2CGLA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose, adp and a modeled atp gamma phosphate.
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords RHAMNULOKINASE
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli bl21(de3)
total genus 165
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cglA02
5FPMA 2Q0RA 1P8ZA 2YHYA 3O5BA 2D0PA 4QS7A 4BG9A 5LY3A 3EKSA 5E26A 3VF6A 5AQQA 4A62A 3D2FB 3IMXA 4RTFD 4EIAA 2E2NA 3VGMA 5AQPA 3WXIA 1MWMA 2QWNA 4CZFA 3UKUB 5AZIA 4WQ5A 3UKRA 3FZFA 1GLEG 4CZGA 4EHTA 3L4IA 2ASMA 3GG4A 1QQNA 3A8YA 5AQKA 4BR4A 2FSNA 3ZEUB 2D0OA 2BTFA 3C7NB 4PKIA 4JHDA 1NGHA 3M6GA 4BQZA 4BROA 2I7PA 4HTLA 4CI6A 4CZMA 3MDQA 4BC4A 3U8XA 1WOQA 3W3DA 1YAGA 1T6DA 2GUPA 1BA0A 2P9SB 3DXKB 1C0GA 1TYQB 2Q0UA 2ZF5O 3CIPA 3EZWA 3LL3A 1XUPO 4M7XA 2QWMA 3KVGA 3OHRA 1NM1A 4ISFA 2HOEA 4BRMA 4BRDA 5AQUA 1YXQA 3ENOA 5AQNA 2P9UB 4IJAA 2ITMA 5EX5A 3QBXA 1XQSC 3LM2A 4A2BA 5LJWA 4DCHA 3WXJA 1Z6RA 3ID8A 3MN5A 3GE1A 3ZETB 3BEXA 4FWRA 3WEEA 1NMDA 2E2OA 4H0VB 4FPAA 4IO8A 3CJAA 4AM7A 4BGBA 4IJNA 2CGLA 1ZC6A 3O8MA 4B1YB 4H0OA 5BN8A 3LDOA 3FE1A 1Y64A 3AY9A 3A5MC 1V4SA 1C0FA 3F9MA 3SMSA 4BR0A 2Q2RA 5JLHA 4CJ7A 2HF4A 3FGUA 5KPRA 2P9PA 3CQXA 3LDNA 2J4RA 1NGEA 5F2RA 3BF3A 3VF2A 4RCHA 1SZ2A 2E88A 2V51B 5LJVA 4HWIA 4CBWA 5BR9A 5AQSA 3VGKA 4ISEA 1IJJA 3I8BA 1JCFA 1DEJA 2Q97A 4CZJA 5F1XA 4FPBA 3MN9A 2YCHA 3G25A 2PBDA 4BRAA 4H5WA 2P9NA 5AFUH 1Z05A 3GBTA 2YHWA 2QWLA 2E1ZA 4FWMA 4H0XB 3DAWA 1HKGA 4FWSA 4FOEA 2QM1A 3CJ9A 4FO0A 5EXWA 3FLCO 3IDHA 1NBWA 5ADXH 3ZX0A 1U6ZA 5EOYA 2QWQA 3WXLA 4BRHA 1TUUA 3AARA 4CZEA 3L6QA 5FPEA 1DKGD 3A5LC 1NGIA 3QFUA 3SJHA 3TU5A 4BRNA 1NGCA 5AQYA 1RDWX 2EWSA 1QZ6A 3L0QA 3CI5A 4ISGA 1T6CA 2QXLA 3GL1A 4BRCA 1YVNA 3RSEA 4H5RA 4BRIA 3WEEB 3DXMA 1NGBA 3H46O 3JS6A 2YHXA 4C23A 4DQ8A 2YI1A 1XC3A 3VENA 1Q18A 4FWKA 4BRLA 5KQDA 1GLJO 2D1KA 2IIRA 4BRPA 2CGJA 1E4FT 4Z94A 3H1QA 3MN7A 1QZ5A 4BVOA 5EVZA 4CZLA 4FWOA 5AZJA 3DJCA 2V7YA 1KAZA 3VF4A 1KXPA 4BRQA 2V7ZA 3UE5A 4B1ZA 3KZBA 4MLHA 4LC9B 5CE3A 1RFQA 1H1VA 3KHYA 5B8HA 1QHAA 1BWFO 1KAXA 4JAXA 1X9JA 4AM6A 4H0TB 5KPTA 3HSCA 1NGAA 2IVNA 2P9IA 4WYBA 3DWLA 3H3OB 5JLFA 5JMVA 3P4IA 3QB0A 2P9NB 2IVPA 4JD2A 3WUHA 4BRGA 1ATSA 3M1FA 4M63C 3IFRA 2QW9A 4FWNA 3HI0A 3QBWA 3FZLA 3VGLA 1BUPA 5AQJA 5FPNA 2GTDA 2ASPA 2HMPA 5BN9A 4M7YA 1ESVA 1V4TA 3A5OC 4FSVA 3HBTA 4NB4A 3W0LA 1EQYA 1GLAG 2YJEA 4FWQA 4PL7A 3O1BA 2GWKA 3D2FA 1JCEA 4JNEA 4MO4A 3ULEA 4BR5A 3BF1A 1J6ZA 5AFUA 1MWKA 3H6EA 3GDQA 4JN4A 4IXCA 4BR7A 1GLCG 3UKUA 5AZIB 3UKRB 4K42A 3WXKA 1U2VA 3VEZA 4L3QA 3WQTA 4WQ4C 4B9QA 2FSJA 1HKBA 3H45C 5EY4A 2FXUA 4WQ4A 2FF6A 5ADXA 3EO3A 4NO7A 4RWTA 2VWBA 3ZEUA 3D2EA 4H0PA 1BO5O 3AAPA 3CJ1A 3UB5A 3BP8A 3EN9A 5ELZA 4JHDB 2DPNA 5AQMA 3VERA 5AZJB 1JCGA 5FPDA 4H03B 2F9TA 1SQKA 5AQHA 2W41A 3R8EA 2A6AA 2QWOA 3U9DA 1D4XA 3TPQA 3VESA 3D7EO 3CETA 2AP1A 2HF3A 4EAHD 5BPNA 2FF3B 4BGAA 3QFPA 4CZHA 1SAZA 4XH5A 2P9IB 4CD1A 2H3GX 3U4LA 2PAVA 1TUYA 2CGKA 2GWJA 1K8KA 4O5FA 2KHOA 2GEMA 3QMLA 3AAQA 2E8AA 1MDUB 5JICA 1LOTB 3HZ6A 2GELA 1NGFA 3HTVA 1T44A 2OANA 5AQFA 4DB3A 1HJOA 5AR0A 3ZETA 5BRHA 3VEWA 3FZHA 2D4WA 4IWVA 4CBXA 3O4WA 2CH5A 5BRFA 3LDPA 1GLBG 2AA4A 3FR0A 3VEVA 3O80A 4E1JA 3CJ7A 3HM8A 3CJCA 3A0IX 3ATUA 2A5XA 4DHYA 2ZGYA 3ATVA 5AQTA 2VYPA 3LM9A 4YDUC 1NGJA 3ULEB 4CD3A 4YDUA 2E2QA 1BA1A 3FZMA 5BRDA 1E4GT 4K43A 4WQ5C 2P9PB 1RGIA 2Q31A 1ATNA 1U2VB 2F9WA 3EKUA 3B8AX 3O08A 1GLDG 2BUPA 2FSKA 4O8KA 3WT0A 3ZX3A 4BC5A 4BREA 1NGGA 3MK6A 3C0BA 5AQXA 2ASOA 3S41A 3D2EB 1QQOA 1S3XA 2P9KA 2CH6A 3I33A 4IZ9A 4EHUA 3IUCA 1HLUA 2UYTA 2P9LA 2NLXA 1DGKN 5AQGA 1NWKA 5BREA 1LCUA 1S22A 4MLEA 1R59O 3LDQA 1NGDA 3VEOA 2A42A 4J8FA 4BQLA 3FZKA 4BVPA 5TKYA 2A3ZA 1YUWA 4MO5A 3VEYA 4QS9A 4H0YB 2YJFA 3MN6A 4I6MA 4H5TA 2W40A 3R9PA 4CZIA 3CJBA 4BC2A 2QWRA 3CQYA 4H5VA 1ZBSA 4K25A 5E84A 1K8KB 3VOVA 5I9EB 1BOTO 3O6WA 2WUSA 4FL9A 1BDGA 4A2AA 1BU6O 3U9ZA 4B1XB 3SLCA 4Y0WA 2VCPA 4BC3A 3EL2A 1GLFO 4XH4A 3RSEB 4XEIA 2E20A 3DXMB 1HUXA 2ZGZA 3LDLA 5AQRA 3BUZB 3QICA 1ZXOA 1ATRA 5KPZA 2NZTA 4FWPA 4K41A 3H3NO 5AQWA 4PL8A 3QDKA 5KQ8A 5BPLA 4CBUA 1BG3A 2NRHA 3C7NA 1CZAN 3VETA 4B1UB 1MA9B 2Q1NA 3GOIA 1QQMA 4GY2B 1GLLO 3SMPA 3CERA 4QS8A 2Q36A 4CZKA 3A5NC 4EFHA 2V52B 4FWLA 5AQLA 1HX1A 4BR9A 2IVOA 2A41A 4KBOA 1HPMA 5AQZA 4PKHA 2P9SA 3DXKA 4FOIA 3SK3A 3O1WA 1TYQA 4XH1A 3MMVA 2QWPA 3R6MA 5AQIA 4B1WB 3M3ZA 4BG8A 2P9KB 5BPMA 3VPZA 3H1VX 2E1YA 3MCPA 5AQVA 2P9LB 4A61A 3J8AA 4BR2A 2P9UA 2ZWHA 1NLVA 4F9OA 4JD2B 3VEXA 4BRKA 1HKCA 1WUAA 5F0XA 1G99A 3ENHA 2I7NA 1X3NA 3CHWA 2A40A 4BRFA 2FLOA 1KAYA 4H5NA 4B1VA 2E2PA 1OKJA 3JXUA 5AQOA 3WQUA 4I6MB 1X3MA 3ZX2A 4GNIA 1IG8A 3FFKB 4PKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YHYA 5C24A 5LY3A 3QEVA 4KHWA 3EKSA 2ZD1A 2O8CA 3TSPA 4NLCA 5CZ1A 4AHTA 2E6LA 4A62A 2IGIA 4EIAA 2E2NA 5AQPA 3WXIA 5M1FA 1XC9A 3MAQA 3UKUB 5AZIA 2F96A 2WTUA 3L4IA 1FJGK 2DTUA 2ASMA 4JS4A 1IBMK 2HHXA 1QQNA 3A8YA 3ENBA 4E7IA 3DLKA 1XHZA 1L5UA 2QTDA 1JL1A 1VQ8N 3VMFB 4PKIA 4JHDA 1TKTA 1SKRA 4CGFA 1N33K 4FJ9A 3VQPA 4BC4A 1RTJA 1ASWA 4B9MA 4KH5A 1T8EA 4BE2A 1TL1A 2KW4A 2Q0UA 3PIOL 3MECA 2IS3A 1VSKA 3CCEN 2QWMA 4CK1A 1NM1A 4KHYA 3HPHA 2DFHA 1YXQA 5AQNA 2P9UB 3VA3A 1XQSC 2ZJPL 1WAFA 4E7KA 3RWUA 3QEWA 3QEIA 1VSEA 3TAPA 2XY6A 3WEEA 3J81O 1NMDA 2E2OA 3SI6A 1NNEA 4ZHRA 3CJAA 4AH9A 4FM1A 4CCHA 4O55A 4I2QA 4H0OA 5BN8A 3LDOA 4IFYA 4DTRA 4B3SK 2O8CB 3WNEA 4K8ZA 3O3HA 3A5MC 4E7LA 2HVHA 3ZLJA 1C0FA 4BR0A 3UIQA 3JSMA 5JVHL 5J2MA 2UUCK 2P9PA 3I0SA 3CQXA 2J4RA 3E1YA 5F2RA 3BF3A 3PLAA 1JXBA 2UXBK 4RCHA 1SZ2A 2B6AA 1TVRA 4NCBA 4OJRA 3K5NA 4CEFA 4BE1A 1YJWN 3QIPA 5F1XA 3TARA 3OYIA 2BGGA 3G25A 4E1NA 1J53A 4BRAA 4GMJB 4H5WA 1Q86O 3GBTA 2E1ZA 3AA3A 3PSIA 1HKGA 3OA9A 4FOEA 4CEBA 1QSYA 5EXWA 3IDHA 3ZT4A 1D9DA 5ADXH 4QAGA 5KGXA 3AA4A 4CZEA 4JKBA 4O4GA 1DKGD 4UQGA 3QFUA 3SJHA 3CQ8A 3Q7BA 3VTHA 3AO2A 3DM2A 4ISGA 4CHYA 1T6CA 3AGRA 5J2NA 3GL1A 4KI6A 4AQYK 1YVNA 2ZE2A 4BRIA 3WEEB 4CF0A 1NGBA 3CF5L 4A57A 2NUBA 4DQ8A 3SCXA 4DSKA 2YI1A 3ULDA 2QKBA 2YKNA 4FK4A 5KQDA 3OW2M 4Z4EA 4BY9C 3HP9A 1E4FT 1KSPA 3HPOA 4M3YA 3MN7A 5EVZA 2OTLN 4B8CA 3KIOA 4B1ZA 4MLHA 5CYMA 4J2AA 4FLWA 4U7BA 4W5QA 1QHAA 1KAXA 4JAXA 4H4MA 4FZXC 3CM5A 5KPTA 3TTDA 1NGAA 1S6QA 4WYBA 3B6PA 2Z1GA 3OY9A 3HVTA 1ATSA 4BE0A 3QBWA 4UY8O 2ZQBA 4FLUA 1NK7A 3ZSZA 3VGLA 3MX2A 5LMNK 1BUPA 3S3MA 4M7YA 1ESVA 1V4TA 3A5OC 1ZBHA 2G8UA 4FSVA 1KRPA 1HYVA 4DQQA 1BCMA 1EQYA 5DM7L 2YJEA 3M8QA 4DTSA 4OPKA 1JCEA 4JNEA 2XY7A 3ULEA 2A1SA 1BQNA 3U3YA 3NDKA 1MWKA 3OYNA 4CF1A 4JN4A 4BR7A 1SL2A 1VQ4N 1J9AA 3UKRB 1ZBIA 3WXKA 4DS4A 1VSJA 4L3QA 2KFNA 2EX3A 4AHSA 4B9QA 4L8RB 2FSJA 3H45C 5EY4A 2UUAK 3NF8A 4WQ4A 3V9ZA 3EO3A 1FXXA 3AO1A 3AVMA 4IOXA 1LW2A 3CC7N 3VN5A 3OS0A 4WE1A 2DPNA 3VERA 4PUOA 1JCGA 3CPWM 2F9TA 1HMVA 3OYCA 3CD6N 3U9DA 1GOBA 4NXMK 3N4PA 3S3NA 4LH5A 3DRSA 3CETA 5BPNA 4JKGA 2RKIA 3OBYA 4CZHA 3MWPA 2PAVA 3I0RA 1K8KA 3ZSRA 3ZSQA 3NF6A 3ZT2A 3KJVA 3OYGA 1KVBA 4CJPA 4E1MA 1MDUB 5JICA 1KTQA 1T44A 4DB3A 4KTQA 1HJOA 5AR0A 4FZZA 4J2DA 3FZHA 3KK7A 4KHPK 2KZMA 4CECA 3QEXA 4LH4A 2NRXA 5CZ2A 4CBXA 5EU7A 3O80A 3HM8A 1U45A 4RW7A 1BIUA 2QXFA 4JKCA 1ILYA 4DKWA 3VQDA 3LM9A 3L2QA 3C6TA 3ULEB 4CD3A 2E2QA 1BA1A 3FZMA 4K43A 1RTHA 1RGIA 2Q31A 1GLDG 5JVGL 4M3WA 4BC5A 4DR1K 4CJWA 3C0BA 2ASOA 1C1CA 3S41A 1TV6A 1N36K 4B08A 2CH6A 1HLUA 4FJMA 4O0JA 2P9LA 1VQ5N 1HQEA 5AQGA 1LCUA 3IG1A 1S22A 3IS9A 4KH6A 1R59O 4FK0A 3VEOA 3VTIA 4BQLA 2Z1IA 3SUOA 4I2PA 4IG3A 4JKGB 4K0KK 3LWMA 5HOOA 3VQBA 3QEPA 3J7AP 3NBPA 4H5TA 2W40A 3R9PA 1ZBSA 2JWKA 3ZT1A 4RG8A 5E84A 1K8KB 4DSLA 2YV0X 4A2AA 4B1XB 3U9ZA 3SLCA 4Y0WA 4F2SA 4CVNE 3EL2A 1HYZA 3RSEB 4XEIA 1HUXA 2ZGZA 1ZYQA 4N76A 1SV5A 1ZXOA 3QIOA 3HT3A 4C1NI 3MCAB 3H3NO 5KQ8A 1VQ9N 2RPIA 4CJTA 1BG3A 1CZAN 3OYLA 1MA9B 3LAKA 3SV4A 3GOIA 4M45A 1W9HA 2P1JA 3SPZA 2V52B 4CIGA 3OJSA 2IVOA 5D3GA 1NK5A 4IDHA 2P9SA 3SK3A 4XH1A 4LF6K 5DMRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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