7A 2JLEA 4R5PA 1RT7A 4CIGA 1LWEA 2HHSA 3TABA 3ZSYA 3SUPA 3AA2A 2XY7A 2OPQA 5EU7A 2XY5A 4CHQA 3HPHA 2GUIA 2XHBA 1RT1A 1L3UA 4M3UA 4CGJA 4O44A 5SWMA 1KVBA 4O0JA 3ASMA 3KLIA 5KI6A 4CJQA 4CERA 2D5RA 4NYNA 2P5GA 5HRSA 3QEXA 3PX6A 1L3SA 3K5LA 3TR8A 3OYAA 3MXIA 4HVJA 1WAJA 3VQ7A 4IG0A 1FKPA 1U04A 1ASUA 1XWLA 4DFJA 1KRPA 4KHYA 4PQUA 3O4QA 4I9QA 4I7FA 5HRRA 5HRNA 3NDKA 3TWHA 1NJYA 1S6QA 4HTUA 1QE1A 2RKIA 3QIPA 4O5BA 4PWDA 2O4IA 4QOZB 4CK2A 4HUFA 1RBUA 4ICLA 4L8RB 1RT6A 4FCYA 3AA3A 2Y1IA 4Y1CA 3ZT1A 3QIOA 1S1VA 3NH2A 4KKOA 3BGRA 1RT2A 3LWLA 4FLXA 4E7LA 4DU1A 3TI0A 1BISA 4ELUA 4CEEA 4CFCA 4O0IA 3OYMA 5HLFA 4RW9A 3ZSQA 3SUNA 4KRFA 4CJ4A 3WNEA 3SCXA 4F3OA 1X1PA 4RW6A 2KW4A 1A5XA 1BCOA 3VQDA 1T7PA 4KTZA 4O4GA 1SL1A 2OPRA 3V1OA 3OS1A 1JLCA 4BDZA 3CFPA 1TK0A 1NK9A 1XI1A 4UQGA 3QINA 4CHYA 4LH4A 3C94A 1W9HA 2G8KA 2VWJA 1ITGA 2QKKA 2P5OA 3U3YA 1YTUA 3LWMA 4FVMA 4CJ5A 2XO7A 3AA5X 4KHUA 4MFBA 3CM5A 5DMRA 3VQ6A 4CJTA 4CF8A 4M3YA 3U6FA 3QESA 1UA0A 4H8KA 3OS2A 2HW3A 4EP4A 4CJPA 1I3AA 4DG1A 3K5NA 4CF9A 3SV3A 3VA3A 1J53A 4J2AA 3D0PA 3TANA 3C6TA 2YNFA 1S9GA 4NCGA 3S3NA 1REVA 4CIFA 1XHZA 5J2MA 3M8PA 3CYMA 4CHZA 4W5RA 3K57A 3QEPA 1T8EA 3V9XA 3V81A 3CFOA 1EKEA 3OYIA 1FXXA 1JLGA 3HT3A 3ZSXA 4FJHA 3OYFA 2GBZA 4FW2A 4CEAA 4CJEA 5J2QA 5J1EA 4YFUA 3RWUA 4Z4GA 1YT3A 1VSHA 5HBMA 4CCHA 1IO2A 4RW7A 1QS4A 4M45A 2W42A 2YHBA 1RBTA 4DF4A 1C0TA 3AVGA 1J9AA 3ZSRA 4E1NA 3OYBA 2A1RA 2FBVA 3JSMA 1BI4B 4ELTA 2B6AA 4CIEA 2HVHA 4CFAA 2HHTA 4FK2A 1SUQA 4KV8A 3HPGA 4AHSA 4OGEA 1D5AA 2XY8A 1QSLA 2DFEA 3KLGA 3ZSZA 1IKWA 2IS3A 5CYQA 1VSKA 3LAKA 4DWIA 3EYZA 3KLEA 3TAPA 4M3TA 4FJLA 4ZTJA 1VSDA 3LAMA 1JLAA 4OPJA 3RRGA 4DTUA 4K8ZA 4PA1A 1WN7A 3T3FA 3OYLA 3SQ1A 5FRMA 4FW1A 4W5NA 1XHXA 4AHRA 2G8IA 4J2DA 3AVCA 4I2PA 3M8SA 1GOAA 3L2QA 3FFIA 1D9FA 1J54A 3V9ZA 3QNNA 4C8NA 1TL3A 4DQRA 1NK6A 4FJ9A 1D9DA 2XY6A 1LAVA 1WSGA 3NE6A 1UA1A 2KFNA 3NF8A 1ZBIA 3VQ9A 4E7KA 2B5JA 2Y1JA 2Z1IA 1HMVA 4B08A 3CQ8A 4FM1A 2R7YA 5DK5A 1NK8A 3IAYA 3MXJA 4AHTA 4EZ9A 3MXMA 2D0AA 3VQAA 2HHUA 3V9SA 1TV6A 4FM0A 1EX4A 4GW6A 3KD5E 1GOBA 1LW2A 1RT4A 4FLUA 2P1JA 3LP1A 5FRNA 3LALA 4FZZA 1RT3A 1TKZA 4KO0A 4K8XA 1DTQA 1EXQA 1RNHA 1EP4A 3TAMA 4CGGA 4M3RA 4Z0UA 3AA4A 1C6VA 4CGHA 4DTSA 4C8MA 3DLRA 2BDPA 1IKVA 4DF8A 4F3TA 2HNDA 1VRTA 1JKHA 3AO3A 3KKSA 1LAWA 1BGXT 3P83D 4FJ8A 1BIZA 3C6UA 1S1UA 3VQ4A 3L2RA 3PUFA 2HHWA 3L2VA 4BE2A 1HYZA 3ZSWA 4FJJA 4DLGA 4KHQA 3DLGA 4DFPA 5T7BA 4HUEA 1R0AA 4FZXC 1SKWA 4OVLA 3O3GA 5K14A 3OYNA 4IKFA 2F8SA 4ID1A 4JLHA 2HHVA 3P5JA 2OPPA 1CXUA 4N5SA 4CJRA 4OKJA 1YTAA 1YVUA 4KTWA 3ZT0A 4CE9A 1KTQA 5SZTA 3HXMA 3NHGA 1U45A 2PYJA 4CECA 2YKMA 4C8LA 3DYAA 1NOZA 3QETA 1NJWA 4CHPA 3HK2A 2AJQA 2F96A 1ZBFA 4Z4HA 1JL2A 1JLFA 2ITGA 3QO9A 2ATQA 2P51A 1VSMA 4FJIA 3ZT2A 3THVA 3G0ZA 1NKEA 1NJXA 4LSNA 4Y1DA 3KK2A 2HHXA 2DY4A 2IOCA 2PZSA 1TVRA 2KZMA 1KCFA 3PX0A 3LP3A 4M41A 3I0SA 2F8TA 4AHUA 3DOKA 3SQ4A 1BQMA 4BWJA 1I39A 4CJKA 3OYHA 1TGOA 2OZMA 4FJ5A 4N41A 4FK4A 4QCLA 2X6NA 4DMNA 1TL1A 3SZ2A 4E7HA 3DLBA 4LD0A 4BE1A 3S9HA 1B9FA 3U3GA 1WLJA 1T03A 1RT5A 4B9LA 2G8HA 3L2WA 4NCAA 1JL1A 1X9WA 4DSKA 3AVLA 4M42A 1F21A 3OS0A 1UOCA 3DRPA 4CEFA 4DSLA 3NCIA 1WNSA 4BDYA 3RMBA 3K5MA 3AVMA 4B8AB 3HJFA 1NK7A 1KSPA 4KB0A 3HSTB 4DS5A 4B9MA 2Z1HA 3ALYA 3H08A 3IRXA 3CFRA 3OVNA 4F4KA 1Z25A 2BE2A 1NK5A 2I5JA 3I0RA 3AVIA 3DOLA 4KI6A 1C0MA 1FK9A 5CZ1A 5HP1A 3ITHA 3HVRA 3NGYA 4B9NA 1MU2A 4OJRA 3SPZA 1U48A 3QEVA 1A5WA 4CF1A 3O3HA 4ZTFA 1WAFA 4KB1A 4G1QA 4AHVA 3SUQA 4KHNA 1BI4A 1S1WA 5C42A 3C95A 3QLHA 1HNVA 3I8DA 4H4MA 3RTVA 3NF6A 1TK8A 4CJFA 1LWCA 4I2QA 1J5OA 5HRPA 4B9VA 4CEDA 3AO4A 3LZIA 2X6SA 3AVJA 4OKEA 3DMJA 4CJSA 3L3UA 4EP5A 2YV0X 5C24A 3TARA 2RN2A 3KK3A 1Z26A 3HL8A 4Z4CA 4FJ7A 3AVKA 1KLNA 4DQIA 5KRSA 2YNHA 1U47A 3PO5A 4OGCA 1C0UA 1BQNA 4FJMA 3SV4A 2VG7A 1W0HA 2OPSA 4CJWA 3V1QA 4RW4A 2D0BA 2ZE2A 3WNFA 4KFBA 2IAJA 3SPYA 1L3TA 1TK5A 2HMIA 3E01A 4B8CA 3BDPA 1NOYA 3AO2A 1K6YA 4GMJB 1SL0A 2EHGA 4IBNA 2IC3A 1WSFA 4W5OA 1KFDA 1WSJA 1CZ9A 3SYZA 4FJGA 4CHNA 3HO1A 2E6LA 2KTQA 3MAQA 4DQQA 1LWFA 3OYDA 1RBRA 1U49A 1BIUA 3P1GA 3LP0A 5D3GA 4NYFA 1TKDA 2Z1GA 3F73A 4I9LA 4C8OA 1WSHA 4CF0A 1HRHA 4AHCA 4M3ZA 3HP9A 3OY9A 3SQ2A 4FK0A 4CK3A 2E6MA 4E1MA 3KD1E 3NBPA 3VQQA 2WONA 4HCCA 2G8WA 4KAZA 4Z4IA 5CZ2A 3QEWA 2JGUA 3O4NA 4CEBA 3DLHA 3S3MA 3ISNC 1L5UA 3WNGA 4ZHRA 4CF2A 1L3VA 3HP6A 3M8QA 4FLZA 3V9UA 2B4JA 4J2BA 4KTQA 1UWBA 3TAGA 2YNGA 3NH1A 3RMDA 4F8RA 3SUOA 4FJNA 1VSJA 2XRIA 3A2FA 1SKSA 1S1XA 1SV5A 4BACA 3OYGA 5J2NA 2X78A 1KVCA 3KK1A 3TAFA 1RTIA 2HNYA 1NKBA 1WSIA 2YKNA 4FZYA 4RW8A 2QXFA 3AO5A 4N47A 1XC9A 4FLTA 1Q9YA 4DLEA 5KRTA 5E41A 4NCBA 4CEZA 3KIOA 4ID5A 4CJ3A 4Q0BA 2HNZA 1Y97A 5HROA 1EETA 3SQ0A 3UIQA 4KPYA 3DRRA 3DM2A 2NUBA 3HPOA 1HQEA 3G10A 3NAEA 1HYSA 3QEIA 2RPIA 4CEQA 3KKRA 3OYEA 5KGXA 4OLAA 3VQPA 1JXEA 4DU3A 1N5YA 3VQ8A 4IDKA 3ZSVA 2VG5A 4YNQA 3V6DA 3AVFA 4N76A 4LY7A 3OJUA 2HVIA 5I3UA 4DU4A 2YHAA 3KTQA 2DFFA 2ETJA 4CGIA 3L8BA 3NF9A 2BANA 1HNIA 1SKRA 2O4GA 1JLEA 3VA0A 1QQCA 3PO4A 1VK0A 2HHQA 3SJJA 1IKYA 3NFAA 4HHTA 1Q9XA 4E89A 4CEOA 4HUGA 1JXBA 4BWMA 4E7JA 3JYTA 1UAXA 4DTJA 3AV9A 3PX4A 1NJZA 2ZD1A 2X74A 1C1BA 1VSEA 4O55A 1NK0A 4OLBA 3NGZA 2KQ2A 1RCHA 4DS4A 3T19A 2G8FA 5KTQA 1BHLA 3VQCA 2FBYA 1D8YA 1QSSA 1JLQA 4C8KA 4DTPA 1RILA 4W5TA 2PY5A 2G8VA 4B3OA 5CY4A 1JLBA 1CXQA 2HB5A 4TSXA 1ZYQA 1WSEA 4FM2A 1TKXA 4MQ3A 4W5QA 2Q3SA 1Q8IA 3AVBA 4LH5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DI6A 4DFKA 3OYCA 4DV2K 5AR0A 1T44A 3K5OA 4PHTX 4DQPA 1VSIA 4BC4A 2GELA 3WXIA 4NXNK 2Q97A 3C0BA 1N6QA 2D0PA 3ID6A 4E3SA 3CF5L 3VEOA 1ZBLA 2V52B 1LV5A 1T05A 2VQEK 2YNIA 3O8MA 5AQHA 5JVHL 2P9UB 5C25A 4N56A 1I94K 2JWKA 4CJUA 4B3TK 3T7ZA 3GG4A 4DFMA 5LJVA 1RTDA 1BCMA 1NK4A 4A5AA 4YDUC 3V4IA 2HOEA 3AVNA 3R1XA 4IFVA 4KREA 1KVAA 3FZLA 3VN5A 4WQ4C 4CFDA 4FLYA 4X62K 3D7EO 3SNNA 5F1XA 1E3MA 4E0DA 4O8UA 5FDLA 1DGKN 1DTTA 3BF1A 4CJLA 3ULDA 4FOEA 2FBXA 3NH0A 3MECA 1MWKA 3TAQA 4IWVA 1DKGD 4FWOA 1ZBUA 1RDDA 1C1AA 3L6QA 4DV0K 3PIPL 4JI3K 1RDBA 3SI6A 1X9MA 4AILC 2E5LK 2O8BA 3O3FA 3LZJA 4DQSA 4DV6K 1ZBHA 1NGGA 3V1RA 2FLOA 1HQUA 2RF2A 3CJCA 3HYFA 4XH5A 5AQXA 3ZCMA 4B9SA 4NO7A 5A2QO 1RT7A 4CIGA 1LWEA 2QA4N 3C6HA 1D4XA 5M1PA 5AZJA 2OPQA 5EU7A 2QM1A 1NLVA 4GKKK 5ADXA 5SWMA 4CERA 3O4WA 5HRSA 3PX6A 4JKGA 3VQ7A 1ASUA 4KHYA 1VHXA 1YI2N 5AQQA 2NLXA 5HRRA 4HTUA 2RKIA 1K9MO 3A8YA 2ZJQL 2NNWA 3VOVA 3U4LA 4CZGA 4B3MK 4FWMA 1RT6A 1HKGA 4C1NK 4Y1CA 1NK7A 3QIOA 1S1VA 3TI0A 1EWQA 1BISA 1GLBG 3OYMA 2VYPA 5ADXH 4YY3K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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