4M7XA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Type II pantothenate kinase
publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 98
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA01
3UE5A 4DQ8A 3FFKB 5E84A 4BR9A 4MLHA 1QZ6A 2AA4A 5E26A 1QQMA 3CJ7A 4FO0A 3A5LC 3SLCA 1ZBSA 4CZKA 3WQTA 2P9UA 2PBDA 1QQNA 4BQLA 5EOYA 3H1VX 1SQKA 2Q1NA 2NRHA 5AR0A 1NGEA 1ZC6A 2Q36A 4FOEA 3FLCO 3G25A 1Y64A 5BPMA 1BUPA 4B1VA 4F9OA 1S3XA 5BN8A 5JICA 3VEZA 3RSEB 3BP8A 5AQVA 2HF3A 3U8XA 3ZEUA 4H03B 4CZMA 1MWKA 4JNEA 3VOVA 4H0XB 4XH4A 5AQYA 4BC4A 5ADXH 1ATNA 3U9ZA 4A2BA 3BF3A 4A2AA 4B1ZA 4RTFD 3VEVA 3FZFA 4K43A 4B9QA 5I9EB 1T6CA 3EL2A 3VGLA 3A8YA 2A40A 3LL3A 4JHDB 3U9DA 1CZAN 2CGKA 3MN9A 3MN6A 2A41A 5FPEA 1GLAG 4BRDA 4DCHA 4ISGA 4CZEA 1MDUB 2P9SA 3FGUA 3BEXA 3ZX0A 4BR0A 3WEEB 4IO8A 5FPMA 4BR2A 4PKGA 1T6DA 4XEIA 3WXJA 4B1XB 2V7ZA 3DXKA 3ENOA 1C0FA 2FXUA 2WUSA 5KPZA 4K42A 3L4IA 4CZHA 3WXLA 2ASMA 3UKRA 2CGLA 2Q0RA 5AQUA 4CJ7A 4PL8A 5AQRA 1D4XA 3QFPA 5BRDA 1U2VA 1RFQA 4J8FA 1NLVA 2P9IA 1G99A 4BRPA 4HTLA 2I7NA 3VERA 5ELZA 3VGMA 4WQ5C 3JXUA 1Z6RA 1BG3A 1LCUA 1TYQB 2IVPA 3CERA 1BU6O 4CBUA 4MO5A 4QS9A 4RCHA 1J6ZA 4BR5A 3FE1A 3H1QA 3H3OB 3QBXA 5B8HA 1BOTO 3LM9A 5LJWA 1YVNA 3VENA 5JLFA 4E1JA 1QZ5A 1GLFO 1HJOA 5BRHA 1C0GA 5BREA 3LDOA 3WQUA 5LJVA 1NBWA 2J4RA 4FPBA 4JHDA 4BC5A 3EO3A 1GLDG 5F1XA 3GE1A 4A62A 1E4FT 5AQIA 1XQSC 3IFRA 2BTFA 5AZJA 3WEEA 1BWFO 4H5WA 2QM1A 3UB5A 1NGFA 4DB3A 3FZLA 2QWQA 4FL9A 3D7EO 3H3NO 3WXIA 3CHWA 4H0VB 5AQPA 3AAQA 2KHOA 3FR0A 1NGCA 4RWTA 3H46O 2P9PB 2FSJA 2V51B 3VGKA 2QWLA 2W40A 3TU5A 4FPAA 2Q97A 1TUUA 4BRAA 4BRGA 5EVZA 4EIAA 1RGIA 5JLHA 3LDPA 4FWQA 3CJBA 4JN4A 4EAHD 5BPNA 2GELA 3H6EA 3HBTA 4JD2B 1BA1A 2D4WA 2E2OA 3CI5A 2ZGYA 2OANA 4B1WB 1NMDA 3O08A 1HX1A 4M7YA 3SMPA 3GDQA 3UKUB 3HI0A 3QB0A 3WUHA 3F9MA 3CETA 3HZ6A 3AAPA 4A61A 2FF3B 2NLXA 3DXMA 3VEWA 3HM8A 4ISFA 5LY3A 4WQ4C 3VF6A 2CGJA 1XUPO 2V52B 4FOIA 2E88A 3EKSA 4WQ5A 1HLUA 3EN9A 2A3ZA 4H5TA 4FWNA 3B8AX 4YDUC 5EXWA 1IG8A 3ID8A 5FPNA 2HMPA 1K8KB 2FSKA 2HOEA 5AQXA 4KBOA 2P9KB 3FZHA 3MN5A 3ZETB 1DEJA 3GG4A 3TPQA 5BRFA 3C0BA 1DGKN 2P9NB 5FPDA 1HUXA 1P8ZA 3VEXA 2CH5A 4XH1A 1T44A 5F0XA 1NGJA 3VPZA 4CD3A 1NWKA 2GWJA 4HWIA 1NM1A 2QXLA 5AQMA 3ULEA 2GUPA 3LDLA 5BN9A 3D2FB 1V4TA 4GNIA 1YUWA 2E8AA 2E1ZA 2P9LA 2ASOA 3QFUA 4FWSA 2P9PA 1HKBA 5BR9A 2NZTA 1Z05A 3VESA 4BRIA 2FLOA 2QWNA 1NGBA 3LM2A 2E20A 4EHUA 1Q18A 4BR7A 4JD2A 2D0OA 4K25A 5TKYA 2H3GX 1WUAA 4BGAA 2Q2RA 4H0PA 3M1FA 2Q0UA 3UKUA 3AARA 1HPMA 4M63C 3KHYA 1YAGA 3QMLA 3FZMA 3A5MC 1BO5O 3R8EA 3RSEA 2IIRA 4FWOA 4LC9B 4FWKA 3VEOA 4BQZA 1KXPA 4ISEA 2ZWHA 1JCGA 2GEMA 1ATSA 4B1YB 4CBWA 3QBWA 2QW9A 1GLCG 4BROA 3O6WA 5AQWA 5AZIB 3O1WA 2QWRA 3ZX3A 4QS7A 2CH6A 3GBTA 4BC3A 1K8KA 5KPRA 1LOTB 5AQQA 2QWOA 3ZETA 3WT0A 3ATVA 4BVOA 1JCEA 2QWPA 2UYTA 2P9NA 2YJEA 3W0LA 3OHRA 4WQ4A 4XH5A 4EHTA 3DWLA 2FF6A 2YI1A 3MN7A 4H0OA 4JAXA 2D0PA 4CZLA 4O8KA 1YXQA 2IVOA 3FZKA 3JS6A 3D2FA 2FSNA 1XC3A 2YHWA 5CE3A 5KQ8A 3H45C 4H0YB 1QHAA 3ZEUB 4L3QA 2F9WA 3IDHA 3ATUA 1BA0A 2D1KA 4FSVA 3R9PA 1HKGA 4EFHA 1KAZA 2A5XA 4PKHA 3WXKA 5AQSA 2EWSA 5AQLA 3SK3A 3A5OC 3EZWA 3O80A 4WYBA 2AP1A 3M6GA 4CD1A 2HF4A 5AQNA 4CZGA 2F9TA 3C7NB 2GWKA 5KQDA 5AQZA 1GLEG 1TYQA 3L0QA 3SJHA 2Q31A 5AQOA 2PAVA 1BDGA 4H5NA 3KVGA 2YCHA 5AZIA 4BRQA 3DXKB 3O8MA 4BG8A 4BRNA 3CJ9A 3UKRB 4NO7A 1RDWX 5AQHA 3VEYA 4I6MB 3MCPA 4BGBA 1U2VB 3ENHA 1E4GT 4IXCA 1U6ZA 4QS8A 3VF4A 4BREA 2P9IB 1WOQA 1DKGD 3GL1A 4IZ9A 3I33A 3ZX2A 1NGAA 3MDQA 4BRKA 5EY4A 3VF2A 3CJCA 3DAWA 1EQYA 4PKIA 2E1YA 3D2EB 1JCFA 3QICA 4M7XA 1IJJA 1ESVA 5AQGA 5AQTA 2W41A 4CZFA 1ZXOA 4H5VA 2YJFA 3I8BA 3S41A 1NGGA 4MLEA 2E2PA 3HSCA 1ATRA 1R59O 3MK6A 3M3ZA 2ASPA 1MA9B 5KPTA 3C7NA 3CIPA 5AQKA 4DHYA 5AZJB 1NGDA 1S22A 3BUZB 5EX5A 3KZBA 4FWRA 3P4IA 2YHXA 1X3NA 1NGHA 4IWVA 5AFUH 2A42A 3O4WA 4CZJA 4O5FA 2V7YA 3A5NC 4BRLA 3QDKA 1KAYA 3IUCA 4H0TB 4BRFA 2ITMA 4PL7A 2I7PA 5AQJA 1QQOA 3CJAA 4I6MA 3A0IX 4K41A 4MO4A 1GLLO 1OKJA 2DPNA 3J8AA 1SAZA 3O1BA 3R6MA 2VWBA 4CBXA 2P9KA 5JMVA 1X3MA 2P9UB 3VETA 4NB4A 4BVPA 3SMSA 4C23A 1GLBG 3DJCA 2YHYA 4FWLA 3D2EA 4FWPA 3CQYA 3CJ1A 4BRMA 5F2RA 5ADXA 3U4LA 4CZIA 4YDUA 3DXMB 4BRCA 2IVNA 3LDQA 3CQXA 1GLJO 4Y0WA 1V4SA 4Z94A 3MMVA 3IMXA 2A6AA 5AQFA 1SZ2A 4GY2B 2VCPA 1TUYA 3L6QA 4BRHA 2ZGZA 4IJAA 4B1UB 4AM6A 1X9JA 1NGIA 3O5BA 4AM7A 1KAXA 2VYPA 3EKUA 4IJNA 4BG9A 5BPLA 2E2QA 1HKCA 3W3DA 2P9SB 1MWMA 5AFUA 3AY9A 2GTDA 3HTVA 3ULEB 4H5RA 4FWMA 1H1VA 3LDNA 3BF1A 4BR4A 4BC2A 2QWMA 2P9LB 2ZF5O 2BUPA 4CI6A 2E2NA 3GOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ELVA 3HSTB 3FFKB 5E84A 1W7AA 3WNHA 3AVIA 3CJ7A 2BANA 3THXB 3SNNA 4FCYA 1RILA 4IDHA 4G9ZA 2P9UA 3MEGA 3PO4A 1VRTA 4A57A 4F2SA 3WNGA 1JLCA 5AR0A 4HVJA 3S3NA 4CJ4A 3K5OA 3BZKA 5JICA 1VQ9N 3H08A 5CYQA 4KFBA 1TKDA 4YOVA 4DF4A 3PX0A 4FM0A 2HF3A 3WXMB 1RT7A 2HB5A 4JNEA 5AQYA 5ADXH 1ATNA 1YT3A 1UWBA 3U9ZA 4A2BA 4A2AA 3K57A 4RTFD 4ZHRA 3FZFA 3RMAA 3SI6A 2I5JA 1NK0A 3QIPA 4IKFA 3ZT2A 4UQGA 4OKEA 1KTQA 2CGKA 4FK0A 2A41A 1KQSM 4F8RA 1MDUB 4Z4IA 2B5JA 1JXEA 2P9SA 3FGUA 4AQYK 1Z25A 5J1EA 5KRTA 2HHVA 3WEEB 2RKIA 1NK8A 3HJFA 1WSGA 1VSJA 5FPMA 1C0UA 1TL1A 1WSJA 3C6UA 3WXJA 4B1XB 3NFAA 4DG1A 1C0FA 2FXUA 2YKMA 1LAVA 4LFCK 3NMUA 3WXLA 5FRMA 3UKRA 4CJ7A 5AQRA 2VQEK 1C1BA 2ETJA 2YNGA 4J8FA 1NLVA 3O4NA 2G8VA 4CK1A 3SAFA 4E89A 5ELZA 3VGMA 1BG3A 2XY5A 4CBUA 4RCHA 5GAEP 3THWB 4JI8K 5KI6A 2YV0X 3ITHA 1J6ZA 1TGOA 4KTZA 3MWPA 4BR5A 3DRRA 1C1CA 1BOTO 3OYDA 1YVNA 3HO1A 1QZ5A 3CQ8A 3CCSN 3TAMA 3LDOA 3R3LA 4JHDA 5T7BA 2ZJPL 1GLDG 1HNWK 1E4FT 3IFRA 4M41A 3OBWA 1NJZA 4DTPA 1N5YA 1IKYA 3OYHA 3DI6A 3KLHA 4DSLA 2F7TA 3UB5A 3NGIA 3T69A 2QWQA 4FL9A 3SQ4A 3D7EO 3CHWA 1RDBA 4CFBA 4FJMA 2O8EA 1I3AA 5CR4A 3AVJA 4RWTA 1BCOA 2X78A 3RMBA 2V51B 1T03A 1RTHA 4I2PA 4FPAA 1TUUA 1CLQA 5EVZA 3VQ5A 3V1QA 1W97L 3HBTA 5HROA 4JD2B 2E2OA 1HX1A 4PUOA 3PLAA 1VSMA 3HI0A 3WUHA 1I39A 3CETA 2O8FA 3ZT1A 4CK2A 3HM8A 3CFRA 4B8AB 3VF6A 1XUPO 3OY9A 3TI0A 1ZBHA 1HLUA 4CGJA 2A3ZA 1S6PA 3VQPA 4RW7A 3M8RA 3IRXA 2HMPA 3CC4N 4JK7A 3RTVA 1MU2A 1K8KB 5HRNA 2P9KB 3FZHA 4DFPA 3AV9A 1NNEA 3QEVA 4FLYA 2D5RA 2O8CA 2P9NB 1RCHA 1YVUA 4RG8A 5FPDA 3ZYYX 4MQ3A 3L3VA 1T44A 5F0XA 3LPTA 3VPZA 2W6LA 4KH5A 2GWJA 4AHUA 1EWQA 5DM6L 4KHSA 2QXLA 1O13A 3D2FB 5LMUK 1FKOA 1YUWA 2E8AA 1HNXK 3ZT0A 2P9LA 1UAXA 4GKJK 3QFUA 2P9PA 1ASUA 3PY8A 3O4QA 5A2QO 5JS1A 2QWNA 4OKKA 4CF9A 4EHUA 3MX2A 3CCMN 3NH0A 2D0OA 2H3GX 1WUAA 4BGAA 2Q2RA 4YOWA 4DTUA 3D0PA 4IFEA 3QMLA 3NF8A 3HVRA 3T1AA 3E01A 2B6AA 3RSEA 3VEOA 4BQZA 4FWKA 3LP2A 3L2VA 1YJWN 2ZWHA 2E6LA 2GEMA 4K8ZA 2VG7A 2O8BA 4J2EA 2GUIA 4BROA 3CF5L 3DMJA 1QSSA 1S72N 3AO3A 3CCRN 2QWOA 3ZETA 4DTSA 2HVHA 2QWPA 4FJ9A 4WQ4A 3JYTA 4JAXA 4CZLA 3V4IA 4O8KA 4CVNE 4IO9L 5CE3A 5KQ8A 4H0YB 4L3QA 3OYGA 1Q81O 3RR8A 2D1KA 1W9HA 1HR0K 4PWDA 3RRGA 4CESA 1VQNN 1HKGA 4PKHA 4R5PA 3WXKA 2VQFK 1JXBA 4O0IA 2EWSA 2HBKA 1HQEA 1A5XA 3QNNA 5M1QA 1IKWA 3L2UA 3M6GA 4M3TA 4CD1A 5AQNA 2F9TA 4KH6A 5KQDA 4NYNA 2UXBK 3SJHA 1C6VA 2X6SA 4JLHA 3TAGA 1CXUA 1O1WA 3QETA 1IG9A 4B3OA 3M5RA 3SQ2A 3AVNA 4IDKA 4E1MA 4CHYA 1VQMN 3TAEA 4JI2K 3CJ9A 5LL6Z 4RW8A 5AQHA 4I7FA 4BGBA 4E3SA 4XIUA 1E4GT 3E66A 3S3OA 2P9IB 4M3WA 4KAZA 4JEPA 1WOQA 5C2FA 1TL3A 3MDQA 5EU7A 3E9LA 1EQYA 2RF2A 4DR5K 5JVGL 4B9MA 4CECA 5J2QA 3MAQA 1BHLA 4M7XA 1IJJA 2PYJA 5AQGA 3SAGA 4B9SA 3S41A 1NGGA 2KKZA 5C15A 2ZM6K 3OS0A 2KZMA 4CEOA 5AQKA 3AVFA 4DHYA 4KRFA 3KZBA 3MXIA 2W42A 4FZXC 5M1OA 3KD5E 4FYDA 4WF9L 1YITN 2GX9A 3ZSXA 2A42A 4CZJA 3TANA 4C1NK 1KAYA 3PO5A 1SL2A 4BRFA 1KD1O 1RBRA 1L3VA 4I6MA 1LWEA 4LD0A 3V1RA 2QEXN 2UXDK 1SAZA 1VQLN 5KGWA 4E1NA 1QE1A 1KFSA 3ZSOA 4FJXA 3J7YP 1GLBG 5H1SQ 4FWLA 4LFBK 4MFBA 3TSUA 4FWPA 2HHUA 3AVGA 3CJ1A 4A5BA 5ADXA 3U4LA 1SS6A 5DK5A 4YDUA 1BGXT 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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