3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Conserved archaeal protein
publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
source organism Methanococcus maripaludis s2
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
2E2PA 3IUCA 3O8MA 3G25A 3UKRA 5BPMA 2NZTA 3BEXA 1NGJA 3ZETA 2FXUA 1NGCA 3P4IA 1Q18A 3A5OC 4JHDB 4CI6A 1E4FT 4DCHA 3DXKA 2Q0RA 2YCHA 3CETA 4DQ8A 4FWRA 3U8XA 4J8FA 3CERA 4FPBA 3ZX2A 5AQKA 2P9UA 2P9SA 2Q1NA 4BVPA 4BG9A 2GTDA 3H1QA 4BRIA 2A6AA 4B1XB 1BU6O 3D2EA 1DKGD 3LDNA 4IXCA 4QS9A 2OANA 1RGIA 4I6MA 1OKJA 3M3ZA 5FPMA 1LCUA 2ZGYA 5AZIA 5AQNA 2A41A 5TKYA 2V7YA 3FZKA 2J4RA 4WQ4A 3VGLA 3FZLA 3KVGA 4BROA 4BG8A 1ATSA 1QQMA 4CJ7A 4CZMA 2DPNA 2KHOA 3R9PA 2P9KA 2FLOA 2E8AA 5JLFA 1C0GA 4ISFA 3A5MC 5LJVA 2ZF5O 5B8HA 3WXJA 3HM8A 5AQPA 3UKRB 3I33A 2E2OA 4FWOA 3FZFA 3LDLA 1GLBG 4JD2B 3ZETB 5AQOA 5ADXA 2CH6A 2BTFA 4XH5A 4BC5A 5KQDA 4FL9A 1HJOA 2E2QA 3FFKB 4H0XB 2CGKA 3DXKB 3VEYA 3MDQA 3MCPA 2IIRA 2FSJA 3IFRA 5AQUA 1SQKA 4HWIA 2P9UB 2VCPA 3VEOA 3ID8A 3WQUA 5F1XA 5AQIA 4DHYA 4MLHA 5EX5A 4BRCA 2HMPA 1KAYA 4M63C 4KBOA 1IG8A 3WEEA 5BPLA 2QXLA 3D2EB 3TU5A 4BGAA 5LJWA 4FWSA 4CZFA 3WXLA 4AM7A 3VENA 3BF3A 5EXWA 3CQYA 4O5FA 5AZIB 4H5WA 2YHWA 4H5RA 4EIAA 1H1VA 1T6DA 2ASOA 2Q36A 3EL2A 3O6WA 4BRKA 3CI5A 4LC9B 4BC2A 3M1FA 3EKUA 3H3NO 2E20A 1T44A 1C0FA 2A42A 2P9KB 3SK3A 2E1ZA 1DEJA 2PAVA 2BUPA 3FLCO 5KQ8A 4H0TB 2YHXA 1WOQA 2AA4A 4BRFA 5JMVA 3QBXA 1G99A 1GLEG 3S41A 4BRNA 3VF4A 2P9LA 4WQ4C 1MWMA 3SMPA 4E1JA 3VESA 3O80A 4BR5A 1D4XA 3BP8A 1LOTB 1JCEA 2QWQA 2Q2RA 4NB4A 2AP1A 5AQVA 1HPMA 4IJNA 3VETA 4EAHD 3O4WA 1TYQA 3GOIA 4K42A 5AQTA 3UE5A 3AAPA 4M7YA 3L0QA 3MN9A 4BRQA 1BO5O 1Z05A 2QWPA 3AARA 3GDQA 2E88A 3WEEB 4BR9A 3RSEA 3GG4A 2ASPA 1XUPO 4FWNA 1EQYA 3EZWA 4FO0A 5BREA 1YUWA 1KXPA 2W41A 5EVZA 4K41A 2I7NA 1P8ZA 3FZHA 4PKHA 3CJAA 4MO5A 3A5LC 4FWPA 4MO4A 5AQHA 3FR0A 3O1WA 2D4WA 1GLLO 3D2FA 4M7XA 4FWKA 5AQGA 4CBWA 1MDUB 4B9QA 2QWRA 2PBDA 5FPNA 2W40A 4BGBA 4BC3A 2A40A 2Q0UA 3H46O 3MN5A 4RTFD 1ZC6A 4FOEA 5BRHA 3R8EA 1DGKN 3M6GA 4BC4A 5BPNA 1NGIA 3EN9A 5F0XA 2GWKA 2E1YA 3MN6A 2QW9A 1RDWX 2QWNA 2VWBA 4B1ZA 2ZWHA 1TYQB 3OHRA 5AQFA 1XQSC 2D0PA 4WQ5A 2P9PA 3QBWA 5AR0A 3UKUA 1BA0A 4GNIA 2HOEA 4PL8A 3U9DA 3CJCA 3IMXA 2V51B 3HI0A 1HKCA 1NGHA 2P9IA 4ISGA 2YJEA 5EY4A 2YI1A 3HBTA 3O5BA 2A3ZA 1U6ZA 3AAQA 3LDOA 4XEIA 5CE3A 1Z6RA 4Z94A 3C7NA 3LDQA 3CJ1A 5AQQA 1YAGA 5E26A 2FSKA 4BRGA 3LM9A 3ATUA 3H1VX 4CZLA 1IJJA 5BN8A 2P9SB 1BG3A 3FGUA 1R59O 2YJFA 3H6EA 2D1KA 1HLUA 4Y0WA 3ULEA 4BREA 5AQWA 5AQLA 3QMLA 3KZBA 3ZX0A 1ZBSA 4I6MB 3WUHA 3ENOA 4IJAA 3HSCA 4O8KA 4PL7A 4EHTA 4BRDA 1TUYA 1Y64A 5F2RA 4K25A 3VGKA 3CJ9A 2CGLA 4RWTA 4QS7A 3ATVA 3WQTA 2A5XA 4FWLA 5FPEA 1WUAA 5AQZA 3KHYA 5I9EB 2P9PB 3B8AX 4FWQA 4MLEA 3UKUB 2GELA 3A8YA 3MMVA 3J8AA 4BR7A 2ASMA 4BRMA 3CIPA 4B1YB 4BVOA 3VERA 4PKGA 5EOYA 4QS8A 1NGGA 1V4TA 2P9IB 3BF1A 4CZHA 4JHDA 4A62A 1X9JA 5ADXH 2ITMA 4B1VA 4H0PA 2V7ZA 4IZ9A 4WQ5C 4CZJA 3C7NB 3UB5A 3A0IX 5BRFA 1NWKA 3QDKA 4CBXA 2HF4A 2IVOA 5AZJA 1JCGA 1HKBA 4JNEA 4BQLA 3BUZB 3JXUA 3ULEB 1V4SA 5ELZA 3IDHA 3VEVA 5BN9A 4CZIA 1BOTO 1NM1A 4NO7A 4WYBA 3VEWA 4BRHA 4BR2A 3ZX3A 3U9ZA 1BA1A 4CBUA 3QFPA 3H45C 3QB0A 2I7PA 1QZ5A 3U4LA 3VF6A 4GY2B 3L4IA 4B1WB 4HTLA 4BQZA 2WUSA 3WT0A 3D7EO 2EWSA 4H0VB 1S22A 1XC3A 4FOIA 1BDGA 1GLCG 5AFUH 1S3XA 3O1BA 4JD2A 2QM1A 1T6CA 2CGJA 2QWLA 2P9LB 3MK6A 1HUXA 4H5VA 1YXQA 4L3QA 4BRPA 4CZEA 4B1UB 4CZGA 3FE1A 1GLDG 2QWOA 1BWFO 3DXMA 1NGEA 1YVNA 2IVPA 4DB3A 1MA9B 4YDUA 3VOVA 1J6ZA 1K8KA 3TPQA 5FPDA 1MWKA 5KPTA 5AZJB 4CD1A 3CHWA 3DJCA 3HZ6A 3RSEB 4BRLA 1QQOA 4EFHA 1ATNA 2FSNA 4H5TA 3VGMA 1U2VA 2GUPA 4IO8A 4H0OA 3WXKA 2Q97A 4EHUA 2VYPA 3DWLA 1TUUA 3O08A 3QICA 4XH4A 1JCFA 3ZEUA 1GLAG 1KAXA 3ENHA 3C0BA 3D2FB 1NBWA 3W3DA 5E84A 4ISEA 4PKIA 3SLCA 1NGDA 4H03B 3L6QA 2ZGZA 3A5NC 4BR4A 5AQRA 4K43A 3H3OB 4A2BA 1X3NA 2P9NA 3VPZA 2UYTA 1QHAA 1ATRA 2NLXA 3LL3A 2F9WA 3DXMB 2NRHA 4XH1A 1ZXOA 5AQSA 1GLJO 2CH5A 1HX1A 3VEXA 1K8KB 5LY3A 1KAZA 2HF3A 2F9TA 1NGBA 1NLVA 3CJBA 5AQJA 5KPZA 3CQXA 3GL1A 3F9MA 2FF6A 1E4GT 5JLHA 1SZ2A 1U2VB 5AQYA 4FSVA 3AY9A 1X3MA 3SMSA 3R6MA 4YDUC 5BRDA 4AM6A 4BRAA 3GE1A 3EO3A 1HKGA 2Q31A 3ZEUB 3QFUA 4JAXA 3MN7A 3WXIA 4JN4A 5AQMA 5AQXA 2E2NA 2GEMA 5AFUA 3LDPA 2H3GX 3DAWA 3VF2A 4CD3A 4FPAA 2IVNA 4C23A 4FWMA 3HTVA 3JS6A 4F9OA 2V52B 3CJ7A 1QQNA 3GBTA 2P9NB 5KPRA 1GLFO 1BUPA 4H5NA 3FZMA 3W0LA 2FF3B 1CZAN 1NMDA 4H0YB 4A2AA 5BR9A 3LM2A 4RCHA 4IWVA 4A61A 2GWJA 2YHYA 1RFQA 1NGAA 3SJHA 3EKSA 4BR0A 1ESVA 1SAZA 4CZKA 1NGFA 2QWMA 1QZ6A 2D0OA 3I8BA 5JICA 3VEZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L3VA 3DRPA 1BL3A 5BPMA 1TK8A 2NZTA 4JKEA 1L3SA 2OA8A 2ZQBA 2JWLA 5J2NA 3TAPA 3MECA 4CI6A 4FZXC 3VQAA 4LFAK 4JKGA 3PX4A 1KLNA 3CERA 3KLIA 3ZSOA 2P9SA 4BG9A 1GOCA 2GTDA 4BRIA 4B1XB 3M8RA 1NKEA 1L3UA 4B9MA 3LDNA 5DM7L 1GOAA 2OANA 3NMUA 4I6MA 1T3VA 1OKJA 4KHWA 1A5WA 1EKEA 3CMEN 2O8EB 2FC0A 4FW2A 4DV3K 5AZIA 5AQNA 1R0AA 3P5JA 3FZKA 2J4RA 4WQ4A 3AVAA 1WB9A 3FZLA 3THWA 3HXMA 3MEDA 3SPYA 2YX6A 2OYQA 4CJ7A 4CZMA 4CHYA 2QKBA 3R9PA 1D5AA 2P9KA 4AH9A 4ISFA 5LJVA 2ZF5O 5B8HA 3WXJA 2RF2A 1I39A 2Q3SA 3I33A 3NF7A 4CECA 3DLHA 5HOOA 4JLHA 5AQOA 4BC5A 5KQDA 4FL9A 3OYEA 3KK1A 1W0HA 4H0XB 2CGKA 3EE9A 3VQCA 3PIPL 4N47A 4HWIA 4FZZA 2ZM6K 3PLAA 2PFUA 2P9UB 5CZ2A 3WNFA 1UAXA 4BRCA 4DFJA 2HMPA 4LH5A 4FLWA 3CFRA 3THYB 4KBOA 5BPLA 4FLYA 3WNHA 1WSEA 2QXLA 4A59A 3TU5A 5HROA 5I42A 1RBTA 3G10A 4BGAA 5LJWA 1D8YA 2HHSA 3CCSN 1EO1A 3VENA 3ZSYA 5K14A 3JAMO 3OYMA 3QEXA 4LFBK 1TAUA 2Q36A 1ASUA 3FFIA 1QTMA 3AGRA 5CYMA 3M1FA 2OPSA 4K8XA 4F8RA 3OYFA 4KFBA 1VSKA 2PAVA 1L3TA 5KQ8A 5JMVA 3I56N 4E7LA 1XWLA 3NAEA 1BIUA 3VN5A 4JRQA 3RRGA 1HYSA 4AHRA 3NBPA 4FLZA 2E6LA 1LOTB 2QWQA 4FJJA 4Q0BA 3WXMB 5J2MA 2AP1A 1IG9A 3T7ZA 4EZ6A 4IJNA 1TYQA 3OTOK 2FBTA 3QEVA 3MN9A 3E66A 1S1VA 3I55N 4B3OA 3AARA 1ZBLA 4BR9A 3TSUA 3RSEA 4CGHA 4FWNA 2ASPA 1LV5A 1TL3A 4BACA 2DFFA 1YTAA 1HR0K 4PKHA 4PUOA 4LD0A 2KW4A 2IAJA 5AQHA 3FR0A 3R3LA 1DTQA 4DU3A 4FWKA 1YT3A 3RR7A 1VK0A 1WSFA 4B9SA 4CJQA 2P51A 3TR8A 3H46O 4MDBA 3BZCA 3VQQA 3R8EA 4Z4CA 4FLTA 5C15A 3M6GA 3ZSQA 3KTQA 4E19A 3AO3A 4OPHA 4CJSA 4OLAA 2VWBA 5J1EA 1Z25A 5HBMA 2ZWHA 5AQFA 1BCMA 3N4PA 1XQSC 3E9PA 4FJ9A 2NRWA 3IMXA 3MEGA 3CG7A 3HI0A 1HKCA 4CF9A 2P9IA 3ZT1A 3ZT4A 3Q7BA 5EY4A 1CLQA 3SV3A 5LL6Z 1BIZA 4CJFA 4F2RA 5CE3A 4UY8O 3L4QA 4DLEA 3C7NA 3LDQA 2KTQA 5AQQA 4JS4A 1C1BA 3LM9A 3ATUA 3H1VX 3OBYA 4CZLA 5C10A 1BG3A 1HYZA 1R59O 2YJFA 3O4NA 4CIEA 3OYJA 4KH6A 4BREA 1K6YA 3SNNA 1IKWA 1L3VA 3ZX0A 1FKPA 3WUHA 2OPPA 4CJTA 4AHCA 2NRZA 1U04A 1N32K 3ZSZA 4RW7A 3WQTA 1WUAA 3CQ8A 3ASMA 4E7IA 5AQZA 3QO9A 2WC9A 3B6OA 3CC4N 3SUNA 3KLFA 4DMNA 3UKUB 5C25A 3DLEA 1VSEA 2KZMA 2ASMA 1RBVA 4PKGA 4QS8A 4CFCA 3O9UA 4KKOA 4OLBA 4JI4K 4JHDA 1X9JA 1TVRA 3ZSRA 4WQ5C 4PQUA 4CCHA 4CBXA 2HF4A 2IVOA 4MDAA 1NMNA 2VQFK 4BDYA 4AQYK 5AZJA 4CJ5A 1Y97A 1N33K 4BQLA 2YHAA 4FW1A 3ULEB 1V4SA 3S3MA 1X9SA 3VEVA 4E0DA 2ZJQL 4NO7A 4WYBA 1T03A 3MXMA 3SPZA 4CBUA 2HBKA 4OKKA 2Z1JA 4DTPA 4IFVA 3CCRN 1S1WA 3TI0A 3AV9A 1QSLA 3L4IA 5CR4A 1NJZA 2FBVA 5HRSA 3LDSA 1C0TA 3R1XA 1NOYA 5HRRA 3NVKA 1RT5A 3MX5A 2KQ2A 1KRPA 1S22A 2O8FB 1SL2A 5IT9O 1JL1A 4FOIA 1GLCG 1S3XA 3V81A 3U3GA 3V1OA 2CGJA 3MK6A 4L3QA 3MXIA 4LF4K 4BWMA 1NG9A 3FE1A 1Q86O 1S1UA 1IKXA 2B4JA 1BWFO 3DXMA 1NGEA 4RW4A 3U3YA 1MA9B 4DV4K 5CY4A 5C12A 1VQMN 4B8CA 2X74A 3CM6A 3HZ6A 3G0ZA 3J81O 1Q8IA 4EFHA 1ATNA 1WAFA 3L2RA 1U2VA 2G8HA 4FYDA 2GUPA 3K9KA 4H0OA 2DFHA 3WXKA 1EETA 2VYPA 4CEDA 5GAGP 1RTHA 4DTUA 4FM0A 3W3DA 4Q5VA 3UIQA 3DOKA 1NJWA 5M1PA 1U47A 4ISEA 2KLAA 5T7BA 3EYZA 1YJ9N 2VGMA 3DLRA 5CZ1A 2D5RA 4Z4FA 2XO7A 3TAFA 3NE6A 4J2EA 1QHAA 4DFMA 4CJ4A 4IDKA 3SV4A 3IRXA 1VQ4N 1KVAA 2FBXA 4L8RB 4JK9A 5AQSA 3VEXA 1K8KB 2HBMA 3QEWA 1KAZA 1VQ9N 3HPGA 3A2FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1RT3 A;  5TKW A;  4Z4G A;  4CJP A;  4CK3 A;  3QEI A;  1G15 A;  5ADX H;  4B1V A;  2OPR A;  4OGC A;  1XHX A;  3QES A;  3A0I X;  3KD5 E;  5BRF A;  3QDK A;  3LAN A;  3CCU N;  1XI1 A;  3LAK A;  1DTT A;  2NRX A;  1EP4 A;  3OYB A;  4N41 A;  5E41 A;  1S9G A;  3JXU A;  3KLG A;  2HHH K;  5ELZ A;  3AA3 A;  4DR2 K;  1HNV A;  3ZT2 A;  1YJW N;  1NM1 A;  1RT2 A;  4DQP A;  5KTQ A;  1KFS A;  4DF8 A;  3H45 C;  3O3F A;  2F8S A;  2I7P A;  2A1R A;  4GKK K;  4OJR A;  2XY5 A;  1BQN A;  1Z26 A;  3LP3 A;  2RE2 A;  2WUS A;  4OPA A;  3WT0 A;  5GIP A;  3SZ2 A;  3D7E O;  4FLV A;  2EWS A;  3AO1 A;  2E5L K;  3HK2 A;  1XC3 A;  5AFU H;  4JD2 A;  3SUO A;  2W6L A;  1T6C A;  1GLD G;  2IS3 A;  1UA1 A;  1KCF A;  4YDU A;  3VOV A;  4DUZ K;  1K8K A;  3TPQ A;  4JI5 K;  4C1N I;  1A5X A;  4NCG A;  3CHW A;  3PSF A;  3RWU A;  3SAH A;  1LWF A;  4LF9 K;  4NXM K;  4QCL A;  3ID6 A;  4IO8 A;  4CHQ A;  3AGK A;  3QIP A;  4EHU A;  4KHP K;  1TUU A;  3QIC A;  1VQ7 N;  1N5Y A;  2OPQ A;  1GLA G;  3ZEU A;  3ENH A;  3ZSV A;  3C0B A;  1C6V A;  4C8L A;  3D2F B;  1NBW A;  4LF6 K;  4CIF A;  3DLL L;  2BH1 A;  3L3U A;  2PZS A;  2ITG A;  2JWK A;  4PKI A;  5HRP A;  3PO4 A;  3ITH A;  1VSD A;  4H03 B;  5GIO A;  4K43 A;  2PY5 A;  1XHZ A;  4I2Q A;  4I9L A;  3HL8 A;  5C2F A;  1LW2 A;  1MU2 A;  2HHU A;  4HUE A;  4YNQ A;  4XH1 A;  1YJN N;  1JLC A;  2HF3 A;  2F9T A;  3HOS A;  1NGB A;  3K58 A;  3CQX A;  1JJ2 M;  2VWK A;  3F5T A;  1RDC A;  2FF6 A;  3DOL A;  2QXF A;  2HB5 A;  1SZ2 A;  4FLX A;  2IC3 A;  1X3M A;  5BRD A;  3HPO A;  2Q31 A;  2G8V A;  4NCA A;  4JI0 K;  2HHW A;  3U6F A;  3WXI A;  1O13 A;  4JN4 A;  3OYA A;  3SQ1 A;  5I3U A;  1EWR A;  5AFU A;  1TKX A;  3DAW A;  3LDP A;  4Z4H A;  4FPA A;  2IVN A;  4FJX A;  3CF5 L;  3KJV A;  1WN7 A;  2HVI A;  1YTU A;  3CJ7 A;  1QQN A;  5BR8 K;  3ULD A;  1BGX T;  4BE1 A;  2P9N B;  5FDL A;  4A2A A;  4HCC A;  3LM2 A;  4IWV A;  4B3S K;  1NGA A;  3EKS A;  4DV1 K;  3C6H A;  1QZ6 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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