1HLUA

Structure of bovine beta-actin-profilin complex with actin bound atp phosphates solvent accessible
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Complex (acetylation/actin-binding)
molecule keywords BETA-ACTIN
publication title The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 104
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1hluA03
4FWKA 2W40A 2FSNA 3MDQA 5AQKA 4BRGA 4FWSA 5F2RA 1G99A 4EAHD 3I33A 1NGEA 3H1QA 4GY2B 3O1BA 3A0IX 3O4WA 1ATSA 2A42A 3F9MA 5AQIA 3DXMB 2P9NA 3L4IA 2GELA 4A61A 3HBTA 3UKRA 3CJCA 4PL8A 4C23A 4IJAA 3IFRA 3A5MC 5AQHA 3LL3A 4FSVA 2GEMA 5AQLA 4I6MB 2PBDA 3H3OB 2P9UB 2ASMA 4IZ9A 2P9SB 1ESVA 1GLCG 2FSKA 2Q36A 4MO4A 2IIRA 2ZWHA 4PKGA 2FLOA 3H3NO 3QBWA 5AQZA 5AZJA 3OHRA 5AQMA 4RTFD 3CHWA 5AQQA 4A2BA 3HM8A 3O1WA 3CQYA 3SK3A 3CQXA 4FL9A 3AY9A 4BG8A 1IJJA 3FZLA 3WXKA 5ELZA 3ID8A 4FOIA 4J8FA 5FPMA 3CETA 3WEEB 4CZIA 3H45C 1U6ZA 4CJ7A 2A6AA 4M7XA 3CIPA 4BREA 5BRFA 1E4FT 2GWKA 3SLCA 2PAVA 5BN9A 3TU5A 1NGBA 2YJFA 1NGAA 1BO5O 2HMPA 2UYTA 1J6ZA 2P9KA 1RFQA 3QFUA 5KPZA 5AQUA 2E1YA 2Q2RA 3U9DA 3VGMA 5AQFA 1KAYA 5AFUA 4H0XB 3RSEB 3A5OC 4BC2A 5LJWA 2P9NB 5AZIA 2Q0UA 1BOTO 1E4GT 3UKRB 2YI1A 3QICA 4BROA 5AQSA 5BPNA 4Y0WA 3VEXA 1GLBG 4FWRA 4MLEA 2CH5A 3FZMA 4BGBA 2V7YA 5AQYA 5KPTA 3U8XA 1V4TA 5E84A 4B1UB 5LJVA 1GLAG 4B1XB 2V7ZA 2V51B 3ZEUA 1HKBA 4IO8A 4EHUA 4BC5A 1P8ZA 4FWMA 2P9UA 1XC3A 4CBXA 1NGGA 5EOYA 2BTFA 5KPRA 1LOTB 5JICA 4BVPA 4B1VA 2HOEA 4NB4A 4BRNA 4WQ5C 3C0BA 3FZFA 2Q0RA 4BRHA 3ULEA 5JLHA 5B8HA 3LDOA 3P4IA 3WT0A 3KZBA 4KBOA 5EVZA 4DHYA 2HF4A 3H6EA 2IVNA 5BRDA 4RWTA 4FWOA 4CD3A 5ADXA 1GLEG 1QQMA 4NO7A 1Z6RA 3AARA 4PKIA 3VF6A 1GLJO 4BRLA 3BF1A 3LM2A 3VENA 4FWPA 4H0OA 2ZF5O 4H0PA 4O5FA 4WQ5A 4CZLA 2P9KB 1LCUA 5AQJA 3ATVA 4BRPA 3SJHA 3VGLA 4JAXA 3VERA 1QQNA 2FXUA 2HF3A 2YHWA 2VYPA 4BG9A 3VF2A 5AZIB 3WXIA 1ZXOA 1BA0A 3RSEA 3CJ9A 3M6GA 1NGFA 3VEWA 1X3MA 2VCPA 1XQSC 4CZMA 2J4RA 1HUXA 5AQRA 3LM9A 1ZC6A 2IVOA 3LDPA 2GWJA 4H5NA 5AQOA 3ZETA 2F9WA 4FO0A 3EL2A 4AM6A 4CBWA 4CZKA 3ZEUB 1HPMA 3FGUA 1DKGD 4LC9B 4FWNA 3M1FA 4HTLA 4HWIA 4BRKA 3WUHA 4H0VB 4BRDA 2NLXA 1BUPA 1S22A 4CZJA 1MA9B 3H46O 5EY4A 2E2QA 1RDWX 1WOQA 2YCHA 2H3GX 4A62A 5F0XA 3MN5A 4O8KA 3ULEB 2A5XA 2Q1NA 3G25A 1QHAA 5BPLA 2Q97A 2QWLA 3VEYA 3WQTA 4MO5A 3J8AA 1D4XA 4IXCA 3QFPA 1H1VA 4CD1A 5BRHA 2E20A 4BRMA 2P9PA 3O08A 1GLLO 4H5VA 4H5RA 4A2AA 2AA4A 1GLDG 4XH1A 1K8KA 5FPEA 3GL1A 1NBWA 2D0OA 3QMLA 2WUSA 1YAGA 3SMSA 1SAZA 4BQZA 4CZFA 4AM7A 2E88A 4YDUC 1HKCA 1JCFA 1HX1A 2ZGYA 4K42A 4DB3A 1DEJA 5BPMA 2F9TA 3O6WA 2FSJA 5JLFA 1YVNA 3CJ1A 1HKGA 4L3QA 1TUUA 4QS9A 5LY3A 4BQLA 1BDGA 4YDUA 1NGJA 4XH5A 3FR0A 1RGIA 3BEXA 3MN9A 3VESA 1DGKN 3QDKA 3ZETB 2D4WA 3GG4A 1NMDA 2ZGZA 5I9EB 4WYBA 1NGHA 1ATRA 3S41A 3VF4A 5BR9A 4JHDB 5AFUH 2GUPA 1QQOA 1T6DA 1TUYA 3BF3A 5AQGA 2CGJA 3BUZB 3JS6A 5AQPA 4EFHA 1MWKA 4IJNA 3VGKA 4CZHA 3O8MA 4BR0A 3QBXA 3A5NC 1BG3A 1X9JA 2FF6A 3FFKB 3WXLA 2E2NA 2BUPA 2P9PB 1HLUA 1YXQA 4RCHA 3VPZA 4B1YB 1ATNA 2OANA 3CJ7A 3UKUA 4QS7A 4BC3A 1K8KB 3CI5A 5AQNA 1NGIA 3EZWA 4ISFA 2QM1A 5AR0A 3MCPA 3HSCA 2D0PA 3DWLA 1C0GA 2QWOA 3GDQA 3TPQA 2P9LB 5BREA 4K43A 2NRHA 4B9QA 4Z94A 5FPDA 3VEVA 2AP1A 4GNIA 5AQWA 1HJOA 3ATUA 1KAZA 3FZHA 4M7YA 2IVPA 2KHOA 4WQ4C 4BRFA 4DCHA 1EQYA 2YHXA 4BGAA 1T6CA 4FPAA 3ENOA 4H5WA 1TYQA 3EKSA 1T44A 3LDNA 4FWQA 5CE3A 3AAPA 1IG8A 4BR5A 3BP8A 4H0YB 3CERA 3VEOA 4CI6A 4JNEA 4B1WB 2W41A 1SQKA 2D1KA 4WQ4A 1GLFO 1SZ2A 4JHDA 1YUWA 2E1ZA 3DXKB 3D2EB 4E1JA 5AQVA 1U2VA 3HZ6A 3FE1A 4BRIA 4FWLA 5E26A 5F1XA 3ZX3A 2CGLA 3HI0A 1BU6O 5AQXA 1XUPO 4BR9A 3H1VX 4H0TB 3JXUA 1BWFO 3UKUB 5TKYA 4ISEA 3VOVA 2CGKA 3KHYA 4PKHA 3W0LA 4JD2B 3IDHA 4CBUA 2EWSA 3IUCA 3FLCO 2VWBA 5FPNA 4BRCA 4F9OA 2ASOA 3O5BA 3O80A 1NLVA 4BR2A 2QW9A 1KXPA 2QWRA 2A40A 3DJCA 4B1ZA 2NZTA 3D2FB 1KAXA 1MWMA 2QWNA 4H5TA 3SMPA 2A3ZA 1NM1A 2P9LA 3A5LC 2I7NA 2P9IA 1Y64A 3QB0A 4PL7A 1BA1A 3R6MA 2ITMA 4BR4A 3CJAA 3EO3A 1Z05A 1NWKA 3VEZA 3ZX2A 4FOEA 1TYQB 3C7NA 3WQUA 5EXWA 3HTVA 5KQ8A 3ZX0A 3VETA 3R9PA 2Q31A 4K41A 1WUAA 5JMVA 1MDUB 3WXJA 3L0QA 3FZKA 2FF3B 3D7EO 2E2OA 3EN9A 1V4SA 1QZ5A 4MLHA 3GE1A 4FPBA 4XEIA 3U4LA 2A41A 2E2PA 2QXLA 5KQDA 1U2VB 3GBTA 3M3ZA 3DXKA 4CZGA 3D2EA 2ASPA 1ZBSA 3B8AX 3A8YA 3MK6A 3DXMA 4JN4A 1CZAN 3MN7A 4IWVA 4BC4A 1JCGA 4BR7A 4BRQA 2DPNA 4H03B 3R8EA 3KVGA 3MN6A 1JCEA 5BN8A 4BVOA 4I6MA 2QWMA 3I8BA 1OKJA 3ENHA 4CZEA 2GTDA 1NGCA 1R59O 4EHTA 4XH4A 2P9SA 4JD2A 3W3DA 5AZJB 3IMXA 1NGDA 3UB5A 3LDLA 1C0FA 4K25A 3LDQA 3EKUA 1S3XA 3MMVA 3D2FA 2P9IB 4M63C 2QWPA 3L6QA 3UE5A 4EIAA 3CJBA 2YHYA 2E8AA 2QWQA 5ADXH 1Q18A 4QS8A 3U9ZA 3WEEA 3C7NB 2YJEA 4BRAA 3GOIA 3AAQA 1QZ6A 5AQTA 5EX5A 2I7PA 4ISGA 2V52B 3DAWA 2CH6A 1X3NA 4DQ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HNWK 1W7AA 2PYJA 4BE7B 3ZT0A 1BGXT 4JRQA 3M8PA 2RPIA 3CC2N 2WBNA 5M1KA 5HOOA 3ALYA 3A0IX 3F9MA 1BHLA 4JI6K 3CCEN 2WC9A 3L4IA 3J7ZO 2GELA 3HM9A 1XI1A 3HBTA 3CJCA 1LW2A 4PL8A 4B9VA 4IG0A 5AQHA 4DTSA 1SKWA 5C10A 2GEMA 5AQLA 2X6SA 5GINA 2PBDA 1J9AA 3NF8A 3DOKA 3RMAA 4ELVA 4IZ9A 2P9SB 3LAMA 1ESVA 2O4IA 4DSEA 3C6TA 4KHYA 4E7HA 2VGMA 4PKGA 2FLOA 3H3NO 4N56A 3LWMA 3QBWA 2HBLA 5AQZA 4FCYA 3OHRA 1YTAA 4RTFD 3HYFA 2X6NA 3O1WA 4W5NA 4BG8A 4IKFA 1IJJA 3ID8A 4CJ7A 3K59A 4C8OA 5BRFA 3CIPA 5KRTA 2GWKA 1RT7A 3S9HA 2PAVA 3B6PA 4FLZA 1NGAA 4ILJA 2P9KA 4FVMA 1RFQA 4DSLA 3QFUA 3AVJA 1HPZA 5AQUA 2E1YA 1WSJA 2HB5A 5AQFA 4UY8O 3M8SA 3MX2A 2JLEA 2Z1JA 3CFOA 3A5OC 4Q0BA 3AA2A 1KVCA 2IS3A 3QETA 4DFMA 3MXIA 2GUIA 5AQSA 3SAFA 4Y0WA 2CH5A 3FZMA 3WNEA 5AQYA 1S5JA 1V4TA 3J7YP 5LJVA 3D6RA 1HKBA 1WSIA 4BC5A 4FWMA 4DTNA 4O8UA 3CCMN 2UUCK 2KZMA 5KPRA 5JICA 2KLAA 4B1VA 3TWHA 2RN2A 4NB4A 4KB0A 2Q0RA 4BRHA 3ULEA 5JLHA 4CGDA 4O0IA 5EVZA 2O8CB 1B92A 2XO7A 4RWTA 4CD3A 3J7AP 4DR6K 3AARA 4PKIA 3C94A 2X74A 4IFVA 3OYFA 5SZTA 3SI6A 2ZF5O 4H0PA 4O5FA 4WQ5A 1O13A 1LCUA 2UXDK 1A5XA 1TK0A 2A1SA 1U48A 3AVFA 4KPYA 3SJHA 3VGLA 4JAXA 4AHCA 2FXUA 4FK2A 5HRPA 4NCGA 2VYPA 4BG9A 3VF2A 1XHZA 4LSNA 1BA0A 1HYVA 1ITGA 3CJ9A 4C8NA 1NK4A 4CZMA 2J4RA 1S1VA 3LDPA 5MLCQ 4KHSA 5AQOA 2Z1IA 2GBZA 3QEXA 2O8DA 4YOXA 4H0VB 5C0YA 4NLCA 4JEPA 1VSDA 2KFZA 3HPHA 5HLFA 2YCHA 1WOQA 3N4PA 4TSXA 4A62A 1VQ7N 1TKXA 3MN5A 4DS5A 2HMIA 4X66K 3VA0A 3VEYA 1VQPN 2OZMA 3THXA 4IXCA 3QFPA 1H1VA 4AHSA 3CCJN 4H5VA 3O9SA 3QNNA 5FRMA 1RCHA 2AA4A 4XH1A 2KW4A 3QMLA 2D0OA 3SMSA 4RW6A 4BQZA 1UOCA 4CZFA 2O8EB 1JCFA 5FROA 1JL2A 2KQ2A 2EX3A 2W42A 4WFBL 5JLFA 3CYMA 2QKKA 4HCCA 1J54A 1YVNA 3IAYA 3SNNA 4L3QA 4QS9A 4YOYA 3OBYA 5LY3A 1VQKN 1BDGA 4B8CA 2F96A 4CK2A 4BECA 1NK7A 2HHTA 3G0ZA 3SUOA 4KKOA 4W5TA 4L8RB 1NMDA 2O8FB 4CFBA 2JWLA 5GAGP 1ATRA 5CZ1A 3S41A 2C1IA 4JHDB 5M1QA 2GUPA 3E66A 2LSNA 4CF2A 4LFAK 3VQEA 2HVIA 2BE2A 4OKKA 5LMUK 2ZJQL 3JS6A 5HP1A 4B3TK 4EFHA 2FBYA 1MWKA 3VGKA 2OPRA 1KVBA 1X9JA 2FF6A 3FFKB 3HVRA 1UA0A 2FBTA 3L3UA 4B1YB 3JYTA 1F21A 3UKUA 3HXMA 1VQ9N 3KKRA 4DUYK 4FLYA 4QOZB 1K8KB 3TTDA 5HROA 2YKMA 3MCPA 2WOMA 4KREA 4DU3A 2OYQA 3ULDA 1JL1A 2AP1A 2Z1GA 4CHOA 3TAEA 4LH5A 2IVPA 2KHOA 4U67L 4F2SA 2HHIA 4FJMA 4M3ZA 4NYFA 1T6CA 4BGAA 3NHGA 3ENOA 1TYQA 3EKSA 5CE3A 1IG8A 1L3TA 3I8DA 4H0YB 1K73O 3EE8A 3IKMA 3G71N 4OKEA 1VHXA 1SQKA 1A5WA 4YFUA 1TL1A 2VQEK 4B8AB 1VQ5N 4CJQA 4DQSA 4EP4A 1VAZA 3PSFA 4ILGB 4FZYA 4HCBA 1ZBFA 2YNGA 4B9UA 2G8IA 3AVHA 2WFBA 4KHQA 5AQXA 3F9KA 4BR9A 3PO4A 3JXUA 1BWFO 3VQPA 2HBKA 4QAGA 3VOVA 3W0LA 4IFEA 4JD2B 4CBUA 3K5LA 4RW7A 3IG1A 4KTZA 1RBUA 4NCBA 3NF9A 4DTRA 2ASOA 4DU4A 3O5BA 4YOVA 1CZBA 1KXPA 4FM0A 1N36K 4H5TA 3BY5A 1NM1A 2P9LA 3B6OA 3C6UA 2HHQA 4B3OA 3OJSA 4PQUA 1BI4A 4A5BA 3V81A 4FXDA 3EO3A 3HT3A 4CJWA 2ZJRL 1YITN 4FLUA 4FVUA 3ZX2A 5I42A 2RF2A 5KQ8A 5M1OA 3VETA 1Q9YA 3R9PA 5H1SQ 3S3NA 5C15A 2OTJN 1MDUB 3HP9A 3EY1A 1NK8A 4JS5A 4JV5K 3FZKA 3D7EO 3EN9A 4BE1A 5CYQA 4FPBA 3OVNA 5C12A 3MXMA 2OCEA 2QA4N 3V4IA 3U4LA 2QXLA 2IAJA 5KQDA 1U2VB 1WSFA 3DXKA 1K6YA 4CZGA 1JJ2M 3RR8A 1KTQA 3MK6A 4FJNA 1CZAN 4BC4A 2B6AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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