2ZWHA

Model for the f-actin structure
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
374
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title The nature of the globular- to fibrous-actin transition.
pubmed doi rcsb
total genus 114
structure length 374
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2zwhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2zwhA04
4H0OA 4BRDA 5LJWA 2ITMA 2W41A 4IZ9A 1MWKA 2D1KA 4E1JA 5AQTA 2QWNA 3BUZB 1NLVA 3C0BA 4A2BA 1K8KB 3AY9A 1NGFA 5BRFA 3SMPA 3U9DA 4FWOA 4BQLA 1KXPA 4BRIA 1C0FA 1BG3A 3R6MA 3CJ1A 4K25A 1BWFO 2YHWA 3CERA 3MN5A 3ZETA 4CZGA 2NRHA 5BREA 1JCFA 2YI1A 5AQIA 2H3GX 3EN9A 5AQUA 3VOVA 1ZC6A 3UKUA 2CGJA 3FZFA 5FPEA 1IG8A 2DPNA 1DGKN 3QBWA 1U2VA 3D2EA 3O8MA 4BRNA 1NGGA 3AARA 4H0YB 1GLDG 3O1BA 4F9OA 1HKBA 3L0QA 2E88A 3GOIA 1D4XA 3P4IA 1Z05A 4HTLA 3BP8A 3MK6A 4QS9A 1YXQA 5AQGA 2UYTA 1QZ5A 4BRLA 4NB4A 5E84A 5JLFA 1T6CA 3D7EO 1V4TA 4CBXA 1QHAA 3UE5A 2Q0RA 4BR7A 3FZHA 2A3ZA 3BF3A 3GG4A 4EHUA 1YAGA 4BRFA 3FZLA 1BDGA 3VGLA 4AM7A 1GLFO 2QWLA 4FWQA 4CZHA 4JD2B 1ATNA 4FWSA 4B1ZA 1WOQA 2HF3A 5LJVA 2A40A 3WT0A 2E1ZA 5AQMA 4BRKA 1JCGA 1GLCG 1YUWA 4BR2A 2HF4A 1KAZA 2ZGZA 2VCPA 2ASPA 3VF4A 2IVOA 3ENHA 2P9LA 5EVZA 2GELA 1XUPO 4CZKA 3VERA 3ID8A 2Q2RA 2CH5A 3RSEA 3EZWA 4BR0A 3MN9A 1C0GA 1NBWA 5BRHA 2P9PA 3C7NA 5E26A 4BROA 4JN4A 4BR4A 4WQ4C 4YDUA 3AAPA 4BREA 4BRPA 3DJCA 3QICA 4HWIA 1MWMA 2QWRA 3FFKB 3W0LA 4FWNA 4KBOA 5JMVA 3O6WA 1TUYA 3WEEB 4B1YB 4Z94A 5AQJA 4PKIA 2D4WA 4DB3A 4BQZA 1K8KA 5AQSA 5BRDA 4K43A 3M3ZA 2GWKA 3KHYA 3WXIA 2VYPA 2IVNA 3G25A 1KAXA 3HTVA 5KQ8A 1X3MA 3ULEB 3FZKA 4CBUA 5JICA 3R9PA 2QWOA 1HLUA 3JXUA 3VF6A 3TPQA 4H0PA 5AQWA 5LY3A 1DEJA 1MA9B 3GE1A 4BG9A 1NGDA 3HM8A 1E4GT 2A41A 3A5OC 5KPTA 3F9MA 3UKRB 4BC4A 1GLEG 3B8AX 2GWJA 2ZWHA 3D2FB 1NGEA 1QQOA 3ATUA 4K41A 1T6DA 3VEYA 1WUAA 1QZ6A 2P9KB 3VETA 3BF1A 5EOYA 4A62A 3CJAA 2QWPA 3OHRA 2QWQA 5ADXH 1CZAN 4EAHD 3QFUA 3CETA 1HKGA 2FSJA 3DXKB 3QMLA 3MN6A 4FWRA 1NGIA 3DXMB 4BGBA 1GLJO 4FWPA 4BRGA 2E2QA 2YJEA 2E2PA 4CZFA 3M1FA 3GBTA 3TU5A 3LL3A 4CJ7A 4FWLA 3WXJA 4XH4A 3FR0A 4CI6A 1GLLO 2KHOA 4FSVA 3J8AA 4JD2A 2YHXA 4GNIA 5CE3A 3CIPA 4Y0WA 5TKYA 4JHDB 1ATRA 2P9NA 4LC9B 5F0XA 1Q18A 1TUUA 1XC3A 3ZX3A 3LM2A 2FSKA 2OANA 1GLBG 4I6MB 5AQXA 5AQHA 5ADXA 1LOTB 5ELZA 3LDOA 1NGHA 4FWKA 5F2RA 3IDHA 4CZIA 5AQYA 1NWKA 3UKUB 2FF3B 2PBDA 3SMSA 2PAVA 3GL1A 4H5NA 2WUSA 1BO5O 1T44A 2P9SB 1SAZA 3EKUA 2E2OA 3ZX0A 2GTDA 4DHYA 4IO8A 4MO5A 5AQRA 1BU6O 2QM1A 4B1XB 1S22A 1V4SA 3HBTA 3MCPA 4H0TB 4IWVA 3QB0A 3WEEA 5AQNA 1HKCA 2D0PA 1HUXA 3QFPA 3ZEUB 5AQZA 2F9TA 3O1WA 3MN7A 4BG8A 4GY2B 2I7NA 1XQSC 4CD3A 3CJ9A 1H1VA 3QDKA 2CH6A 1HPMA 1BA0A 5AQPA 3VESA 5FPMA 3FZMA 4CBWA 1OKJA 4NO7A 4H5VA 1TYQB 2Q97A 2V7YA 1X9JA 1KAYA 2F9WA 3H6EA 4PL8A 4RCHA 4CZEA 2HMPA 2P9IB 5AR0A 4BRMA 3EKSA 5AQQA 3FGUA 5EX5A 4BRHA 3ATVA 3H46O 2NLXA 4FPBA 4ISEA 3WQUA 2Q1NA 3H3OB 3BEXA 5EXWA 3UKRA 3H1VX 1G99A 1MDUB 1BUPA 3EL2A 3WXKA 1BOTO 4IJAA 1ZXOA 3D2FA 1R59O 4B9QA 5AZIB 1JCEA 4JAXA 4DCHA 2P9KA 4H5RA 4H0VB 3FE1A 4K42A 4BRAA 2J4RA 2NZTA 2W40A 5AQKA 2V7ZA 3SLCA 4WQ5A 1HX1A 2QXLA 2A6AA 5AQOA 1DKGD 3DXKA 1QQMA 2QW9A 2YCHA 4PKGA 3A0IX 2D0OA 1RDWX 2P9UB 2E1YA 5BPMA 2V52B 3CJ7A 3VEVA 1E4FT 2AP1A 5BPLA 4CZLA 4DQ8A 2GUPA 1S3XA 4WQ4A 3KVGA 2Q31A 3CQYA 3SK3A 3W3DA 3WXLA 2E2NA 4JHDA 2BTFA 4AM6A 1NGJA 2QWMA 3VENA 4BVOA 4ISFA 4PKHA 3VEZA 5AZJB 4M7XA 4I6MA 2Q0UA 3A5NC 1SZ2A 2HOEA 4M63C 2ASMA 1NMDA 3I33A 3KZBA 1ESVA 1U6ZA 1NM1A 2E20A 3SJHA 3FLCO 3A5MC 3L4IA 1LCUA 3IFRA 3U8XA 3A8YA 1QQNA 3H3NO 3LDLA 2E8AA 4FOEA 4WYBA 5JLHA 2FF6A 4XEIA 4B1WB 1RFQA 2P9SA 5FPDA 1NGCA 3CHWA 2YHYA 4YDUC 3ENOA 3VGKA 3ZETB 4L3QA 2ASOA 4QS8A 2FLOA 3IMXA 4QS7A 3ZEUA 1ZBSA 4MLEA 4FPAA 4O5FA 4H0XB 4FL9A 1U2VB 3DAWA 3D2EB 1IJJA 2AA4A 4BC5A 4B1VA 2IIRA 3CJCA 4BC3A 2A5XA 4RTFD 3L6QA 4MLHA 2FSNA 1ATSA 3WUHA 2A42A 1X3NA 1TYQA 3H45C 3ZX2A 4B1UB 3AAQA 2VWBA 4CZJA 3EO3A 3H1QA 4EHTA 3MDQA 5BN9A 4FO0A 5BR9A 2CGLA 3LDNA 4MO4A 4XH1A 2P9NB 2P9IA 3O5BA 4CZMA 3QBXA 4M7YA 5FPNA 2ZGYA 2EWSA 3IUCA 3U9ZA 4BR5A 4H5TA 4EFHA 5AFUH 4PL7A 4CD1A 4ISGA 4WQ5C 5AQFA 4JNEA 4BR9A 3VEOA 2ZF5O 1EQYA 3ULEA 3A5LC 3VEXA 4BRQA 3MMVA 3O4WA 2Q36A 1J6ZA 1YVNA 5EY4A 3CJBA 4O8KA 5AZIA 3WQTA 5AQLA 3UB5A 5B8HA 2FXUA 1P8ZA 3HZ6A 4H5WA 4IJNA 1GLAG 3O80A 4A2AA 1NGAA 5I9EB 2V51B 3VEWA 4IXCA 3S41A 5KPRA 5AQVA 1NGBA 1Z6RA 4EIAA 2GEMA 2CGKA 4H03B 3LDQA 5F1XA 3M6GA 4A61A 5BPNA 4BRCA 3CQXA 3VPZA 1BA1A 2P9UA 1HJOA 2I7PA 2YJFA 3GDQA 2IVPA 3JS6A 4C23A 2P9LB 3DWLA 1RGIA 3U4LA 5KQDA 4BGAA 3HI0A 4RWTA 3LDPA 4BVPA 5AFUA 3RSEB 5BN8A 2P9PB 3C7NB 1Y64A 3R8EA 5KPZA 3CI5A 3VF2A 4FWMA 4XH5A 2BUPA 3I8BA 4J8FA 3O08A 4BC2A 3DXMA 3VGMA 3LM9A 5AZJA 4FOIA 3HSCA 1SQKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRDA 3ISNC 5LJWA 2W41A 3WXMB 4ILGB 4FLZA 2XRIA 1VQON 1NLVA 4LF8K 3C0BA 4CEQA 4A2BA 2HNYA 4Z4CA 1K8KB 1YITN 2W6KA 5BRFA 3U9DA 3ALYA 4BQLA 3V9ZA 5HBMA 1C0FA 4DWIA 1WNSA 3SJJA 1BWFO 3VQPA 3LALA 5BREA 3V81A 4KHSA 4EZ9A 4K8XA 3VOVA 1ZC6A 4JI3K 2CGJA 5FPEA 2DPNA 3ASMA 5HRSA 3NGYA 4E19A 2E88A 3I0RA 5MLCQ 4B9NA 3E01A 1Z05A 1WSFA 1A5WA 3A2FA 4E72A 4G1QA 2IAJA 3KWGA 4DR7K 2OCEA 4HVJA 2LSNA 3NGIA 3LZJA 3OYKA 3D7EO 1V4TA 4CBXA 1BHLA 1QHAA 3UE5A 5FRMA 1YTUA 1RBRA 1YAGA 3CXCM 3FZLA 2NRTA 3HRGA 3ZSOA 3CCUN 3DLKA 2QWLA 2HBMA 2G8IA 1JLGA 3SPYA 4B1ZA 4Z4FA 1RT7A 3L3VA 1SKSA 1WOQA 3CFRA 5AQMA 4BRKA 1GLCG 2O8BA 4B3MK 1QQCA 3M8QA 4DR1K 4W5TA 2DY4A 3ZCMA 5J2MA 3G0ZA 3ENHA 3CFOA 2P9LA 4KHYA 2O8EB 1I3AA 5DMRA 4FJXA 3ID8A 1QVGM 2Q2RA 2IC3A 4BR0A 3O3HA 2P9PA 4O4GA 4BR4A 4WQ4C 4BRPA 4IFVA 2WC9A 3W0LA 5SWMA 4JK9A 4KBOA 3O6WA 1TV6A 1B9DA 4FK0A 1HPZA 2WONA 1SS6A 4DB3A 1VSFA 4B9UA 4FLXA 4CIEA 5BRDA 4RW7A 1VRUA 2HHXA 3TR8A 1QSSA 3U3YA 4CJ4A 3RVCA 1KSPA 3G25A 5C42A 3HTVA 1G15A 3FZKA 3OY9A 4CHOA 2NRXA 2HB5A 2QWOA 3MXJA 1Q9YA 1KVCA 5AQWA 1NKBA 1MA9B 1BCOA 2JWKA 2OYQA 1NGDA 3HM8A 3OYBA 4FLYA 4WE1A 4BC4A 3CMEN 2X6SA 2YNFA 3VEYA 1FW6A 4IOAL 4C8LA 1WUAA 3SQ0A 4A62A 1NJYA 3AA4A 3OHRA 1LW2A 2QWQA 5ADXH 1CZAN 4EAHD 3QFUA 1REVA 5J2PA 2W42A 4JI6K 4FWRA 1GLJO 1RILA 3SAHA 3SUPA 2YJEA 1YVUA 2E2PA 3N4QA 1NK0A 1Z25A 3FFIA 3K9KA 2BH1A 2F7TA 4JS4A 4PHTX 4CI6A 3T1YK 3K5LA 2O8DA 4JD2A 4YORA 4CJWA 3CIPA 3P5JA 1ATRA 2P9NA 5GAEP 5KRSA 2W00A 4KV8A 5F0XA 1XC3A 1TUUA 3ZX3A 4BE1A 4JKEA 3LM2A 3TSUA 4HUEA 4JK7A 3K0SA 4DQRA 4J2DA 4WCEL 3C94A 3KLIA 3TI0A 1LOTB 3PLAA 3VQ5A 2D0AA 1D9FA 2KQ2A 1TGOA 1L3TA 5F2RA 2OPRA 3MAQA 5AQYA 1NWKA 4JKFA 3UKUB 2ZQBA 4CF9A 4ELVA 2YNHA 3SMSA 2HMIA 3SAFA 1VSHA 3GL1A 1QS4A 4DS5A 1SL0A 2GTDA 3E9OA 4N5SA 1UA1A 4IO8A 1K6YA 3TAFA 2QM1A 1BQNA 3HPOA 3HBTA 3WEEA 1KQSM 1HKCA 2D0PA 3V4IA 1KLMA 3AGRA 1HUXA 4FJKA 4YFUA 1BCMA 1OVYA 1XQSC 1BQMA 4AQYK 3CJ9A 4L8RB 1QSYA 1A5XA 5AQPA 4OLBA 2P5OA 3PO4A 5FPMA 4CJRA 1OVQA 4OO1J 1KD1O 3PX4A 1NJWA 4PWDA 1NKEA 4BDPA 2F9WA 4OPJA 4PL8A 4I2PA 3RRHA 4YOTA 1IKWA 4FPBA 1YIJN 2Q1NA 1KLNA 3AO1A 1N33K 5M1QA 4YNQA 1BUPA 1RBVA 4YOYA 3WXKA 3ENBA 3D2FA 1R59O 5AZIB 1FKOA 2HHUA 5JENA 2P9KA 2YKNA 4FJ5A 2A1SA 5AQKA 2V7ZA 4AHUA 4H4OA 1IV0A 1DKGD 3DXKA 1N6QA 2OZSA 3TTDA 4MDAA 4JI1K 3AVNA 1WAJA 3CD6N 4W5OA 2E6MA 1BIUA 3HXMA 1E4FT 3AVKA 1YHQN 4DF8A 2QK9A 1WBBA 3LANA 3CQYA 4CHQA 4DSIA 5C15A 2E2NA 4AM6A 2QWMA 2UU9K 4BVOA 2G8WA 3DLHA 4FK4A 4PKHA 4X66K 1SZ2A 1K9MO 4ZHRA 3LP2A 4FJMA 4CFCA 1U6ZA 4N76A 1NM1A 3EYZA 4DS4A 1XC9A 1XMOK 1WLJA 2ATQA 3A5MC 1D8YA 4CFDA 3VQEA 3KLEA 1EKEA 3A8YA 3H3NO 1FK9A 2E8AA 3ZT1A 1LAWA 2O4GA 4IEIA 2FF6A 4XEIA 2YNGA 4B1WB 4DTMA 1RFQA 5I3UA 3VGKA 3N4PA 1C1AA 3HSTB 3NE6A 4JKBA 3C95A 1JJ2M 3MEGA 2FLOA 2RE2A 4YOUA 3OYEA 1HYSA 5C25A 4JKGA 1Y97A 1TK8A 1ASWA 3OYLA 3QETA 4LY7A 4B1VA 4DSKA 3O9QA 3JAMO 3OJUA 2UUBK 4OGCA 1J54A 3S3NA 4FZXC 3VQBA 2FSNA 3PSIA 2G8VA 2VWBA 4CECA 3H1QA 4CGIA 2FBVA 2CGLA 4ICLA 3J80O 3QBXA 1RDAA 4XIUA 2XY7A 2KKZA 1ASVA 1M90O 4PL7A 1T7PA 2GBZA 1BI4A 2PFUA 4JI2K 5AQFA 4OKKA 2JWLA 3SV4A 4BR9A 1XHZA 5GAGP 3ULEA 4OPAA 3CCJN 2Z1GA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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