2ZGYA

Parm with gdp
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 102
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgyA01
1ZBSA 3LM9A 4FO0A 4FWLA 4BC2A 4WQ4A 3JS6A 4AM6A 3F9MA 4BR5A 4O5FA 1JCFA 4C23A 3ZX2A 5FPMA 3ULEB 3W0LA 5KPZA 3AY9A 1BUPA 5AQTA 2E2OA 2FSKA 3UKUA 5AQIA 1XUPO 5BRHA 4H5TA 3BP8A 3ZETB 1RGIA 4QS8A 4CZKA 2Q0RA 5AQLA 1C0FA 2I7PA 2P9IA 2P9PA 5AQZA 3VPZA 2QWOA 2QWLA 2FXUA 3LL3A 4CZGA 1BA0A 5AZIB 4EFHA 5BRDA 1Z6RA 2IVOA 3P4IA 4BGBA 4YDUA 3ENHA 3FZHA 4BR0A 3VF4A 3IUCA 3DXMA 1MA9B 3U8XA 3FZFA 1KXPA 4HTLA 2Q1NA 1YUWA 4IJAA 4BRKA 5AZJB 1IG8A 1E4FT 2AP1A 4A2BA 2GTDA 3FGUA 1QZ6A 1V4TA 3C7NA 1YXQA 2CGJA 3AARA 5AQMA 4ISFA 1CZAN 3MDQA 3C0BA 3WT0A 3I33A 5AQXA 4JHDA 4BGAA 4QS7A 1GLFO 5EXWA 4BVPA 1NBWA 2A6AA 4CD3A 1E4GT 1LCUA 3UKRB 4BRAA 5FPDA 3LDNA 1NLVA 4CBXA 2E1YA 5BN8A 3EKUA 1NGJA 2GWKA 2W41A 4KBOA 1Z05A 2A42A 4BR4A 3ID8A 3FZMA 1NM1A 4BC4A 3DJCA 3M6GA 4FWQA 5F0XA 2AA4A 3EN9A 3FR0A 3IMXA 3VF6A 2E8AA 3MN6A 5AQHA 3WXJA 1BU6O 2F9TA 5EX5A 2HMPA 1HLUA 3DXKA 3HSCA 3WXKA 4XH1A 3ENOA 1R59O 4WYBA 2QWPA 4B1YB 1MDUB 1GLCG 4K42A 2Q36A 2P9IB 2P9PB 5AQPA 4A61A 4O8KA 4FWRA 3H1QA 4FWOA 2D0PA 1HX1A 1TYQA 2YJEA 5AQNA 2PBDA 4CBUA 3KZBA 1H1VA 3DXMB 4LC9B 2OANA 1DEJA 4A2AA 1SQKA 5LY3A 1DKGD 4BRLA 4FL9A 3A5NC 4FWKA 4BRDA 4JNEA 4EAHD 1SAZA 2BTFA 4JN4A 3C7NB 4CI6A 3SK3A 2P9LB 3CI5A 3O4WA 5AQGA 2HOEA 2ZWHA 3SMPA 3BF3A 5EVZA 4I6MA 3O1BA 4H0PA 2QWQA 4BREA 3MN9A 1MWKA 2ZF5O 3MMVA 4BRIA 3W3DA 1ESVA 1GLEG 5AQFA 2D1KA 1BA1A 1U6ZA 4L3QA 5E84A 4B9QA 5KPRA 2P9UB 3QFPA 3AAQA 3J8AA 3CJAA 1D4XA 3GOIA 5BPNA 2EWSA 2A41A 3MK6A 1QHAA 5AQWA 4H5NA 3RSEA 2P9NA 2ZGZA 4H5VA 4PKHA 3WXLA 3EO3A 1QQNA 3S41A 4H0YB 1K8KA 1GLDG 3ZX3A 1GLJO 2D0OA 4WQ5C 3EKSA 3FZKA 1RFQA 4BR7A 1Y64A 4CD1A 3SMSA 4K41A 2YHXA 3DXKB 4CZHA 5LJVA 3LDPA 5BN9A 4BRCA 3CJ7A 4EHTA 5E26A 4B1XB 2VCPA 3LDOA 3O8MA 3HBTA 3VF2A 1HPMA 2GUPA 3CJBA 3IDHA 3VGKA 1HKCA 2IIRA 1ATRA 3O6WA 5AR0A 3BEXA 4H5RA 3ZEUB 3QB0A 2YHYA 4B1WB 1HJOA 1XC3A 1NGHA 2YI1A 2QWRA 3IFRA 1BG3A 3QBWA 1QQOA 4EIAA 1BDGA 4BR2A 3QBXA 2UYTA 2KHOA 4BQLA 4H0XB 3M3ZA 5AQQA 3VENA 3GL1A 5AQJA 2Q0UA 2FSNA 3ZX0A 3O5BA 5EY4A 4FOIA 3GG4A 3VOVA 5JICA 2CGKA 3A8YA 4GY2B 4WQ5A 5AFUA 4H03B 4DHYA 4H0TB 4I6MB 4BQZA 4NO7A 1G99A 5BREA 4F9OA 1SZ2A 2W40A 3LM2A 5ELZA 4BG8A 2CH6A 2QM1A 3B8AX 2V51B 4BRQA 5F1XA 3GDQA 1TUUA 5AQOA 2DPNA 4MLEA 1ATSA 3UB5A 1NGEA 3WQTA 4CZJA 2VYPA 4CZEA 5AQYA 2NRHA 3BF1A 3CJ1A 5JMVA 3ULEA 4GNIA 5KQ8A 4FOEA 3EL2A 3RSEB 3UKUB 5EOYA 5JLFA 1EQYA 3WQUA 4BVOA 4CZIA 3EZWA 1TUYA 5BPLA 3O80A 4M7YA 4B1VA 1BWFO 2E1ZA 4IWVA 4ISGA 3R9PA 3VEVA 3CJCA 1V4SA 3MCPA 1T6CA 3CERA 2QWNA 4CBWA 1T6DA 4BG9A 3A5LC 3D7EO 1OKJA 2WUSA 3VESA 4JAXA 3CQYA 2A5XA 3VETA 4BC5A 4Z94A 1ZC6A 1X3MA 2ASPA 1HUXA 1WOQA 2ITMA 4PL7A 4BR9A 3VGLA 4BRHA 2E20A 4WQ4C 2P9KA 3GE1A 1WUAA 3VEWA 5AZJA 4BROA 3LDQA 3DWLA 2FF3B 2HF3A 3QMLA 1KAZA 2QXLA 1XQSC 4BRFA 3CETA 4K25A 2IVPA 1LOTB 1QQMA 5TKYA 3HTVA 1KAYA 4DQ8A 3U9ZA 3VEXA 2GEMA 3A0IX 5AFUH 4JHDB 5ADXA 3SJHA 4BRGA 3H6EA 2CGLA 3M1FA 1C0GA 3WEEA 3H46O 4BRMA 4CZLA 4H5WA 2I7NA 1QZ5A 3ATUA 3VEOA 3G25A 4B1UB 3D2FA 4IZ9A 4Y0WA 3FE1A 3L0QA 3A5MC 4QS9A 4BRNA 3CIPA 3H1VX 2P9SA 3FLCO 2D4WA 2H3GX 3UE5A 1ATNA 3TU5A 2FSJA 4FWMA 2QWMA 2V7YA 3U4LA 1Q18A 3HI0A 3R6MA 2HF4A 3CJ9A 2NZTA 5KQDA 1NMDA 1NGDA 2GWJA 4JD2A 3KVGA 5FPEA 1IJJA 2ZGYA 5B8HA 4NB4A 3H45C 3L6QA 2E2NA 1J6ZA 3VEZA 1NWKA 3I8BA 3QICA 4MLHA 1NGBA 1X9JA 4FWSA 3U9DA 3ATVA 5LJWA 2FF6A 5AQKA 3WXIA 4BRPA 4M7XA 1TYQB 1ZXOA 3D2EA 5I9EB 4PKGA 4A62A 1BO5O 4EHUA 1T44A 3MN5A 3QFUA 1KAXA 2QW9A 4FPBA 4J8FA 2P9KB 1HKGA 1U2VA 2CH5A 4PL8A 5BRFA 1RDWX 4CZFA 5AQSA 5ADXH 1JCEA 2IVNA 1GLLO 2V52B 2E2QA 1NGIA 2P9LA 3O08A 2A3ZA 4DCHA 4CJ7A 4ISEA 1S22A 3MN7A 2J4RA 2YHWA 4IXCA 1MWMA 4XH5A 3CQXA 2Q97A 4FSVA 3WEEB 4K43A 3JXUA 3VEYA 1P8ZA 4B1ZA 3O1WA 2P9UA 2BUPA 3KHYA 4CZMA 4MO5A 2Q31A 3D2FB 4HWIA 3L4IA 4PKIA 4AM7A 2P9NB 1NGAA 1NGGA 5AQRA 2P9SB 5BPMA 3SLCA 2E88A 1X3NA 3LDLA 3OHRA 4RCHA 1K8KB 3ZETA 3DAWA 1GLBG 3FFKB 1BOTO 4FWPA 4XH4A 3AAPA 4FWNA 4JD2B 3H3OB 5AZIA 2VWBA 3GBTA 2FLOA 4E1JA 5JLHA 4IJNA 3R8EA 5AQUA 4RTFD 5F2RA 4RWTA 4FPAA 4IO8A 3QDKA 4M63C 3HM8A 1NGCA 2A40A 5FPNA 1JCGA 1NGFA 1DGKN 3ZEUA 2F9WA 2V7ZA 4MO4A 3CHWA 3D2EB 3VGMA 5KPTA 3BUZB 2YJFA 4H0OA 3HZ6A 5AQVA 2ASMA 2GELA 5CE3A 3VERA 3WUHA 4BC3A 1YAGA 5BR9A 1YVNA 2Q2RA 1U2VB 2ASOA 2E2PA 3H3NO 4H0VB 3TPQA 2YCHA 1HKBA 3UKRA 1GLAG 1S3XA 4YDUC 2NLXA 4XEIA 2PAVA 3FZLA 4DB3A 3A5OC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GMJB 4O0JA 3LM9A 3L2RA 3ZSZA 3HOTA 1LWCA 4KHSA 4KH4A 2HVIA 4OKKA 1JCFA 4FM1A 1K9MO 3ZSQA 3HP6A 4IEIA 4JKAA 2QEXN 1DT9A 2IGIA 2KKZA 1VRUA 4O5BA 4CZKA 2VQEK 3SBGA 1C0FA 2I7PA 2P9PA 2FXUA 4CF0A 2RN2A 5AZIB 4JI1K 5GIPA 4N47A 4YOYA 3FZHA 3VF4A 5HBMA 2G8UA 1CXQA 3U8XA 4HTLA 3THWA 1VSDA 2Q1NA 1U4BA 3T69A 1E4FT 3CCEN 3ZT2A 2G8VA 3EE9A 4OKEA 4CHOA 2NUBA 3C7NA 4YHHK 1NKBA 4CFCA 1XNRK 1JLBA 1W2BM 3C0BA 3WT0A 1HQEA 4O8UA 3IRXA 4BGAA 1M1KO 1GLFO 4DQQA 4LSNA 3DLKA 4GVMA 4BACA 1TK0A 3LWMA 1JLGA 4CBXA 3EKUA 2W41A 1NK8A 5TKWA 1Z05A 4I2QA 3THYA 4R79A 1REVA 3FZMA 1LWEA 4M41A 4ICLA 3PX4A 4FWQA 3IAYA 3EN9A 5HROA 3E9PA 2OTJN 4C1NI 3OYDA 3FR0A 4JI5K 3WXJA 1FJGK 3ENOA 1JLEA 2QWPA 3CYMA 4B1YB 1D5AA 4K42A 4N76A 4C8KA 3TAFA 2P9PB 5AQPA 1T03A 4A61A 1L3TA 3H1QA 4RW6A 3T7ZA 4FCYA 2B6AA 1VQNN 1HR0K 1DKGD 4BRLA 3C6AA 4FJ7A 3O3GA 3PLAA 3PO5A 3RMAA 1EKEA 4RW9A 5H1SQ 2PY5A 1U47A 5J2NA 3C7NB 3CM5A 4DTNA 1VSFA 1LAVA 4EP4A 2ZWHA 5C12A 3BF3A 5EVZA 4I6MA 3QESA 2WBNA 2QA4N 3V1OA 3NVKA 2D1KA 1X9MA 4L3QA 3QFPA 1FK9A 1N5YA 3O9RA 5I42A 1NU0A 2KW4A 2EWSA 4JRQA 3PX0A 2A41A 2YX6A 3KKSA 3MK6A 3CFRA 3QETA 2P9NA 4OLAA 3OYAA 3THYB 4JKDA 4PKHA 3WXLA 4JI7K 2I5JA 5BR8K 2A1RA 1LW0A 4Z4GA 1K8KA 3DLBA 3RMCA 2NRXA 3DRSA 1GOAA 3KK1A 1GLJO 4B9VA 1Y64A 3G4SN 3QNOA 4K41A 5LJVA 4BRCA 4IFYA 1VSIA 1JXEA 4B08A 3O8MA 3HBTA 2G8IA 2GUPA 3CJBA 3IDHA 4KH6A 5AR0A 3O6WA 1QHTA 3BEXA 3QB0A 4X65K 1NK5A 3RR8A 2GV9A 4MQ3A 4A57A 1TAUA 3A2FA 1OVQA 4E7LA 3UIQA 4NLBA 2KHOA 3ULDA 1I39A 4FJ9A 3PV8A 1VQ7N 5AQJA 4E7HA 1HNXK 3VTHA 5HRNA 1NKCA 2G8HA 1RT3A 3L3UA 1ZBFA 3HRGA 3NBPA 3P31A 4CJ4A 3IKMA 4H0TB 3OBWA 4I6MB 3O4QA 3OS2A 4CGHA 3I56N 1SZ2A 2W40A 3LM2A 5ELZA 3HP9A 2QM1A 4JEPA 4ID5A 2V51B 4YOVA 2HW3A 3MEDA 3UB5A 1NGEA 4Z0UA 3WQTA 4CZJA 3G6EN 3SQ0A 4K8XA 4CEOA 4CZEA 3BF1A 2Z1GA 3ULEA 3OYCA 4GNIA 4NCBA 4KHNA 4RG8A 2EX3A 1BGXT 1LV5A 3AVAA 3QINA 3WQUA 4BVOA 4M7YA 1TL3A 3CCQN 3R9PA 4OPHA 4ILGB 3VEVA 1Y97A 3HT3A 1T6CA 1T8EA 3QNNA 3D7EO 1TGOA 3ZT3A 3CQYA 1RT6A 2P1JA 4BC5A 1ZC6A 1YJNN 3TI0A 1VAZA 1QE1A 1UWBA 2NRWA 4WQ4C 3MX2A 3J7AP 5AZJA 1TL1A 2PYLA 3ZT0A 3G10A 3QMLA 1XQSC 1LAWA 4K25A 1FXXA 4CHZA 2LSNA 4DQ8A 3U9ZA 4LH5A 2YKMA 2PZSA 4IOXA 4JHDB 3OVNA 1RBUA 4BRGA 3M1FA 1YT3A 4C8OA 4CZLA 5MLCQ 4JI6K 3CC7N 4FLYA 4W5NA 2I7NA 1JL2A 3TAEA 4B1UB 3D2FA 4IZ9A 4Y0WA 3FE1A 2KTQA 3A5MC 1X1PA 4QS9A 3KTQA 3FLCO 2VG7A 2D4WA 3WNHA 1Q9XA 1WSFA 2QWMA 3M8PA 4W5QA 3LALA 3OW2M 1WSEA 2O8CA 3BGRA 4CK3A 3OS1A 4FW1A 3KVGA 4JD2A 5FPEA 3P1GA 1S1TA 5B8HA 3V81A 3S3MA 1X9SA 2F96A 2E2NA 2JWLA 2FBXA 1F21A 3VEZA 2XY8A 3J81O 5C0YA 1JL1A 1RBTA 3SV3A 3SAGA 4QOZB 5LJWA 2FF6A 1QSSA 2X6SA 1KFDA 3HYFA 4BRPA 1BL3A 3NCIA 4IG3A 4DS5A 1TYQB 1ZXOA 4PA1A 4PKGA 1BO5O 3ZT1A 4BE2A 3MN5A 4J8FA 1UA1A 1T3VA 1EWQA 4FM2A 3CMEN 4MDBA 4PL8A 4F8RA 4CZFA 4CERA 4NYNA 4GKJK 3MWTA 1Q9YA 5HOOA 3TSQA 1VSHA 4DFKA 3QEIA 4ISEA 1C1CA 3MN7A 2YHWA 4DMNA 1TKDA 4KO0A 3G0ZA 1TV6A 3PO4A 4K43A 4DR2K 1P8ZA 3KWGA 4CFAA 3B6OA 2Y1IA 3AO5A 4CZMA 3SUQA 2Q31A 3D2FB 2OPQA 1XMQK 1J5EK 3OYBA 3OHRA 4RW8A 4IEEA 3NE6A 4CIEA 5M1PA 5C15A 4XH4A 3V9WA 2O8CB 4X62K 4JD2B 3GBTA 1N33K 2FLOA 5GINA 1ILYA 5JLHA 4KI4A 1S6PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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