3UE5A

Ecp-cleaved actin in complex with spir domain d
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
371
structure length
364
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/transport protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 121
structure length 364
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ue5A03
4H0OA 5AQZA 5AQUA 2P9PB 2QM1A 2V52B 3J8AA 4WQ5C 4H03B 2CGLA 5F0XA 5I9EB 2V7YA 4NB4A 4FPAA 4XH4A 3UKUB 4CBXA 3UE5A 4ISGA 2V51B 2P9IA 2E2PA 3GOIA 2QWPA 1ATSA 3SLCA 3HBTA 3FZMA 3EO3A 4BR7A 3L4IA 4MLEA 2I7NA 4A62A 5EOYA 3U9ZA 5AQIA 3H46O 1E4FT 1T6DA 2A42A 4FO0A 4MO5A 5FPMA 2YCHA 4FWRA 5AQKA 1NGBA 3OHRA 2D4WA 1JCFA 1HKCA 4FWLA 2IVPA 2QWQA 4CZHA 4MLHA 3P4IA 4WQ4C 4ISEA 3M1FA 2E8AA 4H0TB 2GTDA 2YI1A 3MCPA 3WEEB 5BPLA 3C0BA 4CZIA 2GWJA 5AQTA 2QW9A 2CH5A 3WXKA 1QZ6A 4O8KA 2E20A 2VWBA 1ZXOA 1Z05A 3GE1A 1SZ2A 1Z6RA 1QQMA 3RSEA 3M6GA 3WXJA 5AFUA 3H45C 5JMVA 2A41A 1V4TA 3AARA 3IFRA 1HKBA 4BRQA 4FOEA 4H0XB 4RCHA 3MMVA 3VGKA 3ULEA 1XUPO 3TU5A 3ZEUA 3ZETA 5KQ8A 1BA1A 1KAXA 1K8KA 3I33A 3M3ZA 4JD2B 1DGKN 1GLCG 2Q31A 5AQQA 5AR0A 4BGAA 5BN8A 2BTFA 3R9PA 3VF6A 4BR0A 2HF4A 3VGLA 4H5RA 3ZX0A 3VPZA 1NM1A 4BRFA 3KZBA 5FPEA 3H3NO 4XH5A 4K43A 1X3MA 3QDKA 3VENA 1E4GT 1XQSC 2FSJA 4PL7A 4FWMA 2FSNA 4FWSA 1G99A 1HX1A 5AFUH 2P9IB 5BREA 3GG4A 3BP8A 3VF4A 5B8HA 5CE3A 4RWTA 3CQYA 3VEOA 5KQDA 3A5LC 3FE1A 1ATNA 2E2NA 1ZBSA 4E1JA 2HF3A 1S22A 1YXQA 4J8FA 1DKGD 3FZKA 4BR5A 1NMDA 4XH1A 3BF3A 3QMLA 3LDNA 3FLCO 4CZMA 5AZIA 1IJJA 3B8AX 2F9WA 1OKJA 1R59O 1NGAA 2CH6A 3LM9A 2NZTA 2OANA 4JN4A 2IIRA 2BUPA 3U8XA 3HTVA 1Q18A 2A6AA 3CJAA 2QXLA 1NBWA 4BRHA 1SQKA 4C23A 3IMXA 3LL3A 3VESA 1NGEA 3RSEB 3VERA 3R6MA 4AM6A 1RFQA 1HPMA 3BUZB 4BC5A 2YJEA 4IXCA 3ULEB 4FWOA 1NGHA 4K25A 4A61A 3ZEUB 3ZETB 4FOIA 5AQMA 5AQLA 4FPBA 1K8KB 4K42A 2FLOA 5AQOA 2H3GX 3AY9A 4BRDA 3SK3A 3HM8A 2E2QA 3ENHA 4GY2B 4BRKA 3WT0A 4BR4A 3A0IX 3HI0A 2WUSA 2E1YA 4H5TA 2FF3B 2ZWHA 4WQ5A 3MN7A 2F9TA 1XC3A 1NGFA 4YDUC 5KPRA 4PKHA 3UKRA 3W3DA 2NRHA 2IVNA 1BOTO 4H5NA 4IJNA 2P9UA 1X9JA 3C7NB 1V4SA 3GDQA 4CD1A 5KPTA 4CD3A 3CJ1A 1JCGA 3O4WA 4H5VA 3LM2A 1BA0A 1WOQA 4B1VA 4IJAA 1ESVA 2PBDA 2YHWA 3EL2A 3F9MA 1HLUA 4JNEA 5AZIB 1HKGA 4BVPA 3MN5A 4BROA 5ELZA 3BEXA 5E26A 1T44A 4F9OA 4WQ4A 4IWVA 1NGCA 4GNIA 3O08A 3DAWA 2D0PA 2A5XA 4IO8A 3FZFA 4B1YB 2ASPA 2VCPA 3D2FA 4H0PA 4QS7A 4JAXA 3CJBA 4BVOA 3CIPA 1T6CA 3FFKB 2ZGYA 4BREA 3VEWA 4BG8A 1U2VA 3LDLA 3IUCA 4BQZA 5BRDA 3CI5A 3VETA 4ISFA 2HMPA 2P9SA 5AQSA 2GELA 1HUXA 4A2BA 4EFHA 4FWPA 3FZLA 2CGKA 4FWNA 3AAQA 4B1WB 5EXWA 1NWKA 3CERA 3WQTA 1J6ZA 4LC9B 3ZX2A 1BDGA 3CJ7A 3LDQA 1ATRA 2CGJA 5AQGA 3KHYA 3MDQA 3VOVA 5F1XA 3SMPA 2Q97A 1GLDG 3VEYA 3UKRB 3QFPA 5AQFA 2DPNA 3QFUA 2ITMA 2Q2RA 3QBXA 4BRLA 4BGBA 1BWFO 4HWIA 2P9UB 4NO7A 4BRCA 2YJFA 2GEMA 3AAPA 4K41A 4CBUA 1TYQA 3EKSA 2Q0RA 4Y0WA 3WEEA 1BUPA 4BRMA 4BRAA 2YHYA 1NGDA 4EHUA 1RDWX 3O5BA 4BQLA 2VYPA 2ZGZA 1GLLO 3L6QA 1BO5O 5ADXH 2ASMA 1IG8A 4IZ9A 4CZFA 3ENOA 1YVNA 3DXKA 5AQRA 4H5WA 3H6EA 1GLFO 1YUWA 4CZEA 1MWMA 3EN9A 3IDHA 3W0LA 1KAYA 4B1ZA 3DXMA 3D2FB 1X3NA 3CHWA 3H1VX 5AQXA 1GLJO 1S3XA 3ATVA 3MK6A 3A8YA 1U2VB 5AQPA 1YAGA 3ZX3A 2P9KA 2P9SB 1GLBG 2FF6A 1NLVA 3VEXA 1MDUB 3GBTA 1CZAN 3BF1A 5BRHA 2E88A 2D0OA 3U9DA 3WQUA 4PKGA 2I7PA 5AQVA 5FPNA 3WXIA 3HZ6A 4M63C 2D1KA 4DQ8A 3CETA 3O80A 3WXLA 3JS6A 2GWKA 3KVGA 2AA4A 4RTFD 1KAZA 1QHAA 4BRPA 5AZJA 3CJ9A 4CJ7A 1EQYA 3QBWA 3SMSA 4KBOA 3VF2A 3QICA 1JCEA 4I6MA 1MWKA 3MN9A 4M7XA 2P9NA 3O6WA 4H0YB 1QQNA 5BN9A 1WUAA 4YDUA 4BR2A 4CZJA 5JLHA 3CJCA 2NLXA 5AQJA 4B1UB 2QWOA 1GLAG 5KPZA 2QWRA 3S41A 1U6ZA 1TYQB 5F2RA 4CZGA 1TUYA 2UYTA 1LOTB 2P9LA 1RGIA 3O1BA 4XEIA 2Q36A 4DB3A 2QWMA 2V7ZA 3FZHA 3D2EA 5EVZA 2FXUA 2YHXA 3R8EA 4DCHA 3ATUA 3D7EO 4A2AA 3VGMA 2E1ZA 3DXKB 4JHDA 4PKIA 2QWNA 1BU6O 3FR0A 2J4RA 3JXUA 2W41A 3EZWA 3EKUA 3GL1A 2W40A 1NGIA 4L3QA 4BG9A 3DJCA 2P9PA 3DXMB 4EHTA 4HTLA 4EIAA 3A5OC 3L0QA 4BRNA 1H1VA 5EX5A 5TKYA 1SAZA 4QS8A 5EY4A 3VEZA 3UKUA 3I8BA 4BC4A 4MO4A 4AM7A 2P9KB 3G25A 2HOEA 3SJHA 4M7YA 4EAHD 2A3ZA 5E84A 5FPDA 3FGUA 1C0GA 2ASOA 4BRIA 3A5MC 3VEVA 5BPMA 2QWLA 1BG3A 5ADXA 1NGJA 5LY3A 4WYBA 1TUUA 2AP1A 1GLEG 3HSCA 4PL8A 4BR9A 3ID8A 4FL9A 5JLFA 3U4LA 4CBWA 3QB0A 5AZJB 1P8ZA 5BRFA 4QS9A 3LDPA 1KXPA 2GUPA 1QZ5A 1Y64A 4FWKA 1LCUA 4I6MB 5BR9A 3TPQA 1HJOA 1NGGA 2P9NB 4CZKA 3C7NA 4BRGA 3UB5A 3O1WA 2ZF5O 2Q1NA 3LDOA 4FSVA 4H0VB 3A5NC 4O5FA 1DEJA 3WUHA 3CQXA 5LJWA 5AQNA 3DWLA 3O8MA 5JICA 1MA9B 2IVOA 4DHYA 4FWQA 4CI6A 1C0FA 5BPNA 2EWSA 5AQHA 4B9QA 2P9LB 4B1XB 5LJVA 2Q0UA 2E2OA 4BC2A 1D4XA 4Z94A 4BC3A 2A40A 3D2EB 2KHOA 2PAVA 3H1QA 1ZC6A 4JHDB 5AQWA 4JD2A 5AQYA 3MN6A 4CZLA 3H3OB 2FSKA 1QQOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E9OA 1SL1A 2O8FB 5AQUA 3PIOL 2V52B 3SV4A 3G10A 2CGLA 2OPPA 5I9EB 4E19A 4NB4A 3UKUB 3LPUA 4FLWA 5CR4A 4DFJA 3T1YK 1NJIO 3GOIA 2E6LA 2QWPA 1Q8IA 3V1RA 2VQFK 3QEXA 3U3YA 1YI2N 3FZMA 4KHWA 2HVHA 4A62A 2I7NA 1ZBFA 5EOYA 3SYZA 1E4FT 2ITGA 2A42A 4FK2A 4MO5A 5FPMA 1JXBA 1W2BM 5AQKA 1HKCA 2IVPA 1JLAA 3SI6A 2R7YA 4CF1A 3DOLA 3CM6A 1N32K 2GTDA 3WEEB 1YJNN 3C0BA 2GWJA 4DF4A 2PYLA 2D5RA 3WXKA 1QZ6A 2UXCK 1RTIA 4KHNA 1SUQA 1JLBA 4U67L 1QQMA 4U7BA 4OLAA 3V81A 4IEIA 3PV8A 1HNZK 3H45C 1S1WA 1OH7A 1VSKA 3OVNA 1YHQN 1LWEA 3L2WA 1WN7A 4JRQA 3TI0A 3O3FA 4RW9A 3ZCMA 5HP1A 3I33A 3NHGA 4YY3K 2ATQA 3VF6A 4IFYA 2PYJA 5HRPA 2HHIA 1S72N 4ILHA 3BY5A 3VPZA 1RDDA 4QAGA 1NM1A 3KZBA 5FPEA 1HQEA 4JKGB 2XY8A 2KQ2A 1X3MA 1XQSC 3K58A 4N5SA 1G99A 3BP8A 4CF2A 3TSQA 4CESA 4RWTA 1KD1O 3RRHA 4F3OA 4LSNA 4KHUA 2O8DB 3OYNA 4Q0BA 1ZBSA 1DKGD 3CCJN 1HNXK 4FJKA 1NMDA 4DU3A 3BF3A 3QMLA 3NH0A 4CEDA 3IRXA 2G8IA 3A2FA 1C0TA 3B8AX 4CFDA 1NGAA 2CH6A 4CEAA 4JN4A 2WONA 2BUPA 1HNIA 1BI4B 1TAQA 3LWMA 1NBWA 1KRPA 3HJFA 4BRHA 1NKBA 3R3LA 4C23A 3HT3A 3RSEB 1WBBA 1P90A 3R6MA 2UUBK 1HPMA 3J7YP 4IXCA 3OS0A 4W5QA 3L3UA 3WXMB 3ULEB 4FWOA 1RT7A 4DV5K 4CJKA 3ZETB 1EKEA 5AQMA 3L4QA 4JK8A 3RVCA 5AQOA 4FLTA 1D5AA 2FC0A 5LMNK 3ENHA 3NE6A 4BRKA 2KZMA 3WT0A 4OGEA 3NGIA 4IDKA 3HI0A 4JI6K 2E1YA 2FF3B 3KWGA 3ZSYA 4X62K 2ZWHA 4FXDA 3VQCA 2F9TA 1XC3A 3O9RA 2VG6A 1SKRA 1W97L 1NK6A 1L3TA 2W00A 4RW6A 1BOTO 4MFBA 1OH5A 2P9UA 3AA5X 2UUCK 3C7NB 3BGRA 5FRNA 3O4WA 1WOQA 4IEEA 2HHUA 4J2AA 4CE9A 3EL2A 4JNEA 4CK1A 5AZIB 3S3OA 4Z4CA 5E26A 4F9OA 3VA3A 2NRWA 1C0UA 4CIFA 3O08A 5GIPA 3DAWA 1DTQA 2D0PA 3HPGA 1JJ2M 2A5XA 3E01A 2ASPA 1XMQK 2VCPA 3AVIA 2JWKA 3KD5E 4QS7A 2DFFA 4WFNL 2C1GA 4LF9K 3QETA 4BREA 3VEWA 4FZZA 1N36K 3IUCA 2X6SA 4Z0UA 4JI3K 3CI5A 2P9SA 2GX9A 1RBVA 4IBNA 1HUXA 4K8ZA 1BHLA 1TV6A 3KTQA 4KI6A 4KTWA 4FM1A 4XJXA 4J2EA 4DFMA 5C10A 1X1PA 3IS9A 3CERA 1J6ZA 3I0SA 4OLBA 2CGJA 3VOVA 4JKAA 2HHTA 1GLDG 3UKRB 2OZSA 4M3TA 5AJ3K 3QFPA 4OPHA 1L5UA 2DPNA 3G71N 2ITMA 3QBXA 4BGBA 1JLQA 3CCMN 4Y1CA 3CC4N 3OS1A 3NF9A 4NO7A 1U04A 3CMAN 1NJXA 3AAPA 3Q7CA 4K41A 4CBUA 3DOKA 3O3GA 1LW2A 1TYQA 4E7JA 1BUPA 4BRMA 4DSFA 1X9WA 3HOSA 4DTJA 1U49A 3PX4A 1BO5O 4CIEA 2JLEA 4CZFA 3OYCA 4B9LA 1RTHA 3ENOA 4CJTA 4KV8A 2EHGA 3H6EA 1GLFO 4CZEA 1MWMA 3NF7A 4FLZA 3IDHA 3O9UA 2VWJA 3D2FB 1X3NA 3TTDA 1HNWK 3H1VX 5AQXA 3TAEA 1GLJO 4DTOA 2PFUA 4KFBA 5M1FA 1U2VB 4DR4K 5LL6Z 2P9KA 3K5OA 3ZSWA 2DY4A 4FW2A 4FVUA 3MXIA 3WQUA 4PKGA 2ZJRL 2I7PA 1B9DA 4DQ8A 3O80A 5LMUK 4RTFD 3R1XA 2UXDK 1VSMA 1Z26A 3SMSA 1HPZA 1QSSA 1RT2A 4DV1K 4CJRA 4GKJK 1JCEA 4FM0A 3OA9A 3J81O 3O9SA 4FJ9A 5BN9A 3E66A 2XY5A 4BR2A 5JLHA 3CJCA 2QA4N 3CQ8A 1Y97A 4O55A 5KPZA 1GLAG 3PY8A 1VQ5N 1U6ZA 4DTSA 4OGCA 1LOTB 3O9TA 5IWAK 2QWMA 2O4GA 1CXUA 3VQ4A 4OO1J 2FXUA 3R8EA 4DCHA 1XHZA 3DXKB 4W5TA 2BH1A 4CERA 3FR0A 2IS3A 1N34K 2UUAK 4LY7A 3SQ0A 2OPQA 3C6UA 4OPAA 4LF5K 3TSPA 2KKZA 3AA4A 4CEBA 1NK8A 3DJCA 4HTLA 3A5OC 4EP4A 1IBLK 3CYGA 5EX5A 2G8KA 1SAZA 5EY4A 4M41A 3I8BA 4IKFA 4AH9A 3SJHA 4AHVA 2A3ZA 4IG0A 1RDAA 5FPDA 4DQQA 1KLMA 1KSPA 1BQMA 1VSHA 2JWLA 5BPMA 2QWLA 1BG3A 1NGJA 5HOOA 1C0MA 3HSCA 4PL8A 4BR9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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