3DXMB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0993548
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
total genus 51
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxmB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxmB02
4JNEA 2A42A 1Z6RA 2GWJA 1U2VB 3WXKA 5F0XA 1IG8A 1S3XA 1BDGA 3CJBA 5JLHA 4CBWA 2I7PA 3VEYA 1IJJA 1Y64A 1OKJA 2P9IB 5BR9A 2VWBA 3LDNA 3A0IX 4K42A 3D2FB 2P9UA 4BRPA 1SZ2A 4WYBA 3MK6A 5FPDA 1GLFO 2CH5A 5AQPA 3VGMA 2YHWA 4BR0A 2E2OA 1NGCA 5FPNA 4E1JA 1X3MA 5AQUA 1NGGA 1GLDG 1WOQA 4IZ9A 4BROA 2P9LB 2GTDA 3BF1A 2Q1NA 3AAPA 4ISGA 3EKUA 4HWIA 2YI1A 4H0TB 1NGIA 2PAVA 4H0YB 2E2QA 1DGKN 1BG3A 3WQUA 4H0PA 4HTLA 4PL8A 2E1YA 4QS8A 5AQXA 3R6MA 1BOTO 4H5WA 4XH5A 3CQXA 3LL3A 1TYQB 4FWQA 3ZX0A 2CGKA 3GOIA 2FSKA 5AQYA 3ULEA 4BRKA 4RWTA 3H3NO 1NM1A 4B9QA 4EAHD 1X3NA 4EHUA 4BR4A 3VOVA 1HPMA 1QZ6A 1KAXA 4IWVA 3SMSA 3CHWA 4IJAA 5BREA 5AQQA 3A8YA 1LOTB 2FXUA 4BC5A 3L0QA 2AA4A 3AARA 3JS6A 4JD2B 2Q97A 1R59O 4H5RA 1NGEA 2E2PA 3ATUA 1NLVA 2QXLA 3A5NC 1NGAA 4FL9A 1XUPO 1BA0A 3ZEUB 4JHDB 3WEEB 4FPBA 3CI5A 1TUYA 2A6AA 3GL1A 4PKHA 1J6ZA 1HUXA 5BPLA 5AQSA 4BRGA 1Q18A 2Q31A 3UKRA 3A5LC 3U9DA 4CZGA 3VGLA 1ATRA 1NGDA 3FZFA 4CBXA 1XQSC 1C0GA 2J4RA 3H46O 3IFRA 1HX1A 5AFUH 2D4WA 4ISEA 3MMVA 1NMDA 4B1UB 5JMVA 1BA1A 3OHRA 4B1WB 3AY9A 1MDUB 1E4FT 1BUPA 2IIRA 3H45C 4BG9A 4PKGA 1CZAN 3ID8A 3O1WA 3ZETB 4K25A 3GG4A 4A2BA 2FF3B 3F9MA 3CIPA 3EZWA 5AQHA 5AQVA 4BQLA 5JICA 2Q0RA 3VPZA 5ADXA 4CD3A 5KPRA 3BF3A 5AQRA 1MWMA 1SAZA 3BUZB 2IVPA 4AM6A 3VETA 3UE5A 5E26A 3VF4A 3MCPA 2VYPA 2HF3A 2OANA 3VENA 3FLCO 5AQOA 4BR9A 3LM9A 2E1ZA 1ZBSA 4CI6A 2P9UB 2QWPA 3SK3A 4RCHA 3QBWA 1GLCG 3UB5A 5BN9A 4BRNA 3QBXA 1C0FA 5KQ8A 3JXUA 3I8BA 2P9PA 3MN6A 4BGBA 4BR5A 3VEZA 5AQFA 1HKCA 2D0PA 3HZ6A 2Q2RA 3QDKA 4GY2B 1DKGD 3GBTA 5EVZA 1QQNA 1RDWX 4CZHA 2FLOA 2E2NA 4BRCA 1EQYA 1YAGA 3J8AA 1WUAA 5BPMA 4FWPA 4PL7A 4BRHA 3U8XA 3TU5A 1JCGA 1DEJA 3L4IA 4XEIA 3M1FA 4B1ZA 3QFUA 2W41A 4BVPA 2PBDA 4WQ4C 2ZGZA 3ZX2A 2GWKA 2YCHA 3ULEB 4BRDA 5FPMA 5KPTA 1S22A 1TUUA 4A2AA 5AR0A 4H0XB 4CD1A 3ATVA 4EIAA 4FWLA 1GLEG 3MDQA 5B8HA 1P8ZA 1K8KA 4A62A 4IJNA 5EXWA 4Z94A 4FWOA 3M3ZA 2BTFA 2FF6A 2BUPA 4B1XB 2KHOA 3VEWA 4K43A 3TPQA 2FSNA 5BN8A 4H03B 5JLFA 2FSJA 2IVOA 3W3DA 3VEVA 3O08A 2A3ZA 1E4GT 3UKRB 4O8KA 3VGKA 3KZBA 5E84A 3FFKB 1HJOA 3CERA 1XC3A 4KBOA 4BC4A 5F2RA 2EWSA 1YXQA 3U9ZA 4BG8A 4FWRA 3QB0A 1ZC6A 4WQ5C 2P9SA 2P9NA 3HSCA 5LJVA 1ATSA 4IO8A 4O5FA 5AQWA 3GE1A 1QQOA 2E88A 3EO3A 4CJ7A 4I6MA 3VESA 2YJEA 3R8EA 3HI0A 4BC2A 2V52B 3DWLA 3DXKA 1ZXOA 1GLLO 1V4SA 3C0BA 4CZLA 3CJ1A 5AQIA 5EY4A 4FO0A 4GNIA 3ENHA 4B1YB 3CJAA 2QWQA 1QHAA 2IVNA 3G25A 3MN9A 2HMPA 4FWSA 4EHTA 4K41A 5AQKA 3DAWA 2DPNA 4F9OA 4FPAA 4FOEA 3O4WA 5ADXH 2QWMA 3L6QA 3IDHA 4DQ8A 3O6WA 2QWOA 4XH1A 1T6CA 5AQNA 3BEXA 3U4LA 2ASOA 5EOYA 4BRIA 2QWRA 4L3QA 2E8AA 4BGAA 2Q36A 3I33A 2UYTA 2P9KA 3CQYA 1HKBA 3VF6A 4CBUA 4BREA 4BVOA 1NGHA 2CGLA 3WT0A 5BRFA 2QM1A 1SQKA 4ISFA 3VEOA 3SLCA 1BU6O 1GLAG 1D4XA 3D2EA 3FZKA 3SMPA 3CETA 2ZWHA 4AM7A 3WXJA 4JN4A 1BO5O 1MA9B 2E20A 3DXMA 4WQ4A 3UKUA 1ESVA 1KAYA 5LY3A 1GLJO 4FWMA 4MLHA 4J8FA 5AZIA 3C7NA 4FWNA 3FR0A 5F1XA 5AQJA 1T44A 2CGJA 3IUCA 4CZJA 3ENOA 3LDPA 2NLXA 4H0VB 1T6DA 3QICA 4FWKA 1NBWA 3AAQA 4FSVA 2V7ZA 3WXLA 5AZJA 1K8KB 1HLUA 2A40A 4CZKA 3LDOA 3RSEA 3LDQA 1LCUA 3H3OB 4H5VA 4CZFA 4YDUC 2ZGYA 3O80A 4M7YA 1H1VA 1RGIA 5AQZA 3M6GA 4QS7A 4EFHA 1U2VA 3FZLA 4BRLA 1G99A 3EL2A 2A41A 4C23A 3HM8A 2WUSA 4QS9A 5AQLA 1NGBA 3MN7A 4WQ5A 2P9IA 5KQDA 3H1VX 3O1BA 4H5TA 3D2FA 3B8AX 4PKIA 2F9TA 4DHYA 4CZMA 2P9SB 2GEMA 2P9NB 2F9WA 1QZ5A 2ZF5O 2Q0UA 3R9PA 3BP8A 5KPZA 4I6MB 3WQTA 4NB4A 1HKGA 2P9LA 3KHYA 3SJHA 3VERA 3DXKB 4CZEA 4Y0WA 5BRHA 3LM2A 5FPEA 3KVGA 2VCPA 2GUPA 2HOEA 1U6ZA 1NGFA 3CJ7A 4H0OA 5LJWA 3FZMA 3MN5A 2ITMA 3DJCA 3VEXA 5AQMA 1KXPA 1RFQA 2GELA 4LC9B 3H6EA 4A61A 2AP1A 4BRQA 4CZIA 2ASPA 2V51B 3D7EO 1JCEA 3FZHA 2YHYA 1YUWA 1TYQA 3FGUA 1X9JA 4RTFD 4FOIA 5AQGA 4BRFA 4BC3A 3O8MA 4XH4A 2NRHA 1ATNA 3WUHA 1JCFA 1GLBG 1MWKA 4MLEA 3S41A 3CJ9A 3IMXA 1BWFO 3QMLA 4M7XA 2P9KB 2YHXA 1NWKA 5AQTA 3GDQA 5BRDA 4JD2A 2CH6A 4BQZA 2HF4A 2W40A 4BRAA 4IXCA 4H5NA 4M63C 3ZEUA 3D2EB 2QWLA 4DCHA 4JHDA 3WEEA 2QW9A 3VF2A 3QFPA 2YJFA 1QQMA 2QWNA 2D0OA 3ZX3A 5AFUA 3DXMB 1Z05A 3UKUB 1KAZA 1YVNA 2ASMA 5BPNA 3FE1A 4BRMA 4JAXA 2I7NA 3O5BA 2P9PB 4BR7A 2NZTA 1V4TA 4MO5A 5EX5A 2V7YA 2A5XA 3A5OC 3C7NB 5AZIB 1NGJA 5I9EB 4NO7A 2H3GX 5CE3A 4YDUA 3HTVA 3ZETA 5AZJB 5TKYA 3LDLA 3A5MC 3RSEB 2D1KA 3CJCA 3H1QA 3WXIA 3HBTA 3EN9A 3W0LA 4DB3A 4MO4A 4BR2A 3EKSA 3P4IA 4B1VA 5ELZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TSUA 3TTFA 1Z6RA 2ZJRL 5J1EA 1IG8A 4E7LA 4DTOA 3CJBA 4ZTJA 4IKFA 4DU1A 4M3TA 4FJ7A 2D0CA 4NCGA 2QTDA 4YY3K 1Y64A 4DQPA 1ILYA 2VWBA 1YVUA 3A0IX 1VSDA 4WYBA 4HUFA 3MK6A 3NFAA 1GLFO 5DK5A 2CH5A 3VGMA 5FPNA 4E0DA 1L3TA 3WNFA 5AQUA 2WTUA 3MECA 1T03A 3CYGA 2Q1NA 3AAPA 3G4SN 1QSSA 4BEBA 2YI1A 4YORA 2HB5A 1Q81O 2YNGA 3EYZA 2NRRA 4CGFA 4CJ4A 1IBKK 4LF7K 1RNHA 5KRSA 4KHUA 4B9TA 4QS8A 1BOTO 1RCHA 3QIPA 3F73A 1C0MA 2IDOA 3ULEA 4BRKA 4NCAA 1NM1A 4OKKA 1VSLA 3VOVA 1K9MO 3AVLA 3V4IA 4IJAA 4Z4GA 3PUFA 3CC2N 3MAQA 5AQQA 3ZT3A 5MLCQ 5J2MA 4OX9K 4BC5A 3CCUN 5H1SQ 4KAZA 2HVIA 5JENA 1MU2A 4M45A 1U45A 4JD2B 4H5RA 1R59O 4CEQA 3QETA 1UOCA 3ULDA 4KH5A 1C6VA 3VA3A 2PYLA 3VQ4A 1N36K 3HVRA 3ZSZA 3ZSRA 1J6ZA 5AQSA 3M5RA 1HMVA 1VK0A 4CZGA 4M42A 3DI6A 1ATRA 3FZFA 3AV9A 1KVBA 4YOYA 1VAZA 4IOXA 3OHRA 5M1NA 1RBVA 2HSTA 4F3OA 4DR7K 1BGXT 3QEVA 1CZAN 3O1WA 3GG4A 4FLXA 3KK2A 4BQLA 4LSNA 3S3MA 1TV6A 1W2BM 3BF3A 4LFBK 2IVPA 3U6FA 3VETA 3V9XA 3QESA 3VF4A 4HTUA 3NGIA 3LANA 2F96A 2KQ2A 3FLCO 3MWTA 3HT3A 2FBYA 1ZBUA 4K0KK 4CIEA 3THVA 4BE7B 3TAQA 4IOAL 2O8EB 1O13A 4RCHA 2W6KA 1WSFA 1RBSA 4NXMK 3PX6A 4KFBA 4HVJA 3S5TA 5KTQA 4YOVA 3M8RA 1RTJA 3I8BA 2UUAK 5AQFA 2X74A 3HZ6A 2P51A 4WCEL 1DKGD 1QSLA 1QQNA 4CK2A 4I9LA 4CEDA 4CEZA 1EQYA 3KK3A 4FJMA 1WUAA 2OCEA 4CERA 3SBTA 3U8XA 1TK5A 3L4IA 1NK0A 4XEIA 3CG7A 3M1FA 2W41A 3OYBA 3L4QA 1WAFA 4WQ4C 3DOLA 4AHSA 2YCHA 2E5LK 3CYMA 4FJ8A 5AR0A 1YJNN 5FROA 4CD1A 1L3VA 2FC0A 1QSYA 1JXEA 1GLEG 3MDQA 5B8HA 4A62A 1QQCA 4LFCK 4YHHK 2BTFA 2Z1IA 1BCMA 4FLZA 3VEWA 3TPQA 3MCAB 5M1FA 1XMQK 1VQ6N 2X6SA 2IVOA 1FW6A 2HHQA 3J7AP 3SZ2A 1DT9A 3I56N 1W97L 2JLEA 3OA9A 4AF1A 4FJIA 1U04A 4X65K 2IAJA 5C25A 4M3ZA 4B3RK 5E84A 1HJOA 3OBYA 1XC3A 5J2QA 1HNXK 1KLMA 4JKDA 3DLLL 4IBNA 1ZC6A 2P9SA 4A59A 4MDAA 3T3FA 1ATSA 5D3GA 4IO8A 4PQUA 4O5FA 3K2PA 5AQWA 1QQOA 4WFNL 3KD1E 3VESA 4DV1K 2YJEA 3DWLA 1GLLO 3OJUA 1S9EA 5HBMA 3NH1A 2WBNA 1NK7A 4J2EA 5GIOA 4EZ6A 2YNFA 3ENHA 1QE1A 3IAYA 3CJAA 4FLYA 1QHAA 3MN9A 4FWSA 5M1OA 4K41A 4E19A 1NK4A 2DPNA 3HK2A 3SNNA 4FPAA 2UU9K 3IDHA 3K9KA 5AQNA 4CHOA 1KD1O 4B9NA 3VQ8A 3BEXA 3TAPA 2NRVA 4DV5K 1RDAA 2VGNA 3T19A 3OYAA 1WB9A 1VHXA 2P9KA 4N76A 4PHTX 5JVGL 3VF6A 2CGLA 1NKBA 3WT0A 5BRFA 1YF5L 1WBDA 1YITN 4GW6A 4CW7B 4CFDA 1GLAG 3AVKA 1WSIA 3D2EA 4ID5A 3OYKA 1HPZA 1N5YA 3MX5A 2ZWHA 3ZT1A 3WXJA 4JN4A 1MA9B 4WQ4A 4JK8A 1KAYA 3VQQA 4J2BA 1GLJO 4HHTA 3OYJA 2B4JA 4FJHA 1VQ7N 4J8FA 4JKFA 1M90O 4QAGA 2G8KA 4DTXA 3J7ZO 1T44A 5HP1A 3LDPA 3HOTA 4LH4A 1NBWA 2V7ZA 3FFIA 3WXLA 1HRHA 1HLUA 1K8KB 4DSKA 2HBKA 1EKEA 1HQEA 1RT3A 4C8NA 4H5VA 3VA0A 1EETA 4FCYA 4YDUC 3SCXA 1RBUA 3B6PA 3O80A 3DLKA 4PWDA 5HRRA 2HBMA 4I2PA 4BACA 4QS7A 2RN2A 3EL2A 1NJZA 4X62K 1VRTA 3HM8A 3DRSA 1NOZA 4QS9A 3THWB 3J7YP 2IC3A 5KQDA 1OH6A 1KSPA 2UXCK 3LWMA 3AA5X 4DFMA 2F9TA 3R1XA 4O8UA 3CFPA 2GEMA 1L5UA 4Z4IA 5M1PA 4I6MB 4NB4A 3SJHA 1NJWA 4G1QA 3DXKB 4CZEA 4Y0WA 4BECA 4C8OA 1OH7A 4H0OA 1U6ZA 4M3RA 4N5SA 1XWLA 4LC9B 4A57A 3CCSN 4KV8A 4GV3A 1JLGA 3J80O 1J54A 4FOIA 4JI1K 1SL1A 5SWMA 4BRFA 3O4NA 3O8MA 4XH4A 3NDKA 4CECA 2Y1IA 1I94K 1X9SA 1GLBG 3D6RA 4MLEA 3S41A 4W5TA 1IO2A 1IKWA 1TK0A 1YTAA 3VQBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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